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***  PERIPLASMIC BINDING PROTEIN 25-JUN-97 1ANF  ***

CA distance fluctuations for 2604251423122313351

---  normal mode 13  ---

This matrix displays the maximum distance fluctuations between all pairs of CA atoms and between the two extreme conformations that were computed for this mode (DQMIN/DQMAX). Distance increases are plotted in blue and decreases in red for the strongest 10% of the residue pair distance changes. Every pixel corresponds to a single residue. Grey lines are drawn every 10 residues, yellow lines every 100 residues (counting from the upper left corner).

The following table indicates for every residue the two corresponding residues with the strongest CA distance fluctuations.

[HELP on distance fluctuations]

GD ok
largest increasereflargest decrease
ALA 84 0.03 LYS 1 -0.05 LYS 370
ALA 84 0.03 ILE 2 -0.05 TYR 341
ALA 84 0.03 GLU 3 -0.05 TYR 341
ALA 84 0.03 GLU 4 -0.04 THR 345
ALA 84 0.04 GLY 5 -0.04 THR 345
ALA 84 0.04 LYS 6 -0.04 THR 345
ALA 84 0.04 LEU 7 -0.05 TYR 341
ALA 84 0.03 VAL 8 -0.05 TYR 341
ALA 84 0.03 ILE 9 -0.05 TYR 341
ALA 84 0.02 TRP 10 -0.06 TYR 341
ALA 84 0.02 ILE 11 -0.06 THR 345
ASN 294 0.02 ASN 12 -0.07 GLU 153
LYS 15 0.03 GLY 13 -0.06 GLN 152
ASN 294 0.02 ASP 14 -0.05 GLU 153
GLY 13 0.03 LYS 15 -0.05 GLY 228
ASN 294 0.03 GLY 16 -0.05 TRP 230
ALA 292 0.03 TYR 17 -0.05 ALA 231
GLY 19 0.04 ASN 18 -0.06 SER 233
ASN 18 0.04 GLY 19 -0.07 LYS 297
ALA 84 0.03 LEU 20 -0.05 LYS 297
ALA 84 0.03 ALA 21 -0.06 ASP 236
ALA 84 0.03 GLU 22 -0.06 LYS 25
ALA 84 0.04 VAL 23 -0.07 VAL 293
ALA 84 0.04 GLY 24 -0.05 ASP 236
ALA 84 0.04 LYS 25 -0.06 GLU 22
ALA 84 0.04 LYS 26 -0.05 ALA 292
ALA 84 0.04 PHE 27 -0.05 ASN 124
ALA 84 0.04 GLU 28 -0.05 ASP 236
ALA 84 0.04 LYS 29 -0.06 ASP 236
ALA 84 0.04 ASP 30 -0.05 ASN 124
ALA 84 0.05 THR 31 -0.04 ASN 124
ALA 84 0.04 GLY 32 -0.05 THR 237
ALA 84 0.04 ILE 33 -0.05 THR 237
ALA 84 0.04 LYS 34 -0.05 THR 237
ALA 84 0.04 VAL 35 -0.05 THR 237
ALA 84 0.03 THR 36 -0.06 THR 237
ALA 84 0.03 VAL 37 -0.05 THR 345
ALA 84 0.03 GLU 38 -0.06 THR 345
ALA 84 0.02 HIS 39 -0.06 THR 345
ALA 84 0.02 PRO 40 -0.07 THR 345
ALA 292 0.02 ASP 41 -0.08 THR 345
LEU 43 0.02 LYS 42 -0.09 THR 345
LYS 42 0.02 LEU 43 -0.08 TYR 341
PHE 67 0.02 GLU 44 -0.09 TYR 341
TYR 70 0.02 GLU 45 -0.11 TYR 341
GLY 143 0.01 LYS 46 -0.08 TYR 341
ALA 84 0.01 PHE 47 -0.08 TYR 341
GLY 143 0.01 PRO 48 -0.08 TYR 341
GLY 143 0.01 GLN 49 -0.08 TYR 341
ALA 84 0.02 VAL 50 -0.07 TYR 341
ALA 84 0.02 ALA 51 -0.06 LYS 370
LYS 102 0.01 ALA 52 -0.07 LYS 370
ALA 84 0.02 THR 53 -0.06 LYS 370
ALA 84 0.02 GLY 54 -0.05 LYS 370
ALA 84 0.02 ASP 55 -0.05 TYR 341
ALA 84 0.02 GLY 56 -0.06 TYR 341
ALA 84 0.03 PRO 57 -0.06 TYR 341
ALA 84 0.03 ASP 58 -0.05 TYR 341
ALA 84 0.03 ILE 59 -0.05 TYR 341
ALA 84 0.02 ILE 60 -0.06 TYR 341
LYS 42 0.02 PHE 61 -0.05 TYR 341
LYS 42 0.02 TRP 62 -0.06 TYR 341
ALA 215 0.02 ALA 63 -0.05 TYR 341
GLY 68 0.02 HIS 64 -0.04 ALA 168
SER 211 0.02 ASP 65 -0.04 ALA 168
SER 211 0.02 ARG 66 -0.05 SER 337
ALA 318 0.02 PHE 67 -0.06 LYS 370
ALA 318 0.02 GLY 68 -0.06 LYS 370
SER 211 0.02 GLY 69 -0.08 LYS 370
GLU 45 0.02 TYR 70 -0.07 LYS 370
GLU 45 0.02 ALA 71 -0.06 LYS 370
ALA 318 0.02 GLN 72 -0.07 LYS 370
ALA 318 0.02 SER 73 -0.07 LYS 370
LYS 102 0.02 GLY 74 -0.06 LYS 370
LYS 102 0.02 LEU 75 -0.06 LYS 370
ILE 104 0.02 LEU 76 -0.06 LYS 370
ALA 268 0.03 ALA 77 -0.05 LYS 370
ALA 268 0.02 GLU 78 -0.05 LYS 370
ALA 268 0.02 ILE 79 -0.05 GLY 174
SER 270 0.02 THR 80 -0.05 GLY 174
LYS 273 0.03 PRO 81 -0.06 GLY 174
GLU 274 0.04 ASP 82 -0.07 GLY 174
PHE 85 0.05 LYS 83 -0.10 GLY 174
PHE 85 0.09 ALA 84 -0.08 GLY 174
ALA 84 0.09 PHE 85 -0.06 GLY 174
ASP 87 0.02 GLN 86 -0.07 GLY 174
GLN 86 0.02 ASP 87 -0.08 GLY 174
ASN 18 0.02 LYS 88 -0.06 GLY 174
THR 237 0.02 LEU 89 -0.06 GLY 174
PRO 91 0.04 TYR 90 -0.07 GLN 325
TYR 90 0.04 PRO 91 -0.09 GLY 174
LYS 313 0.03 PHE 92 -0.08 GLY 174
ALA 312 0.03 THR 93 -0.07 GLU 328
LYS 313 0.02 TRP 94 -0.08 GLY 174
LYS 313 0.03 ASP 95 -0.10 GLY 174
ALA 318 0.03 ALA 96 -0.07 GLY 174
ALA 312 0.02 VAL 97 -0.06 GLY 174
ALA 318 0.02 ARG 98 -0.07 GLY 174
ALA 318 0.02 TYR 99 -0.06 LYS 175
ALA 318 0.02 ASN 100 -0.05 LYS 370
ALA 318 0.02 GLY 101 -0.07 GLY 174
LEU 76 0.02 LYS 102 -0.06 GLY 174
ALA 268 0.02 LEU 103 -0.06 GLY 174
LEU 76 0.02 ILE 104 -0.05 LYS 370
PRO 91 0.01 ALA 105 -0.05 LYS 370
PRO 91 0.02 TYR 106 -0.05 GLY 174
ALA 264 0.02 PRO 107 -0.05 GLY 174
GLY 13 0.02 ILE 108 -0.05 ALA 109
ALA 312 0.02 ALA 109 -0.05 ILE 108
ALA 96 0.03 VAL 110 -0.05 ALA 324
ALA 318 0.02 GLU 111 -0.04 LEU 284
VAL 259 0.03 ALA 112 -0.05 LEU 247
GLY 327 0.02 LEU 113 -0.05 GLY 300
TYR 242 0.03 SER 114 -0.05 GLY 300
LEU 247 0.03 LEU 115 -0.05 GLY 19
TYR 242 0.03 ILE 116 -0.05 GLY 19
PRO 248 0.04 TYR 117 -0.05 GLY 19
THR 249 0.03 ASN 118 -0.04 LYS 29
PRO 125 0.04 LYS 119 -0.05 LYS 29
THR 249 0.03 ASP 120 -0.04 LYS 29
ILE 132 0.02 LEU 121 -0.04 LYS 29
TRP 129 0.04 LEU 122 -0.05 PRO 315
GLY 252 0.04 PRO 123 -0.07 PRO 315
LYS 127 0.05 ASN 124 -0.08 PRO 315
LYS 119 0.04 PRO 125 -0.06 ALA 318
TRP 129 0.05 PRO 126 -0.06 ALA 318
ASN 124 0.05 LYS 127 -0.06 GLU 322
ASN 124 0.05 THR 128 -0.06 PRO 248
PRO 126 0.05 TRP 129 -0.04 GLU 322
ASN 124 0.05 GLU 130 -0.04 ALA 134
ASN 124 0.04 GLU 131 -0.05 GLU 322
LEU 122 0.03 ILE 132 -0.04 GLU 322
GLY 353 0.03 PRO 133 -0.04 GLU 322
GLY 353 0.03 ALA 134 -0.05 GLU 322
GLY 353 0.03 LEU 135 -0.05 VAL 246
GLY 353 0.03 ASP 136 -0.04 VAL 246
LYS 200 0.04 LYS 137 -0.04 VAL 246
GLY 353 0.03 GLU 138 -0.05 PRO 126
ILE 212 0.02 LEU 139 -0.04 PRO 125
ASN 205 0.03 LYS 140 -0.03 PRO 125
ASN 205 0.04 ALA 141 -0.04 PRO 125
ILE 212 0.04 LYS 142 -0.04 PRO 125
ILE 212 0.05 GLY 143 -0.02 LEU 121
ILE 212 0.03 LYS 144 -0.02 LYS 29
ILE 212 0.03 SER 145 -0.03 LYS 29
LEU 195 0.02 ALA 146 -0.03 LYS 29
ALA 364 0.02 LEU 147 -0.03 LYS 25
PHE 149 0.02 MET 148 -0.03 LYS 25
MET 148 0.02 PHE 149 -0.04 ASP 14
GLY 143 0.03 ASN 150 -0.05 ASN 12
GLY 143 0.03 LEU 151 -0.05 ASP 41
TYR 341 0.03 GLN 152 -0.07 ASP 41
SER 337 0.03 GLU 153 -0.07 ASN 12
ILE 178 0.02 PRO 154 -0.06 ASN 12
SER 337 0.02 TYR 155 -0.06 ASN 12
ILE 178 0.02 PHE 156 -0.05 ASN 12
MET 148 0.02 THR 157 -0.05 ASN 12
LEU 115 0.02 TRP 158 -0.05 TRP 62
LEU 115 0.03 PRO 159 -0.05 VAL 259
TYR 117 0.03 LEU 160 -0.04 THR 93
PRO 126 0.03 ILE 161 -0.04 THR 93
LEU 115 0.03 ALA 162 -0.05 PHE 92
LYS 119 0.03 ALA 163 -0.05 PHE 92
ASN 124 0.03 ASP 164 -0.05 PHE 92
ASN 124 0.03 GLY 165 -0.05 PHE 92
ASN 124 0.02 GLY 166 -0.05 PHE 92
LYS 326 0.03 TYR 167 -0.05 LYS 83
LYS 326 0.03 ALA 168 -0.05 LYS 83
GLN 325 0.03 PHE 169 -0.05 LYS 83
GLN 325 0.03 LYS 170 -0.06 LYS 83
GLN 325 0.03 TYR 171 -0.07 LYS 83
GLN 325 0.02 GLU 172 -0.07 LYS 83
ASP 180 0.03 ASN 173 -0.09 LYS 83
LYS 179 0.02 GLY 174 -0.10 LYS 83
ASP 209 0.01 LYS 175 -0.08 LYS 83
GLN 325 0.02 TYR 176 -0.07 LYS 83
ALA 342 0.02 ASP 177 -0.06 LYS 83
PHE 339 0.03 ILE 178 -0.06 LYS 83
ASN 173 0.02 LYS 179 -0.05 LYS 83
ASN 173 0.03 ASP 180 -0.05 LYS 83
LYS 326 0.02 VAL 181 -0.05 LYS 83
LYS 326 0.02 GLY 182 -0.05 LYS 83
PRO 126 0.02 VAL 183 -0.05 GLU 45
PRO 126 0.03 ASP 184 -0.05 GLU 45
ASN 124 0.03 ASN 185 -0.04 LYS 83
ASN 124 0.03 ALA 186 -0.04 LYS 83
ASN 124 0.03 GLY 187 -0.05 LYS 83
ASN 124 0.03 ALA 188 -0.04 LYS 83
ASN 124 0.03 LYS 189 -0.05 LYS 42
ASN 124 0.04 ALA 190 -0.04 LYS 83
PRO 126 0.04 GLY 191 -0.04 THR 93
PRO 126 0.03 LEU 192 -0.05 ASP 41
VAL 357 0.04 THR 193 -0.05 ASP 41
GLU 130 0.03 PHE 194 -0.04 ASN 12
PRO 126 0.03 LEU 195 -0.04 ASN 12
PRO 133 0.03 VAL 196 -0.04 ASP 41
GLY 353 0.04 ASP 197 -0.04 ASN 12
GLY 353 0.03 LEU 198 -0.03 ASN 12
LYS 137 0.04 ILE 199 -0.04 ASN 12
ASN 201 0.06 LYS 200 -0.03 ASP 41
LYS 200 0.06 ASN 201 -0.03 TYR 90
GLY 353 0.04 LYS 202 -0.03 LYS 29
LYS 137 0.04 HIS 203 -0.03 LYS 29
ILE 348 0.03 MET 204 -0.03 LYS 29
ALA 141 0.04 ASN 205 -0.03 HIS 39
ILE 348 0.04 ALA 206 -0.04 ASP 41
ALA 141 0.04 ASP 207 -0.05 SER 352
GLY 143 0.04 THR 208 -0.03 HIS 39
GLY 143 0.03 ASP 209 -0.04 SER 352
GLY 143 0.03 TYR 210 -0.04 HIS 39
GLY 143 0.04 SER 211 -0.04 SER 238
GLY 143 0.05 ILE 212 -0.03 ARG 354
GLY 143 0.03 ALA 213 -0.03 THR 36
ALA 215 0.03 GLU 214 -0.03 THR 36
GLY 143 0.03 ALA 215 -0.03 ARG 354
GLY 143 0.04 ALA 216 -0.03 ASN 205
GLY 143 0.02 PHE 217 -0.03 LYS 29
LYS 219 0.03 ASN 218 -0.03 LYS 29
ASN 218 0.03 LYS 219 -0.02 LYS 29
SER 238 0.02 GLY 220 -0.03 LYS 29
LYS 142 0.03 GLU 221 -0.02 LYS 29
SER 337 0.02 THR 222 -0.03 LYS 29
TRP 129 0.02 ALA 223 -0.04 LYS 29
LEU 160 0.02 MET 224 -0.04 GLY 19
TYR 167 0.02 THR 225 -0.04 GLY 19
TYR 167 0.02 ILE 226 -0.05 ASN 227
GLY 327 0.02 ASN 227 -0.05 ILE 226
VAL 259 0.02 GLY 228 -0.05 GLY 19
ASN 234 0.02 PRO 229 -0.05 GLY 19
ALA 215 0.02 TRP 230 -0.05 GLY 19
ALA 215 0.02 ALA 231 -0.05 ASN 18
ASN 234 0.03 TRP 232 -0.06 GLY 19
GLU 310 0.04 SER 233 -0.06 ASN 18
GLU 310 0.03 ASN 234 -0.06 ASN 18
LYS 219 0.02 ILE 235 -0.06 ASN 18
THR 237 0.04 ASP 236 -0.06 ASN 18
GLU 310 0.05 THR 237 -0.06 ASN 18
GLU 310 0.03 SER 238 -0.05 ASN 18
GLU 310 0.03 LYS 239 -0.05 LYS 25
THR 245 0.03 VAL 240 -0.05 LYS 29
THR 249 0.03 ASN 241 -0.05 LYS 29
THR 245 0.04 TYR 242 -0.05 LYS 25
THR 245 0.04 GLY 243 -0.06 LYS 295
THR 245 0.03 VAL 244 -0.05 ASN 124
GLY 243 0.04 THR 245 -0.05 ILE 317
PRO 254 0.03 VAL 246 -0.05 ALA 301
TYR 242 0.04 LEU 247 -0.05 ALA 301
LYS 119 0.04 PRO 248 -0.06 THR 128
ASN 124 0.04 THR 249 -0.05 TYR 90
ASN 124 0.04 PHE 250 -0.05 TYR 90
ASN 124 0.04 LYS 251 -0.05 PHE 92
ASN 124 0.05 GLY 252 -0.05 TYR 90
ASN 124 0.04 GLN 253 -0.05 TYR 90
TYR 242 0.03 PRO 254 -0.05 TYR 90
LEU 115 0.03 SER 255 -0.05 TYR 90
LEU 115 0.03 LYS 256 -0.06 VAL 259
GLY 327 0.03 PRO 257 -0.05 VAL 259
TYR 242 0.02 PHE 258 -0.07 VAL 259
ALA 112 0.03 VAL 259 -0.07 PHE 258
ALA 318 0.02 GLY 260 -0.05 VAL 261
ALA 312 0.02 VAL 261 -0.06 PHE 258
ALA 312 0.02 LEU 262 -0.05 PHE 258
LYS 42 0.02 SER 263 -0.05 PHE 258
PRO 107 0.02 ALA 264 -0.05 TYR 341
ALA 84 0.02 GLY 265 -0.05 TYR 341
ALA 84 0.02 ILE 266 -0.05 LYS 370
ALA 84 0.02 ASN 267 -0.05 LYS 370
ALA 77 0.03 ALA 268 -0.05 LYS 370
ALA 84 0.02 ALA 269 -0.05 LYS 370
ALA 84 0.03 SER 270 -0.05 LYS 370
ALA 84 0.03 PRO 271 -0.04 LYS 370
ALA 84 0.04 ASN 272 -0.04 TYR 341
ALA 84 0.04 LYS 273 -0.05 LYS 370
ALA 84 0.05 GLU 274 -0.04 LYS 370
ALA 84 0.05 LEU 275 -0.04 TYR 341
ALA 84 0.04 ALA 276 -0.04 TYR 341
ALA 84 0.05 LYS 277 -0.04 LYS 370
ALA 84 0.06 GLU 278 -0.04 LYS 370
ALA 84 0.05 PHE 279 -0.04 TYR 341
ALA 84 0.05 LEU 280 -0.04 GLY 174
ALA 84 0.06 GLU 281 -0.05 GLY 174
ALA 84 0.07 ASN 282 -0.04 GLY 174
ALA 84 0.05 TYR 283 -0.04 ASN 124
ALA 84 0.04 LEU 284 -0.05 ALA 109
ALA 84 0.04 LEU 285 -0.04 GLY 174
ALA 84 0.04 THR 286 -0.04 GLN 325
ALA 84 0.03 ASP 287 -0.05 ASN 124
ALA 84 0.03 GLU 288 -0.05 ASN 124
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THR 193 0.03 GLU 359 -0.06 LYS 42
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