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LOGs for ID: 2604262027292517067

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2604262027292517067.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2604262027292517067.atom to be opened. Openam> File opened: 2604262027292517067.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 374 First residue number = 1 Last residue number = 374 Number of atoms found = 2839 Mean number per residue = 7.6 Pdbmat> Coordinate statistics: = 0.633060 +/- 10.028237 From: -23.781000 To: 28.766000 = 0.611337 +/- 15.954594 From: -30.891000 To: 32.938000 = -0.388695 +/- 10.898378 From: -27.000000 To: 27.266000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 2.8847 % Filled. Pdbmat> 1046401 non-zero elements. Pdbmat> 114498 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 80.66 +/- 23.35 Maximum number = 133 Minimum number = 10 Pdbmat> Matrix trace = 2.289960E+06 Pdbmat> Larger element = 491.603 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 374 non-zero elements, NRBL set to 2 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2604262027292517067.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 2 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2604262027292517067.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2604262027292517067.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 2839 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 2 residue(s) per block. Blocpdb> 374 residues. Blocpdb> 19 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 14 atoms in block 2 Block first atom: 20 Blocpdb> 14 atoms in block 3 Block first atom: 34 Blocpdb> 8 atoms in block 4 Block first atom: 48 Blocpdb> 11 atoms in block 5 Block first atom: 56 Blocpdb> 8 atoms in block 6 Block first atom: 67 Blocpdb> 17 atoms in block 7 Block first atom: 75 Blocpdb> 19 atoms in block 8 Block first atom: 92 Blocpdb> 13 atoms in block 9 Block first atom: 111 Blocpdb> 12 atoms in block 10 Block first atom: 124 Blocpdb> 14 atoms in block 11 Block first atom: 136 Blocpdb> 15 atoms in block 12 Block first atom: 150 Blocpdb> 17 atoms in block 13 Block first atom: 165 Blocpdb> 15 atoms in block 14 Block first atom: 182 Blocpdb> 15 atoms in block 15 Block first atom: 197 Blocpdb> 15 atoms in block 16 Block first atom: 212 Blocpdb> 19 atoms in block 17 Block first atom: 227 Blocpdb> 20 atoms in block 18 Block first atom: 246 Blocpdb> 11 atoms in block 19 Block first atom: 266 Blocpdb> 14 atoms in block 20 Block first atom: 277 Blocpdb> 12 atoms in block 21 Block first atom: 291 Blocpdb> 20 atoms in block 22 Block first atom: 303 Blocpdb> 16 atoms in block 23 Block first atom: 323 Blocpdb> 16 atoms in block 24 Block first atom: 339 Blocpdb> 15 atoms in block 25 Block first atom: 355 Blocpdb> 17 atoms in block 26 Block first atom: 370 Blocpdb> 17 atoms in block 27 Block first atom: 387 Blocpdb> 18 atoms in block 28 Block first atom: 404 Blocpdb> 14 atoms in block 29 Block first atom: 422 Blocpdb> 16 atoms in block 30 Block first atom: 436 Blocpdb> 19 atoms in block 31 Block first atom: 452 Blocpdb> 15 atoms in block 32 Block first atom: 471 Blocpdb> 22 atoms in block 33 Block first atom: 486 Blocpdb> 17 atoms in block 34 Block first atom: 508 Blocpdb> 13 atoms in block 35 Block first atom: 525 Blocpdb> 16 atoms in block 36 Block first atom: 538 Blocpdb> 16 atoms in block 37 Block first atom: 554 Blocpdb> 16 atoms in block 38 Block first atom: 570 Blocpdb> 15 atoms in block 39 Block first atom: 586 Blocpdb> 20 atoms in block 40 Block first atom: 601 Blocpdb> 17 atoms in block 41 Block first atom: 621 Blocpdb> 11 atoms in block 42 Block first atom: 638 Blocpdb> 19 atoms in block 43 Block first atom: 649 Blocpdb> 15 atoms in block 44 Block first atom: 668 Blocpdb> 17 atoms in block 45 Block first atom: 683 Blocpdb> 19 atoms in block 46 Block first atom: 700 Blocpdb> 19 atoms in block 47 Block first atom: 719 Blocpdb> 16 atoms in block 48 Block first atom: 738 Blocpdb> 16 atoms in block 49 Block first atom: 754 Blocpdb> 15 atoms in block 50 Block first atom: 770 Blocpdb> 11 atoms in block 51 Block first atom: 785 Blocpdb> 8 atoms in block 52 Block first atom: 796 Blocpdb> 19 atoms in block 53 Block first atom: 804 Blocpdb> 10 atoms in block 54 Block first atom: 823 Blocpdb> 14 atoms in block 55 Block first atom: 833 Blocpdb> 20 atoms in block 56 Block first atom: 847 Blocpdb> 10 atoms in block 57 Block first atom: 867 Blocpdb> 14 atoms in block 58 Block first atom: 877 Blocpdb> 12 atoms in block 59 Block first atom: 891 Blocpdb> 14 atoms in block 60 Block first atom: 903 Blocpdb> 15 atoms in block 61 Block first atom: 917 Blocpdb> 18 atoms in block 62 Block first atom: 932 Blocpdb> 18 atoms in block 63 Block first atom: 950 Blocpdb> 13 atoms in block 64 Block first atom: 968 Blocpdb> 13 atoms in block 65 Block first atom: 981 Blocpdb> 12 atoms in block 66 Block first atom: 994 Blocpdb> 15 atoms in block 67 Block first atom: 1006 Blocpdb> 20 atoms in block 68 Block first atom: 1021 Blocpdb> 14 atoms in block 69 Block first atom: 1041 Blocpdb> 23 atoms in block 70 Block first atom: 1055 Blocpdb> 13 atoms in block 71 Block first atom: 1078 Blocpdb> 13 atoms in block 72 Block first atom: 1091 Blocpdb> 15 atoms in block 73 Block first atom: 1104 Blocpdb> 17 atoms in block 74 Block first atom: 1119 Blocpdb> 13 atoms in block 75 Block first atom: 1136 Blocpdb> 16 atoms in block 76 Block first atom: 1149 Blocpdb> 14 atoms in block 77 Block first atom: 1165 Blocpdb> 17 atoms in block 78 Block first atom: 1179 Blocpdb> 14 atoms in block 79 Block first atom: 1196 Blocpdb> 10 atoms in block 80 Block first atom: 1210 Blocpdb> 17 atoms in block 81 Block first atom: 1220 Blocpdb> 20 atoms in block 82 Block first atom: 1237 Blocpdb> 10 atoms in block 83 Block first atom: 1257 Blocpdb> 15 atoms in block 84 Block first atom: 1267 Blocpdb> 16 atoms in block 85 Block first atom: 1282 Blocpdb> 13 atoms in block 86 Block first atom: 1298 Blocpdb> 14 atoms in block 87 Block first atom: 1311 Blocpdb> 13 atoms in block 88 Block first atom: 1325 Blocpdb> 15 atoms in block 89 Block first atom: 1338 Blocpdb> 18 atoms in block 90 Block first atom: 1353 Blocpdb> 16 atoms in block 91 Block first atom: 1371 Blocpdb> 15 atoms in block 92 Block first atom: 1387 Blocpdb> 12 atoms in block 93 Block first atom: 1402 Blocpdb> 19 atoms in block 94 Block first atom: 1414 Blocpdb> 11 atoms in block 95 Block first atom: 1433 Blocpdb> 16 atoms in block 96 Block first atom: 1444 Blocpdb> 15 atoms in block 97 Block first atom: 1460 Blocpdb> 15 atoms in block 98 Block first atom: 1475 Blocpdb> 11 atoms in block 99 Block first atom: 1490 Blocpdb> 10 atoms in block 100 Block first atom: 1501 Blocpdb> 15 atoms in block 101 Block first atom: 1511 Blocpdb> 14 atoms in block 102 Block first atom: 1526 Blocpdb> 13 atoms in block 103 Block first atom: 1540 Blocpdb> 19 atoms in block 104 Block first atom: 1553 Blocpdb> 13 atoms in block 105 Block first atom: 1572 Blocpdb> 17 atoms in block 106 Block first atom: 1585 Blocpdb> 13 atoms in block 107 Block first atom: 1602 Blocpdb> 14 atoms in block 108 Block first atom: 1615 Blocpdb> 15 atoms in block 109 Block first atom: 1629 Blocpdb> 17 atoms in block 110 Block first atom: 1644 Blocpdb> 14 atoms in block 111 Block first atom: 1661 Blocpdb> 17 atoms in block 112 Block first atom: 1675 Blocpdb> 19 atoms in block 113 Block first atom: 1692 Blocpdb> 18 atoms in block 114 Block first atom: 1711 Blocpdb> 11 atoms in block 115 Block first atom: 1729 Blocpdb> 12 atoms in block 116 Block first atom: 1740 Blocpdb> 24 atoms in block 117 Block first atom: 1752 Blocpdb> 18 atoms in block 118 Block first atom: 1776 Blocpdb> 18 atoms in block 119 Block first atom: 1794 Blocpdb> 13 atoms in block 120 Block first atom: 1812 Blocpdb> 14 atoms in block 121 Block first atom: 1825 Blocpdb> 16 atoms in block 122 Block first atom: 1839 Blocpdb> 13 atoms in block 123 Block first atom: 1855 Blocpdb> 16 atoms in block 124 Block first atom: 1868 Blocpdb> 15 atoms in block 125 Block first atom: 1884 Blocpdb> 13 atoms in block 126 Block first atom: 1899 Blocpdb> 15 atoms in block 127 Block first atom: 1912 Blocpdb> 19 atoms in block 128 Block first atom: 1927 Blocpdb> 17 atoms in block 129 Block first atom: 1946 Blocpdb> 16 atoms in block 130 Block first atom: 1963 Blocpdb> 16 atoms in block 131 Block first atom: 1979 Blocpdb> 15 atoms in block 132 Block first atom: 1995 Blocpdb> 10 atoms in block 133 Block first atom: 2010 Blocpdb> 13 atoms in block 134 Block first atom: 2020 Blocpdb> 16 atoms in block 135 Block first atom: 2033 Blocpdb> 15 atoms in block 136 Block first atom: 2049 Blocpdb> 19 atoms in block 137 Block first atom: 2064 Blocpdb> 9 atoms in block 138 Block first atom: 2083 Blocpdb> 11 atoms in block 139 Block first atom: 2092 Blocpdb> 15 atoms in block 140 Block first atom: 2103 Blocpdb> 14 atoms in block 141 Block first atom: 2118 Blocpdb> 15 atoms in block 142 Block first atom: 2132 Blocpdb> 13 atoms in block 143 Block first atom: 2147 Blocpdb> 12 atoms in block 144 Block first atom: 2160 Blocpdb> 13 atoms in block 145 Block first atom: 2172 Blocpdb> 16 atoms in block 146 Block first atom: 2185 Blocpdb> 15 atoms in block 147 Block first atom: 2201 Blocpdb> 13 atoms in block 148 Block first atom: 2216 Blocpdb> 15 atoms in block 149 Block first atom: 2229 Blocpdb> 11 atoms in block 150 Block first atom: 2244 Blocpdb> 18 atoms in block 151 Block first atom: 2255 Blocpdb> 18 atoms in block 152 Block first atom: 2273 Blocpdb> 20 atoms in block 153 Block first atom: 2291 Blocpdb> 16 atoms in block 154 Block first atom: 2311 Blocpdb> 17 atoms in block 155 Block first atom: 2327 Blocpdb> 14 atoms in block 156 Block first atom: 2344 Blocpdb> 13 atoms in block 157 Block first atom: 2358 Blocpdb> 10 atoms in block 158 Block first atom: 2371 Blocpdb> 17 atoms in block 159 Block first atom: 2381 Blocpdb> 16 atoms in block 160 Block first atom: 2398 Blocpdb> 18 atoms in block 161 Block first atom: 2414 Blocpdb> 16 atoms in block 162 Block first atom: 2432 Blocpdb> 10 atoms in block 163 Block first atom: 2448 Blocpdb> 11 atoms in block 164 Block first atom: 2458 Blocpdb> 19 atoms in block 165 Block first atom: 2469 Blocpdb> 18 atoms in block 166 Block first atom: 2488 Blocpdb> 14 atoms in block 167 Block first atom: 2506 Blocpdb> 16 atoms in block 168 Block first atom: 2520 Blocpdb> 17 atoms in block 169 Block first atom: 2536 Blocpdb> 15 atoms in block 170 Block first atom: 2553 Blocpdb> 19 atoms in block 171 Block first atom: 2568 Blocpdb> 14 atoms in block 172 Block first atom: 2587 Blocpdb> 18 atoms in block 173 Block first atom: 2601 Blocpdb> 14 atoms in block 174 Block first atom: 2619 Blocpdb> 14 atoms in block 175 Block first atom: 2633 Blocpdb> 18 atoms in block 176 Block first atom: 2647 Blocpdb> 12 atoms in block 177 Block first atom: 2665 Blocpdb> 16 atoms in block 178 Block first atom: 2677 Blocpdb> 15 atoms in block 179 Block first atom: 2693 Blocpdb> 13 atoms in block 180 Block first atom: 2708 Blocpdb> 16 atoms in block 181 Block first atom: 2721 Blocpdb> 16 atoms in block 182 Block first atom: 2737 Blocpdb> 17 atoms in block 183 Block first atom: 2753 Blocpdb> 20 atoms in block 184 Block first atom: 2770 Blocpdb> 16 atoms in block 185 Block first atom: 2790 Blocpdb> 17 atoms in block 186 Block first atom: 2806 Blocpdb> 17 atoms in block 187 Block first atom: 2822 Blocpdb> 187 blocks. Blocpdb> At most, 24 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 8 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 1046588 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 8517 Prepmat> Matrix trace = 2289960.0000 Prepmat> Last element read: 8517 8517 174.2782 Prepmat> 17579 lines saved. Prepmat> 15481 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 2839 RTB> Total mass = 2839.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 2839 RTB> Number of blocks = 187 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 259617.5068 RTB> 72676 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1122 Diagstd> Nb of non-zero elements: 72676 Diagstd> Projected matrix trace = 259617.5068 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1122 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 259617.5068 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.8994906 1.2617562 1.6903389 2.5600899 4.1074922 5.2907117 5.9331614 7.0822053 7.2994312 8.9196525 9.9031089 10.2493641 10.4297514 11.8936159 12.2994590 13.1422483 13.9801214 15.0010512 15.4737266 15.9172171 16.4741011 17.3187122 18.1707852 18.4371152 18.8875677 19.9076227 20.1155786 20.6162575 20.8667984 21.5731758 22.8080427 22.9052885 23.3436575 24.0326066 25.1561918 25.4911010 26.4515401 27.3034317 27.4483461 27.9586450 28.7075461 29.5986221 30.1551925 30.5179421 31.1868109 31.7336674 32.1758927 32.4990650 33.0775256 34.5145734 34.7170917 35.0982735 35.8041542 36.0403367 37.1011727 37.2963283 38.0718843 38.6927728 39.0274890 39.5740009 40.5017459 40.7866810 41.4856878 42.9100145 43.1262419 43.2145871 43.8832099 44.4095481 44.6352090 44.8638331 45.4034349 46.5791753 47.2258624 47.5418230 47.9043759 48.2863291 48.4753649 48.8508970 49.4613007 50.2967049 51.2469927 51.7894785 52.8847637 53.2388079 53.9162910 54.0187026 54.5462411 55.1117838 55.3659714 56.1360265 56.6135135 57.0024044 57.7744257 58.2144595 58.4473924 59.3007245 59.9630319 60.2589282 60.7792566 61.0743471 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034323 0.0034330 0.0034340 0.0034341 0.0034343 0.0034345 102.9896528 121.9784181 141.1829257 173.7492312 220.0815580 249.7769341 264.5077265 288.9878192 293.3862739 324.3166510 341.7283880 347.6512061 350.6971677 374.5003552 380.8362538 393.6680007 406.0231086 420.5872735 427.1621266 433.2403022 440.7538789 451.9111724 462.8946146 466.2746070 471.9362071 484.5124938 487.0365392 493.0604809 496.0474142 504.3735705 518.6080921 519.7125010 524.6621462 532.3481129 544.6502772 548.2638063 558.4968941 567.4190320 568.9228419 574.1869800 581.8262564 590.7871314 596.3158223 599.8917687 606.4301202 611.7238503 615.9714493 619.0571063 624.5421981 637.9645330 639.8334611 643.3364485 649.7734917 651.9130879 661.4379346 663.1752656 670.0349647 675.4764416 678.3917928 683.1251270 691.0860911 693.5127714 699.4302758 711.3357093 713.1256990 713.8557533 719.3570000 723.6581491 725.4944035 727.3500422 731.7110864 741.1245128 746.2515203 748.7437249 751.5932545 754.5836227 756.0592372 758.9821312 763.7092431 770.1317835 777.3730365 781.4767276 789.6971386 792.3360965 797.3615411 798.1184584 802.0061415 806.1530738 808.0100124 813.6096940 817.0626052 819.8640956 825.3974041 828.5347249 830.1906739 836.2291067 840.8859035 842.9580871 846.5896845 848.6423426 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 2839 Rtb_to_modes> Number of blocs = 187 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9906E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9945E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8995 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.262 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.690 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.560 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.107 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.291 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.933 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.082 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.299 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.920 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.903 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.07 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1122 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000 1.00002 1.00003 0.99999 1.00001 0.99998 1.00002 0.99998 0.99998 0.99999 1.00002 1.00003 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 1.00001 0.99999 1.00004 1.00002 1.00003 1.00001 1.00001 0.99999 0.99997 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 0.99997 0.99998 0.99999 1.00002 1.00000 1.00002 1.00000 0.99998 1.00000 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 0.99998 1.00001 1.00001 0.99999 1.00002 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 0.99998 0.99998 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 1.00002 1.00001 1.00000 0.99999 0.99998 1.00002 1.00001 1.00000 1.00002 0.99997 1.00001 1.00000 1.00002 0.99998 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 0.99997 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00003 0.99999 1.00004 1.00001 0.99998 1.00000 0.99999 1.00004 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 51102 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000 1.00002 1.00003 0.99999 1.00001 0.99998 1.00002 0.99998 0.99998 0.99999 1.00002 1.00003 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 1.00001 0.99999 1.00004 1.00002 1.00003 1.00001 1.00001 0.99999 0.99997 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 0.99997 0.99998 0.99999 1.00002 1.00000 1.00002 1.00000 0.99998 1.00000 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 0.99998 1.00001 1.00001 0.99999 1.00002 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 0.99998 0.99998 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 1.00002 1.00001 1.00000 0.99999 0.99998 1.00002 1.00001 1.00000 1.00002 0.99997 1.00001 1.00000 1.00002 0.99998 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 0.99997 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00003 0.99999 1.00004 1.00001 0.99998 1.00000 0.99999 1.00004 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3: 0.000 0.000 Vector 4:-0.000 0.000 0.000 Vector 5: 0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 6:-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 7:-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 8: 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 9:-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 10: 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2604262027292517067.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2604262027292517067.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2604262027292517067.atom Openam> file on opening on unit 11: 2604262027292517067.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 374 First residue number = 1 Last residue number = 374 Number of atoms found = 2839 Mean number per residue = 7.6 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9906E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9945E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8995 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.262 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.690 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.560 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.107 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.291 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.933 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.082 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.299 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.920 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.903 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.07 Bfactors> 106 vectors, 8517 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.899500 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= -0.765 for 374 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.032 +/- 0.04 Bfactors> = 95.927 +/- 1.05 Bfactors> Shiftng-fct= 95.895 Bfactors> Scaling-fct= 30.063 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2604262027292517067.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2604262027292517067.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4322E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4329E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 103.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 122.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 141.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 173.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 220.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 249.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 264.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 289.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 293.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 324.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 341.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 347.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 350.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 374.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 380.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 393.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 406.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 420.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 427.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 433.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 440.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 451.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 462.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 466.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 471.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 484.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 487.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 493.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 496.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 504.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 518.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 519.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 524.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 532.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 544.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 548.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 558.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 567.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 568.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 574.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 581.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 590.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 596.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 599.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 606.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 611.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 616.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 619.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 624.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 637.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 639.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 643.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 649.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 651.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 661.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 663.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 670.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 675.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 678.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 683.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 691.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 693.5 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vecteur en lecture: 741.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 746.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 748.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 751.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 754.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 756.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 758.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 763.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 770.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 777.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 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Chkmod> That is: 2839 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. 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for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-50 2604262027292517067.eigenfacs 2604262027292517067.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2604262027292517067.eigenfacs 2604262027292517067.atom calculating perturbed structure for DQ=-30 2604262027292517067.eigenfacs 2604262027292517067.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2604262027292517067.eigenfacs 2604262027292517067.atom calculating perturbed structure for DQ=-10 2604262027292517067.eigenfacs 2604262027292517067.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2604262027292517067.eigenfacs 2604262027292517067.atom calculating perturbed structure for DQ=10 2604262027292517067.eigenfacs 2604262027292517067.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2604262027292517067.eigenfacs 2604262027292517067.atom calculating perturbed structure for DQ=30 2604262027292517067.eigenfacs 2604262027292517067.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2604262027292517067.eigenfacs 2604262027292517067.atom calculating perturbed structure for DQ=50 2604262027292517067.eigenfacs 2604262027292517067.atom making animated gifs 11 models are in 2604262027292517067.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2604262027292517067.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2604262027292517067.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 2604262027292517067 9 -50 50 10 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-50 2604262027292517067.eigenfacs 2604262027292517067.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2604262027292517067.eigenfacs 2604262027292517067.atom calculating perturbed structure for DQ=-30 2604262027292517067.eigenfacs 2604262027292517067.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2604262027292517067.eigenfacs 2604262027292517067.atom calculating perturbed structure for DQ=-10 2604262027292517067.eigenfacs 2604262027292517067.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2604262027292517067.eigenfacs 2604262027292517067.atom calculating perturbed structure for DQ=10 2604262027292517067.eigenfacs 2604262027292517067.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2604262027292517067.eigenfacs 2604262027292517067.atom calculating perturbed structure for DQ=30 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will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 2604262027292517067 10 -50 50 10 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-50 2604262027292517067.eigenfacs 2604262027292517067.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2604262027292517067.eigenfacs 2604262027292517067.atom calculating perturbed structure for DQ=-30 2604262027292517067.eigenfacs 2604262027292517067.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2604262027292517067.eigenfacs 2604262027292517067.atom calculating perturbed structure for DQ=-10 2604262027292517067.eigenfacs 2604262027292517067.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2604262027292517067.eigenfacs 2604262027292517067.atom calculating perturbed structure for DQ=10 2604262027292517067.eigenfacs 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gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2604262027292517067.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 2604262027292517067 11 -50 50 10 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-50 2604262027292517067.eigenfacs 2604262027292517067.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2604262027292517067.eigenfacs 2604262027292517067.atom calculating perturbed structure for DQ=-30 2604262027292517067.eigenfacs 2604262027292517067.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2604262027292517067.eigenfacs 2604262027292517067.atom calculating perturbed structure for DQ=-10 2604262027292517067.eigenfacs 2604262027292517067.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2604262027292517067.eigenfacs 2604262027292517067.atom calculating perturbed structure for DQ=10 2604262027292517067.eigenfacs 2604262027292517067.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2604262027292517067.eigenfacs 2604262027292517067.atom calculating perturbed structure for DQ=30 2604262027292517067.eigenfacs 2604262027292517067.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2604262027292517067.eigenfacs 2604262027292517067.atom calculating perturbed structure for DQ=50 2604262027292517067.eigenfacs 2604262027292517067.atom making animated gifs 11 models are in 2604262027292517067.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2604262027292517067.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2604262027292517067.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 2604262027292517067.10.pdb 2604262027292517067.11.pdb 2604262027292517067.7.pdb 2604262027292517067.8.pdb 2604262027292517067.9.pdb STDERR: Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL real 0m20.631s user 0m20.532s sys 0m0.090s rm: cannot remove '2604262027292517067.sdijf': No such file or directory pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing 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