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LOGs for ID: 2604221910351480991

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2604221910351480991.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2604221910351480991.atom to be opened. Openam> File opened: 2604221910351480991.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 1192 First residue number = 18 Last residue number = 315 Number of atoms found = 9024 Mean number per residue = 7.6 Pdbmat> Coordinate statistics: = 0.157000 +/- 20.376786 From: -47.672000 To: 51.719000 = -1.137737 +/- 22.413476 From: -48.652000 To: 52.491000 = -0.311363 +/- 13.654896 From: -34.229000 To: 37.929000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 0.9689 % Filled. Pdbmat> 3550633 non-zero elements. Pdbmat> 388566 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 86.12 +/- 22.18 Maximum number = 131 Minimum number = 23 Pdbmat> Matrix trace = 7.771320E+06 Pdbmat> Larger element = 504.712 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 1192 non-zero elements, NRBL set to 6 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2604221910351480991.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 6 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2604221910351480991.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2604221910351480991.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 9024 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 6 residue(s) per block. Blocpdb> 1192 residues. Blocpdb> 47 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 47 atoms in block 2 Block first atom: 48 Blocpdb> 52 atoms in block 3 Block first atom: 95 Blocpdb> 50 atoms in block 4 Block first atom: 147 Blocpdb> 52 atoms in block 5 Block first atom: 197 Blocpdb> 47 atoms in block 6 Block first atom: 249 Blocpdb> 42 atoms in block 7 Block first atom: 296 Blocpdb> 50 atoms in block 8 Block first atom: 338 Blocpdb> 38 atoms in block 9 Block first atom: 388 Blocpdb> 48 atoms in block 10 Block first atom: 426 Blocpdb> 36 atoms in block 11 Block first atom: 474 Blocpdb> 43 atoms in block 12 Block first atom: 510 Blocpdb> 42 atoms in block 13 Block first atom: 553 Blocpdb> 45 atoms in block 14 Block first atom: 595 Blocpdb> 47 atoms in block 15 Block first atom: 640 Blocpdb> 47 atoms in block 16 Block first atom: 687 Blocpdb> 55 atoms in block 17 Block first atom: 734 Blocpdb> 50 atoms in block 18 Block first atom: 789 Blocpdb> 39 atoms in block 19 Block first atom: 839 Blocpdb> 45 atoms in block 20 Block first atom: 878 Blocpdb> 42 atoms in block 21 Block first atom: 923 Blocpdb> 38 atoms in block 22 Block first atom: 965 Blocpdb> 41 atoms in block 23 Block first atom: 1003 Blocpdb> 46 atoms in block 24 Block first atom: 1044 Blocpdb> 34 atoms in block 25 Block first atom: 1090 Blocpdb> 42 atoms in block 26 Block first atom: 1124 Blocpdb> 40 atoms in block 27 Block first atom: 1166 Blocpdb> 49 atoms in block 28 Block first atom: 1206 Blocpdb> 44 atoms in block 29 Block first atom: 1255 Blocpdb> 42 atoms in block 30 Block first atom: 1299 Blocpdb> 54 atoms in block 31 Block first atom: 1341 Blocpdb> 52 atoms in block 32 Block first atom: 1395 Blocpdb> 50 atoms in block 33 Block first atom: 1447 Blocpdb> 43 atoms in block 34 Block first atom: 1497 Blocpdb> 50 atoms in block 35 Block first atom: 1540 Blocpdb> 40 atoms in block 36 Block first atom: 1590 Blocpdb> 49 atoms in block 37 Block first atom: 1630 Blocpdb> 42 atoms in block 38 Block first atom: 1679 Blocpdb> 48 atoms in block 39 Block first atom: 1721 Blocpdb> 44 atoms in block 40 Block first atom: 1769 Blocpdb> 43 atoms in block 41 Block first atom: 1813 Blocpdb> 44 atoms in block 42 Block first atom: 1856 Blocpdb> 46 atoms in block 43 Block first atom: 1900 Blocpdb> 44 atoms in block 44 Block first atom: 1946 Blocpdb> 46 atoms in block 45 Block first atom: 1990 Blocpdb> 48 atoms in block 46 Block first atom: 2036 Blocpdb> 41 atoms in block 47 Block first atom: 2084 Blocpdb> 51 atoms in block 48 Block first atom: 2125 Blocpdb> 58 atoms in block 49 Block first atom: 2176 Blocpdb> 23 atoms in block 50 Block first atom: 2234 Blocpdb> 47 atoms in block 51 Block first atom: 2257 Blocpdb> 47 atoms in block 52 Block first atom: 2304 Blocpdb> 52 atoms in block 53 Block first atom: 2351 Blocpdb> 50 atoms in block 54 Block first atom: 2403 Blocpdb> 52 atoms in block 55 Block first atom: 2453 Blocpdb> 47 atoms in block 56 Block first atom: 2505 Blocpdb> 42 atoms in block 57 Block first atom: 2552 Blocpdb> 50 atoms in block 58 Block first atom: 2594 Blocpdb> 38 atoms in block 59 Block first atom: 2644 Blocpdb> 48 atoms in block 60 Block first atom: 2682 Blocpdb> 36 atoms in block 61 Block first atom: 2730 Blocpdb> 43 atoms in block 62 Block first atom: 2766 Blocpdb> 42 atoms in block 63 Block first atom: 2809 Blocpdb> 45 atoms in block 64 Block first atom: 2851 Blocpdb> 47 atoms in block 65 Block first atom: 2896 Blocpdb> 47 atoms in block 66 Block first atom: 2943 Blocpdb> 55 atoms in block 67 Block first atom: 2990 Blocpdb> 50 atoms in block 68 Block first atom: 3045 Blocpdb> 39 atoms in block 69 Block first atom: 3095 Blocpdb> 45 atoms in block 70 Block first atom: 3134 Blocpdb> 42 atoms in block 71 Block first atom: 3179 Blocpdb> 38 atoms in block 72 Block first atom: 3221 Blocpdb> 41 atoms in block 73 Block first atom: 3259 Blocpdb> 46 atoms in block 74 Block first atom: 3300 Blocpdb> 34 atoms in block 75 Block first atom: 3346 Blocpdb> 42 atoms in block 76 Block first atom: 3380 Blocpdb> 40 atoms in block 77 Block first atom: 3422 Blocpdb> 49 atoms in block 78 Block first atom: 3462 Blocpdb> 44 atoms in block 79 Block first atom: 3511 Blocpdb> 42 atoms in block 80 Block first atom: 3555 Blocpdb> 54 atoms in block 81 Block first atom: 3597 Blocpdb> 52 atoms in block 82 Block first atom: 3651 Blocpdb> 50 atoms in block 83 Block first atom: 3703 Blocpdb> 43 atoms in block 84 Block first atom: 3753 Blocpdb> 50 atoms in block 85 Block first atom: 3796 Blocpdb> 40 atoms in block 86 Block first atom: 3846 Blocpdb> 49 atoms in block 87 Block first atom: 3886 Blocpdb> 42 atoms in block 88 Block first atom: 3935 Blocpdb> 48 atoms in block 89 Block first atom: 3977 Blocpdb> 44 atoms in block 90 Block first atom: 4025 Blocpdb> 43 atoms in block 91 Block first atom: 4069 Blocpdb> 44 atoms in block 92 Block first atom: 4112 Blocpdb> 46 atoms in block 93 Block first atom: 4156 Blocpdb> 44 atoms in block 94 Block first atom: 4202 Blocpdb> 46 atoms in block 95 Block first atom: 4246 Blocpdb> 48 atoms in block 96 Block first atom: 4292 Blocpdb> 41 atoms in block 97 Block first atom: 4340 Blocpdb> 51 atoms in block 98 Block first atom: 4381 Blocpdb> 58 atoms in block 99 Block first atom: 4432 Blocpdb> 23 atoms in block 100 Block first atom: 4490 Blocpdb> 47 atoms in block 101 Block first atom: 4513 Blocpdb> 47 atoms in block 102 Block first atom: 4560 Blocpdb> 52 atoms in block 103 Block first atom: 4607 Blocpdb> 50 atoms in block 104 Block first atom: 4659 Blocpdb> 52 atoms in block 105 Block first atom: 4709 Blocpdb> 47 atoms in block 106 Block first atom: 4761 Blocpdb> 42 atoms in block 107 Block first atom: 4808 Blocpdb> 50 atoms in block 108 Block first atom: 4850 Blocpdb> 38 atoms in block 109 Block first atom: 4900 Blocpdb> 48 atoms in block 110 Block first atom: 4938 Blocpdb> 36 atoms in block 111 Block first atom: 4986 Blocpdb> 43 atoms in block 112 Block first atom: 5022 Blocpdb> 42 atoms in block 113 Block first atom: 5065 Blocpdb> 45 atoms in block 114 Block first atom: 5107 Blocpdb> 47 atoms in block 115 Block first atom: 5152 Blocpdb> 47 atoms in block 116 Block first atom: 5199 Blocpdb> 55 atoms in block 117 Block first atom: 5246 Blocpdb> 50 atoms in block 118 Block first atom: 5301 Blocpdb> 39 atoms in block 119 Block first atom: 5351 Blocpdb> 45 atoms in block 120 Block first atom: 5390 Blocpdb> 42 atoms in block 121 Block first atom: 5435 Blocpdb> 38 atoms in block 122 Block first atom: 5477 Blocpdb> 41 atoms in block 123 Block first atom: 5515 Blocpdb> 46 atoms in block 124 Block first atom: 5556 Blocpdb> 34 atoms in block 125 Block first atom: 5602 Blocpdb> 42 atoms in block 126 Block first atom: 5636 Blocpdb> 40 atoms in block 127 Block first atom: 5678 Blocpdb> 49 atoms in block 128 Block first atom: 5718 Blocpdb> 44 atoms in block 129 Block first atom: 5767 Blocpdb> 42 atoms in block 130 Block first atom: 5811 Blocpdb> 54 atoms in block 131 Block first atom: 5853 Blocpdb> 52 atoms in block 132 Block first atom: 5907 Blocpdb> 50 atoms in block 133 Block first atom: 5959 Blocpdb> 43 atoms in block 134 Block first atom: 6009 Blocpdb> 50 atoms in block 135 Block first atom: 6052 Blocpdb> 40 atoms in block 136 Block first atom: 6102 Blocpdb> 49 atoms in block 137 Block first atom: 6142 Blocpdb> 42 atoms in block 138 Block first atom: 6191 Blocpdb> 48 atoms in block 139 Block first atom: 6233 Blocpdb> 44 atoms in block 140 Block first atom: 6281 Blocpdb> 43 atoms in block 141 Block first atom: 6325 Blocpdb> 44 atoms in block 142 Block first atom: 6368 Blocpdb> 46 atoms in block 143 Block first atom: 6412 Blocpdb> 44 atoms in block 144 Block first atom: 6458 Blocpdb> 46 atoms in block 145 Block first atom: 6502 Blocpdb> 48 atoms in block 146 Block first atom: 6548 Blocpdb> 41 atoms in block 147 Block first atom: 6596 Blocpdb> 51 atoms in block 148 Block first atom: 6637 Blocpdb> 58 atoms in block 149 Block first atom: 6688 Blocpdb> 23 atoms in block 150 Block first atom: 6746 Blocpdb> 47 atoms in block 151 Block first atom: 6769 Blocpdb> 47 atoms in block 152 Block first atom: 6816 Blocpdb> 52 atoms in block 153 Block first atom: 6863 Blocpdb> 50 atoms in block 154 Block first atom: 6915 Blocpdb> 52 atoms in block 155 Block first atom: 6965 Blocpdb> 47 atoms in block 156 Block first atom: 7017 Blocpdb> 42 atoms in block 157 Block first atom: 7064 Blocpdb> 50 atoms in block 158 Block first atom: 7106 Blocpdb> 38 atoms in block 159 Block first atom: 7156 Blocpdb> 48 atoms in block 160 Block first atom: 7194 Blocpdb> 36 atoms in block 161 Block first atom: 7242 Blocpdb> 43 atoms in block 162 Block first atom: 7278 Blocpdb> 42 atoms in block 163 Block first atom: 7321 Blocpdb> 45 atoms in block 164 Block first atom: 7363 Blocpdb> 47 atoms in block 165 Block first atom: 7408 Blocpdb> 47 atoms in block 166 Block first atom: 7455 Blocpdb> 55 atoms in block 167 Block first atom: 7502 Blocpdb> 50 atoms in block 168 Block first atom: 7557 Blocpdb> 39 atoms in block 169 Block first atom: 7607 Blocpdb> 45 atoms in block 170 Block first atom: 7646 Blocpdb> 42 atoms in block 171 Block first atom: 7691 Blocpdb> 38 atoms in block 172 Block first atom: 7733 Blocpdb> 41 atoms in block 173 Block first atom: 7771 Blocpdb> 46 atoms in block 174 Block first atom: 7812 Blocpdb> 34 atoms in block 175 Block first atom: 7858 Blocpdb> 42 atoms in block 176 Block first atom: 7892 Blocpdb> 40 atoms in block 177 Block first atom: 7934 Blocpdb> 49 atoms in block 178 Block first atom: 7974 Blocpdb> 44 atoms in block 179 Block first atom: 8023 Blocpdb> 42 atoms in block 180 Block first atom: 8067 Blocpdb> 54 atoms in block 181 Block first atom: 8109 Blocpdb> 52 atoms in block 182 Block first atom: 8163 Blocpdb> 50 atoms in block 183 Block first atom: 8215 Blocpdb> 43 atoms in block 184 Block first atom: 8265 Blocpdb> 50 atoms in block 185 Block first atom: 8308 Blocpdb> 40 atoms in block 186 Block first atom: 8358 Blocpdb> 49 atoms in block 187 Block first atom: 8398 Blocpdb> 42 atoms in block 188 Block first atom: 8447 Blocpdb> 48 atoms in block 189 Block first atom: 8489 Blocpdb> 44 atoms in block 190 Block first atom: 8537 Blocpdb> 43 atoms in block 191 Block first atom: 8581 Blocpdb> 44 atoms in block 192 Block first atom: 8624 Blocpdb> 46 atoms in block 193 Block first atom: 8668 Blocpdb> 44 atoms in block 194 Block first atom: 8714 Blocpdb> 46 atoms in block 195 Block first atom: 8758 Blocpdb> 48 atoms in block 196 Block first atom: 8804 Blocpdb> 41 atoms in block 197 Block first atom: 8852 Blocpdb> 51 atoms in block 198 Block first atom: 8893 Blocpdb> 58 atoms in block 199 Block first atom: 8944 Blocpdb> 23 atoms in block 200 Block first atom: 9001 Blocpdb> 200 blocks. Blocpdb> At most, 58 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 23 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 3550833 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 27072 Prepmat> Matrix trace = 7771320.0000 Prepmat> Last element read: 27072 27072 176.2007 Prepmat> 20101 lines saved. Prepmat> 18326 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 9024 RTB> Total mass = 9024.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 9024 RTB> Number of blocks = 200 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 235890.6045 RTB> 60864 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1200 Diagstd> Nb of non-zero elements: 60864 Diagstd> Projected matrix trace = 235890.6045 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1200 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 235890.6045 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.4837876 0.6619517 0.9428387 1.0160861 1.0823576 1.1328749 1.8791259 1.9535283 2.0247908 2.5868081 2.9898536 4.5352613 5.0553560 5.1125291 5.3998675 5.7152604 6.3927504 7.3879242 12.2552156 12.9123568 13.7126921 13.7712759 14.1544250 15.2747754 15.5952143 15.6173469 16.7915509 17.2093004 17.2671365 17.3375553 18.2258462 18.4317277 18.8760954 19.0680965 19.4204972 19.8385564 19.8693834 20.0314208 20.6891164 21.0603886 21.1826396 21.2578283 22.0243152 22.1160066 22.1649445 22.5148629 22.6813565 24.5212480 25.0667490 25.2526458 25.6444121 25.7165412 25.7955031 26.6006002 27.5228677 28.0042277 28.5534367 28.7366344 29.0621169 29.7325779 29.8330223 30.0695795 30.1340063 30.5541296 30.6931893 31.0668357 31.1741583 31.4463942 31.8750559 32.2333196 32.5386133 33.0084995 33.1224412 33.5521415 33.7117906 33.8045831 35.0074744 35.1786337 35.7032725 35.9616369 36.3617691 36.7411171 37.4761702 37.5435073 37.6536459 37.6931669 38.0141045 39.1718893 39.4476240 39.8982192 41.2049712 41.2969067 41.4018510 41.5878194 41.9178312 42.6354098 43.2060420 43.4741313 44.3328748 44.9690750 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034330 0.0034331 0.0034336 0.0034337 0.0034338 0.0034342 75.5305528 88.3503807 105.4420827 109.4612807 112.9745636 115.5809519 148.8583561 151.7767083 154.5202338 174.6535371 187.7674208 231.2578253 244.1581086 245.5348682 252.3404252 259.6051423 274.5611933 295.1593164 380.1506686 390.2096804 402.1208976 402.9789584 408.5464075 424.4071545 428.8357210 429.1399129 444.9801991 450.4814249 451.2377670 452.1569487 463.5954136 466.2064776 471.7928583 474.1862444 478.5479413 483.6712945 484.0469353 486.0166607 493.9309637 498.3431247 499.7874187 500.6736405 509.6200279 510.6797482 511.2444475 515.2641582 517.1657947 537.7328460 543.6811634 545.6934287 549.9100464 550.6828595 551.5276388 560.0683083 569.6946247 574.6548553 580.2624592 582.1209533 585.4083367 592.1224989 593.1218276 595.4687267 596.1063078 600.2473326 601.6117219 605.2625326 606.3070922 608.9486997 613.0850952 616.5208910 619.4336589 623.8902109 624.9660838 629.0068902 630.5015967 631.3687357 642.5037553 644.0725116 648.8574458 651.2009211 654.8137384 658.2205825 664.7722488 665.3692117 666.3444688 666.6940729 669.5263326 679.6456468 682.0334980 685.9177420 697.0598809 697.8370791 698.7231932 700.2906934 703.0637111 709.0559424 713.7851726 715.9962319 723.0331799 728.2026537 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 9024 Rtb_to_modes> Number of blocs = 200 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9941E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9947E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9976E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9984E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9994E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4838 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6620 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9428 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.016 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.082 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.133 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.879 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.954 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.025 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.587 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.990 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.535 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.055 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.113 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.400 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.715 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.393 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.388 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.97 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1200 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00002 0.99998 1.00001 0.99999 1.00002 1.00002 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 1.00002 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00003 1.00003 0.99998 1.00001 0.99999 1.00001 1.00003 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 1.00002 1.00001 1.00002 1.00003 0.99999 1.00000 1.00002 0.99996 1.00000 1.00002 1.00001 0.99998 1.00001 0.99999 1.00002 0.99999 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000 0.99998 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000 0.99998 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 0.99998 0.99999 0.99999 1.00001 1.00002 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 0.99998 1.00001 0.99998 0.99997 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 162432 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00002 0.99998 1.00001 0.99999 1.00002 1.00002 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 1.00002 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00003 1.00003 0.99998 1.00001 0.99999 1.00001 1.00003 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 1.00002 1.00001 1.00002 1.00003 0.99999 1.00000 1.00002 0.99996 1.00000 1.00002 1.00001 0.99998 1.00001 0.99999 1.00002 0.99999 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000 0.99998 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000 0.99998 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 0.99998 0.99999 0.99999 1.00001 1.00002 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 0.99998 1.00001 0.99998 0.99997 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3: 0.000 0.000 Vector 4:-0.000 0.000 0.000 Vector 5: 0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 6:-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 7:-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 8: 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 9: 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 10: 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2604221910351480991.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2604221910351480991.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2604221910351480991.atom Openam> file on opening on unit 11: 2604221910351480991.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 1192 First residue number = 18 Last residue number = 315 Number of atoms found = 9024 Mean number per residue = 7.6 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9941E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9947E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9976E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9984E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9994E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4838 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6620 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9428 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.016 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.082 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.133 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.879 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.954 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.025 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.587 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.990 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.535 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.055 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.113 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.400 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.715 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.393 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.388 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.97 Bfactors> 106 vectors, 27072 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.483800 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= -0.079 for 1192 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.024 +/- 0.02 Bfactors> = 87.424 +/- 8.74 Bfactors> Shiftng-fct= 87.400 Bfactors> Scaling-fct= 569.810 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2604221910351480991.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2604221910351480991.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4328E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4329E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4334E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4335E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 75.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 88.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 105.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 109.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 113.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 115.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 148.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 151.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 154.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 174.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 187.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 231.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 244.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 245.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 252.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 259.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 274.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 295.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 380.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 390.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 402.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 402.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 408.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 424.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 428.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 429.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 444.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 450.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 451.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 452.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 463.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 466.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 471.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 474.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 478.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 483.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 484.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 486.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 493.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 498.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 499.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 500.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 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CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 551.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 560.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 569.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 574.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 580.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 582.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 585.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 592.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 593.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 595.4 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vecteur en lecture: 623.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 624.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 629.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 630.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 631.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 642.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 644.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 648.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 651.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 654.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 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CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 697.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 698.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 700.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 703.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 709.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 713.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 715.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 723.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 728.2 Chkmod> 106 vectors, 27072 coordinates in file. Chkmod> That is: 9024 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. Chkmod> Normal end. 0.0034 0.8632 0.0034 0.8050 0.0034 0.7872 0.0034 0.6819 0.0034 0.8771 0.0034 0.7950 75.5283 0.7170 88.3498 0.7769 105.4354 0.7407 109.4519 0.4697 112.9510 0.5718 115.5824 0.7038 148.8470 0.6853 151.7885 0.6169 154.5216 0.6344 174.6525 0.9006 187.7640 0.8507 231.2412 0.8312 244.1390 0.8086 245.5356 0.7221 252.3327 0.7204 259.5881 0.8042 274.5548 0.7841 295.1482 0.7934 380.2085 0.5548 390.1573 0.5227 402.0642 0.5624 402.9430 0.5203 408.4650 0.4810 424.3226 0.4393 428.8831 0.4625 429.1579 0.3597 444.9405 0.5307 450.4712 0.3819 451.2558 0.3825 452.1694 0.3985 463.6283 0.4904 466.1646 0.5057 471.8214 0.4802 474.1896 0.4523 478.5213 0.2020 483.6681 0.0912 484.0337 0.1203 485.9786 0.1354 493.9203 0.4852 498.3171 0.2652 499.7348 0.3132 500.6777 0.4250 509.5482 0.1889 510.7039 0.2636 511.1655 0.2132 515.1864 0.3157 517.1281 0.4215 537.6961 0.7107 543.6931 0.5538 545.6414 0.5477 549.8391 0.5381 550.6962 0.4734 551.5520 0.4880 560.0379 0.5402 569.6405 0.7082 574.5868 0.5604 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DQ=-80 2604221910351480991.eigenfacs 2604221910351480991.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2604221910351480991.eigenfacs 2604221910351480991.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2604221910351480991.eigenfacs 2604221910351480991.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2604221910351480991.eigenfacs 2604221910351480991.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2604221910351480991.eigenfacs 2604221910351480991.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2604221910351480991.eigenfacs 2604221910351480991.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2604221910351480991.eigenfacs 2604221910351480991.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2604221910351480991.eigenfacs 2604221910351480991.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2604221910351480991.eigenfacs 2604221910351480991.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2604221910351480991.eigenfacs 2604221910351480991.atom making animated gifs 11 models are in 2604221910351480991.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2604221910351480991.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2604221910351480991.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 2604221910351480991 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 2604221910351480991.eigenfacs 2604221910351480991.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2604221910351480991.eigenfacs 2604221910351480991.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2604221910351480991.eigenfacs 2604221910351480991.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2604221910351480991.eigenfacs 2604221910351480991.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2604221910351480991.eigenfacs 2604221910351480991.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2604221910351480991.eigenfacs 2604221910351480991.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2604221910351480991.eigenfacs 2604221910351480991.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2604221910351480991.eigenfacs 2604221910351480991.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2604221910351480991.eigenfacs 2604221910351480991.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2604221910351480991.eigenfacs 2604221910351480991.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2604221910351480991.eigenfacs 2604221910351480991.atom making animated gifs 11 models are in 2604221910351480991.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2604221910351480991.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2604221910351480991.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 2604221910351480991 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 2604221910351480991.eigenfacs 2604221910351480991.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2604221910351480991.eigenfacs 2604221910351480991.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2604221910351480991.eigenfacs 2604221910351480991.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2604221910351480991.eigenfacs 2604221910351480991.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2604221910351480991.eigenfacs 2604221910351480991.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2604221910351480991.eigenfacs 2604221910351480991.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2604221910351480991.eigenfacs 2604221910351480991.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2604221910351480991.eigenfacs 2604221910351480991.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2604221910351480991.eigenfacs 2604221910351480991.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2604221910351480991.eigenfacs 2604221910351480991.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2604221910351480991.eigenfacs 2604221910351480991.atom making animated gifs 11 models are in 2604221910351480991.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2604221910351480991.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2604221910351480991.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 2604221910351480991 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 2604221910351480991.eigenfacs 2604221910351480991.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2604221910351480991.eigenfacs 2604221910351480991.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2604221910351480991.eigenfacs 2604221910351480991.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2604221910351480991.eigenfacs 2604221910351480991.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2604221910351480991.eigenfacs 2604221910351480991.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2604221910351480991.eigenfacs 2604221910351480991.atom calculating perturbed structure for DQ=20 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MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2604221910351480991.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 2604221910351480991.10.pdb 2604221910351480991.11.pdb 2604221910351480991.7.pdb 2604221910351480991.8.pdb 2604221910351480991.9.pdb STDERR: Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL real 0m54.783s user 0m54.469s sys 0m0.286s rm: cannot remove '2604221910351480991.sdijf': No such file or directory pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: 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