*** aspartate open to closed cut off 8 ***
Output from eigenvector calculation:
STDOUT:
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 2604241226251976617.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 2604241226251976617.atom to be opened.
Openam> File opened: 2604241226251976617.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 401
First residue number = 3
Last residue number = 410
Number of atoms found = 401
Mean number per residue = 1.0
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 43.865883 +/- 15.185813 From: 14.662000 To: 76.615000
= 13.256613 +/- 11.406021 From: -11.812000 To: 37.795000
= 46.847032 +/- 10.389321 From: 7.064000 To: 68.044000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 2.8401 % Filled.
Pdbmat> 20568 non-zero elements.
Pdbmat> 2018 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 10.06 +/- 2.94
Maximum number = 18
Minimum number = 2
Pdbmat> Matrix trace = 40360.0
Pdbmat> Larger element = 74.5503
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
401 non-zero elements, NRBL set to 3
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 2604241226251976617.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 3
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 2604241226251976617.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
2604241226251976617.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 401 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 3 residue(s) per block.
Blocpdb> 401 residues.
Blocpdb> 3 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 3 atoms in block 2
Block first atom: 4
Blocpdb> 3 atoms in block 3
Block first atom: 7
Blocpdb> 3 atoms in block 4
Block first atom: 10
Blocpdb> 3 atoms in block 5
Block first atom: 13
Blocpdb> 3 atoms in block 6
Block first atom: 16
Blocpdb> 3 atoms in block 7
Block first atom: 19
Blocpdb> 3 atoms in block 8
Block first atom: 22
Blocpdb> 3 atoms in block 9
Block first atom: 25
Blocpdb> 3 atoms in block 10
Block first atom: 28
Blocpdb> 3 atoms in block 11
Block first atom: 31
Blocpdb> 3 atoms in block 12
Block first atom: 34
Blocpdb> 3 atoms in block 13
Block first atom: 37
Blocpdb> 3 atoms in block 14
Block first atom: 40
Blocpdb> 3 atoms in block 15
Block first atom: 43
Blocpdb> 3 atoms in block 16
Block first atom: 46
Blocpdb> 3 atoms in block 17
Block first atom: 49
Blocpdb> 3 atoms in block 18
Block first atom: 52
Blocpdb> 3 atoms in block 19
Block first atom: 55
Blocpdb> 3 atoms in block 20
Block first atom: 58
%Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 21 i.e., less than what is required for a rigid body.
%Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 62th, in residue A 64
%Blocpdb-Wn> It will be merged with next block.
Blocpdb> 5 atoms in block 21
Block first atom: 61
Blocpdb> 3 atoms in block 22
Block first atom: 66
Blocpdb> 3 atoms in block 23
Block first atom: 69
Blocpdb> 3 atoms in block 24
Block first atom: 72
Blocpdb> 3 atoms in block 25
Block first atom: 75
Blocpdb> 3 atoms in block 26
Block first atom: 78
Blocpdb> 3 atoms in block 27
Block first atom: 81
Blocpdb> 3 atoms in block 28
Block first atom: 84
Blocpdb> 3 atoms in block 29
Block first atom: 87
Blocpdb> 3 atoms in block 30
Block first atom: 90
Blocpdb> 3 atoms in block 31
Block first atom: 93
Blocpdb> 3 atoms in block 32
Block first atom: 96
Blocpdb> 3 atoms in block 33
Block first atom: 99
Blocpdb> 3 atoms in block 34
Block first atom: 102
Blocpdb> 3 atoms in block 35
Block first atom: 105
Blocpdb> 3 atoms in block 36
Block first atom: 108
Blocpdb> 3 atoms in block 37
Block first atom: 111
Blocpdb> 3 atoms in block 38
Block first atom: 114
Blocpdb> 3 atoms in block 39
Block first atom: 117
Blocpdb> 3 atoms in block 40
Block first atom: 120
%Blocpdb-Wn> 1 atoms in block 41 i.e., less than what is required for a rigid body.
%Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 123th, in residue A 126
%Blocpdb-Wn> It will be merged with next block.
Blocpdb> 3 atoms in block 41
Block first atom: 123
Blocpdb> 3 atoms in block 42
Block first atom: 126
Blocpdb> 3 atoms in block 43
Block first atom: 129
Blocpdb> 3 atoms in block 44
Block first atom: 132
Blocpdb> 3 atoms in block 45
Block first atom: 135
Blocpdb> 3 atoms in block 46
Block first atom: 138
Blocpdb> 3 atoms in block 47
Block first atom: 141
%Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 48 i.e., less than what is required for a rigid body.
%Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 145th, in residue A 152
%Blocpdb-Wn> It will be merged with next block.
Blocpdb> 5 atoms in block 48
Block first atom: 144
Blocpdb> 3 atoms in block 49
Block first atom: 149
Blocpdb> 3 atoms in block 50
Block first atom: 152
Blocpdb> 3 atoms in block 51
Block first atom: 155
Blocpdb> 3 atoms in block 52
Block first atom: 158
Blocpdb> 3 atoms in block 53
Block first atom: 161
Blocpdb> 3 atoms in block 54
Block first atom: 164
Blocpdb> 3 atoms in block 55
Block first atom: 167
Blocpdb> 3 atoms in block 56
Block first atom: 170
Blocpdb> 3 atoms in block 57
Block first atom: 173
Blocpdb> 3 atoms in block 58
Block first atom: 176
Blocpdb> 3 atoms in block 59
Block first atom: 179
Blocpdb> 3 atoms in block 60
Block first atom: 182
Blocpdb> 3 atoms in block 61
Block first atom: 185
Blocpdb> 3 atoms in block 62
Block first atom: 188
Blocpdb> 3 atoms in block 63
Block first atom: 191
Blocpdb> 3 atoms in block 64
Block first atom: 194
Blocpdb> 3 atoms in block 65
Block first atom: 197
Blocpdb> 3 atoms in block 66
Block first atom: 200
Blocpdb> 3 atoms in block 67
Block first atom: 203
Blocpdb> 3 atoms in block 68
Block first atom: 206
Blocpdb> 3 atoms in block 69
Block first atom: 209
Blocpdb> 3 atoms in block 70
Block first atom: 212
Blocpdb> 3 atoms in block 71
Block first atom: 215
Blocpdb> 3 atoms in block 72
Block first atom: 218
Blocpdb> 3 atoms in block 73
Block first atom: 221
Blocpdb> 3 atoms in block 74
Block first atom: 224
Blocpdb> 3 atoms in block 75
Block first atom: 227
Blocpdb> 3 atoms in block 76
Block first atom: 230
Blocpdb> 3 atoms in block 77
Block first atom: 233
Blocpdb> 3 atoms in block 78
Block first atom: 236
Blocpdb> 3 atoms in block 79
Block first atom: 239
Blocpdb> 3 atoms in block 80
Block first atom: 242
Blocpdb> 3 atoms in block 81
Block first atom: 245
Blocpdb> 3 atoms in block 82
Block first atom: 248
Blocpdb> 3 atoms in block 83
Block first atom: 251
Blocpdb> 3 atoms in block 84
Block first atom: 254
Blocpdb> 3 atoms in block 85
Block first atom: 257
Blocpdb> 3 atoms in block 86
Block first atom: 260
Blocpdb> 3 atoms in block 87
Block first atom: 263
Blocpdb> 3 atoms in block 88
Block first atom: 266
Blocpdb> 3 atoms in block 89
Block first atom: 269
Blocpdb> 3 atoms in block 90
Block first atom: 272
Blocpdb> 3 atoms in block 91
Block first atom: 275
Blocpdb> 3 atoms in block 92
Block first atom: 278
Blocpdb> 3 atoms in block 93
Block first atom: 281
Blocpdb> 3 atoms in block 94
Block first atom: 284
Blocpdb> 3 atoms in block 95
Block first atom: 287
Blocpdb> 3 atoms in block 96
Block first atom: 290
Blocpdb> 3 atoms in block 97
Block first atom: 293
Blocpdb> 3 atoms in block 98
Block first atom: 296
Blocpdb> 3 atoms in block 99
Block first atom: 299
Blocpdb> 3 atoms in block 100
Block first atom: 302
Blocpdb> 3 atoms in block 101
Block first atom: 305
Blocpdb> 3 atoms in block 102
Block first atom: 308
Blocpdb> 3 atoms in block 103
Block first atom: 311
Blocpdb> 3 atoms in block 104
Block first atom: 314
Blocpdb> 3 atoms in block 105
Block first atom: 317
Blocpdb> 3 atoms in block 106
Block first atom: 320
Blocpdb> 3 atoms in block 107
Block first atom: 323
Blocpdb> 3 atoms in block 108
Block first atom: 326
Blocpdb> 3 atoms in block 109
Block first atom: 329
Blocpdb> 3 atoms in block 110
Block first atom: 332
Blocpdb> 3 atoms in block 111
Block first atom: 335
Blocpdb> 3 atoms in block 112
Block first atom: 338
Blocpdb> 3 atoms in block 113
Block first atom: 341
Blocpdb> 3 atoms in block 114
Block first atom: 344
Blocpdb> 3 atoms in block 115
Block first atom: 347
Blocpdb> 3 atoms in block 116
Block first atom: 350
Blocpdb> 3 atoms in block 117
Block first atom: 353
Blocpdb> 3 atoms in block 118
Block first atom: 356
Blocpdb> 3 atoms in block 119
Block first atom: 359
Blocpdb> 3 atoms in block 120
Block first atom: 362
Blocpdb> 3 atoms in block 121
Block first atom: 365
Blocpdb> 3 atoms in block 122
Block first atom: 368
Blocpdb> 3 atoms in block 123
Block first atom: 371
Blocpdb> 3 atoms in block 124
Block first atom: 374
Blocpdb> 3 atoms in block 125
Block first atom: 377
Blocpdb> 3 atoms in block 126
Block first atom: 380
Blocpdb> 3 atoms in block 127
Block first atom: 383
Blocpdb> 3 atoms in block 128
Block first atom: 386
Blocpdb> 3 atoms in block 129
Block first atom: 389
Blocpdb> 3 atoms in block 130
Block first atom: 392
Blocpdb> 3 atoms in block 131
Block first atom: 395
%Blocpdb-Wn> 1 atoms in block 132 i.e., less than what is required for a rigid body.
%Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 398th, in residue A 406
%Blocpdb-Wn> It will be merged with next block.
Blocpdb> 4 atoms in block 132
Block first atom: 397
Blocpdb> 132 blocks.
Blocpdb> At most, 5 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 3 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 20700 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 1203
Prepmat> Matrix trace = 40360.0000
Prepmat> Last element read: 1203 1203 30.3598
Prepmat> 8779 lines saved.
Prepmat> 8137 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 401
RTB> Total mass = 401.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 401
RTB> Number of blocks = 132
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 22837.0160
RTB> 21096 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 792
Diagstd> Nb of non-zero elements: 21096
Diagstd> Projected matrix trace = 22837.0160
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 792 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 22837.0160
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 14 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
%Diagstd-Wn> Six expected. Parts of the structure interact too little ?
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0507727
0.0815466 0.1245636 0.1806576 0.1940628 0.2479639
0.2875346 0.3109677 0.3597365 0.4012143 0.4266305
0.4402362 0.4953144 0.5302729 0.5651374 0.5672757
0.5864149 0.6313457 0.6803794 0.6945554 0.7226694
0.7727997 0.7990848 0.8351425 0.8652116 0.8749522
0.9120639 0.9662848 1.0232725 1.0487875 1.1612308
1.1865384 1.2210144 1.2665544 1.2854856 1.3320915
1.4179109 1.4854317 1.5008146 1.5201299 1.5716959
1.5821249 1.6281486 1.6738918 1.7427491 1.8090695
1.8280877 1.9306941 2.0061301 2.0724711 2.0942430
2.1268468 2.1688716 2.1933114 2.2459397 2.2673254
2.3907967 2.4852077 2.5033921 2.5289669 2.6385927
2.6672881 2.7459395 2.7703079 2.8352847 2.8548288
2.8997402 2.9354849 3.0157472 3.1076793 3.1845265
3.2337128 3.2855965 3.3683051 3.3770230 3.3964665
3.4356622 3.5431889 3.5746710 3.6798492 3.7078150
3.7680510 3.8022427 3.8612485 3.9148676 3.9421580
4.0330144 4.1110183 4.1634372 4.2402206 4.2974617
4.3171800
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034323 0.0034330 0.0034335 0.0034336 0.0034336
0.0034337 0.0034338 0.0034338 0.0034339 0.0034339
0.0034339 0.0034340 0.0034340 0.0034340 24.4686782
31.0097541 38.3257718 46.1554906 47.8372798 54.0741238
58.2291327 60.5554100 65.1309653 68.7833727 70.9285720
72.0506907 76.4250569 79.0760583 81.6342282 81.7885266
83.1567988 86.2837241 89.5717072 90.5000326 92.3134756
95.4616077 97.0714933 99.2374467 101.0081549 101.5751435
103.7069640 106.7450758 109.8476881 111.2087674 117.0185078
118.2867694 119.9929339 122.2101295 123.1200813 125.3320994
129.3063180 132.3492928 133.0328215 133.8861438 136.1380530
136.5889816 138.5614123 140.4943852 143.3549573 146.0571777
146.8228972 150.8870680 153.8065472 156.3289909 157.1479850
158.3665231 159.9234684 160.8219878 162.7400066 163.5129684
167.9061505 171.1893033 171.8144638 172.6898649 176.3930461
177.3496110 179.9454044 180.7420896 182.8494324 183.4785558
184.9161422 186.0523685 188.5787484 191.4314884 193.7839099
195.2747099 196.8350323 199.2971052 199.5548495 200.1285025
201.2799480 204.4054318 205.3115202 208.3100825 209.1001317
210.7917789 211.7459929 213.3826762 214.8591332 215.6067211
218.0771520 220.1760035 221.5752704 223.6091178 225.1133698
225.6292289
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 401
Rtb_to_modes> Number of blocs = 132
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9902E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9947E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9973E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9976E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9981E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9984E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9989E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9993E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9997E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9998E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9999E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9999E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.0773E-02
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.317
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 792 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
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1.00001 1.00000 1.00003 0.99999 1.00001
0.99998 1.00002 0.99999 1.00000 1.00001
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0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000
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0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999
1.00001 0.99997 1.00001 1.00000 1.00001
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1.00002 1.00002 1.00001 1.00003 1.00001
1.00001
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 7218 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
0.99997 1.00001 0.99999 1.00003 1.00001
1.00001 0.99995 0.99999 1.00002 0.99999
0.99998 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000
0.99998 1.00002 1.00001 1.00004 1.00000
0.99999 0.99999 1.00000 1.00002 0.99999
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1.00000 1.00003 0.99999 1.00001 1.00002
1.00001 1.00000 1.00003 0.99999 1.00001
0.99998 1.00002 0.99999 1.00000 1.00001
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0.99997 1.00001 1.00003 1.00000 1.00000
1.00000 1.00003 1.00002 0.99999 0.99998
1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000
0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000
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0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999
1.00001 0.99997 1.00001 1.00000 1.00001
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1.00000 1.00001 1.00002 1.00001 1.00002
1.00002 1.00002 1.00001 1.00003 1.00001
1.00001
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2: 0.000
Vector 3:-0.000 0.000
Vector 4:-0.000-0.000 0.000
Vector 5:-0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 6: 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000
Vector 7: 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000
Vector 8:-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000
Vector 9: 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
Vector 10:-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2604241226251976617.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2604241226251976617.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 2604241226251976617.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2604241226251976617.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 401
First residue number = 3
Last residue number = 410
Number of atoms found = 401
Mean number per residue = 1.0
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9902E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9947E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9973E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9976E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9981E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9984E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9989E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9993E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9997E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9998E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9999E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9999E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.0773E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.1547E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1246
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1807
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1941
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2480
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2875
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3110
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3597
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4012
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4266
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4402
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4953
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5303
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5651
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5673
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5864
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6313
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6804
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6946
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7227
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7728
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7991
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8351
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8652
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8750
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9121
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9663
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.023
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.049
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.161
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.187
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.221
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.267
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.285
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.332
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.418
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.485
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.501
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.520
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.572
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.582
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.628
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.674
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.743
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.809
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.828
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.931
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.006
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.072
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.094
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.127
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.169
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.267
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.391
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.485
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.802
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.861
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.915
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.942
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.033
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.111
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.163
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.240
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.297
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.317
Bfactors> 106 vectors, 1203 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 14 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.050773
Bfactors> 92 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= 0.480 for 401 C-alpha atoms.
Bfactors> = 4.780 +/- 5.58
Bfactors> = 12.755 +/- 8.12
Bfactors> Shiftng-fct= 7.975
Bfactors> Scaling-fct= 1.457
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2604241226251976617.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2604241226251976617.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4321E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4329E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4333E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4334E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4335E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4335E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 24.47
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 31.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 38.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 46.16
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 47.84
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 54.08
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 58.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 60.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 65.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 68.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 70.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 72.04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 79.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 81.63
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 81.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 83.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 86.28
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 89.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 90.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 92.31
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 95.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 97.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 99.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 101.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 101.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 103.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 106.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 109.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 111.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 117.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 118.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 120.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 122.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 123.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 125.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 129.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 132.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 133.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 133.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 136.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 136.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 138.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 140.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 143.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 146.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 146.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 150.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 153.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 156.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 157.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 158.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 159.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 160.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 162.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 163.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 167.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 171.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 171.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 172.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 176.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 177.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 179.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 180.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 182.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 183.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 184.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 186.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 188.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 191.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 193.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 195.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 196.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 199.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 199.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 200.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 201.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 204.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 205.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 208.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 209.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 210.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 211.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 213.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 214.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 215.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 218.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 220.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 221.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 223.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 225.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 225.6
Chkmod> 106 vectors, 1203 coordinates in file.
Chkmod> That is: 401 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector 4 is: 1.0001 (instead of 1.0000).
%Chkmod-Wn> Norm of vector 7 is: 0.9999 (instead of 1.0000).
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.7807
0.0034 0.7034
0.0034 0.4556
0.0034 0.0643
0.0034 0.0787
0.0034 0.2262
0.0034 0.0474
0.0034 0.0237
0.0034 0.0765
0.0034 0.4531
0.0034 0.2032
0.0034 0.1502
0.0034 0.0949
0.0034 0.0480
24.4677 0.3983
31.0085 0.5350
38.3297 0.1477
46.1589 0.4194
47.8398 0.1865
54.0757 0.4674
58.2231 0.0444
60.5560 0.4705
65.1249 0.4499
68.7792 0.2002
70.9230 0.6487
72.0446 0.4138
76.4207 0.4325
79.0747 0.4949
81.6280 0.3014
81.7868 0.3713
83.1522 0.2524
86.2769 0.4974
89.5692 0.0981
90.4991 0.5241
92.3115 0.3038
95.4575 0.4722
97.0683 0.4925
99.2307 0.4956
101.0031 0.2863
101.5736 0.2184
103.7046 0.1449
106.7413 0.5259
109.8283 0.5826
111.2153 0.4298
117.0019 0.2868
118.3047 0.5520
119.9871 0.4794
122.2264 0.5428
123.0915 0.5607
125.3224 0.4647
129.3048 0.6491
132.3244 0.6315
133.0353 0.6087
133.8747 0.5402
136.1454 0.5544
136.5777 0.5266
138.5491 0.2331
140.4929 0.3402
143.3591 0.5857
146.0481 0.5384
146.8131 0.5337
150.8925 0.5943
153.7950 0.5320
156.3045 0.5575
157.1321 0.4894
158.3654 0.5297
159.9213 0.4152
160.8037 0.4270
162.7352 0.3812
163.4942 0.5881
167.9061 0.3929
171.1748 0.5871
171.7936 0.4815
172.6836 0.6124
176.3991 0.3442
177.3324 0.5231
179.9397 0.5016
180.7243 0.3989
182.8324 0.4756
183.4762 0.4277
184.9165 0.5007
186.0290 0.4422
188.5786 0.4536
191.4331 0.4629
193.7900 0.5598
195.2750 0.4936
196.8387 0.4138
199.2795 0.5344
199.5456 0.4840
200.1062 0.5957
201.2812 0.4704
204.3912 0.2241
205.3122 0.4306
208.3054 0.4362
209.0964 0.4761
210.7813 0.5102
211.7301 0.3376
213.3666 0.5643
214.8535 0.5339
215.5931 0.4934
218.0674 0.5467
220.1661 0.3791
221.5541 0.5085
223.5937 0.3714
225.0916 0.4978
225.6148 0.3908
Project conformational change on normal modes:
Projmod> Version 1.36, April 2003.
Projmod> Projection of a difference vector on a set of eigenvectors.
Getnam> CERFACS file with the eigenvectors ?
Getnam> 2604241226251976617.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2604241226251976617.eigenfacs
Getnam> Pdb file with the reference structure ?
Getnam> 2604241226251976617.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2604241226251976617.atom
Getnam> Pdb file with the other conformer ?
Getnam> 2604241226251976617.atom2
Openam> file on opening on unit 12:
2604241226251976617.atom2
Getrep> Are the masses given in the pdb file ? (y/n)
Getrep> F
Projmod> All masses will all be assumed to be of 1.
Getrep> Displacement along one mode ? (y/n)
Getrep> F
Openam> file on opening on unit 13:
projmod.res
Openam> file on opening on unit 14:
dr.res
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4321E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4329E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4333E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4334E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4335E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4335E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 24.47
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 31.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 38.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 46.16
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 47.84
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 54.08
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 58.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 60.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 65.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 68.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 70.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 72.04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 76.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 79.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 81.63
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 81.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 83.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 86.28
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 89.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 90.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 92.31
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 95.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 97.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 99.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 101.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 101.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 103.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 106.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 109.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 111.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 117.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 118.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 120.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 122.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 123.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 125.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 129.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 132.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 133.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 133.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 136.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 136.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 138.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 140.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 143.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 146.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 146.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 150.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 153.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 156.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 157.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 158.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 159.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 160.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 162.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 163.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 167.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 171.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 171.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 172.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 176.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 177.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 179.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 180.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 182.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 183.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 184.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 186.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 188.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 191.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 193.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 195.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 196.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 199.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 199.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 200.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 201.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 204.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 205.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 208.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 209.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 210.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 211.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 213.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 214.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 215.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 218.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 220.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 221.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 223.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 225.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 225.6
Projmod> 106 vectors, 1203 coordinates in file.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 401
First residue number = 3
Last residue number = 410
Number of atoms found = 401
Mean number per residue = 1.0
Projmod> Cartesian (eigen)vectors will be studied.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 401
First residue number = 3
Last residue number = 410
Number of atoms found = 401
Mean number per residue = 1.0
Projmod> File dr.res: displacement=f(atom number).
Projmod> 401 atoms are considered.
Projmod> Atomic r.m.s. displacements= 1.66
Projmod> Atomic average masses = 1.00 +/- 0.00
Projmod> File projmod.res: dr.vector=f(fqcy), and cumulative square sum.
Vector: 1 F= 0.00 Cos= -0.034 Sum= 0.001 q= -1.1369
Vector: 2 F= 0.00 Cos= 0.009 Sum= 0.001 q= 0.3070
Vector: 3 F= 0.00 Cos= 0.038 Sum= 0.003 q= 1.2684
%Projmod-Wn> Eigenvector 4 Norm= 1.0001
Vector: 4 F= 0.00 Cos= 0.006 Sum= 0.003 q= 0.2093
Vector: 5 F= 0.00 Cos= -0.017 Sum= 0.003 q= -0.5497
Vector: 6 F= 0.00 Cos= -0.032 Sum= 0.004 q= -1.0779
%Projmod-Wn> Eigenvector 7 Norm= 0.9999
Vector: 7 F= 0.00 Cos= 0.186 Sum= 0.039 q= 6.1726
Vector: 8 F= 0.00 Cos= 0.013 Sum= 0.039 q= 0.4354
Vector: 9 F= 0.00 Cos= -0.019 Sum= 0.039 q= -0.6284
Vector: 10 F= 0.00 Cos= 0.094 Sum= 0.048 q= 3.1242
Vector: 11 F= 0.00 Cos= 0.121 Sum= 0.063 q= 4.0232
Vector: 12 F= 0.00 Cos= 0.092 Sum= 0.071 q= 3.0523
Vector: 13 F= 0.00 Cos= -0.047 Sum= 0.073 q= -1.5653
Vector: 14 F= 0.00 Cos= 0.082 Sum= 0.080 q= 2.7356
Vector: 15 F= 24.47 Cos= 0.649 Sum= 0.501 q= 21.5290
Vector: 16 F= 31.01 Cos= 0.365 Sum= 0.634 q= 12.1304
Vector: 17 F= 38.33 Cos= 0.081 Sum= 0.641 q= 2.6806
Vector: 18 F= 46.16 Cos= 0.108 Sum= 0.653 q= 3.6007
Vector: 19 F= 47.84 Cos= 0.116 Sum= 0.666 q= 3.8661
Vector: 20 F= 54.08 Cos= -0.160 Sum= 0.692 q= -5.3138
Vector: 21 F= 58.22 Cos= 0.124 Sum= 0.707 q= 4.1294
Vector: 22 F= 60.56 Cos= 0.027 Sum= 0.708 q= 0.8998
Vector: 23 F= 65.12 Cos= -0.158 Sum= 0.733 q= -5.2291
Vector: 24 F= 68.78 Cos= -0.023 Sum= 0.733 q= -0.7531
Vector: 25 F= 70.92 Cos= 0.121 Sum= 0.748 q= 4.0218
Vector: 26 F= 72.04 Cos= -0.046 Sum= 0.750 q= -1.5182
Vector: 27 F= 76.42 Cos= 0.043 Sum= 0.752 q= 1.4290
Vector: 28 F= 79.07 Cos= -0.012 Sum= 0.752 q= -0.3910
Vector: 29 F= 81.63 Cos= -0.011 Sum= 0.752 q= -0.3528
Vector: 30 F= 81.79 Cos= 0.093 Sum= 0.761 q= 3.0920
Vector: 31 F= 83.15 Cos= 0.062 Sum= 0.765 q= 2.0625
Vector: 32 F= 86.28 Cos= 0.023 Sum= 0.765 q= 0.7503
Vector: 33 F= 89.57 Cos= -0.196 Sum= 0.804 q= -6.5219
Vector: 34 F= 90.50 Cos= 0.017 Sum= 0.804 q= 0.5637
Vector: 35 F= 92.31 Cos= 0.097 Sum= 0.814 q= 3.2287
Vector: 36 F= 95.46 Cos= -0.063 Sum= 0.817 q= -2.0773
Vector: 37 F= 97.07 Cos= -0.009 Sum= 0.818 q= -0.2899
Vector: 38 F= 99.23 Cos= -0.002 Sum= 0.818 q= -0.0610
Vector: 39 F= 101.00 Cos= -0.019 Sum= 0.818 q= -0.6468
Vector: 40 F= 101.57 Cos= -0.052 Sum= 0.821 q= -1.7421
Vector: 41 F= 103.70 Cos= -0.014 Sum= 0.821 q= -0.4733
Vector: 42 F= 106.74 Cos= 0.023 Sum= 0.821 q= 0.7539
Vector: 43 F= 109.83 Cos= -0.022 Sum= 0.822 q= -0.7326
Vector: 44 F= 111.22 Cos= 0.004 Sum= 0.822 q= 0.1265
Vector: 45 F= 117.00 Cos= -0.045 Sum= 0.824 q= -1.4884
Vector: 46 F= 118.30 Cos= -0.051 Sum= 0.826 q= -1.6866
Vector: 47 F= 119.99 Cos= 0.074 Sum= 0.832 q= 2.4711
Vector: 48 F= 122.23 Cos= 0.051 Sum= 0.835 q= 1.6829
Vector: 49 F= 123.09 Cos= -0.021 Sum= 0.835 q= -0.7083
Vector: 50 F= 125.32 Cos= 0.024 Sum= 0.836 q= 0.8121
Vector: 51 F= 129.30 Cos= 0.001 Sum= 0.836 q= 0.0461
Vector: 52 F= 132.32 Cos= 0.029 Sum= 0.836 q= 0.9519
Vector: 53 F= 133.04 Cos= -0.020 Sum= 0.837 q= -0.6781
Vector: 54 F= 133.87 Cos= 0.050 Sum= 0.839 q= 1.6582
Vector: 55 F= 136.15 Cos= 0.056 Sum= 0.843 q= 1.8627
Vector: 56 F= 136.58 Cos= -0.061 Sum= 0.846 q= -2.0177
Vector: 57 F= 138.55 Cos= 0.141 Sum= 0.866 q= 4.6650
Vector: 58 F= 140.49 Cos= -0.061 Sum= 0.870 q= -2.0330
Vector: 59 F= 143.36 Cos= -0.012 Sum= 0.870 q= -0.3889
Vector: 60 F= 146.05 Cos= 0.005 Sum= 0.870 q= 0.1773
Vector: 61 F= 146.81 Cos= 0.017 Sum= 0.870 q= 0.5660
Vector: 62 F= 150.89 Cos= 0.063 Sum= 0.874 q= 2.0808
Vector: 63 F= 153.79 Cos= -0.012 Sum= 0.874 q= -0.3935
Vector: 64 F= 156.30 Cos= -0.046 Sum= 0.876 q= -1.5205
Vector: 65 F= 157.13 Cos= -0.054 Sum= 0.879 q= -1.7811
Vector: 66 F= 158.37 Cos= 0.037 Sum= 0.881 q= 1.2145
Vector: 67 F= 159.92 Cos= -0.010 Sum= 0.881 q= -0.3300
Vector: 68 F= 160.80 Cos= -0.023 Sum= 0.881 q= -0.7721
Vector: 69 F= 162.74 Cos= -0.043 Sum= 0.883 q= -1.4387
Vector: 70 F= 163.49 Cos= 0.042 Sum= 0.885 q= 1.3842
Vector: 71 F= 167.91 Cos= -0.007 Sum= 0.885 q= -0.2419
Vector: 72 F= 171.17 Cos= -0.019 Sum= 0.885 q= -0.6222
Vector: 73 F= 171.79 Cos= -0.027 Sum= 0.886 q= -0.9081
Vector: 74 F= 172.68 Cos= 0.002 Sum= 0.886 q= 0.0608
Vector: 75 F= 176.40 Cos= -0.020 Sum= 0.886 q= -0.6757
Vector: 76 F= 177.33 Cos= 0.001 Sum= 0.886 q= 0.0211
Vector: 77 F= 179.94 Cos= 0.016 Sum= 0.887 q= 0.5448
Vector: 78 F= 180.72 Cos= 0.000 Sum= 0.887 q= 0.0127
Vector: 79 F= 182.83 Cos= 0.007 Sum= 0.887 q= 0.2466
Vector: 80 F= 183.48 Cos= 0.021 Sum= 0.887 q= 0.6944
Vector: 81 F= 184.92 Cos= 0.015 Sum= 0.887 q= 0.5000
Vector: 82 F= 186.03 Cos= 0.003 Sum= 0.887 q= 0.0945
Vector: 83 F= 188.58 Cos= -0.002 Sum= 0.887 q= -0.0684
Vector: 84 F= 191.43 Cos= -0.005 Sum= 0.887 q= -0.1550
Vector: 85 F= 193.79 Cos= -0.003 Sum= 0.887 q= -0.0911
Vector: 86 F= 195.27 Cos= -0.020 Sum= 0.888 q= -0.6475
Vector: 87 F= 196.84 Cos= 0.057 Sum= 0.891 q= 1.8805
Vector: 88 F= 199.28 Cos= 0.013 Sum= 0.891 q= 0.4182
Vector: 89 F= 199.55 Cos= 0.044 Sum= 0.893 q= 1.4599
Vector: 90 F= 200.11 Cos= 0.022 Sum= 0.894 q= 0.7159
Vector: 91 F= 201.28 Cos= 0.047 Sum= 0.896 q= 1.5483
Vector: 92 F= 204.39 Cos= -0.025 Sum= 0.896 q= -0.8297
Vector: 93 F= 205.31 Cos= 0.030 Sum= 0.897 q= 0.9937
Vector: 94 F= 208.31 Cos= -0.002 Sum= 0.897 q= -0.0567
Vector: 95 F= 209.10 Cos= -0.012 Sum= 0.897 q= -0.4045
Vector: 96 F= 210.78 Cos= -0.002 Sum= 0.897 q= -0.0726
Vector: 97 F= 211.73 Cos= -0.015 Sum= 0.898 q= -0.5003
Vector: 98 F= 213.37 Cos= -0.034 Sum= 0.899 q= -1.1305
Vector: 99 F= 214.85 Cos= -0.019 Sum= 0.899 q= -0.6422
Vector: 100 F= 215.59 Cos= 0.031 Sum= 0.900 q= 1.0303
Vector: 101 F= 218.07 Cos= 0.018 Sum= 0.900 q= 0.5820
Vector: 102 F= 220.17 Cos= 0.011 Sum= 0.901 q= 0.3806
Vector: 103 F= 221.55 Cos= 0.013 Sum= 0.901 q= 0.4249
Vector: 104 F= 223.59 Cos= -0.000 Sum= 0.901 q= -0.0150
Vector: 105 F= 225.09 Cos= 0.023 Sum= 0.901 q= 0.7548
Vector: 106 F= 225.61 Cos= 0.008 Sum= 0.901 q= 0.2569
Projmod> Best zero-frequency found : 0.003432
Projmod> 14 frequencies less than: 0.003434
Projmod> Lowest non-zero frequency : 24.467694
Projmod> Best overlap with diff.vect. = 0.65 for mode 15 with F= 24.47 cm-1.
Projmod> 1-3-6-9-12-all-best contrb. = 0.421 0.593 0.678 0.728 0.768 0.901
Projmod> Normal end.
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2604241226251976617 7 -20 20 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-20
2604241226251976617.eigenfacs
2604241226251976617.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2604241226251976617.eigenfacs
2604241226251976617.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2604241226251976617.eigenfacs
2604241226251976617.atom
making animated gifs
3 models are in 2604241226251976617.7.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
3 models are in 2604241226251976617.7.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
3 models are in 2604241226251976617.7.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=7 DQ=-20 401 2.027 365 1.241
MODEL 2 MODE=7 DQ=0 401 1.658 377 1.303
MODEL 3 MODE=7 DQ=20 401 1.696 374 1.321
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 2604241226251976617 8 -20 20 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-20
2604241226251976617.eigenfacs
2604241226251976617.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2604241226251976617.eigenfacs
2604241226251976617.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2604241226251976617.eigenfacs
2604241226251976617.atom
making animated gifs
3 models are in 2604241226251976617.8.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
3 models are in 2604241226251976617.8.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
3 models are in 2604241226251976617.8.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=8 DQ=-20 401 1.919 370 1.291
MODEL 2 MODE=8 DQ=0 401 1.658 377 1.303
MODEL 3 MODE=8 DQ=20 401 1.896 367 1.280
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 2604241226251976617 9 -20 20 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-20
2604241226251976617.eigenfacs
2604241226251976617.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2604241226251976617.eigenfacs
2604241226251976617.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2604241226251976617.eigenfacs
2604241226251976617.atom
making animated gifs
3 models are in 2604241226251976617.9.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
3 models are in 2604241226251976617.9.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
3 models are in 2604241226251976617.9.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=9 DQ=-20 401 1.829 369 1.278
MODEL 2 MODE=9 DQ=0 401 1.658 377 1.303
MODEL 3 MODE=9 DQ=20 401 1.864 370 1.296
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 2604241226251976617 10 -20 20 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-20
2604241226251976617.eigenfacs
2604241226251976617.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2604241226251976617.eigenfacs
2604241226251976617.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2604241226251976617.eigenfacs
2604241226251976617.atom
making animated gifs
3 models are in 2604241226251976617.10.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
3 models are in 2604241226251976617.10.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
3 models are in 2604241226251976617.10.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=10 DQ=-20 401 1.895 362 1.234
MODEL 2 MODE=10 DQ=0 401 1.658 377 1.303
MODEL 3 MODE=10 DQ=20 401 1.724 375 1.340
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 2604241226251976617 11 -20 20 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-20
2604241226251976617.eigenfacs
2604241226251976617.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2604241226251976617.eigenfacs
2604241226251976617.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2604241226251976617.eigenfacs
2604241226251976617.atom
making animated gifs
3 models are in 2604241226251976617.11.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
3 models are in 2604241226251976617.11.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
3 models are in 2604241226251976617.11.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=11 DQ=-20 401 1.926 362 1.227
MODEL 2 MODE=11 DQ=0 401 1.658 377 1.303
MODEL 3 MODE=11 DQ=20 401 1.704 378 1.352
getting mode 12
running: ../../bin/get_modes.sh 2604241226251976617 12 -20 20 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 12
calculating perturbed structure for DQ=-20
2604241226251976617.eigenfacs
2604241226251976617.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2604241226251976617.eigenfacs
2604241226251976617.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2604241226251976617.eigenfacs
2604241226251976617.atom
making animated gifs
3 models are in 2604241226251976617.12.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
3 models are in 2604241226251976617.12.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
3 models are in 2604241226251976617.12.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=12 DQ=-20 401 1.928 363 1.233
MODEL 2 MODE=12 DQ=0 401 1.658 377 1.303
MODEL 3 MODE=12 DQ=20 401 1.763 376 1.329
getting mode 13
running: ../../bin/get_modes.sh 2604241226251976617 13 -20 20 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 13
calculating perturbed structure for DQ=-20
2604241226251976617.eigenfacs
2604241226251976617.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2604241226251976617.eigenfacs
2604241226251976617.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2604241226251976617.eigenfacs
2604241226251976617.atom
making animated gifs
3 models are in 2604241226251976617.13.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
3 models are in 2604241226251976617.13.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
3 models are in 2604241226251976617.13.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=13 DQ=-20 401 1.820 371 1.310
MODEL 2 MODE=13 DQ=0 401 1.658 377 1.303
MODEL 3 MODE=13 DQ=20 401 1.904 365 1.246
getting mode 14
running: ../../bin/get_modes.sh 2604241226251976617 14 -20 20 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 14
calculating perturbed structure for DQ=-20
2604241226251976617.eigenfacs
2604241226251976617.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2604241226251976617.eigenfacs
2604241226251976617.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2604241226251976617.eigenfacs
2604241226251976617.atom
making animated gifs
3 models are in 2604241226251976617.14.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
3 models are in 2604241226251976617.14.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
3 models are in 2604241226251976617.14.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=14 DQ=-20 401 1.953 366 1.271
MODEL 2 MODE=14 DQ=0 401 1.658 377 1.303
MODEL 3 MODE=14 DQ=20 401 1.808 369 1.288
getting mode 15
running: ../../bin/get_modes.sh 2604241226251976617 15 -20 20 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 15
calculating perturbed structure for DQ=-20
2604241226251976617.eigenfacs
2604241226251976617.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2604241226251976617.eigenfacs
2604241226251976617.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2604241226251976617.eigenfacs
2604241226251976617.atom
making animated gifs
3 models are in 2604241226251976617.15.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
3 models are in 2604241226251976617.15.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
3 models are in 2604241226251976617.15.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=15 DQ=-20 401 2.428 348 1.464
MODEL 2 MODE=15 DQ=0 401 1.658 377 1.303
MODEL 3 MODE=15 DQ=20 401 1.264 394 1.062
getting mode 16
running: ../../bin/get_modes.sh 2604241226251976617 16 -20 20 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 16
calculating perturbed structure for DQ=-20
2604241226251976617.eigenfacs
2604241226251976617.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2604241226251976617.eigenfacs
2604241226251976617.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2604241226251976617.eigenfacs
2604241226251976617.atom
making animated gifs
3 models are in 2604241226251976617.16.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
3 models are in 2604241226251976617.16.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
3 models are in 2604241226251976617.16.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=16 DQ=-20 401 2.226 341 1.444
MODEL 2 MODE=16 DQ=0 401 1.658 377 1.303
MODEL 3 MODE=16 DQ=20 401 1.592 379 1.151
2604241226251976617.10.pdb
2604241226251976617.11.pdb
2604241226251976617.12.pdb
2604241226251976617.13.pdb
2604241226251976617.14.pdb
2604241226251976617.15.pdb
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