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***  01-AUG-25  ***

LOGs for ID: 2603040145423895155

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2603040145423895155.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2603040145423895155.atom to be opened. Openam> File opened: 2603040145423895155.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 531 First residue number = 87 Last residue number = 617 Number of atoms found = 4270 Mean number per residue = 8.0 Pdbmat> Coordinate statistics: = -2.537491 +/- 22.624136 From: -61.214000 To: 37.016000 = -1.507681 +/- 11.433005 From: -30.908000 To: 31.344000 = 0.858695 +/- 19.081203 From: -46.018000 To: 44.892000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 1.9147 % Filled. Pdbmat> 1571059 non-zero elements. Pdbmat> 171741 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 80.44 +/- 23.40 Maximum number = 132 Minimum number = 10 Pdbmat> Matrix trace = 3.434820E+06 Pdbmat> Larger element = 491.291 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 531 non-zero elements, NRBL set to 3 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2603040145423895155.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 3 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2603040145423895155.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2603040145423895155.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 4270 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 3 residue(s) per block. Blocpdb> 531 residues. Blocpdb> 22 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 23 atoms in block 2 Block first atom: 23 Blocpdb> 27 atoms in block 3 Block first atom: 46 Blocpdb> 29 atoms in block 4 Block first atom: 73 Blocpdb> 18 atoms in block 5 Block first atom: 102 Blocpdb> 25 atoms in block 6 Block first atom: 120 Blocpdb> 21 atoms in block 7 Block first atom: 145 Blocpdb> 31 atoms in block 8 Block first atom: 166 Blocpdb> 28 atoms in block 9 Block first atom: 197 Blocpdb> 29 atoms in block 10 Block first atom: 225 Blocpdb> 21 atoms in block 11 Block first atom: 254 Blocpdb> 33 atoms in block 12 Block first atom: 275 Blocpdb> 27 atoms in block 13 Block first atom: 308 Blocpdb> 25 atoms in block 14 Block first atom: 335 Blocpdb> 26 atoms in block 15 Block first atom: 360 Blocpdb> 25 atoms in block 16 Block first atom: 386 Blocpdb> 26 atoms in block 17 Block first atom: 411 Blocpdb> 19 atoms in block 18 Block first atom: 437 Blocpdb> 25 atoms in block 19 Block first atom: 456 Blocpdb> 17 atoms in block 20 Block first atom: 481 Blocpdb> 25 atoms in block 21 Block first atom: 498 Blocpdb> 23 atoms in block 22 Block first atom: 523 Blocpdb> 23 atoms in block 23 Block first atom: 546 Blocpdb> 21 atoms in block 24 Block first atom: 569 Blocpdb> 25 atoms in block 25 Block first atom: 590 Blocpdb> 24 atoms in block 26 Block first atom: 615 Blocpdb> 27 atoms in block 27 Block first atom: 639 Blocpdb> 23 atoms in block 28 Block first atom: 666 Blocpdb> 27 atoms in block 29 Block first atom: 689 Blocpdb> 19 atoms in block 30 Block first atom: 716 Blocpdb> 21 atoms in block 31 Block first atom: 735 Blocpdb> 24 atoms in block 32 Block first atom: 756 Blocpdb> 18 atoms in block 33 Block first atom: 780 Blocpdb> 27 atoms in block 34 Block first atom: 798 Blocpdb> 21 atoms in block 35 Block first atom: 825 Blocpdb> 22 atoms in block 36 Block first atom: 846 Blocpdb> 20 atoms in block 37 Block first atom: 868 Blocpdb> 27 atoms in block 38 Block first atom: 888 Blocpdb> 19 atoms in block 39 Block first atom: 915 Blocpdb> 24 atoms in block 40 Block first atom: 934 Blocpdb> 28 atoms in block 41 Block first atom: 958 Blocpdb> 24 atoms in block 42 Block first atom: 986 Blocpdb> 23 atoms in block 43 Block first atom: 1010 Blocpdb> 23 atoms in block 44 Block first atom: 1033 Blocpdb> 26 atoms in block 45 Block first atom: 1056 Blocpdb> 24 atoms in block 46 Block first atom: 1082 Blocpdb> 24 atoms in block 47 Block first atom: 1106 Blocpdb> 19 atoms in block 48 Block first atom: 1130 Blocpdb> 19 atoms in block 49 Block first atom: 1149 Blocpdb> 24 atoms in block 50 Block first atom: 1168 Blocpdb> 22 atoms in block 51 Block first atom: 1192 Blocpdb> 21 atoms in block 52 Block first atom: 1214 Blocpdb> 29 atoms in block 53 Block first atom: 1235 Blocpdb> 26 atoms in block 54 Block first atom: 1264 Blocpdb> 25 atoms in block 55 Block first atom: 1290 Blocpdb> 20 atoms in block 56 Block first atom: 1315 Blocpdb> 21 atoms in block 57 Block first atom: 1335 Blocpdb> 22 atoms in block 58 Block first atom: 1356 Blocpdb> 23 atoms in block 59 Block first atom: 1378 Blocpdb> 27 atoms in block 60 Block first atom: 1401 Blocpdb> 24 atoms in block 61 Block first atom: 1428 Blocpdb> 24 atoms in block 62 Block first atom: 1452 Blocpdb> 29 atoms in block 63 Block first atom: 1476 Blocpdb> 23 atoms in block 64 Block first atom: 1505 Blocpdb> 22 atoms in block 65 Block first atom: 1528 Blocpdb> 25 atoms in block 66 Block first atom: 1550 Blocpdb> 20 atoms in block 67 Block first atom: 1575 Blocpdb> 22 atoms in block 68 Block first atom: 1595 Blocpdb> 32 atoms in block 69 Block first atom: 1617 Blocpdb> 22 atoms in block 70 Block first atom: 1649 Blocpdb> 26 atoms in block 71 Block first atom: 1671 Blocpdb> 22 atoms in block 72 Block first atom: 1697 Blocpdb> 26 atoms in block 73 Block first atom: 1719 Blocpdb> 21 atoms in block 74 Block first atom: 1745 Blocpdb> 24 atoms in block 75 Block first atom: 1766 Blocpdb> 29 atoms in block 76 Block first atom: 1790 Blocpdb> 25 atoms in block 77 Block first atom: 1819 Blocpdb> 25 atoms in block 78 Block first atom: 1844 Blocpdb> 26 atoms in block 79 Block first atom: 1869 Blocpdb> 26 atoms in block 80 Block first atom: 1895 Blocpdb> 26 atoms in block 81 Block first atom: 1921 Blocpdb> 19 atoms in block 82 Block first atom: 1947 Blocpdb> 27 atoms in block 83 Block first atom: 1966 Blocpdb> 19 atoms in block 84 Block first atom: 1993 Blocpdb> 31 atoms in block 85 Block first atom: 2012 Blocpdb> 25 atoms in block 86 Block first atom: 2043 Blocpdb> 23 atoms in block 87 Block first atom: 2068 Blocpdb> 19 atoms in block 88 Block first atom: 2091 Blocpdb> 25 atoms in block 89 Block first atom: 2110 Blocpdb> 23 atoms in block 90 Block first atom: 2135 Blocpdb> 25 atoms in block 91 Block first atom: 2158 Blocpdb> 29 atoms in block 92 Block first atom: 2183 Blocpdb> 21 atoms in block 93 Block first atom: 2212 Blocpdb> 32 atoms in block 94 Block first atom: 2233 Blocpdb> 21 atoms in block 95 Block first atom: 2265 Blocpdb> 21 atoms in block 96 Block first atom: 2286 Blocpdb> 27 atoms in block 97 Block first atom: 2307 Blocpdb> 21 atoms in block 98 Block first atom: 2334 Blocpdb> 33 atoms in block 99 Block first atom: 2355 Blocpdb> 31 atoms in block 100 Block first atom: 2388 Blocpdb> 22 atoms in block 101 Block first atom: 2419 Blocpdb> 25 atoms in block 102 Block first atom: 2441 Blocpdb> 22 atoms in block 103 Block first atom: 2466 Blocpdb> 20 atoms in block 104 Block first atom: 2488 Blocpdb> 31 atoms in block 105 Block first atom: 2508 Blocpdb> 25 atoms in block 106 Block first atom: 2539 Blocpdb> 25 atoms in block 107 Block first atom: 2564 Blocpdb> 27 atoms in block 108 Block first atom: 2589 Blocpdb> 29 atoms in block 109 Block first atom: 2616 Blocpdb> 22 atoms in block 110 Block first atom: 2645 Blocpdb> 21 atoms in block 111 Block first atom: 2667 Blocpdb> 28 atoms in block 112 Block first atom: 2688 Blocpdb> 23 atoms in block 113 Block first atom: 2716 Blocpdb> 23 atoms in block 114 Block first atom: 2739 Blocpdb> 25 atoms in block 115 Block first atom: 2762 Blocpdb> 30 atoms in block 116 Block first atom: 2787 Blocpdb> 25 atoms in block 117 Block first atom: 2817 Blocpdb> 19 atoms in block 118 Block first atom: 2842 Blocpdb> 28 atoms in block 119 Block first atom: 2861 Blocpdb> 26 atoms in block 120 Block first atom: 2889 Blocpdb> 27 atoms in block 121 Block first atom: 2915 Blocpdb> 22 atoms in block 122 Block first atom: 2942 Blocpdb> 25 atoms in block 123 Block first atom: 2964 Blocpdb> 23 atoms in block 124 Block first atom: 2989 Blocpdb> 31 atoms in block 125 Block first atom: 3012 Blocpdb> 21 atoms in block 126 Block first atom: 3043 Blocpdb> 23 atoms in block 127 Block first atom: 3064 Blocpdb> 26 atoms in block 128 Block first atom: 3087 Blocpdb> 25 atoms in block 129 Block first atom: 3113 Blocpdb> 23 atoms in block 130 Block first atom: 3138 Blocpdb> 25 atoms in block 131 Block first atom: 3161 Blocpdb> 27 atoms in block 132 Block first atom: 3186 Blocpdb> 22 atoms in block 133 Block first atom: 3213 Blocpdb> 30 atoms in block 134 Block first atom: 3235 Blocpdb> 21 atoms in block 135 Block first atom: 3265 Blocpdb> 25 atoms in block 136 Block first atom: 3286 Blocpdb> 26 atoms in block 137 Block first atom: 3311 Blocpdb> 20 atoms in block 138 Block first atom: 3337 Blocpdb> 27 atoms in block 139 Block first atom: 3357 Blocpdb> 17 atoms in block 140 Block first atom: 3384 Blocpdb> 22 atoms in block 141 Block first atom: 3401 Blocpdb> 18 atoms in block 142 Block first atom: 3423 Blocpdb> 23 atoms in block 143 Block first atom: 3441 Blocpdb> 26 atoms in block 144 Block first atom: 3464 Blocpdb> 21 atoms in block 145 Block first atom: 3490 Blocpdb> 28 atoms in block 146 Block first atom: 3511 Blocpdb> 22 atoms in block 147 Block first atom: 3539 Blocpdb> 23 atoms in block 148 Block first atom: 3561 Blocpdb> 26 atoms in block 149 Block first atom: 3584 Blocpdb> 20 atoms in block 150 Block first atom: 3610 Blocpdb> 23 atoms in block 151 Block first atom: 3630 Blocpdb> 26 atoms in block 152 Block first atom: 3653 Blocpdb> 23 atoms in block 153 Block first atom: 3679 Blocpdb> 20 atoms in block 154 Block first atom: 3702 Blocpdb> 22 atoms in block 155 Block first atom: 3722 Blocpdb> 26 atoms in block 156 Block first atom: 3744 Blocpdb> 26 atoms in block 157 Block first atom: 3770 Blocpdb> 25 atoms in block 158 Block first atom: 3796 Blocpdb> 20 atoms in block 159 Block first atom: 3821 Blocpdb> 28 atoms in block 160 Block first atom: 3841 Blocpdb> 20 atoms in block 161 Block first atom: 3869 Blocpdb> 21 atoms in block 162 Block first atom: 3889 Blocpdb> 26 atoms in block 163 Block first atom: 3910 Blocpdb> 27 atoms in block 164 Block first atom: 3936 Blocpdb> 22 atoms in block 165 Block first atom: 3963 Blocpdb> 26 atoms in block 166 Block first atom: 3985 Blocpdb> 19 atoms in block 167 Block first atom: 4011 Blocpdb> 21 atoms in block 168 Block first atom: 4030 Blocpdb> 29 atoms in block 169 Block first atom: 4051 Blocpdb> 25 atoms in block 170 Block first atom: 4080 Blocpdb> 22 atoms in block 171 Block first atom: 4105 Blocpdb> 22 atoms in block 172 Block first atom: 4127 Blocpdb> 26 atoms in block 173 Block first atom: 4149 Blocpdb> 24 atoms in block 174 Block first atom: 4175 Blocpdb> 22 atoms in block 175 Block first atom: 4199 Blocpdb> 29 atoms in block 176 Block first atom: 4221 Blocpdb> 21 atoms in block 177 Block first atom: 4249 Blocpdb> 177 blocks. Blocpdb> At most, 33 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 17 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 1571236 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 12810 Prepmat> Matrix trace = 3434820.0000 Prepmat> Last element read: 12810 12810 57.7871 Prepmat> 15754 lines saved. Prepmat> 14098 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 4270 RTB> Total mass = 4270.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 4270 RTB> Number of blocks = 177 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 220575.8659 RTB> 56925 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1062 Diagstd> Nb of non-zero elements: 56925 Diagstd> Projected matrix trace = 220575.8659 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1062 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 220575.8659 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0934917 0.2525518 0.3576793 0.6236201 0.8548239 1.0839419 1.4804979 1.6244269 2.2257375 2.7404388 2.8720198 3.0109895 3.3997340 3.7742984 3.9076338 4.7379426 5.0795764 5.5868455 5.8939683 6.2891586 6.8981234 7.1635998 7.8665534 8.8378824 9.2323187 9.7537227 10.4844988 10.7787781 11.3107002 11.3932330 12.0489455 12.3356601 13.4605123 13.5683531 14.0145695 14.8699410 15.2661993 15.7234786 17.1228206 17.3384668 18.1100102 18.5394155 18.9886648 19.5362182 20.6159986 21.2481702 21.7218517 22.1971413 22.3926625 22.5518729 22.9273974 23.1329587 24.2359111 24.6317115 25.0857486 25.2984406 25.7345391 26.6368614 26.9140088 27.7934317 28.3392617 28.7339207 28.9672478 29.0503862 29.6464360 30.4579738 30.8695933 31.5134847 31.8730757 32.6364997 32.8744447 33.7573096 34.3677709 34.4348943 35.5053906 36.1611810 36.8885320 37.1326329 37.4197106 38.0639702 38.3612991 39.0615873 39.1715984 40.0131126 40.5073539 40.9315130 41.8727483 41.9213413 42.3769384 43.4238024 43.8797326 43.9227735 44.4921799 45.2391223 45.4785933 45.9479842 46.2156971 47.0669571 47.8313675 47.9613114 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034322 0.0034331 0.0034331 0.0034340 0.0034342 0.0034344 33.2033423 54.5720851 64.9444733 85.7541848 100.3999765 113.0572172 132.1293120 138.4029551 162.0064285 179.7650806 184.0301576 188.4299367 200.2247438 210.9664502 214.6605357 236.3688150 244.7422962 256.6720691 263.6326389 272.3275352 285.2073811 290.6437163 304.5702844 322.8266566 329.9519315 339.1411451 351.6163955 356.5168376 365.2077845 366.5378004 376.9378943 381.3963022 398.4061884 399.9989477 406.5230370 418.7452582 424.2879953 430.5956095 449.3481253 452.1688354 462.1198539 467.5664045 473.1975580 479.9715870 493.0573853 500.5598922 506.1085827 511.6156300 513.8639458 515.6874805 519.9632617 522.2889906 534.5950782 538.9426764 543.8871686 546.1880026 550.8755256 560.4499122 563.3580119 572.4879728 578.0821325 582.0934668 584.4520649 585.2901767 591.2641211 599.3020797 603.3380763 609.5979456 613.0660511 620.3646854 622.6220445 630.9271167 636.6063447 637.2277165 647.0568332 653.0051148 659.5397370 661.7183103 664.2713055 669.9653203 672.5768784 678.6880837 679.6431228 686.9046371 691.1339344 694.7429999 702.6855351 703.0931477 706.9033973 715.5816664 719.3284984 719.6812008 724.3310836 730.3858744 732.3164533 736.0859218 738.2271854 744.9949714 751.0203050 752.0397652 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 4270 Rtb_to_modes> Number of blocs = 177 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9896E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9951E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9952E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.3492E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2526 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3577 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6236 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8548 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.084 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.480 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.624 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.226 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.740 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.872 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.011 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.400 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.774 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.908 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.738 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.080 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.587 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.894 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.289 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.898 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.164 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.867 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.838 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.232 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.754 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.96 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1062 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 0.99997 1.00000 1.00000 0.99998 0.99998 1.00001 1.00001 1.00000 0.99998 0.99999 1.00001 1.00002 0.99999 0.99998 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 1.00002 0.99999 1.00001 0.99997 0.99999 0.99998 0.99999 1.00002 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 0.99998 0.99996 1.00000 1.00000 0.99998 0.99999 1.00001 0.99999 0.99997 1.00002 1.00000 1.00002 1.00002 0.99999 1.00004 1.00000 1.00001 1.00000 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 0.99998 0.99997 1.00001 0.99997 0.99998 1.00000 1.00002 0.99999 0.99998 1.00000 1.00002 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00002 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 1.00004 1.00002 1.00001 0.99998 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 76860 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 0.99997 1.00000 1.00000 0.99998 0.99998 1.00001 1.00001 1.00000 0.99998 0.99999 1.00001 1.00002 0.99999 0.99998 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 1.00002 0.99999 1.00001 0.99997 0.99999 0.99998 0.99999 1.00002 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 0.99998 0.99996 1.00000 1.00000 0.99998 0.99999 1.00001 0.99999 0.99997 1.00002 1.00000 1.00002 1.00002 0.99999 1.00004 1.00000 1.00001 1.00000 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 0.99998 0.99997 1.00001 0.99997 0.99998 1.00000 1.00002 0.99999 0.99998 1.00000 1.00002 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00002 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 1.00004 1.00002 1.00001 0.99998 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3: 0.000 0.000 Vector 4:-0.000-0.000 0.000 Vector 5:-0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 6:-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 7: 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 8:-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 9: 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 10: 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2603040145423895155.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2603040145423895155.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2603040145423895155.atom Openam> file on opening on unit 11: 2603040145423895155.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 531 First residue number = 87 Last residue number = 617 Number of atoms found = 4270 Mean number per residue = 8.0 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9896E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9951E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9952E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.3492E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2526 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3577 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6236 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8548 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.084 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.480 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.624 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.226 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.740 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.872 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.011 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.400 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.774 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.908 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.738 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.080 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.587 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.894 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.289 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.898 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.164 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.867 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.838 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.232 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.754 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.96 Bfactors> 106 vectors, 12810 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.093492 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= -0.402 for 531 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.101 +/- 0.13 Bfactors> = 89.591 +/- 14.44 Bfactors> Shiftng-fct= 89.490 Bfactors> Scaling-fct= 112.398 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2603040145423895155.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2603040145423895155.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4320E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4330E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4330E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 33.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 54.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 64.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 85.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 100.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 113.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 132.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 138.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 162.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 179.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 184.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 188.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 200.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 210.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 214.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 236.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 244.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 256.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 263.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 272.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 285.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 290.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 304.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 322.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 329.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 339.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 351.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 356.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 365.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 366.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 376.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 381.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 398.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 400.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 406.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 418.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 424.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 430.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 449.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 452.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 462.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 467.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 473.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 480.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 493.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 500.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 506.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 511.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 513.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 515.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 520.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 522.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 534.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 538.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 543.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 546.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 550.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 560.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 563.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 572.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 578.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 582.0 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Chkmod> That is: 4270 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. 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DQ=-80 2603040145423895155.eigenfacs 2603040145423895155.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2603040145423895155.eigenfacs 2603040145423895155.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2603040145423895155.eigenfacs 2603040145423895155.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2603040145423895155.eigenfacs 2603040145423895155.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2603040145423895155.eigenfacs 2603040145423895155.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2603040145423895155.eigenfacs 2603040145423895155.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2603040145423895155.eigenfacs 2603040145423895155.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2603040145423895155.eigenfacs 2603040145423895155.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2603040145423895155.eigenfacs 2603040145423895155.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2603040145423895155.eigenfacs 2603040145423895155.atom making animated gifs 11 models are in 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animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 2603040145423895155 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 2603040145423895155.eigenfacs 2603040145423895155.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2603040145423895155.eigenfacs 2603040145423895155.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2603040145423895155.eigenfacs 2603040145423895155.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2603040145423895155.eigenfacs 2603040145423895155.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2603040145423895155.eigenfacs 2603040145423895155.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2603040145423895155.eigenfacs 2603040145423895155.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2603040145423895155.eigenfacs 2603040145423895155.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2603040145423895155.eigenfacs 2603040145423895155.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2603040145423895155.eigenfacs 2603040145423895155.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2603040145423895155.eigenfacs 2603040145423895155.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2603040145423895155.eigenfacs 2603040145423895155.atom making animated gifs 11 models are in 2603040145423895155.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2603040145423895155.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2603040145423895155.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 2603040145423895155 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 2603040145423895155.eigenfacs 2603040145423895155.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2603040145423895155.eigenfacs 2603040145423895155.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2603040145423895155.eigenfacs 2603040145423895155.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2603040145423895155.eigenfacs 2603040145423895155.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2603040145423895155.eigenfacs 2603040145423895155.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2603040145423895155.eigenfacs 2603040145423895155.atom calculating perturbed structure for DQ=20 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100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2603040145423895155.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 2603040145423895155 11 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-100 2603040145423895155.eigenfacs 2603040145423895155.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2603040145423895155.eigenfacs 2603040145423895155.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2603040145423895155.eigenfacs 2603040145423895155.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2603040145423895155.eigenfacs 2603040145423895155.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2603040145423895155.eigenfacs 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MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2603040145423895155.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 2603040145423895155.10.pdb 2603040145423895155.11.pdb 2603040145423895155.7.pdb 2603040145423895155.8.pdb 2603040145423895155.9.pdb STDERR: Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL real 0m21.877s user 0m21.730s sys 0m0.134s rm: cannot remove '2603040145423895155.sdijf': No such file or directory pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: 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