***  6csc_aligned_close  ***
Output from eigenvector calculation:
STDOUT:
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 2604241133101949041.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 10.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 2604241133101949041.atom to be opened.
Openam> File opened: 2604241133101949041.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 429
First residue number = 1
Last residue number = 433
Number of atoms found = 429
Mean number per residue = 1.0
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 28.944921 +/- 13.472524 From: 4.614000 To: 59.887000
= 51.915709 +/- 12.048117 From: 21.278000 To: 76.845000
= -15.637256 +/- 12.142027 From: -41.404000 To: 11.708000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 4.4591 % Filled.
Pdbmat> 36958 non-zero elements.
Pdbmat> 3821 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 17.81 +/- 5.90
Maximum number = 32
Minimum number = 4
Pdbmat> Matrix trace = 76420.0
Pdbmat> Larger element = 125.777
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
429 non-zero elements, NRBL set to 3
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 2604241133101949041.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 3
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 2604241133101949041.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
2604241133101949041.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 429 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 3 residue(s) per block.
Blocpdb> 429 residues.
Blocpdb> 3 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 3 atoms in block 2
Block first atom: 4
Blocpdb> 3 atoms in block 3
Block first atom: 7
Blocpdb> 3 atoms in block 4
Block first atom: 10
Blocpdb> 3 atoms in block 5
Block first atom: 13
Blocpdb> 3 atoms in block 6
Block first atom: 16
Blocpdb> 3 atoms in block 7
Block first atom: 19
Blocpdb> 3 atoms in block 8
Block first atom: 22
Blocpdb> 3 atoms in block 9
Block first atom: 25
Blocpdb> 3 atoms in block 10
Block first atom: 28
Blocpdb> 3 atoms in block 11
Block first atom: 31
Blocpdb> 3 atoms in block 12
Block first atom: 34
Blocpdb> 3 atoms in block 13
Block first atom: 37
Blocpdb> 3 atoms in block 14
Block first atom: 40
Blocpdb> 3 atoms in block 15
Block first atom: 43
Blocpdb> 3 atoms in block 16
Block first atom: 46
Blocpdb> 3 atoms in block 17
Block first atom: 49
Blocpdb> 3 atoms in block 18
Block first atom: 52
Blocpdb> 3 atoms in block 19
Block first atom: 55
Blocpdb> 3 atoms in block 20
Block first atom: 58
Blocpdb> 3 atoms in block 21
Block first atom: 61
Blocpdb> 3 atoms in block 22
Block first atom: 64
Blocpdb> 3 atoms in block 23
Block first atom: 67
Blocpdb> 3 atoms in block 24
Block first atom: 70
Blocpdb> 3 atoms in block 25
Block first atom: 73
Blocpdb> 3 atoms in block 26
Block first atom: 76
Blocpdb> 3 atoms in block 27
Block first atom: 79
%Blocpdb-Wn> 1 atoms in block 28 i.e., less than what is required for a rigid body.
%Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 82th, in residue A 82
%Blocpdb-Wn> It will be merged with next block.
Blocpdb> 4 atoms in block 28
Block first atom: 82
Blocpdb> 3 atoms in block 29
Block first atom: 86
Blocpdb> 3 atoms in block 30
Block first atom: 89
Blocpdb> 3 atoms in block 31
Block first atom: 92
Blocpdb> 3 atoms in block 32
Block first atom: 95
Blocpdb> 3 atoms in block 33
Block first atom: 98
Blocpdb> 3 atoms in block 34
Block first atom: 101
Blocpdb> 3 atoms in block 35
Block first atom: 104
Blocpdb> 3 atoms in block 36
Block first atom: 107
Blocpdb> 3 atoms in block 37
Block first atom: 110
Blocpdb> 3 atoms in block 38
Block first atom: 113
Blocpdb> 3 atoms in block 39
Block first atom: 116
Blocpdb> 3 atoms in block 40
Block first atom: 119
Blocpdb> 3 atoms in block 41
Block first atom: 122
Blocpdb> 3 atoms in block 42
Block first atom: 125
Blocpdb> 3 atoms in block 43
Block first atom: 128
Blocpdb> 3 atoms in block 44
Block first atom: 131
Blocpdb> 3 atoms in block 45
Block first atom: 134
Blocpdb> 3 atoms in block 46
Block first atom: 137
Blocpdb> 3 atoms in block 47
Block first atom: 140
Blocpdb> 3 atoms in block 48
Block first atom: 143
Blocpdb> 3 atoms in block 49
Block first atom: 146
Blocpdb> 3 atoms in block 50
Block first atom: 149
Blocpdb> 3 atoms in block 51
Block first atom: 152
Blocpdb> 3 atoms in block 52
Block first atom: 155
Blocpdb> 3 atoms in block 53
Block first atom: 158
Blocpdb> 3 atoms in block 54
Block first atom: 161
Blocpdb> 3 atoms in block 55
Block first atom: 164
Blocpdb> 3 atoms in block 56
Block first atom: 167
Blocpdb> 3 atoms in block 57
Block first atom: 170
Blocpdb> 3 atoms in block 58
Block first atom: 173
Blocpdb> 3 atoms in block 59
Block first atom: 176
Blocpdb> 3 atoms in block 60
Block first atom: 179
Blocpdb> 3 atoms in block 61
Block first atom: 182
Blocpdb> 3 atoms in block 62
Block first atom: 185
Blocpdb> 3 atoms in block 63
Block first atom: 188
Blocpdb> 3 atoms in block 64
Block first atom: 191
Blocpdb> 3 atoms in block 65
Block first atom: 194
Blocpdb> 3 atoms in block 66
Block first atom: 197
Blocpdb> 3 atoms in block 67
Block first atom: 200
Blocpdb> 3 atoms in block 68
Block first atom: 203
Blocpdb> 3 atoms in block 69
Block first atom: 206
Blocpdb> 3 atoms in block 70
Block first atom: 209
Blocpdb> 3 atoms in block 71
Block first atom: 212
Blocpdb> 3 atoms in block 72
Block first atom: 215
Blocpdb> 3 atoms in block 73
Block first atom: 218
Blocpdb> 3 atoms in block 74
Block first atom: 221
Blocpdb> 3 atoms in block 75
Block first atom: 224
Blocpdb> 3 atoms in block 76
Block first atom: 227
Blocpdb> 3 atoms in block 77
Block first atom: 230
Blocpdb> 3 atoms in block 78
Block first atom: 233
Blocpdb> 3 atoms in block 79
Block first atom: 236
Blocpdb> 3 atoms in block 80
Block first atom: 239
Blocpdb> 3 atoms in block 81
Block first atom: 242
Blocpdb> 3 atoms in block 82
Block first atom: 245
Blocpdb> 3 atoms in block 83
Block first atom: 248
Blocpdb> 3 atoms in block 84
Block first atom: 251
Blocpdb> 3 atoms in block 85
Block first atom: 254
Blocpdb> 3 atoms in block 86
Block first atom: 257
Blocpdb> 3 atoms in block 87
Block first atom: 260
Blocpdb> 3 atoms in block 88
Block first atom: 263
Blocpdb> 3 atoms in block 89
Block first atom: 266
Blocpdb> 3 atoms in block 90
Block first atom: 269
Blocpdb> 3 atoms in block 91
Block first atom: 272
Blocpdb> 3 atoms in block 92
Block first atom: 275
Blocpdb> 3 atoms in block 93
Block first atom: 278
Blocpdb> 3 atoms in block 94
Block first atom: 281
Blocpdb> 3 atoms in block 95
Block first atom: 284
Blocpdb> 3 atoms in block 96
Block first atom: 287
%Blocpdb-Wn> 1 atoms in block 97 i.e., less than what is required for a rigid body.
%Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 290th, in residue A 291
%Blocpdb-Wn> It will be merged with next block.
Blocpdb> 4 atoms in block 97
Block first atom: 290
Blocpdb> 3 atoms in block 98
Block first atom: 294
Blocpdb> 3 atoms in block 99
Block first atom: 297
Blocpdb> 3 atoms in block 100
Block first atom: 300
Blocpdb> 3 atoms in block 101
Block first atom: 303
Blocpdb> 3 atoms in block 102
Block first atom: 306
Blocpdb> 3 atoms in block 103
Block first atom: 309
Blocpdb> 3 atoms in block 104
Block first atom: 312
Blocpdb> 3 atoms in block 105
Block first atom: 315
Blocpdb> 3 atoms in block 106
Block first atom: 318
Blocpdb> 3 atoms in block 107
Block first atom: 321
Blocpdb> 3 atoms in block 108
Block first atom: 324
Blocpdb> 3 atoms in block 109
Block first atom: 327
Blocpdb> 3 atoms in block 110
Block first atom: 330
Blocpdb> 3 atoms in block 111
Block first atom: 333
Blocpdb> 3 atoms in block 112
Block first atom: 336
Blocpdb> 3 atoms in block 113
Block first atom: 339
Blocpdb> 3 atoms in block 114
Block first atom: 342
Blocpdb> 3 atoms in block 115
Block first atom: 345
Blocpdb> 3 atoms in block 116
Block first atom: 348
Blocpdb> 3 atoms in block 117
Block first atom: 351
Blocpdb> 3 atoms in block 118
Block first atom: 354
Blocpdb> 3 atoms in block 119
Block first atom: 357
Blocpdb> 3 atoms in block 120
Block first atom: 360
Blocpdb> 3 atoms in block 121
Block first atom: 363
Blocpdb> 3 atoms in block 122
Block first atom: 366
Blocpdb> 3 atoms in block 123
Block first atom: 369
Blocpdb> 3 atoms in block 124
Block first atom: 372
Blocpdb> 3 atoms in block 125
Block first atom: 375
Blocpdb> 3 atoms in block 126
Block first atom: 378
Blocpdb> 3 atoms in block 127
Block first atom: 381
Blocpdb> 3 atoms in block 128
Block first atom: 384
Blocpdb> 3 atoms in block 129
Block first atom: 387
Blocpdb> 3 atoms in block 130
Block first atom: 390
Blocpdb> 3 atoms in block 131
Block first atom: 393
Blocpdb> 3 atoms in block 132
Block first atom: 396
Blocpdb> 3 atoms in block 133
Block first atom: 399
Blocpdb> 3 atoms in block 134
Block first atom: 402
Blocpdb> 3 atoms in block 135
Block first atom: 405
Blocpdb> 3 atoms in block 136
Block first atom: 408
Blocpdb> 3 atoms in block 137
Block first atom: 411
Blocpdb> 3 atoms in block 138
Block first atom: 414
Blocpdb> 3 atoms in block 139
Block first atom: 417
Blocpdb> 3 atoms in block 140
Block first atom: 420
Blocpdb> 3 atoms in block 141
Block first atom: 423
Blocpdb> 4 atoms in block 142
Block first atom: 425
Blocpdb> 142 blocks.
Blocpdb> At most, 4 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 3 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 37100 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 1287
Prepmat> Matrix trace = 76420.0000
Prepmat> Last element read: 1287 1287 6.1878
Prepmat> 10154 lines saved.
Prepmat> 9142 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 429
RTB> Total mass = 429.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 429
RTB> Number of blocks = 142
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 47164.3654
RTB> 34266 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 852
Diagstd> Nb of non-zero elements: 34266
Diagstd> Projected matrix trace = 47164.3654
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 852 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 47164.3654
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.0400340 0.1122965 0.2230693 0.2613900
0.2820263 0.4010842 0.4844012 0.5745744 0.6021982
0.6833507 0.8277724 0.8999004 0.9531052 1.1641331
1.4597297 1.5674057 1.6791050 1.8714893 1.9564576
2.1401561 2.1477164 2.2269086 2.2915151 2.5872152
2.5982559 2.7416091 2.9194014 3.0765717 3.2815322
3.4227532 3.5754722 3.7287990 3.8435255 3.9162905
4.1190272 4.1783638 4.2248774 4.6065558 4.7232128
4.8813452 4.9957982 5.1720786 5.3518480 5.3903235
5.6101996 5.6818263 5.7358579 5.8716906 6.0634581
6.1623191 6.1808384 6.3344054 6.3599281 6.4541898
6.6465843 6.6942083 6.8585849 7.0690522 7.1793426
7.4114614 7.4488667 7.5639054 7.6572470 7.7928742
7.9824101 8.0315688 8.1927806 8.2924791 8.4026572
8.5568890 8.5926105 8.7003863 8.9382585 9.0203673
9.2399531 9.5181751 9.5708444 9.6867912 9.8778200
10.0236232 10.2705080 10.3945469 10.6070442 10.7205474
10.8798995 10.9226630 11.1207873 11.2308978 11.3015526
11.3603382 11.5201613 11.6192347 11.9104278 11.9474903
12.0027447 12.0915125 12.2254642 12.3780957 12.3912688
12.6395594
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034336 0.0034337 0.0034338 0.0034338 0.0034342
0.0034343 21.7275107 36.3896995 51.2879293 55.5187567
57.6686930 68.7722227 75.5784361 82.3129982 84.2684513
89.7670792 98.7985914 103.0131113 106.0146026 117.1646491
131.1992972 135.9521239 140.7129967 148.5555765 151.8904621
158.8612597 159.1416085 162.0490455 164.3829021 174.6672794
175.0395722 179.8034606 185.5419788 190.4709728 196.7132509
200.9014510 205.3345286 209.6909880 212.8924038 214.8981766
220.3903670 221.9721087 223.2041866 233.0684296 236.0011041
239.9192205 242.7156196 246.9606957 251.2159234 252.1173286
257.2079788 258.8446878 260.0725227 263.1339354 267.3963475
269.5674023 269.9721562 273.3053968 273.8554467 275.8774143
279.9590679 280.9602566 284.3888331 288.7193380 290.9629015
295.6291162 296.3741918 298.6539916 300.4910971 303.1406050
306.8049043 307.7481647 310.8214214 312.7069071 314.7774425
317.6531959 318.3155420 320.3056130 324.6547313 326.1424959
330.0883253 335.0210735 335.9467221 337.9755232 341.2917845
343.8014052 348.0096149 350.1047978 353.6653145 355.5525206
358.1852701 358.8885040 362.1287852 363.9171466 365.0600729
366.0082806 368.5738854 370.1553604 374.7649452 375.3475836
376.2145304 377.6031374 379.6889514 382.0517538 382.2549945
386.0657269
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 429
Rtb_to_modes> Number of blocs = 142
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9981E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9983E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9989E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9989E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.0034E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1123
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2231
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2614
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2820
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4011
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4844
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5746
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6022
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6834
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8278
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8999
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9531
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.164
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.460
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.567
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.679
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.871
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.956
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.140
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.148
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.227
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.292
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.587
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.598
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.742
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.919
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.077
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.282
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.423
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.575
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.729
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.844
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.916
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.119
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.178
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.225
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.607
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.723
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.881
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.996
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.172
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.352
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.390
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.610
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.682
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.736
Rdmodfacs> Eigenvector number: 54
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.872
Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.063
Rdmodfacs> Eigenvector number: 56
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.162
Rdmodfacs> Eigenvector number: 57
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.181
Rdmodfacs> Eigenvector number: 58
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.334
Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.360
Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.454
Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.647
Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.694
Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.859
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.069
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.179
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.411
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.449
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.564
Rdmodfacs> Eigenvector number: 69
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.657
Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.793
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.982
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.032
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.193
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.292
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.403
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.557
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.593
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.700
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.938
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.020
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.240
Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.518
Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.571
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.687
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.878
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.27
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.39
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.61
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.72
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.88
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.92
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.12
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.23
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.30
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.36
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.52
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.62
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.91
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.95
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.00
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.23
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.38
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.39
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.64
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 852 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999
0.99999 1.00001 1.00002 0.99998 0.99998
0.99999 0.99999 1.00000 0.99998 0.99997
1.00003 1.00001 1.00002 0.99997 1.00000
1.00000 1.00000 0.99998 0.99999 1.00003
1.00000 0.99997 1.00002 0.99999 1.00000
1.00002 0.99998 0.99999 0.99998 1.00002
1.00002 0.99996 1.00001 0.99999 0.99999
0.99998 1.00001 1.00001 0.99998 1.00000
1.00000 1.00001 0.99998 1.00002 0.99998
0.99999 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000
1.00001 0.99999 1.00001 1.00001 1.00001
1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999
1.00000 1.00001 0.99999 0.99997 1.00001
1.00003 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000
1.00000 0.99998 0.99999 1.00000 1.00001
0.99997 0.99999 1.00000 0.99999 0.99998
1.00002 0.99998 0.99997 0.99995 0.99999
0.99997 0.99998 1.00001 0.99999 1.00000
1.00000 1.00002 1.00001 0.99997 1.00001
0.99999 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000
1.00000
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 7722 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999
0.99999 1.00001 1.00002 0.99998 0.99998
0.99999 0.99999 1.00000 0.99998 0.99997
1.00003 1.00001 1.00002 0.99997 1.00000
1.00000 1.00000 0.99998 0.99999 1.00003
1.00000 0.99997 1.00002 0.99999 1.00000
1.00002 0.99998 0.99999 0.99998 1.00002
1.00002 0.99996 1.00001 0.99999 0.99999
0.99998 1.00001 1.00001 0.99998 1.00000
1.00000 1.00001 0.99998 1.00002 0.99998
0.99999 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000
1.00001 0.99999 1.00001 1.00001 1.00001
1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999
1.00000 1.00001 0.99999 0.99997 1.00001
1.00003 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000
1.00000 0.99998 0.99999 1.00000 1.00001
0.99997 0.99999 1.00000 0.99999 0.99998
1.00002 0.99998 0.99997 0.99995 0.99999
0.99997 0.99998 1.00001 0.99999 1.00000
1.00000 1.00002 1.00001 0.99997 1.00001
0.99999 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000
1.00000
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2: 0.000
Vector 3: 0.000-0.000
Vector 4: 0.000 0.000-0.000
Vector 5: 0.000-0.000 0.000 0.000
Vector 6: 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000
Vector 7:-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000
Vector 8:-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 9:-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 10: 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2604241133101949041.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2604241133101949041.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 2604241133101949041.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2604241133101949041.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 429
First residue number = 1
Last residue number = 433
Number of atoms found = 429
Mean number per residue = 1.0
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9981E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9983E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9989E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9989E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.0034E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1123
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2231
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2614
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2820
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4011
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4844
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5746
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6022
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6834
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8278
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8999
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9531
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.164
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.460
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.567
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.679
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.871
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.956
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.140
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.148
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.227
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.292
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.587
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.598
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.742
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.919
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.077
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.282
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.423
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.575
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.729
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.844
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.916
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.119
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.178
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.225
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.607
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.723
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.881
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.996
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.172
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.352
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.390
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.610
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.682
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.736
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.872
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.063
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.162
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.181
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.334
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.360
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.454
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.647
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.694
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.859
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.069
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.179
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.411
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.449
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.564
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.657
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.793
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.982
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.032
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.193
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.292
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.403
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.557
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.593
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.700
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.938
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.020
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.240
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.518
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.571
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.687
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.878
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.27
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.95
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.00
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.64
Bfactors> 106 vectors, 1287 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.040034
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= 0.184 for 429 C-alpha atoms.
Bfactors> = 2.764 +/- 7.07
Bfactors> = 11.198 +/- 9.51
Bfactors> Shiftng-fct= 8.435
Bfactors> Scaling-fct= 1.344
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2604241133101949041.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2604241133101949041.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4335E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4335E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 21.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 36.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 51.29
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 55.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 57.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 68.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 75.58
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 82.31
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 84.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 89.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 98.80
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 103.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 106.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 117.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 131.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 135.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 140.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 148.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 151.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 158.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 159.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 162.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 164.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 174.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 175.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 179.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 185.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 190.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 196.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 200.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 205.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 209.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 212.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 214.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 220.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 222.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 223.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 233.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 236.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 239.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 242.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 246.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 251.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 252.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 257.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 258.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 260.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 263.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 267.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 269.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 270.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 273.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 273.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 275.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 280.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 280.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 284.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 288.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 290.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 295.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 296.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 298.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 300.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 303.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 306.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 307.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 310.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 312.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 314.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 317.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 318.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 320.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 324.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 326.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 330.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 335.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 335.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 338.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 341.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 343.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 348.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 350.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 353.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 355.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 358.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 358.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 362.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 363.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 365.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 366.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 368.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 370.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 374.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 375.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 376.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 377.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 379.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 382.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 382.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 386.1
Chkmod> 106 vectors, 1287 coordinates in file.
Chkmod> That is: 429 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.9195
0.0034 0.7273
0.0034 0.9271
0.0034 0.8952
0.0034 0.7596
0.0034 0.8787
21.7266 0.1195
36.3887 0.0751
51.2893 0.0430
55.5174 0.1043
57.6635 0.0467
68.7706 0.1708
75.5751 0.0874
82.3113 0.3258
84.2650 0.1495
89.7665 0.4012
98.7960 0.1699
103.0087 0.2267
106.0098 0.4373
117.1529 0.1739
131.2058 0.3142
135.9287 0.2583
140.7026 0.0793
148.5298 0.3402
151.8662 0.2124
158.8486 0.5486
159.1453 0.5573
162.0454 0.4196
164.3932 0.3629
174.6525 0.3959
175.0234 0.2455
179.8086 0.4368
185.5213 0.4377
190.4761 0.4391
196.7188 0.6277
200.9001 0.3075
205.3122 0.4243
209.6876 0.3941
212.8964 0.3296
214.8810 0.1948
220.3802 0.5557
221.9529 0.5053
223.1978 0.4848
233.0697 0.4734
235.9857 0.4497
239.9004 0.5087
242.7101 0.3563
246.9482 0.4246
251.2087 0.4860
252.0989 0.3307
257.1924 0.3253
258.8375 0.4001
260.0646 0.2746
263.1296 0.5153
267.3748 0.1689
269.5489 0.3888
269.9641 0.1826
273.2849 0.3389
273.8452 0.2103
275.8615 0.3115
279.9558 0.2981
280.9438 0.3768
284.3852 0.5903
288.7059 0.5100
290.9435 0.4628
295.6072 0.4817
296.3641 0.3881
298.6430 0.3490
300.4734 0.3937
303.1300 0.4303
306.7839 0.4687
307.7432 0.4861
310.8122 0.4005
312.6844 0.3354
314.7704 0.4807
317.6416 0.3432
318.3091 0.5125
320.2848 0.2901
324.6361 0.4696
326.1219 0.3945
330.0750 0.3356
335.0036 0.4551
335.9350 0.4442
337.9647 0.3638
341.2802 0.4051
343.7245 0.5508
347.9861 0.4584
350.0132 0.4724
353.6994 0.4877
355.5282 0.4236
358.1715 0.2412
358.8293 0.1846
362.1004 0.5225
363.8870 0.4429
365.0193 0.4343
365.9871 0.4586
368.5555 0.3731
370.1517 0.2050
374.7421 0.3178
375.3709 0.4611
376.1554 0.4298
377.5633 0.4197
379.7431 0.4890
382.0647 0.5440
382.2190 0.3714
386.0559 0.3989
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2604241133101949041 7 -20 20 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-20
2604241133101949041.eigenfacs
2604241133101949041.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2604241133101949041.eigenfacs
2604241133101949041.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2604241133101949041.eigenfacs
2604241133101949041.atom
making animated gifs
3 models are in 2604241133101949041.7.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
3 models are in 2604241133101949041.7.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
3 models are in 2604241133101949041.7.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 2604241133101949041 8 -20 20 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-20
2604241133101949041.eigenfacs
2604241133101949041.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2604241133101949041.eigenfacs
2604241133101949041.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2604241133101949041.eigenfacs
2604241133101949041.atom
making animated gifs
3 models are in 2604241133101949041.8.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
3 models are in 2604241133101949041.8.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
3 models are in 2604241133101949041.8.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 2604241133101949041 9 -20 20 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-20
2604241133101949041.eigenfacs
2604241133101949041.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2604241133101949041.eigenfacs
2604241133101949041.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2604241133101949041.eigenfacs
2604241133101949041.atom
making animated gifs
3 models are in 2604241133101949041.9.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
3 models are in 2604241133101949041.9.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
3 models are in 2604241133101949041.9.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 2604241133101949041 10 -20 20 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-20
2604241133101949041.eigenfacs
2604241133101949041.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2604241133101949041.eigenfacs
2604241133101949041.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2604241133101949041.eigenfacs
2604241133101949041.atom
making animated gifs
3 models are in 2604241133101949041.10.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
3 models are in 2604241133101949041.10.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
3 models are in 2604241133101949041.10.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 2604241133101949041 11 -20 20 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-20
2604241133101949041.eigenfacs
2604241133101949041.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2604241133101949041.eigenfacs
2604241133101949041.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2604241133101949041.eigenfacs
2604241133101949041.atom
making animated gifs
3 models are in 2604241133101949041.11.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
3 models are in 2604241133101949041.11.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
3 models are in 2604241133101949041.11.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 12
running: ../../bin/get_modes.sh 2604241133101949041 12 -20 20 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 12
calculating perturbed structure for DQ=-20
2604241133101949041.eigenfacs
2604241133101949041.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2604241133101949041.eigenfacs
2604241133101949041.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2604241133101949041.eigenfacs
2604241133101949041.atom
making animated gifs
3 models are in 2604241133101949041.12.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
3 models are in 2604241133101949041.12.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
3 models are in 2604241133101949041.12.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 13
running: ../../bin/get_modes.sh 2604241133101949041 13 -20 20 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 13
calculating perturbed structure for DQ=-20
2604241133101949041.eigenfacs
2604241133101949041.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2604241133101949041.eigenfacs
2604241133101949041.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2604241133101949041.eigenfacs
2604241133101949041.atom
making animated gifs
3 models are in 2604241133101949041.13.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
3 models are in 2604241133101949041.13.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
3 models are in 2604241133101949041.13.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 14
running: ../../bin/get_modes.sh 2604241133101949041 14 -20 20 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 14
calculating perturbed structure for DQ=-20
2604241133101949041.eigenfacs
2604241133101949041.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2604241133101949041.eigenfacs
2604241133101949041.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2604241133101949041.eigenfacs
2604241133101949041.atom
making animated gifs
3 models are in 2604241133101949041.14.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
3 models are in 2604241133101949041.14.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
3 models are in 2604241133101949041.14.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 15
running: ../../bin/get_modes.sh 2604241133101949041 15 -20 20 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 15
calculating perturbed structure for DQ=-20
2604241133101949041.eigenfacs
2604241133101949041.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2604241133101949041.eigenfacs
2604241133101949041.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2604241133101949041.eigenfacs
2604241133101949041.atom
making animated gifs
3 models are in 2604241133101949041.15.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
3 models are in 2604241133101949041.15.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
3 models are in 2604241133101949041.15.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 16
running: ../../bin/get_modes.sh 2604241133101949041 16 -20 20 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 16
calculating perturbed structure for DQ=-20
2604241133101949041.eigenfacs
2604241133101949041.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2604241133101949041.eigenfacs
2604241133101949041.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2604241133101949041.eigenfacs
2604241133101949041.atom
making animated gifs
3 models are in 2604241133101949041.16.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
3 models are in 2604241133101949041.16.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
3 models are in 2604241133101949041.16.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
2604241133101949041.10.pdb
2604241133101949041.11.pdb
2604241133101949041.12.pdb
2604241133101949041.13.pdb
2604241133101949041.14.pdb
2604241133101949041.15.pdb
2604241133101949041.16.pdb
2604241133101949041.7.pdb
2604241133101949041.8.pdb
2604241133101949041.9.pdb
STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 0m8.216s
user 0m8.198s
sys 0m0.015s
rm: cannot remove '2604241133101949041.sdijf': No such file or directory
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:
elNémo
is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed
by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Between 2015 and 2025, it was hosted by US2B (Nantes).
Last modification: april 24th, 2026.
|