*** ***
Output from eigenvector calculation:
STDOUT:
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 2604241311332013760.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 10.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 2604241311332013760.atom to be opened.
Openam> File opened: 2604241311332013760.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 238
First residue number = 1
Last residue number = 238
Number of atoms found = 238
Mean number per residue = 1.0
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 31.502345 +/- 9.186381 From: 11.195000 To: 49.317000
= 58.933412 +/- 8.946772 From: 38.541000 To: 77.221000
= 27.498882 +/- 12.198887 From: 4.595000 To: 53.716000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijf
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 8.0484 % Filled.
Pdbmat> 20544 non-zero elements.
Pdbmat> 2124 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 17.85 +/- 5.25
Maximum number = 31
Minimum number = 5
Pdbmat> Matrix trace = 42480.0
Pdbmat> Larger element = 118.466
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
using diagstd (there are 238 atoms in your structure)
Diagstd> Version 1.05, August 2004.
Diagstd> Matrix to be read from file: pdbmat.sdijf
Diagstd> Lecture de la matrice -Format CERFACS-
Diagstd> Matrix dimension (Nord) = 714
Diagstd> Number of non-zero elements 20544
Diagstd> Nb of elements found twice: 0
Diagstd> Nb of elements > 1E+10 : 0
Diagstd> Matrix trace: 42480.0000007
%Diagstd-Wn: Nb on non-zero elements there: 714
Openam> file on opening on unit 11:
pdbmat.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 714 eigenvectors are about to be computed.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 42480.0000007
Diagstd> Eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.4420654 0.7545045 0.8277079 1.0421062
1.0890998 1.3698899 2.0282601 2.0877222 2.1670508
2.5924234 2.6923093 3.0593602 3.3073486 3.3758860
3.4818958 3.8647839 4.0029409 4.2848629 4.4760466
4.5896815 4.9547403 4.9892677 5.2493670 5.5937771
5.7028450 5.8832812 6.0620142 6.1109323 6.3817082
6.5177179 6.7052797 7.1222570 7.2343583 7.3930165
7.8250466 7.9200315 8.1446121 8.2605765 8.3556042
8.6627259 8.9002592 9.0521646 9.2440312 9.2602167
9.5783404 9.8434393 10.0773070 10.2428639 10.4898712
10.5602298 10.8137448 11.1534768 11.2702631 11.2979346
12.0879525 12.2147455 12.4489401 12.5527940 12.6144694
12.9372535 13.0148733 13.1266172 13.2359355 13.3669512
13.6178119 13.8548448 14.0274865 14.2657167 14.4577447
14.7738230 14.9557977 15.0516045 15.1638026 15.2212862
15.3378867 15.4438277 15.6182938 15.7792280 15.9156315
16.1220846 16.4652906 16.5202110 16.5652667 16.8552427
16.8989478 17.1423460 17.4500438 17.4616710 17.5643038
17.8485174 18.1000354 18.2836443 18.4087107 18.5618893
18.6611132 19.1063544 19.2710467 19.5344363 19.7160195
20.0280869 20.1085369 20.3826760 20.4971127 20.7145977
20.8178978 21.0104786 21.2022593 21.4468639 21.5334308
21.6995699 21.9154033 22.0640520 22.1665167 22.2990096
22.3975351 22.7895532 22.9333287 23.0998641 23.2488178
23.3811560 23.4719666 23.7532980 23.7918291 23.9175752
24.1488937 24.3083015 24.4717902 24.4984740 24.7396492
24.7676344 25.0704300 25.1901844 25.6568506 25.7916019
25.8794743 25.9818801 26.2806960 26.3757889 26.5720321
26.7683797 26.9312630 27.0072321 27.2182075 27.3187851
27.5979794 27.6817865 27.9456018 28.0915967 28.2623359
28.4366000 28.5110736 28.6980093 28.8184961 28.9396126
29.0401601 29.2275682 29.3258314 29.3582139 29.5446403
29.5714389 29.7693991 30.0365153 30.1104674 30.1772187
30.3253127 30.5098028 30.6368905 30.7662155 31.0310257
31.0517500 31.1201125 31.2641069 31.4044595 31.6342381
31.7122278 31.7496683 31.8994267 32.0568530 32.2930469
32.4030417 32.4906882 32.6982469 32.7317034 32.9821799
33.2851860 33.3396805 33.5619615 33.5740257 33.7610642
33.9104364 34.0495139 34.1862343 34.2550475 34.3621897
34.5115378 34.6365814 34.7532287 34.8426425 34.9394971
35.0720541 35.3157161 35.3949165 35.5617354 35.6503659
35.7586971 35.7681676 35.9258832 36.0938614 36.1456055
36.3151844 36.3409280 36.4822385 36.6868837 36.8222953
37.0000452 37.2501010 37.2861482 37.3856539 37.6696843
37.7722510 37.8019538 37.9332146 38.0901315 38.1370004
38.3169811 38.4049921 38.6335349 38.7501556 39.0951638
39.1912918 39.4274121 39.5138449 39.5750355 39.6502123
39.8154234 40.0820088 40.1233061 40.1771813 40.3494936
40.5954881 40.6710937 40.9200355 41.1703776 41.2010080
41.2742618 41.4600392 41.6695962 41.8166649 41.9205094
42.1120504 42.1835978 42.2996296 42.3740935 42.4972724
42.5288983 42.7179844 42.8203919 42.9075264 42.9497455
43.1479529 43.2813525 43.5176131 43.6386599 43.6948594
43.7400859 43.9204770 43.9987725 44.0154377 44.1545484
44.2601748 44.3715810 44.5249802 44.7120323 44.8288855
44.9509080 45.0912948 45.1854597 45.2832933 45.3330112
45.3719905 45.6554671 45.6739060 45.8145406 45.9003359
46.1221413 46.2413087 46.3978020 46.4195427 46.5887221
46.6737819 46.8443363 46.9257464 47.0837163 47.2310492
47.3871820 47.6390336 47.8509978 47.8969223 48.0398263
48.0815188 48.2334853 48.2715264 48.4992048 48.5526204
48.6644397 48.9422397 48.9525631 49.0548185 49.1967249
49.4017732 49.5660965 49.6490498 49.7497447 49.7763244
49.9602410 50.0791146 50.2378084 50.4286116 50.5685286
50.7957214 50.9113468 51.0143694 51.1393297 51.4044558
51.5914793 51.7375426 51.8546421 51.8951466 52.1046067
52.2718513 52.2890319 52.4292597 52.5046461 52.6412064
52.8934304 52.9847956 53.0719013 53.1945195 53.3906302
53.5048566 53.5569990 53.6408911 53.8233467 53.9396747
53.9730688 54.1073283 54.4159462 54.5162790 54.6336922
54.7760298 54.8762413 54.9787343 55.1092230 55.2312901
55.3218616 55.4922663 55.5664008 55.7321488 55.8889352
56.0453356 56.1662936 56.3261458 56.3733578 56.5800185
56.6060247 56.7977487 56.9808964 57.1485068 57.2544191
57.4361724 57.6307585 57.6483801 57.8172451 57.8508035
58.1884633 58.2249587 58.4413827 58.6390871 58.6451648
58.8828793 58.9521023 59.0594363 59.2358716 59.4606501
59.4906585 59.8071302 59.8622539 60.0342693 60.0896077
60.1829973 60.3771820 60.6934631 60.7560044 60.8482820
61.0160137 61.1566522 61.2452510 61.4704001 61.6267929
61.6676954 61.7671873 62.0131086 62.2581180 62.3017724
62.4586030 62.5402339 62.8154392 62.9450103 63.0911129
63.2095563 63.4928190 63.6138348 63.7614487 63.8584616
64.1279906 64.3414720 64.4572311 64.4756720 64.8436712
65.0523125 65.2279974 65.3018331 65.4302141 65.5169884
65.6755402 65.7461353 65.9164643 66.2012650 66.3616808
66.5528172 66.7165539 67.0049187 67.0973545 67.1229058
67.1597761 67.3737120 67.5657320 67.7801564 67.7882046
67.9973669 68.2901488 68.3350692 68.4929780 68.6391687
68.8379597 68.9417300 69.0756569 69.3278088 69.4450947
69.5542463 69.6645982 69.9202744 69.9961562 70.2428336
70.6119609 70.8118867 70.8895341 71.0677610 71.1130111
71.3964676 71.4958164 71.7043802 71.8249495 71.9449335
72.1733858 72.3386623 72.5769646 72.8125284 72.8897408
73.2184643 73.2625544 73.5547697 73.7460398 73.8516694
74.0280889 74.2809276 74.3519752 74.5204314 74.6212775
74.8022227 75.0278735 75.3113419 75.4511653 75.8180933
75.9590833 76.0484317 76.2993798 76.3333753 76.5920132
76.7162171 77.0098886 77.0814953 77.1013775 77.2332555
77.4167941 77.7370296 77.7778882 78.0449868 78.0870589
78.3087734 78.5395038 78.7635950 78.9543302 79.0316638
79.3532201 79.4624476 79.6560868 80.0809128 80.2593371
80.3439572 80.4562605 80.6613418 80.7933331 81.1590321
81.2269761 81.6046137 81.8848820 82.0133663 82.1897912
82.3624621 82.5110273 82.7433903 82.9229508 83.0989344
83.5024631 83.6072799 83.9395876 84.2864063 84.3826734
84.4822348 84.7030038 84.8600964 85.0672684 85.1942418
85.5536626 85.6451949 85.9674470 86.0113903 86.2565266
86.7046916 86.8690711 87.2964051 87.4217936 87.7070819
87.7343892 88.1252921 88.2059420 88.4344251 88.7306729
89.0136440 89.1553841 89.4859029 89.6561984 90.0008498
90.3309098 90.4876545 90.5795746 90.8331169 91.0507975
91.2776071 91.5571939 91.6887026 91.9198485 92.0378550
92.3905420 92.5058588 92.6754949 92.7252771 92.9074306
93.0524566 93.3873989 93.5961257 93.9522946 94.0368644
94.1983039 94.3998914 94.8010335 94.8851255 95.3777083
95.4501475 95.5597246 95.8000660 95.9973817 96.3081740
96.6337525 96.7273953 96.9018974 97.0470979 97.2359929
97.3782556 97.9818470 98.2173114 98.3687003 98.5057734
98.8405972 99.3542004 99.5033387 99.5597766 99.6962197
99.9362797 100.3153245 100.3963276 100.5072960 100.5970761
101.1126698 101.3594476 101.7571423 101.8644603 102.0951375
102.1719489 102.4711991 102.9245054 103.0879149 103.3082721
103.6595227 104.0417274 104.0906518 104.4128192 104.6076934
105.1495943 105.5439670 105.7301231 105.9586847 106.4389636
106.8170600 107.0827757 107.3657597 107.4083361 107.8906367
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1032.0802620 1032.9753209 1033.4998517 1034.9452816 1036.1846571
1037.4744338 1039.0621310 1039.8080948 1041.1179403 1041.7860184
1043.7801604 1044.4313518 1045.3885454 1045.6692821 1046.6958567
1047.5124702 1049.3960370 1050.5681164 1052.5651244 1053.0387432
1053.9422674 1055.0694004 1057.3087256 1057.7775574 1060.5196550
1060.9223098 1061.5311064 1062.8651918 1063.9592001 1065.6800967
1067.4798907 1067.9969855 1068.9599173 1069.7604967 1070.8010954
1071.5841359 1074.9000702 1076.1908644 1077.0199473 1077.7700798
1079.6002108 1082.4015279 1083.2136072 1083.5207604 1084.2629698
1085.5675913 1087.6243482 1088.0633797 1088.6645338 1089.1506609
1091.9382242 1093.2699165 1095.4125979 1095.9900834 1097.2303439
1097.6430174 1099.2492787 1101.6779942 1102.5521945 1103.7299543
1105.6047162 1107.6410873 1107.9014847 1109.6146737 1110.6496734
1113.5227159 1115.6089433 1116.5923528 1117.7985955 1120.3290540
1122.3171272 1123.7121855 1125.1960036 1125.4190826 1127.9430127
1128.3624083 1129.1693462 1131.7386391 1132.8658825 1134.9386727
1138.4515492 1140.5031454 1141.7810465 1143.1602842 1144.8948421
1146.3514635 1147.4130969 1150.7090424 1152.4772552 1155.1663707
1158.5726124 1159.0205911 1161.3954556 1163.4800653 1164.6962050
1168.6588045 1170.2532586 1172.1718226 1174.5018009 1174.5581217
1177.5262528 1180.8346830 1181.6087204 1183.9944992 1187.1019030
1190.4262934 1192.4922488 1194.1844881 1195.7158224 1196.8788792
1198.9068761 1201.7226334 1202.2471746 1206.1903901 1208.5911570
1212.2373343 1213.6080909 1214.8859039 1218.7735487 1219.7802057
1222.5556422 1224.1468906 1226.4196098 1234.8360368 1237.2345287
1240.7525144 1242.2924830 1246.0522596 1253.1691056 1256.3707933
1257.7857968 1261.0002354 1262.0554768 1268.2791641 1272.5945972
1275.8015191 1276.4213457 1279.2563827 1287.3310037 1291.4503823
1298.7191611 1302.6668740 1305.9809172 1314.6997219 1318.5617246
1326.3939795 1327.9611889 1339.1450822 1343.9131773 1349.6376703
1356.1099004 1362.0401293 1374.2761898 1396.8748548
Diagstd> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2604241311332013760.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2604241311332013760.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 2604241311332013760.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2604241311332013760.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 238
First residue number = 1
Last residue number = 238
Number of atoms found = 238
Mean number per residue = 1.0
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9018E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9499E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9723E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9932E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0054E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0126E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4421
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7545
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8277
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.042
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.089
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.370
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.028
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.088
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.167
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.592
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.692
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.059
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.307
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.376
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.482
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.865
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.003
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.285
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.476
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.590
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.955
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.989
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.249
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.594
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.703
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.883
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.062
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.111
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.382
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.518
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.705
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.122
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.234
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.393
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.825
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.920
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.145
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.261
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.356
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.663
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.900
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.052
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.244
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.260
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.578
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.843
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.08
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.24
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.49
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.27
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.45
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.24
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.85
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.27
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.96
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.16
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.44
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.47
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.86
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.45
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.85
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.28
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.41
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.11
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.27
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.03
%Rdmodfacs-Wn> More than 106 vectors in file.
Bfactors> 106 vectors, 714 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.442100
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= 0.533 for 238 C-alpha atoms.
Bfactors> = 1.266 +/- 2.77
Bfactors> = 20.283 +/- 8.39
Bfactors> Shiftng-fct= 19.017
Bfactors> Scaling-fct= 3.025
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2604241311332013760.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2604241311332013760.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4169E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4252E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4291E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4326E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4431E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4554E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 72.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 94.32
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 98.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 110.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 113.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 127.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 154.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 156.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 159.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 174.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 178.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 189.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 197.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 199.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 202.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 213.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 217.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 224.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 229.7
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 486.0
%Rdmodfacs-Err> More than 106 vectors in file.
Chkmod> 106 vectors, 714 coordinates in file.
Chkmod> That is: 238 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector 24 is: 0.9999 (instead of 1.0000).
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.6837
0.0034 0.6885
0.0034 0.9449
0.0034 0.8632
0.0034 0.7453
0.0035 0.6656
72.1999 0.0059
94.3205 0.0705
98.7900 0.5881
110.8436 0.4909
113.3158 0.5837
127.0975 0.0971
154.6360 0.3027
156.9068 0.3413
159.8476 0.0629
174.8212 0.1038
178.1616 0.5614
189.9181 0.3975
197.4666 0.1024
199.5161 0.6128
202.6241 0.6761
213.4771 0.3276
217.2548 0.5310
224.7771 0.2663
229.7321 0.4836
232.6392 0.3633
241.7121 0.5166
242.5400 0.5566
248.7797 0.0939
256.8253 0.2995
259.3154 0.1761
263.3759 0.5483
267.3527 0.3701
268.4311 0.3331
274.3185 0.5183
277.2259 0.6110
281.1746 0.3269
289.7861 0.4280
292.0558 0.2118
295.2480 0.3706
303.7518 0.4138
305.5901 0.4970
309.9004 0.4954
312.0994 0.5212
313.8888 0.3592
319.6030 0.3762
323.9453 0.4167
326.6998 0.4873
330.1464 0.3767
330.4320 0.3605
336.0579 0.4685
340.6751 0.3538
344.7521 0.4291
347.4774 0.3049
351.6935 0.2965
352.8650 0.4016
357.0175 0.5728
362.5885 0.4680
364.5345 0.5434
365.0193 0.4534
377.5633 0.5017
379.4324 0.5066
383.1434 0.5219
384.6790 0.5215
385.5975 0.5312
390.6104 0.3637
391.6655 0.2015
393.4676 0.4280
395.1124 0.4614
397.0474 0.5038
400.7423 0.3425
404.1118 0.3752
406.7293 0.3053
410.1934 0.4484
412.9151 0.4112
417.3178 0.4725
419.9934 0.4099
421.2548 0.2798
422.7915 0.4505
423.6273 0.4676
425.2941 0.2999
426.6780 0.4205
429.1579 0.4703
431.3503 0.4642
433.2596 0.4722
435.9726 0.3717
440.6801 0.4972
441.3485 0.3334
442.0159 0.1067
445.8671 0.5057
446.3957 0.4822
449.5542 0.4362
453.6014 0.4876
453.7313 0.3321
455.0288 0.4059
458.7708 0.4109
461.9723 0.3602
464.2637 0.5138
465.9116 0.4553
467.8058 0.3812
469.0644 0.4280
474.6866 0.5180
476.6696 0.4874
479.8746 0.4233
482.2032 0.4182
485.9786 0.5117
Project conformational change on normal modes:
Projmod> Version 1.36, April 2003.
Projmod> Projection of a difference vector on a set of eigenvectors.
Getnam> CERFACS file with the eigenvectors ?
Getnam> 2604241311332013760.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2604241311332013760.eigenfacs
Getnam> Pdb file with the reference structure ?
Getnam> 2604241311332013760.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2604241311332013760.atom
Getnam> Pdb file with the other conformer ?
Getnam> 2604241311332013760.atom2
Openam> file on opening on unit 12:
2604241311332013760.atom2
Getrep> Are the masses given in the pdb file ? (y/n)
Getrep> F
Projmod> All masses will all be assumed to be of 1.
Getrep> Displacement along one mode ? (y/n)
Getrep> F
Openam> file on opening on unit 13:
projmod.res
Openam> file on opening on unit 14:
dr.res
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4169E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4252E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4291E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4326E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4431E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4554E-03
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 94.32
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 98.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 110.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 113.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 127.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 178.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 199.5
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 241.7
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 248.8
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 277.2
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 281.2
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 289.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 292.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 295.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 303.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 313.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 319.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 323.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 326.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 330.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 330.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 336.1
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 340.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 344.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 347.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 351.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 352.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 357.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 362.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 364.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
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%Rdmodfacs-Err> More than 106 vectors in file.
Projmod> 106 vectors, 714 coordinates in file.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 238
First residue number = 1
Last residue number = 238
Number of atoms found = 238
Mean number per residue = 1.0
Projmod> Cartesian (eigen)vectors will be studied.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 238
First residue number = 1
Last residue number = 238
Number of atoms found = 238
Mean number per residue = 1.0
Projmod> File dr.res: displacement=f(atom number).
Projmod> 238 atoms are considered.
Projmod> Atomic r.m.s. displacements= 4.70
Projmod> Atomic average masses = 1.00 +/- 0.00
Projmod> File projmod.res: dr.vector=f(fqcy), and cumulative square sum.
Vector: 1 F= 0.00 Cos= -0.000 Sum= 0.000 q= -0.0006
Vector: 2 F= 0.00 Cos= 0.000 Sum= 0.000 q= 0.0004
Vector: 3 F= 0.00 Cos= 0.000 Sum= 0.000 q= 0.0002
Vector: 4 F= 0.00 Cos= -0.000 Sum= 0.000 q= -0.0002
Vector: 5 F= 0.00 Cos= -0.000 Sum= 0.000 q= -0.0007
Vector: 6 F= 0.00 Cos= -0.000 Sum= 0.000 q= -0.0008
Vector: 7 F= 72.20 Cos= 0.084 Sum= 0.007 q= 6.0842
Vector: 8 F= 94.32 Cos= 0.059 Sum= 0.011 q= 4.2649
Vector: 9 F= 98.79 Cos= -0.508 Sum= 0.269 q= -36.8401
Vector: 10 F= 110.84 Cos= 0.495 Sum= 0.513 q= 35.8475
Vector: 11 F= 113.32 Cos= -0.191 Sum= 0.550 q= -13.8626
Vector: 12 F= 127.10 Cos= -0.008 Sum= 0.550 q= -0.5508
Vector: 13 F= 154.64 Cos= 0.138 Sum= 0.569 q= 9.9860
Vector: 14 F= 156.91 Cos= 0.112 Sum= 0.582 q= 8.1454
Vector: 15 F= 159.85 Cos= 0.119 Sum= 0.596 q= 8.6291
Vector: 16 F= 174.82 Cos= -0.015 Sum= 0.596 q= -1.0668
Vector: 17 F= 178.16 Cos= 0.315 Sum= 0.695 q= 22.8456
Vector: 18 F= 189.92 Cos= -0.107 Sum= 0.707 q= -7.7513
Vector: 19 F= 197.47 Cos= -0.035 Sum= 0.708 q= -2.5402
Vector: 20 F= 199.52 Cos= 0.203 Sum= 0.749 q= 14.6876
Vector: 21 F= 202.62 Cos= 0.104 Sum= 0.760 q= 7.5142
Vector: 22 F= 213.48 Cos= 0.032 Sum= 0.761 q= 2.3480
Vector: 23 F= 217.25 Cos= 0.016 Sum= 0.761 q= 1.1613
%Projmod-Wn> Eigenvector 24 Norm= 0.9999
Vector: 24 F= 224.78 Cos= 0.035 Sum= 0.762 q= 2.5251
Vector: 25 F= 229.73 Cos= -0.052 Sum= 0.765 q= -3.7575
Vector: 26 F= 232.64 Cos= -0.013 Sum= 0.765 q= -0.9127
Vector: 27 F= 241.71 Cos= -0.019 Sum= 0.765 q= -1.3790
Vector: 28 F= 242.54 Cos= -0.176 Sum= 0.796 q= -12.7482
Vector: 29 F= 248.78 Cos= 0.027 Sum= 0.797 q= 1.9297
Vector: 30 F= 256.83 Cos= 0.065 Sum= 0.801 q= 4.7454
Vector: 31 F= 259.32 Cos= -0.036 Sum= 0.803 q= -2.6251
Vector: 32 F= 263.38 Cos= -0.066 Sum= 0.807 q= -4.7941
Vector: 33 F= 267.35 Cos= -0.018 Sum= 0.807 q= -1.3123
Vector: 34 F= 268.43 Cos= -0.028 Sum= 0.808 q= -2.0495
Vector: 35 F= 274.32 Cos= -0.003 Sum= 0.808 q= -0.2402
Vector: 36 F= 277.23 Cos= 0.096 Sum= 0.817 q= 6.9777
Vector: 37 F= 281.17 Cos= -0.048 Sum= 0.820 q= -3.5151
Vector: 38 F= 289.79 Cos= 0.027 Sum= 0.821 q= 1.9385
Vector: 39 F= 292.06 Cos= -0.055 Sum= 0.824 q= -4.0158
Vector: 40 F= 295.25 Cos= 0.058 Sum= 0.827 q= 4.2065
Vector: 41 F= 303.75 Cos= -0.019 Sum= 0.827 q= -1.3696
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Vector: 43 F= 309.90 Cos= -0.003 Sum= 0.828 q= -0.2143
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Vector: 47 F= 323.95 Cos= 0.000 Sum= 0.830 q= 0.0160
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Vector: 50 F= 330.43 Cos= -0.012 Sum= 0.830 q= -0.8441
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Vector: 54 F= 347.48 Cos= -0.035 Sum= 0.832 q= -2.5426
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Vector: 59 F= 364.53 Cos= -0.056 Sum= 0.837 q= -4.0425
Vector: 60 F= 365.02 Cos= 0.009 Sum= 0.837 q= 0.6228
Vector: 61 F= 377.56 Cos= 0.013 Sum= 0.837 q= 0.9762
Vector: 62 F= 379.43 Cos= -0.008 Sum= 0.837 q= -0.5749
Vector: 63 F= 383.14 Cos= -0.002 Sum= 0.837 q= -0.1458
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Vector: 65 F= 385.60 Cos= 0.008 Sum= 0.837 q= 0.5549
Vector: 66 F= 390.61 Cos= 0.003 Sum= 0.837 q= 0.2455
Vector: 67 F= 391.67 Cos= 0.001 Sum= 0.837 q= 0.1031
Vector: 68 F= 393.47 Cos= -0.033 Sum= 0.838 q= -2.3799
Vector: 69 F= 395.11 Cos= 0.047 Sum= 0.840 q= 3.4088
Vector: 70 F= 397.05 Cos= 0.025 Sum= 0.841 q= 1.7924
Vector: 71 F= 400.74 Cos= 0.014 Sum= 0.841 q= 1.0030
Vector: 72 F= 404.11 Cos= 0.001 Sum= 0.841 q= 0.0422
Vector: 73 F= 406.73 Cos= -0.027 Sum= 0.842 q= -1.9370
Vector: 74 F= 410.19 Cos= -0.021 Sum= 0.842 q= -1.5478
Vector: 75 F= 412.92 Cos= 0.002 Sum= 0.842 q= 0.1732
Vector: 76 F= 417.32 Cos= 0.013 Sum= 0.843 q= 0.9738
Vector: 77 F= 419.99 Cos= -0.031 Sum= 0.843 q= -2.2636
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Vector: 86 F= 435.97 Cos= -0.005 Sum= 0.848 q= -0.3606
Vector: 87 F= 440.68 Cos= -0.057 Sum= 0.851 q= -4.1084
Vector: 88 F= 441.35 Cos= -0.012 Sum= 0.851 q= -0.8844
Vector: 89 F= 442.02 Cos= 0.041 Sum= 0.853 q= 2.9522
Vector: 90 F= 445.87 Cos= 0.026 Sum= 0.853 q= 1.8894
Vector: 91 F= 446.40 Cos= -0.026 Sum= 0.854 q= -1.9119
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Vector: 100 F= 467.81 Cos= -0.017 Sum= 0.863 q= -1.2535
Vector: 101 F= 469.06 Cos= -0.049 Sum= 0.865 q= -3.5198
Vector: 102 F= 474.69 Cos= 0.016 Sum= 0.865 q= 1.1360
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Vector: 105 F= 482.20 Cos= -0.021 Sum= 0.866 q= -1.5197
Vector: 106 F= 485.98 Cos= -0.023 Sum= 0.866 q= -1.6587
Projmod> Best zero-frequency found : 0.003417
Projmod> 6 frequencies less than: 0.003455
Projmod> Lowest non-zero frequency : 72.199950
Projmod> Best overlap with diff.vect. = -0.51 for mode 9 with F= 98.79 cm-1.
Projmod> 1-3-6-9-12-all-best contrb. = 0.258 0.602 0.711 0.756 0.788 0.866
Projmod> Normal end.
getting mode 7
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normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
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calculating perturbed structure for DQ=0
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calculating perturbed structure for DQ=20
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MODEL 2 will be plotted
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getting mode 10
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getting mode 11
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getting mode 13
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getting mode 14
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getting mode 15
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getting mode 16
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user 0m5.542s
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