CNRS Nantes University US2B US2B
home |  start a new run |  job status |  references&downloads |  examples |  help  

Should you encounter any unexpected behaviour,
please let us know.
elNémo has been hacked on november 27th.
It has been moved away and runs again.
**Still some additional cleaning from time to time**
Sorry for the inconvenience.


***  TRANSPORT PROTEIN 26-OCT-20 7DCE  ***

LOGs for ID: 2603031115043683922

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2603031115043683922.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2603031115043683922.atom to be opened. Openam> File opened: 2603031115043683922.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 912 First residue number = 103 Last residue number = 217 Number of atoms found = 7062 Mean number per residue = 7.7 Pdbmat> Coordinate statistics: = 107.193931 +/- 19.941165 From: 56.229000 To: 157.124000 = 93.463192 +/- 10.645321 From: 63.438000 To: 122.473000 = 110.643509 +/- 28.619945 From: 52.239000 To: 158.875000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 1.1535 % Filled. Pdbmat> 2588775 non-zero elements. Pdbmat> 282982 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 80.14 +/- 21.60 Maximum number = 128 Minimum number = 8 Pdbmat> Matrix trace = 5.659640E+06 Pdbmat> Larger element = 527.441 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 912 non-zero elements, NRBL set to 5 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2603031115043683922.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 5 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2603031115043683922.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2603031115043683922.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 7062 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 5 residue(s) per block. Blocpdb> 912 residues. Blocpdb> 36 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 36 atoms in block 2 Block first atom: 37 Blocpdb> 41 atoms in block 3 Block first atom: 73 Blocpdb> 34 atoms in block 4 Block first atom: 114 Blocpdb> 38 atoms in block 5 Block first atom: 148 Blocpdb> 35 atoms in block 6 Block first atom: 186 Blocpdb> 43 atoms in block 7 Block first atom: 221 Blocpdb> 48 atoms in block 8 Block first atom: 264 Blocpdb> 38 atoms in block 9 Block first atom: 312 Blocpdb> 39 atoms in block 10 Block first atom: 350 Blocpdb> 36 atoms in block 11 Block first atom: 389 Blocpdb> 41 atoms in block 12 Block first atom: 425 Blocpdb> 36 atoms in block 13 Block first atom: 466 Blocpdb> 44 atoms in block 14 Block first atom: 502 Blocpdb> 41 atoms in block 15 Block first atom: 546 Blocpdb> 33 atoms in block 16 Block first atom: 587 Blocpdb> 42 atoms in block 17 Block first atom: 620 Blocpdb> 32 atoms in block 18 Block first atom: 662 Blocpdb> 36 atoms in block 19 Block first atom: 694 Blocpdb> 41 atoms in block 20 Block first atom: 730 Blocpdb> 40 atoms in block 21 Block first atom: 771 Blocpdb> 45 atoms in block 22 Block first atom: 811 Blocpdb> 32 atoms in block 23 Block first atom: 856 Blocpdb> 39 atoms in block 24 Block first atom: 888 Blocpdb> 41 atoms in block 25 Block first atom: 927 Blocpdb> 49 atoms in block 26 Block first atom: 968 Blocpdb> 16 atoms in block 27 Block first atom: 1017 Blocpdb> 36 atoms in block 28 Block first atom: 1033 Blocpdb> 35 atoms in block 29 Block first atom: 1069 Blocpdb> 31 atoms in block 30 Block first atom: 1104 Blocpdb> 40 atoms in block 31 Block first atom: 1135 Blocpdb> 35 atoms in block 32 Block first atom: 1175 Blocpdb> 40 atoms in block 33 Block first atom: 1210 Blocpdb> 33 atoms in block 34 Block first atom: 1250 Blocpdb> 50 atoms in block 35 Block first atom: 1283 Blocpdb> 33 atoms in block 36 Block first atom: 1333 Blocpdb> 33 atoms in block 37 Block first atom: 1366 Blocpdb> 35 atoms in block 38 Block first atom: 1399 Blocpdb> 47 atoms in block 39 Block first atom: 1434 Blocpdb> 46 atoms in block 40 Block first atom: 1481 Blocpdb> 34 atoms in block 41 Block first atom: 1527 Blocpdb> 33 atoms in block 42 Block first atom: 1561 Blocpdb> 41 atoms in block 43 Block first atom: 1594 Blocpdb> 42 atoms in block 44 Block first atom: 1635 Blocpdb> 41 atoms in block 45 Block first atom: 1677 Blocpdb> 45 atoms in block 46 Block first atom: 1718 Blocpdb> 41 atoms in block 47 Block first atom: 1763 Blocpdb> 46 atoms in block 48 Block first atom: 1804 Blocpdb> 40 atoms in block 49 Block first atom: 1850 Blocpdb> 41 atoms in block 50 Block first atom: 1890 Blocpdb> 44 atoms in block 51 Block first atom: 1931 Blocpdb> 35 atoms in block 52 Block first atom: 1975 Blocpdb> 46 atoms in block 53 Block first atom: 2010 Blocpdb> 44 atoms in block 54 Block first atom: 2056 Blocpdb> 36 atoms in block 55 Block first atom: 2100 Blocpdb> 35 atoms in block 56 Block first atom: 2136 Blocpdb> 39 atoms in block 57 Block first atom: 2171 Blocpdb> 41 atoms in block 58 Block first atom: 2210 Blocpdb> 46 atoms in block 59 Block first atom: 2251 Blocpdb> 38 atoms in block 60 Block first atom: 2297 Blocpdb> 40 atoms in block 61 Block first atom: 2335 Blocpdb> 41 atoms in block 62 Block first atom: 2375 Blocpdb> 45 atoms in block 63 Block first atom: 2416 Blocpdb> 34 atoms in block 64 Block first atom: 2461 Blocpdb> 36 atoms in block 65 Block first atom: 2495 Blocpdb> 31 atoms in block 66 Block first atom: 2531 Blocpdb> 53 atoms in block 67 Block first atom: 2562 Blocpdb> 40 atoms in block 68 Block first atom: 2615 Blocpdb> 47 atoms in block 69 Block first atom: 2655 Blocpdb> 36 atoms in block 70 Block first atom: 2702 Blocpdb> 37 atoms in block 71 Block first atom: 2738 Blocpdb> 38 atoms in block 72 Block first atom: 2775 Blocpdb> 41 atoms in block 73 Block first atom: 2813 Blocpdb> 45 atoms in block 74 Block first atom: 2854 Blocpdb> 51 atoms in block 75 Block first atom: 2899 Blocpdb> 39 atoms in block 76 Block first atom: 2950 Blocpdb> 36 atoms in block 77 Block first atom: 2989 Blocpdb> 49 atoms in block 78 Block first atom: 3025 Blocpdb> 37 atoms in block 79 Block first atom: 3074 Blocpdb> 46 atoms in block 80 Block first atom: 3111 Blocpdb> 46 atoms in block 81 Block first atom: 3157 Blocpdb> 36 atoms in block 82 Block first atom: 3203 Blocpdb> 39 atoms in block 83 Block first atom: 3239 Blocpdb> 45 atoms in block 84 Block first atom: 3278 Blocpdb> 36 atoms in block 85 Block first atom: 3323 Blocpdb> 36 atoms in block 86 Block first atom: 3359 Blocpdb> 45 atoms in block 87 Block first atom: 3395 Blocpdb> 41 atoms in block 88 Block first atom: 3440 Blocpdb> 33 atoms in block 89 Block first atom: 3481 Blocpdb> 46 atoms in block 90 Block first atom: 3514 Blocpdb> 27 atoms in block 91 Block first atom: 3560 Blocpdb> 42 atoms in block 92 Block first atom: 3587 Blocpdb> 39 atoms in block 93 Block first atom: 3629 Blocpdb> 56 atoms in block 94 Block first atom: 3668 Blocpdb> 29 atoms in block 95 Block first atom: 3724 Blocpdb> 43 atoms in block 96 Block first atom: 3753 Blocpdb> 44 atoms in block 97 Block first atom: 3796 Blocpdb> 45 atoms in block 98 Block first atom: 3840 Blocpdb> 7 atoms in block 99 Block first atom: 3885 Blocpdb> 37 atoms in block 100 Block first atom: 3892 Blocpdb> 34 atoms in block 101 Block first atom: 3929 Blocpdb> 32 atoms in block 102 Block first atom: 3963 Blocpdb> 36 atoms in block 103 Block first atom: 3995 Blocpdb> 35 atoms in block 104 Block first atom: 4031 Blocpdb> 40 atoms in block 105 Block first atom: 4066 Blocpdb> 42 atoms in block 106 Block first atom: 4106 Blocpdb> 36 atoms in block 107 Block first atom: 4148 Blocpdb> 44 atoms in block 108 Block first atom: 4184 Blocpdb> 40 atoms in block 109 Block first atom: 4228 Blocpdb> 32 atoms in block 110 Block first atom: 4268 Blocpdb> 49 atoms in block 111 Block first atom: 4300 Blocpdb> 40 atoms in block 112 Block first atom: 4349 Blocpdb> 37 atoms in block 113 Block first atom: 4389 Blocpdb> 35 atoms in block 114 Block first atom: 4426 Blocpdb> 38 atoms in block 115 Block first atom: 4461 Blocpdb> 38 atoms in block 116 Block first atom: 4499 Blocpdb> 42 atoms in block 117 Block first atom: 4537 Blocpdb> 46 atoms in block 118 Block first atom: 4579 Blocpdb> 31 atoms in block 119 Block first atom: 4625 Blocpdb> 36 atoms in block 120 Block first atom: 4656 Blocpdb> 35 atoms in block 121 Block first atom: 4692 Blocpdb> 33 atoms in block 122 Block first atom: 4727 Blocpdb> 35 atoms in block 123 Block first atom: 4760 Blocpdb> 33 atoms in block 124 Block first atom: 4795 Blocpdb> 6 atoms in block 125 Block first atom: 4828 Blocpdb> 29 atoms in block 126 Block first atom: 4834 Blocpdb> 34 atoms in block 127 Block first atom: 4863 Blocpdb> 47 atoms in block 128 Block first atom: 4897 Blocpdb> 34 atoms in block 129 Block first atom: 4944 Blocpdb> 37 atoms in block 130 Block first atom: 4978 Blocpdb> 32 atoms in block 131 Block first atom: 5015 Blocpdb> 40 atoms in block 132 Block first atom: 5047 Blocpdb> 36 atoms in block 133 Block first atom: 5087 Blocpdb> 38 atoms in block 134 Block first atom: 5123 Blocpdb> 33 atoms in block 135 Block first atom: 5161 Blocpdb> 32 atoms in block 136 Block first atom: 5194 Blocpdb> 35 atoms in block 137 Block first atom: 5226 Blocpdb> 41 atoms in block 138 Block first atom: 5261 Blocpdb> 40 atoms in block 139 Block first atom: 5302 Blocpdb> 39 atoms in block 140 Block first atom: 5342 Blocpdb> 41 atoms in block 141 Block first atom: 5381 Blocpdb> 15 atoms in block 142 Block first atom: 5422 Blocpdb> 35 atoms in block 143 Block first atom: 5437 Blocpdb> 36 atoms in block 144 Block first atom: 5472 Blocpdb> 29 atoms in block 145 Block first atom: 5508 Blocpdb> 29 atoms in block 146 Block first atom: 5537 Blocpdb> 38 atoms in block 147 Block first atom: 5566 Blocpdb> 34 atoms in block 148 Block first atom: 5604 Blocpdb> 36 atoms in block 149 Block first atom: 5638 Blocpdb> 53 atoms in block 150 Block first atom: 5674 Blocpdb> 34 atoms in block 151 Block first atom: 5727 Blocpdb> 45 atoms in block 152 Block first atom: 5761 Blocpdb> 35 atoms in block 153 Block first atom: 5806 Blocpdb> 28 atoms in block 154 Block first atom: 5841 Blocpdb> 41 atoms in block 155 Block first atom: 5869 Blocpdb> 27 atoms in block 156 Block first atom: 5910 Blocpdb> 42 atoms in block 157 Block first atom: 5937 Blocpdb> 36 atoms in block 158 Block first atom: 5979 Blocpdb> 29 atoms in block 159 Block first atom: 6015 Blocpdb> 46 atoms in block 160 Block first atom: 6044 Blocpdb> 43 atoms in block 161 Block first atom: 6090 Blocpdb> 36 atoms in block 162 Block first atom: 6133 Blocpdb> 28 atoms in block 163 Block first atom: 6169 Blocpdb> 37 atoms in block 164 Block first atom: 6197 Blocpdb> 39 atoms in block 165 Block first atom: 6234 Blocpdb> 36 atoms in block 166 Block first atom: 6273 Blocpdb> 39 atoms in block 167 Block first atom: 6309 Blocpdb> 43 atoms in block 168 Block first atom: 6348 Blocpdb> 28 atoms in block 169 Block first atom: 6391 Blocpdb> 36 atoms in block 170 Block first atom: 6419 Blocpdb> 46 atoms in block 171 Block first atom: 6455 Blocpdb> 41 atoms in block 172 Block first atom: 6501 Blocpdb> 47 atoms in block 173 Block first atom: 6542 Blocpdb> 36 atoms in block 174 Block first atom: 6589 Blocpdb> 36 atoms in block 175 Block first atom: 6625 Blocpdb> 38 atoms in block 176 Block first atom: 6661 Blocpdb> 37 atoms in block 177 Block first atom: 6699 Blocpdb> 39 atoms in block 178 Block first atom: 6736 Blocpdb> 36 atoms in block 179 Block first atom: 6775 Blocpdb> 40 atoms in block 180 Block first atom: 6811 Blocpdb> 44 atoms in block 181 Block first atom: 6851 Blocpdb> 39 atoms in block 182 Block first atom: 6895 Blocpdb> 38 atoms in block 183 Block first atom: 6934 Blocpdb> 33 atoms in block 184 Block first atom: 6972 Blocpdb> 45 atoms in block 185 Block first atom: 7005 Blocpdb> 13 atoms in block 186 Block first atom: 7049 Blocpdb> 186 blocks. Blocpdb> At most, 56 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 6 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 2588961 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 21186 Prepmat> Matrix trace = 5659640.0000 Prepmat> Last element read: 21186 21186 120.7100 Prepmat> 17392 lines saved. Prepmat> 15797 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 7062 RTB> Total mass = 7062.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 7062 RTB> Number of blocks = 186 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 204068.3897 RTB> 54594 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1116 Diagstd> Nb of non-zero elements: 54594 Diagstd> Projected matrix trace = 204068.3897 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1116 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 204068.3897 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0629052 0.1009783 0.2091497 0.6190579 0.9067087 1.2054775 1.8691145 2.0500497 2.4171163 2.5074772 3.5141107 3.7743900 4.0403935 4.8755547 5.1107789 5.2450019 5.9003026 6.5517564 6.9372348 7.5386749 7.7745238 8.3837524 8.4986713 8.7515923 9.5287032 9.9235584 10.5382065 10.9472850 11.6963172 11.8193524 12.0745434 12.5056207 12.8423275 13.9968978 14.3145187 14.5403927 14.9144555 15.4502469 15.7626723 15.8859847 16.3853831 16.6431718 17.1838616 17.9562781 18.4984743 18.8230522 19.1114104 19.4893936 19.6031635 19.9514157 20.2361152 20.5279628 20.9622655 21.1625465 22.0285882 22.1403280 22.2657501 22.4814443 23.1679074 23.6895374 23.9500076 24.3177252 24.5182948 24.7991950 25.2756758 25.8147755 26.4137234 26.9872055 27.3763268 28.0573176 28.2385422 28.6666855 28.6994168 29.3048311 29.5514722 29.8833233 30.5889903 31.3887581 31.8528161 31.8726791 32.3447828 32.7252245 33.1828668 33.7128586 33.9071745 34.1004997 34.7959923 34.9988072 35.4381247 35.6968987 36.1393961 36.5701590 36.6275434 37.1252307 37.3430394 37.6441402 37.7570294 38.6274016 38.9880653 39.0870802 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034329 0.0034335 0.0034337 0.0034337 0.0034342 0.0034358 27.2357107 34.5071692 49.6619628 85.4399382 103.4020558 119.2270592 148.4612923 155.4810535 168.8278353 171.9545899 203.5649470 210.9690120 218.2765661 239.7768755 245.4928390 248.6956021 263.7742667 277.9547815 286.0147798 298.1554740 302.7834822 314.4231409 316.5707589 321.2468062 335.2063062 342.0810336 352.5158365 359.2927819 371.3811430 373.3293392 377.3380827 384.0147504 389.1501034 406.2666532 410.8503443 414.0791358 419.3715662 426.8379178 431.1319459 432.8150467 439.5654812 443.0097944 450.1483502 460.1542543 467.0498480 471.1295050 474.7245039 479.3960414 480.7932495 485.0451197 488.4935699 492.0035155 497.1808457 499.5503220 509.6694615 510.9604734 512.4056926 514.8816153 522.6833730 528.5347786 531.4324975 535.4966443 537.7004642 540.7718450 545.9422038 551.7336301 558.0975209 564.1235601 568.1759784 575.1993073 577.0539482 581.4120399 581.7438702 587.8477923 590.3163892 593.6216435 600.5896604 608.3903920 612.8711771 613.0622364 617.5859390 621.2073675 625.5358894 630.5115839 632.3260601 634.1261336 640.5601149 642.4242140 646.4436090 648.7995257 652.8083875 656.6874318 657.2024538 661.6523523 663.5904263 666.2603538 667.2586149 674.9055942 678.0490669 678.9095147 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 7062 Rtb_to_modes> Number of blocs = 186 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9939E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9975E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9982E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9987E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0011E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.2905E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1010 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2091 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6191 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9067 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.205 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.869 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.050 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.417 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.507 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.514 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.774 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.040 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.876 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.111 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.245 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.900 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.552 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.937 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.539 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.775 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.384 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.499 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.752 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.529 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.924 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.09 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1116 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 0.99997 1.00000 0.99997 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 0.99998 1.00002 1.00000 0.99997 1.00003 0.99999 1.00001 1.00003 0.99999 1.00002 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00003 1.00005 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00003 1.00000 0.99998 1.00000 0.99998 1.00001 1.00002 0.99998 1.00000 1.00001 1.00002 0.99999 1.00002 1.00002 0.99999 0.99999 1.00000 0.99998 1.00002 1.00000 1.00001 0.99998 0.99999 1.00002 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 1.00003 1.00003 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 0.99998 1.00000 1.00002 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00004 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 0.99999 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 127116 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 0.99997 1.00000 0.99997 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 0.99998 1.00002 1.00000 0.99997 1.00003 0.99999 1.00001 1.00003 0.99999 1.00002 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00003 1.00005 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00003 1.00000 0.99998 1.00000 0.99998 1.00001 1.00002 0.99998 1.00000 1.00001 1.00002 0.99999 1.00002 1.00002 0.99999 0.99999 1.00000 0.99998 1.00002 1.00000 1.00001 0.99998 0.99999 1.00002 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 1.00003 1.00003 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 0.99998 1.00000 1.00002 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00004 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 0.99999 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3:-0.000-0.000 Vector 4: 0.000 0.000 0.000 Vector 5: 0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 6:-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 7:-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 8:-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 9:-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 10: 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2603031115043683922.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2603031115043683922.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2603031115043683922.atom Openam> file on opening on unit 11: 2603031115043683922.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 912 First residue number = 103 Last residue number = 217 Number of atoms found = 7062 Mean number per residue = 7.7 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9939E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9975E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9982E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9987E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0011E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.2905E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1010 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2091 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6191 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9067 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.205 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.869 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.050 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.417 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.507 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.514 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.774 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.040 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.876 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.111 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.245 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.900 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.552 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.937 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.539 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.775 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.384 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.499 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.752 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.529 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.924 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.09 Bfactors> 106 vectors, 21186 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.062905 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.771 for 912 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.091 +/- 0.07 Bfactors> = 106.329 +/- 41.06 Bfactors> Shiftng-fct= 106.238 Bfactors> Scaling-fct= 628.367 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2603031115043683922.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2603031115043683922.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4328E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4334E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4335E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4357E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 27.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 34.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 49.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 85.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 103.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 119.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 148.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 155.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 168.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 171.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 203.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 210.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 218.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 239.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 245.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 248.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 263.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 277.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 286.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 298.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 302.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 314.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 316.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 321.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 335.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 342.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 352.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 359.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 371.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 373.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 377.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 384.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 389.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 406.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 410.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 414.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 419.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 426.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 431.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 432.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 439.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 442.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 450.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 460.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 467.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 471.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 474.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 479.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 480.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 485.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 488.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 492.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 497.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 499.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 509.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 510.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 512.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 514.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 522.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 528.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 531.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 535.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 537.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 540.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 546.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 551.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 558.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 564.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 568.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 575.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 577.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 581.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 581.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 587.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 590.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 593.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 600.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 608.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 612.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 613.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 617.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 621.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 625.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 630.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 632.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 634.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 640.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 642.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 646.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 648.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 652.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 656.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 657.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 661.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 663.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 666.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 667.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 674.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 678.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 678.9 Chkmod> 106 vectors, 21186 coordinates in file. Chkmod> That is: 7062 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 29 is: 1.0001 (instead of 1.0000). Chkmod> Normal end. 0.0034 0.8253 0.0034 0.6890 0.0034 0.9557 0.0034 0.7125 0.0034 0.9819 0.0034 0.9400 27.2345 0.6918 34.5094 0.6162 49.6539 0.7126 85.4392 0.5945 103.3971 0.6669 119.1983 0.6725 148.4504 0.6461 155.4725 0.7297 168.8165 0.4210 171.9308 0.4789 203.5530 0.6307 210.9491 0.4910 218.2566 0.5500 239.7775 0.3154 245.4876 0.3871 248.6849 0.3898 263.7562 0.3593 277.9480 0.0016 285.9977 0.3779 298.1491 0.2129 302.7798 0.3584 314.4143 0.3453 316.5633 0.2745 321.2405 0.2726 335.1971 0.2494 342.0740 0.2096 352.5307 0.4546 359.3219 0.3624 371.4237 0.2493 373.3235 0.4189 377.2509 0.4438 384.0655 0.2843 389.0981 0.2710 406.2942 0.2376 410.7679 0.0692 414.0558 0.3469 419.2909 0.2483 426.8162 0.4057 431.0769 0.3905 432.8512 0.3900 439.6085 0.2865 442.9486 0.3268 450.0784 0.5741 460.1822 0.4304 467.0491 0.2461 471.0711 0.3418 474.6866 0.3452 479.3829 0.4929 480.7338 0.3511 485.0071 0.4762 488.5195 0.4146 492.0068 0.5202 497.1326 0.5717 499.4988 0.6015 509.6639 0.4694 510.9348 0.3766 512.4326 0.4607 514.8430 0.1569 522.6845 0.3440 528.5173 0.0813 531.4096 0.2933 535.4987 0.3463 537.6961 0.3001 540.7574 0.3920 545.9655 0.3202 551.6589 0.3099 558.0342 0.4174 564.1285 0.4530 568.1897 0.2636 575.2021 0.3715 577.0441 0.2978 581.4207 0.2934 581.7248 0.4772 587.7741 0.3663 590.2763 0.3457 593.5632 0.4654 600.5738 0.4129 608.3763 0.3605 612.8178 0.4172 613.0102 0.3246 617.5138 0.1546 621.2260 0.4234 625.4820 0.2278 630.4578 0.2835 632.3253 0.3050 634.0943 0.4673 640.5695 0.3563 642.4076 0.1005 646.4330 0.2870 648.7999 0.2830 652.7858 0.0560 656.6578 0.2866 657.1963 0.4269 661.6664 0.2825 663.5349 0.3655 666.1951 0.4551 667.2562 0.1244 674.8993 0.2563 678.0368 0.2876 678.9057 0.4002 getting mode 7 running: ../../bin/get_modes.sh 2603031115043683922 7 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 7 calculating perturbed structure for DQ=-100 2603031115043683922.eigenfacs 2603031115043683922.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2603031115043683922.eigenfacs 2603031115043683922.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2603031115043683922.eigenfacs 2603031115043683922.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2603031115043683922.eigenfacs 2603031115043683922.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2603031115043683922.eigenfacs 2603031115043683922.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2603031115043683922.eigenfacs 2603031115043683922.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2603031115043683922.eigenfacs 2603031115043683922.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2603031115043683922.eigenfacs 2603031115043683922.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2603031115043683922.eigenfacs 2603031115043683922.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2603031115043683922.eigenfacs 2603031115043683922.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2603031115043683922.eigenfacs 2603031115043683922.atom making animated gifs 11 models are in 2603031115043683922.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2603031115043683922.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2603031115043683922.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 2603031115043683922 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 2603031115043683922.eigenfacs 2603031115043683922.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2603031115043683922.eigenfacs 2603031115043683922.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2603031115043683922.eigenfacs 2603031115043683922.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2603031115043683922.eigenfacs 2603031115043683922.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2603031115043683922.eigenfacs 2603031115043683922.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2603031115043683922.eigenfacs 2603031115043683922.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2603031115043683922.eigenfacs 2603031115043683922.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2603031115043683922.eigenfacs 2603031115043683922.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2603031115043683922.eigenfacs 2603031115043683922.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2603031115043683922.eigenfacs 2603031115043683922.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2603031115043683922.eigenfacs 2603031115043683922.atom making animated gifs 11 models are in 2603031115043683922.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2603031115043683922.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2603031115043683922.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 2603031115043683922 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 2603031115043683922.eigenfacs 2603031115043683922.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2603031115043683922.eigenfacs 2603031115043683922.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2603031115043683922.eigenfacs 2603031115043683922.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2603031115043683922.eigenfacs 2603031115043683922.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2603031115043683922.eigenfacs 2603031115043683922.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2603031115043683922.eigenfacs 2603031115043683922.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2603031115043683922.eigenfacs 2603031115043683922.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2603031115043683922.eigenfacs 2603031115043683922.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2603031115043683922.eigenfacs 2603031115043683922.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2603031115043683922.eigenfacs 2603031115043683922.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2603031115043683922.eigenfacs 2603031115043683922.atom making animated gifs 11 models are in 2603031115043683922.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2603031115043683922.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2603031115043683922.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 2603031115043683922 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 2603031115043683922.eigenfacs 2603031115043683922.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2603031115043683922.eigenfacs 2603031115043683922.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2603031115043683922.eigenfacs 2603031115043683922.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2603031115043683922.eigenfacs 2603031115043683922.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2603031115043683922.eigenfacs 2603031115043683922.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2603031115043683922.eigenfacs 2603031115043683922.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2603031115043683922.eigenfacs 2603031115043683922.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2603031115043683922.eigenfacs 2603031115043683922.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2603031115043683922.eigenfacs 2603031115043683922.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2603031115043683922.eigenfacs 2603031115043683922.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2603031115043683922.eigenfacs 2603031115043683922.atom making animated gifs 11 models are in 2603031115043683922.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2603031115043683922.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2603031115043683922.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 2603031115043683922 11 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-100 2603031115043683922.eigenfacs 2603031115043683922.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2603031115043683922.eigenfacs 2603031115043683922.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2603031115043683922.eigenfacs 2603031115043683922.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2603031115043683922.eigenfacs 2603031115043683922.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2603031115043683922.eigenfacs 2603031115043683922.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2603031115043683922.eigenfacs 2603031115043683922.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2603031115043683922.eigenfacs 2603031115043683922.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2603031115043683922.eigenfacs 2603031115043683922.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2603031115043683922.eigenfacs 2603031115043683922.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2603031115043683922.eigenfacs 2603031115043683922.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2603031115043683922.eigenfacs 2603031115043683922.atom making animated gifs 11 models are in 2603031115043683922.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2603031115043683922.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2603031115043683922.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 2603031115043683922.10.pdb 2603031115043683922.11.pdb 2603031115043683922.7.pdb 2603031115043683922.8.pdb 2603031115043683922.9.pdb STDERR: Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL real 0m39.524s user 0m39.247s sys 0m0.263s rm: cannot remove '2603031115043683922.sdijf': No such file or directory pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format




If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:

elNémo is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Between 2015 and 2025, it was hosted by US2B (Nantes).
Last modification: december 26th, 2025.