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* LGC-53 *

LOGs for ID: 2604231409311700449

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:

CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
 Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
 Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.    

 Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.

 Pdbmat> Coordinate filename     = 2604231409311700449.atom

 Pdbmat> Distance cutoff         =       8.00
         Force constant          =      10.00
         Origin of mass values   =       CONS
 Pdbmat> Levelshift              =    1.0E-09
         PRINTing level          =          2

 Pdbmat> Coordinate file 2604231409311700449.atom to be opened.

 Openam> File opened: 2604231409311700449.atom

 Pdbmat> Coordinate file in PDB format.

 Rdatompdb> Reading pdb file.
 Rdatompdb> End of file reached.
 Rdatompdb> Number of I/O errors:      0

 Rdatompdb> Number of residues found =    278
            First residue number     =      1
            Last  residue number     =    278
            Number of atoms found    =   2289
            Mean number per residue  =      8.2

 Pdbmat> Coordinate statistics: 
 =    30.288908 +/-    36.708776 From:   -26.748000 To:   118.782000
 =    -0.619756 +/-     7.680588 From:   -21.653000 To:    18.157000
 =   -16.098032 +/-    18.561479 From:   -53.786000 To:    31.564000
 Pdbmat> Masses are all set to one.

 Openam> File opened: pdbmat.xyzm
 Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.

 Openam> File opened: pdbmat.sdijb

 Pdbmat> Matrix statistics:

 Pdbmat> The matrix is   2.9216 % Filled.
 Pdbmat>       688961  non-zero elements.
 Pdbmat>        75038 atom-atom interactions.

 Pdbmat> Number per atom=     65.56 +/-     22.09
         Maximum number =    124
         Minimum number =      7

 Pdbmat> Matrix trace   = 1.500760E+06
 Pdbmat> Larger element =  486.812    
 Pdbmat>      0 elements larger than +/-  1.0E+10

 Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
278 non-zero elements, NRBL set to 2
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
 Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
 Diagrtb> Version 2.52, November 2004. 
 Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.

 Diagrtb> Options taken into account:

 MATRix filename          = pdbmat.sdijb
 COORdinates filename     = 2604231409311700449.atom
 Eigenvector OUTPut file  = matrix.eigenrtb
 Nb of VECTors required   =        106
 EigeNVALues chosen       =       LOWE
 Type of SUBStructuring   =       NONE
 Nb of residues per BLOck =          2
 Origin of MASS values    =       CONS
 MATRix FORMat            =       BINA
 Temporary files cleaning =       ALL 
 Output PRINting level    =          2

 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.

 Blocpdb> Entering in.

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.xyzm   

 Blocpdb> Coordinate file 2604231409311700449.atom to be opened.

 Openam> file on opening on unit     11:
 2604231409311700449.atom                                                                                                        

 Blocpdb> Coordinate file in PDB format.

 Blocpdb>  2289 atoms picked in pdb file.
 Blocpdb>   All masses set to unity.
 Blocpdb> Coordinate file is rewritten.

 Blocpdb> Substructuring:
 Blocpdb>     2 residue(s) per block.
 Blocpdb>   278 residues.
 Blocpdb>    16 atoms in block      1
 Block first atom:      1
 Blocpdb>    20 atoms in block      2
 Block first atom:     17
 Blocpdb>    12 atoms in block      3
 Block first atom:     37
 Blocpdb>    16 atoms in block      4
 Block first atom:     49
 Blocpdb>    18 atoms in block      5
 Block first atom:     65
 Blocpdb>    15 atoms in block      6
 Block first atom:     83
 Blocpdb>    18 atoms in block      7
 Block first atom:     98
 Blocpdb>    20 atoms in block      8
 Block first atom:    116
 Blocpdb>    12 atoms in block      9
 Block first atom:    136
 Blocpdb>    16 atoms in block     10
 Block first atom:    148
 Blocpdb>    19 atoms in block     11
 Block first atom:    164
 Blocpdb>    21 atoms in block     12
 Block first atom:    183
 Blocpdb>    19 atoms in block     13
 Block first atom:    204
 Blocpdb>    22 atoms in block     14
 Block first atom:    223
 Blocpdb>    12 atoms in block     15
 Block first atom:    245
 Blocpdb>    15 atoms in block     16
 Block first atom:    257
 Blocpdb>    15 atoms in block     17
 Block first atom:    272
 Blocpdb>    15 atoms in block     18
 Block first atom:    287
 Blocpdb>    15 atoms in block     19
 Block first atom:    302
 Blocpdb>    16 atoms in block     20
 Block first atom:    317
 Blocpdb>    15 atoms in block     21
 Block first atom:    333
 Blocpdb>    20 atoms in block     22
 Block first atom:    348
 Blocpdb>    15 atoms in block     23
 Block first atom:    368
 Blocpdb>    16 atoms in block     24
 Block first atom:    383
 Blocpdb>    19 atoms in block     25
 Block first atom:    399
 Blocpdb>    16 atoms in block     26
 Block first atom:    418
 Blocpdb>    12 atoms in block     27
 Block first atom:    434
 Blocpdb>    15 atoms in block     28
 Block first atom:    446
 Blocpdb>    19 atoms in block     29
 Block first atom:    461
 Blocpdb>     9 atoms in block     30
 Block first atom:    480
 Blocpdb>    22 atoms in block     31
 Block first atom:    489
 Blocpdb>    17 atoms in block     32
 Block first atom:    511
 Blocpdb>    17 atoms in block     33
 Block first atom:    528
 Blocpdb>    16 atoms in block     34
 Block first atom:    545
 Blocpdb>    18 atoms in block     35
 Block first atom:    561
 Blocpdb>    22 atoms in block     36
 Block first atom:    579
 Blocpdb>    19 atoms in block     37
 Block first atom:    601
 Blocpdb>    16 atoms in block     38
 Block first atom:    620
 Blocpdb>    24 atoms in block     39
 Block first atom:    636
 Blocpdb>    15 atoms in block     40
 Block first atom:    660
 Blocpdb>    14 atoms in block     41
 Block first atom:    675
 Blocpdb>    20 atoms in block     42
 Block first atom:    689
 Blocpdb>    14 atoms in block     43
 Block first atom:    709
 Blocpdb>    20 atoms in block     44
 Block first atom:    723
 Blocpdb>    13 atoms in block     45
 Block first atom:    743
 Blocpdb>    19 atoms in block     46
 Block first atom:    756
 Blocpdb>    20 atoms in block     47
 Block first atom:    775
 Blocpdb>    13 atoms in block     48
 Block first atom:    795
 Blocpdb>    25 atoms in block     49
 Block first atom:    808
 Blocpdb>    16 atoms in block     50
 Block first atom:    833
 Blocpdb>    16 atoms in block     51
 Block first atom:    849
 Blocpdb>    13 atoms in block     52
 Block first atom:    865
 Blocpdb>    12 atoms in block     53
 Block first atom:    878
 Blocpdb>    19 atoms in block     54
 Block first atom:    890
 Blocpdb>    15 atoms in block     55
 Block first atom:    909
 Blocpdb>    11 atoms in block     56
 Block first atom:    924
 Blocpdb>    12 atoms in block     57
 Block first atom:    935
 Blocpdb>    16 atoms in block     58
 Block first atom:    947
 Blocpdb>    13 atoms in block     59
 Block first atom:    963
 Blocpdb>    18 atoms in block     60
 Block first atom:    976
 Blocpdb>    20 atoms in block     61
 Block first atom:    994
 Blocpdb>    12 atoms in block     62
 Block first atom:   1014
 Blocpdb>    15 atoms in block     63
 Block first atom:   1026
 Blocpdb>    17 atoms in block     64
 Block first atom:   1041
 Blocpdb>    15 atoms in block     65
 Block first atom:   1058
 Blocpdb>    18 atoms in block     66
 Block first atom:   1073
 Blocpdb>    18 atoms in block     67
 Block first atom:   1091
 Blocpdb>    16 atoms in block     68
 Block first atom:   1109
 Blocpdb>    13 atoms in block     69
 Block first atom:   1125
 Blocpdb>    16 atoms in block     70
 Block first atom:   1138
 Blocpdb>    22 atoms in block     71
 Block first atom:   1154
 Blocpdb>    15 atoms in block     72
 Block first atom:   1176
 Blocpdb>    13 atoms in block     73
 Block first atom:   1191
 Blocpdb>    15 atoms in block     74
 Block first atom:   1204
 Blocpdb>    19 atoms in block     75
 Block first atom:   1219
 Blocpdb>    14 atoms in block     76
 Block first atom:   1238
 Blocpdb>    15 atoms in block     77
 Block first atom:   1252
 Blocpdb>    17 atoms in block     78
 Block first atom:   1267
 Blocpdb>    12 atoms in block     79
 Block first atom:   1284
 Blocpdb>    11 atoms in block     80
 Block first atom:   1296
 Blocpdb>    16 atoms in block     81
 Block first atom:   1307
 Blocpdb>    17 atoms in block     82
 Block first atom:   1323
 Blocpdb>    17 atoms in block     83
 Block first atom:   1340
 Blocpdb>    14 atoms in block     84
 Block first atom:   1357
 Blocpdb>    22 atoms in block     85
 Block first atom:   1371
 Blocpdb>    21 atoms in block     86
 Block first atom:   1393
 Blocpdb>    19 atoms in block     87
 Block first atom:   1414
 Blocpdb>    15 atoms in block     88
 Block first atom:   1433
 Blocpdb>    18 atoms in block     89
 Block first atom:   1448
 Blocpdb>    16 atoms in block     90
 Block first atom:   1466
 Blocpdb>    19 atoms in block     91
 Block first atom:   1482
 Blocpdb>    14 atoms in block     92
 Block first atom:   1501
 Blocpdb>    15 atoms in block     93
 Block first atom:   1515
 Blocpdb>    18 atoms in block     94
 Block first atom:   1530
 Blocpdb>    22 atoms in block     95
 Block first atom:   1548
 Blocpdb>    17 atoms in block     96
 Block first atom:   1570
 Blocpdb>    14 atoms in block     97
 Block first atom:   1587
 Blocpdb>    13 atoms in block     98
 Block first atom:   1601
 Blocpdb>    18 atoms in block     99
 Block first atom:   1614
 Blocpdb>    16 atoms in block    100
 Block first atom:   1632
 Blocpdb>    15 atoms in block    101
 Block first atom:   1648
 Blocpdb>    15 atoms in block    102
 Block first atom:   1663
 Blocpdb>    14 atoms in block    103
 Block first atom:   1678
 Blocpdb>    12 atoms in block    104
 Block first atom:   1692
 Blocpdb>    17 atoms in block    105
 Block first atom:   1704
 Blocpdb>    17 atoms in block    106
 Block first atom:   1721
 Blocpdb>    16 atoms in block    107
 Block first atom:   1738
 Blocpdb>    12 atoms in block    108
 Block first atom:   1754
 Blocpdb>    12 atoms in block    109
 Block first atom:   1766
 Blocpdb>    15 atoms in block    110
 Block first atom:   1778
 Blocpdb>    22 atoms in block    111
 Block first atom:   1793
 Blocpdb>    20 atoms in block    112
 Block first atom:   1815
 Blocpdb>    15 atoms in block    113
 Block first atom:   1835
 Blocpdb>    18 atoms in block    114
 Block first atom:   1850
 Blocpdb>    20 atoms in block    115
 Block first atom:   1868
 Blocpdb>    17 atoms in block    116
 Block first atom:   1888
 Blocpdb>    16 atoms in block    117
 Block first atom:   1905
 Blocpdb>    17 atoms in block    118
 Block first atom:   1921
 Blocpdb>    15 atoms in block    119
 Block first atom:   1938
 Blocpdb>    15 atoms in block    120
 Block first atom:   1953
 Blocpdb>    18 atoms in block    121
 Block first atom:   1968
 Blocpdb>    12 atoms in block    122
 Block first atom:   1986
 Blocpdb>    18 atoms in block    123
 Block first atom:   1998
 Blocpdb>    16 atoms in block    124
 Block first atom:   2016
 Blocpdb>    17 atoms in block    125
 Block first atom:   2032
 Blocpdb>    11 atoms in block    126
 Block first atom:   2049
 Blocpdb>    17 atoms in block    127
 Block first atom:   2060
 Blocpdb>    18 atoms in block    128
 Block first atom:   2077
 Blocpdb>    16 atoms in block    129
 Block first atom:   2095
 Blocpdb>    18 atoms in block    130
 Block first atom:   2111
 Blocpdb>    16 atoms in block    131
 Block first atom:   2129
 Blocpdb>    16 atoms in block    132
 Block first atom:   2145
 Blocpdb>    23 atoms in block    133
 Block first atom:   2161
 Blocpdb>    25 atoms in block    134
 Block first atom:   2184
 Blocpdb>    24 atoms in block    135
 Block first atom:   2209
 Blocpdb>    12 atoms in block    136
 Block first atom:   2233
 Blocpdb>    14 atoms in block    137
 Block first atom:   2245
 Blocpdb>     8 atoms in block    138
 Block first atom:   2259
 Blocpdb>    23 atoms in block    139
 Block first atom:   2266

 Blocpdb>   139 blocks.

 Blocpdb> At most,     25 atoms in each of them.
 Blocpdb> At least,     8 atoms in each of them.

 Blocpdb> Normal end of Blocpdb.

 Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
 Diagrtb> Memory allocation for RTB.
 Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
 Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.

 Prepmat> Entering in.
 Prepmat> Rewriting of the matrix begins.

 Prepmat>       689100 matrix lines read.

 Prepmat> Matrix order    =       6867

 Prepmat> Matrix trace    =    1500760.0000
 Prepmat> Last element read:    6867   6867       101.2135
 Prepmat>         9731 lines saved.
 Prepmat>         8702 empty lines.
 Prepmat> Number of lines on output is as expected.
 Prepmat> Normal end of Prepmat.

 RTB> Entering in.
 RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file:  2289
 RTB> Total mass =        2289.0000
 RTB> Number of atoms found in matrix:  2289
 RTB> Number of blocks =   139
 RTB> Projection begins.
 RTB> Projected matrix is being saved.
 RTB> Projected matrix trace =  143699.5625
 RTB>     34923 non-zero elements.
 RTB> Normal end of RTB.

 Diagstd> Entering in.

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.sdijb                      
 Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb                      
 Diagstd> CERFACS matrix format.
 Diagstd> Projected matrix order =      834
 Diagstd> Nb of non-zero elements:    34923
 Diagstd> Projected matrix trace =  143699.5625

 Openam> file on opening on unit     11:
 diagrtb_work.eigenfacs                  
 Diagstd> Diagonalization.

 Diagstd>    834 eigenvectors are computed. 
 Diagstd>    106 of them to be saved. 

 Diagstd> Sum of eigenvalues = 143699.5625
 Diagstd> Best zero-eigenvalue found  :     0.000000

 Diagstd>      6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to:    0.0000000

 Diagstd> Selected eigenvalues: 
      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000
      0.0000000      0.0133999      0.0267982      0.0596042      0.0767343
      0.1213824      0.1472916      0.2062114      0.2584635      0.4460256
      0.5044548      0.5655400      0.8416947      0.8898437      0.9389849
      1.0338787      1.1765025      1.4063898      1.5362035      1.7005804
      1.8549528      1.9424174      2.1941207      2.5302767      2.8139497
      3.0441679      3.1172720      3.2056000      3.5110661      3.6837458
      4.0476400      4.2872276      4.5805344      4.9603657      5.1031688
      5.4657741      5.6880228      5.7998612      6.1139329      6.2051436
      6.8155144      7.0727870      7.2593582      7.6123024      7.9794771
      8.4521823      8.5661624      9.0866121      9.3092535      9.5448826
      9.7432626     10.0844702     10.4206532     10.8650986     11.0155840
     11.3019188     11.7417121     12.5211186     12.7801992     13.0586817
     13.2990545     13.8228625     14.0223988     14.6140338     15.4660423
     15.7326510     15.9761155     16.8131973     17.1918807     17.3356731
     17.8249447     18.3407432     18.5719055     18.8903668     19.5407024
     20.0209237     20.4367172     20.9768636     21.4412610     22.0689633
     22.6899290     22.8933046     23.5851271     24.1226450     24.6501419
     24.8380886     25.4296067     26.3706603     26.4995061     26.8381276
     27.5541328     27.8959623     28.3013365     28.6240085     29.1556111
     29.6444508     30.0457081     30.6635868     31.3644708     31.5984511
     31.7609157

 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
      0.0034328      0.0034335      0.0034335      0.0034338      0.0034342
      0.0034343     12.5703275     17.7765737     26.5114575     30.0808410
     37.8332129     41.6758351     49.3118921     55.2070933     72.5229025
     77.1269982     81.6633025     99.6259742    102.4358895    105.2263676
    110.4155058    117.7854644    128.7799139    134.5921265    141.6099826
    147.8977979    151.3444710    160.8516560    172.7345792    182.1601791
    189.4652568    191.7267153    194.4240325    203.4767445    208.4203429
    218.4722189    224.8451632    232.4092216    241.8533605    245.3099962
    253.8756924    258.9857962    261.5195019    268.5070023    270.5024481
    283.4944752    288.7955988    292.5798360    299.6079253    306.7485350
    315.7037269    317.8252754    327.3378867    331.3238571    335.4907690
    338.9592456    344.8433255    350.5441729    357.9415523    360.4118355
    365.0659862    372.1011345    384.2526272    388.2076518    392.4144106
    396.0095539    403.7330230    406.6365735    415.1263814    427.0560488
    430.7211870    434.0411212    445.2669230    450.2533726    452.1324044
    458.4683663    465.0543862    467.9759260    471.9711758    480.0266681
    485.8893001    490.9088351    497.3539334    502.8291448    510.1363213
    517.2635172    519.5765280    527.3687489    533.3444046    539.1442675
    541.1957360    547.6020958    557.6423931    559.0030407    562.5632869
    570.0181099    573.5429611    577.6951920    580.9790961    586.3492235
    591.2443240    595.2323165    601.3215347    608.1549725    610.4191896
    611.9864234

 Diagstd> Normal end.

 Rtb_to_modes> Entering in.

 Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file =   2289
 Rtb_to_modes> Number of blocs =    139

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.eigenfacs                  

 Openam> file on opening on unit     11:
 matrix.eigenrtb                         

 Rdmodfacs> Entering in.

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     1
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9930E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     2
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9973E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     3
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9974E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     4
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9989E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     5
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0001E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     6
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0002E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     7
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.3400E-02

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     8
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  2.6798E-02

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     9
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  5.9604E-02

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    10
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  7.6734E-02

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    11
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  0.1214    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    12
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  0.1473    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    13
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  0.2062    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    14
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  0.2585    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    15
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  0.4460    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    16
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  0.5045    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    17
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  0.5655    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    18
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  0.8417    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    19
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  0.8898    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    20
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  0.9390    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    21
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   1.034    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    22
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   1.177    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    23
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   1.406    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    24
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   1.536    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    25
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   1.701    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    26
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   1.855    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    27
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   1.942    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    28
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   2.194    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    29
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   2.530    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    30
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   2.814    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    31
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   3.044    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    32
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   3.117    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    33
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   3.206    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    34
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   3.511    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    35
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   3.684    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    36
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   4.048    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    37
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   4.287    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    38
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   4.581    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    39
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   4.960    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    40
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   5.103    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    41
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   5.466    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    42
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   5.688    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    43
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   5.800    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    44
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   6.114    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    45
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   6.205    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    46
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   6.816    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    47
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   7.073    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    48
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   7.259    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    49
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   7.612    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    50
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   7.979    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    51
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   8.452    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    52
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   8.566    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    53
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   9.087    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    54
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   9.309    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    55
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   9.545    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    56
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   9.743    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    57
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   10.08    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    58
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   10.42    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    59
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   10.87    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    60
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   11.02    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    61
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   11.30    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    62
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   11.74    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    63
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   12.52    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    64
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   12.78    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    65
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   13.06    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    66
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   13.30    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    67
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   13.82    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    68
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   14.02    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    69
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   14.61    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    70
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   15.47    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    71
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   15.73    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    72
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   15.98    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    73
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   16.81    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    74
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   17.19    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    75
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   17.34    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    76
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   17.82    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    77
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   18.34    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    78
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   18.57    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    79
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   18.89    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    80
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   19.54    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    81
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   20.02    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    82
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   20.44    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    83
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   20.98    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    84
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   21.44    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    85
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   22.07    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    86
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   22.69    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    87
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   22.89    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    88
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   23.59    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    89
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   24.12    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    90
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   24.65    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    91
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   24.84    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    92
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   25.43    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    93
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   26.37    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    94
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   26.50    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    95
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   26.84    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    96
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   27.55    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    97
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   27.90    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    98
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   28.30    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    99
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   28.62    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   100
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   29.16    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   101
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   29.64    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   102
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   30.05    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   103
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   30.66    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   104
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   31.36    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   105
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   31.60    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   106
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   31.76    

 Rtb_to_modes>  106 vectors, with    834 coordinates in vector file.

 Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
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 1.00000 1.00001 0.99996 1.00003 1.00000
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 1.00002 0.99999 1.00001 0.99997 0.99999
 1.00001 1.00002 0.99999 0.99999 1.00000
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 0.99999 1.00000 0.99997 1.00002 0.99999
 1.00001

 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
 Rtb_to_modes>    41202 lines found in RTB file.

 Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
 1.00001 1.00000 1.00005 0.99999 1.00000
 1.00000 1.00001 0.99996 1.00003 1.00000
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 0.99999 1.00000 0.99999 0.99995 0.99999
 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000
 0.99999 0.99999 1.00001 0.99997 1.00000
 1.00001 0.99997 0.99997 1.00002 1.00002
 1.00002 1.00000 1.00001 1.00002 0.99996
 1.00000 1.00002 0.99996 0.99999 0.99999
 1.00001 0.99999 1.00002 1.00000 1.00001
 1.00002 0.99999 1.00001 0.99997 0.99999
 1.00001 1.00002 0.99999 0.99999 1.00000
 0.99998 1.00001 0.99998 1.00001 1.00000
 0.99999 1.00001 0.99999 0.99998 0.99997
 1.00000 1.00001 1.00000 0.99998 1.00000
 0.99999 1.00000 1.00003 1.00000 0.99999
 1.00001 0.99998 1.00000 0.99999 1.00001
 1.00000 0.99997 0.99998 0.99998 1.00001
 1.00001 0.99998 1.00003 0.99999 1.00002
 0.99999 1.00000 0.99997 1.00002 0.99999
 1.00001

 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
 Vector   2: 0.000
 Vector   3:-0.000 0.000
 Vector   4: 0.000-0.000 0.000
 Vector   5:-0.000 0.000-0.000 0.000
 Vector   6:-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000
 Vector   7:-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000
 Vector   8:-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000
 Vector   9: 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000
 Vector  10: 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000

 Rtb_to_modes>   106 eigenvectors saved.

 Rtb_to_modes> Normal end.

 Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
 Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.                
 Getnam> Eigenvector filename ?
 Getnam> 2604231409311700449.eigenfacs

 Openam> file on opening on unit     10:
 2604231409311700449.eigenfacs                                   
 Getnam> Corresponding pdb filename ?
 Getnam> 2604231409311700449.atom

 Openam> file on opening on unit     11:
 2604231409311700449.atom                                        
 Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
 Getnum>            0
 Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
 Getnum>        10000
%Getnum-Err: number larger than    106 This is not allowed. Sorry.

 Rdatompdb> Reading pdb file.
 Rdatompdb> End of file reached.
 Rdatompdb> Number of I/O errors:            0

 Rdatompdb> Number of residues found =    278
            First residue number     =      1
            Last  residue number     =    278
            Number of atoms found    =   2289
            Mean number per residue  =      8.2

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     1
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9930E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     2
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9973E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     3
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9974E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     4
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9989E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     5
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0001E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     6
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0002E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     7
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.3400E-02

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     8
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  2.6798E-02

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     9
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  5.9604E-02

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    10
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  7.6734E-02

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    11
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  0.1214    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    12
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  0.1473    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    13
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  0.2062    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    14
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  0.2585    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    15
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  0.4460    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    16
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  0.5045    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    17
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  0.5655    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    18
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  0.8417    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    19
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  0.8898    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    20
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  0.9390    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    21
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   1.034    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    22
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   1.177    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    23
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   1.406    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    24
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   1.536    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    25
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   1.701    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    26
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   1.855    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    27
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   1.942    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    28
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   2.194    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    29
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   2.530    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    30
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   2.814    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    31
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   3.044    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    32
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   3.117    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    33
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   3.206    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    34
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   3.511    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    35
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   3.684    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    36
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   4.048    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    37
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   4.287    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    38
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   4.581    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    39
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   4.960    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    40
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   5.103    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    41
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   5.466    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    42
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   5.688    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    43
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   5.800    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    44
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   6.114    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    45
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   6.205    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    46
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   6.816    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    47
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   7.073    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    48
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   7.259    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    49
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   7.612    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    50
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   7.979    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    51
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   8.452    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    52
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   8.566    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    53
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   9.087    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    54
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   9.309    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    55
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   9.545    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    56
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   9.743    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    57
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   10.08    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    58
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   10.42    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    59
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   10.87    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    60
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   11.02    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    61
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   11.30    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    62
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   11.74    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    63
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   12.52    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    64
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   12.78    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    65
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   13.06    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    66
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   13.30    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    67
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   13.82    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    68
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   14.02    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    69
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   14.61    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    70
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   15.47    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    71
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   15.73    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    72
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   15.98    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    73
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   16.81    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    74
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   17.19    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    75
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   17.34    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    76
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   17.82    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    77
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   18.34    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    78
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   18.57    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    79
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   18.89    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    80
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   19.54    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    81
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   20.02    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    82
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   20.44    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    83
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   20.98    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    84
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   21.44    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    85
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   22.07    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    86
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   22.69    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    87
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   22.89    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    88
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   23.59    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    89
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   24.12    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    90
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   24.65    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    91
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   24.84    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    92
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   25.43    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    93
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   26.37    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    94
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   26.50    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    95
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   26.84    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    96
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   27.55    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    97
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   27.90    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    98
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   28.30    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    99
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   28.62    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   100
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   29.16    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   101
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   29.64    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   102
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   30.05    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   103
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   30.66    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   104
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   31.36    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   105
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   31.60    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   106
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   31.76    

 Bfactors>  106 vectors,   6867 coordinates in file.

 Openam> file on opening on unit     12:
 bfactors.pred                                                   

 Bfactors> Best zero-eigenvalue found  :     0.000000
 Bfactors>     6 eigenvalues less than :     0.000000
 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue  :     0.013400
 Bfactors>   100 eigenvectors will be considered.
 Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.

 Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
          (CHARMM units assumed for eigenvalues)

 Bfactors> Correlation=     -0.650 for    278 C-alpha atoms.
 Bfactors> =      1.251 +/-   2.20
 Bfactors> =      0.815 +/-   0.17
 Bfactors> Shiftng-fct=     -0.436
 Bfactors> Scaling-fct=      0.078

 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.

 Bfactors> Normal end.
check_modes
 Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.                
 Getnam> Eigenvector filename ?
 Getnam> 2604231409311700449.eigenfacs

 Openam> file on opening on unit     10:
 2604231409311700449.eigenfacs                                   

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     1
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4326E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     2
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4333E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     3
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4334E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     4
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4336E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     5
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4340E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     6
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4342E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     7
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   12.57    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     8
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   17.78    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     9
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   26.51    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    10
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   30.08    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    11
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   37.83    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    12
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   41.68    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    13
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   49.31    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    14
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   55.21    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    15
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   72.52    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    16
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   77.13    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   365.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    62
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   372.1    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   388.2    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   406.6    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   415.1    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   430.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    72
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   434.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    73
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   445.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    74
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   450.2    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   452.2    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   458.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    77
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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   471.9    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   586.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   101
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   591.2    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   595.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   103
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   601.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   104
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   608.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   105
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   610.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   106
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   612.0    

 Chkmod>  106 vectors,   6867 coordinates in file.
 Chkmod>      That is:   2289 cartesian points.

 Openam> file on opening on unit     11:
 Chkmod.res                                                      
 Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector    24 is:   0.9999 (instead of 1.0000). 

 Chkmod> Normal end.
      0.0034      0.8896
      0.0034      0.7928
      0.0034      0.7085
      0.0034      0.8634
      0.0034      0.7551
      0.0034      0.8859
     12.5698      0.3945
     17.7757      0.3584
     26.5103      0.3572
     30.0795      0.3602
     37.8343      0.5702
     41.6752      0.6069
     49.3084      0.4799
     55.2086      0.3292
     72.5177      0.5588
     77.1271      0.2510
     81.6569      0.5097
     99.6220      0.2302
    102.4290      0.3110
    105.2227      0.3103
    110.4172      0.3034
    117.8053      0.5787
    128.7565      0.3603
    134.5774      0.2857
    141.6214      0.3557
    147.8933      0.5030
    151.3217      0.4377
    160.8403      0.5304
    172.7177      0.5535
    182.1540      0.2720
    189.4519      0.3746
    191.7101      0.3849
    194.4278      0.1533
    203.4661      0.3651
    208.4186      0.2189
    218.4726      0.4499
    224.8295      0.2876
    232.4111      0.2992
    241.8341      0.4329
    245.2954      0.1900
    253.8700      0.3452
    258.9742      0.2953
    261.5114      0.2830
    268.4969      0.2118
    270.4877      0.2602
    283.4924      0.2788
    288.7875      0.3145
    292.5601      0.1866
    299.5891      0.3529
    306.7262      0.2926
    315.6868      0.3059
    317.8086      0.4425
    327.3308      0.2819
    331.3051      0.3240
    335.4784      0.1733
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    350.5181      0.5459
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    610.4079      0.5074
    611.9513      0.2971
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2604231409311700449 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
2604231409311700449.eigenfacs
2604231409311700449.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2604231409311700449.eigenfacs
2604231409311700449.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2604231409311700449.eigenfacs
2604231409311700449.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2604231409311700449.eigenfacs
2604231409311700449.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
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2604231409311700449.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2604231409311700449.eigenfacs
2604231409311700449.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2604231409311700449.eigenfacs
2604231409311700449.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2604231409311700449.eigenfacs
2604231409311700449.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2604231409311700449.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=80
2604231409311700449.eigenfacs
2604231409311700449.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2604231409311700449.eigenfacs
2604231409311700449.atom
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11 models are in 2604231409311700449.7.pdb, 1 models will be skipped
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MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
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MODEL 11 will be plotted
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making thumbnail 100x100
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getting mode 8
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MODEL 5 will be plotted
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MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
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making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604231409311700449.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
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making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
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MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 11
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MODEL 3 will be plotted
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
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MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
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2604231409311700449.8.pdb
2604231409311700449.9.pdb



STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL

real	0m12.629s
user	0m12.546s
sys	0m0.075s
rm: cannot remove '2604231409311700449.sdijf': No such file or directory
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K. Suhre & Y.H. Sanejouand, ElNemo: a normal mode web-server for protein movement analysis and the generation of templates for molecular replacement. Nucleic Acids Research, 32, W610-W614, 2004.
K. Suhre & Y.H. Sanejouand, On the potential of normal mode analysis for solving difficult molecular replacement problems. Acta Cryst. D vol.60, p796-799, 2004 © International Union of Crystallography.
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