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* HORMONE 14-JAN-23 8I2H *

LOGs for ID: 2603031212113736499

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:

CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
 Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
 Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.    

 Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.

 Pdbmat> Coordinate filename     = 2603031212113736499.atom

 Pdbmat> Distance cutoff         =       8.00
         Force constant          =      10.00
         Origin of mass values   =       CONS
 Pdbmat> Levelshift              =    1.0E-09
         PRINTing level          =          2

 Pdbmat> Coordinate file 2603031212113736499.atom to be opened.

 Openam> File opened: 2603031212113736499.atom

 Pdbmat> Coordinate file in PDB format.

 Rdatompdb> Reading pdb file.
 Rdatompdb> End of file reached.
 Rdatompdb> Number of I/O errors:      0

 Rdatompdb> Number of residues found =    283
            First residue number     =    362
            Last  residue number     =      0
            Number of atoms found    =   2277
            Mean number per residue  =      8.0

 Pdbmat> Coordinate statistics: 
 =   112.260299 +/-     8.804077 From:    90.138000 To:   134.319000
 =   212.332491 +/-   822.817518 From:    69.210000 To:  9109.210000
 =   230.927495 +/-   872.433872 From:    88.005000 To:  9120.570000
 Pdbmat> Masses are all set to one.
%Pdbmat-W> residue:'UNL ' is not a well known amino-acid.

%Pdbmat-W>      1 residue(s) not known.

 Openam> File opened: pdbmat.xyzm
 Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.

 Openam> File opened: pdbmat.sdijb

 Pdbmat> Matrix statistics:

 Pdbmat> The matrix is   3.5860 % Filled.
 Pdbmat>       836775  non-zero elements.
 Pdbmat>        91483 atom-atom interactions.

 Pdbmat> Number per atom=     80.35 +/-     24.19
         Maximum number =    132
         Minimum number =      0

 Pdbmat> Matrix trace   = 1.829660E+06
 Pdbmat> Larger element =  556.402    
 Pdbmat>      0 elements larger than +/-  1.0E+10

 Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
283 non-zero elements, NRBL set to 2
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
 Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
 Diagrtb> Version 2.52, November 2004. 
 Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.

 Diagrtb> Options taken into account:

 MATRix filename          = pdbmat.sdijb
 COORdinates filename     = 2603031212113736499.atom
 Eigenvector OUTPut file  = matrix.eigenrtb
 Nb of VECTors required   =        106
 EigeNVALues chosen       =       LOWE
 Type of SUBStructuring   =       NONE
 Nb of residues per BLOck =          2
 Origin of MASS values    =       CONS
 MATRix FORMat            =       BINA
 Temporary files cleaning =       ALL 
 Output PRINting level    =          2

 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.

 Blocpdb> Entering in.

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.xyzm   

 Blocpdb> Coordinate file 2603031212113736499.atom to be opened.

 Openam> file on opening on unit     11:
 2603031212113736499.atom                                                                                                        

 Blocpdb> Coordinate file in PDB format.

 Blocpdb>  2277 atoms picked in pdb file.
 Blocpdb>   All masses set to unity.
 Blocpdb> Coordinate file is rewritten.

 Blocpdb> Substructuring:
 Blocpdb>     2 residue(s) per block.
 Blocpdb>   283 residues.
 Blocpdb>    20 atoms in block      1
 Block first atom:      1
 Blocpdb>    16 atoms in block      2
 Block first atom:     21
 Blocpdb>    18 atoms in block      3
 Block first atom:     37
 Blocpdb>    16 atoms in block      4
 Block first atom:     55
 Blocpdb>    25 atoms in block      5
 Block first atom:     71
 Blocpdb>    14 atoms in block      6
 Block first atom:     96
 Blocpdb>    16 atoms in block      7
 Block first atom:    110
 Blocpdb>    13 atoms in block      8
 Block first atom:    126
 Blocpdb>    11 atoms in block      9
 Block first atom:    139
 Blocpdb>    16 atoms in block     10
 Block first atom:    150
 Blocpdb>    15 atoms in block     11
 Block first atom:    166
 Blocpdb>    15 atoms in block     12
 Block first atom:    181
 Blocpdb>    16 atoms in block     13
 Block first atom:    196
 Blocpdb>    14 atoms in block     14
 Block first atom:    212
 Blocpdb>    15 atoms in block     15
 Block first atom:    226
 Blocpdb>    21 atoms in block     16
 Block first atom:    241
 Blocpdb>    15 atoms in block     17
 Block first atom:    262
 Blocpdb>    14 atoms in block     18
 Block first atom:    277
 Blocpdb>    22 atoms in block     19
 Block first atom:    291
 Blocpdb>    16 atoms in block     20
 Block first atom:    313
 Blocpdb>    14 atoms in block     21
 Block first atom:    329
 Blocpdb>    13 atoms in block     22
 Block first atom:    343
 Blocpdb>    16 atoms in block     23
 Block first atom:    356
 Blocpdb>    16 atoms in block     24
 Block first atom:    372
 Blocpdb>    14 atoms in block     25
 Block first atom:    388
 Blocpdb>    12 atoms in block     26
 Block first atom:    402
 Blocpdb>    20 atoms in block     27
 Block first atom:    414
 Blocpdb>    16 atoms in block     28
 Block first atom:    434
 Blocpdb>    13 atoms in block     29
 Block first atom:    450
 Blocpdb>    13 atoms in block     30
 Block first atom:    463
 Blocpdb>    16 atoms in block     31
 Block first atom:    476
 Blocpdb>    17 atoms in block     32
 Block first atom:    492
 Blocpdb>    15 atoms in block     33
 Block first atom:    509
 Blocpdb>    21 atoms in block     34
 Block first atom:    524
 Blocpdb>    18 atoms in block     35
 Block first atom:    545
 Blocpdb>    17 atoms in block     36
 Block first atom:    563
 Blocpdb>    16 atoms in block     37
 Block first atom:    580
 Blocpdb>    23 atoms in block     38
 Block first atom:    596
 Blocpdb>    11 atoms in block     39
 Block first atom:    619
 Blocpdb>     9 atoms in block     40
 Block first atom:    630
 Blocpdb>    14 atoms in block     41
 Block first atom:    639
 Blocpdb>    10 atoms in block     42
 Block first atom:    653
 Blocpdb>    15 atoms in block     43
 Block first atom:    663
 Blocpdb>    18 atoms in block     44
 Block first atom:    678
 Blocpdb>    18 atoms in block     45
 Block first atom:    696
 Blocpdb>    11 atoms in block     46
 Block first atom:    714
 Blocpdb>    17 atoms in block     47
 Block first atom:    725
 Blocpdb>    13 atoms in block     48
 Block first atom:    742
 Blocpdb>    19 atoms in block     49
 Block first atom:    755
 Blocpdb>    15 atoms in block     50
 Block first atom:    774
 Blocpdb>    13 atoms in block     51
 Block first atom:    789
 Blocpdb>    15 atoms in block     52
 Block first atom:    802
 Blocpdb>    20 atoms in block     53
 Block first atom:    817
 Blocpdb>    24 atoms in block     54
 Block first atom:    837
 Blocpdb>    15 atoms in block     55
 Block first atom:    861
 Blocpdb>    17 atoms in block     56
 Block first atom:    876
 Blocpdb>    13 atoms in block     57
 Block first atom:    893
 Blocpdb>    17 atoms in block     58
 Block first atom:    906
 Blocpdb>    14 atoms in block     59
 Block first atom:    923
 Blocpdb>    16 atoms in block     60
 Block first atom:    937
 Blocpdb>    17 atoms in block     61
 Block first atom:    953
 Blocpdb>    21 atoms in block     62
 Block first atom:    970
 Blocpdb>    10 atoms in block     63
 Block first atom:    991
 Blocpdb>    13 atoms in block     64
 Block first atom:   1001
 Blocpdb>    15 atoms in block     65
 Block first atom:   1014
 Blocpdb>    12 atoms in block     66
 Block first atom:   1029
 Blocpdb>    22 atoms in block     67
 Block first atom:   1041
 Blocpdb>    16 atoms in block     68
 Block first atom:   1063
 Blocpdb>    16 atoms in block     69
 Block first atom:   1079
 Blocpdb>    10 atoms in block     70
 Block first atom:   1095
 Blocpdb>    19 atoms in block     71
 Block first atom:   1105
 Blocpdb>    15 atoms in block     72
 Block first atom:   1124
 Blocpdb>    15 atoms in block     73
 Block first atom:   1139
 Blocpdb>    14 atoms in block     74
 Block first atom:   1154
 Blocpdb>    18 atoms in block     75
 Block first atom:   1168
 Blocpdb>    17 atoms in block     76
 Block first atom:   1186
 Blocpdb>    13 atoms in block     77
 Block first atom:   1203
 Blocpdb>    14 atoms in block     78
 Block first atom:   1216
 Blocpdb>    15 atoms in block     79
 Block first atom:   1230
 Blocpdb>    16 atoms in block     80
 Block first atom:   1245
 Blocpdb>    16 atoms in block     81
 Block first atom:   1261
 Blocpdb>    13 atoms in block     82
 Block first atom:   1277
 Blocpdb>    14 atoms in block     83
 Block first atom:   1290
 Blocpdb>    17 atoms in block     84
 Block first atom:   1304
 Blocpdb>    19 atoms in block     85
 Block first atom:   1321
 Blocpdb>    14 atoms in block     86
 Block first atom:   1340
 Blocpdb>    16 atoms in block     87
 Block first atom:   1354
 Blocpdb>    15 atoms in block     88
 Block first atom:   1370
 Blocpdb>    15 atoms in block     89
 Block first atom:   1385
 Blocpdb>    13 atoms in block     90
 Block first atom:   1400
 Blocpdb>    18 atoms in block     91
 Block first atom:   1413
 Blocpdb>    15 atoms in block     92
 Block first atom:   1431
 Blocpdb>    10 atoms in block     93
 Block first atom:   1446
 Blocpdb>    18 atoms in block     94
 Block first atom:   1456
 Blocpdb>    18 atoms in block     95
 Block first atom:   1474
 Blocpdb>    20 atoms in block     96
 Block first atom:   1492
 Blocpdb>    15 atoms in block     97
 Block first atom:   1512
 Blocpdb>    18 atoms in block     98
 Block first atom:   1527
 Blocpdb>    15 atoms in block     99
 Block first atom:   1545
 Blocpdb>    16 atoms in block    100
 Block first atom:   1560
 Blocpdb>    13 atoms in block    101
 Block first atom:   1576
 Blocpdb>    12 atoms in block    102
 Block first atom:   1589
 Blocpdb>    14 atoms in block    103
 Block first atom:   1601
 Blocpdb>    18 atoms in block    104
 Block first atom:   1615
 Blocpdb>    13 atoms in block    105
 Block first atom:   1633
 Blocpdb>    20 atoms in block    106
 Block first atom:   1646
 Blocpdb>    13 atoms in block    107
 Block first atom:   1666
 Blocpdb>    16 atoms in block    108
 Block first atom:   1679
 Blocpdb>    19 atoms in block    109
 Block first atom:   1695
 Blocpdb>    15 atoms in block    110
 Block first atom:   1714
 Blocpdb>    19 atoms in block    111
 Block first atom:   1729
 Blocpdb>    14 atoms in block    112
 Block first atom:   1748
 Blocpdb>    12 atoms in block    113
 Block first atom:   1762
 Blocpdb>    14 atoms in block    114
 Block first atom:   1774
 Blocpdb>    22 atoms in block    115
 Block first atom:   1788
 Blocpdb>    13 atoms in block    116
 Block first atom:   1810
 Blocpdb>    11 atoms in block    117
 Block first atom:   1823
 Blocpdb>    14 atoms in block    118
 Block first atom:   1834
 Blocpdb>    16 atoms in block    119
 Block first atom:   1848
 Blocpdb>    15 atoms in block    120
 Block first atom:   1864
 Blocpdb>    15 atoms in block    121
 Block first atom:   1879
 Blocpdb>    13 atoms in block    122
 Block first atom:   1894
 Blocpdb>    14 atoms in block    123
 Block first atom:   1907
 Blocpdb>    17 atoms in block    124
 Block first atom:   1921
 Blocpdb>    16 atoms in block    125
 Block first atom:   1938
 Blocpdb>    15 atoms in block    126
 Block first atom:   1954
 Blocpdb>    21 atoms in block    127
 Block first atom:   1969
 Blocpdb>    15 atoms in block    128
 Block first atom:   1990
 Blocpdb>    14 atoms in block    129
 Block first atom:   2005
 Blocpdb>    11 atoms in block    130
 Block first atom:   2019
 Blocpdb>    15 atoms in block    131
 Block first atom:   2030
 Blocpdb>    19 atoms in block    132
 Block first atom:   2045
 Blocpdb>    17 atoms in block    133
 Block first atom:   2064
 Blocpdb>    19 atoms in block    134
 Block first atom:   2081
 Blocpdb>    16 atoms in block    135
 Block first atom:   2100
 Blocpdb>    19 atoms in block    136
 Block first atom:   2116
 Blocpdb>    22 atoms in block    137
 Block first atom:   2135
 Blocpdb>    19 atoms in block    138
 Block first atom:   2157
 Blocpdb>    19 atoms in block    139
 Block first atom:   2176
 Blocpdb>    16 atoms in block    140
 Block first atom:   2195
 Blocpdb>    15 atoms in block    141
 Block first atom:   2211
 Blocpdb>    52 atoms in block    142
 Block first atom:   2225

 Blocpdb>   142 blocks.

 Blocpdb> At most,     52 atoms in each of them.
 Blocpdb> At least,     9 atoms in each of them.

 Blocpdb> Normal end of Blocpdb.

 Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
 Diagrtb> Memory allocation for RTB.
 Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
 Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.

 Prepmat> Entering in.
 Prepmat> Rewriting of the matrix begins.

 Prepmat>       836917 matrix lines read.

 Prepmat> Matrix order    =       6831

 Prepmat> Matrix trace    =    1829660.0000
 Prepmat> Last element read:    6831   6831         0.0000
 Prepmat>        10154 lines saved.
 Prepmat>         8727 empty lines.
 Prepmat> Number of lines on output is as expected.
 Prepmat> Normal end of Prepmat.

 RTB> Entering in.
 RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file:  2277
 RTB> Total mass =        2277.0000
 RTB> Number of atoms found in matrix:  2277
 RTB> Number of blocks =   142
 RTB> Projection begins.
 RTB> Projected matrix is being saved.
 RTB> Projected matrix trace =  194770.4490
 RTB>     49206 non-zero elements.
 RTB> Normal end of RTB.

 Diagstd> Entering in.

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.sdijb                      
 Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb                      
 Diagstd> CERFACS matrix format.
 Diagstd> Projected matrix order =      852
 Diagstd> Nb of non-zero elements:    49206
 Diagstd> Projected matrix trace =  194770.4490

 Openam> file on opening on unit     11:
 diagrtb_work.eigenfacs                  
 Diagstd> Diagonalization.

 Diagstd>    852 eigenvectors are computed. 
 Diagstd>    106 of them to be saved. 

 Diagstd> Sum of eigenvalues = 194770.4490
 Diagstd> Best zero-eigenvalue found  :     0.000000

 Diagstd>     12 zero-eigenvalues, that is, below or equal to:    0.0000000
%Diagstd-Wn> Six expected. Parts of the structure interact too little ?

 Diagstd> Selected eigenvalues: 
      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000
      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000
      0.0000000      0.0000000      1.7331013      2.7970741      3.0226724
      3.9418176      4.6000269      4.9265313      6.1385454      6.8519665
      7.6797269      7.7290763      8.3639872      8.9888923      9.9619470
     10.6358332     11.2733992     12.0435745     12.1256362     12.8752289
     13.7401858     14.4306976     14.8501235     15.5604182     16.3042903
     16.7294899     17.1643557     18.6581908     19.6982613     20.0094520
     21.4888198     22.0415855     22.8945295     23.2574064     24.5012955
     24.7834570     25.4961243     26.8547967     27.7451834     27.9465630
     28.8953255     29.5711090     30.1446654     30.3365858     31.4039885
     33.1126200     33.6360402     34.3140270     35.5693210     36.2148726
     36.8165302     37.2494287     37.5336051     38.1264986     39.2630523
     39.5893969     40.5794396     41.2132912     41.8331198     42.9647723
     43.5054438     44.0988630     44.8378174     44.9987806     46.3177361
     46.8376475     47.6679050     48.2092721     49.1637384     50.2130789
     50.6842539     51.2052804     52.1761239     52.8334009     53.7461214
     54.5163758     54.9132322     55.8497951     56.0386238     56.5720206
     57.5966618     58.1507035     59.8700529     60.0924711     60.5069674
     62.3721480     63.0682292     63.7324922     63.9886096     65.1909706
     66.0046888     66.5576087     67.0302123     68.0147148     68.4642088
     69.6865738

 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
      0.0034323      0.0034326      0.0034330      0.0034333      0.0034338
      0.0034340      0.0034340      0.0034340      0.0034340      0.0034340
      0.0034340      0.0034343    142.9576014    181.6131381    188.7951442
    215.5974116    232.9032057    241.0271145    269.0469143    284.2515846
    300.9318598    301.8971946    314.0522871    325.5729897    342.7420528
    354.1449386    364.6050861    376.8538717    378.1355831    389.6482759
    402.5238171    412.5142384    418.4661306    428.3570437    438.4764060
    444.1571210    449.8927905    469.0617781    481.9580376    485.7500759
    503.3864982    509.8197967    519.5904281    523.6919781    537.5140297
    540.6002256    548.3178246    562.7379635    571.9908481    574.0629027
    583.7260507    590.5124874    596.2117272    598.1066499    608.5379754
    624.8734219    629.7928295    636.1083908    647.6391102    653.4897220
    658.8957527    662.7581673    665.2814597    670.5153766    680.4360420
    683.2579969    691.7486224    697.1302513    702.3529443    711.7894352
    716.2540356    721.1223841    727.1391236    728.4431319    739.0416975
    743.1779521    749.7359105    753.9812868    761.4085158    769.4912858
    773.0931217    777.0566022    784.3884434    789.3135599    796.1022377
    801.7865535    804.6995972    811.5327901    812.9035326    816.7631316
    824.1266094    828.0808985    840.2337094    841.7930039    844.6912073
    857.6115686    862.3838182    866.9134299    868.6535864    876.7767073
    882.2317314    885.9192435    889.0589896    895.5641930    898.5186113
    906.5042332

 Diagstd> Normal end.

 Rtb_to_modes> Entering in.

 Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file =   2277
 Rtb_to_modes> Number of blocs =    142

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.eigenfacs                  

 Openam> file on opening on unit     11:
 matrix.eigenrtb                         

 Rdmodfacs> Entering in.

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     1
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9905E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     2
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9921E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     3
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9945E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     4
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9961E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     5
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9990E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     6
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0000E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     7
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0000E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     8
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0000E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     9
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0000E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    10
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0000E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    11
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0000E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    12
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0002E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    13
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   1.733    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    14
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   2.797    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    15
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   3.023    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    16
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   3.942    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    17
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   4.600    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    18
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   4.927    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    19
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   6.139    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    20
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   6.852    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    21
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   7.680    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    22
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   7.729    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    23
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   8.364    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    24
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   8.989    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    25
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   9.962    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    26
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   10.64    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    27
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   11.27    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    28
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   12.04    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    29
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   12.13    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    30
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   12.88    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    31
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   13.74    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    32
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   14.43    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    33
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   14.85    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    34
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   15.56    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    35
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   16.30    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    36
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   16.73    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    37
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   17.16    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    38
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   18.66    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    39
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   19.70    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    40
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   20.01    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    41
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   21.49    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    42
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   22.04    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    43
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   22.89    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    44
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   23.26    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    45
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   24.50    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    46
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   24.78    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    47
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   25.50    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    48
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   26.85    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    49
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   27.75    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    50
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   27.95    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    51
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   28.90    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    52
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   29.57    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    53
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   30.14    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    54
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   30.34    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    55
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   31.40    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    56
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   33.11    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    57
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   33.64    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    58
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   34.31    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    59
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   35.57    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    60
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   36.21    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    61
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   36.82    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    62
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   37.25    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    63
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   37.53    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    64
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   38.13    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    65
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   39.26    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    66
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   39.59    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    67
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   40.58    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    68
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   41.21    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    69
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   41.83    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    70
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   42.96    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    71
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   43.51    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    72
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   44.10    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    73
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   44.84    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    74
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   45.00    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    75
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   46.32    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    76
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   46.84    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    77
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   47.67    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    78
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   48.21    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    79
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   49.16    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    80
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   50.21    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    81
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   50.68    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    82
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   51.21    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    83
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   52.18    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    84
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   52.83    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    85
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   53.75    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    86
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   54.52    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    87
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   54.91    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    88
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   55.85    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    89
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   56.04    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    90
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   56.57    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    91
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   57.60    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    92
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   58.15    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    93
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   59.87    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    94
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   60.09    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    95
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   60.51    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    96
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   62.37    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    97
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   63.07    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    98
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   63.73    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    99
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   63.99    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   100
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   65.19    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   101
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   66.00    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   102
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   66.56    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   103
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   67.03    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   104
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   68.01    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   105
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   68.46    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   106
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   69.69    

 Rtb_to_modes>  106 vectors, with    852 coordinates in vector file.

 Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 1.00002
 0.99997 0.99994 1.00003 0.99998 1.00001
 1.00003 1.00001 0.99998 1.00001 1.00002
 1.00000 0.99998 1.00000 1.00000 0.99998
 1.00002 0.99998 0.99999 0.99996 0.99999
 0.99997 1.00000 0.99998 1.00001 0.99997
 0.99999 1.00002 1.00001 0.99999 0.99999
 1.00000 0.99997 1.00000 1.00002 0.99999
 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 1.00002
 0.99997 0.99999 1.00001 1.00001 0.99999
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 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001
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 1.00002 1.00002 0.99997 1.00002 1.00002
 1.00001 0.99998 1.00001 1.00001 0.99999
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 1.00000 0.99998 0.99999 1.00001 1.00000
 1.00000

 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
 Rtb_to_modes>    40986 lines found in RTB file.

 Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 1.00002
 0.99997 0.99994 1.00003 0.99998 1.00001
 1.00003 1.00001 0.99998 1.00001 1.00002
 1.00000 0.99998 1.00000 1.00000 0.99998
 1.00002 0.99998 0.99999 0.99996 0.99999
 0.99997 1.00000 0.99998 1.00001 0.99997
 0.99999 1.00002 1.00001 0.99999 0.99999
 1.00000 0.99997 1.00000 1.00002 0.99999
 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 1.00002
 0.99997 0.99999 1.00001 1.00001 0.99999
 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 0.99999
 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001
 0.99998 1.00001 0.99997 0.99999 0.99997
 1.00000 1.00001 1.00000 0.99997 0.99999
 1.00002 1.00002 0.99997 1.00002 1.00002
 1.00001 0.99998 1.00001 1.00001 0.99999
 0.99999 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000
 1.00000 0.99999 1.00003 1.00000 1.00001
 1.00002 1.00001 0.99998 1.00001 0.99998
 1.00001 0.99999 1.00002 1.00002 0.99999
 1.00000 0.99998 0.99999 1.00001 1.00000
 1.00000

 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
 Vector   2:-0.000
 Vector   3:-0.000-0.000
 Vector   4:-0.000 0.000-0.000
 Vector   5:-0.000 0.000-0.000 0.000
 Vector   6: 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
 Vector   7: 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000
 Vector   8: 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
 Vector   9: 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000
 Vector  10: 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000

 Rtb_to_modes>   106 eigenvectors saved.

 Rtb_to_modes> Normal end.

 Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
 Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.                
 Getnam> Eigenvector filename ?
 Getnam> 2603031212113736499.eigenfacs

 Openam> file on opening on unit     10:
 2603031212113736499.eigenfacs                                   
 Getnam> Corresponding pdb filename ?
 Getnam> 2603031212113736499.atom

 Openam> file on opening on unit     11:
 2603031212113736499.atom                                        
 Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
 Getnum>            0
 Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
 Getnum>        10000
%Getnum-Err: number larger than    106 This is not allowed. Sorry.

 Rdatompdb> Reading pdb file.
 Rdatompdb> End of file reached.
 Rdatompdb> Number of I/O errors:            0

 Rdatompdb> Number of residues found =    283
            First residue number     =    362
            Last  residue number     =      0
            Number of atoms found    =   2277
            Mean number per residue  =      8.0

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     1
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9905E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     2
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9921E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     3
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9945E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     4
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9961E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     5
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9990E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     6
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0000E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     7
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0000E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     8
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0000E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     9
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0000E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    10
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0000E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    11
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0000E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    12
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0002E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    13
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   1.733    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    14
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   2.797    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    15
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   3.023    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    16
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   3.942    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    17
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   4.600    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    18
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   4.927    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    19
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   6.139    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    20
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   6.852    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    21
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   7.680    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    22
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   7.729    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    23
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   8.364    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    24
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   8.989    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    25
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   9.962    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    26
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   10.64    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    27
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   11.27    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    28
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   12.04    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    29
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   12.13    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    30
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   12.88    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    31
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   13.74    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    32
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   14.43    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    33
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   14.85    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    34
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   15.56    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    35
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   16.30    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    36
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   16.73    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    37
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   17.16    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    38
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   18.66    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    39
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   19.70    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    40
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   20.01    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    41
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   21.49    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    42
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   22.04    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    43
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   22.89    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    44
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   23.26    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    45
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   24.50    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    46
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   24.78    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    47
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   25.50    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    48
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   26.85    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    49
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   27.75    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    50
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   27.95    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    51
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   28.90    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    52
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   29.57    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    53
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   30.14    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    54
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   30.34    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    55
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   31.40    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    56
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   33.11    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    57
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   33.64    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    58
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   34.31    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    59
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   35.57    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    60
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   36.21    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    61
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   36.82    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    62
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   37.25    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    63
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   37.53    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    64
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   38.13    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    65
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   39.26    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    66
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   39.59    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    67
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   40.58    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    68
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   41.21    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    69
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   41.83    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    70
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   42.96    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    71
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   43.51    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    72
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   44.10    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    73
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   44.84    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    74
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   45.00    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    75
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   46.32    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    76
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   46.84    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    77
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   47.67    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    78
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   48.21    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    79
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   49.16    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    80
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   50.21    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    81
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   50.68    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    82
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   51.21    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    83
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   52.18    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    84
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   52.83    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    85
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   53.75    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    86
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   54.52    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    87
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   54.91    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    88
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   55.85    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    89
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   56.04    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    90
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   56.57    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    91
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   57.60    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    92
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   58.15    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    93
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   59.87    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    94
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   60.09    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    95
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   60.51    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    96
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   62.37    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    97
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   63.07    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    98
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   63.73    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    99
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   63.99    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   100
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   65.19    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   101
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   66.00    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   102
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   66.56    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   103
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   67.03    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   104
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   68.01    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   105
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   68.46    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   106
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   69.69    

 Bfactors>  106 vectors,   6831 coordinates in file.

 Openam> file on opening on unit     12:
 bfactors.pred                                                   

 Bfactors> Best zero-eigenvalue found  :     0.000000
 Bfactors>    12 eigenvalues less than :     0.000000
 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue  :     1.733000
 Bfactors>    94 eigenvectors will be considered.
 Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.

 Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
          (CHARMM units assumed for eigenvalues)

 Bfactors> Correlation=     -0.345 for    282 C-alpha atoms.
 Bfactors> =      0.034 +/-   0.03
 Bfactors> =     85.747 +/-   9.57
 Bfactors> Shiftng-fct=     85.713
 Bfactors> Scaling-fct=    279.179

 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.

 Bfactors> Normal end.
check_modes
 Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.                
 Getnam> Eigenvector filename ?
 Getnam> 2603031212113736499.eigenfacs

 Openam> file on opening on unit     10:
 2603031212113736499.eigenfacs                                   

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     1
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4322E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     2
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4325E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     3
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4329E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     4
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4331E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     5
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4336E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     6
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4338E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     7
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4338E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     8
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4338E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     9
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4338E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    10
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4338E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    11
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4338E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    12
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4342E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    13
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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   889.0    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   898.5    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   906.5    

 Chkmod>  106 vectors,   6831 coordinates in file.
 Chkmod>      That is:   2277 cartesian points.

 Openam> file on opening on unit     11:
 Chkmod.res                                                      
 Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.

 Chkmod> Normal end.
      0.0034         NaN
      0.0034         NaN
      0.0034         NaN
      0.0034         NaN
      0.0034         NaN
      0.0034         NaN
      0.0034         NaN
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      0.0034         NaN
      0.0034         NaN
      0.0034         NaN
      0.0034         NaN
    142.9473         NaN
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    519.5167         NaN
    523.6987         NaN
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    898.4524         NaN
    906.4876         NaN
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2603031212113736499 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
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calculating perturbed structure for DQ=-60
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calculating perturbed structure for DQ=0
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calculating perturbed structure for DQ=20
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getting mode 8
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
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MODEL 7 will be plotted
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making thumbnail 100x100
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
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MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
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making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
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MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
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making small animated gif 100x100
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
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MODEL 1 will be plotted
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making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
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2603031212113736499.8.pdb
2603031212113736499.9.pdb



STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL

real	0m9.872s
user	0m9.811s
sys	0m0.059s
rm: cannot remove '2603031212113736499.sdijf': No such file or directory
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_INVALID_FLAG IEEE_DIVIDE_BY_ZERO
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K. Suhre & Y.H. Sanejouand, ElNemo: a normal mode web-server for protein movement analysis and the generation of templates for molecular replacement. Nucleic Acids Research, 32, W610-W614, 2004.
K. Suhre & Y.H. Sanejouand, On the potential of normal mode analysis for solving difficult molecular replacement problems. Acta Cryst. D vol.60, p796-799, 2004 © International Union of Crystallography.
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Still some additional cleaning from time to time
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