*** ***
Output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 2603031856443846125.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 2603031856443846125.atom to be opened.
Openam> File opened: 2603031856443846125.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 430
First residue number = 283
Last residue number = 747
Number of atoms found = 3587
Mean number per residue = 8.3
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 121.969681 +/- 15.695157 From: 93.014000 To: 164.484000
= 154.158225 +/- 9.663503 From: 125.376000 To: 176.529000
= 145.776508 +/- 22.122884 From: 103.921000 To: 192.308000
Pdbmat> Masses are all set to one.
%Pdbmat-W> residue:'UNL ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> 1 residue(s) not known.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 2.2246 % Filled.
Pdbmat> 1288161 non-zero elements.
Pdbmat> 140766 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 78.49 +/- 22.46
Maximum number = 135
Minimum number = 10
Pdbmat> Matrix trace = 2.815320E+06
Pdbmat> Larger element = 510.172
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
430 non-zero elements, NRBL set to 3
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 2603031856443846125.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 3
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 2603031856443846125.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
2603031856443846125.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 3587 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 3 residue(s) per block.
Blocpdb> 430 residues.
Blocpdb> 19 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 22 atoms in block 2
Block first atom: 20
Blocpdb> 23 atoms in block 3
Block first atom: 42
Blocpdb> 23 atoms in block 4
Block first atom: 65
Blocpdb> 21 atoms in block 5
Block first atom: 88
Blocpdb> 22 atoms in block 6
Block first atom: 109
Blocpdb> 24 atoms in block 7
Block first atom: 131
Blocpdb> 25 atoms in block 8
Block first atom: 155
Blocpdb> 26 atoms in block 9
Block first atom: 180
Blocpdb> 25 atoms in block 10
Block first atom: 206
Blocpdb> 24 atoms in block 11
Block first atom: 231
Blocpdb> 18 atoms in block 12
Block first atom: 255
Blocpdb> 25 atoms in block 13
Block first atom: 273
Blocpdb> 24 atoms in block 14
Block first atom: 298
Blocpdb> 26 atoms in block 15
Block first atom: 322
Blocpdb> 23 atoms in block 16
Block first atom: 348
Blocpdb> 24 atoms in block 17
Block first atom: 371
Blocpdb> 22 atoms in block 18
Block first atom: 395
Blocpdb> 21 atoms in block 19
Block first atom: 417
Blocpdb> 16 atoms in block 20
Block first atom: 438
Blocpdb> 19 atoms in block 21
Block first atom: 454
Blocpdb> 19 atoms in block 22
Block first atom: 473
Blocpdb> 25 atoms in block 23
Block first atom: 492
Blocpdb> 25 atoms in block 24
Block first atom: 517
Blocpdb> 28 atoms in block 25
Block first atom: 542
Blocpdb> 26 atoms in block 26
Block first atom: 570
Blocpdb> 26 atoms in block 27
Block first atom: 596
Blocpdb> 24 atoms in block 28
Block first atom: 622
Blocpdb> 31 atoms in block 29
Block first atom: 646
Blocpdb> 30 atoms in block 30
Block first atom: 677
Blocpdb> 21 atoms in block 31
Block first atom: 707
Blocpdb> 24 atoms in block 32
Block first atom: 728
Blocpdb> 20 atoms in block 33
Block first atom: 752
Blocpdb> 28 atoms in block 34
Block first atom: 772
Blocpdb> 20 atoms in block 35
Block first atom: 800
Blocpdb> 21 atoms in block 36
Block first atom: 820
Blocpdb> 26 atoms in block 37
Block first atom: 841
Blocpdb> 21 atoms in block 38
Block first atom: 867
Blocpdb> 24 atoms in block 39
Block first atom: 888
Blocpdb> 23 atoms in block 40
Block first atom: 912
Blocpdb> 21 atoms in block 41
Block first atom: 935
Blocpdb> 22 atoms in block 42
Block first atom: 956
Blocpdb> 29 atoms in block 43
Block first atom: 978
Blocpdb> 24 atoms in block 44
Block first atom: 1007
Blocpdb> 23 atoms in block 45
Block first atom: 1031
Blocpdb> 27 atoms in block 46
Block first atom: 1054
Blocpdb> 25 atoms in block 47
Block first atom: 1081
Blocpdb> 31 atoms in block 48
Block first atom: 1106
Blocpdb> 30 atoms in block 49
Block first atom: 1137
Blocpdb> 27 atoms in block 50
Block first atom: 1167
Blocpdb> 31 atoms in block 51
Block first atom: 1194
Blocpdb> 30 atoms in block 52
Block first atom: 1225
Blocpdb> 30 atoms in block 53
Block first atom: 1255
Blocpdb> 26 atoms in block 54
Block first atom: 1285
Blocpdb> 24 atoms in block 55
Block first atom: 1311
Blocpdb> 23 atoms in block 56
Block first atom: 1335
Blocpdb> 22 atoms in block 57
Block first atom: 1358
Blocpdb> 30 atoms in block 58
Block first atom: 1380
Blocpdb> 20 atoms in block 59
Block first atom: 1410
Blocpdb> 22 atoms in block 60
Block first atom: 1430
Blocpdb> 29 atoms in block 61
Block first atom: 1452
Blocpdb> 24 atoms in block 62
Block first atom: 1481
Blocpdb> 19 atoms in block 63
Block first atom: 1505
Blocpdb> 34 atoms in block 64
Block first atom: 1524
Blocpdb> 18 atoms in block 65
Block first atom: 1558
Blocpdb> 25 atoms in block 66
Block first atom: 1576
Blocpdb> 19 atoms in block 67
Block first atom: 1601
Blocpdb> 15 atoms in block 68
Block first atom: 1620
Blocpdb> 34 atoms in block 69
Block first atom: 1635
Blocpdb> 26 atoms in block 70
Block first atom: 1669
Blocpdb> 29 atoms in block 71
Block first atom: 1695
Blocpdb> 28 atoms in block 72
Block first atom: 1724
Blocpdb> 29 atoms in block 73
Block first atom: 1752
Blocpdb> 23 atoms in block 74
Block first atom: 1781
Blocpdb> 25 atoms in block 75
Block first atom: 1804
Blocpdb> 21 atoms in block 76
Block first atom: 1829
Blocpdb> 27 atoms in block 77
Block first atom: 1850
Blocpdb> 27 atoms in block 78
Block first atom: 1877
Blocpdb> 27 atoms in block 79
Block first atom: 1904
Blocpdb> 25 atoms in block 80
Block first atom: 1931
Blocpdb> 23 atoms in block 81
Block first atom: 1956
Blocpdb> 20 atoms in block 82
Block first atom: 1979
Blocpdb> 31 atoms in block 83
Block first atom: 1999
Blocpdb> 26 atoms in block 84
Block first atom: 2030
Blocpdb> 30 atoms in block 85
Block first atom: 2056
Blocpdb> 18 atoms in block 86
Block first atom: 2086
Blocpdb> 26 atoms in block 87
Block first atom: 2104
Blocpdb> 19 atoms in block 88
Block first atom: 2130
Blocpdb> 26 atoms in block 89
Block first atom: 2149
Blocpdb> 23 atoms in block 90
Block first atom: 2175
Blocpdb> 32 atoms in block 91
Block first atom: 2198
Blocpdb> 22 atoms in block 92
Block first atom: 2230
Blocpdb> 29 atoms in block 93
Block first atom: 2252
Blocpdb> 20 atoms in block 94
Block first atom: 2281
Blocpdb> 24 atoms in block 95
Block first atom: 2301
Blocpdb> 25 atoms in block 96
Block first atom: 2325
Blocpdb> 25 atoms in block 97
Block first atom: 2350
Blocpdb> 27 atoms in block 98
Block first atom: 2375
Blocpdb> 25 atoms in block 99
Block first atom: 2402
Blocpdb> 30 atoms in block 100
Block first atom: 2427
Blocpdb> 27 atoms in block 101
Block first atom: 2457
Blocpdb> 26 atoms in block 102
Block first atom: 2484
Blocpdb> 26 atoms in block 103
Block first atom: 2510
Blocpdb> 18 atoms in block 104
Block first atom: 2536
Blocpdb> 21 atoms in block 105
Block first atom: 2554
Blocpdb> 25 atoms in block 106
Block first atom: 2575
Blocpdb> 8 atoms in block 107
Block first atom: 2600
Blocpdb> 26 atoms in block 108
Block first atom: 2608
Blocpdb> 26 atoms in block 109
Block first atom: 2634
Blocpdb> 19 atoms in block 110
Block first atom: 2660
Blocpdb> 25 atoms in block 111
Block first atom: 2679
Blocpdb> 31 atoms in block 112
Block first atom: 2704
Blocpdb> 19 atoms in block 113
Block first atom: 2735
Blocpdb> 20 atoms in block 114
Block first atom: 2754
Blocpdb> 28 atoms in block 115
Block first atom: 2774
Blocpdb> 24 atoms in block 116
Block first atom: 2802
Blocpdb> 31 atoms in block 117
Block first atom: 2826
Blocpdb> 21 atoms in block 118
Block first atom: 2857
Blocpdb> 27 atoms in block 119
Block first atom: 2878
Blocpdb> 24 atoms in block 120
Block first atom: 2905
Blocpdb> 24 atoms in block 121
Block first atom: 2929
Blocpdb> 23 atoms in block 122
Block first atom: 2953
Blocpdb> 28 atoms in block 123
Block first atom: 2976
Blocpdb> 24 atoms in block 124
Block first atom: 3004
Blocpdb> 24 atoms in block 125
Block first atom: 3028
Blocpdb> 21 atoms in block 126
Block first atom: 3052
Blocpdb> 20 atoms in block 127
Block first atom: 3073
Blocpdb> 24 atoms in block 128
Block first atom: 3093
Blocpdb> 22 atoms in block 129
Block first atom: 3117
Blocpdb> 24 atoms in block 130
Block first atom: 3139
Blocpdb> 30 atoms in block 131
Block first atom: 3163
Blocpdb> 26 atoms in block 132
Block first atom: 3193
Blocpdb> 24 atoms in block 133
Block first atom: 3219
Blocpdb> 23 atoms in block 134
Block first atom: 3243
Blocpdb> 24 atoms in block 135
Block first atom: 3266
Blocpdb> 26 atoms in block 136
Block first atom: 3290
Blocpdb> 23 atoms in block 137
Block first atom: 3316
Blocpdb> 28 atoms in block 138
Block first atom: 3339
Blocpdb> 27 atoms in block 139
Block first atom: 3367
Blocpdb> 19 atoms in block 140
Block first atom: 3394
Blocpdb> 16 atoms in block 141
Block first atom: 3413
Blocpdb> 37 atoms in block 142
Block first atom: 3429
Blocpdb> 28 atoms in block 143
Block first atom: 3466
Blocpdb> 24 atoms in block 144
Block first atom: 3494
Blocpdb> 70 atoms in block 145
Block first atom: 3517
Blocpdb> 145 blocks.
Blocpdb> At most, 70 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 8 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 1288306 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 10761
Prepmat> Matrix trace = 2815320.0000
Prepmat> Last element read: 10761 10761 300.1598
Prepmat> 10586 lines saved.
Prepmat> 9311 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 3587
RTB> Total mass = 3587.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 3587
RTB> Number of blocks = 145
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 172278.2506
RTB> 43689 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 870
Diagstd> Nb of non-zero elements: 43689
Diagstd> Projected matrix trace = 172278.2506
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 870 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 172278.2506
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.0441472 0.1348623 0.2979619 0.6701486
0.7401489 1.0614646 1.3717431 1.8784067 2.7378467
2.8600064 3.5230028 4.0557646 4.4540939 5.1067907
5.4664047 6.5491835 7.6757008 7.8417432 8.6491721
9.2105063 9.4759200 10.1176899 10.2428786 10.8798478
11.1140580 11.5877713 11.7756290 12.8620654 13.1057797
13.6588927 13.9140258 14.6936094 14.9539191 15.3265742
16.0335991 16.4239871 17.2572233 17.8731185 18.6553687
19.3037729 20.0079859 20.1313850 21.1391918 21.3158162
21.8400363 22.5717979 22.9760173 23.5355263 23.7356760
23.8729402 24.7233783 25.0502596 25.9783713 26.3042679
26.9403429 27.3536897 27.7841331 28.0947544 28.4330440
29.7324614 30.1437233 30.6382785 31.2992657 31.8694722
32.0002984 32.2152493 33.3585743 33.7794131 34.1570892
34.8006071 35.5760994 35.8065290 35.9687336 36.5465734
37.2546269 37.3431603 38.4075854 38.8131044 39.2048175
39.8984625 40.1676392 40.7434496 41.3903290 42.2789639
42.5800920 43.3879018 44.0534018 44.2023846 44.5302932
44.6904718 45.0591796 45.1904860 45.6528285 46.5631837
47.1173444 47.6938960 48.2984920 48.5757497 49.2158523
49.5402258
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034331 0.0034331 0.0034333 0.0034334 0.0034335
0.0034342 22.8163883 39.8786568 59.2755536 88.8957170
93.4232179 111.8788610 127.1837623 148.8298692 179.6800431
183.6448628 203.8223364 218.6913730 229.1790764 245.3970341
253.8903361 277.9001999 300.8529666 304.0896142 319.3614937
329.5619256 334.2765983 345.4108405 347.5411975 358.1844183
362.0192051 369.6538538 372.6381686 389.4490401 393.1214242
401.3312952 405.0621676 416.2550604 419.9260276 425.1261566
434.8212807 440.0829849 451.1082182 459.0874782 469.0263028
477.1076495 485.7322803 487.2278529 499.2745968 501.3560539
507.4835377 515.9152401 520.5142874 526.8139144 529.0492251
530.5767749 539.9445814 543.5023123 553.4791174 556.9399733
563.6335548 567.9410220 572.3921982 575.5829231 579.0378577
592.1213382 596.2024103 601.0733319 607.5224830 613.0313938
614.2883720 616.3480528 627.1898496 631.1336419 634.6520794
640.6025903 647.7008178 649.7950405 651.2651719 656.4756351
662.8044101 663.5915000 672.9825183 676.5259665 679.9312441
685.9198327 688.2297376 693.1451338 698.6259599 706.0857525
708.5958070 715.2858018 720.7505878 721.9683010 724.6412581
725.9433818 728.9318396 729.9931524 733.7179182 740.9972796
745.3936401 749.9402801 754.6786531 756.8416717 761.8119579
764.3183231
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 3587
Rtb_to_modes> Number of blocs = 145
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9949E-10
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.54
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 870 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
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1.00000
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 64566 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
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1.00000 1.00000 0.99998 1.00002 1.00000
1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001
1.00000 1.00000 1.00001 1.00003 1.00001
1.00000
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2:-0.000
Vector 3: 0.000-0.000
Vector 4: 0.000 0.000-0.000
Vector 5:-0.000 0.000-0.000 0.000
Vector 6: 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000
Vector 7: 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000
Vector 8:-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000
Vector 9: 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000
Vector 10: 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2603031856443846125.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2603031856443846125.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 2603031856443846125.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2603031856443846125.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 430
First residue number = 283
Last residue number = 747
Number of atoms found = 3587
Mean number per residue = 8.3
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1349
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2980
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6701
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7401
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.061
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.24
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.88
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.32
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.87
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.58
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.06
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.65
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.69
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.58
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.54
Bfactors> 106 vectors, 10761 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.044147
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= -0.388 for 429 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.185 +/- 0.23
Bfactors> = 98.575 +/- 31.64
Bfactors> Shiftng-fct= 98.390
Bfactors> Scaling-fct= 139.807
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2603031856443846125.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2603031856443846125.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4329E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4330E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4331E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4333E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4333E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 22.82
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 39.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 59.28
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 88.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 93.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 111.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 127.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 148.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 179.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 183.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 203.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 218.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 229.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 245.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 253.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 277.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 300.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 304.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 319.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 329.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 334.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 345.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 347.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 358.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 361.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 369.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 372.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 389.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 393.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 401.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 405.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 416.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 419.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 425.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 434.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 440.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 451.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 459.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 469.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 477.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 485.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 487.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 499.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 501.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 507.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 515.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 520.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 526.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 529.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 530.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 539.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 543.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 553.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 556.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 563.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 567.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 572.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 575.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 579.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 592.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 596.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 601.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 607.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 613.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 614.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 616.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 627.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 631.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 634.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 640.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 647.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 649.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 651.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 656.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 662.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 663.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 673.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 676.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 679.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 685.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 688.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 693.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 698.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 706.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 708.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 715.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 720.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 721.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 724.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 725.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 728.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 730.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 733.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 740.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 745.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 749.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 754.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 756.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 761.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 764.3
Chkmod> 106 vectors, 10761 coordinates in file.
Chkmod> That is: 3587 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector 10 is: 0.9999 (instead of 1.0000).
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.7085
0.0034 0.7618
0.0034 0.8833
0.0034 0.7528
0.0034 0.9494
0.0034 0.8963
22.8154 0.4827
39.8825 0.4296
59.2768 0.3156
88.8887 0.4617
93.4161 0.5569
111.8496 0.5640
127.1902 0.6246
148.8074 0.3286
179.6774 0.5327
183.6368 0.4568
203.8135 0.5185
218.6883 0.5420
229.1668 0.3579
245.3915 0.4360
253.8700 0.2766
277.8844 0.4590
300.8459 0.1525
304.0815 0.2792
319.3446 0.1853
329.5566 0.4424
334.2637 0.1439
345.4354 0.1650
347.4774 0.2399
358.1715 0.4447
361.9376 0.2783
369.6735 0.4761
372.6913 0.2706
389.4011 0.2845
393.1678 0.4107
401.3303 0.1314
404.9862 0.1496
416.1861 0.2827
419.8530 0.3118
425.1554 0.4847
434.7538 0.3985
440.0107 0.3938
451.1251 0.4310
459.0277 0.4310
469.0644 0.4558
477.0405 0.3260
485.7359 0.4425
487.1902 0.3942
499.2627 0.4470
501.3837 0.2945
507.4613 0.3653
515.8725 0.3795
520.5371 0.4083
526.8414 0.2669
529.0747 0.3240
530.5213 0.4050
539.8845 0.2045
543.4762 0.3386
553.4727 0.3724
556.8709 0.3118
563.6058 0.1421
567.8783 0.3564
572.3251 0.2642
575.5095 0.3244
578.9820 0.4383
592.0714 0.4374
596.1400 0.4534
601.0644 0.5089
607.5035 0.3706
613.0102 0.4980
614.2591 0.1523
616.3670 0.2297
627.1763 0.3976
631.1120 0.4045
634.6519 0.5218
640.5695 0.3365
647.7085 0.4159
649.7986 0.4156
651.2487 0.4219
656.4782 0.2430
662.7348 0.4633
663.5349 0.4067
672.9748 0.4944
676.4699 0.4277
679.8603 0.4890
685.9036 0.3927
688.2204 0.4720
693.0860 0.4404
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Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 0m16.473s
user 0m16.316s
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rm: cannot remove '2603031856443846125.sdijf': No such file or directory
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