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***  test_cutoff10_hıv  ***

LOGs for ID: 2604251125092265882

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2604251125092265882.atom Pdbmat> Distance cutoff = 10.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2604251125092265882.atom to be opened. Openam> File opened: 2604251125092265882.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 99 First residue number = 1 Last residue number = 99 Number of atoms found = 99 Mean number per residue = 1.0 Pdbmat> Coordinate statistics: = 15.029354 +/- 8.158668 From: -0.586000 To: 30.495000 = 32.184030 +/- 6.974105 From: 13.203000 To: 43.904000 = 12.970616 +/- 7.571457 From: -7.792000 To: 27.911000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijf Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 16.2701 % Filled. Pdbmat> 7200 non-zero elements. Pdbmat> 734 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 14.83 +/- 5.35 Maximum number = 26 Minimum number = 3 Pdbmat> Matrix trace = 14680.0 Pdbmat> Larger element = 116.139 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. using diagstd (there are 99 atoms in your structure) Diagstd> Version 1.05, August 2004. Diagstd> Matrix to be read from file: pdbmat.sdijf Diagstd> Lecture de la matrice -Format CERFACS- Diagstd> Matrix dimension (Nord) = 297 Diagstd> Number of non-zero elements 7200 Diagstd> Nb of elements found twice: 0 Diagstd> Nb of elements > 1E+10 : 0 Diagstd> Matrix trace: 14680.0000003 %Diagstd-Wn: Nb on non-zero elements there: 297 Openam> file on opening on unit 11: pdbmat.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 297 eigenvectors are about to be computed. Diagstd> Sum of eigenvalues = 14680.0000003 Diagstd> Eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0192085 0.2616382 0.2872459 0.3532312 0.4765924 0.6502224 1.0305906 1.2835264 1.6633178 1.8199306 1.8994634 2.3443167 2.9881515 3.2797678 3.3299861 3.7021999 3.8625665 4.0322718 4.1664563 4.5655502 4.7126581 5.3253752 5.5005495 5.7438622 6.2299634 6.3181236 6.7879644 6.8604608 7.1499847 7.3839168 7.8320580 7.9098790 8.5811031 9.0459446 9.4613940 9.6220788 9.7722667 10.0050499 10.4882963 11.0202460 11.2580532 11.4802420 11.6662358 11.7538319 12.5244411 12.6570242 12.9470359 13.4631598 13.5938115 13.9140920 14.4726156 15.0092872 15.3230324 15.6870898 15.8473243 16.6235064 16.8282614 17.4071563 17.8743970 18.3014423 19.0532953 19.2930243 19.7826865 20.4204286 20.6907919 20.8567626 21.4243487 21.5481003 21.7693953 22.0077124 22.1984726 22.4011289 22.7447678 23.0244329 23.1488933 23.6432558 23.9934538 24.2349702 24.4381828 24.9247334 25.2312277 25.6518713 25.9280073 26.1741789 26.5613105 26.7645679 27.0262233 27.3345641 27.7599631 28.0618504 28.1793557 28.6653809 28.9097460 29.0686629 29.5315947 29.6445396 29.9375347 30.4898384 30.6826928 31.1110614 31.3934564 31.6600018 32.5347128 32.7803754 32.8407184 32.8874527 33.0523881 33.1387145 33.6538588 33.8551702 34.3776843 34.7178849 34.8491666 35.2234939 35.2976440 35.5176034 35.8690864 35.9872291 36.3049111 36.5637444 36.8977289 37.5620407 37.6199385 37.8031171 38.0252867 38.2791605 38.7198811 38.9636396 39.1910633 39.6313331 40.0394758 40.1907298 40.4132130 40.8013240 41.3974656 41.4617959 41.8077838 41.9530103 42.1570369 42.5465544 42.6446317 42.7763430 43.2082031 43.3303823 43.7921028 43.9846387 44.4832939 44.7861959 45.2556824 45.4356938 45.5665191 45.7479923 46.1896052 46.4753283 47.0667360 47.5378480 48.0403381 48.2515486 48.5050887 48.7418158 49.8979893 50.0494528 50.1315852 50.5314361 51.2812078 51.6282441 52.1546368 52.5679935 52.8134229 52.8834487 53.2699756 53.6221422 54.2431239 54.6971129 55.5767125 55.8102267 56.2936199 56.7325250 57.0160626 57.1382547 57.5567632 58.0767649 58.3998798 58.9759080 59.1495421 59.4336711 60.0149761 60.5465639 61.2287141 61.3549023 61.7482436 62.5892318 62.6697494 63.0248530 63.9302481 64.6366436 64.7684596 64.9038712 65.3765752 65.7532674 65.8736765 66.0787390 66.6498348 67.2030695 67.6481649 67.8227306 68.1825689 68.3411117 69.1422217 69.8149603 70.2085155 70.3335032 70.7366503 70.8975100 71.1509075 71.5884132 72.7015440 72.9101978 73.3322593 73.6188971 74.0309826 74.7758974 75.0176794 75.7311677 76.7348285 77.1072279 77.7027814 78.1979040 78.8676483 79.5279434 79.8590769 80.2887122 80.4529145 81.5805624 81.8496436 82.3322292 82.7603366 84.2058269 84.5938761 85.0665810 85.5863705 85.8833706 86.9222754 87.1654737 87.6647556 88.1795976 88.9703069 89.7883355 90.1886423 90.9694579 92.0871804 92.2060479 92.7578968 94.2077338 94.6403683 95.3869633 96.1556170 96.4155416 97.7584314 98.6488771 99.3039322 99.6679421 100.6745560 101.7272377 102.4119664 103.5442806 104.1154052 105.7373665 106.2602498 108.1267359 108.8053439 109.5990677 112.4136714 114.5365950 114.6716440 115.5583442 117.4116734 117.8178003 119.4495410 121.4342268 124.9463414 125.7751093 127.6914089 129.6803549 131.1326378 133.5260684 136.0122373 141.6205370 142.6803549 148.9083430 155.2791641 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the matrix is a hessien in CHARMM units): 0.0034137 0.0034247 0.0034295 0.0034382 0.0034424 0.0034477 15.0501973 55.5451154 58.1998941 64.5393789 74.9667782 87.5641295 110.2397868 123.0262192 140.0499323 146.4949630 149.6617249 166.2659899 187.7139673 196.6603611 198.1602261 208.9417425 213.4190901 218.0570747 221.6555940 232.0287707 235.7372694 250.5938369 254.6820395 260.2539236 271.0428943 272.9539217 282.9209176 284.4277216 290.3673867 295.0792544 303.9017680 305.4078531 318.1023228 326.6045580 334.0202869 336.8447132 339.4633841 343.4827337 351.6800670 360.4880933 364.3568415 367.9347451 370.9032639 372.2931264 384.3036043 386.3323591 390.7333274 398.4453667 400.3740324 405.0631316 413.1129353 420.7027140 425.0770329 430.0970571 432.2880723 442.7479894 445.4663518 453.0636240 459.1038979 464.5558554 474.0021699 476.9748010 482.9897499 490.7131617 493.9509632 495.9281141 502.6307962 504.0803574 506.6621519 509.4279057 511.6309720 513.9610801 517.8882219 521.0624194 522.4688432 528.0182342 531.9142984 534.5847005 536.8212939 542.1388636 545.4619642 549.9900168 552.9423451 555.5610802 559.6545384 561.7918037 564.5312150 567.7424354 572.1431763 575.2457685 576.4488936 581.3988098 583.8716903 585.4742619 590.1178213 591.2452095 594.1598447 599.6154870 601.5088427 605.6931949 608.4359225 611.0134183 619.3965310 621.7305982 622.3025841 622.7452142 624.3048404 625.1195896 629.9596233 631.8409672 636.6981527 639.8407704 641.0493709 644.4830450 645.1610491 647.1681075 650.3624193 651.4325944 654.3015801 656.6298357 659.6219483 665.5334213 666.0461480 667.6657309 669.6247987 671.8564374 675.7130207 677.8366374 679.8119638 683.6197806 687.1308883 688.4275255 690.3303548 693.6372512 698.6861870 699.2288435 702.1402241 703.3586689 705.0668881 708.3166944 709.1326211 710.2268835 713.8030234 714.8115160 718.6098733 720.1878574 724.2587478 726.7204277 730.5195438 731.9709786 733.0240216 734.4822416 738.0187667 740.2978936 744.9932212 748.7124226 752.6590844 754.3118118 756.2909989 758.1342770 767.0731882 768.2365172 768.8666068 771.9267671 777.6325003 780.2593068 784.2269139 787.3285149 789.1643133 789.6873206 792.5679916 795.1835005 799.7746357 803.1145278 809.5463279 811.2452621 814.7509367 817.9209589 819.9623127 820.8404801 823.8411138 827.5542789 829.8531691 833.9357618 835.1624768 837.1659551 841.2500425 844.9675508 849.7141486 850.5892994 853.3114726 859.1027134 859.6551305 862.0872082 868.2573633 873.0410781 873.9308383 874.8439258 878.0239517 880.5498541 881.3557284 882.7264779 886.5328217 890.2046021 893.1477124 894.2993515 896.6685974 897.7104893 902.9567430 907.3388942 909.8926892 910.7022403 913.3085543 914.3464255 915.9789684 918.7908223 925.9064242 927.2341505 929.9140575 931.7296878 934.3337512 939.0227134 940.5396162 945.0017375 951.2431526 953.5485832 957.2239644 960.2688401 964.3722961 968.4008373 970.4148265 973.0217008 974.0161796 980.8184526 982.4346619 985.3266230 987.8850301 996.4748749 998.7682838 1001.5549215 1004.6102041 1006.3517832 1012.4202511 1013.8355781 1016.7350455 1019.7162418 1024.2779522 1028.9759890 1031.2671993 1035.7217193 1042.0651408 1042.7374807 1045.8531928 1053.9950195 1056.4124023 1060.5711077 1064.8357166 1066.2739590 1073.6738911 1078.5526579 1082.1276727 1084.1091896 1089.5700119 1095.2516251 1098.9315266 1104.9899747 1108.0332093 1116.6306001 1119.3881280 1129.1764882 1132.7143259 1136.8383358 1151.3433220 1162.1639894 1162.8489358 1167.3361514 1176.6598082 1178.6930840 1186.8272869 1196.6463933 1213.8277231 1217.8467232 1227.0891603 1236.6089215 1243.5139995 1254.8109825 1266.4389891 1292.2852837 1297.1116822 1325.1187397 1353.1684784 Diagstd> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2604251125092265882.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2604251125092265882.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2604251125092265882.atom Openam> file on opening on unit 11: 2604251125092265882.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 99 First residue number = 1 Last residue number = 99 Number of atoms found = 99 Mean number per residue = 1.0 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.8824E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9461E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9742E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0025E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0049E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0080E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.9209E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2616 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2872 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3532 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4766 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6502 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.031 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.284 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.663 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.820 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.899 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.344 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.988 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.280 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.330 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.702 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.863 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.032 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.166 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.566 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.713 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.325 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.501 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.744 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.230 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.318 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.788 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.860 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.150 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.384 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.832 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.910 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.581 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.046 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.461 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.622 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.772 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.11 %Rdmodfacs-Wn> More than 106 vectors in file. Bfactors> 106 vectors, 297 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.019209 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.033 for 99 C-alpha atoms. Bfactors> = 12.175 +/- 79.31 Bfactors> = 31.076 +/- 10.13 Bfactors> Shiftng-fct= 18.901 Bfactors> Scaling-fct= 0.128 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2604251125092265882.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2604251125092265882.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4136E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4245E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4294E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4381E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4422E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4475E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 15.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 55.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 58.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 64.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 74.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 87.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 110.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 123.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 140.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 146.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 149.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 166.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 187.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 196.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 198.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 208.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 213.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 218.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 221.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 232.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 235.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 250.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 254.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 260.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 271.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 272.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 282.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 284.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 290.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 295.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 303.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 305.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 318.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 326.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 334.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 336.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 339.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 343.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 351.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 360.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 364.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 367.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 370.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 372.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 384.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 386.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 390.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 398.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 400.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 405.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 413.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 420.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 425.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 430.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 432.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 442.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 445.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 453.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 459.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 464.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 473.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 476.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 482.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 490.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 493.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 495.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 502.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 504.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 506.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 509.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 511.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 513.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 517.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 521.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 522.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 528.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 531.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 534.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 536.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 542.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 545.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 549.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 552.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 555.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 559.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 561.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 564.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 567.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 572.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 575.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 576.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 581.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 583.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 585.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 590.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 591.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 594.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 599.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 601.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 605.7 %Rdmodfacs-Err> More than 106 vectors in file. Chkmod> 106 vectors, 297 coordinates in file. Chkmod> That is: 99 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 37 is: 0.9999 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 38 is: 1.0001 (instead of 1.0000). Chkmod> Normal end. 0.0034 0.6003 0.0034 0.7247 0.0034 0.9458 0.0034 0.7007 0.0034 0.6787 0.0034 0.7874 15.0497 0.0159 55.5387 0.1143 58.1927 0.1896 64.5338 0.1252 74.9642 0.2180 87.5589 0.1644 110.2569 0.3143 123.0436 0.2746 140.0305 0.1664 146.4915 0.2393 149.6370 0.5120 166.2476 0.2548 187.7011 0.2739 196.6589 0.4621 198.1521 0.3414 208.9271 0.3704 213.4219 0.2391 218.0404 0.3179 221.6339 0.5889 232.0302 0.3797 235.7357 0.3890 250.5743 0.5381 254.6815 0.2434 260.2459 0.5163 271.0321 0.4430 272.9395 0.4677 282.9095 0.5010 284.4060 0.2691 290.3552 0.5619 295.0682 0.7108 303.8876 0.3261 305.3971 0.3261 318.0868 0.4700 326.5915 0.2413 333.9990 0.3923 336.8289 0.3635 339.4442 0.3244 343.5529 0.2113 351.6935 0.4231 360.4686 0.3644 364.3727 0.3413 367.9151 0.4868 370.9472 0.1861 372.2165 0.4488 384.2190 0.4655 386.3612 0.6187 390.7613 0.1538 398.3815 0.5659 400.3007 0.2750 404.9862 0.4144 413.0579 0.2717 420.6946 0.2202 425.0167 0.2596 430.1185 0.4596 432.3060 0.5001 442.6823 0.5416 445.4702 0.3266 453.0812 0.5474 459.0277 0.3570 464.5176 0.4809 473.9408 0.4472 476.9169 0.4598 482.9362 0.4447 490.6869 0.4835 493.9203 0.5188 495.9453 0.5003 502.5582 0.3914 504.0809 0.4577 506.6474 0.2956 509.4325 0.4931 511.6266 0.4488 513.9261 0.4011 517.8117 0.5505 520.9899 0.5223 522.4589 0.5405 527.9592 0.4325 531.8532 0.3935 534.5069 0.3967 536.8182 0.3977 542.0641 0.5897 545.4253 0.4333 549.9463 0.3634 552.9399 0.4830 555.4929 0.4912 559.6167 0.4261 561.7197 0.6113 564.5464 0.5068 567.6707 0.5287 572.1190 0.4110 575.2021 0.5128 576.4307 0.4714 581.4207 0.4856 583.8492 0.2178 585.4626 0.5469 590.0766 0.4939 591.1746 0.3640 594.1588 0.4501 599.5913 0.5178 601.4566 0.5323 605.6569 0.4892 Project conformational change on normal modes: Projmod> Version 1.36, April 2003. Projmod> Projection of a difference vector on a set of eigenvectors. Getnam> CERFACS file with the eigenvectors ? Getnam> 2604251125092265882.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2604251125092265882.eigenfacs Getnam> Pdb file with the reference structure ? Getnam> 2604251125092265882.atom Openam> file on opening on unit 11: 2604251125092265882.atom Getnam> Pdb file with the other conformer ? Getnam> 2604251125092265882.atom2 Openam> file on opening on unit 12: 2604251125092265882.atom2 Getrep> Are the masses given in the pdb file ? (y/n) Getrep> F Projmod> All masses will all be assumed to be of 1. Getrep> Displacement along one mode ? (y/n) Getrep> F Openam> file on opening on unit 13: projmod.res Openam> file on opening on unit 14: dr.res Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4136E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4245E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4294E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4381E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4422E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4475E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 15.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 55.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 58.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 64.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 74.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 87.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 110.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 123.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 140.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 146.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 149.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 166.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 187.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 196.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 198.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 208.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 213.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 218.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 221.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 232.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 235.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 250.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 254.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 260.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 271.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 272.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 282.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 284.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 290.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 295.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 303.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 305.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 318.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 326.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 334.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 336.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 339.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 343.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 351.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 360.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 364.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 367.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 370.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 372.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 384.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 386.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 390.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 398.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 400.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 405.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 413.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 420.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 425.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 430.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 432.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 442.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 445.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 453.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 459.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 464.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 473.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 476.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 482.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 490.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 493.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 495.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 502.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 504.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 506.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 509.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 511.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 513.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 517.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 521.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 522.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 528.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 531.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 534.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 536.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 542.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 545.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 549.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 552.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 555.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 559.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 561.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 564.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 567.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 572.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 575.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 576.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 581.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 583.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 585.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 590.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 591.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 594.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 599.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 601.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 605.7 %Rdmodfacs-Err> More than 106 vectors in file. Projmod> 106 vectors, 297 coordinates in file. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 99 First residue number = 1 Last residue number = 99 Number of atoms found = 99 Mean number per residue = 1.0 Projmod> Cartesian (eigen)vectors will be studied. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 99 First residue number = 1 Last residue number = 99 Number of atoms found = 99 Mean number per residue = 1.0 Projmod> File dr.res: displacement=f(atom number). Projmod> 99 atoms are considered. Projmod> Atomic r.m.s. displacements= 1.03 Projmod> Atomic average masses = 1.00 +/- 0.00 Projmod> File projmod.res: dr.vector=f(fqcy), and cumulative square sum. Vector: 1 F= 0.00 Cos= 0.000 Sum= 0.000 q= 0.0005 Vector: 2 F= 0.00 Cos= 0.000 Sum= 0.000 q= 0.0001 Vector: 3 F= 0.00 Cos= -0.000 Sum= 0.000 q= -0.0002 Vector: 4 F= 0.00 Cos= 0.000 Sum= 0.000 q= 0.0000 Vector: 5 F= 0.00 Cos= 0.000 Sum= 0.000 q= 0.0001 Vector: 6 F= 0.00 Cos= -0.000 Sum= 0.000 q= -0.0003 Vector: 7 F= 15.05 Cos= -0.077 Sum= 0.006 q= -0.7899 Vector: 8 F= 55.54 Cos= 0.215 Sum= 0.052 q= 2.1970 Vector: 9 F= 58.19 Cos= -0.705 Sum= 0.550 q= -7.1940 Vector: 10 F= 64.53 Cos= -0.350 Sum= 0.672 q= -3.5717 Vector: 11 F= 74.96 Cos= 0.062 Sum= 0.676 q= 0.6313 Vector: 12 F= 87.56 Cos= -0.268 Sum= 0.748 q= -2.7316 Vector: 13 F= 110.26 Cos= 0.121 Sum= 0.762 q= 1.2339 Vector: 14 F= 123.04 Cos= 0.034 Sum= 0.764 q= 0.3507 Vector: 15 F= 140.03 Cos= -0.163 Sum= 0.790 q= -1.6660 Vector: 16 F= 146.49 Cos= 0.147 Sum= 0.812 q= 1.5018 Vector: 17 F= 149.64 Cos= 0.037 Sum= 0.813 q= 0.3812 Vector: 18 F= 166.25 Cos= -0.053 Sum= 0.816 q= -0.5387 Vector: 19 F= 187.70 Cos= -0.014 Sum= 0.816 q= -0.1414 Vector: 20 F= 196.66 Cos= -0.071 Sum= 0.821 q= -0.7254 Vector: 21 F= 198.15 Cos= -0.098 Sum= 0.831 q= -1.0043 Vector: 22 F= 208.93 Cos= 0.051 Sum= 0.834 q= 0.5181 Vector: 23 F= 213.42 Cos= -0.097 Sum= 0.843 q= -0.9916 Vector: 24 F= 218.04 Cos= 0.048 Sum= 0.846 q= 0.4924 Vector: 25 F= 221.63 Cos= 0.025 Sum= 0.846 q= 0.2537 Vector: 26 F= 232.03 Cos= -0.052 Sum= 0.849 q= -0.5287 Vector: 27 F= 235.74 Cos= -0.071 Sum= 0.854 q= -0.7251 Vector: 28 F= 250.57 Cos= -0.029 Sum= 0.855 q= -0.2964 Vector: 29 F= 254.68 Cos= 0.041 Sum= 0.856 q= 0.4173 Vector: 30 F= 260.25 Cos= 0.062 Sum= 0.860 q= 0.6332 Vector: 31 F= 271.03 Cos= -0.047 Sum= 0.862 q= -0.4757 Vector: 32 F= 272.94 Cos= -0.045 Sum= 0.864 q= -0.4606 Vector: 33 F= 282.91 Cos= -0.043 Sum= 0.866 q= -0.4376 Vector: 34 F= 284.41 Cos= -0.071 Sum= 0.871 q= -0.7274 Vector: 35 F= 290.36 Cos= 0.023 Sum= 0.872 q= 0.2324 Vector: 36 F= 295.07 Cos= -0.017 Sum= 0.872 q= -0.1740 %Projmod-Wn> Eigenvector 37 Norm= 0.9999 Vector: 37 F= 303.89 Cos= 0.051 Sum= 0.875 q= 0.5243 %Projmod-Wn> Eigenvector 38 Norm= 1.0001 Vector: 38 F= 305.40 Cos= -0.041 Sum= 0.876 q= -0.4144 Vector: 39 F= 318.09 Cos= -0.050 Sum= 0.879 q= -0.5140 Vector: 40 F= 326.59 Cos= 0.016 Sum= 0.879 q= 0.1677 Vector: 41 F= 334.00 Cos= 0.019 Sum= 0.880 q= 0.1941 Vector: 42 F= 336.83 Cos= 0.047 Sum= 0.882 q= 0.4822 Vector: 43 F= 339.44 Cos= -0.003 Sum= 0.882 q= -0.0319 Vector: 44 F= 343.55 Cos= 0.000 Sum= 0.882 q= 0.0038 Vector: 45 F= 351.69 Cos= -0.022 Sum= 0.882 q= -0.2230 Vector: 46 F= 360.47 Cos= -0.005 Sum= 0.882 q= -0.0513 Vector: 47 F= 364.37 Cos= 0.001 Sum= 0.882 q= 0.0076 Vector: 48 F= 367.92 Cos= -0.006 Sum= 0.882 q= -0.0564 Vector: 49 F= 370.95 Cos= -0.004 Sum= 0.882 q= -0.0382 Vector: 50 F= 372.22 Cos= -0.097 Sum= 0.892 q= -0.9888 Vector: 51 F= 384.22 Cos= 0.025 Sum= 0.892 q= 0.2513 Vector: 52 F= 386.36 Cos= 0.050 Sum= 0.895 q= 0.5127 Vector: 53 F= 390.76 Cos= -0.039 Sum= 0.897 q= -0.3999 Vector: 54 F= 398.38 Cos= -0.021 Sum= 0.897 q= -0.2186 Vector: 55 F= 400.30 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0.2330 Vector: 74 F= 504.08 Cos= -0.020 Sum= 0.917 q= -0.2048 Vector: 75 F= 506.65 Cos= 0.014 Sum= 0.917 q= 0.1410 Vector: 76 F= 509.43 Cos= -0.035 Sum= 0.919 q= -0.3549 Vector: 77 F= 511.63 Cos= 0.036 Sum= 0.920 q= 0.3670 Vector: 78 F= 513.93 Cos= 0.004 Sum= 0.920 q= 0.0394 Vector: 79 F= 517.81 Cos= 0.027 Sum= 0.921 q= 0.2765 Vector: 80 F= 520.99 Cos= -0.041 Sum= 0.922 q= -0.4231 Vector: 81 F= 522.46 Cos= 0.031 Sum= 0.923 q= 0.3123 Vector: 82 F= 527.96 Cos= 0.031 Sum= 0.924 q= 0.3160 Vector: 83 F= 531.85 Cos= -0.027 Sum= 0.925 q= -0.2726 Vector: 84 F= 534.51 Cos= -0.022 Sum= 0.925 q= -0.2211 Vector: 85 F= 536.82 Cos= 0.032 Sum= 0.926 q= 0.3226 Vector: 86 F= 542.06 Cos= 0.033 Sum= 0.928 q= 0.3323 Vector: 87 F= 545.43 Cos= -0.010 Sum= 0.928 q= -0.1027 Vector: 88 F= 549.95 Cos= -0.022 Sum= 0.928 q= -0.2204 Vector: 89 F= 552.94 Cos= -0.019 Sum= 0.928 q= -0.1988 Vector: 90 F= 555.49 Cos= -0.007 Sum= 0.929 q= -0.0756 Vector: 91 F= 559.62 Cos= -0.003 Sum= 0.929 q= -0.0321 Vector: 92 F= 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Projmod> 1-3-6-9-12-all-best contrb. = 0.497 0.692 0.786 0.820 0.841 0.934 Projmod> Normal end. getting mode 7 running: ../../bin/get_modes.sh 2604251125092265882 7 -20 20 20 on on normal mode computation generate a series of perturbations for mode 7 calculating perturbed structure for DQ=-20 2604251125092265882.eigenfacs 2604251125092265882.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2604251125092265882.eigenfacs 2604251125092265882.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2604251125092265882.eigenfacs 2604251125092265882.atom making animated gifs 3 models are in 2604251125092265882.7.pdb, 0 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 2 will be plotted MODEL 3 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 3 models are in 2604251125092265882.7.pdb, 0 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 2 will be plotted MODEL 3 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 3 models are in 2604251125092265882.7.pdb, 0 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 2 will be plotted MODEL 3 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 compute RMSD to second conformer MODEL 1 MODE=7 DQ=-20 99 2.184 95 0.703 MODEL 2 MODE=7 DQ=0 99 1.025 96 0.742 MODEL 3 MODE=7 DQ=20 99 2.326 95 0.734 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 2604251125092265882 8 -20 20 20 on on normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-20 2604251125092265882.eigenfacs 2604251125092265882.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2604251125092265882.eigenfacs 2604251125092265882.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2604251125092265882.eigenfacs 2604251125092265882.atom making animated gifs 3 models are in 2604251125092265882.8.pdb, 0 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 2 will be plotted MODEL 3 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 3 models are in 2604251125092265882.8.pdb, 0 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 2 will be plotted MODEL 3 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 3 models are in 2604251125092265882.8.pdb, 0 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 2 will be plotted MODEL 3 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 compute RMSD to second conformer MODEL 1 MODE=8 DQ=-20 99 2.445 90 0.974 MODEL 2 MODE=8 DQ=0 99 1.025 96 0.742 MODEL 3 MODE=8 DQ=20 99 2.050 93 0.746 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 2604251125092265882 9 -20 20 20 on on normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-20 2604251125092265882.eigenfacs 2604251125092265882.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2604251125092265882.eigenfacs 2604251125092265882.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2604251125092265882.eigenfacs 2604251125092265882.atom making animated gifs 3 models are in 2604251125092265882.9.pdb, 0 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 2 will be plotted MODEL 3 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 3 models are in 2604251125092265882.9.pdb, 0 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 2 will be plotted MODEL 3 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 3 models are in 2604251125092265882.9.pdb, 0 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 2 will be plotted MODEL 3 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 compute RMSD to second conformer MODEL 1 MODE=9 DQ=-20 99 1.478 92 0.878 MODEL 2 MODE=9 DQ=0 99 1.025 96 0.742 MODEL 3 MODE=9 DQ=20 99 2.828 84 0.845 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 2604251125092265882 10 -20 20 20 on on normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-20 2604251125092265882.eigenfacs 2604251125092265882.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2604251125092265882.eigenfacs 2604251125092265882.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2604251125092265882.eigenfacs 2604251125092265882.atom making animated gifs 3 models are in 2604251125092265882.10.pdb, 0 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 2 will be plotted MODEL 3 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 3 models are in 2604251125092265882.10.pdb, 0 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 2 will be plotted MODEL 3 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 3 models are in 2604251125092265882.10.pdb, 0 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 2 will be plotted MODEL 3 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 compute RMSD to second conformer MODEL 1 MODE=10 DQ=-20 99 1.910 90 0.699 MODEL 2 MODE=10 DQ=0 99 1.025 96 0.742 MODEL 3 MODE=10 DQ=20 99 2.556 87 1.063 getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 2604251125092265882 11 -20 20 20 on on normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-20 2604251125092265882.eigenfacs 2604251125092265882.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2604251125092265882.eigenfacs 2604251125092265882.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2604251125092265882.eigenfacs 2604251125092265882.atom making animated gifs 3 models are in 2604251125092265882.11.pdb, 0 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 2 will be plotted MODEL 3 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 3 models are in 2604251125092265882.11.pdb, 0 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 2 will be plotted MODEL 3 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 3 models are in 2604251125092265882.11.pdb, 0 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 2 will be plotted MODEL 3 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 compute RMSD to second conformer MODEL 1 MODE=11 DQ=-20 99 2.311 91 1.131 MODEL 2 MODE=11 DQ=0 99 1.025 96 0.742 MODEL 3 MODE=11 DQ=20 99 2.198 92 1.216 getting mode 12 running: ../../bin/get_modes.sh 2604251125092265882 12 -20 20 20 on on normal mode computation generate a series of perturbations for mode 12 calculating perturbed structure for DQ=-20 2604251125092265882.eigenfacs 2604251125092265882.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2604251125092265882.eigenfacs 2604251125092265882.atom calculating perturbed 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13 -20 20 20 on on normal mode computation generate a series of perturbations for mode 13 calculating perturbed structure for DQ=-20 2604251125092265882.eigenfacs 2604251125092265882.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2604251125092265882.eigenfacs 2604251125092265882.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2604251125092265882.eigenfacs 2604251125092265882.atom making animated gifs 3 models are in 2604251125092265882.13.pdb, 0 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 2 will be plotted MODEL 3 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 3 models are in 2604251125092265882.13.pdb, 0 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 2 will be plotted MODEL 3 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 3 models are in 2604251125092265882.13.pdb, 0 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 2 will be plotted MODEL 3 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 compute RMSD to second conformer MODEL 1 MODE=13 DQ=-20 99 2.364 84 1.167 MODEL 2 MODE=13 DQ=0 99 1.025 96 0.742 MODEL 3 MODE=13 DQ=20 99 2.143 87 0.964 getting mode 14 running: ../../bin/get_modes.sh 2604251125092265882 14 -20 20 20 on on normal mode computation generate a series of perturbations for mode 14 calculating perturbed structure for DQ=-20 2604251125092265882.eigenfacs 2604251125092265882.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2604251125092265882.eigenfacs 2604251125092265882.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2604251125092265882.eigenfacs 2604251125092265882.atom making animated gifs 3 models are in 2604251125092265882.14.pdb, 0 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 2 will be plotted MODEL 3 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 3 models are in 2604251125092265882.14.pdb, 0 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 2 will be plotted MODEL 3 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 3 models are in 2604251125092265882.14.pdb, 0 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 2 will be plotted MODEL 3 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 compute RMSD to second conformer MODEL 1 MODE=14 DQ=-20 99 2.288 86 1.261 MODEL 2 MODE=14 DQ=0 99 1.025 96 0.742 MODEL 3 MODE=14 DQ=20 99 2.225 91 1.177 getting mode 15 running: ../../bin/get_modes.sh 2604251125092265882 15 -20 20 20 on on normal mode computation generate a series of perturbations for mode 15 calculating perturbed structure for DQ=-20 2604251125092265882.eigenfacs 2604251125092265882.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2604251125092265882.eigenfacs 2604251125092265882.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2604251125092265882.eigenfacs 2604251125092265882.atom making animated gifs 3 models are in 2604251125092265882.15.pdb, 0 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 2 will be plotted MODEL 3 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 3 models are in 2604251125092265882.15.pdb, 0 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 2 will be plotted MODEL 3 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 3 models are in 2604251125092265882.15.pdb, 0 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 2 will be plotted MODEL 3 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 compute RMSD to second conformer MODEL 1 MODE=15 DQ=-20 99 2.102 89 1.049 MODEL 2 MODE=15 DQ=0 99 1.025 96 0.742 MODEL 3 MODE=15 DQ=20 99 2.401 88 1.130 getting mode 16 running: ../../bin/get_modes.sh 2604251125092265882 16 -20 20 20 on on normal mode computation generate a series of 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animated gif 300x300 compute RMSD to second conformer MODEL 1 MODE=16 DQ=-20 99 2.387 87 1.402 MODEL 2 MODE=16 DQ=0 99 1.025 96 0.742 MODEL 3 MODE=16 DQ=20 99 2.117 89 1.083 2604251125092265882.10.pdb 2604251125092265882.11.pdb 2604251125092265882.12.pdb 2604251125092265882.13.pdb 2604251125092265882.14.pdb 2604251125092265882.15.pdb 2604251125092265882.16.pdb 2604251125092265882.7.pdb 2604251125092265882.8.pdb 2604251125092265882.9.pdb STDERR: real 0m0.361s user 0m0.352s sys 0m0.008s rm: cannot remove '2604251125092265882.sdijb': No such file or directory pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format 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