*** ***
Output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 2604241005481913808.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 2604241005481913808.atom to be opened.
Openam> File opened: 2604241005481913808.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 238
First residue number = 1
Last residue number = 238
Number of atoms found = 238
Mean number per residue = 1.0
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 31.502311 +/- 9.641772 From: 10.769000 To: 51.051000
= 58.933408 +/- 9.697325 From: 36.383000 To: 80.091000
= 27.498916 +/- 13.258228 From: 3.670000 To: 55.185000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijf
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 4.6228 % Filled.
Pdbmat> 11800 non-zero elements.
Pdbmat> 1153 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 9.69 +/- 2.69
Maximum number = 17
Minimum number = 2
Pdbmat> Matrix trace = 23060.0
Pdbmat> Larger element = 71.1436
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
using diagstd (there are 238 atoms in your structure)
Diagstd> Version 1.05, August 2004.
Diagstd> Matrix to be read from file: pdbmat.sdijf
Diagstd> Lecture de la matrice -Format CERFACS-
Diagstd> Matrix dimension (Nord) = 714
Diagstd> Number of non-zero elements 11800
Diagstd> Nb of elements found twice: 0
Diagstd> Nb of elements > 1E+10 : 0
Diagstd> Matrix trace: 23060.0000007
%Diagstd-Wn: Nb on non-zero elements there: 714
Openam> file on opening on unit 11:
pdbmat.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 714 eigenvectors are about to be computed.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 23060.0000007
Diagstd> Eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.0000000 0.0062761 0.0093810 0.0315221
0.0644847 0.1072225 0.1340022 0.1470193 0.1792618
0.1842513 0.2125541 0.2553974 0.2727017 0.3251768
0.3631494 0.3918752 0.4474928 0.4947611 0.5274173
0.6053619 0.6726642 0.7261249 0.7654402 0.7903969
0.8349413 0.8411933 0.8567709 0.9216402 0.9526674
1.0116688 1.1095956 1.1465504 1.2053750 1.2570001
1.4222058 1.4666497 1.5511287 1.5902111 1.6520327
1.7132615 1.7384590 1.8507633 1.9197517 1.9908439
2.0305592 2.1115725 2.1701852 2.2155108 2.2493608
2.3441253 2.3753853 2.4214122 2.5956036 2.6306210
2.6597471 2.6866551 2.7791992 2.8982761 3.0385351
3.0984280 3.1290876 3.1594994 3.2727656 3.3098302
3.4989401 3.5039671 3.5497847 3.6059653 3.7337832
3.8438016 3.8900272 3.9723446 4.0391767 4.1015029
4.1584888 4.2283273 4.3202171 4.3467852 4.4308555
4.4953812 4.5920744 4.6350753 4.7728587 4.7998170
4.9042693 5.0004035 5.0669850 5.0992717 5.1483516
5.1980991 5.3681025 5.3850183 5.5047772 5.5315637
5.6002270 5.6662543 5.6980076 5.7577813 5.8639003
6.0476610 6.1058863 6.2342315 6.2400073 6.3429069
6.4278544 6.5337695 6.5575446 6.6465814 6.7200781
6.8376605 6.8491461 6.9689660 7.0395047 7.1127282
7.1380493 7.2446697 7.4145771 7.4800716 7.5670613
7.6677992 7.6912706 7.7282697 7.9923513 8.1354388
8.2147947 8.2701450 8.3294005 8.3957732 8.6045525
8.6278153 8.7001624 8.7585064 8.7918923 8.9539929
9.0484603 9.0823882 9.1264781 9.1827068 9.3070400
9.4574626 9.5114447 9.5555866 9.6104215 9.6602910
9.9626918 9.9880834 10.0893669 10.2444299 10.3172645
10.3419367 10.4757886 10.5813541 10.6704458 10.6965761
10.7497901 10.8462307 10.9821790 10.9883899 11.1040503
11.2051034 11.2765884 11.3640937 11.4163185 11.4802567
11.6561277 11.7262447 11.7552197 11.9085308 11.9926018
12.0310656 12.0733461 12.2585381 12.4549843 12.5732905
12.6707777 12.7600417 12.8406336 13.0463385 13.0859517
13.1946658 13.2372854 13.3385681 13.4939792 13.5795911
13.6760537 13.7808769 13.8356674 13.9099787 14.0856483
14.1157667 14.2345603 14.3596710 14.4407052 14.5368980
14.6352855 14.6969929 14.7362664 14.8846197 15.0181359
15.0620089 15.1180753 15.2321983 15.3499602 15.4099750
15.4796054 15.5193852 15.6139875 15.6813638 15.7333330
15.7910880 15.8678605 16.0541191 16.1571919 16.2076193
16.2742623 16.4249545 16.5064685 16.6152140 16.7272173
16.8194334 16.8507249 16.9053079 17.1327906 17.1573407
17.2846539 17.3793653 17.4372551 17.5461269 17.7721356
17.8376697 17.9114635 17.9173627 18.2265699 18.3009328
18.3880333 18.5055015 18.6354322 18.6494385 18.7398875
18.8259229 18.9841922 19.1085279 19.2010780 19.2800381
19.3616572 19.4857281 19.5173040 19.5774270 19.7051806
19.7368104 19.8238777 19.8464553 19.9787251 20.1335969
20.2656239 20.2884440 20.4306459 20.6152349 20.6324333
20.7869276 20.8889944 20.9798707 21.0556760 21.1115234
21.1586759 21.3316753 21.4211174 21.4730633 21.6111929
21.6785766 21.7379611 21.7902053 21.8465001 21.9153672
22.0161092 22.0936099 22.1408463 22.2629965 22.3268308
22.3832556 22.4626593 22.5431348 22.6857912 22.7279676
22.8501275 22.9158765 22.9392395 23.0260429 23.0952915
23.2686609 23.2884841 23.3275693 23.4462604 23.4860480
23.5217835 23.5442343 23.5875810 23.7328382 23.7990223
23.8334695 23.9102117 24.0567905 24.0652793 24.1039308
24.1777208 24.2226606 24.2286591 24.2852430 24.3280650
24.3496406 24.5372309 24.5903300 24.6386089 24.7374520
24.7871569 24.8586506 24.8830036 25.0145544 25.0528005
25.2026691 25.2178996 25.2431808 25.4003411 25.5133723
25.5522579 25.6206353 25.6772881 25.7523672 25.9424752
25.9949603 26.0458507 26.0909749 26.2977853 26.3330522
26.3524061 26.4043769 26.5130198 26.5755159 26.6533794
26.7301190 26.9289310 27.0602934 27.1402891 27.2467637
27.2501014 27.4601551 27.5119135 27.6107675 27.6449664
27.7031434 27.7880009 27.8865123 27.9587192 28.0175042
28.0599748 28.1788569 28.2303932 28.2944213 28.3495190
28.5139479 28.6089485 28.6255472 28.7302234 28.8920616
29.0516614 29.0977066 29.1764847 29.2928302 29.3059736
29.4125358 29.4750151 29.5736992 29.6535793 29.7599880
29.8314506 29.9153350 30.1014380 30.2130617 30.3418326
30.3885239 30.5188619 30.6184953 30.6518737 30.7587789
30.8665793 30.8943392 30.9563140 31.0608297 31.1264015
31.2441255 31.2648190 31.2937054 31.5110850 31.6170613
31.6840143 31.8431747 31.9257802 31.9692928 32.0289742
32.0996510 32.1498416 32.3164557 32.3681287 32.4546778
32.5663410 32.6490463 32.7547531 32.8870192 32.9508101
33.0444222 33.0926473 33.2772267 33.3286502 33.4723214
33.5440219 33.6256674 33.6922082 33.8181169 33.8409606
33.9618841 34.0396579 34.2075526 34.3947391 34.4394094
34.4935841 34.5810842 34.7194954 34.8300512 34.9622513
35.0254243 35.3298892 35.4421594 35.4881062 35.5435003
35.7219725 35.8702037 36.0629337 36.1460081 36.2311452
36.2839284 36.3826316 36.4487680 36.5903852 36.6548749
36.8542638 36.9339547 37.0055618 37.1447108 37.2008540
37.4022677 37.5058551 37.7232921 37.8870672 38.0141119
38.0528087 38.1914108 38.4037118 38.6854092 38.7682847
38.8252625 38.8582953 38.9142206 38.9827354 39.1564866
39.2923347 39.4747934 39.5526347 39.7372208 39.8107171
39.8438102 39.9576039 40.1164863 40.3328317 40.4344305
40.5477325 40.6086702 40.9550073 40.9798267 41.1315278
41.2783293 41.3825523 41.4297278 41.7017113 41.8672446
42.0117493 42.1355996 42.3472523 42.4180946 42.5607058
42.9125472 42.9715979 43.0457023 43.1317528 43.2764077
43.3105883 43.3964882 43.5790513 43.7488499 43.8568127
43.9866448 44.0493167 44.1872800 44.5024682 44.6296925
44.6320366 44.9515829 45.0056209 45.1281232 45.2854677
45.3516639 45.4449138 45.6511811 45.8530795 45.9374626
46.0926159 46.1247390 46.3363413 46.4798713 46.5863620
46.8551899 46.9486643 47.1199953 47.2423680 47.3180906
47.4223439 47.7860427 47.8464697 48.0201467 48.0541554
48.2007529 48.3791188 48.4749900 48.8281966 48.8939225
49.0957935 49.4000189 49.4197490 49.5087596 49.6997514
49.8697429 49.9221898 49.9737533 50.1583170 50.3375493
50.4778638 50.6844628 50.8156762 51.0039758 51.0715217
51.1706494 51.4055408 51.5010336 51.7060192 51.8031046
51.8973638 51.9759374 52.3890635 52.6109426 52.6907376
52.8176307 52.8936261 53.0762086 53.1306022 53.2111811
53.4241890 53.4961476 53.6331097 53.7561536 54.0336972
54.1407838 54.2318437 54.6981114 54.9643952 55.0579452
55.2275383 55.4754023 55.5473957 55.6480184 55.8222839
55.8752255 55.9428799 56.2027686 56.3020092 56.5415455
56.7535441 56.9424251 57.1727340 57.3353983 57.4881091
57.5566307 57.8588143 57.8981972 58.0378413 58.1917059
58.3074979 58.4924827 58.9506828 59.1026549 59.3070465
59.4700565 59.9337974 60.1893512 60.2813357 60.5140507
60.7409627 60.8420162 60.9591503 61.1626205 61.3191803
61.4303009 61.7320200 62.1134677 62.2746278 62.4012656
62.7404841 62.8821417 62.9331150 63.1460116 63.4044842
63.6586959 63.8431502 64.0206606 64.3144827 64.6949787
64.7362482 64.7942590 65.2357107 65.4830586 65.8140855
65.9917603 66.3195459 66.5151271 66.7504559 66.9107883
67.4605179 67.6905963 67.8579211 68.1692018 68.3271166
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806.9992349 808.8081346 809.3327809 810.0654921 811.3328881
811.7175292 812.2087991 814.0932152 814.8116447 816.5431085
818.0724622 819.4326418 821.0881050 822.2553297 823.3496256
823.8401653 825.9999954 826.2810654 827.2769150 828.3727894
829.1965436 830.5108449 833.7573971 834.8313995 836.2736806
837.4221733 840.6808953 842.4712927 843.1148016 844.7406485
846.3229455 847.0266581 847.8416214 849.2554110 850.3416481
851.1117803 853.1993665 855.8313050 856.9408590 857.8117272
860.1401355 861.1106146 861.4595592 862.9154457 864.6797077
866.4113819 867.6657098 868.8711071 870.8626623 873.4349525
873.7134943 874.1048783 877.0775186 878.7387106 880.9569898
882.1453249 884.3334496 885.6364714 887.2017677 888.2666432
891.9081161 893.4277762 894.5313290 896.5806976 897.6185671
900.2194645 900.9873308 901.8477278 902.5348142 905.2569654
907.0401707 908.7568775 911.1099660 914.1124031 915.0641215
917.4727827 921.3241625 922.8606994 923.6863544 926.5864728
928.7435665 929.3647383 930.2775743 935.7545726 939.1482673
943.2652176 943.5806983 946.6028124 949.0541293 949.3558571
951.9578949 954.2930957 957.8279236 959.1852220 960.3998974
960.5793474 962.6837648 966.5228419 968.8293715 972.2344286
974.9811231 978.7805194 979.2811683 980.5378172 982.0692768
987.2671730 988.5494073 991.0069412 991.5683497 994.2957049
998.0459192 1000.6118331 1005.0842251 1005.9562344 1007.9906236
1014.4739456 1016.0388344 1018.4151412 1019.0328308 1025.8851060
1028.6980585 1032.6025605 1036.8289177 1037.4740238 1042.7522372
1044.9431194 1045.7560509 1055.1749396 1057.0345861 1065.6684674
1070.1152081 1079.7154255 1086.4252437 1092.6238931
Diagstd> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2604241005481913808.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2604241005481913808.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 2604241005481913808.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2604241005481913808.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 238
First residue number = 1
Last residue number = 238
Number of atoms found = 238
Mean number per residue = 1.0
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9544E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9868E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0007E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0016E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0022E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0056E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0075E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.2761E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.3810E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.1522E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.4485E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1072
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1340
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1470
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1793
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1843
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2126
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2554
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2727
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3252
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3631
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3919
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4475
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4948
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5274
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6054
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6727
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7261
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7654
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7904
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8349
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8412
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8568
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9216
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9527
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.012
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.110
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.147
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.205
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.257
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.422
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.467
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.551
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.590
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.652
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.713
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.738
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.851
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.920
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.991
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.031
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.112
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.170
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.216
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.249
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.344
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.375
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.421
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.596
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.631
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.660
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.687
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.779
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.898
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.039
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.098
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.129
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.159
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.273
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.310
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.499
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.504
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.550
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.606
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.734
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.844
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.890
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.972
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.039
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.102
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.158
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.228
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.320
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.347
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.431
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.495
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.592
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.635
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.773
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.800
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.904
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.000
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.067
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.099
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.148
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.198
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.368
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.385
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.505
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.532
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.600
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.666
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.698
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.758
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.864
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.048
%Rdmodfacs-Wn> More than 106 vectors in file.
Bfactors> 106 vectors, 714 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 7 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.006276
Bfactors> 99 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= 0.636 for 238 C-alpha atoms.
Bfactors> = 26.964 +/- 22.58
Bfactors> = 30.859 +/- 7.22
Bfactors> Shiftng-fct= 3.895
Bfactors> Scaling-fct= 0.320
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2604241005481913808.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2604241005481913808.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4260E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4315E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4350E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4366E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4376E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4434E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4467E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 8.602
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 10.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 19.28
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 27.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 35.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 39.75
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 41.63
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 45.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 46.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 50.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 54.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 56.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 61.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 65.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 67.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 72.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 76.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 78.86
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 84.49
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 89.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 92.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 95.00
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 96.54
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 99.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 99.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 100.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 104.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 252.0
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 260.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 263.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 267.0
%Rdmodfacs-Err> More than 106 vectors in file.
Chkmod> 106 vectors, 714 coordinates in file.
Chkmod> That is: 238 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.8030
0.0034 0.6963
0.0034 0.0120
0.0034 0.6614
0.0034 0.8216
0.0034 0.7949
0.0034 0.8165
8.6024 0.7426
10.5172 0.6276
19.2790 0.6717
27.5744 0.0153
35.5528 0.6653
39.7493 0.1545
41.6328 0.1533
45.9798 0.3897
46.6165 0.2388
50.0678 0.1108
54.8766 0.1623
56.7047 0.3097
61.9230 0.4731
65.4319 0.3240
67.9774 0.2441
72.6396 0.3352
76.3821 0.5750
78.8582 0.3228
84.4885 0.5459
89.0610 0.4398
92.5284 0.4931
94.9994 0.4581
96.5384 0.4884
99.2188 0.0996
99.5924 0.4504
100.5116 0.3912
104.2432 0.5045
105.9875 0.4542
109.2363 0.3710
114.4032 0.5821
116.2943 0.5439
119.1983 0.4137
121.7431 0.5833
129.4871 0.3561
131.5200 0.4710
135.2330 0.3990
136.9226 0.3506
139.5667 0.5283
142.1200 0.4543
143.1534 0.4861
147.7338 0.6717
150.4621 0.6777
153.2189 0.5809
154.7503 0.5544
157.8060 0.4776
159.9582 0.5652
161.6447 0.3757
162.8439 0.4963
166.2476 0.3709
167.3433 0.5515
168.9562 0.4141
174.9561 0.3763
176.1315 0.5419
177.0995 0.4398
177.9961 0.3974
181.0176 0.6103
184.8527 0.5977
189.2962 0.2820
191.1249 0.6094
192.0788 0.3099
192.9974 0.2757
196.4489 0.3420
197.5562 0.3163
203.1181 0.3509
203.2632 0.3346
204.5930 0.5990
206.2004 0.2799
209.8282 0.4974
212.8964 0.4869
214.1664 0.4911
216.4120 0.5287
218.2296 0.5151
219.9249 0.4846
221.4210 0.3238
223.2771 0.5613
225.6932 0.4334
226.3974 0.5435
228.5744 0.5612
230.2192 0.5489
232.6899 0.5247
233.7769 0.4212
237.2315 0.4868
237.9015 0.4600
240.4650 0.5448
242.8072 0.4788
244.4286 0.5312
245.1993 0.3043
246.3746 0.4856
247.5682 0.4485
251.5839 0.5418
251.9820 0.3245
254.7741 0.3891
255.3981 0.5331
256.9630 0.3351
258.4728 0.4637
259.2017 0.4804
260.5628 0.4904
262.9503 0.3600
267.0438 0.2976
Project conformational change on normal modes:
Projmod> Version 1.36, April 2003.
Projmod> Projection of a difference vector on a set of eigenvectors.
Getnam> CERFACS file with the eigenvectors ?
Getnam> 2604241005481913808.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2604241005481913808.eigenfacs
Getnam> Pdb file with the reference structure ?
Getnam> 2604241005481913808.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2604241005481913808.atom
Getnam> Pdb file with the other conformer ?
Getnam> 2604241005481913808.atom2
Openam> file on opening on unit 12:
2604241005481913808.atom2
Getrep> Are the masses given in the pdb file ? (y/n)
Getrep> F
Projmod> All masses will all be assumed to be of 1.
Getrep> Displacement along one mode ? (y/n)
Getrep> F
Openam> file on opening on unit 13:
projmod.res
Openam> file on opening on unit 14:
dr.res
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4260E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4315E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4350E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4366E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4376E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4434E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4467E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 8.602
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 10.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 19.28
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 27.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 35.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 39.75
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 41.63
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 45.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 46.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 50.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 54.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 56.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 61.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 65.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 67.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 72.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 76.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 78.86
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 84.49
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 89.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 92.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 95.00
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 96.54
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 99.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 99.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 100.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 104.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 106.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 109.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 114.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 116.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 119.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 121.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 129.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 131.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 135.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 136.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 139.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 142.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 143.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 147.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 150.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 153.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 154.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 157.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 160.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 161.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 162.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 166.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 167.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 169.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 175.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 176.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 177.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 178.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 181.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 184.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 189.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 191.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 192.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 193.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 196.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 197.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 203.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 212.9
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 214.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 216.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 218.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 219.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 240.5
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 254.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 255.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 257.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 258.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 259.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 260.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 263.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 267.0
%Rdmodfacs-Err> More than 106 vectors in file.
Projmod> 106 vectors, 714 coordinates in file.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 238
First residue number = 1
Last residue number = 238
Number of atoms found = 238
Mean number per residue = 1.0
Projmod> Cartesian (eigen)vectors will be studied.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 238
First residue number = 1
Last residue number = 238
Number of atoms found = 238
Mean number per residue = 1.0
Projmod> File dr.res: displacement=f(atom number).
Projmod> 238 atoms are considered.
Projmod> Atomic r.m.s. displacements= 4.70
Projmod> Atomic average masses = 1.00 +/- 0.00
Projmod> File projmod.res: dr.vector=f(fqcy), and cumulative square sum.
Vector: 1 F= 0.00 Cos= -0.002 Sum= 0.000 q= -0.1606
Vector: 2 F= 0.00 Cos= -0.002 Sum= 0.000 q= -0.1183
Vector: 3 F= 0.00 Cos= 0.036 Sum= 0.001 q= 2.5747
Vector: 4 F= 0.00 Cos= 0.015 Sum= 0.001 q= 1.0691
Vector: 5 F= 0.00 Cos= -0.002 Sum= 0.001 q= -0.1517
Vector: 6 F= 0.00 Cos= 0.004 Sum= 0.002 q= 0.2816
Vector: 7 F= 0.00 Cos= -0.003 Sum= 0.002 q= -0.2476
Vector: 8 F= 8.60 Cos= 0.837 Sum= 0.702 q= 60.6816
Vector: 9 F= 10.52 Cos= -0.416 Sum= 0.875 q= -30.1629
Vector: 10 F= 19.28 Cos= 0.192 Sum= 0.912 q= 13.9045
Vector: 11 F= 27.57 Cos= 0.025 Sum= 0.913 q= 1.8409
Vector: 12 F= 35.55 Cos= 0.048 Sum= 0.915 q= 3.4741
Vector: 13 F= 39.75 Cos= 0.007 Sum= 0.915 q= 0.4742
Vector: 14 F= 41.63 Cos= -0.042 Sum= 0.917 q= -3.0639
Vector: 15 F= 45.98 Cos= -0.061 Sum= 0.921 q= -4.4397
Vector: 16 F= 46.62 Cos= 0.068 Sum= 0.925 q= 4.9129
Vector: 17 F= 50.07 Cos= -0.039 Sum= 0.927 q= -2.8452
Vector: 18 F= 54.88 Cos= -0.064 Sum= 0.931 q= -4.6272
Vector: 19 F= 56.70 Cos= -0.095 Sum= 0.940 q= -6.9185
Vector: 20 F= 61.92 Cos= -0.082 Sum= 0.947 q= -5.9206
Vector: 21 F= 65.43 Cos= 0.015 Sum= 0.947 q= 1.0896
Vector: 22 F= 67.98 Cos= -0.015 Sum= 0.947 q= -1.0582
Vector: 23 F= 72.64 Cos= -0.026 Sum= 0.948 q= -1.9136
Vector: 24 F= 76.38 Cos= 0.016 Sum= 0.948 q= 1.1802
Vector: 25 F= 78.86 Cos= -0.011 Sum= 0.948 q= -0.8184
Vector: 26 F= 84.49 Cos= 0.048 Sum= 0.951 q= 3.4782
Vector: 27 F= 89.06 Cos= -0.046 Sum= 0.953 q= -3.3012
Vector: 28 F= 92.53 Cos= -0.035 Sum= 0.954 q= -2.5403
Vector: 29 F= 95.00 Cos= -0.018 Sum= 0.954 q= -1.3159
Vector: 30 F= 96.54 Cos= 0.010 Sum= 0.954 q= 0.7342
Vector: 31 F= 99.22 Cos= -0.007 Sum= 0.954 q= -0.4841
Vector: 32 F= 99.59 Cos= -0.020 Sum= 0.955 q= -1.4252
Vector: 33 F= 100.51 Cos= -0.025 Sum= 0.955 q= -1.8332
Vector: 34 F= 104.24 Cos= -0.020 Sum= 0.956 q= -1.4273
Vector: 35 F= 105.99 Cos= -0.008 Sum= 0.956 q= -0.5767
Vector: 36 F= 109.24 Cos= 0.011 Sum= 0.956 q= 0.8241
Vector: 37 F= 114.40 Cos= -0.000 Sum= 0.956 q= -0.0073
Vector: 38 F= 116.29 Cos= 0.038 Sum= 0.957 q= 2.7324
Vector: 39 F= 119.20 Cos= 0.017 Sum= 0.958 q= 1.2240
Vector: 40 F= 121.74 Cos= -0.002 Sum= 0.958 q= -0.1160
Vector: 41 F= 129.49 Cos= -0.014 Sum= 0.958 q= -1.0353
Vector: 42 F= 131.52 Cos= 0.014 Sum= 0.958 q= 0.9848
Vector: 43 F= 135.23 Cos= 0.039 Sum= 0.960 q= 2.8162
Vector: 44 F= 136.92 Cos= 0.007 Sum= 0.960 q= 0.5076
Vector: 45 F= 139.57 Cos= 0.040 Sum= 0.961 q= 2.9155
Vector: 46 F= 142.12 Cos= 0.036 Sum= 0.962 q= 2.6199
Vector: 47 F= 143.15 Cos= -0.014 Sum= 0.963 q= -1.0118
Vector: 48 F= 147.73 Cos= -0.014 Sum= 0.963 q= -1.0306
Vector: 49 F= 150.46 Cos= 0.003 Sum= 0.963 q= 0.2316
Vector: 50 F= 153.22 Cos= -0.004 Sum= 0.963 q= -0.3081
Vector: 51 F= 154.75 Cos= 0.016 Sum= 0.963 q= 1.1250
Vector: 52 F= 157.81 Cos= -0.009 Sum= 0.963 q= -0.6745
Vector: 53 F= 159.96 Cos= -0.030 Sum= 0.964 q= -2.1467
Vector: 54 F= 161.64 Cos= -0.011 Sum= 0.964 q= -0.7823
Vector: 55 F= 162.84 Cos= -0.010 Sum= 0.964 q= -0.7075
Vector: 56 F= 166.25 Cos= -0.015 Sum= 0.965 q= -1.0764
Vector: 57 F= 167.34 Cos= -0.022 Sum= 0.965 q= -1.6065
Vector: 58 F= 168.96 Cos= -0.006 Sum= 0.965 q= -0.4295
Vector: 59 F= 174.96 Cos= -0.009 Sum= 0.965 q= -0.6196
Vector: 60 F= 176.13 Cos= 0.020 Sum= 0.966 q= 1.4589
Vector: 61 F= 177.10 Cos= -0.005 Sum= 0.966 q= -0.3903
Vector: 62 F= 178.00 Cos= -0.000 Sum= 0.966 q= -0.0205
Vector: 63 F= 181.02 Cos= 0.001 Sum= 0.966 q= 0.1038
Vector: 64 F= 184.85 Cos= 0.040 Sum= 0.967 q= 2.9313
Vector: 65 F= 189.30 Cos= -0.008 Sum= 0.967 q= -0.5454
Vector: 66 F= 191.12 Cos= 0.037 Sum= 0.969 q= 2.6910
Vector: 67 F= 192.08 Cos= -0.011 Sum= 0.969 q= -0.8186
Vector: 68 F= 193.00 Cos= -0.002 Sum= 0.969 q= -0.1290
Vector: 69 F= 196.45 Cos= -0.034 Sum= 0.970 q= -2.5005
Vector: 70 F= 197.56 Cos= 0.021 Sum= 0.970 q= 1.5442
Vector: 71 F= 203.12 Cos= -0.003 Sum= 0.970 q= -0.1900
Vector: 72 F= 203.26 Cos= -0.003 Sum= 0.970 q= -0.2093
Vector: 73 F= 204.59 Cos= -0.008 Sum= 0.971 q= -0.6043
Vector: 74 F= 206.20 Cos= -0.017 Sum= 0.971 q= -1.2246
Vector: 75 F= 209.83 Cos= 0.000 Sum= 0.971 q= 0.0069
Vector: 76 F= 212.90 Cos= -0.009 Sum= 0.971 q= -0.6503
Vector: 77 F= 214.17 Cos= -0.015 Sum= 0.971 q= -1.0816
Vector: 78 F= 216.41 Cos= -0.004 Sum= 0.971 q= -0.2969
Vector: 79 F= 218.23 Cos= 0.001 Sum= 0.971 q= 0.1077
Vector: 80 F= 219.92 Cos= -0.009 Sum= 0.971 q= -0.6304
Vector: 81 F= 221.42 Cos= -0.004 Sum= 0.971 q= -0.3109
Vector: 82 F= 223.28 Cos= -0.023 Sum= 0.972 q= -1.6310
Vector: 83 F= 225.69 Cos= 0.006 Sum= 0.972 q= 0.4299
Vector: 84 F= 226.40 Cos= 0.037 Sum= 0.973 q= 2.6671
Vector: 85 F= 228.57 Cos= 0.014 Sum= 0.973 q= 1.0509
Vector: 86 F= 230.22 Cos= -0.020 Sum= 0.974 q= -1.4835
Vector: 87 F= 232.69 Cos= -0.021 Sum= 0.974 q= -1.4996
Vector: 88 F= 233.78 Cos= 0.009 Sum= 0.974 q= 0.6781
Vector: 89 F= 237.23 Cos= 0.000 Sum= 0.974 q= 0.0014
Vector: 90 F= 237.90 Cos= -0.014 Sum= 0.974 q= -1.0076
Vector: 91 F= 240.46 Cos= -0.009 Sum= 0.975 q= -0.6215
Vector: 92 F= 242.81 Cos= -0.020 Sum= 0.975 q= -1.4225
Vector: 93 F= 244.43 Cos= 0.027 Sum= 0.976 q= 1.9272
Vector: 94 F= 245.20 Cos= 0.024 Sum= 0.976 q= 1.7354
Vector: 95 F= 246.37 Cos= -0.012 Sum= 0.976 q= -0.9036
Vector: 96 F= 247.57 Cos= 0.012 Sum= 0.976 q= 0.8608
Vector: 97 F= 251.58 Cos= -0.027 Sum= 0.977 q= -1.9494
Vector: 98 F= 251.98 Cos= 0.011 Sum= 0.977 q= 0.7966
Vector: 99 F= 254.77 Cos= 0.005 Sum= 0.977 q= 0.3682
Vector: 100 F= 255.40 Cos= 0.011 Sum= 0.977 q= 0.8091
Vector: 101 F= 256.96 Cos= -0.011 Sum= 0.978 q= -0.7950
Vector: 102 F= 258.47 Cos= -0.008 Sum= 0.978 q= -0.5948
Vector: 103 F= 259.20 Cos= -0.010 Sum= 0.978 q= -0.7047
Vector: 104 F= 260.56 Cos= -0.001 Sum= 0.978 q= -0.0528
Vector: 105 F= 262.95 Cos= 0.000 Sum= 0.978 q= 0.0106
Vector: 106 F= 267.04 Cos= -0.005 Sum= 0.978 q= -0.3339
Projmod> Best zero-frequency found : 0.003426
Projmod> 7 frequencies less than: 0.003447
Projmod> Lowest non-zero frequency : 8.602438
Projmod> Best overlap with diff.vect. = 0.84 for mode 8 with F= 8.60 cm-1.
Projmod> 1-3-6-9-12-all-best contrb. = 0.701 0.911 0.931 0.941 0.947 0.978
Projmod> Normal end.
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2604241005481913808 7 -20 20 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-20
2604241005481913808.eigenfacs
2604241005481913808.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2604241005481913808.eigenfacs
2604241005481913808.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2604241005481913808.eigenfacs
2604241005481913808.atom
making animated gifs
3 models are in 2604241005481913808.7.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
3 models are in 2604241005481913808.7.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
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making animated gif 300x300
3 models are in 2604241005481913808.7.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=7 DQ=-20 238 4.698 148 0.971
MODEL 2 MODE=7 DQ=0 238 4.699 148 0.969
MODEL 3 MODE=7 DQ=20 238 4.707 147 0.964
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 2604241005481913808 8 -20 20 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-20
2604241005481913808.eigenfacs
2604241005481913808.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2604241005481913808.eigenfacs
2604241005481913808.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2604241005481913808.eigenfacs
2604241005481913808.atom
making animated gifs
3 models are in 2604241005481913808.8.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
3 models are in 2604241005481913808.8.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
3 models are in 2604241005481913808.8.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=8 DQ=-20 238 5.827 45 2.219
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MODEL 3 MODE=8 DQ=20 238 3.682 157 1.191
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 2604241005481913808 9 -20 20 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-20
2604241005481913808.eigenfacs
2604241005481913808.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2604241005481913808.eigenfacs
2604241005481913808.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2604241005481913808.eigenfacs
2604241005481913808.atom
making animated gifs
3 models are in 2604241005481913808.9.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
3 models are in 2604241005481913808.9.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
3 models are in 2604241005481913808.9.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=9 DQ=-20 238 4.321 148 0.998
MODEL 2 MODE=9 DQ=0 238 4.699 148 0.969
MODEL 3 MODE=9 DQ=20 238 5.368 144 0.611
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 2604241005481913808 10 -20 20 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-20
2604241005481913808.eigenfacs
2604241005481913808.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2604241005481913808.eigenfacs
2604241005481913808.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2604241005481913808.eigenfacs
2604241005481913808.atom
making animated gifs
3 models are in 2604241005481913808.10.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
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making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
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MODEL 1 will be plotted
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making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
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MODEL 1 will be plotted
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MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=10 DQ=-20 238 5.105 152 1.022
MODEL 2 MODE=10 DQ=0 238 4.699 148 0.969
MODEL 3 MODE=10 DQ=20 238 4.625 142 0.747
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 2604241005481913808 11 -20 20 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-20
2604241005481913808.eigenfacs
2604241005481913808.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2604241005481913808.eigenfacs
2604241005481913808.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2604241005481913808.eigenfacs
2604241005481913808.atom
making animated gifs
3 models are in 2604241005481913808.11.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
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making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
3 models are in 2604241005481913808.11.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
3 models are in 2604241005481913808.11.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=11 DQ=-20 238 4.906 147 0.854
MODEL 2 MODE=11 DQ=0 238 4.699 148 0.969
MODEL 3 MODE=11 DQ=20 238 4.842 77 2.063
getting mode 12
running: ../../bin/get_modes.sh 2604241005481913808 12 -20 20 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 12
calculating perturbed structure for DQ=-20
2604241005481913808.eigenfacs
2604241005481913808.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2604241005481913808.eigenfacs
2604241005481913808.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2604241005481913808.eigenfacs
2604241005481913808.atom
making animated gifs
3 models are in 2604241005481913808.12.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
3 models are in 2604241005481913808.12.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
3 models are in 2604241005481913808.12.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=12 DQ=-20 238 4.933 147 0.887
MODEL 2 MODE=12 DQ=0 238 4.699 148 0.969
MODEL 3 MODE=12 DQ=20 238 4.814 137 0.893
getting mode 13
running: ../../bin/get_modes.sh 2604241005481913808 13 -20 20 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 13
calculating perturbed structure for DQ=-20
2604241005481913808.eigenfacs
2604241005481913808.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2604241005481913808.eigenfacs
2604241005481913808.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2604241005481913808.eigenfacs
2604241005481913808.atom
making animated gifs
3 models are in 2604241005481913808.13.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
3 models are in 2604241005481913808.13.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
3 models are in 2604241005481913808.13.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=13 DQ=-20 238 4.882 151 1.145
MODEL 2 MODE=13 DQ=0 238 4.699 148 0.969
MODEL 3 MODE=13 DQ=20 238 4.866 145 0.728
getting mode 14
running: ../../bin/get_modes.sh 2604241005481913808 14 -20 20 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 14
calculating perturbed structure for DQ=-20
2604241005481913808.eigenfacs
2604241005481913808.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2604241005481913808.eigenfacs
2604241005481913808.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2604241005481913808.eigenfacs
2604241005481913808.atom
making animated gifs
3 models are in 2604241005481913808.14.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
3 models are in 2604241005481913808.14.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
3 models are in 2604241005481913808.14.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=14 DQ=-20 238 4.821 77 2.152
MODEL 2 MODE=14 DQ=0 238 4.699 148 0.969
MODEL 3 MODE=14 DQ=20 238 4.927 131 1.075
getting mode 15
running: ../../bin/get_modes.sh 2604241005481913808 15 -20 20 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 15
calculating perturbed structure for DQ=-20
2604241005481913808.eigenfacs
2604241005481913808.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2604241005481913808.eigenfacs
2604241005481913808.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2604241005481913808.eigenfacs
2604241005481913808.atom
making animated gifs
3 models are in 2604241005481913808.15.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
3 models are in 2604241005481913808.15.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
3 models are in 2604241005481913808.15.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=15 DQ=-20 238 4.797 137 1.218
MODEL 2 MODE=15 DQ=0 238 4.699 148 0.969
MODEL 3 MODE=15 DQ=20 238 4.950 78 2.138
getting mode 16
running: ../../bin/get_modes.sh 2604241005481913808 16 -20 20 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 16
calculating perturbed structure for DQ=-20
2604241005481913808.eigenfacs
2604241005481913808.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2604241005481913808.eigenfacs
2604241005481913808.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2604241005481913808.eigenfacs
2604241005481913808.atom
making animated gifs
3 models are in 2604241005481913808.16.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
3 models are in 2604241005481913808.16.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
3 models are in 2604241005481913808.16.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=16 DQ=-20 238 4.958 144 1.153
MODEL 2 MODE=16 DQ=0 238 4.699 148 0.969
MODEL 3 MODE=16 DQ=20 238 4.788 139 0.996
2604241005481913808.10.pdb
2604241005481913808.11.pdb
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2604241005481913808.13.pdb
2604241005481913808.14.pdb
2604241005481913808.15.pdb
2604241005481913808.16.pdb
2604241005481913808.7.pdb
2604241005481913808.8.pdb
2604241005481913808.9.pdb
STDERR:
real 0m5.001s
user 0m4.981s
sys 0m0.017s
rm: cannot remove '2604241005481913808.sdijb': No such file or directory
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