***    ***
Output from eigenvector calculation:
STDOUT:
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 2604241308362010980.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 10.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 2604241308362010980.atom to be opened.
Openam> File opened: 2604241308362010980.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 238
First residue number = 1
Last residue number = 238
Number of atoms found = 238
Mean number per residue = 1.0
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 31.502311 +/- 9.641772 From: 10.769000 To: 51.051000
= 58.933408 +/- 9.697325 From: 36.383000 To: 80.091000
= 27.498916 +/- 13.258228 From: 3.670000 To: 55.185000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijf
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 7.9125 % Filled.
Pdbmat> 20197 non-zero elements.
Pdbmat> 2086 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 17.53 +/- 5.30
Maximum number = 32
Minimum number = 6
Pdbmat> Matrix trace = 41720.0
Pdbmat> Larger element = 114.595
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
using diagstd (there are 238 atoms in your structure)
Diagstd> Version 1.05, August 2004.
Diagstd> Matrix to be read from file: pdbmat.sdijf
Diagstd> Lecture de la matrice -Format CERFACS-
Diagstd> Matrix dimension (Nord) = 714
Diagstd> Number of non-zero elements 20197
Diagstd> Nb of elements found twice: 0
Diagstd> Nb of elements > 1E+10 : 0
Diagstd> Matrix trace: 41720.0000007
%Diagstd-Wn: Nb on non-zero elements there: 714
Openam> file on opening on unit 11:
pdbmat.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 714 eigenvectors are about to be computed.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 41720.0000007
Diagstd> Eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.1121512 0.2164520 0.5709004 0.6739996
0.9506974 1.1096905 1.2898317 1.6906363 1.7095712
1.9842922 2.0592222 2.2121839 2.7218922 2.7368442
2.8859150 3.0188854 3.2112456 3.6575796 3.8920899
4.1586135 4.3875213 4.6230381 4.7745518 4.9550971
5.1253088 5.3220538 5.5370326 5.6999669 5.9230245
6.0344190 6.1011559 6.4023285 6.5118749 6.6025712
6.8491096 7.3660099 7.3877948 7.5407020 7.6461796
7.6794796 7.9458894 8.1971514 8.3730868 8.8120267
8.8473357 9.0352407 9.1349414 9.3322476 9.5712428
9.7235544 9.8644156 10.0618064 10.2977834 10.4600783
10.7124022 10.8789850 10.9585777 11.1190861 11.4120313
11.5659555 11.9353642 11.9847939 12.2841981 12.5994041
12.7243864 12.9511828 13.1190461 13.2413551 13.3490801
13.4036906 13.7315848 13.8950561 14.0250200 14.1816200
14.3516753 14.6109574 14.8950561 14.9464075 15.2809017
15.4503934 15.6009937 15.6751290 15.8492462 16.1452403
16.2487115 16.3975825 16.6034045 16.7310194 16.8080033
17.2082225 17.2125879 17.2954527 17.4071018 17.6731854
17.9005257 18.2720170 18.3384801 18.5078774 18.7078795
19.0489601 19.3042529 19.4290043 19.7330588 19.8415188
19.9675066 19.9879235 20.2349550 20.5262238 20.6595161
20.8139226 20.9351933 21.4273132 21.4336541 21.6397070
21.9248740 22.0389620 22.2306128 22.3780479 22.6641894
22.7915121 22.8679987 22.9663299 23.1547048 23.3863268
23.4923151 23.7146803 23.9535072 24.0495804 24.1319888
24.3057489 24.5939137 24.7915138 24.7964629 24.8944968
25.0314852 25.2437190 25.3011170 25.4769984 25.5621121
25.8628801 26.0001887 26.2583813 26.3846136 26.5136624
26.8125319 26.9535239 27.0522182 27.1275977 27.3116368
27.4766779 27.6650531 27.8201800 27.8965844 28.1160865
28.3019122 28.3151033 28.5034288 28.7327485 28.9680309
29.0261259 29.2859516 29.3240235 29.4307206 29.5480615
29.5976689 29.7103220 29.7635509 30.0738164 30.2187376
30.2247526 30.4320785 30.5582220 30.7125610 30.8713041
31.0092473 31.1279670 31.2671028 31.3291228 31.5391529
31.6817399 31.7056963 31.8531527 31.9612830 32.2985902
32.4402286 32.4746741 32.8423394 32.9114671 32.9711636
33.1679864 33.3246274 33.4726761 33.5322368 33.6792831
33.8034699 34.0258048 34.1633341 34.2325399 34.3425419
34.6509073 34.7295386 34.8740155 35.0160376 35.3393654
35.4091810 35.5492041 35.6622420 35.8097430 36.0168590
36.2215258 36.3882002 36.4705009 36.5411457 36.7991145
36.8611777 36.9098701 37.0316285 37.1714168 37.2305871
37.4756493 37.5531589 37.6073343 37.8665363 37.9984470
38.0872797 38.2999637 38.3797373 38.5004472 38.6479700
38.8063027 38.8463627 39.0633339 39.2024995 39.3025753
39.3804063 39.4879870 39.6137006 39.6856656 39.7904342
39.9142332 39.9852964 40.0513929 40.3762652 40.4566072
40.6409306 40.6639542 40.8360734 40.8901717 41.0617716
41.1218507 41.2159345 41.3856974 41.5642437 41.6623352
41.6879480 41.7785003 42.1089505 42.1965170 42.2844594
42.4163322 42.4504399 42.5950837 42.7894930 42.8421577
42.9219774 43.0693705 43.2171469 43.4337056 43.6210801
43.6411674 43.7409071 43.9659632 44.0547398 44.1596137
44.3012511 44.5612605 44.6469591 44.8627005 44.9497323
45.0265608 45.2527177 45.3084006 45.4600928 45.5726872
45.6006970 45.7469297 45.8326383 45.9823532 46.0427254
46.1614386 46.2381563 46.3617875 46.5022988 46.6238318
46.7291188 46.8565433 46.9184559 47.0180933 47.0743881
47.1413496 47.3180579 47.4625901 47.5664294 47.6430445
47.8791546 47.9932340 48.0977388 48.2582208 48.4508619
48.5999702 48.7135184 48.7547062 48.9708281 49.0419946
49.1633744 49.2830198 49.3885610 49.4382993 49.5763292
49.6840734 49.8007666 49.9571046 50.1366025 50.2407845
50.3027245 50.5651501 50.6480563 50.7046197 50.8472462
50.8964934 51.0498872 51.1142415 51.1895349 51.2492027
51.4782341 51.5786610 51.6705968 51.9310608 52.0878577
52.2645655 52.3635277 52.5353981 52.6634170 52.7299757
52.8791401 52.9134664 53.0571605 53.1306227 53.2526436
53.4272917 53.7190079 53.7965045 53.9624959 54.0992104
54.1852786 54.4154119 54.5510990 54.6286252 54.7631940
55.0170930 55.0925621 55.1139255 55.4519326 55.5154910
55.5836079 55.8390864 55.9414962 56.1095654 56.4037777
56.4475488 56.6565050 56.8164750 56.9838562 57.1526764
57.1955794 57.3827053 57.4509639 57.6867753 57.7367510
57.8460579 57.9338973 58.0265440 58.2356035 58.2629430
58.4055222 58.5983976 58.8328982 59.0180703 59.1979204
59.2677421 59.4200353 59.5221093 59.5485027 59.7942783
59.9052800 60.0043524 60.1009570 60.1621289 60.3511153
60.5440707 60.5973682 60.7531089 60.9475408 61.2060639
61.3447856 61.4425455 61.5923871 61.6755428 61.7726149
62.0536201 62.1459245 62.2470847 62.2776103 62.3386043
62.5273229 62.6005629 62.7673098 62.8407057 63.1675151
63.2137125 63.3552099 63.5683926 63.7055457 63.7463110
63.9880257 64.2700161 64.3837030 64.4116816 64.8044397
64.9344047 65.0551487 65.2323634 65.4440796 65.5110321
65.5644043 65.5861760 65.7572849 66.0916730 66.1864729
66.3507541 66.4864675 66.8393880 66.9193125 67.1863737
67.3899057 67.4762854 67.5614995 67.8248905 67.8947926
68.0252402 68.2181620 68.4293314 68.5271740 68.6561338
68.8404960 68.8957661 69.0105404 69.1018163 69.1628524
69.3622747 69.4584625 69.6289608 69.8154900 70.1177610
70.2045746 70.4541751 70.7308367 70.9696570 71.1233472
71.2117457 71.4728208 71.6275576 71.7587082 71.9000150
72.0630782 72.2586724 72.4389249 72.8392891 72.9791547
73.0828187 73.2887744 73.3863768 73.4611526 73.6719070
74.0144311 74.0332471 74.1997225 74.4088039 74.5966629
74.7610253 74.9346853 74.9724856 75.1868093 75.6694773
75.8157167 75.9867056 76.2035698 76.2673060 76.4777231
76.7331973 76.8049983 77.0190263 77.1393049 77.1900820
77.5843426 77.6380932 77.9292526 78.0507760 78.4313726
78.5786803 78.9034074 79.1119896 79.3522375 79.4575595
79.6605294 79.7661615 80.0083309 80.0944921 80.3746007
80.9207250 80.9564557 81.1327388 81.2654696 81.4887200
81.7041191 81.8711343 81.8937830 82.2639206 82.4039511
82.6166279 82.8701286 83.0547367 83.2486813 83.5529703
83.6168068 83.7696851 83.8750959 84.5410609 84.5807073
84.8371530 84.9167494 85.0494777 85.5489992 85.7569316
85.9534804 86.1680281 86.2374542 86.5310392 86.9088140
87.2932003 87.3540430 87.6681863 88.2115535 88.4079190
88.6686382 88.8618762 89.1114876 89.1819383 89.6231212
89.7475231 90.0747963 90.3176309 90.4615072 90.6661766
90.7595405 90.9493573 91.1978085 91.4139223 91.5461047
91.9236436 92.0261560 92.2051077 92.5036756 92.9558696
93.0224344 93.2120633 93.2311913 93.4446857 93.5548727
93.8941662 94.0514864 94.2835421 94.4313625 94.7073720
95.2007589 95.4529562 95.5788654 95.8479973 96.0297541
96.0890105 96.5864680 96.6263110 96.9752303 97.4575638
97.7223213 97.9432135 98.2295145 98.3494128 98.5984629
98.8562119 98.9095192 98.9497746 99.2920687 99.7171817
99.9083055 100.3423440 100.5519174 100.6842210 100.9760499
101.1424778 101.5757758 101.7534177 101.8909865 102.2407296
102.4380138 102.9369854 103.1035451 103.3677484 103.6791281
103.8843178 103.9546022 104.1588338 104.2886066 105.1717472
105.1939623 105.4911694 106.0557030 106.1701052 106.3382722
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1014.5781104 1014.9316252 1016.7549401 1019.9009950 1021.0355517
1022.5399850 1023.6536032 1025.0903075 1025.4954409 1028.0288737
1028.7421066 1030.6161047 1032.0043996 1032.8260660 1033.9937920
1034.5260348 1035.6072868 1037.0208339 1038.2488338 1038.9992048
1041.1394324 1041.7198053 1042.7321639 1044.4190270 1046.9686782
1047.3434734 1048.4104494 1048.5180163 1049.7178547 1050.3365688
1052.2394620 1053.1206095 1054.4190056 1055.2452556 1056.7862965
1059.5354340 1060.9379188 1061.6374147 1063.1310485 1064.1385799
1064.4668496 1067.2186908 1067.4387884 1069.3643214 1072.0204147
1073.4755757 1074.6881365 1076.2577187 1076.9143545 1078.2770273
1079.6854844 1079.9765503 1080.1962988 1082.0630317 1084.3769513
1085.4156445 1087.7708122 1088.9061696 1089.6223112 1091.2002806
1092.0991638 1094.4359600 1095.3925498 1096.1327753 1098.0124142
1099.0712686 1101.7447837 1102.6357757 1104.0476267 1105.7092644
1106.8028692 1107.1772178 1108.2642770 1108.9544618 1113.6400079
1113.7576169 1115.3298707 1118.3102200 1118.9132175 1119.7990124
1123.7941678 1125.6434454 1127.0927267 1128.1326586 1129.3021845
1130.3497528 1132.9122517 1133.3466748 1136.8746453 1139.0614634
1140.5132614 1142.3055833 1142.8447415 1145.3149549 1149.1181264
1151.7546803 1152.7572594 1154.2946360 1155.3143781 1155.9498070
1161.2417581 1161.6478727 1162.9894498 1166.6778263 1168.3531770
1171.8062935 1173.0020571 1174.3722753 1178.0980453 1178.2959198
1182.9846551 1184.1626264 1189.7965755 1191.2955399 1192.5771858
1194.8470816 1200.4980136 1201.7226271 1204.6998005 1205.4606111
1207.9618386 1209.7388340 1212.0066223 1213.6424983 1218.4280153
1222.9059176 1223.2826300 1227.7728200 1230.8177162 1237.8272418
1241.7659567 1242.5132349 1246.1461425 1248.9099657 1251.1666357
1251.7939042 1257.1986489 1258.0069003 1265.7202279 1267.1529454
1271.4023506 1274.7492431 1276.8098364 1280.5081174 1284.5240271
1290.1896218 1292.5902875 1298.3007481 1300.6680060 1308.3578699
1316.7311280 1322.1596330 1332.5317305 1340.2740762 1346.6329475
1361.1043342 1374.2806365 1376.7716274 1386.3746969
Diagstd> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2604241308362010980.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2604241308362010980.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 2604241308362010980.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2604241308362010980.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 238
First residue number = 1
Last residue number = 238
Number of atoms found = 238
Mean number per residue = 1.0
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.8773E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9175E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9853E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0051E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0066E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0097E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1122
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2165
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5709
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6740
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9507
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.110
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.290
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.691
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.710
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.984
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.059
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.212
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.722
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.737
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.886
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.019
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.211
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.658
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.892
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.159
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.388
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.623
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.775
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.955
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.125
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.322
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.537
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.700
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.923
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.034
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.101
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.402
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.512
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.603
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.849
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.366
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.388
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.541
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.646
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.679
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.946
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.197
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.373
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.812
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.847
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.035
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.135
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.332
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.571
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.724
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.864
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.71
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.96
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.41
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.28
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.95
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.24
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.18
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.95
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.28
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.45
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.85
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.25
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.41
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.67
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.27
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.51
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.71
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.05
%Rdmodfacs-Wn> More than 106 vectors in file.
Bfactors> 106 vectors, 714 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.112200
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= 0.529 for 238 C-alpha atoms.
Bfactors> = 2.132 +/- 2.16
Bfactors> = 30.859 +/- 7.22
Bfactors> Shiftng-fct= 28.727
Bfactors> Scaling-fct= 3.338
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2604241308362010980.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2604241308362010980.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4127E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4196E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4313E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4426E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4451E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4504E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 36.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 50.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 82.05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 89.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 105.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 114.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 123.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 141.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 142.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 152.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 155.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 161.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 179.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 179.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 184.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 188.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 194.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 207.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 473.9
%Rdmodfacs-Err> More than 106 vectors in file.
Chkmod> 106 vectors, 714 coordinates in file.
Chkmod> That is: 238 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector 16 is: 0.9999 (instead of 1.0000).
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.9143
0.0034 0.7528
0.0034 0.6999
0.0034 0.8084
0.0034 0.7961
0.0035 0.8367
36.3725 0.7491
50.5249 0.6545
82.0459 0.6922
89.1470 0.0366
105.8762 0.6540
114.4032 0.2668
123.3308 0.6655
141.2045 0.0820
141.9955 0.2582
152.9493 0.0206
155.8134 0.3270
161.4988 0.4152
179.1516 0.3653
179.6445 0.0819
184.4696 0.4775
188.6723 0.1922
194.5794 0.3433
207.6818 0.3051
214.2215 0.4605
221.4477 0.3710
227.4626 0.4296
233.4740 0.2427
237.2812 0.4469
241.7121 0.3288
245.8236 0.4349
250.5037 0.4537
255.5135 0.5161
259.2472 0.3363
264.2698 0.0876
266.7346 0.5510
268.2113 0.4764
274.7480 0.2056
277.0983 0.4484
279.0277 0.4381
284.1778 0.5058
294.7084 0.2503
295.1482 0.3284
298.1886 0.2093
300.2574 0.3763
300.9047 0.3087
306.0913 0.2493
310.8881 0.4119
314.2080 0.4691
322.3398 0.1603
322.9793 0.4305
326.3929 0.3109
328.1942 0.3087
331.7142 0.4017
335.9350 0.3912
338.6095 0.4029
341.0383 0.4458
344.4099 0.3950
348.4940 0.4329
351.1903 0.4742
355.3623 0.4596
358.1715 0.4988
359.4859 0.3415
362.1004 0.3146
366.7917 0.4300
369.3544 0.2823
375.2138 0.3019
375.8418 0.5164
380.5185 0.3859
385.4445 0.5177
387.2757 0.4618
390.7613 0.4500
393.3178 0.1143
395.1124 0.4521
396.7503 0.4587
397.4926 0.4556
402.3573 0.4159
404.8406 0.4282
406.7293 0.2431
408.8978 0.5013
411.3416 0.4624
415.0513 0.3137
419.1503 0.3865
419.8530 0.3062
424.4615 0.4188
426.8162 0.4499
428.8831 0.3790
429.9814 0.3761
432.3060 0.3418
436.3781 0.2532
437.7270 0.3588
439.7426 0.4671
442.4159 0.2960
444.1448 0.2811
445.2055 0.5053
450.4712 0.2793
450.4712 0.4765
451.6476 0.3322
453.0812 0.4053
456.4518 0.4033
459.4129 0.4620
464.1367 0.4944
465.0250 0.4629
467.1753 0.4440
469.6924 0.2476
473.9408 0.3121
Project conformational change on normal modes:
Projmod> Version 1.36, April 2003.
Projmod> Projection of a difference vector on a set of eigenvectors.
Getnam> CERFACS file with the eigenvectors ?
Getnam> 2604241308362010980.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2604241308362010980.eigenfacs
Getnam> Pdb file with the reference structure ?
Getnam> 2604241308362010980.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2604241308362010980.atom
Getnam> Pdb file with the other conformer ?
Getnam> 2604241308362010980.atom2
Openam> file on opening on unit 12:
2604241308362010980.atom2
Getrep> Are the masses given in the pdb file ? (y/n)
Getrep> F
Projmod> All masses will all be assumed to be of 1.
Getrep> Displacement along one mode ? (y/n)
Getrep> F
Openam> file on opening on unit 13:
projmod.res
Openam> file on opening on unit 14:
dr.res
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4127E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4196E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4313E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4426E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4451E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4504E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 36.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 50.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 82.05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 89.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 105.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 114.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 123.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 141.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 142.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 152.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 155.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 161.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 179.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 179.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 184.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 188.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 194.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 207.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 214.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 221.4
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 227.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 237.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 241.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 245.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 250.5
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 266.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 268.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 274.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 277.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 279.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 284.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 294.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 295.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 298.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 300.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 300.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 306.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 310.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 314.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 322.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 323.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 326.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 328.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 331.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 335.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 338.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 341.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 344.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
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%Rdmodfacs-Err> More than 106 vectors in file.
Projmod> 106 vectors, 714 coordinates in file.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 238
First residue number = 1
Last residue number = 238
Number of atoms found = 238
Mean number per residue = 1.0
Projmod> Cartesian (eigen)vectors will be studied.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 238
First residue number = 1
Last residue number = 238
Number of atoms found = 238
Mean number per residue = 1.0
Projmod> File dr.res: displacement=f(atom number).
Projmod> 238 atoms are considered.
Projmod> Atomic r.m.s. displacements= 4.70
Projmod> Atomic average masses = 1.00 +/- 0.00
Projmod> File projmod.res: dr.vector=f(fqcy), and cumulative square sum.
Vector: 1 F= 0.00 Cos= 0.000 Sum= 0.000 q= 0.0004
Vector: 2 F= 0.00 Cos= -0.000 Sum= 0.000 q= -0.0004
Vector: 3 F= 0.00 Cos= 0.000 Sum= 0.000 q= 0.0006
Vector: 4 F= 0.00 Cos= -0.000 Sum= 0.000 q= -0.0001
Vector: 5 F= 0.00 Cos= 0.000 Sum= 0.000 q= 0.0006
Vector: 6 F= 0.00 Cos= -0.000 Sum= 0.000 q= -0.0003
Vector: 7 F= 36.37 Cos= -0.888 Sum= 0.788 q= -64.3612
Vector: 8 F= 50.52 Cos= -0.291 Sum= 0.873 q= -21.0875
Vector: 9 F= 82.05 Cos= 0.179 Sum= 0.905 q= 12.9517
Vector: 10 F= 89.15 Cos= 0.003 Sum= 0.905 q= 0.2405
Vector: 11 F= 105.88 Cos= -0.022 Sum= 0.905 q= -1.5921
Vector: 12 F= 114.40 Cos= -0.029 Sum= 0.906 q= -2.0723
Vector: 13 F= 123.33 Cos= 0.179 Sum= 0.938 q= 13.0004
Vector: 14 F= 141.20 Cos= 0.070 Sum= 0.943 q= 5.1002
Vector: 15 F= 142.00 Cos= 0.033 Sum= 0.944 q= 2.3622
%Projmod-Wn> Eigenvector 16 Norm= 0.9999
Vector: 16 F= 152.95 Cos= -0.017 Sum= 0.945 q= -1.2496
Vector: 17 F= 155.81 Cos= -0.017 Sum= 0.945 q= -1.2648
Vector: 18 F= 161.50 Cos= 0.022 Sum= 0.945 q= 1.5859
Vector: 19 F= 179.15 Cos= 0.016 Sum= 0.946 q= 1.1596
Vector: 20 F= 179.64 Cos= -0.027 Sum= 0.946 q= -1.9910
Vector: 21 F= 184.47 Cos= 0.051 Sum= 0.949 q= 3.7131
Vector: 22 F= 188.67 Cos= -0.006 Sum= 0.949 q= -0.4397
Vector: 23 F= 194.58 Cos= 0.017 Sum= 0.949 q= 1.2178
Vector: 24 F= 207.68 Cos= -0.022 Sum= 0.950 q= -1.5958
Vector: 25 F= 214.22 Cos= -0.017 Sum= 0.950 q= -1.2686
Vector: 26 F= 221.45 Cos= 0.031 Sum= 0.951 q= 2.2733
Vector: 27 F= 227.46 Cos= 0.007 Sum= 0.951 q= 0.4911
Vector: 28 F= 233.47 Cos= 0.005 Sum= 0.951 q= 0.3694
Vector: 29 F= 237.28 Cos= 0.003 Sum= 0.951 q= 0.1956
Vector: 30 F= 241.71 Cos= -0.028 Sum= 0.952 q= -2.0226
Vector: 31 F= 245.82 Cos= 0.006 Sum= 0.952 q= 0.4070
Vector: 32 F= 250.50 Cos= -0.012 Sum= 0.952 q= -0.8827
Vector: 33 F= 255.51 Cos= 0.016 Sum= 0.952 q= 1.1753
Vector: 34 F= 259.25 Cos= 0.001 Sum= 0.952 q= 0.0869
Vector: 35 F= 264.27 Cos= -0.003 Sum= 0.952 q= -0.2161
Vector: 36 F= 266.73 Cos= 0.064 Sum= 0.957 q= 4.6683
Vector: 37 F= 268.21 Cos= -0.001 Sum= 0.957 q= -0.1071
Vector: 38 F= 274.75 Cos= -0.022 Sum= 0.957 q= -1.5858
Vector: 39 F= 277.10 Cos= -0.013 Sum= 0.957 q= -0.9217
Vector: 40 F= 279.03 Cos= -0.025 Sum= 0.958 q= -1.7863
Vector: 41 F= 284.18 Cos= -0.023 Sum= 0.958 q= -1.6425
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Vector: 43 F= 295.15 Cos= 0.003 Sum= 0.959 q= 0.2003
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Vector: 45 F= 300.26 Cos= -0.004 Sum= 0.959 q= -0.3086
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Vector: 47 F= 306.09 Cos= -0.023 Sum= 0.960 q= -1.6698
Vector: 48 F= 310.89 Cos= -0.018 Sum= 0.960 q= -1.2745
Vector: 49 F= 314.21 Cos= -0.002 Sum= 0.960 q= -0.1560
Vector: 50 F= 322.34 Cos= -0.012 Sum= 0.960 q= -0.8884
Vector: 51 F= 322.98 Cos= -0.008 Sum= 0.960 q= -0.5807
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Vector: 53 F= 328.19 Cos= 0.003 Sum= 0.960 q= 0.2400
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Vector: 60 F= 351.19 Cos= -0.016 Sum= 0.962 q= -1.1866
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Vector: 64 F= 362.10 Cos= -0.022 Sum= 0.963 q= -1.6178
Vector: 65 F= 366.79 Cos= 0.011 Sum= 0.963 q= 0.7908
Vector: 66 F= 369.35 Cos= -0.014 Sum= 0.963 q= -1.0458
Vector: 67 F= 375.21 Cos= -0.001 Sum= 0.963 q= -0.0415
Vector: 68 F= 375.84 Cos= 0.022 Sum= 0.964 q= 1.6203
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Vector: 70 F= 385.44 Cos= -0.008 Sum= 0.964 q= -0.5719
Vector: 71 F= 387.28 Cos= 0.010 Sum= 0.964 q= 0.7472
Vector: 72 F= 390.76 Cos= -0.004 Sum= 0.964 q= -0.3154
Vector: 73 F= 393.32 Cos= 0.001 Sum= 0.964 q= 0.0868
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Vector: 75 F= 396.75 Cos= -0.010 Sum= 0.964 q= -0.7459
Vector: 76 F= 397.49 Cos= -0.014 Sum= 0.964 q= -1.0357
Vector: 77 F= 402.36 Cos= -0.010 Sum= 0.965 q= -0.7410
Vector: 78 F= 404.84 Cos= -0.015 Sum= 0.965 q= -1.0560
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Vector: 87 F= 428.88 Cos= -0.003 Sum= 0.967 q= -0.2169
Vector: 88 F= 429.98 Cos= 0.001 Sum= 0.967 q= 0.0720
Vector: 89 F= 432.31 Cos= -0.006 Sum= 0.967 q= -0.4432
Vector: 90 F= 436.38 Cos= 0.007 Sum= 0.967 q= 0.5216
Vector: 91 F= 437.73 Cos= 0.003 Sum= 0.967 q= 0.2136
Vector: 92 F= 439.74 Cos= 0.006 Sum= 0.967 q= 0.4372
Vector: 93 F= 442.42 Cos= -0.023 Sum= 0.968 q= -1.6668
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Vector: 99 F= 453.08 Cos= -0.005 Sum= 0.968 q= -0.3609
Vector: 100 F= 456.45 Cos= 0.015 Sum= 0.968 q= 1.0625
Vector: 101 F= 459.41 Cos= 0.015 Sum= 0.969 q= 1.1123
Vector: 102 F= 464.14 Cos= -0.003 Sum= 0.969 q= -0.2457
Vector: 103 F= 465.03 Cos= 0.010 Sum= 0.969 q= 0.7019
Vector: 104 F= 467.18 Cos= -0.010 Sum= 0.969 q= -0.7491
Vector: 105 F= 469.69 Cos= 0.002 Sum= 0.969 q= 0.1313
Vector: 106 F= 473.94 Cos= -0.007 Sum= 0.969 q= -0.5364
Projmod> Best zero-frequency found : 0.003413
Projmod> 6 frequencies less than: 0.003450
Projmod> Lowest non-zero frequency : 36.372493
Projmod> Best overlap with diff.vect. = -0.89 for mode 7 with F= 36.37 cm-1.
Projmod> 1-3-6-9-12-all-best contrb. = 0.788 0.905 0.946 0.951 0.953 0.969
Projmod> Normal end.
getting mode 7
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normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
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calculating perturbed structure for DQ=0
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calculating perturbed structure for DQ=20
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MODEL 2 will be plotted
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getting mode 14
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getting mode 15
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getting mode 16
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rm: cannot remove '2604241308362010980.sdijb': No such file or directory
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