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***  clusters  ***

LOGs for ID: 2604221406451425459

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2604221406451425459.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2604221406451425459.atom to be opened. Openam> File opened: 2604221406451425459.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 775 First residue number = 1 Last residue number = 775 Number of atoms found = 7705 Mean number per residue = 9.9 Pdbmat> Coordinate statistics: = -0.849860 +/- 18.672345 From: -61.183000 To: 39.161000 = -0.798669 +/- 16.765082 From: -41.275000 To: 40.945000 = 0.335882 +/- 16.397519 From: -40.871000 To: 37.896000 Pdbmat> Masses are all set to one. %Pdbmat-W> residue:'LIG ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'LIG ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> 2 residue(s) not known. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 1.2584 % Filled. Pdbmat> 3361966 non-zero elements. Pdbmat> 368484 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 95.65 +/- 25.88 Maximum number = 154 Minimum number = 15 Pdbmat> Matrix trace = 7.369680E+06 Pdbmat> Larger element = 583.624 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 775 non-zero elements, NRBL set to 4 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2604221406451425459.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 4 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2604221406451425459.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2604221406451425459.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 7705 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 4 residue(s) per block. Blocpdb> 775 residues. Blocpdb> 33 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 38 atoms in block 2 Block first atom: 34 Blocpdb> 42 atoms in block 3 Block first atom: 72 Blocpdb> 33 atoms in block 4 Block first atom: 114 Blocpdb> 32 atoms in block 5 Block first atom: 147 Blocpdb> 43 atoms in block 6 Block first atom: 179 Blocpdb> 37 atoms in block 7 Block first atom: 222 Blocpdb> 52 atoms in block 8 Block first atom: 259 Blocpdb> 31 atoms in block 9 Block first atom: 311 Blocpdb> 49 atoms in block 10 Block first atom: 342 Blocpdb> 47 atoms in block 11 Block first atom: 391 Blocpdb> 53 atoms in block 12 Block first atom: 438 Blocpdb> 32 atoms in block 13 Block first atom: 491 Blocpdb> 34 atoms in block 14 Block first atom: 523 Blocpdb> 29 atoms in block 15 Block first atom: 557 Blocpdb> 42 atoms in block 16 Block first atom: 586 Blocpdb> 29 atoms in block 17 Block first atom: 628 Blocpdb> 35 atoms in block 18 Block first atom: 657 Blocpdb> 42 atoms in block 19 Block first atom: 692 Blocpdb> 33 atoms in block 20 Block first atom: 734 Blocpdb> 32 atoms in block 21 Block first atom: 767 Blocpdb> 39 atoms in block 22 Block first atom: 799 Blocpdb> 45 atoms in block 23 Block first atom: 838 Blocpdb> 33 atoms in block 24 Block first atom: 883 Blocpdb> 37 atoms in block 25 Block first atom: 916 Blocpdb> 41 atoms in block 26 Block first atom: 953 Blocpdb> 29 atoms in block 27 Block first atom: 994 Blocpdb> 35 atoms in block 28 Block first atom: 1023 Blocpdb> 38 atoms in block 29 Block first atom: 1058 Blocpdb> 32 atoms in block 30 Block first atom: 1096 Blocpdb> 49 atoms in block 31 Block first atom: 1128 Blocpdb> 38 atoms in block 32 Block first atom: 1177 Blocpdb> 40 atoms in block 33 Block first atom: 1215 Blocpdb> 42 atoms in block 34 Block first atom: 1255 Blocpdb> 43 atoms in block 35 Block first atom: 1297 Blocpdb> 35 atoms in block 36 Block first atom: 1340 Blocpdb> 45 atoms in block 37 Block first atom: 1375 Blocpdb> 39 atoms in block 38 Block first atom: 1420 Blocpdb> 39 atoms in block 39 Block first atom: 1459 Blocpdb> 42 atoms in block 40 Block first atom: 1498 Blocpdb> 38 atoms in block 41 Block first atom: 1540 Blocpdb> 46 atoms in block 42 Block first atom: 1578 Blocpdb> 33 atoms in block 43 Block first atom: 1624 Blocpdb> 41 atoms in block 44 Block first atom: 1657 Blocpdb> 34 atoms in block 45 Block first atom: 1698 Blocpdb> 37 atoms in block 46 Block first atom: 1732 Blocpdb> 52 atoms in block 47 Block first atom: 1769 Blocpdb> 40 atoms in block 48 Block first atom: 1821 Blocpdb> 41 atoms in block 49 Block first atom: 1861 Blocpdb> 44 atoms in block 50 Block first atom: 1902 Blocpdb> 41 atoms in block 51 Block first atom: 1946 Blocpdb> 36 atoms in block 52 Block first atom: 1987 Blocpdb> 31 atoms in block 53 Block first atom: 2023 Blocpdb> 38 atoms in block 54 Block first atom: 2054 Blocpdb> 51 atoms in block 55 Block first atom: 2092 Blocpdb> 44 atoms in block 56 Block first atom: 2143 Blocpdb> 46 atoms in block 57 Block first atom: 2187 Blocpdb> 42 atoms in block 58 Block first atom: 2233 Blocpdb> 49 atoms in block 59 Block first atom: 2275 Blocpdb> 43 atoms in block 60 Block first atom: 2324 Blocpdb> 45 atoms in block 61 Block first atom: 2367 Blocpdb> 38 atoms in block 62 Block first atom: 2412 Blocpdb> 36 atoms in block 63 Block first atom: 2450 Blocpdb> 45 atoms in block 64 Block first atom: 2486 Blocpdb> 36 atoms in block 65 Block first atom: 2531 Blocpdb> 39 atoms in block 66 Block first atom: 2567 Blocpdb> 42 atoms in block 67 Block first atom: 2606 Blocpdb> 35 atoms in block 68 Block first atom: 2648 Blocpdb> 31 atoms in block 69 Block first atom: 2683 Blocpdb> 36 atoms in block 70 Block first atom: 2714 Blocpdb> 57 atoms in block 71 Block first atom: 2750 Blocpdb> 48 atoms in block 72 Block first atom: 2807 Blocpdb> 42 atoms in block 73 Block first atom: 2855 Blocpdb> 42 atoms in block 74 Block first atom: 2897 Blocpdb> 31 atoms in block 75 Block first atom: 2939 Blocpdb> 32 atoms in block 76 Block first atom: 2970 Blocpdb> 42 atoms in block 77 Block first atom: 3002 Blocpdb> 48 atoms in block 78 Block first atom: 3044 Blocpdb> 45 atoms in block 79 Block first atom: 3092 Blocpdb> 31 atoms in block 80 Block first atom: 3137 Blocpdb> 37 atoms in block 81 Block first atom: 3168 Blocpdb> 42 atoms in block 82 Block first atom: 3205 Blocpdb> 47 atoms in block 83 Block first atom: 3247 Blocpdb> 37 atoms in block 84 Block first atom: 3294 Blocpdb> 48 atoms in block 85 Block first atom: 3331 Blocpdb> 56 atoms in block 86 Block first atom: 3379 Blocpdb> 47 atoms in block 87 Block first atom: 3435 Blocpdb> 43 atoms in block 88 Block first atom: 3482 Blocpdb> 38 atoms in block 89 Block first atom: 3525 Blocpdb> 46 atoms in block 90 Block first atom: 3563 Blocpdb> 45 atoms in block 91 Block first atom: 3609 Blocpdb> 44 atoms in block 92 Block first atom: 3654 Blocpdb> 38 atoms in block 93 Block first atom: 3698 Blocpdb> 31 atoms in block 94 Block first atom: 3736 Blocpdb> 42 atoms in block 95 Block first atom: 3767 Blocpdb> 30 atoms in block 96 Block first atom: 3809 Blocpdb> 37 atoms in block 97 Block first atom: 3839 Blocpdb> 37 atoms in block 98 Block first atom: 3876 Blocpdb> 53 atoms in block 99 Block first atom: 3913 Blocpdb> 37 atoms in block 100 Block first atom: 3966 Blocpdb> 46 atoms in block 101 Block first atom: 4003 Blocpdb> 42 atoms in block 102 Block first atom: 4049 Blocpdb> 33 atoms in block 103 Block first atom: 4091 Blocpdb> 37 atoms in block 104 Block first atom: 4124 Blocpdb> 38 atoms in block 105 Block first atom: 4161 Blocpdb> 38 atoms in block 106 Block first atom: 4199 Blocpdb> 46 atoms in block 107 Block first atom: 4237 Blocpdb> 34 atoms in block 108 Block first atom: 4283 Blocpdb> 35 atoms in block 109 Block first atom: 4317 Blocpdb> 37 atoms in block 110 Block first atom: 4352 Blocpdb> 39 atoms in block 111 Block first atom: 4389 Blocpdb> 41 atoms in block 112 Block first atom: 4428 Blocpdb> 56 atoms in block 113 Block first atom: 4469 Blocpdb> 42 atoms in block 114 Block first atom: 4525 Blocpdb> 41 atoms in block 115 Block first atom: 4567 Blocpdb> 44 atoms in block 116 Block first atom: 4608 Blocpdb> 32 atoms in block 117 Block first atom: 4652 Blocpdb> 36 atoms in block 118 Block first atom: 4684 Blocpdb> 42 atoms in block 119 Block first atom: 4720 Blocpdb> 31 atoms in block 120 Block first atom: 4762 Blocpdb> 35 atoms in block 121 Block first atom: 4793 Blocpdb> 48 atoms in block 122 Block first atom: 4828 Blocpdb> 35 atoms in block 123 Block first atom: 4876 Blocpdb> 38 atoms in block 124 Block first atom: 4911 Blocpdb> 35 atoms in block 125 Block first atom: 4949 Blocpdb> 33 atoms in block 126 Block first atom: 4984 Blocpdb> 36 atoms in block 127 Block first atom: 5017 Blocpdb> 38 atoms in block 128 Block first atom: 5053 Blocpdb> 37 atoms in block 129 Block first atom: 5091 Blocpdb> 54 atoms in block 130 Block first atom: 5128 Blocpdb> 30 atoms in block 131 Block first atom: 5182 Blocpdb> 39 atoms in block 132 Block first atom: 5212 Blocpdb> 36 atoms in block 133 Block first atom: 5251 Blocpdb> 37 atoms in block 134 Block first atom: 5287 Blocpdb> 35 atoms in block 135 Block first atom: 5324 Blocpdb> 34 atoms in block 136 Block first atom: 5359 Blocpdb> 41 atoms in block 137 Block first atom: 5393 Blocpdb> 39 atoms in block 138 Block first atom: 5434 Blocpdb> 36 atoms in block 139 Block first atom: 5473 Blocpdb> 36 atoms in block 140 Block first atom: 5509 Blocpdb> 46 atoms in block 141 Block first atom: 5545 Blocpdb> 30 atoms in block 142 Block first atom: 5591 Blocpdb> 41 atoms in block 143 Block first atom: 5621 Blocpdb> 36 atoms in block 144 Block first atom: 5662 Blocpdb> 45 atoms in block 145 Block first atom: 5698 Blocpdb> 36 atoms in block 146 Block first atom: 5743 Blocpdb> 37 atoms in block 147 Block first atom: 5779 Blocpdb> 38 atoms in block 148 Block first atom: 5816 Blocpdb> 44 atoms in block 149 Block first atom: 5854 Blocpdb> 44 atoms in block 150 Block first atom: 5898 Blocpdb> 45 atoms in block 151 Block first atom: 5942 Blocpdb> 40 atoms in block 152 Block first atom: 5987 Blocpdb> 36 atoms in block 153 Block first atom: 6027 Blocpdb> 36 atoms in block 154 Block first atom: 6063 Blocpdb> 40 atoms in block 155 Block first atom: 6099 Blocpdb> 34 atoms in block 156 Block first atom: 6139 Blocpdb> 39 atoms in block 157 Block first atom: 6173 Blocpdb> 48 atoms in block 158 Block first atom: 6212 Blocpdb> 40 atoms in block 159 Block first atom: 6260 Blocpdb> 43 atoms in block 160 Block first atom: 6300 Blocpdb> 47 atoms in block 161 Block first atom: 6343 Blocpdb> 41 atoms in block 162 Block first atom: 6390 Blocpdb> 27 atoms in block 163 Block first atom: 6431 Blocpdb> 48 atoms in block 164 Block first atom: 6458 Blocpdb> 37 atoms in block 165 Block first atom: 6506 Blocpdb> 38 atoms in block 166 Block first atom: 6543 Blocpdb> 42 atoms in block 167 Block first atom: 6581 Blocpdb> 33 atoms in block 168 Block first atom: 6623 Blocpdb> 44 atoms in block 169 Block first atom: 6656 Blocpdb> 35 atoms in block 170 Block first atom: 6700 Blocpdb> 49 atoms in block 171 Block first atom: 6735 Blocpdb> 37 atoms in block 172 Block first atom: 6784 Blocpdb> 40 atoms in block 173 Block first atom: 6821 Blocpdb> 39 atoms in block 174 Block first atom: 6861 Blocpdb> 40 atoms in block 175 Block first atom: 6900 Blocpdb> 39 atoms in block 176 Block first atom: 6940 Blocpdb> 38 atoms in block 177 Block first atom: 6979 Blocpdb> 27 atoms in block 178 Block first atom: 7017 Blocpdb> 26 atoms in block 179 Block first atom: 7044 Blocpdb> 37 atoms in block 180 Block first atom: 7070 Blocpdb> 35 atoms in block 181 Block first atom: 7107 Blocpdb> 31 atoms in block 182 Block first atom: 7142 Blocpdb> 39 atoms in block 183 Block first atom: 7173 Blocpdb> 44 atoms in block 184 Block first atom: 7212 Blocpdb> 41 atoms in block 185 Block first atom: 7256 Blocpdb> 32 atoms in block 186 Block first atom: 7297 Blocpdb> 38 atoms in block 187 Block first atom: 7329 Blocpdb> 51 atoms in block 188 Block first atom: 7367 Blocpdb> 44 atoms in block 189 Block first atom: 7418 Blocpdb> 33 atoms in block 190 Block first atom: 7462 Blocpdb> 36 atoms in block 191 Block first atom: 7495 Blocpdb> 34 atoms in block 192 Block first atom: 7531 Blocpdb> 40 atoms in block 193 Block first atom: 7565 Blocpdb> 14 atoms in block 194 Block first atom: 7605 Blocpdb> 75 atoms in block 195 Block first atom: 7619 Blocpdb> 12 atoms in block 196 Block first atom: 7693 Blocpdb> 196 blocks. Blocpdb> At most, 75 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 12 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 3362162 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 23115 Prepmat> Matrix trace = 7369680.0000 Prepmat> Last element read: 23115 23115 258.7757 Prepmat> 19307 lines saved. Prepmat> 17457 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 7705 RTB> Total mass = 7705.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 7705 RTB> Number of blocks = 196 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 271339.6838 RTB> 63624 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1176 Diagstd> Nb of non-zero elements: 63624 Diagstd> Projected matrix trace = 271339.6838 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1176 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 271339.6838 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.1110162 0.2845044 0.4866391 0.9732281 1.2639295 1.7749251 1.8855369 2.2983342 2.4772573 2.8838455 3.1540952 3.5341745 3.8718269 4.6716846 4.9790835 5.5937584 5.7637250 6.0506251 6.0832637 6.7448970 7.1759308 7.8184816 8.2083766 8.4387926 8.9481905 9.2909356 9.9227188 10.2764139 10.8332194 11.3762096 11.8646708 12.0170751 12.3901910 13.4689969 14.1185969 14.9844174 15.0800817 15.7002390 16.1123937 16.5079343 17.3840705 17.7569783 18.0260803 18.2077157 19.2252765 19.6014615 20.3457975 20.3949146 21.1210006 21.7575925 21.9309229 22.5145564 23.0257434 23.4517462 24.0431953 25.0742713 25.7605938 25.9787342 27.1257750 27.3694834 27.6517576 28.0713185 28.6934949 29.1511062 29.4468975 29.9173598 30.0506736 30.8306559 31.1220052 31.3995627 32.2126635 32.4358204 32.9130447 33.5315102 33.9043800 34.5191939 35.3217094 35.7359911 36.1593195 36.4229389 37.0056005 37.7384260 38.2413659 38.7894600 39.4877622 39.6272515 40.5557784 40.8721719 41.2716064 41.4506594 41.8326450 42.1669840 43.3251530 43.6690681 43.8860540 44.2826944 44.9202206 45.2318715 45.6702178 46.0769895 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034310 0.0034319 0.0034328 0.0034332 0.0034336 0.0034352 36.1816510 57.9215015 75.7528124 107.1279000 122.0834236 144.6722710 149.1120706 164.6273044 170.9152586 184.4086448 192.8557876 204.1452486 213.6747708 234.7102399 242.3092453 256.8308160 260.7035259 267.1132323 267.8327018 282.0219703 290.8937572 303.6382572 311.1171258 315.4535621 324.8350544 330.9977226 342.0665613 348.1096588 357.4160483 366.2638633 374.0443734 376.4390499 382.2383710 398.5317323 408.0290179 420.3540264 421.6937140 430.2772776 435.8884009 441.2062399 452.7630929 457.5934638 461.0477757 463.3647717 476.1366128 480.7723767 489.8156294 490.4065093 499.0597269 506.5247833 508.5383794 515.2606505 521.0772482 525.8754213 532.4653757 543.7627340 551.1543189 553.4829839 565.5699909 568.1049592 571.0270093 575.3428043 581.6838477 586.3039230 589.2709788 593.9596084 595.2815001 602.9574455 605.7997163 608.4950925 616.3233169 618.4544570 622.9874673 628.8134713 632.3000028 638.0072338 645.3809428 649.1546849 652.9883072 655.3642892 660.5854565 667.0942101 671.5246796 676.3198705 682.3803958 683.5845776 691.5469190 694.2392094 697.6232831 699.1349326 702.3489586 705.1500641 714.7683817 717.5996902 719.3803106 722.6238635 727.8069872 730.3273397 733.8576426 737.1185290 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 7705 Rtb_to_modes> Number of blocs = 196 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9829E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9882E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9931E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9956E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9980E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0007E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1110 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2845 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4866 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9732 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.264 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.775 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.886 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.298 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.477 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.884 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.154 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.534 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.872 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.672 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.979 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.594 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.764 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.051 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.083 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.745 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.176 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.818 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.208 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.439 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.948 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.291 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.923 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.08 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1176 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00002 1.00000 1.00004 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 0.99998 1.00002 0.99999 1.00001 1.00002 1.00000 1.00000 1.00000 0.99995 1.00003 0.99998 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 1.00002 0.99998 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00002 1.00000 0.99998 1.00000 1.00002 1.00001 1.00003 0.99998 0.99999 1.00000 1.00001 0.99998 1.00001 0.99999 0.99998 1.00001 1.00001 1.00000 0.99998 1.00001 0.99997 1.00001 0.99999 1.00005 0.99998 0.99998 1.00002 1.00000 1.00001 1.00000 1.00002 0.99999 1.00001 1.00002 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 0.99999 0.99998 1.00001 1.00000 0.99995 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 0.99998 0.99998 1.00002 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 0.99997 1.00001 0.99999 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 138690 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00002 1.00000 1.00004 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 0.99998 1.00002 0.99999 1.00001 1.00002 1.00000 1.00000 1.00000 0.99995 1.00003 0.99998 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 1.00002 0.99998 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00002 1.00000 0.99998 1.00000 1.00002 1.00001 1.00003 0.99998 0.99999 1.00000 1.00001 0.99998 1.00001 0.99999 0.99998 1.00001 1.00001 1.00000 0.99998 1.00001 0.99997 1.00001 0.99999 1.00005 0.99998 0.99998 1.00002 1.00000 1.00001 1.00000 1.00002 0.99999 1.00001 1.00002 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 0.99999 0.99998 1.00001 1.00000 0.99995 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 0.99998 0.99998 1.00002 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 0.99997 1.00001 0.99999 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3: 0.000 0.000 Vector 4: 0.000 0.000 0.000 Vector 5:-0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 6: 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 7: 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 8:-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 9: 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 10:-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2604221406451425459.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2604221406451425459.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2604221406451425459.atom Openam> file on opening on unit 11: 2604221406451425459.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 775 First residue number = 1 Last residue number = 775 Number of atoms found = 7705 Mean number per residue = 9.9 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9829E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9882E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9931E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9956E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9980E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0007E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1110 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2845 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4866 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9732 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.264 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.775 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.886 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.298 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.477 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.884 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.154 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.534 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.872 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.672 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.979 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.594 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.764 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.051 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.083 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.745 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.176 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.818 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.208 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.439 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.948 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.291 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.923 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.08 Bfactors> 106 vectors, 23115 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.111000 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) %Bfactors-Wn> Experimental B-factors are nearly constant ! Bfactors> = 0.048 +/- 0.12 Bfactors> = 0.000 +/- 0.00 Bfactors> Shiftng-fct= -0.048 Bfactors> Scaling-fct= 0.000 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2604221406451425459.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2604221406451425459.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4309E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4318E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4326E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4331E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4335E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4350E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 36.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 57.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 75.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 107.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 122.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 144.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 149.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 164.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 170.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 184.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 192.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 204.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 213.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 234.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 242.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 256.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 260.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 267.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 267.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 282.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 290.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 303.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 311.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 315.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 324.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 331.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 342.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 348.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 357.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 366.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 374.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 376.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 382.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 398.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 408.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 420.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 421.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 430.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 435.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 441.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 452.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 457.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 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CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 521.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 525.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 532.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 543.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 551.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 553.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 565.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 568.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 571.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 575.3 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vecteur en lecture: 618.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 622.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 628.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 632.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 638.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 645.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 649.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 653.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 655.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 660.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 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CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 705.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 714.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 717.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 719.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 722.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 727.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 730.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 733.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 737.1 Chkmod> 106 vectors, 23115 coordinates in file. Chkmod> That is: 7705 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. Chkmod> Normal end. 0.0034 0.7689 0.0034 0.6049 0.0034 0.6885 0.0034 0.7762 0.0034 0.9791 0.0034 0.8699 36.1775 0.1776 57.9186 0.1942 75.7465 0.0604 107.1218 0.0518 122.0816 0.0394 144.6691 0.0063 149.1240 0.1963 164.6083 0.3992 170.8990 0.0987 184.4057 0.3816 192.8446 0.3089 204.1314 0.4575 213.6704 0.4370 234.7081 0.3878 242.2968 0.4284 256.8253 0.2960 260.6986 0.3638 267.1100 0.0528 267.8154 0.1354 282.0120 0.1104 290.8827 0.1891 303.6159 0.1965 311.0966 0.2528 315.4439 0.1087 324.8177 0.4286 330.9847 0.4021 342.0567 0.4894 348.1554 0.5565 357.3476 0.1383 366.3092 0.2326 373.9547 0.2922 376.4687 0.2432 382.2190 0.3708 398.5295 0.3119 408.0318 0.4504 420.2740 0.5277 421.6745 0.2708 430.2555 0.4313 435.8373 0.2026 441.2149 0.3070 452.6906 0.4304 457.6128 0.4771 461.0781 0.4815 463.3739 0.3252 476.1747 0.3738 480.7338 0.4258 489.8452 0.3632 490.3264 0.3846 499.0265 0.3464 506.5311 0.5297 508.5058 0.2549 515.1864 0.3762 521.1030 0.3574 525.8333 0.5377 532.4071 0.4981 543.6931 0.3264 551.1243 0.5004 553.4727 0.4186 565.5898 0.2930 568.0859 0.4795 570.9843 0.2687 575.3046 0.4426 581.6235 0.4834 586.2676 0.3483 589.2767 0.4561 593.9603 0.3380 595.2493 0.4657 602.9251 0.4544 605.7542 0.2857 608.4732 0.4882 616.2714 0.3674 618.4678 0.0889 622.9319 0.5914 628.7723 0.4470 632.2320 0.3245 637.9873 0.3406 645.3376 0.3254 649.1632 0.4192 652.9664 0.5123 655.3097 0.3294 660.5964 0.4565 667.0795 0.4216 671.4839 0.5077 676.2955 0.3907 682.3704 0.4684 683.5789 0.4570 691.5532 0.4432 694.1910 0.4375 697.5798 0.4465 699.0994 0.5299 702.2966 0.4899 705.1450 0.2803 714.7777 0.3084 717.5765 0.4827 719.3818 0.4089 722.5709 0.4322 727.7740 0.5126 730.2809 0.5025 733.8244 0.5488 737.1110 0.3452 getting mode 7 running: ../../bin/get_modes.sh 2604221406451425459 7 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 7 calculating perturbed structure for DQ=-100 2604221406451425459.eigenfacs 2604221406451425459.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2604221406451425459.eigenfacs 2604221406451425459.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2604221406451425459.eigenfacs 2604221406451425459.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2604221406451425459.eigenfacs 2604221406451425459.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2604221406451425459.eigenfacs 2604221406451425459.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2604221406451425459.eigenfacs 2604221406451425459.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2604221406451425459.eigenfacs 2604221406451425459.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2604221406451425459.eigenfacs 2604221406451425459.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2604221406451425459.eigenfacs 2604221406451425459.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2604221406451425459.eigenfacs 2604221406451425459.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2604221406451425459.eigenfacs 2604221406451425459.atom making animated gifs 11 models are in 2604221406451425459.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2604221406451425459.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2604221406451425459.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 2604221406451425459 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 2604221406451425459.eigenfacs 2604221406451425459.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2604221406451425459.eigenfacs 2604221406451425459.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2604221406451425459.eigenfacs 2604221406451425459.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2604221406451425459.eigenfacs 2604221406451425459.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2604221406451425459.eigenfacs 2604221406451425459.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2604221406451425459.eigenfacs 2604221406451425459.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2604221406451425459.eigenfacs 2604221406451425459.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2604221406451425459.eigenfacs 2604221406451425459.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2604221406451425459.eigenfacs 2604221406451425459.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2604221406451425459.eigenfacs 2604221406451425459.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2604221406451425459.eigenfacs 2604221406451425459.atom making animated gifs 11 models are in 2604221406451425459.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2604221406451425459.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2604221406451425459.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 2604221406451425459 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 2604221406451425459.eigenfacs 2604221406451425459.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2604221406451425459.eigenfacs 2604221406451425459.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2604221406451425459.eigenfacs 2604221406451425459.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2604221406451425459.eigenfacs 2604221406451425459.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2604221406451425459.eigenfacs 2604221406451425459.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2604221406451425459.eigenfacs 2604221406451425459.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2604221406451425459.eigenfacs 2604221406451425459.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2604221406451425459.eigenfacs 2604221406451425459.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2604221406451425459.eigenfacs 2604221406451425459.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2604221406451425459.eigenfacs 2604221406451425459.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2604221406451425459.eigenfacs 2604221406451425459.atom making animated gifs 11 models are in 2604221406451425459.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2604221406451425459.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2604221406451425459.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 2604221406451425459 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 2604221406451425459.eigenfacs 2604221406451425459.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2604221406451425459.eigenfacs 2604221406451425459.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2604221406451425459.eigenfacs 2604221406451425459.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2604221406451425459.eigenfacs 2604221406451425459.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2604221406451425459.eigenfacs 2604221406451425459.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2604221406451425459.eigenfacs 2604221406451425459.atom calculating perturbed structure for DQ=20 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