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***  wild type  ***

LOGs for ID: 2604280935442830722

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2604280935442830722.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2604280935442830722.atom to be opened. Openam> File opened: 2604280935442830722.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 1102 First residue number = 33 Last residue number = 583 Number of atoms found = 8945 Mean number per residue = 8.1 Pdbmat> Coordinate statistics: = 22.559534 +/- 14.883283 From: -14.320000 To: 58.417000 = 41.026111 +/- 14.927510 From: 3.272000 To: 75.965000 = 39.570724 +/- 23.025636 From: -10.218000 To: 89.748000 Pdbmat> Masses are all set to one. %Pdbmat-W> residue:'OAS ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> 1 residue(s) not known. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 0.9896 % Filled. Pdbmat> 3563423 non-zero elements. Pdbmat> 390037 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 87.21 +/- 21.24 Maximum number = 134 Minimum number = 10 Pdbmat> Matrix trace = 7.800740E+06 Pdbmat> Larger element = 530.765 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 1102 non-zero elements, NRBL set to 6 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2604280935442830722.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 6 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2604280935442830722.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2604280935442830722.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 8945 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 6 residue(s) per block. Blocpdb> 1102 residues. Blocpdb> 42 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 51 atoms in block 2 Block first atom: 43 Blocpdb> 38 atoms in block 3 Block first atom: 94 Blocpdb> 53 atoms in block 4 Block first atom: 132 Blocpdb> 45 atoms in block 5 Block first atom: 185 Blocpdb> 48 atoms in block 6 Block first atom: 230 Blocpdb> 40 atoms in block 7 Block first atom: 278 Blocpdb> 51 atoms in block 8 Block first atom: 318 Blocpdb> 43 atoms in block 9 Block first atom: 369 Blocpdb> 52 atoms in block 10 Block first atom: 412 Blocpdb> 49 atoms in block 11 Block first atom: 464 Blocpdb> 55 atoms in block 12 Block first atom: 513 Blocpdb> 61 atoms in block 13 Block first atom: 568 Blocpdb> 46 atoms in block 14 Block first atom: 629 Blocpdb> 47 atoms in block 15 Block first atom: 675 Blocpdb> 45 atoms in block 16 Block first atom: 722 Blocpdb> 52 atoms in block 17 Block first atom: 767 Blocpdb> 54 atoms in block 18 Block first atom: 819 Blocpdb> 44 atoms in block 19 Block first atom: 873 Blocpdb> 55 atoms in block 20 Block first atom: 917 Blocpdb> 44 atoms in block 21 Block first atom: 972 Blocpdb> 39 atoms in block 22 Block first atom: 1016 Blocpdb> 47 atoms in block 23 Block first atom: 1055 Blocpdb> 46 atoms in block 24 Block first atom: 1102 Blocpdb> 49 atoms in block 25 Block first atom: 1148 Blocpdb> 58 atoms in block 26 Block first atom: 1197 Blocpdb> 41 atoms in block 27 Block first atom: 1255 Blocpdb> 51 atoms in block 28 Block first atom: 1296 Blocpdb> 53 atoms in block 29 Block first atom: 1347 Blocpdb> 57 atoms in block 30 Block first atom: 1400 Blocpdb> 49 atoms in block 31 Block first atom: 1457 Blocpdb> 43 atoms in block 32 Block first atom: 1506 Blocpdb> 41 atoms in block 33 Block first atom: 1549 Blocpdb> 51 atoms in block 34 Block first atom: 1590 Blocpdb> 51 atoms in block 35 Block first atom: 1641 Blocpdb> 56 atoms in block 36 Block first atom: 1692 Blocpdb> 50 atoms in block 37 Block first atom: 1748 Blocpdb> 46 atoms in block 38 Block first atom: 1798 Blocpdb> 48 atoms in block 39 Block first atom: 1844 Blocpdb> 44 atoms in block 40 Block first atom: 1892 Blocpdb> 51 atoms in block 41 Block first atom: 1936 Blocpdb> 49 atoms in block 42 Block first atom: 1987 Blocpdb> 45 atoms in block 43 Block first atom: 2036 Blocpdb> 44 atoms in block 44 Block first atom: 2081 Blocpdb> 45 atoms in block 45 Block first atom: 2125 Blocpdb> 57 atoms in block 46 Block first atom: 2170 Blocpdb> 50 atoms in block 47 Block first atom: 2227 Blocpdb> 52 atoms in block 48 Block first atom: 2277 Blocpdb> 51 atoms in block 49 Block first atom: 2329 Blocpdb> 50 atoms in block 50 Block first atom: 2380 Blocpdb> 47 atoms in block 51 Block first atom: 2430 Blocpdb> 48 atoms in block 52 Block first atom: 2477 Blocpdb> 53 atoms in block 53 Block first atom: 2525 Blocpdb> 50 atoms in block 54 Block first atom: 2578 Blocpdb> 56 atoms in block 55 Block first atom: 2628 Blocpdb> 51 atoms in block 56 Block first atom: 2684 Blocpdb> 59 atoms in block 57 Block first atom: 2735 Blocpdb> 46 atoms in block 58 Block first atom: 2794 Blocpdb> 56 atoms in block 59 Block first atom: 2840 Blocpdb> 64 atoms in block 60 Block first atom: 2896 Blocpdb> 53 atoms in block 61 Block first atom: 2960 Blocpdb> 58 atoms in block 62 Block first atom: 3013 Blocpdb> 57 atoms in block 63 Block first atom: 3071 Blocpdb> 47 atoms in block 64 Block first atom: 3128 Blocpdb> 49 atoms in block 65 Block first atom: 3175 Blocpdb> 47 atoms in block 66 Block first atom: 3224 Blocpdb> 44 atoms in block 67 Block first atom: 3271 Blocpdb> 39 atoms in block 68 Block first atom: 3315 Blocpdb> 44 atoms in block 69 Block first atom: 3354 Blocpdb> 41 atoms in block 70 Block first atom: 3398 Blocpdb> 57 atoms in block 71 Block first atom: 3439 Blocpdb> 55 atoms in block 72 Block first atom: 3496 Blocpdb> 63 atoms in block 73 Block first atom: 3551 Blocpdb> 47 atoms in block 74 Block first atom: 3614 Blocpdb> 50 atoms in block 75 Block first atom: 3661 Blocpdb> 42 atoms in block 76 Block first atom: 3711 Blocpdb> 41 atoms in block 77 Block first atom: 3753 Blocpdb> 45 atoms in block 78 Block first atom: 3794 Blocpdb> 48 atoms in block 79 Block first atom: 3839 Blocpdb> 48 atoms in block 80 Block first atom: 3887 Blocpdb> 50 atoms in block 81 Block first atom: 3935 Blocpdb> 44 atoms in block 82 Block first atom: 3985 Blocpdb> 41 atoms in block 83 Block first atom: 4029 Blocpdb> 41 atoms in block 84 Block first atom: 4070 Blocpdb> 42 atoms in block 85 Block first atom: 4111 Blocpdb> 53 atoms in block 86 Block first atom: 4153 Blocpdb> 42 atoms in block 87 Block first atom: 4206 Blocpdb> 48 atoms in block 88 Block first atom: 4248 Blocpdb> 41 atoms in block 89 Block first atom: 4296 Blocpdb> 45 atoms in block 90 Block first atom: 4337 Blocpdb> 44 atoms in block 91 Block first atom: 4382 Blocpdb> 37 atoms in block 92 Block first atom: 4426 Blocpdb> 42 atoms in block 93 Block first atom: 4463 Blocpdb> 51 atoms in block 94 Block first atom: 4505 Blocpdb> 38 atoms in block 95 Block first atom: 4556 Blocpdb> 53 atoms in block 96 Block first atom: 4594 Blocpdb> 45 atoms in block 97 Block first atom: 4647 Blocpdb> 48 atoms in block 98 Block first atom: 4692 Blocpdb> 46 atoms in block 99 Block first atom: 4740 Blocpdb> 51 atoms in block 100 Block first atom: 4786 Blocpdb> 49 atoms in block 101 Block first atom: 4837 Blocpdb> 52 atoms in block 102 Block first atom: 4886 Blocpdb> 49 atoms in block 103 Block first atom: 4938 Blocpdb> 55 atoms in block 104 Block first atom: 4987 Blocpdb> 61 atoms in block 105 Block first atom: 5042 Blocpdb> 46 atoms in block 106 Block first atom: 5103 Blocpdb> 48 atoms in block 107 Block first atom: 5149 Blocpdb> 44 atoms in block 108 Block first atom: 5197 Blocpdb> 52 atoms in block 109 Block first atom: 5241 Blocpdb> 57 atoms in block 110 Block first atom: 5293 Blocpdb> 44 atoms in block 111 Block first atom: 5350 Blocpdb> 55 atoms in block 112 Block first atom: 5394 Blocpdb> 42 atoms in block 113 Block first atom: 5449 Blocpdb> 39 atoms in block 114 Block first atom: 5491 Blocpdb> 47 atoms in block 115 Block first atom: 5530 Blocpdb> 46 atoms in block 116 Block first atom: 5577 Blocpdb> 49 atoms in block 117 Block first atom: 5623 Blocpdb> 58 atoms in block 118 Block first atom: 5672 Blocpdb> 41 atoms in block 119 Block first atom: 5730 Blocpdb> 51 atoms in block 120 Block first atom: 5771 Blocpdb> 53 atoms in block 121 Block first atom: 5822 Blocpdb> 57 atoms in block 122 Block first atom: 5875 Blocpdb> 49 atoms in block 123 Block first atom: 5932 Blocpdb> 43 atoms in block 124 Block first atom: 5981 Blocpdb> 41 atoms in block 125 Block first atom: 6024 Blocpdb> 51 atoms in block 126 Block first atom: 6065 Blocpdb> 51 atoms in block 127 Block first atom: 6116 Blocpdb> 53 atoms in block 128 Block first atom: 6167 Blocpdb> 50 atoms in block 129 Block first atom: 6220 Blocpdb> 46 atoms in block 130 Block first atom: 6270 Blocpdb> 48 atoms in block 131 Block first atom: 6316 Blocpdb> 45 atoms in block 132 Block first atom: 6364 Blocpdb> 51 atoms in block 133 Block first atom: 6409 Blocpdb> 52 atoms in block 134 Block first atom: 6460 Blocpdb> 45 atoms in block 135 Block first atom: 6512 Blocpdb> 44 atoms in block 136 Block first atom: 6557 Blocpdb> 45 atoms in block 137 Block first atom: 6601 Blocpdb> 57 atoms in block 138 Block first atom: 6646 Blocpdb> 50 atoms in block 139 Block first atom: 6703 Blocpdb> 52 atoms in block 140 Block first atom: 6753 Blocpdb> 51 atoms in block 141 Block first atom: 6805 Blocpdb> 50 atoms in block 142 Block first atom: 6856 Blocpdb> 47 atoms in block 143 Block first atom: 6906 Blocpdb> 48 atoms in block 144 Block first atom: 6953 Blocpdb> 53 atoms in block 145 Block first atom: 7001 Blocpdb> 50 atoms in block 146 Block first atom: 7054 Blocpdb> 56 atoms in block 147 Block first atom: 7104 Blocpdb> 51 atoms in block 148 Block first atom: 7160 Blocpdb> 59 atoms in block 149 Block first atom: 7211 Blocpdb> 46 atoms in block 150 Block first atom: 7270 Blocpdb> 56 atoms in block 151 Block first atom: 7316 Blocpdb> 64 atoms in block 152 Block first atom: 7372 Blocpdb> 53 atoms in block 153 Block first atom: 7436 Blocpdb> 58 atoms in block 154 Block first atom: 7489 Blocpdb> 57 atoms in block 155 Block first atom: 7547 Blocpdb> 47 atoms in block 156 Block first atom: 7604 Blocpdb> 49 atoms in block 157 Block first atom: 7651 Blocpdb> 51 atoms in block 158 Block first atom: 7700 Blocpdb> 44 atoms in block 159 Block first atom: 7751 Blocpdb> 39 atoms in block 160 Block first atom: 7795 Blocpdb> 44 atoms in block 161 Block first atom: 7834 Blocpdb> 41 atoms in block 162 Block first atom: 7878 Blocpdb> 51 atoms in block 163 Block first atom: 7919 Blocpdb> 55 atoms in block 164 Block first atom: 7970 Blocpdb> 63 atoms in block 165 Block first atom: 8025 Blocpdb> 53 atoms in block 166 Block first atom: 8088 Blocpdb> 50 atoms in block 167 Block first atom: 8141 Blocpdb> 42 atoms in block 168 Block first atom: 8191 Blocpdb> 42 atoms in block 169 Block first atom: 8233 Blocpdb> 45 atoms in block 170 Block first atom: 8275 Blocpdb> 48 atoms in block 171 Block first atom: 8320 Blocpdb> 48 atoms in block 172 Block first atom: 8368 Blocpdb> 50 atoms in block 173 Block first atom: 8416 Blocpdb> 44 atoms in block 174 Block first atom: 8466 Blocpdb> 43 atoms in block 175 Block first atom: 8510 Blocpdb> 41 atoms in block 176 Block first atom: 8553 Blocpdb> 42 atoms in block 177 Block first atom: 8594 Blocpdb> 53 atoms in block 178 Block first atom: 8636 Blocpdb> 42 atoms in block 179 Block first atom: 8689 Blocpdb> 48 atoms in block 180 Block first atom: 8731 Blocpdb> 41 atoms in block 181 Block first atom: 8779 Blocpdb> 45 atoms in block 182 Block first atom: 8820 Blocpdb> 44 atoms in block 183 Block first atom: 8865 Blocpdb> 37 atoms in block 184 Block first atom: 8908 Blocpdb> 184 blocks. Blocpdb> At most, 64 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 37 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 3563607 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 26835 Prepmat> Matrix trace = 7800740.0000 Prepmat> Last element read: 26835 26835 221.1823 Prepmat> 17021 lines saved. Prepmat> 15332 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 8945 RTB> Total mass = 8945.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 8945 RTB> Number of blocks = 184 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 216075.3754 RTB> 58008 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1104 Diagstd> Nb of non-zero elements: 58008 Diagstd> Projected matrix trace = 216075.3754 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1104 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 216075.3754 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.9424953 1.4094142 2.9244489 3.0515741 3.9513034 4.1594070 4.4269762 4.8630004 5.3193017 5.3697425 6.1753111 7.4163761 7.6493857 7.8817248 8.2607447 8.2891792 8.7273346 9.3492176 11.0418863 11.2757274 11.9811080 12.3462107 12.3651165 12.8175070 13.7047080 13.8742932 14.3557142 14.6240320 15.4099781 16.0658176 16.3129826 16.8899241 18.0042321 18.9577527 19.4194534 19.7378593 20.2205922 20.7751336 21.4890857 21.5482741 22.4637485 22.7026312 23.3334777 23.5746778 23.9397345 24.1513454 24.4335541 24.8020159 25.8198629 26.3607087 26.8307073 27.2352658 28.1408684 28.4791732 28.7334211 29.2284325 30.2181913 30.4316902 30.8824849 31.1885083 31.6974070 32.0517205 32.5617020 32.6333722 32.9971580 33.6771107 34.0855599 34.5078343 34.7706213 35.5195373 35.8747794 36.5420528 36.8392634 37.3303696 37.8112915 37.9620323 38.5251078 38.7643120 38.8445263 39.5554744 39.7532891 40.2813075 40.5241651 41.2629217 41.8765968 42.8753395 43.3495228 43.7416094 44.2258527 44.4777082 44.8439008 45.3682503 45.7429065 45.8680508 46.7578024 47.2041312 47.7106332 48.0766369 48.3288816 48.7995030 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034334 0.0034334 0.0034336 0.0034342 0.0034348 0.0034350 105.4228801 128.9183089 185.7023069 189.6955915 215.8566674 221.4680020 228.4803602 239.4679695 250.4508966 251.6355589 269.8514148 295.7271201 300.3368083 304.8638380 312.1079858 312.6446819 320.8012812 332.0342724 360.8418624 364.6427336 375.8752868 381.5593691 381.8513991 388.7738647 402.0038137 404.4834106 411.4411098 415.2683620 426.2813089 435.2579339 438.5932735 446.2817517 460.7682878 472.8122365 478.5350806 482.4422167 488.3061741 494.9566839 503.3896115 504.0823899 514.6789360 517.4082831 524.5477352 527.2519121 531.3185087 533.6615887 536.7704532 540.8026005 551.7879929 557.5371631 562.4855123 566.7102784 576.0551021 579.5073768 582.0884055 587.0810234 596.9383951 599.0434409 603.4640449 606.4466232 611.3742571 614.7817315 619.6533889 620.3349601 623.7830198 630.1772092 633.9872097 637.9022478 640.3265444 647.1857259 650.4140285 656.4350334 659.0991463 663.4778448 667.7379138 669.0676126 674.0113526 676.1005984 676.7997588 682.9652065 684.6708115 689.2028419 691.2773359 697.5498798 702.7178262 711.0482406 714.9693767 718.1954666 722.1599306 724.2132746 727.1884494 731.4275175 734.4414146 735.4453780 742.5442265 746.0798047 750.0718560 752.9433813 754.9160399 758.5827797 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 8945 Rtb_to_modes> Number of blocs = 184 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9970E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9970E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9979E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0005E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0006E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9425 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.409 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.924 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.052 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.951 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.159 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.427 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.863 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.319 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.370 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.175 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.416 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.649 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.882 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.261 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.289 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.727 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.349 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.80 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1104 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 1.00001 0.99999 0.99999 1.00001 0.99998 0.99998 1.00001 1.00001 1.00002 0.99998 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00002 0.99998 0.99998 1.00001 1.00002 1.00002 1.00002 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 0.99998 0.99999 0.99999 0.99999 0.99998 0.99998 0.99999 1.00000 1.00002 1.00004 1.00001 1.00002 0.99999 1.00001 0.99999 1.00001 0.99998 1.00001 0.99997 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 0.99997 1.00003 1.00000 1.00000 0.99998 1.00001 0.99998 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 1.00002 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 0.99998 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00002 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 1.00002 1.00002 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 161010 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 1.00001 0.99999 0.99999 1.00001 0.99998 0.99998 1.00001 1.00001 1.00002 0.99998 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00002 0.99998 0.99998 1.00001 1.00002 1.00002 1.00002 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 0.99998 0.99999 0.99999 0.99999 0.99998 0.99998 0.99999 1.00000 1.00002 1.00004 1.00001 1.00002 0.99999 1.00001 0.99999 1.00001 0.99998 1.00001 0.99997 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 0.99997 1.00003 1.00000 1.00000 0.99998 1.00001 0.99998 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 1.00002 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 0.99998 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00002 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 1.00002 1.00002 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3:-0.000 0.000 Vector 4: 0.000-0.000 0.000 Vector 5: 0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 6: 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 7:-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 8: 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 9: 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 10: 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2604280935442830722.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2604280935442830722.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2604280935442830722.atom Openam> file on opening on unit 11: 2604280935442830722.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 1102 First residue number = 33 Last residue number = 583 Number of atoms found = 8945 Mean number per residue = 8.1 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9970E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9970E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9979E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0005E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0006E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9425 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.409 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.924 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.052 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.951 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.159 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.427 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.863 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.319 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.370 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.175 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.416 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.649 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.882 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.261 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.289 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.727 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.349 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.80 Bfactors> 106 vectors, 26835 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.942500 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.656 for 1109 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.013 +/- 0.01 Bfactors> = 27.556 +/- 10.03 Bfactors> Shiftng-fct= 27.543 Bfactors> Scaling-fct= 865.571 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2604280935442830722.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2604280935442830722.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4333E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4333E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4335E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4347E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4348E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 105.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 128.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 185.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 189.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 215.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 221.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 228.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 239.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 250.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 251.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 269.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 295.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 300.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 304.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 312.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 312.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 320.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 332.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 360.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 364.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 375.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 381.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 381.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 388.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 401.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 404.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 411.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 415.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 426.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 435.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 438.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 446.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 460.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 472.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 478.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 482.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 488.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 495.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 503.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 504.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 514.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 517.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 524.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 527.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 531.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 533.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 536.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 540.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 551.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 557.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 562.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 566.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 576.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 579.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 582.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 587.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 596.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 599.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 603.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 606.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 611.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 614.7 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Chkmod> That is: 8945 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. 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animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 2604280935442830722 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 2604280935442830722.eigenfacs 2604280935442830722.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2604280935442830722.eigenfacs 2604280935442830722.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2604280935442830722.eigenfacs 2604280935442830722.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2604280935442830722.eigenfacs 2604280935442830722.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2604280935442830722.eigenfacs 2604280935442830722.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2604280935442830722.eigenfacs 2604280935442830722.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2604280935442830722.eigenfacs 2604280935442830722.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2604280935442830722.eigenfacs 2604280935442830722.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2604280935442830722.eigenfacs 2604280935442830722.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2604280935442830722.eigenfacs 2604280935442830722.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2604280935442830722.eigenfacs 2604280935442830722.atom making animated gifs 11 models are in 2604280935442830722.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2604280935442830722.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2604280935442830722.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 2604280935442830722 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 2604280935442830722.eigenfacs 2604280935442830722.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2604280935442830722.eigenfacs 2604280935442830722.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2604280935442830722.eigenfacs 2604280935442830722.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2604280935442830722.eigenfacs 2604280935442830722.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2604280935442830722.eigenfacs 2604280935442830722.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2604280935442830722.eigenfacs 2604280935442830722.atom calculating perturbed structure for DQ=20 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100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2604280935442830722.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 2604280935442830722 11 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-100 2604280935442830722.eigenfacs 2604280935442830722.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2604280935442830722.eigenfacs 2604280935442830722.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2604280935442830722.eigenfacs 2604280935442830722.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2604280935442830722.eigenfacs 2604280935442830722.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2604280935442830722.eigenfacs 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MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2604280935442830722.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 2604280935442830722.10.pdb 2604280935442830722.11.pdb 2604280935442830722.7.pdb 2604280935442830722.8.pdb 2604280935442830722.9.pdb STDERR: Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL real 0m52.006s user 0m51.596s sys 0m0.382s rm: cannot remove '2604280935442830722.sdijf': No such file or directory pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: 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