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LOGs for ID: 2604270914072637783

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2604270914072637783.atom Pdbmat> Distance cutoff = 10.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2604270914072637783.atom to be opened. Openam> File opened: 2604270914072637783.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 401 First residue number = 3 Last residue number = 410 Number of atoms found = 401 Mean number per residue = 1.0 Pdbmat> Coordinate statistics: = 43.865870 +/- 14.755032 From: 14.696000 To: 76.710000 = 13.256626 +/- 11.442503 From: -12.134000 To: 37.672000 = 46.847035 +/- 10.403271 From: 8.621000 To: 68.684000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 4.9043 % Filled. Pdbmat> 35517 non-zero elements. Pdbmat> 3679 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 18.35 +/- 5.62 Maximum number = 32 Minimum number = 5 Pdbmat> Matrix trace = 73580.0 Pdbmat> Larger element = 132.016 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 401 non-zero elements, NRBL set to 3 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2604270914072637783.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 3 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2604270914072637783.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2604270914072637783.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 401 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 3 residue(s) per block. Blocpdb> 401 residues. Blocpdb> 3 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 3 atoms in block 2 Block first atom: 4 Blocpdb> 3 atoms in block 3 Block first atom: 7 Blocpdb> 3 atoms in block 4 Block first atom: 10 Blocpdb> 3 atoms in block 5 Block first atom: 13 Blocpdb> 3 atoms in block 6 Block first atom: 16 Blocpdb> 3 atoms in block 7 Block first atom: 19 Blocpdb> 3 atoms in block 8 Block first atom: 22 Blocpdb> 3 atoms in block 9 Block first atom: 25 Blocpdb> 3 atoms in block 10 Block first atom: 28 Blocpdb> 3 atoms in block 11 Block first atom: 31 Blocpdb> 3 atoms in block 12 Block first atom: 34 Blocpdb> 3 atoms in block 13 Block first atom: 37 Blocpdb> 3 atoms in block 14 Block first atom: 40 Blocpdb> 3 atoms in block 15 Block first atom: 43 Blocpdb> 3 atoms in block 16 Block first atom: 46 Blocpdb> 3 atoms in block 17 Block first atom: 49 Blocpdb> 3 atoms in block 18 Block first atom: 52 Blocpdb> 3 atoms in block 19 Block first atom: 55 Blocpdb> 3 atoms in block 20 Block first atom: 58 %Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 21 i.e., less than what is required for a rigid body. %Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 62th, in residue A 64 %Blocpdb-Wn> It will be merged with next block. Blocpdb> 5 atoms in block 21 Block first atom: 61 Blocpdb> 3 atoms in block 22 Block first atom: 66 Blocpdb> 3 atoms in block 23 Block first atom: 69 Blocpdb> 3 atoms in block 24 Block first atom: 72 Blocpdb> 3 atoms in block 25 Block first atom: 75 Blocpdb> 3 atoms in block 26 Block first atom: 78 Blocpdb> 3 atoms in block 27 Block first atom: 81 Blocpdb> 3 atoms in block 28 Block first atom: 84 Blocpdb> 3 atoms in block 29 Block first atom: 87 Blocpdb> 3 atoms in block 30 Block first atom: 90 Blocpdb> 3 atoms in block 31 Block first atom: 93 Blocpdb> 3 atoms in block 32 Block first atom: 96 Blocpdb> 3 atoms in block 33 Block first atom: 99 Blocpdb> 3 atoms in block 34 Block first atom: 102 Blocpdb> 3 atoms in block 35 Block first atom: 105 Blocpdb> 3 atoms in block 36 Block first atom: 108 Blocpdb> 3 atoms in block 37 Block first atom: 111 Blocpdb> 3 atoms in block 38 Block first atom: 114 Blocpdb> 3 atoms in block 39 Block first atom: 117 Blocpdb> 3 atoms in block 40 Block first atom: 120 %Blocpdb-Wn> 1 atoms in block 41 i.e., less than what is required for a rigid body. %Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 123th, in residue A 126 %Blocpdb-Wn> It will be merged with next block. Blocpdb> 3 atoms in block 41 Block first atom: 123 Blocpdb> 3 atoms in block 42 Block first atom: 126 Blocpdb> 3 atoms in block 43 Block first atom: 129 Blocpdb> 3 atoms in block 44 Block first atom: 132 Blocpdb> 3 atoms in block 45 Block first atom: 135 Blocpdb> 3 atoms in block 46 Block first atom: 138 Blocpdb> 3 atoms in block 47 Block first atom: 141 %Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 48 i.e., less than what is required for a rigid body. %Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 145th, in residue A 152 %Blocpdb-Wn> It will be merged with next block. Blocpdb> 5 atoms in block 48 Block first atom: 144 Blocpdb> 3 atoms in block 49 Block first atom: 149 Blocpdb> 3 atoms in block 50 Block first atom: 152 Blocpdb> 3 atoms in block 51 Block first atom: 155 Blocpdb> 3 atoms in block 52 Block first atom: 158 Blocpdb> 3 atoms in block 53 Block first atom: 161 Blocpdb> 3 atoms in block 54 Block first atom: 164 Blocpdb> 3 atoms in block 55 Block first atom: 167 Blocpdb> 3 atoms in block 56 Block first atom: 170 Blocpdb> 3 atoms in block 57 Block first atom: 173 Blocpdb> 3 atoms in block 58 Block first atom: 176 Blocpdb> 3 atoms in block 59 Block first atom: 179 Blocpdb> 3 atoms in block 60 Block first atom: 182 Blocpdb> 3 atoms in block 61 Block first atom: 185 Blocpdb> 3 atoms in block 62 Block first atom: 188 Blocpdb> 3 atoms in block 63 Block first atom: 191 Blocpdb> 3 atoms in block 64 Block first atom: 194 Blocpdb> 3 atoms in block 65 Block first atom: 197 Blocpdb> 3 atoms in block 66 Block first atom: 200 Blocpdb> 3 atoms in block 67 Block first atom: 203 Blocpdb> 3 atoms in block 68 Block first atom: 206 Blocpdb> 3 atoms in block 69 Block first atom: 209 Blocpdb> 3 atoms in block 70 Block first atom: 212 Blocpdb> 3 atoms in block 71 Block first atom: 215 Blocpdb> 3 atoms in block 72 Block first atom: 218 Blocpdb> 3 atoms in block 73 Block first atom: 221 Blocpdb> 3 atoms in block 74 Block first atom: 224 Blocpdb> 3 atoms in block 75 Block first atom: 227 Blocpdb> 3 atoms in block 76 Block first atom: 230 Blocpdb> 3 atoms in block 77 Block first atom: 233 Blocpdb> 3 atoms in block 78 Block first atom: 236 Blocpdb> 3 atoms in block 79 Block first atom: 239 Blocpdb> 3 atoms in block 80 Block first atom: 242 Blocpdb> 3 atoms in block 81 Block first atom: 245 Blocpdb> 3 atoms in block 82 Block first atom: 248 Blocpdb> 3 atoms in block 83 Block first atom: 251 Blocpdb> 3 atoms in block 84 Block first atom: 254 Blocpdb> 3 atoms in block 85 Block first atom: 257 Blocpdb> 3 atoms in block 86 Block first atom: 260 Blocpdb> 3 atoms in block 87 Block first atom: 263 Blocpdb> 3 atoms in block 88 Block first atom: 266 Blocpdb> 3 atoms in block 89 Block first atom: 269 Blocpdb> 3 atoms in block 90 Block first atom: 272 Blocpdb> 3 atoms in block 91 Block first atom: 275 Blocpdb> 3 atoms in block 92 Block first atom: 278 Blocpdb> 3 atoms in block 93 Block first atom: 281 Blocpdb> 3 atoms in block 94 Block first atom: 284 Blocpdb> 3 atoms in block 95 Block first atom: 287 Blocpdb> 3 atoms in block 96 Block first atom: 290 Blocpdb> 3 atoms in block 97 Block first atom: 293 Blocpdb> 3 atoms in block 98 Block first atom: 296 Blocpdb> 3 atoms in block 99 Block first atom: 299 Blocpdb> 3 atoms in block 100 Block first atom: 302 Blocpdb> 3 atoms in block 101 Block first atom: 305 Blocpdb> 3 atoms in block 102 Block first atom: 308 Blocpdb> 3 atoms in block 103 Block first atom: 311 Blocpdb> 3 atoms in block 104 Block first atom: 314 Blocpdb> 3 atoms in block 105 Block first atom: 317 Blocpdb> 3 atoms in block 106 Block first atom: 320 Blocpdb> 3 atoms in block 107 Block first atom: 323 Blocpdb> 3 atoms in block 108 Block first atom: 326 Blocpdb> 3 atoms in block 109 Block first atom: 329 Blocpdb> 3 atoms in block 110 Block first atom: 332 Blocpdb> 3 atoms in block 111 Block first atom: 335 Blocpdb> 3 atoms in block 112 Block first atom: 338 Blocpdb> 3 atoms in block 113 Block first atom: 341 Blocpdb> 3 atoms in block 114 Block first atom: 344 Blocpdb> 3 atoms in block 115 Block first atom: 347 Blocpdb> 3 atoms in block 116 Block first atom: 350 Blocpdb> 3 atoms in block 117 Block first atom: 353 Blocpdb> 3 atoms in block 118 Block first atom: 356 Blocpdb> 3 atoms in block 119 Block first atom: 359 Blocpdb> 3 atoms in block 120 Block first atom: 362 Blocpdb> 3 atoms in block 121 Block first atom: 365 Blocpdb> 3 atoms in block 122 Block first atom: 368 Blocpdb> 3 atoms in block 123 Block first atom: 371 Blocpdb> 3 atoms in block 124 Block first atom: 374 Blocpdb> 3 atoms in block 125 Block first atom: 377 Blocpdb> 3 atoms in block 126 Block first atom: 380 Blocpdb> 3 atoms in block 127 Block first atom: 383 Blocpdb> 3 atoms in block 128 Block first atom: 386 Blocpdb> 3 atoms in block 129 Block first atom: 389 Blocpdb> 3 atoms in block 130 Block first atom: 392 Blocpdb> 3 atoms in block 131 Block first atom: 395 %Blocpdb-Wn> 1 atoms in block 132 i.e., less than what is required for a rigid body. %Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 398th, in residue A 406 %Blocpdb-Wn> It will be merged with next block. Blocpdb> 4 atoms in block 132 Block first atom: 397 Blocpdb> 132 blocks. Blocpdb> At most, 5 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 3 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 35649 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 1203 Prepmat> Matrix trace = 73580.0000 Prepmat> Last element read: 1203 1203 44.7987 Prepmat> 8779 lines saved. Prepmat> 7846 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 401 RTB> Total mass = 401.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 401 RTB> Number of blocks = 132 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 44761.6834 RTB> 31572 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 792 Diagstd> Nb of non-zero elements: 31572 Diagstd> Projected matrix trace = 44761.6834 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 792 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 44761.6834 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0011915 0.0035657 0.0131366 0.0510336 0.1790776 0.3667293 0.4416659 0.6666667 0.7043049 0.9188442 1.3168233 1.3949165 1.4943624 1.7542303 1.9935098 2.0188004 2.2080493 2.2632762 2.4771582 2.6287493 2.7850921 2.9318156 3.0336261 3.1657277 3.4125409 3.4868252 3.5363560 3.8576869 4.0893862 4.2855065 4.4043997 4.4778379 4.6214852 4.7017326 4.9780955 5.0339870 5.1001418 5.4007619 5.7245561 5.8881643 6.1526314 6.2369741 6.2985202 6.4565266 6.8653800 6.9900800 7.1977545 7.3178965 7.4792703 7.5082039 8.0232800 8.1213252 8.1961112 8.2759216 8.5785336 8.6292558 8.7694763 8.9629933 9.0059932 9.1522185 9.3217944 9.3379083 9.5302180 9.6264496 9.8232020 10.2787121 10.3660087 10.6216461 10.7965761 11.0043527 11.1835855 11.3467872 11.5264049 11.6914109 11.7860414 11.9815436 12.0642924 12.2452397 12.5423459 12.8022184 12.9569521 13.1493632 13.2417124 13.3575581 13.4340070 13.7549755 13.9104556 14.1033269 14.1498130 14.3483838 14.6173263 14.6773192 14.9442483 15.1659480 15.4499240 15.6626095 15.8788550 15.9092431 16.0609928 16.1206237 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034336 0.0034337 0.0034339 0.0034339 0.0034339 0.0034340 3.7483774 6.4843357 12.4462184 24.5314532 45.9532206 65.7609479 72.1675938 88.6644750 91.1329933 104.0917299 124.6117598 128.2535456 132.7465522 143.8263895 153.3219963 154.2914901 161.3614035 163.3668979 170.9118396 176.0637170 181.2237287 185.9360528 189.1369183 193.2110920 200.6015157 202.7731142 204.2082432 213.2842401 219.5959600 224.8000278 227.8970187 229.7891214 233.4458003 235.4638512 242.2852030 243.6415334 245.2372329 252.3613241 259.8161768 263.5028044 269.3554265 271.1953566 272.5301428 275.9273507 284.5296762 287.1020899 291.3357598 293.7571273 296.9784211 297.5522980 307.5893219 309.4629998 310.8845947 312.3945604 318.0546934 318.9935872 321.5748748 325.1036273 325.8825368 328.5174698 331.5469529 331.8333883 335.2329489 336.9212099 340.3469147 348.1485821 349.6238607 353.9086632 356.8110582 360.2280529 363.1498020 365.7899213 368.6737491 371.3032429 372.8028827 375.8821183 377.1778740 379.9959132 384.5782041 388.5419325 390.8829323 393.7745476 395.1548862 396.8796363 398.0137403 402.7403938 405.0101963 407.8083061 408.4798434 411.3360497 415.1731426 416.0242536 419.7902216 422.8925768 426.8334572 429.7613356 432.7179106 433.1317693 435.1925722 435.9997097 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 401 Rtb_to_modes> Number of blocs = 132 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9978E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9985E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9994E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9994E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9999E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.1915E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.5657E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.3137E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.1034E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1791 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3667 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4417 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6667 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7043 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9188 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.317 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.395 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.494 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.754 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.994 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.019 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.208 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.263 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.477 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.629 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.785 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.932 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.034 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.166 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.413 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.487 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.536 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.858 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.089 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.286 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.404 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.478 Rdmodfacs> Eigenvector 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Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 0.99999 1.00000 0.99999 0.99998 1.00001 1.00000 1.00003 0.99997 0.99995 1.00005 1.00000 0.99998 1.00001 1.00002 1.00000 0.99996 1.00001 1.00001 1.00001 1.00003 1.00001 0.99998 0.99999 0.99998 1.00000 1.00000 1.00002 1.00003 0.99998 1.00000 1.00000 0.99998 0.99999 1.00001 0.99999 1.00002 0.99999 0.99998 1.00000 1.00001 1.00002 1.00001 0.99998 0.99999 1.00004 1.00000 1.00002 1.00000 1.00004 1.00000 1.00004 1.00001 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000 1.00001 1.00003 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 1.00002 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00002 0.99999 0.99999 0.99999 1.00001 1.00000 1.00003 0.99999 1.00000 1.00001 1.00003 0.99999 1.00002 1.00004 1.00000 0.99998 0.99998 0.99999 0.99998 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 1.00001 0.99999 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 0.99997 0.99999 1.00001 1.00001 0.99996 1.00001 0.99999 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3: 0.000 0.000 Vector 4: 0.000-0.000 0.000 Vector 5:-0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 6:-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 7: 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 8:-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 9:-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 10: 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2604270914072637783.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2604270914072637783.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2604270914072637783.atom Openam> file on opening on unit 11: 2604270914072637783.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 401 First residue number = 3 Last residue number = 410 Number of atoms found = 401 Mean number per residue = 1.0 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9978E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9985E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9994E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9994E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9999E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.1915E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.5657E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.3137E-02 Rdmodfacs> 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lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.494 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.754 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.994 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.019 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.208 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.263 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.477 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.629 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.785 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du 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lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.152 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.322 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.338 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.530 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.626 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.823 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.12 Bfactors> 106 vectors, 1203 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.001192 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.341 for 401 C-alpha atoms. Bfactors> = 48.261 +/- 346.52 Bfactors> = 12.396 +/- 7.34 Bfactors> Shiftng-fct= -35.865 Bfactors> Scaling-fct= 0.021 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2604270914072637783.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2604270914072637783.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4334E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.748 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 6.484 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 12.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 24.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 45.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 65.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 72.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 88.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 91.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 104.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 124.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 128.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 132.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 143.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 153.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 154.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 161.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 163.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 170.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 176.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 181.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 185.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 189.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 193.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 200.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 202.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 204.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 213.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 219.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 224.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 227.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 229.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 233.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 235.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 242.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 243.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 245.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 252.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 259.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 263.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 269.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 271.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 272.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 275.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 284.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 287.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 291.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 293.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 297.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 297.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 307.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 309.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 310.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 312.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 318.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 319.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 321.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 325.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 325.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 328.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 331.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 331.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 335.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 336.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 340.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 348.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 349.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 353.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 356.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 360.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 363.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 365.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 368.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 371.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 372.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 375.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 377.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 380.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 384.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 388.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 390.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 393.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 395.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 396.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 397.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 402.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 405.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 407.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 408.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 411.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 415.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 416.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 419.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 422.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 426.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 429.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 432.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 433.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 435.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 436.0 Chkmod> 106 vectors, 1203 coordinates in file. Chkmod> That is: 401 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 7 is: 1.0001 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 10 is: 1.0001 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 84 is: 1.0002 (instead of 1.0000). Chkmod> Normal end. 0.0034 0.7381 0.0034 0.7388 0.0034 0.9021 0.0034 0.7144 0.0034 0.9250 0.0034 0.7743 3.7482 0.0357 6.4841 0.0270 12.4459 0.0179 24.5305 0.0351 45.9541 0.0285 65.7555 0.3895 72.1673 0.2882 88.6629 0.2528 91.1288 0.1169 104.0848 0.5350 124.6148 0.0204 128.2519 0.5433 132.7248 0.1631 143.8108 0.1723 153.3343 0.4214 154.2925 0.4638 161.3527 0.3864 163.3499 0.5233 170.8990 0.0783 176.0646 0.5883 181.2130 0.5048 185.9339 0.1733 189.1405 0.3599 193.2111 0.4550 200.6064 0.5495 202.7695 0.4239 204.1892 0.3356 213.2837 0.1708 219.5762 0.5812 224.8033 0.0149 227.8769 0.3688 229.7834 0.2765 233.4235 0.2861 235.4604 0.2631 242.2725 0.3373 243.6314 0.4412 245.2233 0.3835 252.3561 0.4068 259.8151 0.2257 263.4878 0.6313 269.3519 0.5003 271.1843 0.3757 272.5288 0.3758 275.9256 0.4542 284.5096 0.5004 287.0881 0.4343 291.3282 0.6038 293.7466 0.5505 296.9603 0.3951 297.5355 0.3925 307.5708 0.5306 309.4435 0.5298 310.8691 0.5264 312.3826 0.4348 318.0497 0.5890 318.9752 0.4501 321.5523 0.5258 325.0898 0.4725 325.8687 0.5679 328.4994 0.2034 331.5364 0.4981 331.8208 0.5404 335.2147 0.5546 336.8989 0.4533 340.3288 0.5046 348.1554 0.4800 349.6762 0.5437 353.8660 0.3539 356.8523 0.5011 360.1413 0.3979 363.0760 0.5216 365.8260 0.3090 368.7154 0.4743 371.2649 0.3947 372.8495 0.4613 375.8418 0.4665 377.0946 0.5380 380.0535 0.3768 384.5257 0.5061 388.4916 0.5193 390.9121 0.4801 393.7672 0.4940 395.1124 0.4475 396.8989 0.4324 397.9373 0.3950 402.6503 0.4726 404.9862 0.4434 407.7427 0.4560 408.4650 0.4777 411.3416 0.4109 415.1933 0.4614 416.0444 0.4068 419.7125 0.4795 422.9309 0.5170 426.8162 0.3950 429.7071 0.5076 432.7149 0.4946 433.1235 0.0143 435.1604 0.5850 435.9726 0.3824 Project conformational change on normal modes: Projmod> Version 1.36, April 2003. Projmod> Projection of a difference vector on a set of eigenvectors. Getnam> CERFACS file with the eigenvectors ? Getnam> 2604270914072637783.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2604270914072637783.eigenfacs Getnam> Pdb file with the reference structure ? Getnam> 2604270914072637783.atom Openam> file on opening on unit 11: 2604270914072637783.atom Getnam> Pdb file with the other conformer ? Getnam> 2604270914072637783.atom2 Openam> file on opening on unit 12: 2604270914072637783.atom2 Getrep> Are the masses given in the pdb file ? (y/n) Getrep> F Projmod> All masses will all be assumed to be of 1. Getrep> Displacement along one mode ? (y/n) Getrep> F Openam> file on opening on unit 13: projmod.res Openam> file on opening on unit 14: dr.res Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4334E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.748 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 6.484 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 12.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 24.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 45.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 65.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 72.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 88.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 91.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 104.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 124.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 128.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 132.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 143.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 153.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 154.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 161.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 163.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 170.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 176.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 181.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 185.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 189.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 193.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 200.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 202.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 204.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 213.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 219.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 224.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 227.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 229.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 233.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 235.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 242.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 243.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 245.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 252.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 259.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 263.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 269.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 271.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 272.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 275.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 284.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 287.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 291.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 293.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 297.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 297.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 307.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 309.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 310.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 312.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 318.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 319.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 321.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 325.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 325.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 328.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 331.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 331.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 335.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 336.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 340.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 348.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 349.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 353.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 356.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 360.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 363.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 365.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 368.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 371.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 372.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 375.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 377.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 380.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 384.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 388.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 390.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 393.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 395.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 396.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 397.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 402.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 405.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 407.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 408.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 411.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 415.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 416.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 419.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 422.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 426.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 429.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 432.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 433.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 435.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 436.0 Projmod> 106 vectors, 1203 coordinates in file. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 401 First residue number = 3 Last residue number = 410 Number of atoms found = 401 Mean number per residue = 1.0 Projmod> Cartesian (eigen)vectors will be studied. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 401 First residue number = 3 Last residue number = 410 Number of atoms found = 401 Mean number per residue = 1.0 Projmod> File dr.res: displacement=f(atom number). Projmod> 401 atoms are considered. Projmod> Atomic r.m.s. displacements= 1.66 Projmod> Atomic average masses = 1.00 +/- 0.00 Projmod> File projmod.res: dr.vector=f(fqcy), and cumulative square sum. Vector: 1 F= 0.00 Cos= -0.000 Sum= 0.000 q= -0.0002 Vector: 2 F= 0.00 Cos= -0.000 Sum= 0.000 q= -0.0004 Vector: 3 F= 0.00 Cos= 0.000 Sum= 0.000 q= 0.0002 Vector: 4 F= 0.00 Cos= 0.000 Sum= 0.000 q= 0.0005 Vector: 5 F= 0.00 Cos= 0.000 Sum= 0.000 q= 0.0005 Vector: 6 F= 0.00 Cos= 0.000 Sum= 0.000 q= 0.0003 %Projmod-Wn> Eigenvector 7 Norm= 1.0001 Vector: 7 F= 3.75 Cos= 0.062 Sum= 0.004 q= 2.0576 Vector: 8 F= 6.48 Cos= 0.245 Sum= 0.064 q= 8.1296 Vector: 9 F= 12.45 Cos= 0.024 Sum= 0.064 q= 0.7951 %Projmod-Wn> Eigenvector 10 Norm= 1.0001 Vector: 10 F= 24.53 Cos= -0.108 Sum= 0.076 q= -3.5796 Vector: 11 F= 45.95 Cos= -0.035 Sum= 0.077 q= -1.1655 Vector: 12 F= 65.76 Cos= 0.603 Sum= 0.441 q= 20.0114 Vector: 13 F= 72.17 Cos= 0.377 Sum= 0.583 q= 12.5078 Vector: 14 F= 88.66 Cos= -0.138 Sum= 0.602 q= -4.5735 Vector: 15 F= 91.13 Cos= 0.256 Sum= 0.667 q= 8.4997 Vector: 16 F= 104.08 Cos= 0.202 Sum= 0.708 q= 6.6914 Vector: 17 F= 124.61 Cos= 0.076 Sum= 0.713 q= 2.5158 Vector: 18 F= 128.25 Cos= 0.259 Sum= 0.780 q= 8.5829 Vector: 19 F= 132.72 Cos= 0.063 Sum= 0.784 q= 2.1029 Vector: 20 F= 143.81 Cos= -0.056 Sum= 0.787 q= -1.8428 Vector: 21 F= 153.33 Cos= -0.183 Sum= 0.821 q= -6.0826 Vector: 22 F= 154.29 Cos= -0.038 Sum= 0.822 q= -1.2492 Vector: 23 F= 161.35 Cos= -0.006 Sum= 0.822 q= -0.2059 Vector: 24 F= 163.35 Cos= -0.020 Sum= 0.823 q= -0.6638 Vector: 25 F= 170.90 Cos= 0.029 Sum= 0.824 q= 0.9498 Vector: 26 F= 176.06 Cos= 0.012 Sum= 0.824 q= 0.3820 Vector: 27 F= 181.21 Cos= 0.016 Sum= 0.824 q= 0.5198 Vector: 28 F= 185.93 Cos= -0.043 Sum= 0.826 q= -1.4199 Vector: 29 F= 189.14 Cos= -0.069 Sum= 0.831 q= -2.2815 Vector: 30 F= 193.21 Cos= 0.031 Sum= 0.832 q= 1.0201 Vector: 31 F= 200.61 Cos= -0.049 Sum= 0.834 q= -1.6192 Vector: 32 F= 202.77 Cos= -0.056 Sum= 0.837 q= -1.8491 Vector: 33 F= 204.19 Cos= -0.030 Sum= 0.838 q= -0.9869 Vector: 34 F= 213.28 Cos= -0.012 Sum= 0.838 q= -0.3871 Vector: 35 F= 219.58 Cos= -0.017 Sum= 0.838 q= -0.5760 Vector: 36 F= 224.80 Cos= -0.054 Sum= 0.841 q= -1.7995 Vector: 37 F= 227.88 Cos= -0.057 Sum= 0.845 q= -1.8989 Vector: 38 F= 229.78 Cos= 0.021 Sum= 0.845 q= 0.7102 Vector: 39 F= 233.42 Cos= -0.025 Sum= 0.846 q= -0.8239 Vector: 40 F= 235.46 Cos= 0.103 Sum= 0.856 q= 3.4056 Vector: 41 F= 242.27 Cos= 0.035 Sum= 0.857 q= 1.1613 Vector: 42 F= 243.63 Cos= 0.014 Sum= 0.858 q= 0.4580 Vector: 43 F= 245.22 Cos= 0.034 Sum= 0.859 q= 1.1384 Vector: 44 F= 252.36 Cos= 0.028 Sum= 0.859 q= 0.9147 Vector: 45 F= 259.82 Cos= -0.101 Sum= 0.870 q= -3.3424 Vector: 46 F= 263.49 Cos= -0.000 Sum= 0.870 q= -0.0054 Vector: 47 F= 269.35 Cos= -0.031 Sum= 0.871 q= -1.0160 Vector: 48 F= 271.18 Cos= -0.023 Sum= 0.871 q= -0.7477 Vector: 49 F= 272.53 Cos= 0.014 Sum= 0.871 q= 0.4580 Vector: 50 F= 275.93 Cos= -0.003 Sum= 0.871 q= -0.1033 Vector: 51 F= 284.51 Cos= -0.022 Sum= 0.872 q= -0.7323 Vector: 52 F= 287.09 Cos= 0.007 Sum= 0.872 q= 0.2347 Vector: 53 F= 291.33 Cos= -0.038 Sum= 0.873 q= -1.2585 Vector: 54 F= 293.75 Cos= -0.023 Sum= 0.874 q= -0.7564 Vector: 55 F= 296.96 Cos= -0.008 Sum= 0.874 q= -0.2557 Vector: 56 F= 297.54 Cos= 0.008 Sum= 0.874 q= 0.2545 Vector: 57 F= 307.57 Cos= 0.019 Sum= 0.874 q= 0.6248 Vector: 58 F= 309.44 Cos= -0.033 Sum= 0.875 q= -1.0907 Vector: 59 F= 310.87 Cos= -0.007 Sum= 0.875 q= -0.2309 Vector: 60 F= 312.38 Cos= 0.004 Sum= 0.875 q= 0.1299 Vector: 61 F= 318.05 Cos= -0.004 Sum= 0.875 q= -0.1331 Vector: 62 F= 318.98 Cos= 0.025 Sum= 0.876 q= 0.8294 Vector: 63 F= 321.55 Cos= -0.012 Sum= 0.876 q= -0.4062 Vector: 64 F= 325.09 Cos= -0.015 Sum= 0.876 q= -0.4824 Vector: 65 F= 325.87 Cos= 0.011 Sum= 0.876 q= 0.3639 Vector: 66 F= 328.50 Cos= 0.034 Sum= 0.878 q= 1.1166 Vector: 67 F= 331.54 Cos= 0.018 Sum= 0.878 q= 0.6093 Vector: 68 F= 331.82 Cos= 0.002 Sum= 0.878 q= 0.0738 Vector: 69 F= 335.21 Cos= -0.039 Sum= 0.879 q= -1.2929 Vector: 70 F= 336.90 Cos= -0.028 Sum= 0.880 q= -0.9351 Vector: 71 F= 340.33 Cos= -0.013 Sum= 0.880 q= -0.4206 Vector: 72 F= 348.16 Cos= -0.039 Sum= 0.882 q= -1.3091 Vector: 73 F= 349.68 Cos= -0.014 Sum= 0.882 q= -0.4763 Vector: 74 F= 353.87 Cos= -0.008 Sum= 0.882 q= -0.2744 Vector: 75 F= 356.85 Cos= 0.012 Sum= 0.882 q= 0.3896 Vector: 76 F= 360.14 Cos= 0.031 Sum= 0.883 q= 1.0444 Vector: 77 F= 363.08 Cos= -0.011 Sum= 0.884 q= -0.3763 Vector: 78 F= 365.83 Cos= 0.033 Sum= 0.885 q= 1.1104 Vector: 79 F= 368.72 Cos= -0.014 Sum= 0.885 q= -0.4560 Vector: 80 F= 371.26 Cos= -0.001 Sum= 0.885 q= -0.0496 Vector: 81 F= 372.85 Cos= -0.054 Sum= 0.888 q= -1.7888 Vector: 82 F= 375.84 Cos= 0.009 Sum= 0.888 q= 0.2940 Vector: 83 F= 377.09 Cos= 0.025 Sum= 0.888 q= 0.8445 %Projmod-Wn> Eigenvector 84 Norm= 1.0002 Vector: 84 F= 380.05 Cos= -0.027 Sum= 0.889 q= -0.8805 Vector: 85 F= 384.53 Cos= -0.005 Sum= 0.889 q= -0.1670 Vector: 86 F= 388.49 Cos= -0.013 Sum= 0.889 q= -0.4481 Vector: 87 F= 390.91 Cos= 0.009 Sum= 0.889 q= 0.2862 Vector: 88 F= 393.77 Cos= -0.007 Sum= 0.889 q= -0.2476 Vector: 89 F= 395.11 Cos= -0.002 Sum= 0.890 q= -0.0830 Vector: 90 F= 396.90 Cos= 0.002 Sum= 0.890 q= 0.0606 Vector: 91 F= 397.94 Cos= 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animated gif 300x300 3 models are in 2604270914072637783.7.pdb, 0 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 2 will be plotted MODEL 3 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 compute RMSD to second conformer MODEL 1 MODE=7 DQ=-20 401 1.988 371 1.302 MODEL 2 MODE=7 DQ=0 401 1.658 377 1.303 MODEL 3 MODE=7 DQ=20 401 1.882 371 1.287 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 2604270914072637783 8 -20 20 20 on on normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-20 2604270914072637783.eigenfacs 2604270914072637783.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2604270914072637783.eigenfacs 2604270914072637783.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2604270914072637783.eigenfacs 2604270914072637783.atom making animated gifs 3 models are in 2604270914072637783.8.pdb, 0 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 2 will be plotted MODEL 3 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 3 models are in 2604270914072637783.8.pdb, 0 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 2 will be plotted MODEL 3 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 3 models are in 2604270914072637783.8.pdb, 0 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 2 will be plotted MODEL 3 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 compute RMSD to second conformer MODEL 1 MODE=8 DQ=-20 401 2.135 358 1.172 MODEL 2 MODE=8 DQ=0 401 1.658 377 1.303 MODEL 3 MODE=8 DQ=20 401 1.713 379 1.360 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 2604270914072637783 9 -20 20 20 on on normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-20 2604270914072637783.eigenfacs 2604270914072637783.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2604270914072637783.eigenfacs 2604270914072637783.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2604270914072637783.eigenfacs 2604270914072637783.atom making animated gifs 3 models are in 2604270914072637783.9.pdb, 0 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 2 will be plotted MODEL 3 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 3 models are in 2604270914072637783.9.pdb, 0 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 2 will be plotted MODEL 3 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 3 models are in 2604270914072637783.9.pdb, 0 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 2 will be plotted MODEL 3 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 compute RMSD to second conformer MODEL 1 MODE=9 DQ=-20 401 1.956 365 1.244 MODEL 2 MODE=9 DQ=0 401 1.658 377 1.303 MODEL 3 MODE=9 DQ=20 401 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be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 2 will be plotted MODEL 3 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 compute RMSD to second conformer MODEL 1 MODE=10 DQ=-20 401 1.841 371 1.341 MODEL 2 MODE=10 DQ=0 401 1.658 377 1.303 MODEL 3 MODE=10 DQ=20 401 2.026 362 1.210 getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 2604270914072637783 11 -20 20 20 on on normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-20 2604270914072637783.eigenfacs 2604270914072637783.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2604270914072637783.eigenfacs 2604270914072637783.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2604270914072637783.eigenfacs 2604270914072637783.atom making animated gifs 3 models are in 2604270914072637783.11.pdb, 0 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 2 will be plotted MODEL 3 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 3 models are in 2604270914072637783.11.pdb, 0 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 2 will be plotted MODEL 3 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 3 models are in 2604270914072637783.11.pdb, 0 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 2 will be plotted MODEL 3 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 compute RMSD to second conformer MODEL 1 MODE=11 DQ=-20 401 1.905 367 1.206 MODEL 2 MODE=11 DQ=0 401 1.658 377 1.303 MODEL 3 MODE=11 DQ=20 401 1.965 368 1.359 getting mode 12 running: ../../bin/get_modes.sh 2604270914072637783 12 -20 20 20 on on normal mode computation generate a series of perturbations for mode 12 calculating perturbed structure for DQ=-20 2604270914072637783.eigenfacs 2604270914072637783.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2604270914072637783.eigenfacs 2604270914072637783.atom 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2 will be plotted MODEL 3 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 compute RMSD to second conformer MODEL 1 MODE=13 DQ=-20 401 2.235 345 1.549 MODEL 2 MODE=13 DQ=0 401 1.658 377 1.303 MODEL 3 MODE=13 DQ=20 401 1.580 380 1.145 getting mode 14 running: ../../bin/get_modes.sh 2604270914072637783 14 -20 20 20 on on normal mode computation generate a series of perturbations for mode 14 calculating perturbed structure for DQ=-20 2604270914072637783.eigenfacs 2604270914072637783.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2604270914072637783.eigenfacs 2604270914072637783.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2604270914072637783.eigenfacs 2604270914072637783.atom making animated gifs 3 models are in 2604270914072637783.14.pdb, 0 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 2 will be plotted MODEL 3 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 3 models are in 2604270914072637783.14.pdb, 0 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 2 will be plotted MODEL 3 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 3 models are in 2604270914072637783.14.pdb, 0 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 2 will be plotted MODEL 3 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 compute RMSD to second conformer MODEL 1 MODE=14 DQ=-20 401 1.814 368 1.265 MODEL 2 MODE=14 DQ=0 401 1.658 377 1.303 MODEL 3 MODE=14 DQ=20 401 2.050 353 1.443 getting mode 15 running: ../../bin/get_modes.sh 2604270914072637783 15 -20 20 20 on on normal mode computation generate a series of perturbations for mode 15 calculating perturbed structure for DQ=-20 2604270914072637783.eigenfacs 2604270914072637783.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2604270914072637783.eigenfacs 2604270914072637783.atom calculating perturbed structure for DQ=20 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thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 compute RMSD to second conformer MODEL 1 MODE=16 DQ=-20 401 2.100 354 1.410 MODEL 2 MODE=16 DQ=0 401 1.658 377 1.303 MODEL 3 MODE=16 DQ=20 401 1.754 365 1.291 2604270914072637783.10.pdb 2604270914072637783.11.pdb 2604270914072637783.12.pdb 2604270914072637783.13.pdb 2604270914072637783.14.pdb 2604270914072637783.15.pdb 2604270914072637783.16.pdb 2604270914072637783.7.pdb 2604270914072637783.8.pdb 2604270914072637783.9.pdb STDERR: Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL real 0m6.582s user 0m6.559s sys 0m0.018s rm: cannot remove '2604270914072637783.sdijf': No such file or directory pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing 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