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***  Test1  ***

LOGs for ID: 2604230034281546530

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2604230034281546530.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2604230034281546530.atom to be opened. Openam> File opened: 2604230034281546530.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 4355 First residue number = 1 Last residue number = 339 Number of atoms found = 4355 Mean number per residue = 1.0 Pdbmat> Coordinate statistics: = 0.759797 +/- 26.403739 From: -56.736000 To: 61.020000 = 0.563110 +/- 25.653237 From: -59.325000 To: 62.040000 = -0.164768 +/- 28.291212 From: -65.537000 To: 64.356000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 0.2723 % Filled. Pdbmat> 232385 non-zero elements. Pdbmat> 22920 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 10.53 +/- 2.46 Maximum number = 17 Minimum number = 4 Pdbmat> Matrix trace = 458400. Pdbmat> Larger element = 75.1337 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 4355 non-zero elements, NRBL set to 22 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2604230034281546530.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 22 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2604230034281546530.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2604230034281546530.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 4355 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 22 residue(s) per block. Blocpdb> 4355 residues. Blocpdb> 22 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 22 atoms in block 2 Block first atom: 23 Blocpdb> 22 atoms in block 3 Block first atom: 45 Blocpdb> 22 atoms in block 4 Block first atom: 67 Blocpdb> 22 atoms in block 5 Block first atom: 89 Blocpdb> 22 atoms in block 6 Block first atom: 111 Blocpdb> 22 atoms in block 7 Block first atom: 133 Blocpdb> 22 atoms in block 8 Block first atom: 155 Blocpdb> 22 atoms in block 9 Block first atom: 177 Blocpdb> 22 atoms in block 10 Block first atom: 199 Blocpdb> 22 atoms in block 11 Block first atom: 221 Blocpdb> 22 atoms in block 12 Block first atom: 243 Blocpdb> 22 atoms in block 13 Block first atom: 265 Blocpdb> 22 atoms in block 14 Block first atom: 287 Blocpdb> 22 atoms in block 15 Block first atom: 309 Blocpdb> 22 atoms in block 16 Block first atom: 331 Blocpdb> 22 atoms in block 17 Block first atom: 353 Blocpdb> 22 atoms in block 18 Block first atom: 375 Blocpdb> 22 atoms in block 19 Block first atom: 397 Blocpdb> 22 atoms in block 20 Block first atom: 419 Blocpdb> 22 atoms in block 21 Block first atom: 441 Blocpdb> 22 atoms in block 22 Block first atom: 463 Blocpdb> 22 atoms in block 23 Block first atom: 485 Blocpdb> 22 atoms in block 24 Block first atom: 507 Blocpdb> 22 atoms in block 25 Block first atom: 529 Blocpdb> 22 atoms in block 26 Block first atom: 551 Blocpdb> 22 atoms in block 27 Block first atom: 573 Blocpdb> 22 atoms in block 28 Block first atom: 595 Blocpdb> 22 atoms in block 29 Block first atom: 617 Blocpdb> 22 atoms in block 30 Block first atom: 639 Blocpdb> 22 atoms in block 31 Block first atom: 661 Blocpdb> 22 atoms in block 32 Block first atom: 683 Blocpdb> 22 atoms in block 33 Block first atom: 705 Blocpdb> 22 atoms in block 34 Block first atom: 727 Blocpdb> 22 atoms in block 35 Block first atom: 749 Blocpdb> 22 atoms in block 36 Block first atom: 771 Blocpdb> 22 atoms in block 37 Block first atom: 793 Blocpdb> 22 atoms in block 38 Block first atom: 815 Blocpdb> 22 atoms in block 39 Block first atom: 837 Blocpdb> 22 atoms in block 40 Block first atom: 859 Blocpdb> 22 atoms in block 41 Block first atom: 881 Blocpdb> 22 atoms in block 42 Block first atom: 903 Blocpdb> 22 atoms in block 43 Block first atom: 925 Blocpdb> 22 atoms in block 44 Block first atom: 947 Blocpdb> 22 atoms in block 45 Block first atom: 969 Blocpdb> 22 atoms in block 46 Block first atom: 991 Blocpdb> 22 atoms in block 47 Block first atom: 1013 Blocpdb> 22 atoms in block 48 Block first atom: 1035 Blocpdb> 22 atoms in block 49 Block first atom: 1057 Blocpdb> 22 atoms in block 50 Block first atom: 1079 Blocpdb> 22 atoms in block 51 Block first atom: 1101 Blocpdb> 22 atoms in block 52 Block first atom: 1123 Blocpdb> 22 atoms in block 53 Block first atom: 1145 Blocpdb> 22 atoms in block 54 Block first atom: 1167 Blocpdb> 22 atoms in block 55 Block first atom: 1189 Blocpdb> 22 atoms in block 56 Block first atom: 1211 Blocpdb> 22 atoms in block 57 Block first atom: 1233 Blocpdb> 22 atoms in block 58 Block first atom: 1255 Blocpdb> 22 atoms in block 59 Block first atom: 1277 Blocpdb> 22 atoms in block 60 Block first atom: 1299 Blocpdb> 22 atoms in block 61 Block first atom: 1321 Blocpdb> 22 atoms in block 62 Block first atom: 1343 Blocpdb> 22 atoms in block 63 Block first atom: 1365 Blocpdb> 22 atoms in block 64 Block first atom: 1387 Blocpdb> 22 atoms in block 65 Block first atom: 1409 Blocpdb> 22 atoms in block 66 Block first atom: 1431 Blocpdb> 22 atoms in block 67 Block first atom: 1453 Blocpdb> 22 atoms in block 68 Block first atom: 1475 Blocpdb> 22 atoms in block 69 Block first atom: 1497 Blocpdb> 22 atoms in block 70 Block first atom: 1519 Blocpdb> 22 atoms in block 71 Block first atom: 1541 Blocpdb> 22 atoms in block 72 Block first atom: 1563 Blocpdb> 22 atoms in block 73 Block first atom: 1585 Blocpdb> 22 atoms in block 74 Block first atom: 1607 Blocpdb> 15 atoms in block 75 Block first atom: 1629 Blocpdb> 22 atoms in block 76 Block first atom: 1644 Blocpdb> 22 atoms in block 77 Block first atom: 1666 Blocpdb> 22 atoms in block 78 Block first atom: 1688 Blocpdb> 22 atoms in block 79 Block first atom: 1710 Blocpdb> 22 atoms in block 80 Block first atom: 1732 Blocpdb> 22 atoms in block 81 Block first atom: 1754 Blocpdb> 22 atoms in block 82 Block first atom: 1776 Blocpdb> 22 atoms in block 83 Block first atom: 1798 Blocpdb> 22 atoms in block 84 Block first atom: 1820 Blocpdb> 22 atoms in block 85 Block first atom: 1842 Blocpdb> 22 atoms in block 86 Block first atom: 1864 Blocpdb> 22 atoms in block 87 Block first atom: 1886 Blocpdb> 22 atoms in block 88 Block first atom: 1908 Blocpdb> 22 atoms in block 89 Block first atom: 1930 Blocpdb> 22 atoms in block 90 Block first atom: 1952 Blocpdb> 9 atoms in block 91 Block first atom: 1974 Blocpdb> 22 atoms in block 92 Block first atom: 1983 Blocpdb> 22 atoms in block 93 Block first atom: 2005 Blocpdb> 22 atoms in block 94 Block first atom: 2027 Blocpdb> 22 atoms in block 95 Block first atom: 2049 Blocpdb> 22 atoms in block 96 Block first atom: 2071 Blocpdb> 22 atoms in block 97 Block first atom: 2093 Blocpdb> 22 atoms in block 98 Block first atom: 2115 Blocpdb> 22 atoms in block 99 Block first atom: 2137 Blocpdb> 22 atoms in block 100 Block first atom: 2159 Blocpdb> 22 atoms in block 101 Block first atom: 2181 Blocpdb> 22 atoms in block 102 Block first atom: 2203 Blocpdb> 22 atoms in block 103 Block first atom: 2225 Blocpdb> 22 atoms in block 104 Block first atom: 2247 Blocpdb> 22 atoms in block 105 Block first atom: 2269 Blocpdb> 22 atoms in block 106 Block first atom: 2291 Blocpdb> 9 atoms in block 107 Block first atom: 2313 Blocpdb> 22 atoms in block 108 Block first atom: 2322 Blocpdb> 22 atoms in block 109 Block first atom: 2344 Blocpdb> 22 atoms in block 110 Block first atom: 2366 Blocpdb> 22 atoms in block 111 Block first atom: 2388 Blocpdb> 22 atoms in block 112 Block first atom: 2410 Blocpdb> 22 atoms in block 113 Block first atom: 2432 Blocpdb> 22 atoms in block 114 Block first atom: 2454 Blocpdb> 22 atoms in block 115 Block first atom: 2476 Blocpdb> 22 atoms in block 116 Block first atom: 2498 Blocpdb> 22 atoms in block 117 Block first atom: 2520 Blocpdb> 22 atoms in block 118 Block first atom: 2542 Blocpdb> 22 atoms in block 119 Block first atom: 2564 Blocpdb> 22 atoms in block 120 Block first atom: 2586 Blocpdb> 22 atoms in block 121 Block first atom: 2608 Blocpdb> 22 atoms in block 122 Block first atom: 2630 Blocpdb> 9 atoms in block 123 Block first atom: 2652 Blocpdb> 22 atoms in block 124 Block first atom: 2661 Blocpdb> 22 atoms in block 125 Block first atom: 2683 Blocpdb> 22 atoms in block 126 Block first atom: 2705 Blocpdb> 22 atoms in block 127 Block first atom: 2727 Blocpdb> 22 atoms in block 128 Block first atom: 2749 Blocpdb> 22 atoms in block 129 Block first atom: 2771 Blocpdb> 22 atoms in block 130 Block first atom: 2793 Blocpdb> 22 atoms in block 131 Block first atom: 2815 Blocpdb> 22 atoms in block 132 Block first atom: 2837 Blocpdb> 22 atoms in block 133 Block first atom: 2859 Blocpdb> 22 atoms in block 134 Block first atom: 2881 Blocpdb> 22 atoms in block 135 Block first atom: 2903 Blocpdb> 22 atoms in block 136 Block first atom: 2925 Blocpdb> 22 atoms in block 137 Block first atom: 2947 Blocpdb> 22 atoms in block 138 Block first atom: 2969 Blocpdb> 9 atoms in block 139 Block first atom: 2991 Blocpdb> 22 atoms in block 140 Block first atom: 3000 Blocpdb> 22 atoms in block 141 Block first atom: 3022 Blocpdb> 22 atoms in block 142 Block first atom: 3044 Blocpdb> 22 atoms in block 143 Block first atom: 3066 Blocpdb> 22 atoms in block 144 Block first atom: 3088 Blocpdb> 22 atoms in block 145 Block first atom: 3110 Blocpdb> 22 atoms in block 146 Block first atom: 3132 Blocpdb> 22 atoms in block 147 Block first atom: 3154 Blocpdb> 22 atoms in block 148 Block first atom: 3176 Blocpdb> 22 atoms in block 149 Block first atom: 3198 Blocpdb> 22 atoms in block 150 Block first atom: 3220 Blocpdb> 22 atoms in block 151 Block first atom: 3242 Blocpdb> 22 atoms in block 152 Block first atom: 3264 Blocpdb> 22 atoms in block 153 Block first atom: 3286 Blocpdb> 22 atoms in block 154 Block first atom: 3308 Blocpdb> 9 atoms in block 155 Block first atom: 3330 Blocpdb> 22 atoms in block 156 Block first atom: 3339 Blocpdb> 22 atoms in block 157 Block first atom: 3361 Blocpdb> 22 atoms in block 158 Block first atom: 3383 Blocpdb> 22 atoms in block 159 Block first atom: 3405 Blocpdb> 22 atoms in block 160 Block first atom: 3427 Blocpdb> 22 atoms in block 161 Block first atom: 3449 Blocpdb> 22 atoms in block 162 Block first atom: 3471 Blocpdb> 22 atoms in block 163 Block first atom: 3493 Blocpdb> 22 atoms in block 164 Block first atom: 3515 Blocpdb> 22 atoms in block 165 Block first atom: 3537 Blocpdb> 22 atoms in block 166 Block first atom: 3559 Blocpdb> 22 atoms in block 167 Block first atom: 3581 Blocpdb> 22 atoms in block 168 Block first atom: 3603 Blocpdb> 22 atoms in block 169 Block first atom: 3625 Blocpdb> 22 atoms in block 170 Block first atom: 3647 Blocpdb> 9 atoms in block 171 Block first atom: 3669 Blocpdb> 22 atoms in block 172 Block first atom: 3678 Blocpdb> 22 atoms in block 173 Block first atom: 3700 Blocpdb> 22 atoms in block 174 Block first atom: 3722 Blocpdb> 22 atoms in block 175 Block first atom: 3744 Blocpdb> 22 atoms in block 176 Block first atom: 3766 Blocpdb> 22 atoms in block 177 Block first atom: 3788 Blocpdb> 22 atoms in block 178 Block first atom: 3810 Blocpdb> 22 atoms in block 179 Block first atom: 3832 Blocpdb> 22 atoms in block 180 Block first atom: 3854 Blocpdb> 22 atoms in block 181 Block first atom: 3876 Blocpdb> 22 atoms in block 182 Block first atom: 3898 Blocpdb> 22 atoms in block 183 Block first atom: 3920 Blocpdb> 22 atoms in block 184 Block first atom: 3942 Blocpdb> 22 atoms in block 185 Block first atom: 3964 Blocpdb> 22 atoms in block 186 Block first atom: 3986 Blocpdb> 9 atoms in block 187 Block first atom: 4008 Blocpdb> 22 atoms in block 188 Block first atom: 4017 Blocpdb> 22 atoms in block 189 Block first atom: 4039 Blocpdb> 22 atoms in block 190 Block first atom: 4061 Blocpdb> 22 atoms in block 191 Block first atom: 4083 Blocpdb> 22 atoms in block 192 Block first atom: 4105 Blocpdb> 22 atoms in block 193 Block first atom: 4127 Blocpdb> 22 atoms in block 194 Block first atom: 4149 Blocpdb> 22 atoms in block 195 Block first atom: 4171 Blocpdb> 22 atoms in block 196 Block first atom: 4193 Blocpdb> 22 atoms in block 197 Block first atom: 4215 Blocpdb> 22 atoms in block 198 Block first atom: 4237 Blocpdb> 22 atoms in block 199 Block first atom: 4259 Blocpdb> 22 atoms in block 200 Block first atom: 4281 Blocpdb> 22 atoms in block 201 Block first atom: 4303 Blocpdb> 22 atoms in block 202 Block first atom: 4325 Blocpdb> 9 atoms in block 203 Block first atom: 4346 Blocpdb> 203 blocks. Blocpdb> At most, 22 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 9 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 232588 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 13065 Prepmat> Matrix trace = 458400.0000 Prepmat> Last element read: 13065 13065 19.3778 Prepmat> 20707 lines saved. Prepmat> 19605 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 4355 RTB> Total mass = 4355.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 4355 RTB> Number of blocks = 203 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 18526.7753 RTB> 36591 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1218 Diagstd> Nb of non-zero elements: 36591 Diagstd> Projected matrix trace = 18526.7753 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1218 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 18526.7753 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0737389 0.0844695 0.1067319 0.1178158 0.1523033 0.1819297 0.1849891 0.2213218 0.2295425 0.2546309 0.2678275 0.2916429 0.3066981 0.3280275 0.3368529 0.3829742 0.3901590 0.3962012 0.4101575 0.4411788 0.4667688 0.4946780 0.5002195 0.5082550 0.5352122 0.5596291 0.5941359 0.6102104 0.6247304 0.6512778 0.6761266 0.6968996 0.7049679 0.7218883 0.7350530 0.7435930 0.7665697 0.7984329 0.8090775 0.8468500 0.8640359 0.8753089 0.9018128 0.9199835 0.9340020 0.9563893 0.9749190 0.9813788 0.9916006 1.0224891 1.0355925 1.0612989 1.0673101 1.0751101 1.0912204 1.1037022 1.1340168 1.1411706 1.1559838 1.1778376 1.1804479 1.1907223 1.2100787 1.2366922 1.2447947 1.2484202 1.2608939 1.2697466 1.2860475 1.3087390 1.3149318 1.3282142 1.3580670 1.3753425 1.3889061 1.3946748 1.4301636 1.4456053 1.4658549 1.4851608 1.4929081 1.5196030 1.5351130 1.5504774 1.5651571 1.5810514 1.5942646 1.6115351 1.6383780 1.6471984 1.6677680 1.6828482 1.6914228 1.7133777 1.7223377 1.7347928 1.7706365 1.7865371 1.7911765 1.8033759 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034338 0.0034339 0.0034339 0.0034340 0.0034340 0.0034340 29.4878917 31.5606076 35.4766376 37.2732293 42.3789230 46.3177107 46.7055380 51.0866466 52.0267617 54.7962484 56.1982641 58.6436538 60.1382591 62.1942717 63.0253721 67.2016684 67.8291100 68.3523099 69.5457498 72.1277842 74.1901421 76.3759434 76.8025444 77.4169571 79.4434861 81.2354157 83.7024534 84.8271878 85.8304914 87.6351634 89.2913300 90.6526270 91.1758754 92.2635736 93.1010579 93.6403255 95.0760447 97.0318919 97.6765544 99.9306047 100.9395057 101.5958470 103.1225088 104.1562427 104.9467966 106.1970939 107.2209241 107.5755627 108.1343467 109.8056335 110.5069836 111.8701275 112.1864965 112.5956851 113.4361579 114.0830805 115.6391835 116.0033609 116.7538354 117.8522819 117.9827978 118.4951353 119.4543845 120.7608322 121.1557807 121.3320909 121.9367312 122.3640426 123.1469841 124.2286601 124.5222328 125.1495625 126.5481736 127.3505176 127.9769386 128.2424367 129.8638081 130.5630069 131.4742725 132.3372218 132.6819419 133.8629379 134.5443480 135.2159740 135.8545696 136.5426332 137.1120071 137.8526646 138.9960086 139.3696600 140.2371570 140.8697517 141.2281834 142.1418093 142.5129835 143.0273480 144.4973832 145.1447396 145.3330764 145.8271566 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 4355 Rtb_to_modes> Number of blocs = 203 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9993E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9995E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9998E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.3739E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.4470E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1067 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1178 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1523 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1819 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1850 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2213 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2295 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2546 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2678 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2916 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3067 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3280 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3369 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3830 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3902 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3962 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4102 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4412 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4668 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4947 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5002 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5083 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5352 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5596 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5941 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6102 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6247 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6513 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6761 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6969 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7050 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7219 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7351 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7436 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7666 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7984 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8091 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8468 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8640 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8753 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9018 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9200 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9340 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9564 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9749 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9814 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9916 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.022 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.036 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.061 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.067 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.075 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.091 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.104 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.134 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.141 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.156 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.178 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.180 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.191 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.210 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.237 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.245 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.248 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.261 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.270 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.286 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.309 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.315 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.328 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.358 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.375 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.389 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.395 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.430 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.446 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.466 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.485 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.493 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.520 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.535 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.550 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.565 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.581 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.594 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.612 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.638 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.647 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.668 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.683 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.691 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.713 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.722 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.735 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.771 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.787 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.791 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.803 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1218 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 1.00002 1.00000 1.00000 0.99999 1.00002 1.00000 1.00001 0.99999 0.99998 1.00001 1.00000 1.00001 1.00002 1.00001 1.00001 0.99998 1.00003 1.00001 1.00000 1.00001 0.99998 1.00001 0.99998 1.00002 1.00001 1.00001 1.00001 0.99999 1.00001 0.99997 1.00000 0.99999 1.00002 0.99999 0.99999 1.00002 1.00001 0.99999 1.00001 0.99998 0.99999 1.00001 0.99999 1.00001 1.00001 1.00001 1.00001 0.99999 0.99998 1.00001 1.00001 1.00002 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 0.99996 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 0.99997 0.99997 0.99999 0.99997 0.99999 0.99998 1.00002 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 0.99998 0.99999 0.99997 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 0.99998 1.00002 1.00003 1.00000 1.00000 1.00002 0.99999 0.99999 1.00000 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 78390 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 1.00002 1.00000 1.00000 0.99999 1.00002 1.00000 1.00001 0.99999 0.99998 1.00001 1.00000 1.00001 1.00002 1.00001 1.00001 0.99998 1.00003 1.00001 1.00000 1.00001 0.99998 1.00001 0.99998 1.00002 1.00001 1.00001 1.00001 0.99999 1.00001 0.99997 1.00000 0.99999 1.00002 0.99999 0.99999 1.00002 1.00001 0.99999 1.00001 0.99998 0.99999 1.00001 0.99999 1.00001 1.00001 1.00001 1.00001 0.99999 0.99998 1.00001 1.00001 1.00002 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 0.99996 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 0.99997 0.99997 0.99999 0.99997 0.99999 0.99998 1.00002 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 0.99998 0.99999 0.99997 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 0.99998 1.00002 1.00003 1.00000 1.00000 1.00002 0.99999 0.99999 1.00000 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3: 0.000-0.000 Vector 4:-0.000-0.000-0.000 Vector 5:-0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 6:-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 7: 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 8: 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 9: 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 10: 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2604230034281546530.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2604230034281546530.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2604230034281546530.atom Openam> file on opening on unit 11: 2604230034281546530.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 4355 First residue number = 1 Last residue number = 339 Number of atoms found = 4355 Mean number per residue = 1.0 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9993E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9995E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9998E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.3739E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.4470E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1067 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1178 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1523 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1819 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1850 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2213 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2295 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2546 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2678 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2916 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3067 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3280 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3369 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3830 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3902 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3962 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4102 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4412 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4668 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4947 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5002 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5083 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5352 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5596 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5941 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6102 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6247 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6513 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6761 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6969 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7050 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7219 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7351 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7436 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7666 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7984 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8091 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8468 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8640 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8753 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9018 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9200 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9340 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9564 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9749 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9814 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9916 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.022 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.036 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.061 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.067 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.075 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.091 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.104 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.134 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.141 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.156 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.178 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.180 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.191 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.210 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.237 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.245 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.248 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.261 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.270 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.286 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.309 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.315 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.328 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.358 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.375 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.389 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.395 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.430 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.446 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.466 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.485 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.493 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.520 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.535 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.550 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.565 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.581 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.594 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.612 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.638 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.647 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.668 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.683 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.691 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.713 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.722 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.735 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.771 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.787 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.791 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.803 Bfactors> 106 vectors, 13065 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.073739 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) %Bfactors-Wn> Experimental B-factors are nearly constant ! Bfactors> = 0.646 +/- 0.61 Bfactors> = 0.000 +/- 0.00 Bfactors> Shiftng-fct= -0.646 Bfactors> Scaling-fct= 0.000 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2604230034281546530.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2604230034281546530.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 29.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 31.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 35.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 37.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 42.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 46.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 46.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 51.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 52.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 54.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 56.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 58.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 60.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 62.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 63.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 67.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 67.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 68.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 69.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 72.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 74.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 76.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 76.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 77.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 79.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 81.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 83.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 84.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 85.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 87.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 89.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 90.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 91.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 92.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 93.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 93.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 95.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 97.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 97.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 99.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 100.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 101.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 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CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 112.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 112.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 113.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 114.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 115.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 116.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 116.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 117.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 118.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 118.5 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vecteur en lecture: 125.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 126.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 127.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 128.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 128.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 129.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 130.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 131.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 132.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 132.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 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CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 140.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 141.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 142.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 142.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 143.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 144.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 145.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 145.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 145.8 Chkmod> 106 vectors, 13065 coordinates in file. Chkmod> That is: 4355 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. Chkmod> Normal end. 0.0034 0.7605 0.0034 0.8089 0.0034 0.9155 0.0034 0.9540 0.0034 0.7446 0.0034 0.9984 29.4866 0.2655 31.5593 0.5696 35.4698 0.4168 37.2691 0.2956 42.3766 0.0912 46.3119 0.5649 46.7049 0.6067 51.0819 0.5527 52.0197 0.6977 54.7906 0.6890 56.1930 0.7325 58.6368 0.5392 60.1359 0.6697 62.1890 0.5171 63.0271 0.4718 67.2010 0.6745 67.8298 0.3584 68.3493 0.4226 69.5464 0.6556 72.1264 0.4119 74.1894 0.5851 76.3744 0.5046 76.7977 0.5640 77.4171 0.5022 79.4392 0.5949 81.2298 0.6028 83.6963 0.5948 84.8228 0.6324 85.8247 0.5197 87.6329 0.3805 89.2857 0.4891 90.6488 0.5620 91.1740 0.4942 92.2604 0.5048 93.1000 0.4796 93.6367 0.6140 95.0738 0.5614 97.0257 0.6244 97.6737 0.5286 99.9234 0.5557 100.9331 0.5930 101.5910 0.5305 103.1174 0.5225 104.1527 0.2862 104.9422 0.4209 106.1931 0.3923 107.2153 0.4384 107.5721 0.4703 108.1297 0.4315 109.7747 0.4877 110.5240 0.2382 111.8496 0.3137 112.1654 0.4460 112.5851 0.3794 113.4198 0.3779 114.0936 0.3695 115.6334 0.2999 115.9897 0.3247 116.7496 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will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2604230034281546530.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2604230034281546530.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 2604230034281546530 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 2604230034281546530.eigenfacs 2604230034281546530.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2604230034281546530.eigenfacs 2604230034281546530.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2604230034281546530.eigenfacs 2604230034281546530.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2604230034281546530.eigenfacs 2604230034281546530.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2604230034281546530.eigenfacs 2604230034281546530.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2604230034281546530.eigenfacs 2604230034281546530.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2604230034281546530.eigenfacs 2604230034281546530.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2604230034281546530.eigenfacs 2604230034281546530.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2604230034281546530.eigenfacs 2604230034281546530.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2604230034281546530.eigenfacs 2604230034281546530.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2604230034281546530.eigenfacs 2604230034281546530.atom making animated gifs 11 models are in 2604230034281546530.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2604230034281546530.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2604230034281546530.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 2604230034281546530 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 2604230034281546530.eigenfacs 2604230034281546530.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2604230034281546530.eigenfacs 2604230034281546530.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2604230034281546530.eigenfacs 2604230034281546530.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2604230034281546530.eigenfacs 2604230034281546530.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2604230034281546530.eigenfacs 2604230034281546530.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2604230034281546530.eigenfacs 2604230034281546530.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2604230034281546530.eigenfacs 2604230034281546530.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2604230034281546530.eigenfacs 2604230034281546530.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2604230034281546530.eigenfacs 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