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***  PmM60  ***

LOGs for ID: 2604271734382715076

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2604271734382715076.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2604271734382715076.atom to be opened. Openam> File opened: 2604271734382715076.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 971 First residue number = 1 Last residue number = 971 Number of atoms found = 7727 Mean number per residue = 8.0 Pdbmat> Coordinate statistics: = -5.382223 +/- 24.415704 From: -61.112000 To: 37.671000 = 3.598155 +/- 13.690644 From: -31.813000 To: 36.533000 = -2.839259 +/- 22.957037 From: -54.964000 To: 50.782000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 1.1342 % Filled. Pdbmat> 3047498 non-zero elements. Pdbmat> 333514 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 86.32 +/- 23.42 Maximum number = 133 Minimum number = 10 Pdbmat> Matrix trace = 6.670280E+06 Pdbmat> Larger element = 498.322 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 971 non-zero elements, NRBL set to 5 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2604271734382715076.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 5 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2604271734382715076.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2604271734382715076.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 7727 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 5 residue(s) per block. Blocpdb> 971 residues. Blocpdb> 34 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 43 atoms in block 2 Block first atom: 35 Blocpdb> 39 atoms in block 3 Block first atom: 78 Blocpdb> 40 atoms in block 4 Block first atom: 117 Blocpdb> 36 atoms in block 5 Block first atom: 157 Blocpdb> 45 atoms in block 6 Block first atom: 193 Blocpdb> 34 atoms in block 7 Block first atom: 238 Blocpdb> 39 atoms in block 8 Block first atom: 272 Blocpdb> 38 atoms in block 9 Block first atom: 311 Blocpdb> 39 atoms in block 10 Block first atom: 349 Blocpdb> 42 atoms in block 11 Block first atom: 388 Blocpdb> 35 atoms in block 12 Block first atom: 430 Blocpdb> 42 atoms in block 13 Block first atom: 465 Blocpdb> 38 atoms in block 14 Block first atom: 507 Blocpdb> 43 atoms in block 15 Block first atom: 545 Blocpdb> 33 atoms in block 16 Block first atom: 588 Blocpdb> 39 atoms in block 17 Block first atom: 621 Blocpdb> 40 atoms in block 18 Block first atom: 660 Blocpdb> 47 atoms in block 19 Block first atom: 700 Blocpdb> 36 atoms in block 20 Block first atom: 747 Blocpdb> 30 atoms in block 21 Block first atom: 783 Blocpdb> 51 atoms in block 22 Block first atom: 813 Blocpdb> 35 atoms in block 23 Block first atom: 864 Blocpdb> 38 atoms in block 24 Block first atom: 899 Blocpdb> 45 atoms in block 25 Block first atom: 937 Blocpdb> 42 atoms in block 26 Block first atom: 982 Blocpdb> 52 atoms in block 27 Block first atom: 1024 Blocpdb> 38 atoms in block 28 Block first atom: 1076 Blocpdb> 32 atoms in block 29 Block first atom: 1114 Blocpdb> 45 atoms in block 30 Block first atom: 1146 Blocpdb> 35 atoms in block 31 Block first atom: 1191 Blocpdb> 41 atoms in block 32 Block first atom: 1226 Blocpdb> 42 atoms in block 33 Block first atom: 1267 Blocpdb> 38 atoms in block 34 Block first atom: 1309 Blocpdb> 41 atoms in block 35 Block first atom: 1347 Blocpdb> 42 atoms in block 36 Block first atom: 1388 Blocpdb> 48 atoms in block 37 Block first atom: 1430 Blocpdb> 37 atoms in block 38 Block first atom: 1478 Blocpdb> 44 atoms in block 39 Block first atom: 1515 Blocpdb> 39 atoms in block 40 Block first atom: 1559 Blocpdb> 34 atoms in block 41 Block first atom: 1598 Blocpdb> 37 atoms in block 42 Block first atom: 1632 Blocpdb> 44 atoms in block 43 Block first atom: 1669 Blocpdb> 47 atoms in block 44 Block first atom: 1713 Blocpdb> 33 atoms in block 45 Block first atom: 1760 Blocpdb> 45 atoms in block 46 Block first atom: 1793 Blocpdb> 32 atoms in block 47 Block first atom: 1838 Blocpdb> 43 atoms in block 48 Block first atom: 1870 Blocpdb> 34 atoms in block 49 Block first atom: 1913 Blocpdb> 49 atoms in block 50 Block first atom: 1947 Blocpdb> 37 atoms in block 51 Block first atom: 1996 Blocpdb> 43 atoms in block 52 Block first atom: 2033 Blocpdb> 39 atoms in block 53 Block first atom: 2076 Blocpdb> 42 atoms in block 54 Block first atom: 2115 Blocpdb> 42 atoms in block 55 Block first atom: 2157 Blocpdb> 40 atoms in block 56 Block first atom: 2199 Blocpdb> 33 atoms in block 57 Block first atom: 2239 Blocpdb> 40 atoms in block 58 Block first atom: 2272 Blocpdb> 42 atoms in block 59 Block first atom: 2312 Blocpdb> 44 atoms in block 60 Block first atom: 2354 Blocpdb> 43 atoms in block 61 Block first atom: 2398 Blocpdb> 39 atoms in block 62 Block first atom: 2441 Blocpdb> 39 atoms in block 63 Block first atom: 2480 Blocpdb> 44 atoms in block 64 Block first atom: 2519 Blocpdb> 39 atoms in block 65 Block first atom: 2563 Blocpdb> 41 atoms in block 66 Block first atom: 2602 Blocpdb> 45 atoms in block 67 Block first atom: 2643 Blocpdb> 36 atoms in block 68 Block first atom: 2688 Blocpdb> 44 atoms in block 69 Block first atom: 2724 Blocpdb> 31 atoms in block 70 Block first atom: 2768 Blocpdb> 33 atoms in block 71 Block first atom: 2799 Blocpdb> 36 atoms in block 72 Block first atom: 2832 Blocpdb> 39 atoms in block 73 Block first atom: 2868 Blocpdb> 36 atoms in block 74 Block first atom: 2907 Blocpdb> 36 atoms in block 75 Block first atom: 2943 Blocpdb> 37 atoms in block 76 Block first atom: 2979 Blocpdb> 41 atoms in block 77 Block first atom: 3016 Blocpdb> 44 atoms in block 78 Block first atom: 3057 Blocpdb> 36 atoms in block 79 Block first atom: 3101 Blocpdb> 51 atoms in block 80 Block first atom: 3137 Blocpdb> 44 atoms in block 81 Block first atom: 3188 Blocpdb> 48 atoms in block 82 Block first atom: 3232 Blocpdb> 43 atoms in block 83 Block first atom: 3280 Blocpdb> 39 atoms in block 84 Block first atom: 3323 Blocpdb> 30 atoms in block 85 Block first atom: 3362 Blocpdb> 42 atoms in block 86 Block first atom: 3392 Blocpdb> 37 atoms in block 87 Block first atom: 3434 Blocpdb> 34 atoms in block 88 Block first atom: 3471 Blocpdb> 37 atoms in block 89 Block first atom: 3505 Blocpdb> 41 atoms in block 90 Block first atom: 3542 Blocpdb> 40 atoms in block 91 Block first atom: 3583 Blocpdb> 36 atoms in block 92 Block first atom: 3623 Blocpdb> 39 atoms in block 93 Block first atom: 3659 Blocpdb> 36 atoms in block 94 Block first atom: 3698 Blocpdb> 40 atoms in block 95 Block first atom: 3734 Blocpdb> 38 atoms in block 96 Block first atom: 3774 Blocpdb> 40 atoms in block 97 Block first atom: 3812 Blocpdb> 38 atoms in block 98 Block first atom: 3852 Blocpdb> 41 atoms in block 99 Block first atom: 3890 Blocpdb> 42 atoms in block 100 Block first atom: 3931 Blocpdb> 40 atoms in block 101 Block first atom: 3973 Blocpdb> 51 atoms in block 102 Block first atom: 4013 Blocpdb> 40 atoms in block 103 Block first atom: 4064 Blocpdb> 35 atoms in block 104 Block first atom: 4104 Blocpdb> 40 atoms in block 105 Block first atom: 4139 Blocpdb> 43 atoms in block 106 Block first atom: 4179 Blocpdb> 36 atoms in block 107 Block first atom: 4222 Blocpdb> 48 atoms in block 108 Block first atom: 4258 Blocpdb> 35 atoms in block 109 Block first atom: 4306 Blocpdb> 40 atoms in block 110 Block first atom: 4341 Blocpdb> 40 atoms in block 111 Block first atom: 4381 Blocpdb> 39 atoms in block 112 Block first atom: 4421 Blocpdb> 38 atoms in block 113 Block first atom: 4460 Blocpdb> 40 atoms in block 114 Block first atom: 4498 Blocpdb> 39 atoms in block 115 Block first atom: 4538 Blocpdb> 42 atoms in block 116 Block first atom: 4577 Blocpdb> 44 atoms in block 117 Block first atom: 4619 Blocpdb> 44 atoms in block 118 Block first atom: 4663 Blocpdb> 39 atoms in block 119 Block first atom: 4707 Blocpdb> 41 atoms in block 120 Block first atom: 4746 Blocpdb> 39 atoms in block 121 Block first atom: 4787 Blocpdb> 35 atoms in block 122 Block first atom: 4826 Blocpdb> 34 atoms in block 123 Block first atom: 4861 Blocpdb> 44 atoms in block 124 Block first atom: 4895 Blocpdb> 34 atoms in block 125 Block first atom: 4939 Blocpdb> 47 atoms in block 126 Block first atom: 4973 Blocpdb> 36 atoms in block 127 Block first atom: 5020 Blocpdb> 45 atoms in block 128 Block first atom: 5056 Blocpdb> 39 atoms in block 129 Block first atom: 5101 Blocpdb> 40 atoms in block 130 Block first atom: 5140 Blocpdb> 39 atoms in block 131 Block first atom: 5180 Blocpdb> 46 atoms in block 132 Block first atom: 5219 Blocpdb> 39 atoms in block 133 Block first atom: 5265 Blocpdb> 36 atoms in block 134 Block first atom: 5304 Blocpdb> 41 atoms in block 135 Block first atom: 5340 Blocpdb> 37 atoms in block 136 Block first atom: 5381 Blocpdb> 39 atoms in block 137 Block first atom: 5418 Blocpdb> 37 atoms in block 138 Block first atom: 5457 Blocpdb> 45 atoms in block 139 Block first atom: 5494 Blocpdb> 34 atoms in block 140 Block first atom: 5539 Blocpdb> 43 atoms in block 141 Block first atom: 5573 Blocpdb> 33 atoms in block 142 Block first atom: 5616 Blocpdb> 37 atoms in block 143 Block first atom: 5649 Blocpdb> 43 atoms in block 144 Block first atom: 5686 Blocpdb> 51 atoms in block 145 Block first atom: 5729 Blocpdb> 46 atoms in block 146 Block first atom: 5780 Blocpdb> 35 atoms in block 147 Block first atom: 5826 Blocpdb> 53 atoms in block 148 Block first atom: 5861 Blocpdb> 43 atoms in block 149 Block first atom: 5914 Blocpdb> 35 atoms in block 150 Block first atom: 5957 Blocpdb> 53 atoms in block 151 Block first atom: 5992 Blocpdb> 42 atoms in block 152 Block first atom: 6045 Blocpdb> 47 atoms in block 153 Block first atom: 6087 Blocpdb> 33 atoms in block 154 Block first atom: 6134 Blocpdb> 32 atoms in block 155 Block first atom: 6167 Blocpdb> 45 atoms in block 156 Block first atom: 6199 Blocpdb> 38 atoms in block 157 Block first atom: 6244 Blocpdb> 29 atoms in block 158 Block first atom: 6282 Blocpdb> 39 atoms in block 159 Block first atom: 6311 Blocpdb> 42 atoms in block 160 Block first atom: 6350 Blocpdb> 51 atoms in block 161 Block first atom: 6392 Blocpdb> 33 atoms in block 162 Block first atom: 6443 Blocpdb> 39 atoms in block 163 Block first atom: 6476 Blocpdb> 36 atoms in block 164 Block first atom: 6515 Blocpdb> 42 atoms in block 165 Block first atom: 6551 Blocpdb> 44 atoms in block 166 Block first atom: 6593 Blocpdb> 46 atoms in block 167 Block first atom: 6637 Blocpdb> 40 atoms in block 168 Block first atom: 6683 Blocpdb> 36 atoms in block 169 Block first atom: 6723 Blocpdb> 43 atoms in block 170 Block first atom: 6759 Blocpdb> 43 atoms in block 171 Block first atom: 6802 Blocpdb> 39 atoms in block 172 Block first atom: 6845 Blocpdb> 25 atoms in block 173 Block first atom: 6884 Blocpdb> 43 atoms in block 174 Block first atom: 6909 Blocpdb> 35 atoms in block 175 Block first atom: 6952 Blocpdb> 37 atoms in block 176 Block first atom: 6987 Blocpdb> 33 atoms in block 177 Block first atom: 7024 Blocpdb> 48 atoms in block 178 Block first atom: 7057 Blocpdb> 33 atoms in block 179 Block first atom: 7105 Blocpdb> 38 atoms in block 180 Block first atom: 7138 Blocpdb> 39 atoms in block 181 Block first atom: 7176 Blocpdb> 36 atoms in block 182 Block first atom: 7215 Blocpdb> 45 atoms in block 183 Block first atom: 7251 Blocpdb> 37 atoms in block 184 Block first atom: 7296 Blocpdb> 39 atoms in block 185 Block first atom: 7333 Blocpdb> 43 atoms in block 186 Block first atom: 7372 Blocpdb> 37 atoms in block 187 Block first atom: 7415 Blocpdb> 43 atoms in block 188 Block first atom: 7452 Blocpdb> 42 atoms in block 189 Block first atom: 7495 Blocpdb> 40 atoms in block 190 Block first atom: 7537 Blocpdb> 39 atoms in block 191 Block first atom: 7577 Blocpdb> 40 atoms in block 192 Block first atom: 7616 Blocpdb> 31 atoms in block 193 Block first atom: 7656 Blocpdb> 34 atoms in block 194 Block first atom: 7687 Blocpdb> 7 atoms in block 195 Block first atom: 7720 Blocpdb> 195 blocks. Blocpdb> At most, 53 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 7 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 3047693 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 23181 Prepmat> Matrix trace = 6670280.0000 Prepmat> Last element read: 23181 23181 233.4410 Prepmat> 19111 lines saved. Prepmat> 17314 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 7727 RTB> Total mass = 7727.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 7727 RTB> Number of blocks = 195 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 240693.7400 RTB> 61731 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1170 Diagstd> Nb of non-zero elements: 61731 Diagstd> Projected matrix trace = 240693.7400 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1170 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 240693.7400 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0224896 0.0543869 0.1188488 0.2220637 0.5181578 0.6632498 0.9046308 1.2965425 1.4233599 2.1042252 2.3541385 3.1496718 3.4008771 4.3207328 4.7794096 5.1622337 5.5617180 6.5295867 6.6477939 6.9980106 7.7672917 8.9442214 9.5717917 10.0576065 10.9452290 11.4636894 12.5301422 13.3630569 14.4127428 14.8556040 15.1756215 16.4882940 16.7368945 16.9691913 17.9475563 18.2768257 18.5844706 19.4789686 20.0657158 21.4171123 21.6295106 21.9977488 22.3582202 23.0309933 23.4175963 24.0056625 24.9909312 25.6318070 25.9150571 26.6144461 27.4591958 28.4854662 28.9256290 29.1700658 29.3461026 29.3930099 29.8415365 31.1024414 31.6776700 32.3772950 32.5918005 32.7225936 33.2800897 33.6027422 33.9597004 34.5844133 35.1619326 35.7061738 35.9365014 36.2532096 36.7169132 36.9412114 37.2929346 37.6846160 38.5314302 39.2283421 39.3311605 39.7241960 40.2452327 41.0527902 41.3325918 41.8074476 41.9798224 42.4813501 42.7456300 43.0982430 43.1571432 43.4453214 43.8353049 44.4381737 44.6351981 45.0039359 45.5479959 46.2312369 46.2823732 46.6242766 47.1878813 47.8255015 48.0559959 48.6532541 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034319 0.0034332 0.0034340 0.0034348 0.0034350 0.0034356 16.2849552 25.3245947 37.4362803 51.1721981 78.1675114 88.4369651 103.2835059 123.6484461 129.5545410 157.5220639 166.6139199 192.7205085 200.2584033 225.7220499 237.4009257 246.7255427 256.0942113 277.4841145 279.9845411 287.2649098 302.6426196 324.7630045 335.9633472 344.3837103 359.2590420 367.6693996 384.3910617 396.9613182 412.2575309 418.5433413 423.0274241 440.9436993 444.2554038 447.3277630 460.0424870 464.2433220 468.1342082 479.2678078 486.4325284 502.5459040 505.0316863 509.3125754 513.4686057 521.1366473 525.4923980 532.0496085 542.8583221 549.7748801 552.8042398 560.2140498 569.0352724 579.5713995 584.0320571 586.4945554 588.2615951 588.7315508 593.2064581 605.6092789 611.1838859 617.8962527 619.9397117 621.1823957 626.4516022 629.4810205 632.8156416 638.6096644 643.9196060 648.8838086 650.9733020 653.8355215 658.0037394 660.0105029 663.1450927 666.6184471 674.0666570 680.1352078 681.0259502 684.4202303 688.8941576 695.7714753 698.1385176 702.1374006 703.5833906 707.7737239 709.9718696 712.8941702 713.3811421 715.7589507 718.9642503 723.8913401 725.4943147 728.4848574 732.8750163 738.3512882 738.7595196 741.4832304 745.9513756 750.9742516 752.7817320 757.4452153 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 7727 Rtb_to_modes> Number of blocs = 195 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9878E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9957E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0005E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0006E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0010E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.2490E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.4387E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1188 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2221 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5182 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6632 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9046 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.297 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.423 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.104 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.354 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.150 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.401 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.321 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.779 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.162 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.562 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.530 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.648 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.998 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.767 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.944 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.572 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.65 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1170 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 1.00003 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 1.00002 0.99998 1.00002 1.00002 1.00002 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 1.00002 1.00001 1.00000 1.00002 0.99999 1.00000 1.00000 1.00002 1.00002 0.99999 0.99997 1.00001 0.99999 1.00001 1.00002 1.00000 0.99998 1.00000 0.99998 1.00000 0.99998 1.00002 1.00002 0.99999 0.99998 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 1.00002 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 0.99999 0.99998 1.00002 0.99999 1.00000 0.99999 1.00003 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 0.99998 0.99999 0.99999 0.99998 0.99999 0.99999 1.00001 1.00001 0.99999 0.99997 0.99999 1.00002 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 0.99998 0.99997 1.00002 1.00002 0.99999 1.00000 1.00002 0.99999 1.00000 1.00000 0.99998 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 0.99997 1.00000 1.00000 1.00001 1.00002 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 139086 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 1.00003 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 1.00002 0.99998 1.00002 1.00002 1.00002 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 1.00002 1.00001 1.00000 1.00002 0.99999 1.00000 1.00000 1.00002 1.00002 0.99999 0.99997 1.00001 0.99999 1.00001 1.00002 1.00000 0.99998 1.00000 0.99998 1.00000 0.99998 1.00002 1.00002 0.99999 0.99998 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 1.00002 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 0.99999 0.99998 1.00002 0.99999 1.00000 0.99999 1.00003 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 0.99998 0.99999 0.99999 0.99998 0.99999 0.99999 1.00001 1.00001 0.99999 0.99997 0.99999 1.00002 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 0.99998 0.99997 1.00002 1.00002 0.99999 1.00000 1.00002 0.99999 1.00000 1.00000 0.99998 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 0.99997 1.00000 1.00000 1.00001 1.00002 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3:-0.000 0.000 Vector 4: 0.000 0.000 0.000 Vector 5: 0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 6: 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 7:-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 8: 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 9:-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 10:-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2604271734382715076.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2604271734382715076.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2604271734382715076.atom Openam> file on opening on unit 11: 2604271734382715076.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 971 First residue number = 1 Last residue number = 971 Number of atoms found = 7727 Mean number per residue = 8.0 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9878E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9957E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0005E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0006E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0010E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.2490E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.4387E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1188 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2221 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5182 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6632 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9046 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.297 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.423 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.104 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.354 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.150 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.401 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.321 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.779 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.162 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.562 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.530 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.648 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.998 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.767 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.944 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.572 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.65 Bfactors> 106 vectors, 23181 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.022490 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= -0.529 for 971 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.174 +/- 0.19 Bfactors> = 95.636 +/- 4.40 Bfactors> Shiftng-fct= 95.462 Bfactors> Scaling-fct= 22.665 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2604271734382715076.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2604271734382715076.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4317E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4331E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4347E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4348E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4355E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 16.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 25.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 37.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 51.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 78.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 88.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 103.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 123.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 129.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 157.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 166.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 192.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 200.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 225.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 237.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 246.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 256.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 277.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 280.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 287.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 302.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 324.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 336.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 344.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 359.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 367.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 384.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 396.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 412.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 418.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 423.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 440.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 444.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 447.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 460.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 464.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 468.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 479.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 486.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 502.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 505.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 509.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 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CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 584.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 586.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 588.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 588.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 593.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 605.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 611.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 617.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 619.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 621.1 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vecteur en lecture: 660.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 663.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 666.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 674.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 680.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 681.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 684.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 688.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 695.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 698.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 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CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 728.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 732.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 738.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 738.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 741.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 745.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 751.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 752.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 757.4 Chkmod> 106 vectors, 23181 coordinates in file. Chkmod> That is: 7727 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. Chkmod> Normal end. 0.0034 0.6751 0.0034 0.8829 0.0034 0.6418 0.0034 0.9627 0.0034 0.7161 0.0034 0.8723 16.2844 0.4474 25.3235 0.6293 37.4270 0.5812 51.1742 0.6152 78.1673 0.5399 88.4299 0.7264 103.2773 0.3666 123.6649 0.6905 129.5326 0.5823 157.5069 0.7166 166.6019 0.5555 192.7223 0.5033 200.2534 0.5428 225.7193 0.6758 237.3806 0.6629 246.7094 0.5981 256.0897 0.4331 277.4810 0.4565 279.9769 0.4930 287.2524 0.4401 302.6239 0.2872 324.7450 0.1555 335.9526 0.5002 344.4099 0.3809 359.3219 0.2998 367.5944 0.1583 384.3724 0.2183 396.8989 0.1493 412.2006 0.1277 418.5873 0.4397 423.0703 0.3456 440.9476 0.4024 444.2775 0.1603 447.3192 0.1879 460.0541 0.2800 464.2637 0.1453 468.0578 0.5086 479.2599 0.3036 486.4636 0.3202 502.5582 0.4150 505.0157 0.3220 509.3168 0.4005 513.4670 0.0628 521.1030 0.3240 525.4968 0.3024 532.0748 0.4799 542.8249 0.2238 549.7319 0.4107 552.8332 0.3608 560.1432 0.3942 569.0192 0.4963 579.5926 0.4016 584.0511 0.3429 586.4687 0.4512 588.2754 0.5084 588.6761 0.3915 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DQ=-80 2604271734382715076.eigenfacs 2604271734382715076.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2604271734382715076.eigenfacs 2604271734382715076.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2604271734382715076.eigenfacs 2604271734382715076.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2604271734382715076.eigenfacs 2604271734382715076.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2604271734382715076.eigenfacs 2604271734382715076.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2604271734382715076.eigenfacs 2604271734382715076.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2604271734382715076.eigenfacs 2604271734382715076.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2604271734382715076.eigenfacs 2604271734382715076.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2604271734382715076.eigenfacs 2604271734382715076.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2604271734382715076.eigenfacs 2604271734382715076.atom making animated gifs 11 models are in 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generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 2604271734382715076.eigenfacs 2604271734382715076.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2604271734382715076.eigenfacs 2604271734382715076.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2604271734382715076.eigenfacs 2604271734382715076.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2604271734382715076.eigenfacs 2604271734382715076.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2604271734382715076.eigenfacs 2604271734382715076.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2604271734382715076.eigenfacs 2604271734382715076.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2604271734382715076.eigenfacs 2604271734382715076.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2604271734382715076.eigenfacs 2604271734382715076.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2604271734382715076.eigenfacs 2604271734382715076.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2604271734382715076.eigenfacs 2604271734382715076.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2604271734382715076.eigenfacs 2604271734382715076.atom making animated gifs 11 models are in 2604271734382715076.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2604271734382715076.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2604271734382715076.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 2604271734382715076 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 2604271734382715076.eigenfacs 2604271734382715076.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2604271734382715076.eigenfacs 2604271734382715076.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2604271734382715076.eigenfacs 2604271734382715076.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2604271734382715076.eigenfacs 2604271734382715076.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2604271734382715076.eigenfacs 2604271734382715076.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2604271734382715076.eigenfacs 2604271734382715076.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2604271734382715076.eigenfacs 2604271734382715076.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2604271734382715076.eigenfacs 2604271734382715076.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2604271734382715076.eigenfacs 2604271734382715076.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2604271734382715076.eigenfacs 2604271734382715076.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2604271734382715076.eigenfacs 2604271734382715076.atom making animated gifs 11 models are in 2604271734382715076.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2604271734382715076.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2604271734382715076.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 2604271734382715076 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 2604271734382715076.eigenfacs 2604271734382715076.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2604271734382715076.eigenfacs 2604271734382715076.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2604271734382715076.eigenfacs 2604271734382715076.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2604271734382715076.eigenfacs 2604271734382715076.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2604271734382715076.eigenfacs 2604271734382715076.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2604271734382715076.eigenfacs 2604271734382715076.atom calculating perturbed structure for DQ=20 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