***    ***
Output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 2604262027292517067.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 2604262027292517067.atom to be opened.
Openam> File opened: 2604262027292517067.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 374
First residue number = 1
Last residue number = 374
Number of atoms found = 2839
Mean number per residue = 7.6
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 0.633060 +/- 10.028237 From: -23.781000 To: 28.766000
= 0.611337 +/- 15.954594 From: -30.891000 To: 32.938000
= -0.388695 +/- 10.898378 From: -27.000000 To: 27.266000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 2.8847 % Filled.
Pdbmat> 1046401 non-zero elements.
Pdbmat> 114498 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 80.66 +/- 23.35
Maximum number = 133
Minimum number = 10
Pdbmat> Matrix trace = 2.289960E+06
Pdbmat> Larger element = 491.603
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
374 non-zero elements, NRBL set to 2
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 2604262027292517067.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 2
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 2604262027292517067.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
2604262027292517067.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 2839 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 2 residue(s) per block.
Blocpdb> 374 residues.
Blocpdb> 19 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 14 atoms in block 2
Block first atom: 20
Blocpdb> 14 atoms in block 3
Block first atom: 34
Blocpdb> 8 atoms in block 4
Block first atom: 48
Blocpdb> 11 atoms in block 5
Block first atom: 56
Blocpdb> 8 atoms in block 6
Block first atom: 67
Blocpdb> 17 atoms in block 7
Block first atom: 75
Blocpdb> 19 atoms in block 8
Block first atom: 92
Blocpdb> 13 atoms in block 9
Block first atom: 111
Blocpdb> 12 atoms in block 10
Block first atom: 124
Blocpdb> 14 atoms in block 11
Block first atom: 136
Blocpdb> 15 atoms in block 12
Block first atom: 150
Blocpdb> 17 atoms in block 13
Block first atom: 165
Blocpdb> 15 atoms in block 14
Block first atom: 182
Blocpdb> 15 atoms in block 15
Block first atom: 197
Blocpdb> 15 atoms in block 16
Block first atom: 212
Blocpdb> 19 atoms in block 17
Block first atom: 227
Blocpdb> 20 atoms in block 18
Block first atom: 246
Blocpdb> 11 atoms in block 19
Block first atom: 266
Blocpdb> 14 atoms in block 20
Block first atom: 277
Blocpdb> 12 atoms in block 21
Block first atom: 291
Blocpdb> 20 atoms in block 22
Block first atom: 303
Blocpdb> 16 atoms in block 23
Block first atom: 323
Blocpdb> 16 atoms in block 24
Block first atom: 339
Blocpdb> 15 atoms in block 25
Block first atom: 355
Blocpdb> 17 atoms in block 26
Block first atom: 370
Blocpdb> 17 atoms in block 27
Block first atom: 387
Blocpdb> 18 atoms in block 28
Block first atom: 404
Blocpdb> 14 atoms in block 29
Block first atom: 422
Blocpdb> 16 atoms in block 30
Block first atom: 436
Blocpdb> 19 atoms in block 31
Block first atom: 452
Blocpdb> 15 atoms in block 32
Block first atom: 471
Blocpdb> 22 atoms in block 33
Block first atom: 486
Blocpdb> 17 atoms in block 34
Block first atom: 508
Blocpdb> 13 atoms in block 35
Block first atom: 525
Blocpdb> 16 atoms in block 36
Block first atom: 538
Blocpdb> 16 atoms in block 37
Block first atom: 554
Blocpdb> 16 atoms in block 38
Block first atom: 570
Blocpdb> 15 atoms in block 39
Block first atom: 586
Blocpdb> 20 atoms in block 40
Block first atom: 601
Blocpdb> 17 atoms in block 41
Block first atom: 621
Blocpdb> 11 atoms in block 42
Block first atom: 638
Blocpdb> 19 atoms in block 43
Block first atom: 649
Blocpdb> 15 atoms in block 44
Block first atom: 668
Blocpdb> 17 atoms in block 45
Block first atom: 683
Blocpdb> 19 atoms in block 46
Block first atom: 700
Blocpdb> 19 atoms in block 47
Block first atom: 719
Blocpdb> 16 atoms in block 48
Block first atom: 738
Blocpdb> 16 atoms in block 49
Block first atom: 754
Blocpdb> 15 atoms in block 50
Block first atom: 770
Blocpdb> 11 atoms in block 51
Block first atom: 785
Blocpdb> 8 atoms in block 52
Block first atom: 796
Blocpdb> 19 atoms in block 53
Block first atom: 804
Blocpdb> 10 atoms in block 54
Block first atom: 823
Blocpdb> 14 atoms in block 55
Block first atom: 833
Blocpdb> 20 atoms in block 56
Block first atom: 847
Blocpdb> 10 atoms in block 57
Block first atom: 867
Blocpdb> 14 atoms in block 58
Block first atom: 877
Blocpdb> 12 atoms in block 59
Block first atom: 891
Blocpdb> 14 atoms in block 60
Block first atom: 903
Blocpdb> 15 atoms in block 61
Block first atom: 917
Blocpdb> 18 atoms in block 62
Block first atom: 932
Blocpdb> 18 atoms in block 63
Block first atom: 950
Blocpdb> 13 atoms in block 64
Block first atom: 968
Blocpdb> 13 atoms in block 65
Block first atom: 981
Blocpdb> 12 atoms in block 66
Block first atom: 994
Blocpdb> 15 atoms in block 67
Block first atom: 1006
Blocpdb> 20 atoms in block 68
Block first atom: 1021
Blocpdb> 14 atoms in block 69
Block first atom: 1041
Blocpdb> 23 atoms in block 70
Block first atom: 1055
Blocpdb> 13 atoms in block 71
Block first atom: 1078
Blocpdb> 13 atoms in block 72
Block first atom: 1091
Blocpdb> 15 atoms in block 73
Block first atom: 1104
Blocpdb> 17 atoms in block 74
Block first atom: 1119
Blocpdb> 13 atoms in block 75
Block first atom: 1136
Blocpdb> 16 atoms in block 76
Block first atom: 1149
Blocpdb> 14 atoms in block 77
Block first atom: 1165
Blocpdb> 17 atoms in block 78
Block first atom: 1179
Blocpdb> 14 atoms in block 79
Block first atom: 1196
Blocpdb> 10 atoms in block 80
Block first atom: 1210
Blocpdb> 17 atoms in block 81
Block first atom: 1220
Blocpdb> 20 atoms in block 82
Block first atom: 1237
Blocpdb> 10 atoms in block 83
Block first atom: 1257
Blocpdb> 15 atoms in block 84
Block first atom: 1267
Blocpdb> 16 atoms in block 85
Block first atom: 1282
Blocpdb> 13 atoms in block 86
Block first atom: 1298
Blocpdb> 14 atoms in block 87
Block first atom: 1311
Blocpdb> 13 atoms in block 88
Block first atom: 1325
Blocpdb> 15 atoms in block 89
Block first atom: 1338
Blocpdb> 18 atoms in block 90
Block first atom: 1353
Blocpdb> 16 atoms in block 91
Block first atom: 1371
Blocpdb> 15 atoms in block 92
Block first atom: 1387
Blocpdb> 12 atoms in block 93
Block first atom: 1402
Blocpdb> 19 atoms in block 94
Block first atom: 1414
Blocpdb> 11 atoms in block 95
Block first atom: 1433
Blocpdb> 16 atoms in block 96
Block first atom: 1444
Blocpdb> 15 atoms in block 97
Block first atom: 1460
Blocpdb> 15 atoms in block 98
Block first atom: 1475
Blocpdb> 11 atoms in block 99
Block first atom: 1490
Blocpdb> 10 atoms in block 100
Block first atom: 1501
Blocpdb> 15 atoms in block 101
Block first atom: 1511
Blocpdb> 14 atoms in block 102
Block first atom: 1526
Blocpdb> 13 atoms in block 103
Block first atom: 1540
Blocpdb> 19 atoms in block 104
Block first atom: 1553
Blocpdb> 13 atoms in block 105
Block first atom: 1572
Blocpdb> 17 atoms in block 106
Block first atom: 1585
Blocpdb> 13 atoms in block 107
Block first atom: 1602
Blocpdb> 14 atoms in block 108
Block first atom: 1615
Blocpdb> 15 atoms in block 109
Block first atom: 1629
Blocpdb> 17 atoms in block 110
Block first atom: 1644
Blocpdb> 14 atoms in block 111
Block first atom: 1661
Blocpdb> 17 atoms in block 112
Block first atom: 1675
Blocpdb> 19 atoms in block 113
Block first atom: 1692
Blocpdb> 18 atoms in block 114
Block first atom: 1711
Blocpdb> 11 atoms in block 115
Block first atom: 1729
Blocpdb> 12 atoms in block 116
Block first atom: 1740
Blocpdb> 24 atoms in block 117
Block first atom: 1752
Blocpdb> 18 atoms in block 118
Block first atom: 1776
Blocpdb> 18 atoms in block 119
Block first atom: 1794
Blocpdb> 13 atoms in block 120
Block first atom: 1812
Blocpdb> 14 atoms in block 121
Block first atom: 1825
Blocpdb> 16 atoms in block 122
Block first atom: 1839
Blocpdb> 13 atoms in block 123
Block first atom: 1855
Blocpdb> 16 atoms in block 124
Block first atom: 1868
Blocpdb> 15 atoms in block 125
Block first atom: 1884
Blocpdb> 13 atoms in block 126
Block first atom: 1899
Blocpdb> 15 atoms in block 127
Block first atom: 1912
Blocpdb> 19 atoms in block 128
Block first atom: 1927
Blocpdb> 17 atoms in block 129
Block first atom: 1946
Blocpdb> 16 atoms in block 130
Block first atom: 1963
Blocpdb> 16 atoms in block 131
Block first atom: 1979
Blocpdb> 15 atoms in block 132
Block first atom: 1995
Blocpdb> 10 atoms in block 133
Block first atom: 2010
Blocpdb> 13 atoms in block 134
Block first atom: 2020
Blocpdb> 16 atoms in block 135
Block first atom: 2033
Blocpdb> 15 atoms in block 136
Block first atom: 2049
Blocpdb> 19 atoms in block 137
Block first atom: 2064
Blocpdb> 9 atoms in block 138
Block first atom: 2083
Blocpdb> 11 atoms in block 139
Block first atom: 2092
Blocpdb> 15 atoms in block 140
Block first atom: 2103
Blocpdb> 14 atoms in block 141
Block first atom: 2118
Blocpdb> 15 atoms in block 142
Block first atom: 2132
Blocpdb> 13 atoms in block 143
Block first atom: 2147
Blocpdb> 12 atoms in block 144
Block first atom: 2160
Blocpdb> 13 atoms in block 145
Block first atom: 2172
Blocpdb> 16 atoms in block 146
Block first atom: 2185
Blocpdb> 15 atoms in block 147
Block first atom: 2201
Blocpdb> 13 atoms in block 148
Block first atom: 2216
Blocpdb> 15 atoms in block 149
Block first atom: 2229
Blocpdb> 11 atoms in block 150
Block first atom: 2244
Blocpdb> 18 atoms in block 151
Block first atom: 2255
Blocpdb> 18 atoms in block 152
Block first atom: 2273
Blocpdb> 20 atoms in block 153
Block first atom: 2291
Blocpdb> 16 atoms in block 154
Block first atom: 2311
Blocpdb> 17 atoms in block 155
Block first atom: 2327
Blocpdb> 14 atoms in block 156
Block first atom: 2344
Blocpdb> 13 atoms in block 157
Block first atom: 2358
Blocpdb> 10 atoms in block 158
Block first atom: 2371
Blocpdb> 17 atoms in block 159
Block first atom: 2381
Blocpdb> 16 atoms in block 160
Block first atom: 2398
Blocpdb> 18 atoms in block 161
Block first atom: 2414
Blocpdb> 16 atoms in block 162
Block first atom: 2432
Blocpdb> 10 atoms in block 163
Block first atom: 2448
Blocpdb> 11 atoms in block 164
Block first atom: 2458
Blocpdb> 19 atoms in block 165
Block first atom: 2469
Blocpdb> 18 atoms in block 166
Block first atom: 2488
Blocpdb> 14 atoms in block 167
Block first atom: 2506
Blocpdb> 16 atoms in block 168
Block first atom: 2520
Blocpdb> 17 atoms in block 169
Block first atom: 2536
Blocpdb> 15 atoms in block 170
Block first atom: 2553
Blocpdb> 19 atoms in block 171
Block first atom: 2568
Blocpdb> 14 atoms in block 172
Block first atom: 2587
Blocpdb> 18 atoms in block 173
Block first atom: 2601
Blocpdb> 14 atoms in block 174
Block first atom: 2619
Blocpdb> 14 atoms in block 175
Block first atom: 2633
Blocpdb> 18 atoms in block 176
Block first atom: 2647
Blocpdb> 12 atoms in block 177
Block first atom: 2665
Blocpdb> 16 atoms in block 178
Block first atom: 2677
Blocpdb> 15 atoms in block 179
Block first atom: 2693
Blocpdb> 13 atoms in block 180
Block first atom: 2708
Blocpdb> 16 atoms in block 181
Block first atom: 2721
Blocpdb> 16 atoms in block 182
Block first atom: 2737
Blocpdb> 17 atoms in block 183
Block first atom: 2753
Blocpdb> 20 atoms in block 184
Block first atom: 2770
Blocpdb> 16 atoms in block 185
Block first atom: 2790
Blocpdb> 17 atoms in block 186
Block first atom: 2806
Blocpdb> 17 atoms in block 187
Block first atom: 2822
Blocpdb> 187 blocks.
Blocpdb> At most, 24 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 8 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 1046588 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 8517
Prepmat> Matrix trace = 2289960.0000
Prepmat> Last element read: 8517 8517 174.2782
Prepmat> 17579 lines saved.
Prepmat> 15481 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 2839
RTB> Total mass = 2839.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 2839
RTB> Number of blocks = 187
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 259617.5068
RTB> 72676 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 1122
Diagstd> Nb of non-zero elements: 72676
Diagstd> Projected matrix trace = 259617.5068
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 1122 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 259617.5068
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.8994906 1.2617562 1.6903389 2.5600899
4.1074922 5.2907117 5.9331614 7.0822053 7.2994312
8.9196525 9.9031089 10.2493641 10.4297514 11.8936159
12.2994590 13.1422483 13.9801214 15.0010512 15.4737266
15.9172171 16.4741011 17.3187122 18.1707852 18.4371152
18.8875677 19.9076227 20.1155786 20.6162575 20.8667984
21.5731758 22.8080427 22.9052885 23.3436575 24.0326066
25.1561918 25.4911010 26.4515401 27.3034317 27.4483461
27.9586450 28.7075461 29.5986221 30.1551925 30.5179421
31.1868109 31.7336674 32.1758927 32.4990650 33.0775256
34.5145734 34.7170917 35.0982735 35.8041542 36.0403367
37.1011727 37.2963283 38.0718843 38.6927728 39.0274890
39.5740009 40.5017459 40.7866810 41.4856878 42.9100145
43.1262419 43.2145871 43.8832099 44.4095481 44.6352090
44.8638331 45.4034349 46.5791753 47.2258624 47.5418230
47.9043759 48.2863291 48.4753649 48.8508970 49.4613007
50.2967049 51.2469927 51.7894785 52.8847637 53.2388079
53.9162910 54.0187026 54.5462411 55.1117838 55.3659714
56.1360265 56.6135135 57.0024044 57.7744257 58.2144595
58.4473924 59.3007245 59.9630319 60.2589282 60.7792566
61.0743471
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034323 0.0034330 0.0034340 0.0034341 0.0034343
0.0034345 102.9896528 121.9784181 141.1829257 173.7492312
220.0815580 249.7769341 264.5077265 288.9878192 293.3862739
324.3166510 341.7283880 347.6512061 350.6971677 374.5003552
380.8362538 393.6680007 406.0231086 420.5872735 427.1621266
433.2403022 440.7538789 451.9111724 462.8946146 466.2746070
471.9362071 484.5124938 487.0365392 493.0604809 496.0474142
504.3735705 518.6080921 519.7125010 524.6621462 532.3481129
544.6502772 548.2638063 558.4968941 567.4190320 568.9228419
574.1869800 581.8262564 590.7871314 596.3158223 599.8917687
606.4301202 611.7238503 615.9714493 619.0571063 624.5421981
637.9645330 639.8334611 643.3364485 649.7734917 651.9130879
661.4379346 663.1752656 670.0349647 675.4764416 678.3917928
683.1251270 691.0860911 693.5127714 699.4302758 711.3357093
713.1256990 713.8557533 719.3570000 723.6581491 725.4944035
727.3500422 731.7110864 741.1245128 746.2515203 748.7437249
751.5932545 754.5836227 756.0592372 758.9821312 763.7092431
770.1317835 777.3730365 781.4767276 789.6971386 792.3360965
797.3615411 798.1184584 802.0061415 806.1530738 808.0100124
813.6096940 817.0626052 819.8640956 825.3974041 828.5347249
830.1906739 836.2291067 840.8859035 842.9580871 846.5896845
848.6423426
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 2839
Rtb_to_modes> Number of blocs = 187
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9906E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9945E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0003E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8995
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.262
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.690
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.560
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.107
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.291
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.933
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.082
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.299
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.920
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.903
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.25
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.43
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.89
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.30
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.14
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.98
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.00
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.47
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.92
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.47
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.32
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.17
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.44
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.89
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.91
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.12
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.62
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.87
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.57
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.81
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.91
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.34
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.16
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.49
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.45
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.30
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.45
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.96
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.71
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.60
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.16
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.52
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.19
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.73
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.18
Rdmodfacs> Eigenvector number: 54
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.50
Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.08
Rdmodfacs> Eigenvector number: 56
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.51
Rdmodfacs> Eigenvector number: 57
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.72
Rdmodfacs> Eigenvector number: 58
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.80
Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.04
Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.30
Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.07
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.69
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.57
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.50
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.79
Rdmodfacs> Eigenvector number: 69
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.49
Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.91
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.13
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.21
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.88
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.41
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.64
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.86
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.40
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.58
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.23
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.54
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.90
Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.29
Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.48
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.85
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.46
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.30
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.25
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.79
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.88
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.24
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.92
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.55
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.11
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.37
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.14
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.61
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.00
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.77
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.21
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.45
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.30
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.96
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.26
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.78
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.07
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1122 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000
1.00000 1.00002 1.00001 0.99999 0.99999
1.00000 1.00002 1.00003 0.99999 1.00001
0.99998 1.00002 0.99998 0.99998 0.99999
1.00002 1.00003 1.00000 1.00000 1.00000
1.00002 1.00001 0.99999 1.00004 1.00002
1.00003 1.00001 1.00001 0.99999 0.99997
0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 0.99997
0.99998 0.99999 1.00002 1.00000 1.00002
1.00000 0.99998 1.00000 0.99998 1.00000
1.00000 1.00000 0.99999 0.99998 1.00001
1.00001 0.99999 1.00002 1.00001 1.00000
1.00001 1.00000 0.99998 0.99998 1.00001
0.99999 1.00000 1.00001 1.00002 1.00001
1.00000 0.99999 0.99998 1.00002 1.00001
1.00000 1.00002 0.99997 1.00001 1.00000
1.00002 0.99998 1.00000 0.99999 0.99999
0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000
1.00000 0.99997 0.99999 1.00000 1.00001
0.99999 1.00000 1.00000 1.00003 0.99999
1.00004 1.00001 0.99998 1.00000 0.99999
1.00004
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 51102 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000
1.00000 1.00002 1.00001 0.99999 0.99999
1.00000 1.00002 1.00003 0.99999 1.00001
0.99998 1.00002 0.99998 0.99998 0.99999
1.00002 1.00003 1.00000 1.00000 1.00000
1.00002 1.00001 0.99999 1.00004 1.00002
1.00003 1.00001 1.00001 0.99999 0.99997
0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 0.99997
0.99998 0.99999 1.00002 1.00000 1.00002
1.00000 0.99998 1.00000 0.99998 1.00000
1.00000 1.00000 0.99999 0.99998 1.00001
1.00001 0.99999 1.00002 1.00001 1.00000
1.00001 1.00000 0.99998 0.99998 1.00001
0.99999 1.00000 1.00001 1.00002 1.00001
1.00000 0.99999 0.99998 1.00002 1.00001
1.00000 1.00002 0.99997 1.00001 1.00000
1.00002 0.99998 1.00000 0.99999 0.99999
0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000
1.00000 0.99997 0.99999 1.00000 1.00001
0.99999 1.00000 1.00000 1.00003 0.99999
1.00004 1.00001 0.99998 1.00000 0.99999
1.00004
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2: 0.000
Vector 3: 0.000 0.000
Vector 4:-0.000 0.000 0.000
Vector 5: 0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 6:-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000
Vector 7:-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000
Vector 8: 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000
Vector 9:-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000
Vector 10: 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2604262027292517067.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2604262027292517067.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 2604262027292517067.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2604262027292517067.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 374
First residue number = 1
Last residue number = 374
Number of atoms found = 2839
Mean number per residue = 7.6
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9906E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9945E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0003E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8995
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.262
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.690
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.560
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.107
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.291
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.933
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.082
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.299
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.920
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.903
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.25
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.00
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.47
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.47
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.32
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.44
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.87
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.16
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.49
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.45
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.45
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.96
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.71
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.16
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.18
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.08
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.51
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.80
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.69
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.49
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.41
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.86
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.58
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.54
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.29
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.85
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.25
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.24
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.11
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.00
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.45
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.96
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.07
Bfactors> 106 vectors, 8517 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.899500
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= -0.765 for 374 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.032 +/- 0.04
Bfactors> = 95.927 +/- 1.05
Bfactors> Shiftng-fct= 95.895
Bfactors> Scaling-fct= 30.063
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2604262027292517067.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2604262027292517067.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4322E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4329E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 103.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 122.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 141.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 173.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 220.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 249.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 264.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 289.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 293.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 324.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 341.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 347.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 350.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 374.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 380.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 393.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 406.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 420.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 427.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 433.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 440.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 451.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 462.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 466.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 471.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 484.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 487.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 493.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 496.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 504.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 518.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 519.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 524.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 532.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 544.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 548.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 558.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 567.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 568.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 574.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 581.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 590.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 596.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 599.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 606.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 611.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 616.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 619.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 624.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 637.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 639.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 643.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 649.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 651.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 661.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 663.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 670.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 675.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 678.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 683.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 691.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 693.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 699.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 711.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 713.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 713.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 719.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 723.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 725.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 727.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 731.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 741.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 746.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 748.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 751.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 754.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 756.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 758.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 763.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 770.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 777.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 781.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 789.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 792.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 797.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 798.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 802.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 806.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 808.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 813.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 817.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 819.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 825.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 828.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 830.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 836.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 840.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 842.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 846.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 848.6
Chkmod> 106 vectors, 8517 coordinates in file.
Chkmod> That is: 2839 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.8536
0.0034 0.9765
0.0034 0.7219
0.0034 0.9788
0.0034 0.7743
0.0034 0.7416
102.9858 0.4122
121.9850 0.6945
141.1627 0.5550
173.7387 0.2804
220.0589 0.4840
249.7730 0.5607
264.4928 0.1215
288.9712 0.6040
293.3650 0.6424
324.3090 0.0447
341.7118 0.1834
347.6471 0.4017
350.6863 0.3441
374.4273 0.4007
380.8283 0.2801
393.6174 0.2496
406.0039 0.3522
420.5545 0.3578
427.0924 0.3534
433.2596 0.2894
440.6801 0.2548
451.9086 0.2119
462.8647 0.1973
466.2911 0.3748
471.9463 0.3061
484.5206 0.3540
487.0692 0.3132
493.0841 0.3655
496.0642 0.3289
504.3148 0.2930
518.6081 0.2966
519.7436 0.2602
524.5985 0.4142
532.2964 0.3322
544.6681 0.4436
548.2284 0.4632
558.4567 0.4783
567.3590 0.6055
568.9156 0.6144
574.1762 0.5204
581.8261 0.4436
590.7755 0.4433
596.3378 0.4692
599.8862 0.4314
606.4351 0.4793
611.6622 0.3869
615.9843 0.3586
619.0394 0.1703
624.5387 0.3435
637.8949 0.4758
639.8328 0.5073
643.3247 0.3409
649.7079 0.4347
651.8821 0.4163
661.3991 0.3226
663.1794 0.4060
669.9896 0.3972
675.4232 0.2836
678.3845 0.1736
683.0613 0.4965
691.0415 0.3803
693.5112 0.3493
699.4366 0.3592
711.3051 0.4635
713.1262 0.2525
713.7872 0.4373
719.2998 0.2817
723.6308 0.4027
725.5022 0.4867
727.2877 0.3032
731.6520 0.2260
741.0993 0.2549
746.2522 0.3538
748.6972 0.3146
751.5267 0.3964
754.5799 0.3259
756.0629 0.3957
758.9426 0.3517
763.6664 0.3796
770.1239 0.3201
777.3625 0.3350
781.4471 0.4143
789.6277 0.4916
792.3110 0.2562
797.3547 0.4602
798.0938 0.3843
801.9993 0.4168
806.1054 0.4573
808.0047 0.4377
813.6036 0.5115
817.0022 0.4687
819.8116 0.4118
825.3304 0.3207
828.4674 0.4217
830.1736 0.2074
836.1881 0.3858
840.8285 0.3439
842.9294 0.4027
846.5585 0.4116
848.5757 0.2137
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2604262027292517067 7 -50 50 10 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-50
2604262027292517067.eigenfacs
2604262027292517067.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2604262027292517067.eigenfacs
2604262027292517067.atom
calculating perturbed structure for DQ=-30
2604262027292517067.eigenfacs
2604262027292517067.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2604262027292517067.eigenfacs
2604262027292517067.atom
calculating perturbed structure for DQ=-10
2604262027292517067.eigenfacs
2604262027292517067.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2604262027292517067.eigenfacs
2604262027292517067.atom
calculating perturbed structure for DQ=10
2604262027292517067.eigenfacs
2604262027292517067.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2604262027292517067.eigenfacs
2604262027292517067.atom
calculating perturbed structure for DQ=30
2604262027292517067.eigenfacs
2604262027292517067.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2604262027292517067.eigenfacs
2604262027292517067.atom
calculating perturbed structure for DQ=50
2604262027292517067.eigenfacs
2604262027292517067.atom
making animated gifs
11 models are in 2604262027292517067.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604262027292517067.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604262027292517067.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 2604262027292517067 8 -50 50 10 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-50
2604262027292517067.eigenfacs
2604262027292517067.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2604262027292517067.eigenfacs
2604262027292517067.atom
calculating perturbed structure for DQ=-30
2604262027292517067.eigenfacs
2604262027292517067.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2604262027292517067.eigenfacs
2604262027292517067.atom
calculating perturbed structure for DQ=-10
2604262027292517067.eigenfacs
2604262027292517067.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2604262027292517067.eigenfacs
2604262027292517067.atom
calculating perturbed structure for DQ=10
2604262027292517067.eigenfacs
2604262027292517067.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2604262027292517067.eigenfacs
2604262027292517067.atom
calculating perturbed structure for DQ=30
2604262027292517067.eigenfacs
2604262027292517067.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2604262027292517067.eigenfacs
2604262027292517067.atom
calculating perturbed structure for DQ=50
2604262027292517067.eigenfacs
2604262027292517067.atom
making animated gifs
11 models are in 2604262027292517067.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604262027292517067.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604262027292517067.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 2604262027292517067 9 -50 50 10 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-50
2604262027292517067.eigenfacs
2604262027292517067.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2604262027292517067.eigenfacs
2604262027292517067.atom
calculating perturbed structure for DQ=-30
2604262027292517067.eigenfacs
2604262027292517067.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2604262027292517067.eigenfacs
2604262027292517067.atom
calculating perturbed structure for DQ=-10
2604262027292517067.eigenfacs
2604262027292517067.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2604262027292517067.eigenfacs
2604262027292517067.atom
calculating perturbed structure for DQ=10
2604262027292517067.eigenfacs
2604262027292517067.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2604262027292517067.eigenfacs
2604262027292517067.atom
calculating perturbed structure for DQ=30
2604262027292517067.eigenfacs
2604262027292517067.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2604262027292517067.eigenfacs
2604262027292517067.atom
calculating perturbed structure for DQ=50
2604262027292517067.eigenfacs
2604262027292517067.atom
making animated gifs
11 models are in 2604262027292517067.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604262027292517067.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604262027292517067.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 2604262027292517067 10 -50 50 10 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-50
2604262027292517067.eigenfacs
2604262027292517067.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2604262027292517067.eigenfacs
2604262027292517067.atom
calculating perturbed structure for DQ=-30
2604262027292517067.eigenfacs
2604262027292517067.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2604262027292517067.eigenfacs
2604262027292517067.atom
calculating perturbed structure for DQ=-10
2604262027292517067.eigenfacs
2604262027292517067.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2604262027292517067.eigenfacs
2604262027292517067.atom
calculating perturbed structure for DQ=10
2604262027292517067.eigenfacs
2604262027292517067.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2604262027292517067.eigenfacs
2604262027292517067.atom
calculating perturbed structure for DQ=30
2604262027292517067.eigenfacs
2604262027292517067.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2604262027292517067.eigenfacs
2604262027292517067.atom
calculating perturbed structure for DQ=50
2604262027292517067.eigenfacs
2604262027292517067.atom
making animated gifs
11 models are in 2604262027292517067.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604262027292517067.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604262027292517067.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 2604262027292517067 11 -50 50 10 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-50
2604262027292517067.eigenfacs
2604262027292517067.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2604262027292517067.eigenfacs
2604262027292517067.atom
calculating perturbed structure for DQ=-30
2604262027292517067.eigenfacs
2604262027292517067.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2604262027292517067.eigenfacs
2604262027292517067.atom
calculating perturbed structure for DQ=-10
2604262027292517067.eigenfacs
2604262027292517067.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2604262027292517067.eigenfacs
2604262027292517067.atom
calculating perturbed structure for DQ=10
2604262027292517067.eigenfacs
2604262027292517067.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2604262027292517067.eigenfacs
2604262027292517067.atom
calculating perturbed structure for DQ=30
2604262027292517067.eigenfacs
2604262027292517067.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2604262027292517067.eigenfacs
2604262027292517067.atom
calculating perturbed structure for DQ=50
2604262027292517067.eigenfacs
2604262027292517067.atom
making animated gifs
11 models are in 2604262027292517067.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604262027292517067.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604262027292517067.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
2604262027292517067.10.pdb
2604262027292517067.11.pdb
2604262027292517067.7.pdb
2604262027292517067.8.pdb
2604262027292517067.9.pdb
STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 0m20.631s
user 0m20.532s
sys 0m0.090s
rm: cannot remove '2604262027292517067.sdijf': No such file or directory
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:
elNémo
is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed
by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Between 2015 and 2025, it was hosted by US2B (Nantes).
Last modification: april 24th, 2026.
|