*** closed_cutoff10 ***
Output from eigenvector calculation:
STDOUT:
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 2604261326212470324.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 10.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 2604261326212470324.atom to be opened.
Openam> File opened: 2604261326212470324.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 400
First residue number = 1
Last residue number = 429
Number of atoms found = 400
Mean number per residue = 1.0
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 36.626295 +/- 13.150863 From: 3.755000 To: 64.899000
= 41.999208 +/- 10.175481 From: 17.723000 To: 63.824000
= 15.389237 +/- 13.006622 From: -14.439000 To: 38.891000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 4.7069 % Filled.
Pdbmat> 33918 non-zero elements.
Pdbmat> 3502 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 17.51 +/- 5.95
Maximum number = 30
Minimum number = 4
Pdbmat> Matrix trace = 70040.0
Pdbmat> Larger element = 120.863
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
400 non-zero elements, NRBL set to 3
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 2604261326212470324.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 3
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 2604261326212470324.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
2604261326212470324.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 400 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 3 residue(s) per block.
Blocpdb> 400 residues.
Blocpdb> 3 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 3 atoms in block 2
Block first atom: 4
Blocpdb> 3 atoms in block 3
Block first atom: 7
%Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 4 i.e., less than what is required for a rigid body.
%Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 11th, in residue A 11
%Blocpdb-Wn> It will be merged with next block.
Blocpdb> 5 atoms in block 4
Block first atom: 10
Blocpdb> 3 atoms in block 5
Block first atom: 15
Blocpdb> 3 atoms in block 6
Block first atom: 18
Blocpdb> 3 atoms in block 7
Block first atom: 21
Blocpdb> 3 atoms in block 8
Block first atom: 24
%Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 9 i.e., less than what is required for a rigid body.
%Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 28th, in residue A 29
%Blocpdb-Wn> It will be merged with next block.
Blocpdb> 4 atoms in block 9
Block first atom: 27
Blocpdb> 3 atoms in block 10
Block first atom: 31
Blocpdb> 3 atoms in block 11
Block first atom: 34
Blocpdb> 3 atoms in block 12
Block first atom: 37
Blocpdb> 3 atoms in block 13
Block first atom: 40
Blocpdb> 3 atoms in block 14
Block first atom: 43
Blocpdb> 3 atoms in block 15
Block first atom: 46
Blocpdb> 3 atoms in block 16
Block first atom: 49
Blocpdb> 3 atoms in block 17
Block first atom: 52
Blocpdb> 3 atoms in block 18
Block first atom: 55
Blocpdb> 3 atoms in block 19
Block first atom: 58
Blocpdb> 3 atoms in block 20
Block first atom: 61
Blocpdb> 3 atoms in block 21
Block first atom: 64
Blocpdb> 3 atoms in block 22
Block first atom: 67
Blocpdb> 3 atoms in block 23
Block first atom: 70
Blocpdb> 3 atoms in block 24
Block first atom: 73
%Blocpdb-Wn> 1 atoms in block 25 i.e., less than what is required for a rigid body.
%Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 76th, in residue A 80
%Blocpdb-Wn> It will be merged with next block.
%Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 25 i.e., less than what is required for a rigid body.
%Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 77th, in residue A 82
%Blocpdb-Wn> It will be merged with next block.
Blocpdb> 3 atoms in block 25
Block first atom: 76
Blocpdb> 3 atoms in block 26
Block first atom: 79
Blocpdb> 3 atoms in block 27
Block first atom: 82
Blocpdb> 3 atoms in block 28
Block first atom: 85
Blocpdb> 3 atoms in block 29
Block first atom: 88
Blocpdb> 3 atoms in block 30
Block first atom: 91
Blocpdb> 3 atoms in block 31
Block first atom: 94
Blocpdb> 3 atoms in block 32
Block first atom: 97
%Blocpdb-Wn> 1 atoms in block 33 i.e., less than what is required for a rigid body.
%Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 100th, in residue A 109
%Blocpdb-Wn> It will be merged with next block.
Blocpdb> 4 atoms in block 33
Block first atom: 100
Blocpdb> 3 atoms in block 34
Block first atom: 104
Blocpdb> 3 atoms in block 35
Block first atom: 107
Blocpdb> 3 atoms in block 36
Block first atom: 110
Blocpdb> 3 atoms in block 37
Block first atom: 113
Blocpdb> 3 atoms in block 38
Block first atom: 116
Blocpdb> 3 atoms in block 39
Block first atom: 119
Blocpdb> 3 atoms in block 40
Block first atom: 122
Blocpdb> 3 atoms in block 41
Block first atom: 125
Blocpdb> 3 atoms in block 42
Block first atom: 128
Blocpdb> 3 atoms in block 43
Block first atom: 131
Blocpdb> 3 atoms in block 44
Block first atom: 134
Blocpdb> 3 atoms in block 45
Block first atom: 137
Blocpdb> 3 atoms in block 46
Block first atom: 140
Blocpdb> 3 atoms in block 47
Block first atom: 143
Blocpdb> 3 atoms in block 48
Block first atom: 146
Blocpdb> 3 atoms in block 49
Block first atom: 149
%Blocpdb-Wn> 1 atoms in block 50 i.e., less than what is required for a rigid body.
%Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 152th, in residue A 162
%Blocpdb-Wn> It will be merged with next block.
Blocpdb> 4 atoms in block 50
Block first atom: 152
Blocpdb> 3 atoms in block 51
Block first atom: 156
Blocpdb> 3 atoms in block 52
Block first atom: 159
Blocpdb> 3 atoms in block 53
Block first atom: 162
Blocpdb> 3 atoms in block 54
Block first atom: 165
Blocpdb> 3 atoms in block 55
Block first atom: 168
Blocpdb> 3 atoms in block 56
Block first atom: 171
Blocpdb> 3 atoms in block 57
Block first atom: 174
Blocpdb> 3 atoms in block 58
Block first atom: 177
Blocpdb> 3 atoms in block 59
Block first atom: 180
Blocpdb> 3 atoms in block 60
Block first atom: 183
Blocpdb> 3 atoms in block 61
Block first atom: 186
Blocpdb> 3 atoms in block 62
Block first atom: 189
Blocpdb> 3 atoms in block 63
Block first atom: 192
Blocpdb> 3 atoms in block 64
Block first atom: 195
Blocpdb> 3 atoms in block 65
Block first atom: 198
Blocpdb> 3 atoms in block 66
Block first atom: 201
Blocpdb> 3 atoms in block 67
Block first atom: 204
%Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 68 i.e., less than what is required for a rigid body.
%Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 208th, in residue A 221
%Blocpdb-Wn> It will be merged with next block.
Blocpdb> 5 atoms in block 68
Block first atom: 207
Blocpdb> 3 atoms in block 69
Block first atom: 212
Blocpdb> 3 atoms in block 70
Block first atom: 215
Blocpdb> 3 atoms in block 71
Block first atom: 218
Blocpdb> 3 atoms in block 72
Block first atom: 221
Blocpdb> 3 atoms in block 73
Block first atom: 224
Blocpdb> 3 atoms in block 74
Block first atom: 227
Blocpdb> 3 atoms in block 75
Block first atom: 230
Blocpdb> 3 atoms in block 76
Block first atom: 233
Blocpdb> 3 atoms in block 77
Block first atom: 236
Blocpdb> 3 atoms in block 78
Block first atom: 239
Blocpdb> 3 atoms in block 79
Block first atom: 242
Blocpdb> 3 atoms in block 80
Block first atom: 245
Blocpdb> 3 atoms in block 81
Block first atom: 248
Blocpdb> 3 atoms in block 82
Block first atom: 251
Blocpdb> 3 atoms in block 83
Block first atom: 254
Blocpdb> 3 atoms in block 84
Block first atom: 257
Blocpdb> 3 atoms in block 85
Block first atom: 260
Blocpdb> 3 atoms in block 86
Block first atom: 263
Blocpdb> 3 atoms in block 87
Block first atom: 266
%Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 88 i.e., less than what is required for a rigid body.
%Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 270th, in residue A 285
%Blocpdb-Wn> It will be merged with next block.
Blocpdb> 5 atoms in block 88
Block first atom: 269
%Blocpdb-Wn> 1 atoms in block 89 i.e., less than what is required for a rigid body.
%Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 274th, in residue A 290
%Blocpdb-Wn> It will be merged with next block.
%Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 89 i.e., less than what is required for a rigid body.
%Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 275th, in residue A 298
%Blocpdb-Wn> It will be merged with next block.
Blocpdb> 5 atoms in block 89
Block first atom: 274
Blocpdb> 3 atoms in block 90
Block first atom: 279
Blocpdb> 3 atoms in block 91
Block first atom: 282
Blocpdb> 3 atoms in block 92
Block first atom: 285
Blocpdb> 3 atoms in block 93
Block first atom: 288
Blocpdb> 3 atoms in block 94
Block first atom: 291
Blocpdb> 3 atoms in block 95
Block first atom: 294
Blocpdb> 3 atoms in block 96
Block first atom: 297
Blocpdb> 3 atoms in block 97
Block first atom: 300
Blocpdb> 3 atoms in block 98
Block first atom: 303
Blocpdb> 3 atoms in block 99
Block first atom: 306
Blocpdb> 3 atoms in block 100
Block first atom: 309
Blocpdb> 3 atoms in block 101
Block first atom: 312
Blocpdb> 3 atoms in block 102
Block first atom: 315
Blocpdb> 3 atoms in block 103
Block first atom: 318
Blocpdb> 3 atoms in block 104
Block first atom: 321
Blocpdb> 3 atoms in block 105
Block first atom: 324
Blocpdb> 3 atoms in block 106
Block first atom: 327
Blocpdb> 3 atoms in block 107
Block first atom: 330
Blocpdb> 3 atoms in block 108
Block first atom: 333
Blocpdb> 3 atoms in block 109
Block first atom: 336
%Blocpdb-Wn> 1 atoms in block 110 i.e., less than what is required for a rigid body.
%Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 339th, in residue A 365
%Blocpdb-Wn> It will be merged with next block.
%Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 110 i.e., less than what is required for a rigid body.
%Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 340th, in residue A 367
%Blocpdb-Wn> It will be merged with next block.
Blocpdb> 5 atoms in block 110
Block first atom: 339
Blocpdb> 3 atoms in block 111
Block first atom: 344
Blocpdb> 3 atoms in block 112
Block first atom: 347
Blocpdb> 3 atoms in block 113
Block first atom: 350
Blocpdb> 3 atoms in block 114
Block first atom: 353
Blocpdb> 3 atoms in block 115
Block first atom: 356
Blocpdb> 3 atoms in block 116
Block first atom: 359
Blocpdb> 3 atoms in block 117
Block first atom: 362
Blocpdb> 3 atoms in block 118
Block first atom: 365
Blocpdb> 3 atoms in block 119
Block first atom: 368
Blocpdb> 3 atoms in block 120
Block first atom: 371
Blocpdb> 3 atoms in block 121
Block first atom: 374
Blocpdb> 3 atoms in block 122
Block first atom: 377
Blocpdb> 3 atoms in block 123
Block first atom: 380
Blocpdb> 3 atoms in block 124
Block first atom: 383
Blocpdb> 3 atoms in block 125
Block first atom: 386
Blocpdb> 3 atoms in block 126
Block first atom: 389
Blocpdb> 3 atoms in block 127
Block first atom: 392
Blocpdb> 3 atoms in block 128
Block first atom: 395
Blocpdb> 3 atoms in block 129
Block first atom: 397
Blocpdb> 129 blocks.
Blocpdb> At most, 5 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 3 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 34047 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 1200
Prepmat> Matrix trace = 70040.0000
Prepmat> Last element read: 1200 1200 19.9249
Prepmat> 8386 lines saved.
Prepmat> 7472 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 400
RTB> Total mass = 400.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 400
RTB> Number of blocks = 129
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 42004.8635
RTB> 30933 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 774
Diagstd> Nb of non-zero elements: 30933
Diagstd> Projected matrix trace = 42004.8635
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 774 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 42004.8635
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.0141809 0.0626532 0.0834675 0.2401433
0.2537622 0.3890823 0.4722595 0.4962154 0.5608414
0.6346161 0.6965291 0.9217445 0.9597109 1.0380691
1.1626906 1.2956535 1.4739019 1.5913727 1.8029531
2.0100502 2.1547640 2.1752568 2.2128401 2.3292892
2.4859275 2.6680456 2.7133741 3.0564192 3.1607570
3.2854446 3.4116715 3.5245719 3.6507538 3.7849583
3.9417461 4.0202504 4.1069251 4.2598624 4.3973174
4.6108704 4.7434748 4.9496642 5.1161729 5.2753305
5.4185176 5.5183205 5.7126551 5.8482459 6.0181712
6.2089350 6.2574702 6.3604395 6.5464533 6.6772270
6.8138450 6.9789863 7.0451574 7.1896031 7.3591052
7.4098988 7.5396342 7.6142198 7.8049490 7.9085593
8.2533125 8.3485740 8.4722413 8.5965214 8.7447159
9.0254652 9.1441261 9.2272951 9.2994537 9.4492459
9.5073412 9.6292198 9.9593430 10.0707495 10.1319864
10.4382853 10.5718633 10.6139998 10.8074809 10.9798014
11.0023899 11.2910344 11.4346651 11.5359718 11.6788208
11.8828752 12.0075255 12.0329961 12.1906572 12.4763973
12.5425529 12.6407368 12.7558919 12.9403733 12.9922228
13.1601420
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034335 0.0034338 0.0034339 0.0034340 0.0034341
0.0034342 12.9314664 27.1810863 31.3728453 53.2145647
54.7027024 67.7354498 74.6252221 76.4945320 81.3233590
86.5069132 90.6285279 104.2558821 106.3813479 110.6390422
117.0920360 123.6060460 131.8346477 136.9875919 145.8100636
153.9567490 159.4025037 160.1587043 161.5363629 165.7322350
171.2140927 177.3747945 178.8751933 189.8461272 193.0593491
196.8304805 200.5759609 203.8677214 207.4849274 211.2641605
215.5954575 217.7317848 220.0663666 224.1264257 227.7137154
233.1775505 236.5067721 241.5923338 245.6223532 249.4135928
252.7758179 255.0931175 259.5459657 262.6080858 266.3959081
270.5850754 271.6405961 273.8664565 277.8422684 280.6036732
283.4597540 286.8741735 288.2309613 291.1707453 294.5830717
295.5979505 298.1744441 299.6456562 303.3753668 305.3823756
311.9675518 313.7627849 316.0781231 318.3879732 321.1205747
326.2346432 328.3722015 329.8621491 331.1494197 333.8057817
334.8303524 336.9696837 342.6972537 344.6086527 345.6547891
350.8406129 353.0783182 353.7812542 356.9912060 359.8259847
360.1959250 364.8901542 367.2036631 368.8267170 371.1032665
374.3312193 376.2894478 376.6883321 379.1480621 383.5658010
384.5813780 386.0837076 387.8383009 390.6327789 391.4145896
393.9359074
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 400
Rtb_to_modes> Number of blocs = 129
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9970E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9990E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.959
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.98
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.29
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.88
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.01
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.19
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.48
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.54
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.64
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.76
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.94
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.99
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.16
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 774 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
1.00000 1.00000 0.99998 0.99999 0.99999
1.00000 1.00003 1.00000 1.00001 0.99999
1.00003 1.00002 1.00003 0.99998 0.99999
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0.99998 0.99999 1.00001 1.00002 1.00000
0.99997 0.99998 1.00003 0.99998 1.00003
1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 1.00001
1.00002 0.99999 0.99998 1.00001 0.99999
1.00001 1.00002 1.00000 1.00000 0.99998
1.00000 0.99998 1.00000 1.00000 0.99997
1.00000 1.00002 1.00003 0.99996 0.99996
1.00001 1.00000 1.00000 0.99997 1.00001
1.00001 1.00000 1.00001 0.99996 0.99999
0.99999 1.00002 1.00002 1.00002 1.00003
1.00000 1.00002 1.00001 1.00000 1.00001
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1.00003 0.99999 1.00003 1.00000 0.99999
0.99998 1.00002 0.99999 1.00001 1.00000
1.00000 0.99998 1.00001 1.00002 0.99997
0.99998 1.00002 1.00000 0.99999 0.99998
1.00000 0.99997 0.99999 0.99998 1.00000
1.00000
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 7200 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00000 1.00000 0.99998 0.99999 0.99999
1.00000 1.00003 1.00000 1.00001 0.99999
1.00003 1.00002 1.00003 0.99998 0.99999
0.99998 1.00000 1.00002 1.00000 0.99999
0.99998 0.99999 1.00001 1.00002 1.00000
0.99997 0.99998 1.00003 0.99998 1.00003
1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 1.00001
1.00002 0.99999 0.99998 1.00001 0.99999
1.00001 1.00002 1.00000 1.00000 0.99998
1.00000 0.99998 1.00000 1.00000 0.99997
1.00000 1.00002 1.00003 0.99996 0.99996
1.00001 1.00000 1.00000 0.99997 1.00001
1.00001 1.00000 1.00001 0.99996 0.99999
0.99999 1.00002 1.00002 1.00002 1.00003
1.00000 1.00002 1.00001 1.00000 1.00001
0.99999 0.99998 1.00000 0.99999 0.99999
1.00003 0.99999 1.00003 1.00000 0.99999
0.99998 1.00002 0.99999 1.00001 1.00000
1.00000 0.99998 1.00001 1.00002 0.99997
0.99998 1.00002 1.00000 0.99999 0.99998
1.00000 0.99997 0.99999 0.99998 1.00000
1.00000
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2:-0.000
Vector 3: 0.000 0.000
Vector 4:-0.000 0.000-0.000
Vector 5: 0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 6: 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000
Vector 7: 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000
Vector 8:-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000
Vector 9:-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000
Vector 10:-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2604261326212470324.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2604261326212470324.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 2604261326212470324.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2604261326212470324.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 400
First residue number = 1
Last residue number = 429
Number of atoms found = 400
Mean number per residue = 1.0
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9970E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9990E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9998E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.4181E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.2653E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.3467E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2401
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2538
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3891
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4723
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4962
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6965
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.155
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.175
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.213
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.329
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.486
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.668
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.713
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.056
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.161
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.285
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.412
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.525
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.651
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.785
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.942
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.020
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.107
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.260
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.397
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.611
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.743
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.950
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.116
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.275
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.419
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.518
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.713
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.848
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.018
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.209
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.00
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.54
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.76
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.99
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.16
Bfactors> 106 vectors, 1200 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.014181
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= 0.032 for 400 C-alpha atoms.
Bfactors> = 5.389 +/- 41.83
Bfactors> = 10.425 +/- 8.04
Bfactors> Shiftng-fct= 5.036
Bfactors> Scaling-fct= 0.192
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2604261326212470324.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2604261326212470324.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4333E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 12.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 27.18
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 31.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 53.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 54.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 67.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 74.63
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 76.49
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 81.32
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 86.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 90.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 104.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 106.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 110.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 117.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 123.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 131.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 137.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 145.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 153.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 159.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 161.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 165.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 178.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 189.8
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 200.6
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 203.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 207.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 211.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 215.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 217.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 220.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 224.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 227.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 233.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 236.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 241.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 245.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 249.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 252.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 255.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 259.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 262.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 266.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 270.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 271.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 273.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 277.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 280.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 283.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 286.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 288.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 291.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 294.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 295.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 298.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 299.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 303.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 305.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 311.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 313.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 316.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 318.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 321.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 326.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 328.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 329.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 331.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 333.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 334.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 337.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 342.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 344.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 345.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 350.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 353.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 353.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 357.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 359.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 360.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 364.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 367.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 368.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 371.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 374.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 376.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 376.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 379.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 383.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 384.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 386.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 387.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 390.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 391.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 393.9
Chkmod> 106 vectors, 1200 coordinates in file.
Chkmod> That is: 400 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector 83 is: 1.0001 (instead of 1.0000).
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.6762
0.0034 0.7422
0.0034 0.8225
0.0034 0.7562
0.0034 0.8219
0.0034 0.9064
12.9309 0.0088
27.1799 0.1356
31.3714 0.0522
53.2075 0.0304
54.7044 0.1108
67.7341 0.0146
74.6252 0.0960
76.4901 0.0719
81.3169 0.0998
86.5021 0.2968
90.6227 0.2778
104.2489 0.2010
106.3762 0.1647
110.6306 0.3224
117.1026 0.1176
123.6173 0.1473
131.8334 0.1969
136.9657 0.3796
145.8057 0.3746
153.9482 0.1970
159.4044 0.1644
160.1424 0.1916
161.5353 0.4078
165.7148 0.3428
171.2092 0.4330
177.3657 0.3787
178.8552 0.3934
189.8250 0.3657
193.0585 0.4373
196.8087 0.2301
200.5770 0.5514
203.8713 0.5849
207.4830 0.2315
211.2563 0.4233
215.5931 0.3809
217.7157 0.5640
220.0589 0.2719
224.1204 0.2818
227.6957 0.3570
233.1708 0.3585
236.4848 0.3754
241.5902 0.6084
245.6077 0.5298
249.3951 0.4767
252.7762 0.4234
255.0748 0.4045
259.5427 0.4029
262.5913 0.3820
266.3807 0.3800
270.5749 0.5881
271.6187 0.3243
273.8452 0.4402
277.8207 0.2617
280.5869 0.2732
283.4508 0.1850
286.8621 0.4328
288.2154 0.3189
291.1663 0.2577
294.5683 0.3924
295.5873 0.1785
298.1689 0.1987
299.6285 0.4668
303.3633 0.3789
305.3778 0.3112
311.9483 0.3771
313.7573 0.4289
316.0601 0.2103
318.3832 0.4487
321.1120 0.4599
326.2122 0.3553
328.3558 0.4264
329.8427 0.4054
331.1271 0.4753
333.7871 0.2725
334.8100 0.2719
336.9514 0.4529
342.6766 0.4603
344.5810 0.5506
345.6061 0.4534
350.8544 0.5821
353.0320 0.3469
353.6994 0.5679
357.0175 0.2154
359.8138 0.1200
360.1413 0.3419
364.8578 0.4579
367.1130 0.4970
368.8753 0.5122
371.1061 0.4592
374.2699 0.4791
376.3121 0.4525
376.6253 0.2329
379.1216 0.3964
383.6047 0.3643
384.5257 0.5593
386.0559 0.4320
387.8841 0.5003
390.6104 0.4743
391.3643 0.2736
393.9169 0.4190
Project conformational change on normal modes:
Projmod> Version 1.36, April 2003.
Projmod> Projection of a difference vector on a set of eigenvectors.
Getnam> CERFACS file with the eigenvectors ?
Getnam> 2604261326212470324.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2604261326212470324.eigenfacs
Getnam> Pdb file with the reference structure ?
Getnam> 2604261326212470324.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2604261326212470324.atom
Getnam> Pdb file with the other conformer ?
Getnam> 2604261326212470324.atom2
Openam> file on opening on unit 12:
2604261326212470324.atom2
Getrep> Are the masses given in the pdb file ? (y/n)
Getrep> F
Projmod> All masses will all be assumed to be of 1.
Getrep> Displacement along one mode ? (y/n)
Getrep> F
Openam> file on opening on unit 13:
projmod.res
Openam> file on opening on unit 14:
dr.res
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4333E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 12.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 27.18
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 31.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 53.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 54.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 67.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 245.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 249.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 252.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 255.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 259.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 270.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 271.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 273.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 277.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 280.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 283.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 286.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 288.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 291.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 294.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 295.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 298.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 299.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 303.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 305.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 311.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 313.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 316.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 318.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 321.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 326.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 328.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 329.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 331.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 333.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 334.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 337.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 342.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 344.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 345.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 350.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 353.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 353.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 357.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 359.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 360.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 364.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 367.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 368.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 371.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 374.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 376.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 376.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 379.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 383.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 384.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 386.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 387.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 390.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 391.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 393.9
Projmod> 106 vectors, 1200 coordinates in file.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 400
First residue number = 1
Last residue number = 429
Number of atoms found = 400
Mean number per residue = 1.0
Projmod> Cartesian (eigen)vectors will be studied.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 400
First residue number = 1
Last residue number = 429
Number of atoms found = 400
Mean number per residue = 1.0
Projmod> File dr.res: displacement=f(atom number).
Projmod> 400 atoms are considered.
Projmod> Atomic r.m.s. displacements= 2.32
Projmod> Atomic average masses = 1.00 +/- 0.00
Projmod> File projmod.res: dr.vector=f(fqcy), and cumulative square sum.
Vector: 1 F= 0.00 Cos= -0.172 Sum= 0.030 q= -7.9850
Vector: 2 F= 0.00 Cos= 0.014 Sum= 0.030 q= 0.6669
Vector: 3 F= 0.00 Cos= -0.027 Sum= 0.030 q= -1.2547
Vector: 4 F= 0.00 Cos= -0.003 Sum= 0.030 q= -0.1328
Vector: 5 F= 0.00 Cos= -0.016 Sum= 0.031 q= -0.7540
Vector: 6 F= 0.00 Cos= 0.161 Sum= 0.057 q= 7.4816
Vector: 7 F= 12.93 Cos= 0.063 Sum= 0.061 q= 2.9049
Vector: 8 F= 27.18 Cos= 0.235 Sum= 0.116 q= 10.9191
Vector: 9 F= 31.37 Cos= -0.018 Sum= 0.116 q= -0.8298
Vector: 10 F= 53.21 Cos= -0.126 Sum= 0.132 q= -5.8383
Vector: 11 F= 54.70 Cos= -0.042 Sum= 0.134 q= -1.9419
Vector: 12 F= 67.73 Cos= 0.237 Sum= 0.190 q= 10.9894
Vector: 13 F= 74.63 Cos= -0.162 Sum= 0.216 q= -7.5180
Vector: 14 F= 76.49 Cos= 0.013 Sum= 0.216 q= 0.5884
Vector: 15 F= 81.32 Cos= -0.098 Sum= 0.225 q= -4.5317
Vector: 16 F= 86.50 Cos= 0.495 Sum= 0.471 q= 23.0211
Vector: 17 F= 90.62 Cos= 0.174 Sum= 0.501 q= 8.0645
Vector: 18 F= 104.25 Cos= -0.061 Sum= 0.505 q= -2.8142
Vector: 19 F= 106.38 Cos= -0.068 Sum= 0.509 q= -3.1524
Vector: 20 F= 110.63 Cos= 0.098 Sum= 0.519 q= 4.5559
Vector: 21 F= 117.10 Cos= 0.039 Sum= 0.521 q= 1.7987
Vector: 22 F= 123.62 Cos= -0.051 Sum= 0.523 q= -2.3707
Vector: 23 F= 131.83 Cos= -0.072 Sum= 0.528 q= -3.3545
Vector: 24 F= 136.97 Cos= 0.070 Sum= 0.533 q= 3.2622
Vector: 25 F= 145.81 Cos= -0.082 Sum= 0.540 q= -3.8109
Vector: 26 F= 153.95 Cos= 0.066 Sum= 0.544 q= 3.0734
Vector: 27 F= 159.40 Cos= 0.091 Sum= 0.553 q= 4.2295
Vector: 28 F= 160.14 Cos= 0.067 Sum= 0.557 q= 3.1107
Vector: 29 F= 161.54 Cos= -0.079 Sum= 0.563 q= -3.6808
Vector: 30 F= 165.71 Cos= -0.124 Sum= 0.579 q= -5.7763
Vector: 31 F= 171.21 Cos= 0.047 Sum= 0.581 q= 2.1606
Vector: 32 F= 177.37 Cos= 0.033 Sum= 0.582 q= 1.5515
Vector: 33 F= 178.86 Cos= 0.059 Sum= 0.586 q= 2.7313
Vector: 34 F= 189.82 Cos= 0.064 Sum= 0.590 q= 2.9723
Vector: 35 F= 193.06 Cos= -0.035 Sum= 0.591 q= -1.6088
Vector: 36 F= 196.81 Cos= 0.012 Sum= 0.591 q= 0.5619
Vector: 37 F= 200.58 Cos= -0.128 Sum= 0.607 q= -5.9596
Vector: 38 F= 203.87 Cos= -0.010 Sum= 0.608 q= -0.4699
Vector: 39 F= 207.48 Cos= 0.077 Sum= 0.613 q= 3.5651
Vector: 40 F= 211.26 Cos= -0.053 Sum= 0.616 q= -2.4498
Vector: 41 F= 215.59 Cos= 0.004 Sum= 0.616 q= 0.1642
Vector: 42 F= 217.72 Cos= -0.005 Sum= 0.616 q= -0.2422
Vector: 43 F= 220.06 Cos= 0.041 Sum= 0.618 q= 1.8847
Vector: 44 F= 224.12 Cos= -0.052 Sum= 0.621 q= -2.4071
Vector: 45 F= 227.70 Cos= 0.049 Sum= 0.623 q= 2.2646
Vector: 46 F= 233.17 Cos= -0.017 Sum= 0.623 q= -0.8011
Vector: 47 F= 236.48 Cos= 0.136 Sum= 0.642 q= 6.3095
Vector: 48 F= 241.59 Cos= -0.106 Sum= 0.653 q= -4.9256
Vector: 49 F= 245.61 Cos= 0.029 Sum= 0.654 q= 1.3511
Vector: 50 F= 249.40 Cos= -0.200 Sum= 0.694 q= -9.2906
Vector: 51 F= 252.78 Cos= 0.057 Sum= 0.697 q= 2.6341
Vector: 52 F= 255.07 Cos= -0.041 Sum= 0.699 q= -1.9080
Vector: 53 F= 259.54 Cos= -0.008 Sum= 0.699 q= -0.3761
Vector: 54 F= 262.59 Cos= 0.087 Sum= 0.706 q= 4.0522
Vector: 55 F= 266.38 Cos= 0.104 Sum= 0.717 q= 4.8184
Vector: 56 F= 270.57 Cos= -0.057 Sum= 0.720 q= -2.6405
Vector: 57 F= 271.62 Cos= 0.082 Sum= 0.727 q= 3.8083
Vector: 58 F= 273.85 Cos= -0.001 Sum= 0.727 q= -0.0615
Vector: 59 F= 277.82 Cos= 0.082 Sum= 0.734 q= 3.8246
Vector: 60 F= 280.59 Cos= 0.007 Sum= 0.734 q= 0.3381
Vector: 61 F= 283.45 Cos= 0.049 Sum= 0.736 q= 2.2562
Vector: 62 F= 286.86 Cos= 0.068 Sum= 0.741 q= 3.1567
Vector: 63 F= 288.22 Cos= 0.152 Sum= 0.764 q= 7.0449
Vector: 64 F= 291.17 Cos= 0.004 Sum= 0.764 q= 0.2005
Vector: 65 F= 294.57 Cos= -0.011 Sum= 0.764 q= -0.5294
Vector: 66 F= 295.59 Cos= -0.048 Sum= 0.766 q= -2.2262
Vector: 67 F= 298.17 Cos= 0.058 Sum= 0.770 q= 2.6878
Vector: 68 F= 299.63 Cos= -0.013 Sum= 0.770 q= -0.5836
Vector: 69 F= 303.36 Cos= -0.011 Sum= 0.770 q= -0.4963
Vector: 70 F= 305.38 Cos= 0.058 Sum= 0.773 q= 2.7169
Vector: 71 F= 311.95 Cos= -0.012 Sum= 0.774 q= -0.5555
Vector: 72 F= 313.76 Cos= -0.005 Sum= 0.774 q= -0.2227
Vector: 73 F= 316.06 Cos= -0.083 Sum= 0.780 q= -3.8485
Vector: 74 F= 318.38 Cos= -0.037 Sum= 0.782 q= -1.7345
Vector: 75 F= 321.11 Cos= 0.008 Sum= 0.782 q= 0.3499
Vector: 76 F= 326.21 Cos= -0.008 Sum= 0.782 q= -0.3894
Vector: 77 F= 328.36 Cos= 0.046 Sum= 0.784 q= 2.1562
Vector: 78 F= 329.84 Cos= -0.003 Sum= 0.784 q= -0.1618
Vector: 79 F= 331.13 Cos= -0.015 Sum= 0.784 q= -0.7080
Vector: 80 F= 333.79 Cos= 0.007 Sum= 0.784 q= 0.3173
Vector: 81 F= 334.81 Cos= 0.060 Sum= 0.788 q= 2.7658
Vector: 82 F= 336.95 Cos= 0.057 Sum= 0.791 q= 2.6290
%Projmod-Wn> Eigenvector 83 Norm= 1.0001
Vector: 83 F= 342.68 Cos= -0.003 Sum= 0.791 q= -0.1508
Vector: 84 F= 344.58 Cos= 0.052 Sum= 0.794 q= 2.3992
Vector: 85 F= 345.61 Cos= -0.013 Sum= 0.794 q= -0.6223
Vector: 86 F= 350.85 Cos= 0.054 Sum= 0.797 q= 2.4901
Vector: 87 F= 353.03 Cos= -0.013 Sum= 0.797 q= -0.6067
Vector: 88 F= 353.70 Cos= -0.009 Sum= 0.797 q= -0.4243
Vector: 89 F= 357.02 Cos= -0.011 Sum= 0.797 q= -0.5160
Vector: 90 F= 359.81 Cos= 0.030 Sum= 0.798 q= 1.3803
Vector: 91 F= 360.14 Cos= 0.002 Sum= 0.798 q= 0.0779
Vector: 92 F= 364.86 Cos= 0.085 Sum= 0.805 q= 3.9484
Vector: 93 F= 367.11 Cos= -0.007 Sum= 0.805 q= -0.3093
Vector: 94 F= 368.88 Cos= -0.029 Sum= 0.806 q= -1.3623
Vector: 95 F= 371.11 Cos= 0.064 Sum= 0.810 q= 2.9930
Vector: 96 F= 374.27 Cos= -0.004 Sum= 0.810 q= -0.1786
Vector: 97 F= 376.31 Cos= 0.000 Sum= 0.810 q= 0.0105
Vector: 98 F= 376.63 Cos= 0.037 Sum= 0.812 q= 1.7367
Vector: 99 F= 379.12 Cos= 0.025 Sum= 0.812 q= 1.1613
Vector: 100 F= 383.60 Cos= -0.017 Sum= 0.813 q= -0.7846
Vector: 101 F= 384.53 Cos= 0.048 Sum= 0.815 q= 2.2297
Vector: 102 F= 386.06 Cos= -0.013 Sum= 0.815 q= -0.5877
Vector: 103 F= 387.88 Cos= -0.018 Sum= 0.815 q= -0.8173
Vector: 104 F= 390.61 Cos= 0.000 Sum= 0.815 q= 0.0186
Vector: 105 F= 391.36 Cos= -0.035 Sum= 0.817 q= -1.6335
Vector: 106 F= 393.92 Cos= 0.014 Sum= 0.817 q= 0.6333
Projmod> Best zero-frequency found : 0.003433
Projmod> 6 frequencies less than: 0.003434
Projmod> Lowest non-zero frequency : 12.930939
Projmod> Best overlap with diff.vect. = 0.50 for mode 16 with F= 86.50 cm-1.
Projmod> 1-3-6-9-12-all-best contrb. = 0.246 0.357 0.456 0.531 0.582 0.817
Projmod> Normal end.
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2604261326212470324 7 -20 20 4 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-20
2604261326212470324.eigenfacs
2604261326212470324.atom
calculating perturbed structure for DQ=-16
2604261326212470324.eigenfacs
2604261326212470324.atom
calculating perturbed structure for DQ=-12
2604261326212470324.eigenfacs
2604261326212470324.atom
calculating perturbed structure for DQ=-8
2604261326212470324.eigenfacs
2604261326212470324.atom
calculating perturbed structure for DQ=-4
2604261326212470324.eigenfacs
2604261326212470324.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2604261326212470324.eigenfacs
2604261326212470324.atom
calculating perturbed structure for DQ=4
2604261326212470324.eigenfacs
2604261326212470324.atom
calculating perturbed structure for DQ=8
2604261326212470324.eigenfacs
2604261326212470324.atom
calculating perturbed structure for DQ=12
2604261326212470324.eigenfacs
2604261326212470324.atom
calculating perturbed structure for DQ=16
2604261326212470324.eigenfacs
2604261326212470324.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2604261326212470324.eigenfacs
2604261326212470324.atom
making animated gifs
11 models are in 2604261326212470324.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604261326212470324.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604261326212470324.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=7 DQ=-20 400 2.527 351 1.270
MODEL 2 MODE=7 DQ=-16 400 2.442 351 1.278
MODEL 3 MODE=7 DQ=-12 400 2.372 351 1.275
MODEL 4 MODE=7 DQ=-8 400 2.317 353 1.291
MODEL 5 MODE=7 DQ=-4 400 2.278 354 1.293
MODEL 6 MODE=7 DQ=0 400 2.256 355 1.293
MODEL 7 MODE=7 DQ=4 400 2.252 354 1.287
MODEL 8 MODE=7 DQ=8 400 2.266 352 1.277
MODEL 9 MODE=7 DQ=12 400 2.297 352 1.280
MODEL 10 MODE=7 DQ=16 400 2.344 351 1.272
MODEL 11 MODE=7 DQ=20 400 2.408 351 1.271
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 2604261326212470324 8 -20 20 4 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-20
2604261326212470324.eigenfacs
2604261326212470324.atom
calculating perturbed structure for DQ=-16
2604261326212470324.eigenfacs
2604261326212470324.atom
calculating perturbed structure for DQ=-12
2604261326212470324.eigenfacs
2604261326212470324.atom
calculating perturbed structure for DQ=-8
2604261326212470324.eigenfacs
2604261326212470324.atom
calculating perturbed structure for DQ=-4
2604261326212470324.eigenfacs
2604261326212470324.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2604261326212470324.eigenfacs
2604261326212470324.atom
calculating perturbed structure for DQ=4
2604261326212470324.eigenfacs
2604261326212470324.atom
calculating perturbed structure for DQ=8
2604261326212470324.eigenfacs
2604261326212470324.atom
calculating perturbed structure for DQ=12
2604261326212470324.eigenfacs
2604261326212470324.atom
calculating perturbed structure for DQ=16
2604261326212470324.eigenfacs
2604261326212470324.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2604261326212470324.eigenfacs
2604261326212470324.atom
making animated gifs
11 models are in 2604261326212470324.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604261326212470324.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604261326212470324.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=8 DQ=-20 400 2.680 340 1.238
MODEL 2 MODE=8 DQ=-16 400 2.570 342 1.245
MODEL 3 MODE=8 DQ=-12 400 2.471 344 1.252
MODEL 4 MODE=8 DQ=-8 400 2.385 346 1.261
MODEL 5 MODE=8 DQ=-4 400 2.313 350 1.279
MODEL 6 MODE=8 DQ=0 400 2.256 355 1.293
MODEL 7 MODE=8 DQ=4 400 2.216 362 1.293
MODEL 8 MODE=8 DQ=8 400 2.194 364 1.288
MODEL 9 MODE=8 DQ=12 400 2.190 366 1.317
MODEL 10 MODE=8 DQ=16 400 2.204 364 1.340
MODEL 11 MODE=8 DQ=20 400 2.236 360 1.360
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 2604261326212470324 9 -20 20 4 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-20
2604261326212470324.eigenfacs
2604261326212470324.atom
calculating perturbed structure for DQ=-16
2604261326212470324.eigenfacs
2604261326212470324.atom
calculating perturbed structure for DQ=-12
2604261326212470324.eigenfacs
2604261326212470324.atom
calculating perturbed structure for DQ=-8
2604261326212470324.eigenfacs
2604261326212470324.atom
calculating perturbed structure for DQ=-4
2604261326212470324.eigenfacs
2604261326212470324.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2604261326212470324.eigenfacs
2604261326212470324.atom
calculating perturbed structure for DQ=4
2604261326212470324.eigenfacs
2604261326212470324.atom
calculating perturbed structure for DQ=8
2604261326212470324.eigenfacs
2604261326212470324.atom
calculating perturbed structure for DQ=12
2604261326212470324.eigenfacs
2604261326212470324.atom
calculating perturbed structure for DQ=16
2604261326212470324.eigenfacs
2604261326212470324.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2604261326212470324.eigenfacs
2604261326212470324.atom
making animated gifs
11 models are in 2604261326212470324.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604261326212470324.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604261326212470324.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=9 DQ=-20 400 2.451 356 1.322
MODEL 2 MODE=9 DQ=-16 400 2.380 355 1.321
MODEL 3 MODE=9 DQ=-12 400 2.324 355 1.318
MODEL 4 MODE=9 DQ=-8 400 2.284 359 1.337
MODEL 5 MODE=9 DQ=-4 400 2.261 355 1.315
MODEL 6 MODE=9 DQ=0 400 2.256 355 1.293
MODEL 7 MODE=9 DQ=4 400 2.269 353 1.289
MODEL 8 MODE=9 DQ=8 400 2.299 349 1.300
MODEL 9 MODE=9 DQ=12 400 2.346 344 1.296
MODEL 10 MODE=9 DQ=16 400 2.408 341 1.295
MODEL 11 MODE=9 DQ=20 400 2.485 338 1.279
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 2604261326212470324 10 -20 20 4 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-20
2604261326212470324.eigenfacs
2604261326212470324.atom
calculating perturbed structure for DQ=-16
2604261326212470324.eigenfacs
2604261326212470324.atom
calculating perturbed structure for DQ=-12
2604261326212470324.eigenfacs
2604261326212470324.atom
calculating perturbed structure for DQ=-8
2604261326212470324.eigenfacs
2604261326212470324.atom
calculating perturbed structure for DQ=-4
2604261326212470324.eigenfacs
2604261326212470324.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2604261326212470324.eigenfacs
2604261326212470324.atom
calculating perturbed structure for DQ=4
2604261326212470324.eigenfacs
2604261326212470324.atom
calculating perturbed structure for DQ=8
2604261326212470324.eigenfacs
2604261326212470324.atom
calculating perturbed structure for DQ=12
2604261326212470324.eigenfacs
2604261326212470324.atom
calculating perturbed structure for DQ=16
2604261326212470324.eigenfacs
2604261326212470324.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2604261326212470324.eigenfacs
2604261326212470324.atom
making animated gifs
11 models are in 2604261326212470324.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604261326212470324.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604261326212470324.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=10 DQ=-20 400 2.348 362 1.333
MODEL 2 MODE=10 DQ=-16 400 2.295 360 1.296
MODEL 3 MODE=10 DQ=-12 400 2.259 362 1.312
MODEL 4 MODE=10 DQ=-8 400 2.240 361 1.305
MODEL 5 MODE=10 DQ=-4 400 2.239 357 1.296
MODEL 6 MODE=10 DQ=0 400 2.256 355 1.293
MODEL 7 MODE=10 DQ=4 400 2.291 353 1.289
MODEL 8 MODE=10 DQ=8 400 2.341 349 1.273
MODEL 9 MODE=10 DQ=12 400 2.408 349 1.278
MODEL 10 MODE=10 DQ=16 400 2.489 344 1.226
MODEL 11 MODE=10 DQ=20 400 2.582 344 1.229
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 2604261326212470324 11 -20 20 4 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-20
2604261326212470324.eigenfacs
2604261326212470324.atom
calculating perturbed structure for DQ=-16
2604261326212470324.eigenfacs
2604261326212470324.atom
calculating perturbed structure for DQ=-12
2604261326212470324.eigenfacs
2604261326212470324.atom
calculating perturbed structure for DQ=-8
2604261326212470324.eigenfacs
2604261326212470324.atom
calculating perturbed structure for DQ=-4
2604261326212470324.eigenfacs
2604261326212470324.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2604261326212470324.eigenfacs
2604261326212470324.atom
calculating perturbed structure for DQ=4
2604261326212470324.eigenfacs
2604261326212470324.atom
calculating perturbed structure for DQ=8
2604261326212470324.eigenfacs
2604261326212470324.atom
calculating perturbed structure for DQ=12
2604261326212470324.eigenfacs
2604261326212470324.atom
calculating perturbed structure for DQ=16
2604261326212470324.eigenfacs
2604261326212470324.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2604261326212470324.eigenfacs
2604261326212470324.atom
making animated gifs
11 models are in 2604261326212470324.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604261326212470324.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604261326212470324.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=11 DQ=-20 400 2.429 338 1.348
MODEL 2 MODE=11 DQ=-16 400 2.362 345 1.362
MODEL 3 MODE=11 DQ=-12 400 2.310 353 1.358
MODEL 4 MODE=11 DQ=-8 400 2.275 357 1.337
MODEL 5 MODE=11 DQ=-4 400 2.257 354 1.303
MODEL 6 MODE=11 DQ=0 400 2.256 355 1.293
MODEL 7 MODE=11 DQ=4 400 2.274 353 1.275
MODEL 8 MODE=11 DQ=8 400 2.308 351 1.267
MODEL 9 MODE=11 DQ=12 400 2.359 350 1.274
MODEL 10 MODE=11 DQ=16 400 2.426 348 1.278
MODEL 11 MODE=11 DQ=20 400 2.506 344 1.257
getting mode 12
running: ../../bin/get_modes.sh 2604261326212470324 12 -20 20 4 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 12
calculating perturbed structure for DQ=-20
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2604261326212470324.atom
calculating perturbed structure for DQ=-16
2604261326212470324.eigenfacs
2604261326212470324.atom
calculating perturbed structure for DQ=-12
2604261326212470324.eigenfacs
2604261326212470324.atom
calculating perturbed structure for DQ=-8
2604261326212470324.eigenfacs
2604261326212470324.atom
calculating perturbed structure for DQ=-4
2604261326212470324.eigenfacs
2604261326212470324.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2604261326212470324.eigenfacs
2604261326212470324.atom
calculating perturbed structure for DQ=4
2604261326212470324.eigenfacs
2604261326212470324.atom
calculating perturbed structure for DQ=8
2604261326212470324.eigenfacs
2604261326212470324.atom
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2604261326212470324.eigenfacs
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604261326212470324.12.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=12 DQ=-20 400 2.681 340 1.245
MODEL 2 MODE=12 DQ=-16 400 2.571 341 1.230
MODEL 3 MODE=12 DQ=-12 400 2.472 346 1.293
MODEL 4 MODE=12 DQ=-8 400 2.385 348 1.293
MODEL 5 MODE=12 DQ=-4 400 2.313 351 1.303
MODEL 6 MODE=12 DQ=0 400 2.256 355 1.293
MODEL 7 MODE=12 DQ=4 400 2.216 355 1.268
MODEL 8 MODE=12 DQ=8 400 2.194 356 1.260
MODEL 9 MODE=12 DQ=12 400 2.189 359 1.274
MODEL 10 MODE=12 DQ=16 400 2.203 361 1.274
MODEL 11 MODE=12 DQ=20 400 2.235 364 1.295
getting mode 13
running: ../../bin/get_modes.sh 2604261326212470324 13 -20 20 4 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 13
calculating perturbed structure for DQ=-20
2604261326212470324.eigenfacs
2604261326212470324.atom
calculating perturbed structure for DQ=-16
2604261326212470324.eigenfacs
2604261326212470324.atom
calculating perturbed structure for DQ=-12
2604261326212470324.eigenfacs
2604261326212470324.atom
calculating perturbed structure for DQ=-8
2604261326212470324.eigenfacs
2604261326212470324.atom
calculating perturbed structure for DQ=-4
2604261326212470324.eigenfacs
2604261326212470324.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2604261326212470324.eigenfacs
2604261326212470324.atom
calculating perturbed structure for DQ=4
2604261326212470324.eigenfacs
2604261326212470324.atom
calculating perturbed structure for DQ=8
2604261326212470324.eigenfacs
2604261326212470324.atom
calculating perturbed structure for DQ=12
2604261326212470324.eigenfacs
2604261326212470324.atom
calculating perturbed structure for DQ=16
2604261326212470324.eigenfacs
2604261326212470324.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2604261326212470324.eigenfacs
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making animated gifs
11 models are in 2604261326212470324.13.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604261326212470324.13.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604261326212470324.13.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=13 DQ=-20 400 2.311 345 1.218
MODEL 2 MODE=13 DQ=-16 400 2.265 348 1.214
MODEL 3 MODE=13 DQ=-12 400 2.236 352 1.211
MODEL 4 MODE=13 DQ=-8 400 2.225 353 1.180
MODEL 5 MODE=13 DQ=-4 400 2.232 354 1.274
MODEL 6 MODE=13 DQ=0 400 2.256 355 1.293
MODEL 7 MODE=13 DQ=4 400 2.298 353 1.327
MODEL 8 MODE=13 DQ=8 400 2.356 347 1.327
MODEL 9 MODE=13 DQ=12 400 2.429 343 1.354
MODEL 10 MODE=13 DQ=16 400 2.516 336 1.342
MODEL 11 MODE=13 DQ=20 400 2.616 331 1.333
getting mode 14
running: ../../bin/get_modes.sh 2604261326212470324 14 -20 20 4 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 14
calculating perturbed structure for DQ=-20
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2604261326212470324.atom
calculating perturbed structure for DQ=-16
2604261326212470324.eigenfacs
2604261326212470324.atom
calculating perturbed structure for DQ=-12
2604261326212470324.eigenfacs
2604261326212470324.atom
calculating perturbed structure for DQ=-8
2604261326212470324.eigenfacs
2604261326212470324.atom
calculating perturbed structure for DQ=-4
2604261326212470324.eigenfacs
2604261326212470324.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2604261326212470324.eigenfacs
2604261326212470324.atom
calculating perturbed structure for DQ=4
2604261326212470324.eigenfacs
2604261326212470324.atom
calculating perturbed structure for DQ=8
2604261326212470324.eigenfacs
2604261326212470324.atom
calculating perturbed structure for DQ=12
2604261326212470324.eigenfacs
2604261326212470324.atom
calculating perturbed structure for DQ=16
2604261326212470324.eigenfacs
2604261326212470324.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2604261326212470324.eigenfacs
2604261326212470324.atom
making animated gifs
11 models are in 2604261326212470324.14.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604261326212470324.14.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604261326212470324.14.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=14 DQ=-20 400 2.479 343 1.284
MODEL 2 MODE=14 DQ=-16 400 2.403 347 1.300
MODEL 3 MODE=14 DQ=-12 400 2.342 348 1.286
MODEL 4 MODE=14 DQ=-8 400 2.296 350 1.283
MODEL 5 MODE=14 DQ=-4 400 2.268 352 1.285
MODEL 6 MODE=14 DQ=0 400 2.256 355 1.293
MODEL 7 MODE=14 DQ=4 400 2.263 356 1.304
MODEL 8 MODE=14 DQ=8 400 2.286 354 1.315
MODEL 9 MODE=14 DQ=12 400 2.327 350 1.326
MODEL 10 MODE=14 DQ=16 400 2.384 347 1.336
MODEL 11 MODE=14 DQ=20 400 2.456 341 1.317
getting mode 15
running: ../../bin/get_modes.sh 2604261326212470324 15 -20 20 4 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 15
calculating perturbed structure for DQ=-20
2604261326212470324.eigenfacs
2604261326212470324.atom
calculating perturbed structure for DQ=-16
2604261326212470324.eigenfacs
2604261326212470324.atom
calculating perturbed structure for DQ=-12
2604261326212470324.eigenfacs
2604261326212470324.atom
calculating perturbed structure for DQ=-8
2604261326212470324.eigenfacs
2604261326212470324.atom
calculating perturbed structure for DQ=-4
2604261326212470324.eigenfacs
2604261326212470324.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2604261326212470324.eigenfacs
2604261326212470324.atom
calculating perturbed structure for DQ=4
2604261326212470324.eigenfacs
2604261326212470324.atom
calculating perturbed structure for DQ=8
2604261326212470324.eigenfacs
2604261326212470324.atom
calculating perturbed structure for DQ=12
2604261326212470324.eigenfacs
2604261326212470324.atom
calculating perturbed structure for DQ=16
2604261326212470324.eigenfacs
2604261326212470324.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2604261326212470324.eigenfacs
2604261326212470324.atom
making animated gifs
11 models are in 2604261326212470324.15.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604261326212470324.15.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604261326212470324.15.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=15 DQ=-20 400 2.374 348 1.264
MODEL 2 MODE=15 DQ=-16 400 2.317 347 1.251
MODEL 3 MODE=15 DQ=-12 400 2.276 349 1.257
MODEL 4 MODE=15 DQ=-8 400 2.252 353 1.280
MODEL 5 MODE=15 DQ=-4 400 2.245 355 1.289
MODEL 6 MODE=15 DQ=0 400 2.256 355 1.293
MODEL 7 MODE=15 DQ=4 400 2.285 355 1.301
MODEL 8 MODE=15 DQ=8 400 2.331 353 1.309
MODEL 9 MODE=15 DQ=12 400 2.392 348 1.327
MODEL 10 MODE=15 DQ=16 400 2.468 341 1.303
MODEL 11 MODE=15 DQ=20 400 2.558 338 1.328
getting mode 16
running: ../../bin/get_modes.sh 2604261326212470324 16 -20 20 4 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 16
calculating perturbed structure for DQ=-20
2604261326212470324.eigenfacs
2604261326212470324.atom
calculating perturbed structure for DQ=-16
2604261326212470324.eigenfacs
2604261326212470324.atom
calculating perturbed structure for DQ=-12
2604261326212470324.eigenfacs
2604261326212470324.atom
calculating perturbed structure for DQ=-8
2604261326212470324.eigenfacs
2604261326212470324.atom
calculating perturbed structure for DQ=-4
2604261326212470324.eigenfacs
2604261326212470324.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2604261326212470324.eigenfacs
2604261326212470324.atom
calculating perturbed structure for DQ=4
2604261326212470324.eigenfacs
2604261326212470324.atom
calculating perturbed structure for DQ=8
2604261326212470324.eigenfacs
2604261326212470324.atom
calculating perturbed structure for DQ=12
2604261326212470324.eigenfacs
2604261326212470324.atom
calculating perturbed structure for DQ=16
2604261326212470324.eigenfacs
2604261326212470324.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2604261326212470324.eigenfacs
2604261326212470324.atom
making animated gifs
11 models are in 2604261326212470324.16.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604261326212470324.16.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604261326212470324.16.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=16 DQ=-20 400 2.897 341 1.188
MODEL 2 MODE=16 DQ=-16 400 2.752 342 1.141
MODEL 3 MODE=16 DQ=-12 400 2.614 346 1.141
MODEL 4 MODE=16 DQ=-8 400 2.484 349 1.140
MODEL 5 MODE=16 DQ=-4 400 2.365 349 1.289
MODEL 6 MODE=16 DQ=0 400 2.256 355 1.293
MODEL 7 MODE=16 DQ=4 400 2.161 355 1.252
MODEL 8 MODE=16 DQ=8 400 2.081 360 1.263
MODEL 9 MODE=16 DQ=12 400 2.017 364 1.237
MODEL 10 MODE=16 DQ=16 400 1.972 365 1.222
MODEL 11 MODE=16 DQ=20 400 1.946 369 1.205
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2604261326212470324.8.pdb
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