***  test_cutoff10_hıv  ***
Output from eigenvector calculation:
STDOUT:
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 2604251125092265882.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 10.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 2604251125092265882.atom to be opened.
Openam> File opened: 2604251125092265882.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 99
First residue number = 1
Last residue number = 99
Number of atoms found = 99
Mean number per residue = 1.0
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 15.029354 +/- 8.158668 From: -0.586000 To: 30.495000
= 32.184030 +/- 6.974105 From: 13.203000 To: 43.904000
= 12.970616 +/- 7.571457 From: -7.792000 To: 27.911000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijf
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 16.2701 % Filled.
Pdbmat> 7200 non-zero elements.
Pdbmat> 734 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 14.83 +/- 5.35
Maximum number = 26
Minimum number = 3
Pdbmat> Matrix trace = 14680.0
Pdbmat> Larger element = 116.139
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
using diagstd (there are 99 atoms in your structure)
Diagstd> Version 1.05, August 2004.
Diagstd> Matrix to be read from file: pdbmat.sdijf
Diagstd> Lecture de la matrice -Format CERFACS-
Diagstd> Matrix dimension (Nord) = 297
Diagstd> Number of non-zero elements 7200
Diagstd> Nb of elements found twice: 0
Diagstd> Nb of elements > 1E+10 : 0
Diagstd> Matrix trace: 14680.0000003
%Diagstd-Wn: Nb on non-zero elements there: 297
Openam> file on opening on unit 11:
pdbmat.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 297 eigenvectors are about to be computed.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 14680.0000003
Diagstd> Eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.0192085 0.2616382 0.2872459 0.3532312
0.4765924 0.6502224 1.0305906 1.2835264 1.6633178
1.8199306 1.8994634 2.3443167 2.9881515 3.2797678
3.3299861 3.7021999 3.8625665 4.0322718 4.1664563
4.5655502 4.7126581 5.3253752 5.5005495 5.7438622
6.2299634 6.3181236 6.7879644 6.8604608 7.1499847
7.3839168 7.8320580 7.9098790 8.5811031 9.0459446
9.4613940 9.6220788 9.7722667 10.0050499 10.4882963
11.0202460 11.2580532 11.4802420 11.6662358 11.7538319
12.5244411 12.6570242 12.9470359 13.4631598 13.5938115
13.9140920 14.4726156 15.0092872 15.3230324 15.6870898
15.8473243 16.6235064 16.8282614 17.4071563 17.8743970
18.3014423 19.0532953 19.2930243 19.7826865 20.4204286
20.6907919 20.8567626 21.4243487 21.5481003 21.7693953
22.0077124 22.1984726 22.4011289 22.7447678 23.0244329
23.1488933 23.6432558 23.9934538 24.2349702 24.4381828
24.9247334 25.2312277 25.6518713 25.9280073 26.1741789
26.5613105 26.7645679 27.0262233 27.3345641 27.7599631
28.0618504 28.1793557 28.6653809 28.9097460 29.0686629
29.5315947 29.6445396 29.9375347 30.4898384 30.6826928
31.1110614 31.3934564 31.6600018 32.5347128 32.7803754
32.8407184 32.8874527 33.0523881 33.1387145 33.6538588
33.8551702 34.3776843 34.7178849 34.8491666 35.2234939
35.2976440 35.5176034 35.8690864 35.9872291 36.3049111
36.5637444 36.8977289 37.5620407 37.6199385 37.8031171
38.0252867 38.2791605 38.7198811 38.9636396 39.1910633
39.6313331 40.0394758 40.1907298 40.4132130 40.8013240
41.3974656 41.4617959 41.8077838 41.9530103 42.1570369
42.5465544 42.6446317 42.7763430 43.2082031 43.3303823
43.7921028 43.9846387 44.4832939 44.7861959 45.2556824
45.4356938 45.5665191 45.7479923 46.1896052 46.4753283
47.0667360 47.5378480 48.0403381 48.2515486 48.5050887
48.7418158 49.8979893 50.0494528 50.1315852 50.5314361
51.2812078 51.6282441 52.1546368 52.5679935 52.8134229
52.8834487 53.2699756 53.6221422 54.2431239 54.6971129
55.5767125 55.8102267 56.2936199 56.7325250 57.0160626
57.1382547 57.5567632 58.0767649 58.3998798 58.9759080
59.1495421 59.4336711 60.0149761 60.5465639 61.2287141
61.3549023 61.7482436 62.5892318 62.6697494 63.0248530
63.9302481 64.6366436 64.7684596 64.9038712 65.3765752
65.7532674 65.8736765 66.0787390 66.6498348 67.2030695
67.6481649 67.8227306 68.1825689 68.3411117 69.1422217
69.8149603 70.2085155 70.3335032 70.7366503 70.8975100
71.1509075 71.5884132 72.7015440 72.9101978 73.3322593
73.6188971 74.0309826 74.7758974 75.0176794 75.7311677
76.7348285 77.1072279 77.7027814 78.1979040 78.8676483
79.5279434 79.8590769 80.2887122 80.4529145 81.5805624
81.8496436 82.3322292 82.7603366 84.2058269 84.5938761
85.0665810 85.5863705 85.8833706 86.9222754 87.1654737
87.6647556 88.1795976 88.9703069 89.7883355 90.1886423
90.9694579 92.0871804 92.2060479 92.7578968 94.2077338
94.6403683 95.3869633 96.1556170 96.4155416 97.7584314
98.6488771 99.3039322 99.6679421 100.6745560 101.7272377
102.4119664 103.5442806 104.1154052 105.7373665 106.2602498
108.1267359 108.8053439 109.5990677 112.4136714 114.5365950
114.6716440 115.5583442 117.4116734 117.8178003 119.4495410
121.4342268 124.9463414 125.7751093 127.6914089 129.6803549
131.1326378 133.5260684 136.0122373 141.6205370 142.6803549
148.9083430 155.2791641
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the matrix is a hessien in CHARMM units):
0.0034137 0.0034247 0.0034295 0.0034382 0.0034424
0.0034477 15.0501973 55.5451154 58.1998941 64.5393789
74.9667782 87.5641295 110.2397868 123.0262192 140.0499323
146.4949630 149.6617249 166.2659899 187.7139673 196.6603611
198.1602261 208.9417425 213.4190901 218.0570747 221.6555940
232.0287707 235.7372694 250.5938369 254.6820395 260.2539236
271.0428943 272.9539217 282.9209176 284.4277216 290.3673867
295.0792544 303.9017680 305.4078531 318.1023228 326.6045580
334.0202869 336.8447132 339.4633841 343.4827337 351.6800670
360.4880933 364.3568415 367.9347451 370.9032639 372.2931264
384.3036043 386.3323591 390.7333274 398.4453667 400.3740324
405.0631316 413.1129353 420.7027140 425.0770329 430.0970571
432.2880723 442.7479894 445.4663518 453.0636240 459.1038979
464.5558554 474.0021699 476.9748010 482.9897499 490.7131617
493.9509632 495.9281141 502.6307962 504.0803574 506.6621519
509.4279057 511.6309720 513.9610801 517.8882219 521.0624194
522.4688432 528.0182342 531.9142984 534.5847005 536.8212939
542.1388636 545.4619642 549.9900168 552.9423451 555.5610802
559.6545384 561.7918037 564.5312150 567.7424354 572.1431763
575.2457685 576.4488936 581.3988098 583.8716903 585.4742619
590.1178213 591.2452095 594.1598447 599.6154870 601.5088427
605.6931949 608.4359225 611.0134183 619.3965310 621.7305982
622.3025841 622.7452142 624.3048404 625.1195896 629.9596233
631.8409672 636.6981527 639.8407704 641.0493709 644.4830450
645.1610491 647.1681075 650.3624193 651.4325944 654.3015801
656.6298357 659.6219483 665.5334213 666.0461480 667.6657309
669.6247987 671.8564374 675.7130207 677.8366374 679.8119638
683.6197806 687.1308883 688.4275255 690.3303548 693.6372512
698.6861870 699.2288435 702.1402241 703.3586689 705.0668881
708.3166944 709.1326211 710.2268835 713.8030234 714.8115160
718.6098733 720.1878574 724.2587478 726.7204277 730.5195438
731.9709786 733.0240216 734.4822416 738.0187667 740.2978936
744.9932212 748.7124226 752.6590844 754.3118118 756.2909989
758.1342770 767.0731882 768.2365172 768.8666068 771.9267671
777.6325003 780.2593068 784.2269139 787.3285149 789.1643133
789.6873206 792.5679916 795.1835005 799.7746357 803.1145278
809.5463279 811.2452621 814.7509367 817.9209589 819.9623127
820.8404801 823.8411138 827.5542789 829.8531691 833.9357618
835.1624768 837.1659551 841.2500425 844.9675508 849.7141486
850.5892994 853.3114726 859.1027134 859.6551305 862.0872082
868.2573633 873.0410781 873.9308383 874.8439258 878.0239517
880.5498541 881.3557284 882.7264779 886.5328217 890.2046021
893.1477124 894.2993515 896.6685974 897.7104893 902.9567430
907.3388942 909.8926892 910.7022403 913.3085543 914.3464255
915.9789684 918.7908223 925.9064242 927.2341505 929.9140575
931.7296878 934.3337512 939.0227134 940.5396162 945.0017375
951.2431526 953.5485832 957.2239644 960.2688401 964.3722961
968.4008373 970.4148265 973.0217008 974.0161796 980.8184526
982.4346619 985.3266230 987.8850301 996.4748749 998.7682838
1001.5549215 1004.6102041 1006.3517832 1012.4202511 1013.8355781
1016.7350455 1019.7162418 1024.2779522 1028.9759890 1031.2671993
1035.7217193 1042.0651408 1042.7374807 1045.8531928 1053.9950195
1056.4124023 1060.5711077 1064.8357166 1066.2739590 1073.6738911
1078.5526579 1082.1276727 1084.1091896 1089.5700119 1095.2516251
1098.9315266 1104.9899747 1108.0332093 1116.6306001 1119.3881280
1129.1764882 1132.7143259 1136.8383358 1151.3433220 1162.1639894
1162.8489358 1167.3361514 1176.6598082 1178.6930840 1186.8272869
1196.6463933 1213.8277231 1217.8467232 1227.0891603 1236.6089215
1243.5139995 1254.8109825 1266.4389891 1292.2852837 1297.1116822
1325.1187397 1353.1684784
Diagstd> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2604251125092265882.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2604251125092265882.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 2604251125092265882.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2604251125092265882.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 99
First residue number = 1
Last residue number = 99
Number of atoms found = 99
Mean number per residue = 1.0
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.8824E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9461E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9742E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0025E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0049E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0080E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.9209E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2616
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2872
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3532
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4766
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6502
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.031
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.284
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.663
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.820
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.899
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.344
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.988
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.280
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.330
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.702
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.863
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.032
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.166
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.566
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.713
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.325
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.501
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.744
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.230
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.318
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.788
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.860
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.150
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.384
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.832
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.910
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.581
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.046
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.461
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.622
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.772
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.49
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.67
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.75
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.95
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.47
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.32
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.69
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.85
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.83
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.41
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.87
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.29
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.69
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.86
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.99
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.44
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.65
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.76
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.76
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.18
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.67
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.49
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.11
%Rdmodfacs-Wn> More than 106 vectors in file.
Bfactors> 106 vectors, 297 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.019209
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= 0.033 for 99 C-alpha atoms.
Bfactors> = 12.175 +/- 79.31
Bfactors> = 31.076 +/- 10.13
Bfactors> Shiftng-fct= 18.901
Bfactors> Scaling-fct= 0.128
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2604251125092265882.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2604251125092265882.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4136E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4245E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4294E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4381E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4422E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4475E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 15.05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 55.54
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 58.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 64.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 74.96
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 87.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 110.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 123.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 140.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 146.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 149.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 166.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 187.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 196.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 198.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 208.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 213.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 218.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 221.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 232.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 235.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 250.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 254.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 260.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 271.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 272.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 282.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 284.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 290.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 295.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 303.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 305.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 318.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 326.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 334.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 336.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 339.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 343.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 351.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 360.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 364.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 367.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 370.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 372.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 384.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 386.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 390.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 398.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 400.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 405.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 413.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 420.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 425.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 430.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 432.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 442.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 445.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 453.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 459.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 464.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 473.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 476.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 482.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 490.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 493.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 495.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 502.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 504.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 506.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 509.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 511.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 513.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 517.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 521.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 522.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 528.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 531.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 534.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 536.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 542.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 545.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 549.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 552.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 555.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 559.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 561.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 564.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 567.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 572.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 575.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 576.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 581.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 583.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 585.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 590.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 591.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 594.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 599.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 601.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 605.7
%Rdmodfacs-Err> More than 106 vectors in file.
Chkmod> 106 vectors, 297 coordinates in file.
Chkmod> That is: 99 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector 37 is: 0.9999 (instead of 1.0000).
%Chkmod-Wn> Norm of vector 38 is: 1.0001 (instead of 1.0000).
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.6003
0.0034 0.7247
0.0034 0.9458
0.0034 0.7007
0.0034 0.6787
0.0034 0.7874
15.0497 0.0159
55.5387 0.1143
58.1927 0.1896
64.5338 0.1252
74.9642 0.2180
87.5589 0.1644
110.2569 0.3143
123.0436 0.2746
140.0305 0.1664
146.4915 0.2393
149.6370 0.5120
166.2476 0.2548
187.7011 0.2739
196.6589 0.4621
198.1521 0.3414
208.9271 0.3704
213.4219 0.2391
218.0404 0.3179
221.6339 0.5889
232.0302 0.3797
235.7357 0.3890
250.5743 0.5381
254.6815 0.2434
260.2459 0.5163
271.0321 0.4430
272.9395 0.4677
282.9095 0.5010
284.4060 0.2691
290.3552 0.5619
295.0682 0.7108
303.8876 0.3261
305.3971 0.3261
318.0868 0.4700
326.5915 0.2413
333.9990 0.3923
336.8289 0.3635
339.4442 0.3244
343.5529 0.2113
351.6935 0.4231
360.4686 0.3644
364.3727 0.3413
367.9151 0.4868
370.9472 0.1861
372.2165 0.4488
384.2190 0.4655
386.3612 0.6187
390.7613 0.1538
398.3815 0.5659
400.3007 0.2750
404.9862 0.4144
413.0579 0.2717
420.6946 0.2202
425.0167 0.2596
430.1185 0.4596
432.3060 0.5001
442.6823 0.5416
445.4702 0.3266
453.0812 0.5474
459.0277 0.3570
464.5176 0.4809
473.9408 0.4472
476.9169 0.4598
482.9362 0.4447
490.6869 0.4835
493.9203 0.5188
495.9453 0.5003
502.5582 0.3914
504.0809 0.4577
506.6474 0.2956
509.4325 0.4931
511.6266 0.4488
513.9261 0.4011
517.8117 0.5505
520.9899 0.5223
522.4589 0.5405
527.9592 0.4325
531.8532 0.3935
534.5069 0.3967
536.8182 0.3977
542.0641 0.5897
545.4253 0.4333
549.9463 0.3634
552.9399 0.4830
555.4929 0.4912
559.6167 0.4261
561.7197 0.6113
564.5464 0.5068
567.6707 0.5287
572.1190 0.4110
575.2021 0.5128
576.4307 0.4714
581.4207 0.4856
583.8492 0.2178
585.4626 0.5469
590.0766 0.4939
591.1746 0.3640
594.1588 0.4501
599.5913 0.5178
601.4566 0.5323
605.6569 0.4892
Project conformational change on normal modes:
Projmod> Version 1.36, April 2003.
Projmod> Projection of a difference vector on a set of eigenvectors.
Getnam> CERFACS file with the eigenvectors ?
Getnam> 2604251125092265882.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2604251125092265882.eigenfacs
Getnam> Pdb file with the reference structure ?
Getnam> 2604251125092265882.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2604251125092265882.atom
Getnam> Pdb file with the other conformer ?
Getnam> 2604251125092265882.atom2
Openam> file on opening on unit 12:
2604251125092265882.atom2
Getrep> Are the masses given in the pdb file ? (y/n)
Getrep> F
Projmod> All masses will all be assumed to be of 1.
Getrep> Displacement along one mode ? (y/n)
Getrep> F
Openam> file on opening on unit 13:
projmod.res
Openam> file on opening on unit 14:
dr.res
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4136E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4245E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4294E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4381E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4422E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4475E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 15.05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 55.54
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 58.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 64.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 74.96
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 87.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 110.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 123.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 140.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 146.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 149.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 166.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 187.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 196.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 198.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 208.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 213.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 218.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 221.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 232.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 235.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 250.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 254.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 260.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 271.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 272.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 282.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 284.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 290.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 295.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 303.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 305.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 318.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 326.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 334.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 336.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 339.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 343.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 351.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 360.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 364.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 367.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 370.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 372.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 384.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 386.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 390.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 398.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 400.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 405.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 413.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 420.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 425.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 430.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 432.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 442.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 445.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 453.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 459.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 464.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 473.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 476.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 482.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 490.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 493.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 495.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 502.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 504.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 506.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 509.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 511.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 513.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 517.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 521.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 522.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 528.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 531.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 534.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 536.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 542.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 545.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 549.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 552.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 555.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 559.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 561.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 564.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 567.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 572.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 575.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 576.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 581.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 583.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 585.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 590.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 591.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 594.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 599.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 601.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 605.7
%Rdmodfacs-Err> More than 106 vectors in file.
Projmod> 106 vectors, 297 coordinates in file.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 99
First residue number = 1
Last residue number = 99
Number of atoms found = 99
Mean number per residue = 1.0
Projmod> Cartesian (eigen)vectors will be studied.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 99
First residue number = 1
Last residue number = 99
Number of atoms found = 99
Mean number per residue = 1.0
Projmod> File dr.res: displacement=f(atom number).
Projmod> 99 atoms are considered.
Projmod> Atomic r.m.s. displacements= 1.03
Projmod> Atomic average masses = 1.00 +/- 0.00
Projmod> File projmod.res: dr.vector=f(fqcy), and cumulative square sum.
Vector: 1 F= 0.00 Cos= 0.000 Sum= 0.000 q= 0.0005
Vector: 2 F= 0.00 Cos= 0.000 Sum= 0.000 q= 0.0001
Vector: 3 F= 0.00 Cos= -0.000 Sum= 0.000 q= -0.0002
Vector: 4 F= 0.00 Cos= 0.000 Sum= 0.000 q= 0.0000
Vector: 5 F= 0.00 Cos= 0.000 Sum= 0.000 q= 0.0001
Vector: 6 F= 0.00 Cos= -0.000 Sum= 0.000 q= -0.0003
Vector: 7 F= 15.05 Cos= -0.077 Sum= 0.006 q= -0.7899
Vector: 8 F= 55.54 Cos= 0.215 Sum= 0.052 q= 2.1970
Vector: 9 F= 58.19 Cos= -0.705 Sum= 0.550 q= -7.1940
Vector: 10 F= 64.53 Cos= -0.350 Sum= 0.672 q= -3.5717
Vector: 11 F= 74.96 Cos= 0.062 Sum= 0.676 q= 0.6313
Vector: 12 F= 87.56 Cos= -0.268 Sum= 0.748 q= -2.7316
Vector: 13 F= 110.26 Cos= 0.121 Sum= 0.762 q= 1.2339
Vector: 14 F= 123.04 Cos= 0.034 Sum= 0.764 q= 0.3507
Vector: 15 F= 140.03 Cos= -0.163 Sum= 0.790 q= -1.6660
Vector: 16 F= 146.49 Cos= 0.147 Sum= 0.812 q= 1.5018
Vector: 17 F= 149.64 Cos= 0.037 Sum= 0.813 q= 0.3812
Vector: 18 F= 166.25 Cos= -0.053 Sum= 0.816 q= -0.5387
Vector: 19 F= 187.70 Cos= -0.014 Sum= 0.816 q= -0.1414
Vector: 20 F= 196.66 Cos= -0.071 Sum= 0.821 q= -0.7254
Vector: 21 F= 198.15 Cos= -0.098 Sum= 0.831 q= -1.0043
Vector: 22 F= 208.93 Cos= 0.051 Sum= 0.834 q= 0.5181
Vector: 23 F= 213.42 Cos= -0.097 Sum= 0.843 q= -0.9916
Vector: 24 F= 218.04 Cos= 0.048 Sum= 0.846 q= 0.4924
Vector: 25 F= 221.63 Cos= 0.025 Sum= 0.846 q= 0.2537
Vector: 26 F= 232.03 Cos= -0.052 Sum= 0.849 q= -0.5287
Vector: 27 F= 235.74 Cos= -0.071 Sum= 0.854 q= -0.7251
Vector: 28 F= 250.57 Cos= -0.029 Sum= 0.855 q= -0.2964
Vector: 29 F= 254.68 Cos= 0.041 Sum= 0.856 q= 0.4173
Vector: 30 F= 260.25 Cos= 0.062 Sum= 0.860 q= 0.6332
Vector: 31 F= 271.03 Cos= -0.047 Sum= 0.862 q= -0.4757
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Vector: 33 F= 282.91 Cos= -0.043 Sum= 0.866 q= -0.4376
Vector: 34 F= 284.41 Cos= -0.071 Sum= 0.871 q= -0.7274
Vector: 35 F= 290.36 Cos= 0.023 Sum= 0.872 q= 0.2324
Vector: 36 F= 295.07 Cos= -0.017 Sum= 0.872 q= -0.1740
%Projmod-Wn> Eigenvector 37 Norm= 0.9999
Vector: 37 F= 303.89 Cos= 0.051 Sum= 0.875 q= 0.5243
%Projmod-Wn> Eigenvector 38 Norm= 1.0001
Vector: 38 F= 305.40 Cos= -0.041 Sum= 0.876 q= -0.4144
Vector: 39 F= 318.09 Cos= -0.050 Sum= 0.879 q= -0.5140
Vector: 40 F= 326.59 Cos= 0.016 Sum= 0.879 q= 0.1677
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Vector: 44 F= 343.55 Cos= 0.000 Sum= 0.882 q= 0.0038
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Vector: 47 F= 364.37 Cos= 0.001 Sum= 0.882 q= 0.0076
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Vector: 50 F= 372.22 Cos= -0.097 Sum= 0.892 q= -0.9888
Vector: 51 F= 384.22 Cos= 0.025 Sum= 0.892 q= 0.2513
Vector: 52 F= 386.36 Cos= 0.050 Sum= 0.895 q= 0.5127
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Vector: 55 F= 400.30 Cos= -0.005 Sum= 0.897 q= -0.0475
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Vector: 72 F= 495.95 Cos= 0.068 Sum= 0.916 q= 0.6925
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Vector: 86 F= 542.06 Cos= 0.033 Sum= 0.928 q= 0.3323
Vector: 87 F= 545.43 Cos= -0.010 Sum= 0.928 q= -0.1027
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Vector: 89 F= 552.94 Cos= -0.019 Sum= 0.928 q= -0.1988
Vector: 90 F= 555.49 Cos= -0.007 Sum= 0.929 q= -0.0756
Vector: 91 F= 559.62 Cos= -0.003 Sum= 0.929 q= -0.0321
Vector: 92 F= 561.72 Cos= -0.010 Sum= 0.929 q= -0.1012
Vector: 93 F= 564.55 Cos= 0.011 Sum= 0.929 q= 0.1111
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Vector: 97 F= 576.43 Cos= 0.021 Sum= 0.930 q= 0.2164
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Vector: 99 F= 583.85 Cos= 0.007 Sum= 0.930 q= 0.0680
Vector: 100 F= 585.46 Cos= 0.027 Sum= 0.931 q= 0.2785
Vector: 101 F= 590.08 Cos= 0.003 Sum= 0.931 q= 0.0295
Vector: 102 F= 591.17 Cos= -0.029 Sum= 0.932 q= -0.2934
Vector: 103 F= 594.16 Cos= -0.036 Sum= 0.933 q= -0.3699
Vector: 104 F= 599.59 Cos= 0.003 Sum= 0.933 q= 0.0291
Vector: 105 F= 601.46 Cos= 0.024 Sum= 0.933 q= 0.2420
Vector: 106 F= 605.66 Cos= 0.030 Sum= 0.934 q= 0.3010
Projmod> Best zero-frequency found : 0.003414
Projmod> 6 frequencies less than: 0.003448
Projmod> Lowest non-zero frequency : 15.049741
Projmod> Best overlap with diff.vect. = -0.71 for mode 9 with F= 58.19 cm-1.
Projmod> 1-3-6-9-12-all-best contrb. = 0.497 0.692 0.786 0.820 0.841 0.934
Projmod> Normal end.
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2604251125092265882 7 -20 20 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-20
2604251125092265882.eigenfacs
2604251125092265882.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2604251125092265882.eigenfacs
2604251125092265882.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2604251125092265882.eigenfacs
2604251125092265882.atom
making animated gifs
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
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compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=7 DQ=-20 99 2.184 95 0.703
MODEL 2 MODE=7 DQ=0 99 1.025 96 0.742
MODEL 3 MODE=7 DQ=20 99 2.326 95 0.734
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 2604251125092265882 8 -20 20 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-20
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calculating perturbed structure for DQ=0
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calculating perturbed structure for DQ=20
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
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making animated gif 300x300
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
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compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=8 DQ=-20 99 2.445 90 0.974
MODEL 2 MODE=8 DQ=0 99 1.025 96 0.742
MODEL 3 MODE=8 DQ=20 99 2.050 93 0.746
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 2604251125092265882 9 -20 20 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
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calculating perturbed structure for DQ=0
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calculating perturbed structure for DQ=20
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
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MODEL 3 will be plotted
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making animated gif 300x300
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
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compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=9 DQ=-20 99 1.478 92 0.878
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MODEL 3 MODE=9 DQ=20 99 2.828 84 0.845
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 2604251125092265882 10 -20 20 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
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MODEL 1 will be plotted
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
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making animated gif 300x300
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=10 DQ=-20 99 1.910 90 0.699
MODEL 2 MODE=10 DQ=0 99 1.025 96 0.742
MODEL 3 MODE=10 DQ=20 99 2.556 87 1.063
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 2604251125092265882 11 -20 20 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
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making animated gif 300x300
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=11 DQ=-20 99 2.311 91 1.131
MODEL 2 MODE=11 DQ=0 99 1.025 96 0.742
MODEL 3 MODE=11 DQ=20 99 2.198 92 1.216
getting mode 12
running: ../../bin/get_modes.sh 2604251125092265882 12 -20 20 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 12
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MODEL 1 will be plotted
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
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making animated gif 300x300
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=12 DQ=-20 99 1.994 94 0.948
MODEL 2 MODE=12 DQ=0 99 1.025 96 0.742
MODEL 3 MODE=12 DQ=20 99 2.487 95 1.318
getting mode 13
running: ../../bin/get_modes.sh 2604251125092265882 13 -20 20 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 13
calculating perturbed structure for DQ=-20
2604251125092265882.eigenfacs
2604251125092265882.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2604251125092265882.eigenfacs
2604251125092265882.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2604251125092265882.eigenfacs
2604251125092265882.atom
making animated gifs
3 models are in 2604251125092265882.13.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
3 models are in 2604251125092265882.13.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
3 models are in 2604251125092265882.13.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=13 DQ=-20 99 2.364 84 1.167
MODEL 2 MODE=13 DQ=0 99 1.025 96 0.742
MODEL 3 MODE=13 DQ=20 99 2.143 87 0.964
getting mode 14
running: ../../bin/get_modes.sh 2604251125092265882 14 -20 20 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 14
calculating perturbed structure for DQ=-20
2604251125092265882.eigenfacs
2604251125092265882.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2604251125092265882.eigenfacs
2604251125092265882.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2604251125092265882.eigenfacs
2604251125092265882.atom
making animated gifs
3 models are in 2604251125092265882.14.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
3 models are in 2604251125092265882.14.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
3 models are in 2604251125092265882.14.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=14 DQ=-20 99 2.288 86 1.261
MODEL 2 MODE=14 DQ=0 99 1.025 96 0.742
MODEL 3 MODE=14 DQ=20 99 2.225 91 1.177
getting mode 15
running: ../../bin/get_modes.sh 2604251125092265882 15 -20 20 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 15
calculating perturbed structure for DQ=-20
2604251125092265882.eigenfacs
2604251125092265882.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2604251125092265882.eigenfacs
2604251125092265882.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2604251125092265882.eigenfacs
2604251125092265882.atom
making animated gifs
3 models are in 2604251125092265882.15.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
3 models are in 2604251125092265882.15.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
3 models are in 2604251125092265882.15.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=15 DQ=-20 99 2.102 89 1.049
MODEL 2 MODE=15 DQ=0 99 1.025 96 0.742
MODEL 3 MODE=15 DQ=20 99 2.401 88 1.130
getting mode 16
running: ../../bin/get_modes.sh 2604251125092265882 16 -20 20 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 16
calculating perturbed structure for DQ=-20
2604251125092265882.eigenfacs
2604251125092265882.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2604251125092265882.eigenfacs
2604251125092265882.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2604251125092265882.eigenfacs
2604251125092265882.atom
making animated gifs
3 models are in 2604251125092265882.16.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
3 models are in 2604251125092265882.16.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
3 models are in 2604251125092265882.16.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=16 DQ=-20 99 2.387 87 1.402
MODEL 2 MODE=16 DQ=0 99 1.025 96 0.742
MODEL 3 MODE=16 DQ=20 99 2.117 89 1.083
2604251125092265882.10.pdb
2604251125092265882.11.pdb
2604251125092265882.12.pdb
2604251125092265882.13.pdb
2604251125092265882.14.pdb
2604251125092265882.15.pdb
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2604251125092265882.7.pdb
2604251125092265882.8.pdb
2604251125092265882.9.pdb
STDERR:
real 0m0.361s
user 0m0.352s
sys 0m0.008s
rm: cannot remove '2604251125092265882.sdijb': No such file or directory
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