*** open_cutoff10 ***
Output from eigenvector calculation:
STDOUT:
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 2604261322202455018.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 10.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 2604261322202455018.atom to be opened.
Openam> File opened: 2604261322202455018.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 400
First residue number = 1
Last residue number = 429
Number of atoms found = 400
Mean number per residue = 1.0
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 36.944335 +/- 13.167314 From: 4.195000 To: 65.719000
= 42.308003 +/- 10.661547 From: 14.831000 To: 63.680000
= 15.579035 +/- 13.343983 From: -14.909000 To: 42.062000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 4.6282 % Filled.
Pdbmat> 33351 non-zero elements.
Pdbmat> 3439 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 17.20 +/- 5.79
Maximum number = 30
Minimum number = 3
Pdbmat> Matrix trace = 68780.0
Pdbmat> Larger element = 126.842
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
400 non-zero elements, NRBL set to 3
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 2604261322202455018.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 3
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 2604261322202455018.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
2604261322202455018.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 400 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 3 residue(s) per block.
Blocpdb> 400 residues.
Blocpdb> 3 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 3 atoms in block 2
Block first atom: 4
Blocpdb> 3 atoms in block 3
Block first atom: 7
%Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 4 i.e., less than what is required for a rigid body.
%Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 11th, in residue A 11
%Blocpdb-Wn> It will be merged with next block.
Blocpdb> 5 atoms in block 4
Block first atom: 10
Blocpdb> 3 atoms in block 5
Block first atom: 15
Blocpdb> 3 atoms in block 6
Block first atom: 18
Blocpdb> 3 atoms in block 7
Block first atom: 21
Blocpdb> 3 atoms in block 8
Block first atom: 24
%Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 9 i.e., less than what is required for a rigid body.
%Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 28th, in residue A 29
%Blocpdb-Wn> It will be merged with next block.
Blocpdb> 4 atoms in block 9
Block first atom: 27
Blocpdb> 3 atoms in block 10
Block first atom: 31
Blocpdb> 3 atoms in block 11
Block first atom: 34
Blocpdb> 3 atoms in block 12
Block first atom: 37
Blocpdb> 3 atoms in block 13
Block first atom: 40
Blocpdb> 3 atoms in block 14
Block first atom: 43
Blocpdb> 3 atoms in block 15
Block first atom: 46
Blocpdb> 3 atoms in block 16
Block first atom: 49
Blocpdb> 3 atoms in block 17
Block first atom: 52
Blocpdb> 3 atoms in block 18
Block first atom: 55
Blocpdb> 3 atoms in block 19
Block first atom: 58
Blocpdb> 3 atoms in block 20
Block first atom: 61
Blocpdb> 3 atoms in block 21
Block first atom: 64
Blocpdb> 3 atoms in block 22
Block first atom: 67
Blocpdb> 3 atoms in block 23
Block first atom: 70
Blocpdb> 3 atoms in block 24
Block first atom: 73
%Blocpdb-Wn> 1 atoms in block 25 i.e., less than what is required for a rigid body.
%Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 76th, in residue A 80
%Blocpdb-Wn> It will be merged with next block.
%Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 25 i.e., less than what is required for a rigid body.
%Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 77th, in residue A 82
%Blocpdb-Wn> It will be merged with next block.
Blocpdb> 3 atoms in block 25
Block first atom: 76
Blocpdb> 3 atoms in block 26
Block first atom: 79
Blocpdb> 3 atoms in block 27
Block first atom: 82
Blocpdb> 3 atoms in block 28
Block first atom: 85
Blocpdb> 3 atoms in block 29
Block first atom: 88
Blocpdb> 3 atoms in block 30
Block first atom: 91
Blocpdb> 3 atoms in block 31
Block first atom: 94
Blocpdb> 3 atoms in block 32
Block first atom: 97
%Blocpdb-Wn> 1 atoms in block 33 i.e., less than what is required for a rigid body.
%Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 100th, in residue A 109
%Blocpdb-Wn> It will be merged with next block.
Blocpdb> 4 atoms in block 33
Block first atom: 100
Blocpdb> 3 atoms in block 34
Block first atom: 104
Blocpdb> 3 atoms in block 35
Block first atom: 107
Blocpdb> 3 atoms in block 36
Block first atom: 110
Blocpdb> 3 atoms in block 37
Block first atom: 113
Blocpdb> 3 atoms in block 38
Block first atom: 116
Blocpdb> 3 atoms in block 39
Block first atom: 119
Blocpdb> 3 atoms in block 40
Block first atom: 122
Blocpdb> 3 atoms in block 41
Block first atom: 125
Blocpdb> 3 atoms in block 42
Block first atom: 128
Blocpdb> 3 atoms in block 43
Block first atom: 131
Blocpdb> 3 atoms in block 44
Block first atom: 134
Blocpdb> 3 atoms in block 45
Block first atom: 137
Blocpdb> 3 atoms in block 46
Block first atom: 140
Blocpdb> 3 atoms in block 47
Block first atom: 143
Blocpdb> 3 atoms in block 48
Block first atom: 146
Blocpdb> 3 atoms in block 49
Block first atom: 149
%Blocpdb-Wn> 1 atoms in block 50 i.e., less than what is required for a rigid body.
%Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 152th, in residue A 162
%Blocpdb-Wn> It will be merged with next block.
Blocpdb> 4 atoms in block 50
Block first atom: 152
Blocpdb> 3 atoms in block 51
Block first atom: 156
Blocpdb> 3 atoms in block 52
Block first atom: 159
Blocpdb> 3 atoms in block 53
Block first atom: 162
Blocpdb> 3 atoms in block 54
Block first atom: 165
Blocpdb> 3 atoms in block 55
Block first atom: 168
Blocpdb> 3 atoms in block 56
Block first atom: 171
Blocpdb> 3 atoms in block 57
Block first atom: 174
Blocpdb> 3 atoms in block 58
Block first atom: 177
Blocpdb> 3 atoms in block 59
Block first atom: 180
Blocpdb> 3 atoms in block 60
Block first atom: 183
Blocpdb> 3 atoms in block 61
Block first atom: 186
Blocpdb> 3 atoms in block 62
Block first atom: 189
Blocpdb> 3 atoms in block 63
Block first atom: 192
Blocpdb> 3 atoms in block 64
Block first atom: 195
Blocpdb> 3 atoms in block 65
Block first atom: 198
Blocpdb> 3 atoms in block 66
Block first atom: 201
Blocpdb> 3 atoms in block 67
Block first atom: 204
%Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 68 i.e., less than what is required for a rigid body.
%Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 208th, in residue A 221
%Blocpdb-Wn> It will be merged with next block.
Blocpdb> 5 atoms in block 68
Block first atom: 207
Blocpdb> 3 atoms in block 69
Block first atom: 212
Blocpdb> 3 atoms in block 70
Block first atom: 215
Blocpdb> 3 atoms in block 71
Block first atom: 218
Blocpdb> 3 atoms in block 72
Block first atom: 221
Blocpdb> 3 atoms in block 73
Block first atom: 224
Blocpdb> 3 atoms in block 74
Block first atom: 227
Blocpdb> 3 atoms in block 75
Block first atom: 230
Blocpdb> 3 atoms in block 76
Block first atom: 233
Blocpdb> 3 atoms in block 77
Block first atom: 236
Blocpdb> 3 atoms in block 78
Block first atom: 239
Blocpdb> 3 atoms in block 79
Block first atom: 242
Blocpdb> 3 atoms in block 80
Block first atom: 245
Blocpdb> 3 atoms in block 81
Block first atom: 248
Blocpdb> 3 atoms in block 82
Block first atom: 251
Blocpdb> 3 atoms in block 83
Block first atom: 254
Blocpdb> 3 atoms in block 84
Block first atom: 257
Blocpdb> 3 atoms in block 85
Block first atom: 260
Blocpdb> 3 atoms in block 86
Block first atom: 263
Blocpdb> 3 atoms in block 87
Block first atom: 266
%Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 88 i.e., less than what is required for a rigid body.
%Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 270th, in residue A 285
%Blocpdb-Wn> It will be merged with next block.
Blocpdb> 5 atoms in block 88
Block first atom: 269
%Blocpdb-Wn> 1 atoms in block 89 i.e., less than what is required for a rigid body.
%Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 274th, in residue A 290
%Blocpdb-Wn> It will be merged with next block.
%Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 89 i.e., less than what is required for a rigid body.
%Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 275th, in residue A 298
%Blocpdb-Wn> It will be merged with next block.
Blocpdb> 5 atoms in block 89
Block first atom: 274
Blocpdb> 3 atoms in block 90
Block first atom: 279
Blocpdb> 3 atoms in block 91
Block first atom: 282
Blocpdb> 3 atoms in block 92
Block first atom: 285
Blocpdb> 3 atoms in block 93
Block first atom: 288
Blocpdb> 3 atoms in block 94
Block first atom: 291
Blocpdb> 3 atoms in block 95
Block first atom: 294
Blocpdb> 3 atoms in block 96
Block first atom: 297
Blocpdb> 3 atoms in block 97
Block first atom: 300
Blocpdb> 3 atoms in block 98
Block first atom: 303
Blocpdb> 3 atoms in block 99
Block first atom: 306
Blocpdb> 3 atoms in block 100
Block first atom: 309
Blocpdb> 3 atoms in block 101
Block first atom: 312
Blocpdb> 3 atoms in block 102
Block first atom: 315
Blocpdb> 3 atoms in block 103
Block first atom: 318
Blocpdb> 3 atoms in block 104
Block first atom: 321
Blocpdb> 3 atoms in block 105
Block first atom: 324
Blocpdb> 3 atoms in block 106
Block first atom: 327
Blocpdb> 3 atoms in block 107
Block first atom: 330
Blocpdb> 3 atoms in block 108
Block first atom: 333
Blocpdb> 3 atoms in block 109
Block first atom: 336
%Blocpdb-Wn> 1 atoms in block 110 i.e., less than what is required for a rigid body.
%Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 339th, in residue A 365
%Blocpdb-Wn> It will be merged with next block.
%Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 110 i.e., less than what is required for a rigid body.
%Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 340th, in residue A 367
%Blocpdb-Wn> It will be merged with next block.
Blocpdb> 5 atoms in block 110
Block first atom: 339
Blocpdb> 3 atoms in block 111
Block first atom: 344
Blocpdb> 3 atoms in block 112
Block first atom: 347
Blocpdb> 3 atoms in block 113
Block first atom: 350
Blocpdb> 3 atoms in block 114
Block first atom: 353
Blocpdb> 3 atoms in block 115
Block first atom: 356
Blocpdb> 3 atoms in block 116
Block first atom: 359
Blocpdb> 3 atoms in block 117
Block first atom: 362
Blocpdb> 3 atoms in block 118
Block first atom: 365
Blocpdb> 3 atoms in block 119
Block first atom: 368
Blocpdb> 3 atoms in block 120
Block first atom: 371
Blocpdb> 3 atoms in block 121
Block first atom: 374
Blocpdb> 3 atoms in block 122
Block first atom: 377
Blocpdb> 3 atoms in block 123
Block first atom: 380
Blocpdb> 3 atoms in block 124
Block first atom: 383
Blocpdb> 3 atoms in block 125
Block first atom: 386
Blocpdb> 3 atoms in block 126
Block first atom: 389
Blocpdb> 3 atoms in block 127
Block first atom: 392
Blocpdb> 3 atoms in block 128
Block first atom: 395
Blocpdb> 3 atoms in block 129
Block first atom: 397
Blocpdb> 129 blocks.
Blocpdb> At most, 5 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 3 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 33480 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 1200
Prepmat> Matrix trace = 68780.0000
Prepmat> Last element read: 1200 1200 10.2037
Prepmat> 8386 lines saved.
Prepmat> 7491 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 400
RTB> Total mass = 400.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 400
RTB> Number of blocks = 129
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 41016.3636
RTB> 30249 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 774
Diagstd> Nb of non-zero elements: 30249
Diagstd> Projected matrix trace = 41016.3636
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 774 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 41016.3636
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.0174937 0.0498806 0.0606760 0.0996778
0.1720300 0.2242398 0.3745424 0.4118161 0.4953143
0.5234679 0.6011199 0.7329964 0.7848284 0.8404881
0.9464941 1.0118782 1.2650585 1.4174479 1.6204677
1.7098247 1.7916081 1.9225406 2.0015638 2.1964240
2.2462359 2.3652246 2.4314383 2.6484874 2.7585918
2.7600590 2.9500648 3.2421363 3.3224679 3.4554739
3.5586095 3.7493335 3.7560970 3.9134880 4.0742644
4.2131061 4.3689059 4.4150863 4.5186116 4.6823243
4.7734188 4.9482129 5.0899013 5.1890596 5.2893386
5.4444749 5.6179097 5.6385814 5.9143480 5.9824123
6.1524543 6.4442248 6.5921438 6.6832762 6.8225974
6.9811427 7.0548877 7.3364167 7.4743878 7.5380134
7.8050289 7.9371092 8.2224867 8.3051596 8.5134157
8.6159854 8.7687924 8.9467069 9.0245397 9.0681973
9.2910450 9.4232446 9.5903255 9.6723819 9.7390423
9.9773452 10.1326369 10.2440796 10.3567345 10.5144913
10.5903874 10.6513438 10.7418412 10.9177010 11.0853624
11.3255907 11.3784601 11.4727236 11.6916613 11.8252896
12.0116828 12.0545372 12.2247869 12.2836189 12.3492561
12.6455778
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034334 0.0034339 0.0034340 0.0034341 0.0034341
0.0034343 14.3626910 24.2527474 26.7487581 34.2842362
45.0398994 51.4223154 66.4577685 69.6862295 76.4250459
78.5670282 84.1929701 92.9707231 96.2016752 99.5545384
105.6462889 109.2343943 122.1379402 129.2852041 138.2341889
141.9943526 145.3505857 150.5681232 153.6314026 160.9360634
162.7507362 167.0057698 169.3272710 176.7234727 180.3594903
180.4074471 186.5138385 195.5288806 197.9364034 201.8594508
204.8497541 210.2675801 210.4571470 214.8212714 219.1895710
222.8930255 226.9768830 228.1733278 230.8329419 234.9773618
237.2520921 241.5569131 244.9909041 247.3657732 249.7445182
253.3805526 257.3846598 257.8577616 264.0880313 265.6032904
269.3515486 275.6643598 278.8101727 280.7307489 283.6417474
286.9184911 288.4299346 294.1286125 296.8814721 298.1423933
303.3769202 305.9330931 311.3844132 312.9459037 316.8452492
318.7482116 321.5623355 324.8081258 326.2179177 327.0060295
330.9996705 333.3462037 336.2884516 337.7240569 338.8858264
343.0068392 345.6658848 347.5615724 349.4674265 352.1189616
353.3875169 354.4030752 355.9054542 358.8069760 361.5515504
365.4481022 366.3000899 367.8142453 371.3072185 373.4230946
376.3545820 377.0253499 379.6784340 380.5909419 381.6064255
386.1576283
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 400
Rtb_to_modes> Number of blocs = 129
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9969E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9996E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.7494E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.9881E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.0676E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9678E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1720
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2242
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3745
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4118
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4953
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5235
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6011
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7330
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7848
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8405
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9465
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.012
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.265
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.417
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.620
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.710
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.792
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.923
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.002
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.196
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.246
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.365
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.431
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.648
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.759
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.760
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.950
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.242
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.322
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.455
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.559
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.749
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.756
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.913
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.074
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.213
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.369
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.415
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.519
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.682
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.773
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.948
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.090
Rdmodfacs> Eigenvector number: 54
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.189
Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.289
Rdmodfacs> Eigenvector number: 56
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.444
Rdmodfacs> Eigenvector number: 57
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.618
Rdmodfacs> Eigenvector number: 58
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.639
Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.914
Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.982
Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.152
Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.444
Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.592
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.683
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.823
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.981
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.055
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.336
Rdmodfacs> Eigenvector number: 69
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.474
Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.538
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.805
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.937
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.222
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.305
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.513
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.616
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.769
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.947
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.025
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.068
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.291
Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.423
Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.590
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.672
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.739
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.977
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.13
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.24
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.36
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.51
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.59
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.65
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.74
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.92
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.33
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.38
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.47
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.69
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.83
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.01
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.05
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.22
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.28
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.35
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.65
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 774 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
1.00002 1.00002 1.00000 1.00001 0.99999
1.00001 1.00001 1.00003 0.99998 1.00001
0.99996 0.99999 0.99999 0.99998 0.99998
1.00001 0.99999 1.00001 1.00000 0.99995
0.99999 0.99998 1.00001 0.99998 1.00001
1.00002 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999
1.00002 1.00000 0.99997 1.00001 1.00000
1.00004 1.00001 1.00001 1.00001 1.00002
0.99998 0.99999 1.00002 0.99999 1.00000
1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999
1.00000 0.99998 0.99998 0.99997 1.00000
0.99996 0.99998 1.00001 1.00001 0.99999
1.00002 1.00001 1.00000 1.00002 1.00001
1.00000 0.99998 1.00000 0.99999 1.00000
0.99999 0.99999 1.00001 0.99997 1.00000
0.99999 1.00000 0.99999 0.99997 1.00000
1.00001 1.00004 0.99998 1.00002 0.99999
0.99998 1.00003 0.99997 1.00000 1.00000
0.99997 1.00003 1.00002 1.00001 1.00000
0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999
1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 1.00003
0.99999
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 7200 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00002 1.00002 1.00000 1.00001 0.99999
1.00001 1.00001 1.00003 0.99998 1.00001
0.99996 0.99999 0.99999 0.99998 0.99998
1.00001 0.99999 1.00001 1.00000 0.99995
0.99999 0.99998 1.00001 0.99998 1.00001
1.00002 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999
1.00002 1.00000 0.99997 1.00001 1.00000
1.00004 1.00001 1.00001 1.00001 1.00002
0.99998 0.99999 1.00002 0.99999 1.00000
1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999
1.00000 0.99998 0.99998 0.99997 1.00000
0.99996 0.99998 1.00001 1.00001 0.99999
1.00002 1.00001 1.00000 1.00002 1.00001
1.00000 0.99998 1.00000 0.99999 1.00000
0.99999 0.99999 1.00001 0.99997 1.00000
0.99999 1.00000 0.99999 0.99997 1.00000
1.00001 1.00004 0.99998 1.00002 0.99999
0.99998 1.00003 0.99997 1.00000 1.00000
0.99997 1.00003 1.00002 1.00001 1.00000
0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999
1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 1.00003
0.99999
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2:-0.000
Vector 3:-0.000-0.000
Vector 4: 0.000 0.000 0.000
Vector 5: 0.000 0.000 0.000-0.000
Vector 6:-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000
Vector 7: 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
Vector 8: 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000
Vector 9:-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000
Vector 10:-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2604261322202455018.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2604261322202455018.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 2604261322202455018.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2604261322202455018.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 400
First residue number = 1
Last residue number = 429
Number of atoms found = 400
Mean number per residue = 1.0
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9969E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9996E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.7494E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.9881E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.0676E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9678E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1720
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2242
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3745
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4118
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4953
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5235
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6011
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7330
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7848
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8405
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9465
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.012
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.265
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.417
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.620
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.710
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.792
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.923
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.002
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.196
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.246
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.365
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.431
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.648
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.759
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.760
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.950
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.242
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.322
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.455
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.559
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.749
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.756
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.913
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.074
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.213
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.369
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.415
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.519
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.682
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.773
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.948
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.090
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.189
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.289
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.444
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.618
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.639
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.914
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.982
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.152
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.444
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.592
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.683
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.823
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.981
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.055
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.336
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.474
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.538
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.805
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.937
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.222
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.305
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.513
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.616
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.769
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.947
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.025
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.068
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.291
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.423
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.590
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.672
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.739
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.977
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.24
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.51
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.65
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.47
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.69
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.83
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.28
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.65
Bfactors> 106 vectors, 1200 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.017494
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= 0.013 for 400 C-alpha atoms.
Bfactors> = 5.755 +/- 37.38
Bfactors> = 19.268 +/- 6.95
Bfactors> Shiftng-fct= 13.513
Bfactors> Scaling-fct= 0.186
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2604261322202455018.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2604261322202455018.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4333E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 14.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 24.25
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 26.75
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 34.28
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 45.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 51.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 66.45
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 69.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 76.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 78.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 84.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 92.97
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 96.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 99.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 105.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 109.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 122.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 129.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 138.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 142.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 145.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 150.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 153.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 160.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 162.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 167.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 169.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 176.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 180.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 180.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 186.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 195.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 197.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 201.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 204.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 210.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 210.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 214.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 219.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 222.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 227.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 228.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 230.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 235.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 237.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 241.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 245.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 247.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 249.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 253.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 257.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 257.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 264.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 265.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 269.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 275.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 278.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 280.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 283.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 286.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 288.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 294.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 296.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 298.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 303.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 305.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 311.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 312.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 316.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 318.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 321.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 324.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 326.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 327.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 331.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 333.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 336.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 337.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 338.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 343.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 345.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 347.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 349.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 352.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 353.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 354.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 355.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 358.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 361.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 365.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 366.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 367.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 371.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 373.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 376.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 376.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 379.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 380.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 381.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 386.2
Chkmod> 106 vectors, 1200 coordinates in file.
Chkmod> That is: 400 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector 11 is: 0.9998 (instead of 1.0000).
%Chkmod-Wn> Norm of vector 15 is: 0.9999 (instead of 1.0000).
%Chkmod-Wn> Norm of vector 20 is: 0.9999 (instead of 1.0000).
%Chkmod-Wn> Norm of vector 33 is: 0.9999 (instead of 1.0000).
%Chkmod-Wn> Norm of vector 36 is: 1.0001 (instead of 1.0000).
%Chkmod-Wn> Norm of vector 56 is: 0.9999 (instead of 1.0000).
%Chkmod-Wn> Norm of vector 57 is: 0.9999 (instead of 1.0000).
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.7941
0.0034 0.7001
0.0034 0.7902
0.0034 0.8067
0.0034 0.7540
0.0034 0.8797
14.3622 0.0142
24.2518 0.0704
26.7476 0.1104
34.2828 0.0802
45.0340 0.0797
51.4155 0.0051
66.4512 0.1705
69.6819 0.1297
76.4207 0.2071
78.5661 0.2080
84.1880 0.2495
92.9670 0.2810
96.1958 0.3004
99.5510 0.2011
105.6421 0.0693
109.2363 0.2304
122.1299 0.0477
129.2592 0.1389
138.2083 0.4070
141.9955 0.3434
145.3602 0.0939
150.5796 0.4375
153.6415 0.5159
160.9136 0.2099
162.7352 0.3062
166.9907 0.0702
169.3047 0.4012
176.6996 0.6076
180.3651 0.4353
180.3978 0.1724
186.5038 0.3839
195.5164 0.1784
197.9140 0.2743
201.8369 0.4468
204.8522 0.2131
210.2492 0.3256
210.4454 0.4386
214.7987 0.5997
219.1730 0.3316
222.8807 0.4721
226.9696 0.4807
228.1613 0.4839
230.8330 0.3986
234.9591 0.2820
237.2315 0.3012
241.5413 0.3370
244.9828 0.4292
247.3537 0.3304
249.7258 0.3807
253.3586 0.3934
257.3757 0.3533
257.8563 0.5619
264.0689 0.4048
265.5827 0.3190
269.3300 0.5715
275.6477 0.3310
278.7952 0.5024
280.7129 0.3390
283.6379 0.5010
286.9032 0.3532
288.4198 0.3336
294.1076 0.4967
296.8610 0.4486
298.1293 0.4036
303.3633 0.2759
305.9179 0.4804
311.3618 0.4664
312.9295 0.3135
316.8239 0.4676
318.7348 0.3309
321.5523 0.4187
324.7995 0.3985
326.2122 0.4467
326.9884 0.5149
330.9847 0.3809
333.3276 0.4087
336.2683 0.5472
337.7029 0.4822
338.8705 0.4076
342.9862 0.3595
345.6061 0.2412
347.4774 0.3040
349.5075 0.3146
352.0286 0.4749
353.3659 0.3614
354.3655 0.4881
355.8597 0.4210
358.8293 0.1945
361.6116 0.3675
365.5035 0.4700
366.3092 0.3812
367.7548 0.5034
371.2649 0.5154
373.4814 0.5346
376.3121 0.4754
376.9382 0.4668
379.5878 0.4352
380.5185 0.4546
381.6015 0.3582
386.2086 0.3984
Project conformational change on normal modes:
Projmod> Version 1.36, April 2003.
Projmod> Projection of a difference vector on a set of eigenvectors.
Getnam> CERFACS file with the eigenvectors ?
Getnam> 2604261322202455018.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2604261322202455018.eigenfacs
Getnam> Pdb file with the reference structure ?
Getnam> 2604261322202455018.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2604261322202455018.atom
Getnam> Pdb file with the other conformer ?
Getnam> 2604261322202455018.atom2
Openam> file on opening on unit 12:
2604261322202455018.atom2
Getrep> Are the masses given in the pdb file ? (y/n)
Getrep> F
Projmod> All masses will all be assumed to be of 1.
Getrep> Displacement along one mode ? (y/n)
Getrep> F
Openam> file on opening on unit 13:
projmod.res
Openam> file on opening on unit 14:
dr.res
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4333E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 14.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 24.25
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 26.75
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 34.28
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 45.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 51.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 66.45
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 69.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 76.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 78.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 84.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 92.97
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 96.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 99.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 105.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 109.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 122.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 129.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 138.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 142.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 145.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 150.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 153.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 160.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 162.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 167.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 169.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 176.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 180.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 180.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 186.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 195.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 197.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 201.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 204.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 210.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 210.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 214.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 219.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 222.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 227.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 228.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 230.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 235.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 237.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 241.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 245.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 247.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 249.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 253.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 257.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 257.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 264.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 265.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 269.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 275.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 278.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 280.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 283.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 286.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 288.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 294.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 296.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 298.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 303.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 305.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 311.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 312.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 316.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 318.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 321.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 324.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 326.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 327.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 331.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 333.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 336.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 337.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 338.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 343.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 345.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 347.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 349.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 352.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 353.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 354.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 355.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 358.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 361.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 365.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 366.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 367.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 371.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 373.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 376.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 376.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 379.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 380.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 381.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 386.2
Projmod> 106 vectors, 1200 coordinates in file.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 400
First residue number = 1
Last residue number = 429
Number of atoms found = 400
Mean number per residue = 1.0
Projmod> Cartesian (eigen)vectors will be studied.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 400
First residue number = 1
Last residue number = 429
Number of atoms found = 400
Mean number per residue = 1.0
Projmod> File dr.res: displacement=f(atom number).
Projmod> 400 atoms are considered.
Projmod> Atomic r.m.s. displacements= 2.32
Projmod> Atomic average masses = 1.00 +/- 0.00
Projmod> File projmod.res: dr.vector=f(fqcy), and cumulative square sum.
Vector: 1 F= 0.00 Cos= 0.038 Sum= 0.001 q= 1.7774
Vector: 2 F= 0.00 Cos= -0.053 Sum= 0.004 q= -2.4849
Vector: 3 F= 0.00 Cos= 0.012 Sum= 0.004 q= 0.5773
Vector: 4 F= 0.00 Cos= 0.087 Sum= 0.012 q= 4.0375
Vector: 5 F= 0.00 Cos= -0.003 Sum= 0.012 q= -0.1201
Vector: 6 F= 0.00 Cos= 0.211 Sum= 0.056 q= 9.7947
Vector: 7 F= 14.36 Cos= 0.210 Sum= 0.100 q= 9.7360
Vector: 8 F= 24.25 Cos= 0.213 Sum= 0.146 q= 9.9052
Vector: 9 F= 26.75 Cos= -0.221 Sum= 0.195 q= -10.2826
Vector: 10 F= 34.28 Cos= 0.111 Sum= 0.207 q= 5.1405
%Projmod-Wn> Eigenvector 11 Norm= 0.9998
Vector: 11 F= 45.03 Cos= -0.077 Sum= 0.213 q= -3.5807
Vector: 12 F= 51.42 Cos= 0.025 Sum= 0.214 q= 1.1642
Vector: 13 F= 66.45 Cos= 0.406 Sum= 0.378 q= 18.8530
Vector: 14 F= 69.68 Cos= 0.338 Sum= 0.493 q= 15.7134
%Projmod-Wn> Eigenvector 15 Norm= 0.9999
Vector: 15 F= 76.42 Cos= 0.276 Sum= 0.569 q= 12.8377
Vector: 16 F= 78.57 Cos= -0.143 Sum= 0.590 q= -6.6628
Vector: 17 F= 84.19 Cos= -0.127 Sum= 0.606 q= -5.9182
Vector: 18 F= 92.97 Cos= 0.015 Sum= 0.606 q= 0.6926
Vector: 19 F= 96.20 Cos= 0.012 Sum= 0.606 q= 0.5381
%Projmod-Wn> Eigenvector 20 Norm= 0.9999
Vector: 20 F= 99.55 Cos= -0.022 Sum= 0.607 q= -1.0109
Vector: 21 F= 105.64 Cos= 0.047 Sum= 0.609 q= 2.2037
Vector: 22 F= 109.24 Cos= -0.038 Sum= 0.610 q= -1.7674
Vector: 23 F= 122.13 Cos= -0.053 Sum= 0.613 q= -2.4676
Vector: 24 F= 129.26 Cos= -0.046 Sum= 0.615 q= -2.1323
Vector: 25 F= 138.21 Cos= -0.187 Sum= 0.650 q= -8.6984
Vector: 26 F= 142.00 Cos= 0.181 Sum= 0.683 q= 8.4040
Vector: 27 F= 145.36 Cos= -0.115 Sum= 0.696 q= -5.3583
Vector: 28 F= 150.58 Cos= 0.030 Sum= 0.697 q= 1.4041
Vector: 29 F= 153.64 Cos= 0.139 Sum= 0.717 q= 6.4689
Vector: 30 F= 160.91 Cos= -0.017 Sum= 0.717 q= -0.7746
Vector: 31 F= 162.74 Cos= -0.076 Sum= 0.723 q= -3.5187
Vector: 32 F= 166.99 Cos= 0.004 Sum= 0.723 q= 0.1827
%Projmod-Wn> Eigenvector 33 Norm= 0.9999
Vector: 33 F= 169.30 Cos= 0.051 Sum= 0.725 q= 2.3596
Vector: 34 F= 176.70 Cos= 0.008 Sum= 0.725 q= 0.3658
Vector: 35 F= 180.37 Cos= -0.016 Sum= 0.726 q= -0.7296
%Projmod-Wn> Eigenvector 36 Norm= 1.0001
Vector: 36 F= 180.40 Cos= 0.042 Sum= 0.727 q= 1.9576
Vector: 37 F= 186.50 Cos= -0.091 Sum= 0.736 q= -4.2259
Vector: 38 F= 195.52 Cos= 0.062 Sum= 0.739 q= 2.8742
Vector: 39 F= 197.91 Cos= 0.070 Sum= 0.744 q= 3.2537
Vector: 40 F= 201.84 Cos= 0.044 Sum= 0.746 q= 2.0504
Vector: 41 F= 204.85 Cos= -0.007 Sum= 0.746 q= -0.3338
Vector: 42 F= 210.25 Cos= 0.035 Sum= 0.748 q= 1.6320
Vector: 43 F= 210.45 Cos= -0.037 Sum= 0.749 q= -1.7026
Vector: 44 F= 214.80 Cos= 0.006 Sum= 0.749 q= 0.2949
Vector: 45 F= 219.17 Cos= -0.017 Sum= 0.749 q= -0.7667
Vector: 46 F= 222.88 Cos= -0.103 Sum= 0.760 q= -4.7910
Vector: 47 F= 226.97 Cos= 0.009 Sum= 0.760 q= 0.4035
Vector: 48 F= 228.16 Cos= -0.009 Sum= 0.760 q= -0.4117
Vector: 49 F= 230.83 Cos= 0.024 Sum= 0.761 q= 1.1174
Vector: 50 F= 234.96 Cos= -0.038 Sum= 0.762 q= -1.7739
Vector: 51 F= 237.23 Cos= 0.049 Sum= 0.764 q= 2.2719
Vector: 52 F= 241.54 Cos= -0.025 Sum= 0.765 q= -1.1417
Vector: 53 F= 244.98 Cos= 0.097 Sum= 0.774 q= 4.4839
Vector: 54 F= 247.35 Cos= 0.066 Sum= 0.779 q= 3.0529
Vector: 55 F= 249.73 Cos= -0.057 Sum= 0.782 q= -2.6530
%Projmod-Wn> Eigenvector 56 Norm= 0.9999
Vector: 56 F= 253.36 Cos= 0.034 Sum= 0.783 q= 1.5613
%Projmod-Wn> Eigenvector 57 Norm= 0.9999
Vector: 57 F= 257.38 Cos= -0.071 Sum= 0.788 q= -3.2883
Vector: 58 F= 257.86 Cos= -0.059 Sum= 0.792 q= -2.7229
Vector: 59 F= 264.07 Cos= -0.034 Sum= 0.793 q= -1.5809
Vector: 60 F= 265.58 Cos= -0.059 Sum= 0.796 q= -2.7378
Vector: 61 F= 269.33 Cos= 0.044 Sum= 0.798 q= 2.0445
Vector: 62 F= 275.65 Cos= -0.003 Sum= 0.798 q= -0.1260
Vector: 63 F= 278.80 Cos= 0.065 Sum= 0.802 q= 2.9974
Vector: 64 F= 280.71 Cos= -0.012 Sum= 0.802 q= -0.5763
Vector: 65 F= 283.64 Cos= 0.040 Sum= 0.804 q= 1.8360
Vector: 66 F= 286.90 Cos= -0.016 Sum= 0.804 q= -0.7263
Vector: 67 F= 288.42 Cos= 0.041 Sum= 0.806 q= 1.9108
Vector: 68 F= 294.11 Cos= 0.001 Sum= 0.806 q= 0.0260
Vector: 69 F= 296.86 Cos= 0.001 Sum= 0.806 q= 0.0251
Vector: 70 F= 298.13 Cos= 0.050 Sum= 0.808 q= 2.3146
Vector: 71 F= 303.36 Cos= -0.015 Sum= 0.809 q= -0.7025
Vector: 72 F= 305.92 Cos= 0.048 Sum= 0.811 q= 2.2300
Vector: 73 F= 311.36 Cos= -0.029 Sum= 0.812 q= -1.3249
Vector: 74 F= 312.93 Cos= 0.033 Sum= 0.813 q= 1.5233
Vector: 75 F= 316.82 Cos= 0.063 Sum= 0.817 q= 2.9073
Vector: 76 F= 318.73 Cos= 0.034 Sum= 0.818 q= 1.5583
Vector: 77 F= 321.55 Cos= 0.019 Sum= 0.818 q= 0.9049
Vector: 78 F= 324.80 Cos= 0.058 Sum= 0.822 q= 2.7170
Vector: 79 F= 326.21 Cos= -0.070 Sum= 0.827 q= -3.2523
Vector: 80 F= 326.99 Cos= 0.017 Sum= 0.827 q= 0.7710
Vector: 81 F= 330.98 Cos= 0.038 Sum= 0.828 q= 1.7694
Vector: 82 F= 333.33 Cos= -0.013 Sum= 0.828 q= -0.6134
Vector: 83 F= 336.27 Cos= 0.016 Sum= 0.829 q= 0.7244
Vector: 84 F= 337.70 Cos= -0.044 Sum= 0.831 q= -2.0536
Vector: 85 F= 338.87 Cos= -0.043 Sum= 0.832 q= -1.9907
Vector: 86 F= 342.99 Cos= 0.039 Sum= 0.834 q= 1.7930
Vector: 87 F= 345.61 Cos= 0.052 Sum= 0.837 q= 2.4368
Vector: 88 F= 347.48 Cos= 0.009 Sum= 0.837 q= 0.4382
Vector: 89 F= 349.51 Cos= 0.013 Sum= 0.837 q= 0.5969
Vector: 90 F= 352.03 Cos= -0.002 Sum= 0.837 q= -0.0918
Vector: 91 F= 353.37 Cos= 0.009 Sum= 0.837 q= 0.4378
Vector: 92 F= 354.37 Cos= 0.040 Sum= 0.839 q= 1.8731
Vector: 93 F= 355.86 Cos= 0.006 Sum= 0.839 q= 0.2852
Vector: 94 F= 358.83 Cos= -0.035 Sum= 0.840 q= -1.6140
Vector: 95 F= 361.61 Cos= -0.033 Sum= 0.841 q= -1.5251
Vector: 96 F= 365.50 Cos= -0.027 Sum= 0.842 q= -1.2655
Vector: 97 F= 366.31 Cos= 0.029 Sum= 0.843 q= 1.3374
Vector: 98 F= 367.75 Cos= -0.025 Sum= 0.843 q= -1.1740
Vector: 99 F= 371.26 Cos= 0.035 Sum= 0.844 q= 1.6198
Vector: 100 F= 373.48 Cos= 0.021 Sum= 0.845 q= 0.9934
Vector: 101 F= 376.31 Cos= 0.012 Sum= 0.845 q= 0.5438
Vector: 102 F= 376.94 Cos= -0.009 Sum= 0.845 q= -0.4116
Vector: 103 F= 379.59 Cos= 0.005 Sum= 0.845 q= 0.2538
Vector: 104 F= 380.52 Cos= -0.013 Sum= 0.845 q= -0.5927
Vector: 105 F= 381.60 Cos= -0.012 Sum= 0.845 q= -0.5547
Vector: 106 F= 386.21 Cos= -0.047 Sum= 0.848 q= -2.1662
Projmod> Best zero-frequency found : 0.003433
Projmod> 6 frequencies less than: 0.003434
Projmod> Lowest non-zero frequency : 14.362208
Projmod> Best overlap with diff.vect. = 0.41 for mode 13 with F= 66.45 cm-1.
Projmod> 1-3-6-9-12-all-best contrb. = 0.165 0.355 0.494 0.606 0.662 0.848
Projmod> Normal end.
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2604261322202455018 7 -20 20 4 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-20
2604261322202455018.eigenfacs
2604261322202455018.atom
calculating perturbed structure for DQ=-16
2604261322202455018.eigenfacs
2604261322202455018.atom
calculating perturbed structure for DQ=-12
2604261322202455018.eigenfacs
2604261322202455018.atom
calculating perturbed structure for DQ=-8
2604261322202455018.eigenfacs
2604261322202455018.atom
calculating perturbed structure for DQ=-4
2604261322202455018.eigenfacs
2604261322202455018.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2604261322202455018.eigenfacs
2604261322202455018.atom
calculating perturbed structure for DQ=4
2604261322202455018.eigenfacs
2604261322202455018.atom
calculating perturbed structure for DQ=8
2604261322202455018.eigenfacs
2604261322202455018.atom
calculating perturbed structure for DQ=12
2604261322202455018.eigenfacs
2604261322202455018.atom
calculating perturbed structure for DQ=16
2604261322202455018.eigenfacs
2604261322202455018.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2604261322202455018.eigenfacs
2604261322202455018.atom
making animated gifs
11 models are in 2604261322202455018.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604261322202455018.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604261322202455018.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=7 DQ=-20 400 2.658 343 1.215
MODEL 2 MODE=7 DQ=-16 400 2.551 343 1.210
MODEL 3 MODE=7 DQ=-12 400 2.457 345 1.236
MODEL 4 MODE=7 DQ=-8 400 2.375 346 1.246
MODEL 5 MODE=7 DQ=-4 400 2.308 351 1.285
MODEL 6 MODE=7 DQ=0 400 2.256 355 1.293
MODEL 7 MODE=7 DQ=4 400 2.222 358 1.289
MODEL 8 MODE=7 DQ=8 400 2.205 361 1.279
MODEL 9 MODE=7 DQ=12 400 2.206 364 1.282
MODEL 10 MODE=7 DQ=16 400 2.225 366 1.271
MODEL 11 MODE=7 DQ=20 400 2.262 366 1.277
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 2604261322202455018 8 -20 20 4 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-20
2604261322202455018.eigenfacs
2604261322202455018.atom
calculating perturbed structure for DQ=-16
2604261322202455018.eigenfacs
2604261322202455018.atom
calculating perturbed structure for DQ=-12
2604261322202455018.eigenfacs
2604261322202455018.atom
calculating perturbed structure for DQ=-8
2604261322202455018.eigenfacs
2604261322202455018.atom
calculating perturbed structure for DQ=-4
2604261322202455018.eigenfacs
2604261322202455018.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2604261322202455018.eigenfacs
2604261322202455018.atom
calculating perturbed structure for DQ=4
2604261322202455018.eigenfacs
2604261322202455018.atom
calculating perturbed structure for DQ=8
2604261322202455018.eigenfacs
2604261322202455018.atom
calculating perturbed structure for DQ=12
2604261322202455018.eigenfacs
2604261322202455018.atom
calculating perturbed structure for DQ=16
2604261322202455018.eigenfacs
2604261322202455018.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2604261322202455018.eigenfacs
2604261322202455018.atom
making animated gifs
11 models are in 2604261322202455018.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604261322202455018.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604261322202455018.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=8 DQ=-20 400 2.662 341 1.194
MODEL 2 MODE=8 DQ=-16 400 2.554 342 1.198
MODEL 3 MODE=8 DQ=-12 400 2.459 344 1.219
MODEL 4 MODE=8 DQ=-8 400 2.377 347 1.256
MODEL 5 MODE=8 DQ=-4 400 2.309 349 1.273
MODEL 6 MODE=8 DQ=0 400 2.256 355 1.293
MODEL 7 MODE=8 DQ=4 400 2.221 360 1.287
MODEL 8 MODE=8 DQ=8 400 2.203 362 1.281
MODEL 9 MODE=8 DQ=12 400 2.203 360 1.270
MODEL 10 MODE=8 DQ=16 400 2.222 360 1.299
MODEL 11 MODE=8 DQ=20 400 2.258 361 1.338
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 2604261322202455018 9 -20 20 4 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-20
2604261322202455018.eigenfacs
2604261322202455018.atom
calculating perturbed structure for DQ=-16
2604261322202455018.eigenfacs
2604261322202455018.atom
calculating perturbed structure for DQ=-12
2604261322202455018.eigenfacs
2604261322202455018.atom
calculating perturbed structure for DQ=-8
2604261322202455018.eigenfacs
2604261322202455018.atom
calculating perturbed structure for DQ=-4
2604261322202455018.eigenfacs
2604261322202455018.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2604261322202455018.eigenfacs
2604261322202455018.atom
calculating perturbed structure for DQ=4
2604261322202455018.eigenfacs
2604261322202455018.atom
calculating perturbed structure for DQ=8
2604261322202455018.eigenfacs
2604261322202455018.atom
calculating perturbed structure for DQ=12
2604261322202455018.eigenfacs
2604261322202455018.atom
calculating perturbed structure for DQ=16
2604261322202455018.eigenfacs
2604261322202455018.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2604261322202455018.eigenfacs
2604261322202455018.atom
making animated gifs
11 models are in 2604261322202455018.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604261322202455018.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604261322202455018.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=9 DQ=-20 400 2.250 361 1.327
MODEL 2 MODE=9 DQ=-16 400 2.215 364 1.314
MODEL 3 MODE=9 DQ=-12 400 2.199 365 1.297
MODEL 4 MODE=9 DQ=-8 400 2.200 364 1.280
MODEL 5 MODE=9 DQ=-4 400 2.219 360 1.285
MODEL 6 MODE=9 DQ=0 400 2.256 355 1.293
MODEL 7 MODE=9 DQ=4 400 2.310 348 1.271
MODEL 8 MODE=9 DQ=8 400 2.380 345 1.262
MODEL 9 MODE=9 DQ=12 400 2.463 342 1.252
MODEL 10 MODE=9 DQ=16 400 2.560 340 1.252
MODEL 11 MODE=9 DQ=20 400 2.668 337 1.232
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 2604261322202455018 10 -20 20 4 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-20
2604261322202455018.eigenfacs
2604261322202455018.atom
calculating perturbed structure for DQ=-16
2604261322202455018.eigenfacs
2604261322202455018.atom
calculating perturbed structure for DQ=-12
2604261322202455018.eigenfacs
2604261322202455018.atom
calculating perturbed structure for DQ=-8
2604261322202455018.eigenfacs
2604261322202455018.atom
calculating perturbed structure for DQ=-4
2604261322202455018.eigenfacs
2604261322202455018.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2604261322202455018.eigenfacs
2604261322202455018.atom
calculating perturbed structure for DQ=4
2604261322202455018.eigenfacs
2604261322202455018.atom
calculating perturbed structure for DQ=8
2604261322202455018.eigenfacs
2604261322202455018.atom
calculating perturbed structure for DQ=12
2604261322202455018.eigenfacs
2604261322202455018.atom
calculating perturbed structure for DQ=16
2604261322202455018.eigenfacs
2604261322202455018.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2604261322202455018.eigenfacs
2604261322202455018.atom
making animated gifs
11 models are in 2604261322202455018.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604261322202455018.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604261322202455018.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=10 DQ=-20 400 2.571 332 1.238
MODEL 2 MODE=10 DQ=-16 400 2.479 335 1.243
MODEL 3 MODE=10 DQ=-12 400 2.400 339 1.269
MODEL 4 MODE=10 DQ=-8 400 2.336 347 1.193
MODEL 5 MODE=10 DQ=-4 400 2.288 353 1.319
MODEL 6 MODE=10 DQ=0 400 2.256 355 1.293
MODEL 7 MODE=10 DQ=4 400 2.242 355 1.289
MODEL 8 MODE=10 DQ=8 400 2.246 354 1.310
MODEL 9 MODE=10 DQ=12 400 2.267 352 1.328
MODEL 10 MODE=10 DQ=16 400 2.306 347 1.300
MODEL 11 MODE=10 DQ=20 400 2.361 344 1.288
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 2604261322202455018 11 -20 20 4 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-20
2604261322202455018.eigenfacs
2604261322202455018.atom
calculating perturbed structure for DQ=-16
2604261322202455018.eigenfacs
2604261322202455018.atom
calculating perturbed structure for DQ=-12
2604261322202455018.eigenfacs
2604261322202455018.atom
calculating perturbed structure for DQ=-8
2604261322202455018.eigenfacs
2604261322202455018.atom
calculating perturbed structure for DQ=-4
2604261322202455018.eigenfacs
2604261322202455018.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2604261322202455018.eigenfacs
2604261322202455018.atom
calculating perturbed structure for DQ=4
2604261322202455018.eigenfacs
2604261322202455018.atom
calculating perturbed structure for DQ=8
2604261322202455018.eigenfacs
2604261322202455018.atom
calculating perturbed structure for DQ=12
2604261322202455018.eigenfacs
2604261322202455018.atom
calculating perturbed structure for DQ=16
2604261322202455018.eigenfacs
2604261322202455018.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2604261322202455018.eigenfacs
2604261322202455018.atom
making animated gifs
11 models are in 2604261322202455018.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604261322202455018.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604261322202455018.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=11 DQ=-20 400 2.394 345 1.278
MODEL 2 MODE=11 DQ=-16 400 2.333 347 1.282
MODEL 3 MODE=11 DQ=-12 400 2.288 351 1.291
MODEL 4 MODE=11 DQ=-8 400 2.260 354 1.292
MODEL 5 MODE=11 DQ=-4 400 2.249 356 1.293
MODEL 6 MODE=11 DQ=0 400 2.256 355 1.293
MODEL 7 MODE=11 DQ=4 400 2.281 351 1.171
MODEL 8 MODE=11 DQ=8 400 2.322 352 1.301
MODEL 9 MODE=11 DQ=12 400 2.380 349 1.298
MODEL 10 MODE=11 DQ=16 400 2.453 346 1.291
MODEL 11 MODE=11 DQ=20 400 2.539 343 1.279
getting mode 12
running: ../../bin/get_modes.sh 2604261322202455018 12 -20 20 4 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 12
calculating perturbed structure for DQ=-20
2604261322202455018.eigenfacs
2604261322202455018.atom
calculating perturbed structure for DQ=-16
2604261322202455018.eigenfacs
2604261322202455018.atom
calculating perturbed structure for DQ=-12
2604261322202455018.eigenfacs
2604261322202455018.atom
calculating perturbed structure for DQ=-8
2604261322202455018.eigenfacs
2604261322202455018.atom
calculating perturbed structure for DQ=-4
2604261322202455018.eigenfacs
2604261322202455018.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2604261322202455018.eigenfacs
2604261322202455018.atom
calculating perturbed structure for DQ=4
2604261322202455018.eigenfacs
2604261322202455018.atom
calculating perturbed structure for DQ=8
2604261322202455018.eigenfacs
2604261322202455018.atom
calculating perturbed structure for DQ=12
2604261322202455018.eigenfacs
2604261322202455018.atom
calculating perturbed structure for DQ=16
2604261322202455018.eigenfacs
2604261322202455018.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2604261322202455018.eigenfacs
2604261322202455018.atom
making animated gifs
11 models are in 2604261322202455018.12.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604261322202455018.12.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604261322202455018.12.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=12 DQ=-20 400 2.491 355 1.272
MODEL 2 MODE=12 DQ=-16 400 2.413 355 1.276
MODEL 3 MODE=12 DQ=-12 400 2.349 355 1.280
MODEL 4 MODE=12 DQ=-8 400 2.301 355 1.284
MODEL 5 MODE=12 DQ=-4 400 2.270 355 1.288
MODEL 6 MODE=12 DQ=0 400 2.256 355 1.293
MODEL 7 MODE=12 DQ=4 400 2.260 355 1.298
MODEL 8 MODE=12 DQ=8 400 2.281 354 1.298
MODEL 9 MODE=12 DQ=12 400 2.320 354 1.304
MODEL 10 MODE=12 DQ=16 400 2.374 354 1.309
MODEL 11 MODE=12 DQ=20 400 2.444 352 1.295
getting mode 13
running: ../../bin/get_modes.sh 2604261322202455018 13 -20 20 4 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 13
calculating perturbed structure for DQ=-20
2604261322202455018.eigenfacs
2604261322202455018.atom
calculating perturbed structure for DQ=-16
2604261322202455018.eigenfacs
2604261322202455018.atom
calculating perturbed structure for DQ=-12
2604261322202455018.eigenfacs
2604261322202455018.atom
calculating perturbed structure for DQ=-8
2604261322202455018.eigenfacs
2604261322202455018.atom
calculating perturbed structure for DQ=-4
2604261322202455018.eigenfacs
2604261322202455018.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2604261322202455018.eigenfacs
2604261322202455018.atom
calculating perturbed structure for DQ=4
2604261322202455018.eigenfacs
2604261322202455018.atom
calculating perturbed structure for DQ=8
2604261322202455018.eigenfacs
2604261322202455018.atom
calculating perturbed structure for DQ=12
2604261322202455018.eigenfacs
2604261322202455018.atom
calculating perturbed structure for DQ=16
2604261322202455018.eigenfacs
2604261322202455018.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2604261322202455018.eigenfacs
2604261322202455018.atom
making animated gifs
11 models are in 2604261322202455018.13.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604261322202455018.13.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604261322202455018.13.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=13 DQ=-20 400 2.824 336 1.238
MODEL 2 MODE=13 DQ=-16 400 2.690 339 1.367
MODEL 3 MODE=13 DQ=-12 400 2.565 344 1.183
MODEL 4 MODE=13 DQ=-8 400 2.450 347 1.171
MODEL 5 MODE=13 DQ=-4 400 2.347 349 1.307
MODEL 6 MODE=13 DQ=0 400 2.256 355 1.293
MODEL 7 MODE=13 DQ=4 400 2.180 355 1.252
MODEL 8 MODE=13 DQ=8 400 2.121 356 1.236
MODEL 9 MODE=13 DQ=12 400 2.078 361 1.266
MODEL 10 MODE=13 DQ=16 400 2.055 360 1.239
MODEL 11 MODE=13 DQ=20 400 2.051 356 1.166
getting mode 14
running: ../../bin/get_modes.sh 2604261322202455018 14 -20 20 4 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 14
calculating perturbed structure for DQ=-20
2604261322202455018.eigenfacs
2604261322202455018.atom
calculating perturbed structure for DQ=-16
2604261322202455018.eigenfacs
2604261322202455018.atom
calculating perturbed structure for DQ=-12
2604261322202455018.eigenfacs
2604261322202455018.atom
calculating perturbed structure for DQ=-8
2604261322202455018.eigenfacs
2604261322202455018.atom
calculating perturbed structure for DQ=-4
2604261322202455018.eigenfacs
2604261322202455018.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2604261322202455018.eigenfacs
2604261322202455018.atom
calculating perturbed structure for DQ=4
2604261322202455018.eigenfacs
2604261322202455018.atom
calculating perturbed structure for DQ=8
2604261322202455018.eigenfacs
2604261322202455018.atom
calculating perturbed structure for DQ=12
2604261322202455018.eigenfacs
2604261322202455018.atom
calculating perturbed structure for DQ=16
2604261322202455018.eigenfacs
2604261322202455018.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2604261322202455018.eigenfacs
2604261322202455018.atom
making animated gifs
11 models are in 2604261322202455018.14.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604261322202455018.14.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604261322202455018.14.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=14 DQ=-20 400 2.768 335 1.194
MODEL 2 MODE=14 DQ=-16 400 2.643 341 1.193
MODEL 3 MODE=14 DQ=-12 400 2.529 343 1.157
MODEL 4 MODE=14 DQ=-8 400 2.425 349 1.335
MODEL 5 MODE=14 DQ=-4 400 2.334 354 1.326
MODEL 6 MODE=14 DQ=0 400 2.256 355 1.293
MODEL 7 MODE=14 DQ=4 400 2.195 353 1.251
MODEL 8 MODE=14 DQ=8 400 2.150 351 1.227
MODEL 9 MODE=14 DQ=12 400 2.123 355 1.260
MODEL 10 MODE=14 DQ=16 400 2.115 355 1.244
MODEL 11 MODE=14 DQ=20 400 2.126 353 1.193
getting mode 15
running: ../../bin/get_modes.sh 2604261322202455018 15 -20 20 4 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 15
calculating perturbed structure for DQ=-20
2604261322202455018.eigenfacs
2604261322202455018.atom
calculating perturbed structure for DQ=-16
2604261322202455018.eigenfacs
2604261322202455018.atom
calculating perturbed structure for DQ=-12
2604261322202455018.eigenfacs
2604261322202455018.atom
calculating perturbed structure for DQ=-8
2604261322202455018.eigenfacs
2604261322202455018.atom
calculating perturbed structure for DQ=-4
2604261322202455018.eigenfacs
2604261322202455018.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2604261322202455018.eigenfacs
2604261322202455018.atom
calculating perturbed structure for DQ=4
2604261322202455018.eigenfacs
2604261322202455018.atom
calculating perturbed structure for DQ=8
2604261322202455018.eigenfacs
2604261322202455018.atom
calculating perturbed structure for DQ=12
2604261322202455018.eigenfacs
2604261322202455018.atom
calculating perturbed structure for DQ=16
2604261322202455018.eigenfacs
2604261322202455018.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2604261322202455018.eigenfacs
2604261322202455018.atom
making animated gifs
11 models are in 2604261322202455018.15.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604261322202455018.15.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604261322202455018.15.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=15 DQ=-20 400 2.715 339 1.249
MODEL 2 MODE=15 DQ=-16 400 2.599 340 1.189
MODEL 3 MODE=15 DQ=-12 400 2.494 343 1.148
MODEL 4 MODE=15 DQ=-8 400 2.401 349 1.150
MODEL 5 MODE=15 DQ=-4 400 2.321 352 1.320
MODEL 6 MODE=15 DQ=0 400 2.256 355 1.293
MODEL 7 MODE=15 DQ=4 400 2.208 354 1.251
MODEL 8 MODE=15 DQ=8 400 2.177 352 1.223
MODEL 9 MODE=15 DQ=12 400 2.164 357 1.262
MODEL 10 MODE=15 DQ=16 400 2.169 356 1.242
MODEL 11 MODE=15 DQ=20 400 2.193 353 1.212
getting mode 16
running: ../../bin/get_modes.sh 2604261322202455018 16 -20 20 4 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 16
calculating perturbed structure for DQ=-20
2604261322202455018.eigenfacs
2604261322202455018.atom
calculating perturbed structure for DQ=-16
2604261322202455018.eigenfacs
2604261322202455018.atom
calculating perturbed structure for DQ=-12
2604261322202455018.eigenfacs
2604261322202455018.atom
calculating perturbed structure for DQ=-8
2604261322202455018.eigenfacs
2604261322202455018.atom
calculating perturbed structure for DQ=-4
2604261322202455018.eigenfacs
2604261322202455018.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2604261322202455018.eigenfacs
2604261322202455018.atom
calculating perturbed structure for DQ=4
2604261322202455018.eigenfacs
2604261322202455018.atom
calculating perturbed structure for DQ=8
2604261322202455018.eigenfacs
2604261322202455018.atom
calculating perturbed structure for DQ=12
2604261322202455018.eigenfacs
2604261322202455018.atom
calculating perturbed structure for DQ=16
2604261322202455018.eigenfacs
2604261322202455018.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2604261322202455018.eigenfacs
2604261322202455018.atom
making animated gifs
11 models are in 2604261322202455018.16.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604261322202455018.16.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604261322202455018.16.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=16 DQ=-20 400 2.329 338 1.231
MODEL 2 MODE=16 DQ=-16 400 2.280 343 1.268
MODEL 3 MODE=16 DQ=-12 400 2.247 347 1.243
MODEL 4 MODE=16 DQ=-8 400 2.232 352 1.313
MODEL 5 MODE=16 DQ=-4 400 2.235 353 1.280
MODEL 6 MODE=16 DQ=0 400 2.256 355 1.293
MODEL 7 MODE=16 DQ=4 400 2.294 355 1.303
MODEL 8 MODE=16 DQ=8 400 2.349 355 1.164
MODEL 9 MODE=16 DQ=12 400 2.419 355 1.208
MODEL 10 MODE=16 DQ=16 400 2.503 349 1.206
MODEL 11 MODE=16 DQ=20 400 2.600 343 1.187
2604261322202455018.10.pdb
2604261322202455018.11.pdb
2604261322202455018.12.pdb
2604261322202455018.13.pdb
2604261322202455018.14.pdb
2604261322202455018.15.pdb
2604261322202455018.16.pdb
2604261322202455018.7.pdb
2604261322202455018.8.pdb
2604261322202455018.9.pdb
STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 0m7.546s
user 0m7.526s
sys 0m0.014s
rm: cannot remove '2604261322202455018.sdijf': No such file or directory
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:
elNémo
is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed
by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Between 2015 and 2025, it was hosted by US2B (Nantes).
Last modification: april 24th, 2026.
|
