***  Test1  ***
Output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 2604230034281546530.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 2604230034281546530.atom to be opened.
Openam> File opened: 2604230034281546530.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 4355
First residue number = 1
Last residue number = 339
Number of atoms found = 4355
Mean number per residue = 1.0
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 0.759797 +/- 26.403739 From: -56.736000 To: 61.020000
= 0.563110 +/- 25.653237 From: -59.325000 To: 62.040000
= -0.164768 +/- 28.291212 From: -65.537000 To: 64.356000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 0.2723 % Filled.
Pdbmat> 232385 non-zero elements.
Pdbmat> 22920 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 10.53 +/- 2.46
Maximum number = 17
Minimum number = 4
Pdbmat> Matrix trace = 458400.
Pdbmat> Larger element = 75.1337
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
4355 non-zero elements, NRBL set to 22
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 2604230034281546530.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 22
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 2604230034281546530.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
2604230034281546530.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 4355 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 22 residue(s) per block.
Blocpdb> 4355 residues.
Blocpdb> 22 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 22 atoms in block 2
Block first atom: 23
Blocpdb> 22 atoms in block 3
Block first atom: 45
Blocpdb> 22 atoms in block 4
Block first atom: 67
Blocpdb> 22 atoms in block 5
Block first atom: 89
Blocpdb> 22 atoms in block 6
Block first atom: 111
Blocpdb> 22 atoms in block 7
Block first atom: 133
Blocpdb> 22 atoms in block 8
Block first atom: 155
Blocpdb> 22 atoms in block 9
Block first atom: 177
Blocpdb> 22 atoms in block 10
Block first atom: 199
Blocpdb> 22 atoms in block 11
Block first atom: 221
Blocpdb> 22 atoms in block 12
Block first atom: 243
Blocpdb> 22 atoms in block 13
Block first atom: 265
Blocpdb> 22 atoms in block 14
Block first atom: 287
Blocpdb> 22 atoms in block 15
Block first atom: 309
Blocpdb> 22 atoms in block 16
Block first atom: 331
Blocpdb> 22 atoms in block 17
Block first atom: 353
Blocpdb> 22 atoms in block 18
Block first atom: 375
Blocpdb> 22 atoms in block 19
Block first atom: 397
Blocpdb> 22 atoms in block 20
Block first atom: 419
Blocpdb> 22 atoms in block 21
Block first atom: 441
Blocpdb> 22 atoms in block 22
Block first atom: 463
Blocpdb> 22 atoms in block 23
Block first atom: 485
Blocpdb> 22 atoms in block 24
Block first atom: 507
Blocpdb> 22 atoms in block 25
Block first atom: 529
Blocpdb> 22 atoms in block 26
Block first atom: 551
Blocpdb> 22 atoms in block 27
Block first atom: 573
Blocpdb> 22 atoms in block 28
Block first atom: 595
Blocpdb> 22 atoms in block 29
Block first atom: 617
Blocpdb> 22 atoms in block 30
Block first atom: 639
Blocpdb> 22 atoms in block 31
Block first atom: 661
Blocpdb> 22 atoms in block 32
Block first atom: 683
Blocpdb> 22 atoms in block 33
Block first atom: 705
Blocpdb> 22 atoms in block 34
Block first atom: 727
Blocpdb> 22 atoms in block 35
Block first atom: 749
Blocpdb> 22 atoms in block 36
Block first atom: 771
Blocpdb> 22 atoms in block 37
Block first atom: 793
Blocpdb> 22 atoms in block 38
Block first atom: 815
Blocpdb> 22 atoms in block 39
Block first atom: 837
Blocpdb> 22 atoms in block 40
Block first atom: 859
Blocpdb> 22 atoms in block 41
Block first atom: 881
Blocpdb> 22 atoms in block 42
Block first atom: 903
Blocpdb> 22 atoms in block 43
Block first atom: 925
Blocpdb> 22 atoms in block 44
Block first atom: 947
Blocpdb> 22 atoms in block 45
Block first atom: 969
Blocpdb> 22 atoms in block 46
Block first atom: 991
Blocpdb> 22 atoms in block 47
Block first atom: 1013
Blocpdb> 22 atoms in block 48
Block first atom: 1035
Blocpdb> 22 atoms in block 49
Block first atom: 1057
Blocpdb> 22 atoms in block 50
Block first atom: 1079
Blocpdb> 22 atoms in block 51
Block first atom: 1101
Blocpdb> 22 atoms in block 52
Block first atom: 1123
Blocpdb> 22 atoms in block 53
Block first atom: 1145
Blocpdb> 22 atoms in block 54
Block first atom: 1167
Blocpdb> 22 atoms in block 55
Block first atom: 1189
Blocpdb> 22 atoms in block 56
Block first atom: 1211
Blocpdb> 22 atoms in block 57
Block first atom: 1233
Blocpdb> 22 atoms in block 58
Block first atom: 1255
Blocpdb> 22 atoms in block 59
Block first atom: 1277
Blocpdb> 22 atoms in block 60
Block first atom: 1299
Blocpdb> 22 atoms in block 61
Block first atom: 1321
Blocpdb> 22 atoms in block 62
Block first atom: 1343
Blocpdb> 22 atoms in block 63
Block first atom: 1365
Blocpdb> 22 atoms in block 64
Block first atom: 1387
Blocpdb> 22 atoms in block 65
Block first atom: 1409
Blocpdb> 22 atoms in block 66
Block first atom: 1431
Blocpdb> 22 atoms in block 67
Block first atom: 1453
Blocpdb> 22 atoms in block 68
Block first atom: 1475
Blocpdb> 22 atoms in block 69
Block first atom: 1497
Blocpdb> 22 atoms in block 70
Block first atom: 1519
Blocpdb> 22 atoms in block 71
Block first atom: 1541
Blocpdb> 22 atoms in block 72
Block first atom: 1563
Blocpdb> 22 atoms in block 73
Block first atom: 1585
Blocpdb> 22 atoms in block 74
Block first atom: 1607
Blocpdb> 15 atoms in block 75
Block first atom: 1629
Blocpdb> 22 atoms in block 76
Block first atom: 1644
Blocpdb> 22 atoms in block 77
Block first atom: 1666
Blocpdb> 22 atoms in block 78
Block first atom: 1688
Blocpdb> 22 atoms in block 79
Block first atom: 1710
Blocpdb> 22 atoms in block 80
Block first atom: 1732
Blocpdb> 22 atoms in block 81
Block first atom: 1754
Blocpdb> 22 atoms in block 82
Block first atom: 1776
Blocpdb> 22 atoms in block 83
Block first atom: 1798
Blocpdb> 22 atoms in block 84
Block first atom: 1820
Blocpdb> 22 atoms in block 85
Block first atom: 1842
Blocpdb> 22 atoms in block 86
Block first atom: 1864
Blocpdb> 22 atoms in block 87
Block first atom: 1886
Blocpdb> 22 atoms in block 88
Block first atom: 1908
Blocpdb> 22 atoms in block 89
Block first atom: 1930
Blocpdb> 22 atoms in block 90
Block first atom: 1952
Blocpdb> 9 atoms in block 91
Block first atom: 1974
Blocpdb> 22 atoms in block 92
Block first atom: 1983
Blocpdb> 22 atoms in block 93
Block first atom: 2005
Blocpdb> 22 atoms in block 94
Block first atom: 2027
Blocpdb> 22 atoms in block 95
Block first atom: 2049
Blocpdb> 22 atoms in block 96
Block first atom: 2071
Blocpdb> 22 atoms in block 97
Block first atom: 2093
Blocpdb> 22 atoms in block 98
Block first atom: 2115
Blocpdb> 22 atoms in block 99
Block first atom: 2137
Blocpdb> 22 atoms in block 100
Block first atom: 2159
Blocpdb> 22 atoms in block 101
Block first atom: 2181
Blocpdb> 22 atoms in block 102
Block first atom: 2203
Blocpdb> 22 atoms in block 103
Block first atom: 2225
Blocpdb> 22 atoms in block 104
Block first atom: 2247
Blocpdb> 22 atoms in block 105
Block first atom: 2269
Blocpdb> 22 atoms in block 106
Block first atom: 2291
Blocpdb> 9 atoms in block 107
Block first atom: 2313
Blocpdb> 22 atoms in block 108
Block first atom: 2322
Blocpdb> 22 atoms in block 109
Block first atom: 2344
Blocpdb> 22 atoms in block 110
Block first atom: 2366
Blocpdb> 22 atoms in block 111
Block first atom: 2388
Blocpdb> 22 atoms in block 112
Block first atom: 2410
Blocpdb> 22 atoms in block 113
Block first atom: 2432
Blocpdb> 22 atoms in block 114
Block first atom: 2454
Blocpdb> 22 atoms in block 115
Block first atom: 2476
Blocpdb> 22 atoms in block 116
Block first atom: 2498
Blocpdb> 22 atoms in block 117
Block first atom: 2520
Blocpdb> 22 atoms in block 118
Block first atom: 2542
Blocpdb> 22 atoms in block 119
Block first atom: 2564
Blocpdb> 22 atoms in block 120
Block first atom: 2586
Blocpdb> 22 atoms in block 121
Block first atom: 2608
Blocpdb> 22 atoms in block 122
Block first atom: 2630
Blocpdb> 9 atoms in block 123
Block first atom: 2652
Blocpdb> 22 atoms in block 124
Block first atom: 2661
Blocpdb> 22 atoms in block 125
Block first atom: 2683
Blocpdb> 22 atoms in block 126
Block first atom: 2705
Blocpdb> 22 atoms in block 127
Block first atom: 2727
Blocpdb> 22 atoms in block 128
Block first atom: 2749
Blocpdb> 22 atoms in block 129
Block first atom: 2771
Blocpdb> 22 atoms in block 130
Block first atom: 2793
Blocpdb> 22 atoms in block 131
Block first atom: 2815
Blocpdb> 22 atoms in block 132
Block first atom: 2837
Blocpdb> 22 atoms in block 133
Block first atom: 2859
Blocpdb> 22 atoms in block 134
Block first atom: 2881
Blocpdb> 22 atoms in block 135
Block first atom: 2903
Blocpdb> 22 atoms in block 136
Block first atom: 2925
Blocpdb> 22 atoms in block 137
Block first atom: 2947
Blocpdb> 22 atoms in block 138
Block first atom: 2969
Blocpdb> 9 atoms in block 139
Block first atom: 2991
Blocpdb> 22 atoms in block 140
Block first atom: 3000
Blocpdb> 22 atoms in block 141
Block first atom: 3022
Blocpdb> 22 atoms in block 142
Block first atom: 3044
Blocpdb> 22 atoms in block 143
Block first atom: 3066
Blocpdb> 22 atoms in block 144
Block first atom: 3088
Blocpdb> 22 atoms in block 145
Block first atom: 3110
Blocpdb> 22 atoms in block 146
Block first atom: 3132
Blocpdb> 22 atoms in block 147
Block first atom: 3154
Blocpdb> 22 atoms in block 148
Block first atom: 3176
Blocpdb> 22 atoms in block 149
Block first atom: 3198
Blocpdb> 22 atoms in block 150
Block first atom: 3220
Blocpdb> 22 atoms in block 151
Block first atom: 3242
Blocpdb> 22 atoms in block 152
Block first atom: 3264
Blocpdb> 22 atoms in block 153
Block first atom: 3286
Blocpdb> 22 atoms in block 154
Block first atom: 3308
Blocpdb> 9 atoms in block 155
Block first atom: 3330
Blocpdb> 22 atoms in block 156
Block first atom: 3339
Blocpdb> 22 atoms in block 157
Block first atom: 3361
Blocpdb> 22 atoms in block 158
Block first atom: 3383
Blocpdb> 22 atoms in block 159
Block first atom: 3405
Blocpdb> 22 atoms in block 160
Block first atom: 3427
Blocpdb> 22 atoms in block 161
Block first atom: 3449
Blocpdb> 22 atoms in block 162
Block first atom: 3471
Blocpdb> 22 atoms in block 163
Block first atom: 3493
Blocpdb> 22 atoms in block 164
Block first atom: 3515
Blocpdb> 22 atoms in block 165
Block first atom: 3537
Blocpdb> 22 atoms in block 166
Block first atom: 3559
Blocpdb> 22 atoms in block 167
Block first atom: 3581
Blocpdb> 22 atoms in block 168
Block first atom: 3603
Blocpdb> 22 atoms in block 169
Block first atom: 3625
Blocpdb> 22 atoms in block 170
Block first atom: 3647
Blocpdb> 9 atoms in block 171
Block first atom: 3669
Blocpdb> 22 atoms in block 172
Block first atom: 3678
Blocpdb> 22 atoms in block 173
Block first atom: 3700
Blocpdb> 22 atoms in block 174
Block first atom: 3722
Blocpdb> 22 atoms in block 175
Block first atom: 3744
Blocpdb> 22 atoms in block 176
Block first atom: 3766
Blocpdb> 22 atoms in block 177
Block first atom: 3788
Blocpdb> 22 atoms in block 178
Block first atom: 3810
Blocpdb> 22 atoms in block 179
Block first atom: 3832
Blocpdb> 22 atoms in block 180
Block first atom: 3854
Blocpdb> 22 atoms in block 181
Block first atom: 3876
Blocpdb> 22 atoms in block 182
Block first atom: 3898
Blocpdb> 22 atoms in block 183
Block first atom: 3920
Blocpdb> 22 atoms in block 184
Block first atom: 3942
Blocpdb> 22 atoms in block 185
Block first atom: 3964
Blocpdb> 22 atoms in block 186
Block first atom: 3986
Blocpdb> 9 atoms in block 187
Block first atom: 4008
Blocpdb> 22 atoms in block 188
Block first atom: 4017
Blocpdb> 22 atoms in block 189
Block first atom: 4039
Blocpdb> 22 atoms in block 190
Block first atom: 4061
Blocpdb> 22 atoms in block 191
Block first atom: 4083
Blocpdb> 22 atoms in block 192
Block first atom: 4105
Blocpdb> 22 atoms in block 193
Block first atom: 4127
Blocpdb> 22 atoms in block 194
Block first atom: 4149
Blocpdb> 22 atoms in block 195
Block first atom: 4171
Blocpdb> 22 atoms in block 196
Block first atom: 4193
Blocpdb> 22 atoms in block 197
Block first atom: 4215
Blocpdb> 22 atoms in block 198
Block first atom: 4237
Blocpdb> 22 atoms in block 199
Block first atom: 4259
Blocpdb> 22 atoms in block 200
Block first atom: 4281
Blocpdb> 22 atoms in block 201
Block first atom: 4303
Blocpdb> 22 atoms in block 202
Block first atom: 4325
Blocpdb> 9 atoms in block 203
Block first atom: 4346
Blocpdb> 203 blocks.
Blocpdb> At most, 22 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 9 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 232588 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 13065
Prepmat> Matrix trace = 458400.0000
Prepmat> Last element read: 13065 13065 19.3778
Prepmat> 20707 lines saved.
Prepmat> 19605 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 4355
RTB> Total mass = 4355.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 4355
RTB> Number of blocks = 203
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 18526.7753
RTB> 36591 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 1218
Diagstd> Nb of non-zero elements: 36591
Diagstd> Projected matrix trace = 18526.7753
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 1218 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 18526.7753
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.0737389 0.0844695 0.1067319 0.1178158
0.1523033 0.1819297 0.1849891 0.2213218 0.2295425
0.2546309 0.2678275 0.2916429 0.3066981 0.3280275
0.3368529 0.3829742 0.3901590 0.3962012 0.4101575
0.4411788 0.4667688 0.4946780 0.5002195 0.5082550
0.5352122 0.5596291 0.5941359 0.6102104 0.6247304
0.6512778 0.6761266 0.6968996 0.7049679 0.7218883
0.7350530 0.7435930 0.7665697 0.7984329 0.8090775
0.8468500 0.8640359 0.8753089 0.9018128 0.9199835
0.9340020 0.9563893 0.9749190 0.9813788 0.9916006
1.0224891 1.0355925 1.0612989 1.0673101 1.0751101
1.0912204 1.1037022 1.1340168 1.1411706 1.1559838
1.1778376 1.1804479 1.1907223 1.2100787 1.2366922
1.2447947 1.2484202 1.2608939 1.2697466 1.2860475
1.3087390 1.3149318 1.3282142 1.3580670 1.3753425
1.3889061 1.3946748 1.4301636 1.4456053 1.4658549
1.4851608 1.4929081 1.5196030 1.5351130 1.5504774
1.5651571 1.5810514 1.5942646 1.6115351 1.6383780
1.6471984 1.6677680 1.6828482 1.6914228 1.7133777
1.7223377 1.7347928 1.7706365 1.7865371 1.7911765
1.8033759
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034338 0.0034339 0.0034339 0.0034340 0.0034340
0.0034340 29.4878917 31.5606076 35.4766376 37.2732293
42.3789230 46.3177107 46.7055380 51.0866466 52.0267617
54.7962484 56.1982641 58.6436538 60.1382591 62.1942717
63.0253721 67.2016684 67.8291100 68.3523099 69.5457498
72.1277842 74.1901421 76.3759434 76.8025444 77.4169571
79.4434861 81.2354157 83.7024534 84.8271878 85.8304914
87.6351634 89.2913300 90.6526270 91.1758754 92.2635736
93.1010579 93.6403255 95.0760447 97.0318919 97.6765544
99.9306047 100.9395057 101.5958470 103.1225088 104.1562427
104.9467966 106.1970939 107.2209241 107.5755627 108.1343467
109.8056335 110.5069836 111.8701275 112.1864965 112.5956851
113.4361579 114.0830805 115.6391835 116.0033609 116.7538354
117.8522819 117.9827978 118.4951353 119.4543845 120.7608322
121.1557807 121.3320909 121.9367312 122.3640426 123.1469841
124.2286601 124.5222328 125.1495625 126.5481736 127.3505176
127.9769386 128.2424367 129.8638081 130.5630069 131.4742725
132.3372218 132.6819419 133.8629379 134.5443480 135.2159740
135.8545696 136.5426332 137.1120071 137.8526646 138.9960086
139.3696600 140.2371570 140.8697517 141.2281834 142.1418093
142.5129835 143.0273480 144.4973832 145.1447396 145.3330764
145.8271566
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 4355
Rtb_to_modes> Number of blocs = 203
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9993E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9995E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9998E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.3739E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.4470E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1067
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1178
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1523
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1819
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1850
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2213
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2295
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2546
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2678
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2916
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3067
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3280
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3369
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3830
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3902
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3962
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4102
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4412
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4668
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4947
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5002
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5083
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5352
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5596
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5941
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6102
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6247
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6513
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6761
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6969
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7050
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7219
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7351
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7436
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7666
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7984
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8091
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8468
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8640
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8753
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9018
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9200
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9340
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9564
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9749
Rdmodfacs> Eigenvector number: 54
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9814
Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9916
Rdmodfacs> Eigenvector number: 56
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.022
Rdmodfacs> Eigenvector number: 57
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.036
Rdmodfacs> Eigenvector number: 58
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.061
Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.067
Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.075
Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.091
Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.104
Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.134
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.141
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.156
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.178
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.180
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.191
Rdmodfacs> Eigenvector number: 69
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.210
Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.237
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.245
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.248
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.261
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.270
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.286
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.309
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.315
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.328
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.358
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.375
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.389
Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.395
Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.430
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.446
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.466
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.485
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.493
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.520
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.535
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.550
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.565
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.581
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.594
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.612
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.638
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.647
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.668
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.683
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.691
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.713
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.722
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.735
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.771
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.787
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.791
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.803
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1218 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001
1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999
1.00002 1.00000 1.00000 0.99999 1.00002
1.00000 1.00001 0.99999 0.99998 1.00001
1.00000 1.00001 1.00002 1.00001 1.00001
0.99998 1.00003 1.00001 1.00000 1.00001
0.99998 1.00001 0.99998 1.00002 1.00001
1.00001 1.00001 0.99999 1.00001 0.99997
1.00000 0.99999 1.00002 0.99999 0.99999
1.00002 1.00001 0.99999 1.00001 0.99998
0.99999 1.00001 0.99999 1.00001 1.00001
1.00001 1.00001 0.99999 0.99998 1.00001
1.00001 1.00002 0.99999 0.99999 1.00000
0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 0.99996
0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000
1.00000 0.99997 0.99997 0.99999 0.99997
0.99999 0.99998 1.00002 1.00000 1.00000
1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 0.99998
0.99999 0.99997 0.99999 1.00000 1.00000
1.00001 0.99999 0.99998 1.00002 1.00003
1.00000 1.00000 1.00002 0.99999 0.99999
1.00000
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 78390 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001
1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999
1.00002 1.00000 1.00000 0.99999 1.00002
1.00000 1.00001 0.99999 0.99998 1.00001
1.00000 1.00001 1.00002 1.00001 1.00001
0.99998 1.00003 1.00001 1.00000 1.00001
0.99998 1.00001 0.99998 1.00002 1.00001
1.00001 1.00001 0.99999 1.00001 0.99997
1.00000 0.99999 1.00002 0.99999 0.99999
1.00002 1.00001 0.99999 1.00001 0.99998
0.99999 1.00001 0.99999 1.00001 1.00001
1.00001 1.00001 0.99999 0.99998 1.00001
1.00001 1.00002 0.99999 0.99999 1.00000
0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 0.99996
0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000
1.00000 0.99997 0.99997 0.99999 0.99997
0.99999 0.99998 1.00002 1.00000 1.00000
1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 0.99998
0.99999 0.99997 0.99999 1.00000 1.00000
1.00001 0.99999 0.99998 1.00002 1.00003
1.00000 1.00000 1.00002 0.99999 0.99999
1.00000
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2: 0.000
Vector 3: 0.000-0.000
Vector 4:-0.000-0.000-0.000
Vector 5:-0.000 0.000-0.000 0.000
Vector 6:-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000
Vector 7: 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000
Vector 8: 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000
Vector 9: 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000
Vector 10: 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2604230034281546530.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2604230034281546530.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 2604230034281546530.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2604230034281546530.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 4355
First residue number = 1
Last residue number = 339
Number of atoms found = 4355
Mean number per residue = 1.0
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9993E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9995E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9998E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.3739E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.4470E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1067
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1178
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1523
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1819
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1850
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2213
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2295
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2546
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2678
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2916
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3067
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3280
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3369
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3830
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3902
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3962
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4102
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4412
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4668
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4947
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5002
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5083
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5352
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5596
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5941
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6102
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6247
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6513
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6761
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6969
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7050
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7219
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7351
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7436
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7666
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7984
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8091
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8468
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8640
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8753
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9018
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9200
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9340
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9564
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9749
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9814
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9916
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.022
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.036
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.061
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.067
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.075
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.091
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.104
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.134
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.141
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.156
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.178
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.180
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.191
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.210
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.237
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.245
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.248
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.261
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.270
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.286
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.309
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.315
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.328
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.358
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.375
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.389
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.395
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.430
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.446
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.466
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.485
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.493
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.520
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.535
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.550
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.565
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.581
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.594
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.612
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.638
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.647
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.668
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.683
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.691
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.713
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.722
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.735
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.771
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.787
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.791
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.803
Bfactors> 106 vectors, 13065 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.073739
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
%Bfactors-Wn> Experimental B-factors are nearly constant !
Bfactors> = 0.646 +/- 0.61
Bfactors> = 0.000 +/- 0.00
Bfactors> Shiftng-fct= -0.646
Bfactors> Scaling-fct= 0.000
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2604230034281546530.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2604230034281546530.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 29.49
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 31.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 35.47
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 37.27
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 42.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 46.31
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 46.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 51.08
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 52.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 54.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 56.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 58.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 60.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 62.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 63.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 67.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 67.83
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 68.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 69.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 72.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 74.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 76.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 76.80
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 77.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 79.44
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 81.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 83.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 84.82
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 85.82
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 87.63
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 89.29
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 90.65
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 91.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 92.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 93.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 93.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 95.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 97.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 97.67
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 99.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 100.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 101.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 103.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 104.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 104.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 106.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 107.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 107.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 108.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 109.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 110.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 111.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 112.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 112.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 113.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 114.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 115.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 116.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 116.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 117.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 118.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 118.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 119.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 120.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 121.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 121.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 121.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 122.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 123.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 124.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 124.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 125.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 126.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 127.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 128.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 128.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 129.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 130.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 131.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 132.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 132.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 133.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 134.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 135.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 135.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 136.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 137.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 137.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 139.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 139.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 140.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 140.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 141.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 142.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 142.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 143.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 144.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 145.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 145.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 145.8
Chkmod> 106 vectors, 13065 coordinates in file.
Chkmod> That is: 4355 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.7605
0.0034 0.8089
0.0034 0.9155
0.0034 0.9540
0.0034 0.7446
0.0034 0.9984
29.4866 0.2655
31.5593 0.5696
35.4698 0.4168
37.2691 0.2956
42.3766 0.0912
46.3119 0.5649
46.7049 0.6067
51.0819 0.5527
52.0197 0.6977
54.7906 0.6890
56.1930 0.7325
58.6368 0.5392
60.1359 0.6697
62.1890 0.5171
63.0271 0.4718
67.2010 0.6745
67.8298 0.3584
68.3493 0.4226
69.5464 0.6556
72.1264 0.4119
74.1894 0.5851
76.3744 0.5046
76.7977 0.5640
77.4171 0.5022
79.4392 0.5949
81.2298 0.6028
83.6963 0.5948
84.8228 0.6324
85.8247 0.5197
87.6329 0.3805
89.2857 0.4891
90.6488 0.5620
91.1740 0.4942
92.2604 0.5048
93.1000 0.4796
93.6367 0.6140
95.0738 0.5614
97.0257 0.6244
97.6737 0.5286
99.9234 0.5557
100.9331 0.5930
101.5910 0.5305
103.1174 0.5225
104.1527 0.2862
104.9422 0.4209
106.1931 0.3923
107.2153 0.4384
107.5721 0.4703
108.1297 0.4315
109.7747 0.4877
110.5240 0.2382
111.8496 0.3137
112.1654 0.4460
112.5851 0.3794
113.4198 0.3779
114.0936 0.3695
115.6334 0.2999
115.9897 0.3247
116.7496 0.4099
117.8553 0.3845
117.9553 0.4154
118.5039 0.3577
119.4454 0.3740
120.7707 0.3628
121.1606 0.5351
121.3065 0.5099
121.9366 0.2772
122.3710 0.2813
123.1394 0.4417
124.2357 0.4652
124.5201 0.1975
125.1341 0.2521
126.5396 0.3418
127.3292 0.3883
127.9758 0.3647
128.2519 0.5159
129.8508 0.4548
130.5752 0.1808
131.4751 0.4417
132.3244 0.4453
132.6803 0.5259
133.8747 0.4727
134.5336 0.4225
135.1894 0.3840
135.8419 0.4791
136.5346 0.3263
137.0947 0.4424
137.8666 0.4016
138.9740 0.3573
139.3553 0.4518
140.2409 0.4185
140.8701 0.4738
141.2045 0.3774
142.1200 0.4508
142.4929 0.5159
143.0297 0.4271
144.5060 0.4227
145.1573 0.4985
145.3197 0.4685
145.8057 0.4482
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2604230034281546530 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
2604230034281546530.eigenfacs
2604230034281546530.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2604230034281546530.eigenfacs
2604230034281546530.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2604230034281546530.eigenfacs
2604230034281546530.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2604230034281546530.eigenfacs
2604230034281546530.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2604230034281546530.eigenfacs
2604230034281546530.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2604230034281546530.eigenfacs
2604230034281546530.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2604230034281546530.eigenfacs
2604230034281546530.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2604230034281546530.eigenfacs
2604230034281546530.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2604230034281546530.eigenfacs
2604230034281546530.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2604230034281546530.eigenfacs
2604230034281546530.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2604230034281546530.eigenfacs
2604230034281546530.atom
making animated gifs
11 models are in 2604230034281546530.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604230034281546530.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604230034281546530.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 2604230034281546530 8 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
2604230034281546530.eigenfacs
2604230034281546530.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2604230034281546530.eigenfacs
2604230034281546530.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2604230034281546530.eigenfacs
2604230034281546530.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2604230034281546530.eigenfacs
2604230034281546530.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2604230034281546530.eigenfacs
2604230034281546530.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2604230034281546530.eigenfacs
2604230034281546530.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2604230034281546530.eigenfacs
2604230034281546530.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2604230034281546530.eigenfacs
2604230034281546530.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2604230034281546530.eigenfacs
2604230034281546530.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2604230034281546530.eigenfacs
2604230034281546530.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2604230034281546530.eigenfacs
2604230034281546530.atom
making animated gifs
11 models are in 2604230034281546530.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604230034281546530.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604230034281546530.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 2604230034281546530 9 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
2604230034281546530.eigenfacs
2604230034281546530.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2604230034281546530.eigenfacs
2604230034281546530.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2604230034281546530.eigenfacs
2604230034281546530.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2604230034281546530.eigenfacs
2604230034281546530.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2604230034281546530.eigenfacs
2604230034281546530.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2604230034281546530.eigenfacs
2604230034281546530.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2604230034281546530.eigenfacs
2604230034281546530.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2604230034281546530.eigenfacs
2604230034281546530.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2604230034281546530.eigenfacs
2604230034281546530.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2604230034281546530.eigenfacs
2604230034281546530.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2604230034281546530.eigenfacs
2604230034281546530.atom
making animated gifs
11 models are in 2604230034281546530.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604230034281546530.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604230034281546530.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 2604230034281546530 10 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
2604230034281546530.eigenfacs
2604230034281546530.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2604230034281546530.eigenfacs
2604230034281546530.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2604230034281546530.eigenfacs
2604230034281546530.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2604230034281546530.eigenfacs
2604230034281546530.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2604230034281546530.eigenfacs
2604230034281546530.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2604230034281546530.eigenfacs
2604230034281546530.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2604230034281546530.eigenfacs
2604230034281546530.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2604230034281546530.eigenfacs
2604230034281546530.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2604230034281546530.eigenfacs
2604230034281546530.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2604230034281546530.eigenfacs
2604230034281546530.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2604230034281546530.eigenfacs
2604230034281546530.atom
making animated gifs
11 models are in 2604230034281546530.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604230034281546530.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604230034281546530.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 2604230034281546530 11 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
2604230034281546530.eigenfacs
2604230034281546530.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2604230034281546530.eigenfacs
2604230034281546530.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2604230034281546530.eigenfacs
2604230034281546530.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2604230034281546530.eigenfacs
2604230034281546530.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2604230034281546530.eigenfacs
2604230034281546530.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2604230034281546530.eigenfacs
2604230034281546530.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2604230034281546530.eigenfacs
2604230034281546530.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2604230034281546530.eigenfacs
2604230034281546530.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2604230034281546530.eigenfacs
2604230034281546530.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2604230034281546530.eigenfacs
2604230034281546530.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2604230034281546530.eigenfacs
2604230034281546530.atom
making animated gifs
11 models are in 2604230034281546530.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604230034281546530.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604230034281546530.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
2604230034281546530.10.pdb
2604230034281546530.11.pdb
2604230034281546530.7.pdb
2604230034281546530.8.pdb
2604230034281546530.9.pdb
STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 0m27.008s
user 0m26.899s
sys 0m0.099s
rm: cannot remove '2604230034281546530.sdijf': No such file or directory
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:
elNémo
is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed
by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Between 2015 and 2025, it was hosted by US2B (Nantes).
Last modification: april 24th, 2026.
|