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***  AchE_nma  ***

LOGs for ID: 2603032141003867201

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2603032141003867201.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2603032141003867201.atom to be opened. Openam> File opened: 2603032141003867201.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 528 First residue number = 5 Last residue number = 541 Number of atoms found = 4087 Mean number per residue = 7.7 Pdbmat> Coordinate statistics: = -25.300529 +/- 13.406233 From: -55.519000 To: 5.964000 = 22.446334 +/- 14.336655 From: -11.304000 To: 58.620000 = 0.649277 +/- 11.012410 From: -25.041000 To: 26.608000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 2.1286 % Filled. Pdbmat> 1600090 non-zero elements. Pdbmat> 175087 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 85.68 +/- 21.96 Maximum number = 130 Minimum number = 17 Pdbmat> Matrix trace = 3.501740E+06 Pdbmat> Larger element = 523.705 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 528 non-zero elements, NRBL set to 3 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2603032141003867201.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 3 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2603032141003867201.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2603032141003867201.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 4087 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 3 residue(s) per block. Blocpdb> 528 residues. Blocpdb> 19 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 23 atoms in block 2 Block first atom: 20 Blocpdb> 25 atoms in block 3 Block first atom: 43 Blocpdb> 19 atoms in block 4 Block first atom: 68 Blocpdb> 23 atoms in block 5 Block first atom: 87 Blocpdb> 27 atoms in block 6 Block first atom: 110 Blocpdb> 23 atoms in block 7 Block first atom: 137 Blocpdb> 15 atoms in block 8 Block first atom: 160 Blocpdb> 18 atoms in block 9 Block first atom: 175 Blocpdb> 23 atoms in block 10 Block first atom: 193 Blocpdb> 26 atoms in block 11 Block first atom: 216 Blocpdb> 21 atoms in block 12 Block first atom: 242 Blocpdb> 19 atoms in block 13 Block first atom: 263 Blocpdb> 29 atoms in block 14 Block first atom: 282 Blocpdb> 26 atoms in block 15 Block first atom: 311 Blocpdb> 23 atoms in block 16 Block first atom: 337 Blocpdb> 25 atoms in block 17 Block first atom: 360 Blocpdb> 24 atoms in block 18 Block first atom: 385 Blocpdb> 22 atoms in block 19 Block first atom: 409 Blocpdb> 19 atoms in block 20 Block first atom: 431 Blocpdb> 26 atoms in block 21 Block first atom: 450 Blocpdb> 25 atoms in block 22 Block first atom: 476 Blocpdb> 28 atoms in block 23 Block first atom: 501 Blocpdb> 23 atoms in block 24 Block first atom: 529 Blocpdb> 23 atoms in block 25 Block first atom: 552 Blocpdb> 21 atoms in block 26 Block first atom: 575 Blocpdb> 24 atoms in block 27 Block first atom: 596 Blocpdb> 29 atoms in block 28 Block first atom: 620 Blocpdb> 28 atoms in block 29 Block first atom: 649 Blocpdb> 23 atoms in block 30 Block first atom: 677 Blocpdb> 22 atoms in block 31 Block first atom: 700 Blocpdb> 28 atoms in block 32 Block first atom: 722 Blocpdb> 28 atoms in block 33 Block first atom: 750 Blocpdb> 26 atoms in block 34 Block first atom: 778 Blocpdb> 25 atoms in block 35 Block first atom: 804 Blocpdb> 20 atoms in block 36 Block first atom: 829 Blocpdb> 22 atoms in block 37 Block first atom: 849 Blocpdb> 29 atoms in block 38 Block first atom: 871 Blocpdb> 20 atoms in block 39 Block first atom: 900 Blocpdb> 27 atoms in block 40 Block first atom: 920 Blocpdb> 15 atoms in block 41 Block first atom: 947 Blocpdb> 20 atoms in block 42 Block first atom: 962 Blocpdb> 27 atoms in block 43 Block first atom: 982 Blocpdb> 23 atoms in block 44 Block first atom: 1009 Blocpdb> 26 atoms in block 45 Block first atom: 1032 Blocpdb> 23 atoms in block 46 Block first atom: 1058 Blocpdb> 25 atoms in block 47 Block first atom: 1081 Blocpdb> 21 atoms in block 48 Block first atom: 1106 Blocpdb> 28 atoms in block 49 Block first atom: 1127 Blocpdb> 22 atoms in block 50 Block first atom: 1155 Blocpdb> 20 atoms in block 51 Block first atom: 1177 Blocpdb> 24 atoms in block 52 Block first atom: 1197 Blocpdb> 19 atoms in block 53 Block first atom: 1221 Blocpdb> 20 atoms in block 54 Block first atom: 1240 Blocpdb> 16 atoms in block 55 Block first atom: 1260 Blocpdb> 19 atoms in block 56 Block first atom: 1276 Blocpdb> 24 atoms in block 57 Block first atom: 1295 Blocpdb> 28 atoms in block 58 Block first atom: 1319 Blocpdb> 22 atoms in block 59 Block first atom: 1347 Blocpdb> 30 atoms in block 60 Block first atom: 1369 Blocpdb> 24 atoms in block 61 Block first atom: 1399 Blocpdb> 21 atoms in block 62 Block first atom: 1423 Blocpdb> 16 atoms in block 63 Block first atom: 1444 Blocpdb> 20 atoms in block 64 Block first atom: 1460 Blocpdb> 22 atoms in block 65 Block first atom: 1480 Blocpdb> 24 atoms in block 66 Block first atom: 1502 Blocpdb> 15 atoms in block 67 Block first atom: 1526 Blocpdb> 16 atoms in block 68 Block first atom: 1541 Blocpdb> 19 atoms in block 69 Block first atom: 1557 Blocpdb> 26 atoms in block 70 Block first atom: 1576 Blocpdb> 20 atoms in block 71 Block first atom: 1602 Blocpdb> 21 atoms in block 72 Block first atom: 1622 Blocpdb> 29 atoms in block 73 Block first atom: 1643 Blocpdb> 23 atoms in block 74 Block first atom: 1672 Blocpdb> 23 atoms in block 75 Block first atom: 1695 Blocpdb> 16 atoms in block 76 Block first atom: 1718 Blocpdb> 19 atoms in block 77 Block first atom: 1734 Blocpdb> 26 atoms in block 78 Block first atom: 1753 Blocpdb> 19 atoms in block 79 Block first atom: 1779 Blocpdb> 18 atoms in block 80 Block first atom: 1798 Blocpdb> 33 atoms in block 81 Block first atom: 1816 Blocpdb> 21 atoms in block 82 Block first atom: 1849 Blocpdb> 23 atoms in block 83 Block first atom: 1870 Blocpdb> 19 atoms in block 84 Block first atom: 1893 Blocpdb> 13 atoms in block 85 Block first atom: 1912 Blocpdb> 23 atoms in block 86 Block first atom: 1925 Blocpdb> 21 atoms in block 87 Block first atom: 1948 Blocpdb> 19 atoms in block 88 Block first atom: 1969 Blocpdb> 29 atoms in block 89 Block first atom: 1988 Blocpdb> 21 atoms in block 90 Block first atom: 2017 Blocpdb> 22 atoms in block 91 Block first atom: 2038 Blocpdb> 27 atoms in block 92 Block first atom: 2060 Blocpdb> 31 atoms in block 93 Block first atom: 2087 Blocpdb> 8 atoms in block 94 Block first atom: 2118 Blocpdb> 24 atoms in block 95 Block first atom: 2126 Blocpdb> 28 atoms in block 96 Block first atom: 2150 Blocpdb> 25 atoms in block 97 Block first atom: 2178 Blocpdb> 22 atoms in block 98 Block first atom: 2203 Blocpdb> 23 atoms in block 99 Block first atom: 2225 Blocpdb> 22 atoms in block 100 Block first atom: 2248 Blocpdb> 23 atoms in block 101 Block first atom: 2270 Blocpdb> 21 atoms in block 102 Block first atom: 2293 Blocpdb> 17 atoms in block 103 Block first atom: 2314 Blocpdb> 29 atoms in block 104 Block first atom: 2331 Blocpdb> 21 atoms in block 105 Block first atom: 2360 Blocpdb> 22 atoms in block 106 Block first atom: 2381 Blocpdb> 18 atoms in block 107 Block first atom: 2403 Blocpdb> 26 atoms in block 108 Block first atom: 2421 Blocpdb> 22 atoms in block 109 Block first atom: 2447 Blocpdb> 26 atoms in block 110 Block first atom: 2469 Blocpdb> 21 atoms in block 111 Block first atom: 2495 Blocpdb> 22 atoms in block 112 Block first atom: 2516 Blocpdb> 23 atoms in block 113 Block first atom: 2538 Blocpdb> 23 atoms in block 114 Block first atom: 2561 Blocpdb> 22 atoms in block 115 Block first atom: 2584 Blocpdb> 25 atoms in block 116 Block first atom: 2606 Blocpdb> 24 atoms in block 117 Block first atom: 2631 Blocpdb> 22 atoms in block 118 Block first atom: 2655 Blocpdb> 18 atoms in block 119 Block first atom: 2677 Blocpdb> 23 atoms in block 120 Block first atom: 2695 Blocpdb> 22 atoms in block 121 Block first atom: 2718 Blocpdb> 19 atoms in block 122 Block first atom: 2740 Blocpdb> 19 atoms in block 123 Block first atom: 2759 Blocpdb> 30 atoms in block 124 Block first atom: 2778 Blocpdb> 29 atoms in block 125 Block first atom: 2808 Blocpdb> 25 atoms in block 126 Block first atom: 2837 Blocpdb> 24 atoms in block 127 Block first atom: 2862 Blocpdb> 24 atoms in block 128 Block first atom: 2886 Blocpdb> 25 atoms in block 129 Block first atom: 2910 Blocpdb> 22 atoms in block 130 Block first atom: 2935 Blocpdb> 18 atoms in block 131 Block first atom: 2957 Blocpdb> 26 atoms in block 132 Block first atom: 2975 Blocpdb> 20 atoms in block 133 Block first atom: 3001 Blocpdb> 19 atoms in block 134 Block first atom: 3021 Blocpdb> 22 atoms in block 135 Block first atom: 3040 Blocpdb> 23 atoms in block 136 Block first atom: 3062 Blocpdb> 19 atoms in block 137 Block first atom: 3085 Blocpdb> 20 atoms in block 138 Block first atom: 3104 Blocpdb> 24 atoms in block 139 Block first atom: 3124 Blocpdb> 30 atoms in block 140 Block first atom: 3148 Blocpdb> 30 atoms in block 141 Block first atom: 3178 Blocpdb> 18 atoms in block 142 Block first atom: 3208 Blocpdb> 28 atoms in block 143 Block first atom: 3226 Blocpdb> 29 atoms in block 144 Block first atom: 3254 Blocpdb> 19 atoms in block 145 Block first atom: 3283 Blocpdb> 21 atoms in block 146 Block first atom: 3302 Blocpdb> 29 atoms in block 147 Block first atom: 3323 Blocpdb> 28 atoms in block 148 Block first atom: 3352 Blocpdb> 23 atoms in block 149 Block first atom: 3380 Blocpdb> 23 atoms in block 150 Block first atom: 3403 Blocpdb> 24 atoms in block 151 Block first atom: 3426 Blocpdb> 27 atoms in block 152 Block first atom: 3450 Blocpdb> 23 atoms in block 153 Block first atom: 3477 Blocpdb> 28 atoms in block 154 Block first atom: 3500 Blocpdb> 25 atoms in block 155 Block first atom: 3528 Blocpdb> 27 atoms in block 156 Block first atom: 3553 Blocpdb> 31 atoms in block 157 Block first atom: 3580 Blocpdb> 24 atoms in block 158 Block first atom: 3611 Blocpdb> 22 atoms in block 159 Block first atom: 3635 Blocpdb> 23 atoms in block 160 Block first atom: 3657 Blocpdb> 21 atoms in block 161 Block first atom: 3680 Blocpdb> 20 atoms in block 162 Block first atom: 3701 Blocpdb> 21 atoms in block 163 Block first atom: 3721 Blocpdb> 28 atoms in block 164 Block first atom: 3742 Blocpdb> 24 atoms in block 165 Block first atom: 3770 Blocpdb> 18 atoms in block 166 Block first atom: 3794 Blocpdb> 28 atoms in block 167 Block first atom: 3812 Blocpdb> 22 atoms in block 168 Block first atom: 3840 Blocpdb> 26 atoms in block 169 Block first atom: 3862 Blocpdb> 24 atoms in block 170 Block first atom: 3888 Blocpdb> 26 atoms in block 171 Block first atom: 3912 Blocpdb> 24 atoms in block 172 Block first atom: 3938 Blocpdb> 20 atoms in block 173 Block first atom: 3962 Blocpdb> 30 atoms in block 174 Block first atom: 3982 Blocpdb> 30 atoms in block 175 Block first atom: 4012 Blocpdb> 24 atoms in block 176 Block first atom: 4042 Blocpdb> 22 atoms in block 177 Block first atom: 4065 Blocpdb> 177 blocks. Blocpdb> At most, 33 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 8 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 1600267 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 12261 Prepmat> Matrix trace = 3501740.0000 Prepmat> Last element read: 12261 12261 122.7491 Prepmat> 15754 lines saved. Prepmat> 13847 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 4087 RTB> Total mass = 4087.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 4087 RTB> Number of blocks = 177 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 243905.9879 RTB> 65961 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1062 Diagstd> Nb of non-zero elements: 65961 Diagstd> Projected matrix trace = 243905.9879 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1062 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 243905.9879 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 2.7493020 3.1478357 3.8220423 5.7268864 6.4994005 7.2567262 7.8398651 9.4059601 9.6093727 10.2002257 10.6398655 11.1409926 12.3801107 13.7050724 14.6105396 15.0395408 15.8571812 17.2154591 17.7661703 17.9582388 19.3255638 19.4683447 20.8619317 21.4901272 22.5474250 23.2149386 24.2038463 24.3722805 25.6062794 26.0621332 27.4436126 27.7586142 28.4878550 28.6339438 29.5874174 30.0828294 30.7576743 31.7877324 32.2180600 33.4455098 34.2495889 34.7415084 35.3740147 35.6591260 36.1767437 36.8484150 37.5112863 38.6313244 39.0465333 39.9373782 40.6786380 41.4944679 41.8242071 42.3425803 42.4364125 43.3124314 44.2466713 44.9698791 45.2574403 46.3658545 47.0394784 47.2683721 48.0193198 48.4712578 49.0484587 49.8660387 50.5230616 50.9424714 51.3397424 52.0709705 52.6128387 53.0937113 53.4173010 54.0875751 54.5989089 55.1824971 55.4533317 56.2280454 56.6532052 57.1836652 57.2626697 58.0380610 58.4181310 58.9777459 60.0283103 60.6168321 60.9402245 61.3609313 61.8773037 62.4372377 62.7090657 63.7682934 63.8769779 64.6144817 65.6518786 66.1933070 66.3348630 66.8049418 67.6666407 67.9561262 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034310 0.0034328 0.0034331 0.0034338 0.0034339 0.0034342 180.0555479 192.6643275 212.2965944 259.8690532 276.8419691 292.5267930 304.0531968 333.0403431 336.6222355 346.8168345 354.2120648 362.4576098 382.0828500 402.0091581 415.0767503 421.1264971 432.4224920 450.5620246 457.7118863 460.1793767 477.3768636 479.1370927 495.9895656 503.4018106 515.6366234 523.2136309 534.2413185 536.0969840 549.5010415 554.3706893 568.8737845 572.1292757 579.5957007 581.0799153 590.6752988 595.5999061 602.2433696 612.2447283 616.3749395 628.0065746 635.5108384 640.0584206 645.8586143 648.4561706 653.1456174 659.1810084 665.0836305 674.9398626 678.5572904 686.2542639 692.5936126 699.5042863 702.2781207 706.6167699 707.3992763 714.6634347 722.3298835 728.2091642 730.5337313 739.4254844 744.7774672 746.5873091 752.4944170 756.0272074 760.5153120 766.8275634 771.8627993 775.0599311 778.0761849 783.5976345 787.6642741 791.2556466 793.6632128 798.6270864 802.3932417 806.6700909 808.6472281 814.2762610 817.3489761 821.1665953 821.7336587 827.2784809 829.9828323 833.9487558 841.3434923 845.4577281 847.7099980 850.6310894 854.2027609 858.0589405 859.9247430 867.1568869 867.8955483 872.8913961 879.8707069 883.4913865 884.4355658 887.5637886 893.2696709 895.1783857 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 4087 Rtb_to_modes> Number of blocs = 177 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9828E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9934E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9947E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9991E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9995E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.749 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.148 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.822 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.727 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.499 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.257 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.840 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.406 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.609 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.96 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1062 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 0.99998 1.00001 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 0.99999 0.99998 0.99995 0.99999 1.00000 1.00001 0.99997 1.00000 1.00001 1.00005 1.00003 1.00000 0.99999 0.99998 0.99999 1.00001 0.99998 1.00002 1.00002 1.00001 0.99997 0.99999 0.99999 1.00000 1.00003 1.00000 1.00000 1.00001 1.00002 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 0.99998 1.00001 1.00001 1.00002 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00002 1.00000 1.00001 0.99998 0.99997 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 0.99998 0.99998 0.99998 1.00000 0.99994 1.00000 1.00000 1.00001 1.00002 1.00001 1.00001 0.99998 0.99999 0.99999 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 0.99998 1.00000 0.99999 0.99998 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 0.99997 1.00000 1.00001 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 73566 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 0.99998 1.00001 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 0.99999 0.99998 0.99995 0.99999 1.00000 1.00001 0.99997 1.00000 1.00001 1.00005 1.00003 1.00000 0.99999 0.99998 0.99999 1.00001 0.99998 1.00002 1.00002 1.00001 0.99997 0.99999 0.99999 1.00000 1.00003 1.00000 1.00000 1.00001 1.00002 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 0.99998 1.00001 1.00001 1.00002 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00002 1.00000 1.00001 0.99998 0.99997 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 0.99998 0.99998 0.99998 1.00000 0.99994 1.00000 1.00000 1.00001 1.00002 1.00001 1.00001 0.99998 0.99999 0.99999 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 0.99998 1.00000 0.99999 0.99998 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 0.99997 1.00000 1.00001 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3:-0.000 0.000 Vector 4: 0.000-0.000 0.000 Vector 5: 0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 6:-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 7: 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 8: 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 9: 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 10:-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2603032141003867201.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2603032141003867201.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2603032141003867201.atom Openam> file on opening on unit 11: 2603032141003867201.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 528 First residue number = 5 Last residue number = 541 Number of atoms found = 4087 Mean number per residue = 7.7 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9828E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9934E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9947E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9991E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9995E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.749 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.148 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.822 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.727 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.499 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.257 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.840 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.406 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.609 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.96 Bfactors> 106 vectors, 12261 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 2.749000 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.689 for 528 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.016 +/- 0.02 Bfactors> = 29.363 +/- 12.25 Bfactors> Shiftng-fct= 29.347 Bfactors> Scaling-fct= 734.316 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2603032141003867201.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2603032141003867201.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4309E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4327E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4329E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 180.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 192.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 212.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 259.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 276.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 292.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 304.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 333.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 336.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 346.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 354.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 362.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 382.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 402.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 415.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 421.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 432.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 450.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 457.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 460.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 477.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 479.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 495.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 503.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 515.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 523.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 534.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 536.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 549.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 554.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 568.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 572.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 579.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 581.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 590.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 595.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 602.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 612.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 616.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 628.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 635.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 640.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 645.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 648.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 653.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 659.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 665.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 674.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 678.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 686.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 692.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 699.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 702.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 706.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 707.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 714.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 722.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 728.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 730.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 739.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 744.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 746.6 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vecteur en lecture: 791.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 793.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 798.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 802.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 806.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 808.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 814.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 817.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 821.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 821.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 827.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 830.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 833.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 841.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 845.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 847.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 850.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 854.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 858.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 859.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 867.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 867.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 872.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 879.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 883.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 884.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 887.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 893.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 895.2 Chkmod> 106 vectors, 12261 coordinates in file. Chkmod> That is: 4087 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 76 is: 0.9999 (instead of 1.0000). Chkmod> Normal end. 0.0034 0.7592 0.0034 0.7040 0.0034 0.7384 0.0034 0.9370 0.0034 0.8256 0.0034 0.8626 180.0379 0.4201 192.6611 0.4211 212.2863 0.1939 259.8605 0.4584 276.8216 0.5616 292.5198 0.5404 304.0428 0.5216 333.0268 0.5158 336.6013 0.3313 346.7981 0.3759 354.1991 0.2472 362.4259 0.1938 382.0647 0.3853 402.0642 0.3957 415.0513 0.6847 421.1148 0.4715 432.4424 0.6526 450.6021 0.5485 457.7416 0.6826 460.1822 0.3777 477.4112 0.4569 479.1369 0.5115 495.9453 0.5363 503.3787 0.4438 515.6439 0.4769 523.1355 0.4663 534.1759 0.5246 536.0489 0.5728 549.5174 0.4426 554.3242 0.3609 568.8119 0.3837 572.1190 0.4838 579.5926 0.4807 581.0150 0.4682 590.6757 0.5350 595.5463 0.4358 602.2403 0.5445 612.2403 0.4176 616.3670 0.4651 628.0218 0.4029 635.4874 0.4962 640.0171 0.3924 645.7942 0.3791 648.4363 0.3403 653.1470 0.5036 659.1669 0.3480 665.0437 0.4764 674.8993 0.4571 678.5583 0.4949 686.2473 0.5601 692.5755 0.4249 699.4366 0.5898 702.2127 0.5561 706.5649 0.4123 707.3988 0.3874 714.6127 0.5293 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DQ=-80 2603032141003867201.eigenfacs 2603032141003867201.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2603032141003867201.eigenfacs 2603032141003867201.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2603032141003867201.eigenfacs 2603032141003867201.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2603032141003867201.eigenfacs 2603032141003867201.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2603032141003867201.eigenfacs 2603032141003867201.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2603032141003867201.eigenfacs 2603032141003867201.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2603032141003867201.eigenfacs 2603032141003867201.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2603032141003867201.eigenfacs 2603032141003867201.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2603032141003867201.eigenfacs 2603032141003867201.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2603032141003867201.eigenfacs 2603032141003867201.atom making animated gifs 11 models are in 2603032141003867201.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2603032141003867201.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2603032141003867201.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 2603032141003867201 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 2603032141003867201.eigenfacs 2603032141003867201.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2603032141003867201.eigenfacs 2603032141003867201.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2603032141003867201.eigenfacs 2603032141003867201.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2603032141003867201.eigenfacs 2603032141003867201.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2603032141003867201.eigenfacs 2603032141003867201.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2603032141003867201.eigenfacs 2603032141003867201.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2603032141003867201.eigenfacs 2603032141003867201.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2603032141003867201.eigenfacs 2603032141003867201.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2603032141003867201.eigenfacs 2603032141003867201.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2603032141003867201.eigenfacs 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animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 2603032141003867201 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 2603032141003867201.eigenfacs 2603032141003867201.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2603032141003867201.eigenfacs 2603032141003867201.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2603032141003867201.eigenfacs 2603032141003867201.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2603032141003867201.eigenfacs 2603032141003867201.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2603032141003867201.eigenfacs 2603032141003867201.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2603032141003867201.eigenfacs 2603032141003867201.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2603032141003867201.eigenfacs 2603032141003867201.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2603032141003867201.eigenfacs 2603032141003867201.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2603032141003867201.eigenfacs 2603032141003867201.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2603032141003867201.eigenfacs 2603032141003867201.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2603032141003867201.eigenfacs 2603032141003867201.atom making animated gifs 11 models are in 2603032141003867201.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2603032141003867201.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2603032141003867201.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 2603032141003867201 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 2603032141003867201.eigenfacs 2603032141003867201.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2603032141003867201.eigenfacs 2603032141003867201.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2603032141003867201.eigenfacs 2603032141003867201.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2603032141003867201.eigenfacs 2603032141003867201.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2603032141003867201.eigenfacs 2603032141003867201.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2603032141003867201.eigenfacs 2603032141003867201.atom calculating perturbed structure for DQ=20 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100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2603032141003867201.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 2603032141003867201 11 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-100 2603032141003867201.eigenfacs 2603032141003867201.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2603032141003867201.eigenfacs 2603032141003867201.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2603032141003867201.eigenfacs 2603032141003867201.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2603032141003867201.eigenfacs 2603032141003867201.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2603032141003867201.eigenfacs 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MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2603032141003867201.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 2603032141003867201.10.pdb 2603032141003867201.11.pdb 2603032141003867201.7.pdb 2603032141003867201.8.pdb 2603032141003867201.9.pdb STDERR: Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL real 0m23.434s user 0m23.292s sys 0m0.135s rm: cannot remove '2603032141003867201.sdijf': No such file or directory pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: 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