***  120  ***
Output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 2604280955002834926.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 2604280955002834926.atom to be opened.
Openam> File opened: 2604280955002834926.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 1102
First residue number = 33
Last residue number = 583
Number of atoms found = 8946
Mean number per residue = 8.1
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 22.557845 +/- 14.882742 From: -14.320000 To: 58.417000
= 41.025149 +/- 14.926768 From: 3.272000 To: 75.965000
= 39.575136 +/- 23.026149 From: -10.218000 To: 89.748000
Pdbmat> Masses are all set to one.
%Pdbmat-W> residue:'OAS ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'OAS ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> 2 residue(s) not known.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 0.9897 % Filled.
Pdbmat> 3564293 non-zero elements.
Pdbmat> 390133 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 87.22 +/- 21.24
Maximum number = 134
Minimum number = 10
Pdbmat> Matrix trace = 7.802660E+06
Pdbmat> Larger element = 530.765
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
1102 non-zero elements, NRBL set to 6
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 2604280955002834926.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 6
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 2604280955002834926.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
2604280955002834926.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 8946 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 6 residue(s) per block.
Blocpdb> 1102 residues.
Blocpdb> 42 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 51 atoms in block 2
Block first atom: 43
Blocpdb> 38 atoms in block 3
Block first atom: 94
Blocpdb> 53 atoms in block 4
Block first atom: 132
Blocpdb> 45 atoms in block 5
Block first atom: 185
Blocpdb> 48 atoms in block 6
Block first atom: 230
Blocpdb> 40 atoms in block 7
Block first atom: 278
Blocpdb> 51 atoms in block 8
Block first atom: 318
Blocpdb> 43 atoms in block 9
Block first atom: 369
Blocpdb> 52 atoms in block 10
Block first atom: 412
Blocpdb> 49 atoms in block 11
Block first atom: 464
Blocpdb> 55 atoms in block 12
Block first atom: 513
Blocpdb> 61 atoms in block 13
Block first atom: 568
Blocpdb> 46 atoms in block 14
Block first atom: 629
Blocpdb> 47 atoms in block 15
Block first atom: 675
Blocpdb> 44 atoms in block 16
Block first atom: 722
Blocpdb> 52 atoms in block 17
Block first atom: 766
Blocpdb> 54 atoms in block 18
Block first atom: 818
Blocpdb> 44 atoms in block 19
Block first atom: 872
Blocpdb> 55 atoms in block 20
Block first atom: 916
Blocpdb> 44 atoms in block 21
Block first atom: 971
Blocpdb> 39 atoms in block 22
Block first atom: 1015
Blocpdb> 47 atoms in block 23
Block first atom: 1054
Blocpdb> 46 atoms in block 24
Block first atom: 1101
Blocpdb> 49 atoms in block 25
Block first atom: 1147
Blocpdb> 58 atoms in block 26
Block first atom: 1196
Blocpdb> 41 atoms in block 27
Block first atom: 1254
Blocpdb> 51 atoms in block 28
Block first atom: 1295
Blocpdb> 53 atoms in block 29
Block first atom: 1346
Blocpdb> 57 atoms in block 30
Block first atom: 1399
Blocpdb> 49 atoms in block 31
Block first atom: 1456
Blocpdb> 43 atoms in block 32
Block first atom: 1505
Blocpdb> 41 atoms in block 33
Block first atom: 1548
Blocpdb> 51 atoms in block 34
Block first atom: 1589
Blocpdb> 51 atoms in block 35
Block first atom: 1640
Blocpdb> 56 atoms in block 36
Block first atom: 1691
Blocpdb> 50 atoms in block 37
Block first atom: 1747
Blocpdb> 46 atoms in block 38
Block first atom: 1797
Blocpdb> 48 atoms in block 39
Block first atom: 1843
Blocpdb> 44 atoms in block 40
Block first atom: 1891
Blocpdb> 51 atoms in block 41
Block first atom: 1935
Blocpdb> 49 atoms in block 42
Block first atom: 1986
Blocpdb> 45 atoms in block 43
Block first atom: 2035
Blocpdb> 44 atoms in block 44
Block first atom: 2080
Blocpdb> 45 atoms in block 45
Block first atom: 2124
Blocpdb> 57 atoms in block 46
Block first atom: 2169
Blocpdb> 50 atoms in block 47
Block first atom: 2226
Blocpdb> 52 atoms in block 48
Block first atom: 2276
Blocpdb> 51 atoms in block 49
Block first atom: 2328
Blocpdb> 50 atoms in block 50
Block first atom: 2379
Blocpdb> 47 atoms in block 51
Block first atom: 2429
Blocpdb> 48 atoms in block 52
Block first atom: 2476
Blocpdb> 53 atoms in block 53
Block first atom: 2524
Blocpdb> 50 atoms in block 54
Block first atom: 2577
Blocpdb> 56 atoms in block 55
Block first atom: 2627
Blocpdb> 51 atoms in block 56
Block first atom: 2683
Blocpdb> 59 atoms in block 57
Block first atom: 2734
Blocpdb> 46 atoms in block 58
Block first atom: 2793
Blocpdb> 56 atoms in block 59
Block first atom: 2839
Blocpdb> 64 atoms in block 60
Block first atom: 2895
Blocpdb> 53 atoms in block 61
Block first atom: 2959
Blocpdb> 58 atoms in block 62
Block first atom: 3012
Blocpdb> 57 atoms in block 63
Block first atom: 3070
Blocpdb> 47 atoms in block 64
Block first atom: 3127
Blocpdb> 49 atoms in block 65
Block first atom: 3174
Blocpdb> 47 atoms in block 66
Block first atom: 3223
Blocpdb> 44 atoms in block 67
Block first atom: 3270
Blocpdb> 39 atoms in block 68
Block first atom: 3314
Blocpdb> 44 atoms in block 69
Block first atom: 3353
Blocpdb> 41 atoms in block 70
Block first atom: 3397
Blocpdb> 57 atoms in block 71
Block first atom: 3438
Blocpdb> 55 atoms in block 72
Block first atom: 3495
Blocpdb> 63 atoms in block 73
Block first atom: 3550
Blocpdb> 47 atoms in block 74
Block first atom: 3613
Blocpdb> 50 atoms in block 75
Block first atom: 3660
Blocpdb> 42 atoms in block 76
Block first atom: 3710
Blocpdb> 41 atoms in block 77
Block first atom: 3752
Blocpdb> 45 atoms in block 78
Block first atom: 3793
Blocpdb> 48 atoms in block 79
Block first atom: 3838
Blocpdb> 48 atoms in block 80
Block first atom: 3886
Blocpdb> 50 atoms in block 81
Block first atom: 3934
Blocpdb> 44 atoms in block 82
Block first atom: 3984
Blocpdb> 43 atoms in block 83
Block first atom: 4028
Blocpdb> 41 atoms in block 84
Block first atom: 4071
Blocpdb> 42 atoms in block 85
Block first atom: 4112
Blocpdb> 53 atoms in block 86
Block first atom: 4154
Blocpdb> 42 atoms in block 87
Block first atom: 4207
Blocpdb> 48 atoms in block 88
Block first atom: 4249
Blocpdb> 41 atoms in block 89
Block first atom: 4297
Blocpdb> 45 atoms in block 90
Block first atom: 4338
Blocpdb> 44 atoms in block 91
Block first atom: 4383
Blocpdb> 37 atoms in block 92
Block first atom: 4427
Blocpdb> 42 atoms in block 93
Block first atom: 4464
Blocpdb> 51 atoms in block 94
Block first atom: 4506
Blocpdb> 38 atoms in block 95
Block first atom: 4557
Blocpdb> 53 atoms in block 96
Block first atom: 4595
Blocpdb> 45 atoms in block 97
Block first atom: 4648
Blocpdb> 48 atoms in block 98
Block first atom: 4693
Blocpdb> 46 atoms in block 99
Block first atom: 4741
Blocpdb> 51 atoms in block 100
Block first atom: 4787
Blocpdb> 49 atoms in block 101
Block first atom: 4838
Blocpdb> 52 atoms in block 102
Block first atom: 4887
Blocpdb> 49 atoms in block 103
Block first atom: 4939
Blocpdb> 55 atoms in block 104
Block first atom: 4988
Blocpdb> 61 atoms in block 105
Block first atom: 5043
Blocpdb> 46 atoms in block 106
Block first atom: 5104
Blocpdb> 48 atoms in block 107
Block first atom: 5150
Blocpdb> 44 atoms in block 108
Block first atom: 5198
Blocpdb> 52 atoms in block 109
Block first atom: 5242
Blocpdb> 57 atoms in block 110
Block first atom: 5294
Blocpdb> 44 atoms in block 111
Block first atom: 5351
Blocpdb> 55 atoms in block 112
Block first atom: 5395
Blocpdb> 42 atoms in block 113
Block first atom: 5450
Blocpdb> 39 atoms in block 114
Block first atom: 5492
Blocpdb> 47 atoms in block 115
Block first atom: 5531
Blocpdb> 46 atoms in block 116
Block first atom: 5578
Blocpdb> 49 atoms in block 117
Block first atom: 5624
Blocpdb> 58 atoms in block 118
Block first atom: 5673
Blocpdb> 41 atoms in block 119
Block first atom: 5731
Blocpdb> 51 atoms in block 120
Block first atom: 5772
Blocpdb> 53 atoms in block 121
Block first atom: 5823
Blocpdb> 57 atoms in block 122
Block first atom: 5876
Blocpdb> 49 atoms in block 123
Block first atom: 5933
Blocpdb> 43 atoms in block 124
Block first atom: 5982
Blocpdb> 41 atoms in block 125
Block first atom: 6025
Blocpdb> 51 atoms in block 126
Block first atom: 6066
Blocpdb> 51 atoms in block 127
Block first atom: 6117
Blocpdb> 53 atoms in block 128
Block first atom: 6168
Blocpdb> 50 atoms in block 129
Block first atom: 6221
Blocpdb> 46 atoms in block 130
Block first atom: 6271
Blocpdb> 48 atoms in block 131
Block first atom: 6317
Blocpdb> 45 atoms in block 132
Block first atom: 6365
Blocpdb> 51 atoms in block 133
Block first atom: 6410
Blocpdb> 52 atoms in block 134
Block first atom: 6461
Blocpdb> 45 atoms in block 135
Block first atom: 6513
Blocpdb> 44 atoms in block 136
Block first atom: 6558
Blocpdb> 45 atoms in block 137
Block first atom: 6602
Blocpdb> 57 atoms in block 138
Block first atom: 6647
Blocpdb> 50 atoms in block 139
Block first atom: 6704
Blocpdb> 52 atoms in block 140
Block first atom: 6754
Blocpdb> 51 atoms in block 141
Block first atom: 6806
Blocpdb> 50 atoms in block 142
Block first atom: 6857
Blocpdb> 47 atoms in block 143
Block first atom: 6907
Blocpdb> 48 atoms in block 144
Block first atom: 6954
Blocpdb> 53 atoms in block 145
Block first atom: 7002
Blocpdb> 50 atoms in block 146
Block first atom: 7055
Blocpdb> 56 atoms in block 147
Block first atom: 7105
Blocpdb> 51 atoms in block 148
Block first atom: 7161
Blocpdb> 59 atoms in block 149
Block first atom: 7212
Blocpdb> 46 atoms in block 150
Block first atom: 7271
Blocpdb> 56 atoms in block 151
Block first atom: 7317
Blocpdb> 64 atoms in block 152
Block first atom: 7373
Blocpdb> 53 atoms in block 153
Block first atom: 7437
Blocpdb> 58 atoms in block 154
Block first atom: 7490
Blocpdb> 57 atoms in block 155
Block first atom: 7548
Blocpdb> 47 atoms in block 156
Block first atom: 7605
Blocpdb> 49 atoms in block 157
Block first atom: 7652
Blocpdb> 51 atoms in block 158
Block first atom: 7701
Blocpdb> 44 atoms in block 159
Block first atom: 7752
Blocpdb> 39 atoms in block 160
Block first atom: 7796
Blocpdb> 44 atoms in block 161
Block first atom: 7835
Blocpdb> 41 atoms in block 162
Block first atom: 7879
Blocpdb> 51 atoms in block 163
Block first atom: 7920
Blocpdb> 55 atoms in block 164
Block first atom: 7971
Blocpdb> 63 atoms in block 165
Block first atom: 8026
Blocpdb> 53 atoms in block 166
Block first atom: 8089
Blocpdb> 50 atoms in block 167
Block first atom: 8142
Blocpdb> 42 atoms in block 168
Block first atom: 8192
Blocpdb> 42 atoms in block 169
Block first atom: 8234
Blocpdb> 45 atoms in block 170
Block first atom: 8276
Blocpdb> 48 atoms in block 171
Block first atom: 8321
Blocpdb> 48 atoms in block 172
Block first atom: 8369
Blocpdb> 50 atoms in block 173
Block first atom: 8417
Blocpdb> 44 atoms in block 174
Block first atom: 8467
Blocpdb> 43 atoms in block 175
Block first atom: 8511
Blocpdb> 41 atoms in block 176
Block first atom: 8554
Blocpdb> 42 atoms in block 177
Block first atom: 8595
Blocpdb> 53 atoms in block 178
Block first atom: 8637
Blocpdb> 42 atoms in block 179
Block first atom: 8690
Blocpdb> 48 atoms in block 180
Block first atom: 8732
Blocpdb> 41 atoms in block 181
Block first atom: 8780
Blocpdb> 45 atoms in block 182
Block first atom: 8821
Blocpdb> 44 atoms in block 183
Block first atom: 8866
Blocpdb> 37 atoms in block 184
Block first atom: 8909
Blocpdb> 184 blocks.
Blocpdb> At most, 64 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 37 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 3564477 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 26838
Prepmat> Matrix trace = 7802660.0000
Prepmat> Last element read: 26838 26838 221.1823
Prepmat> 17021 lines saved.
Prepmat> 15333 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 8946
RTB> Total mass = 8946.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 8946
RTB> Number of blocks = 184
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 216113.6908
RTB> 57972 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 1104
Diagstd> Nb of non-zero elements: 57972
Diagstd> Projected matrix trace = 216113.6908
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 1104 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 216113.6908
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.9430414 1.4094374 2.9259210 3.0524395
3.9573757 4.1565576 4.4271296 4.8637606 5.3135634
5.3709536 6.1717949 7.4179370 7.6549738 7.8836676
8.2578606 8.3013332 8.7366248 9.3525460 11.0632041
11.2757363 11.9942173 12.3619619 12.3762325 12.8213186
13.7125013 13.9135268 14.3781088 14.6516996 15.4535338
16.0744296 16.3995418 16.8950735 18.0323775 18.9600280
19.4454752 19.7639470 20.2995750 20.8213635 21.5030599
21.5781165 22.4785397 22.7205275 23.3798696 23.5737354
23.9576708 24.1469986 24.4509281 24.8075755 25.8228940
26.3928199 26.8357410 27.2851383 28.1584086 28.4869638
28.7643466 29.2337778 30.2162988 30.4599120 30.9024323
31.2088368 31.7078792 32.0878931 32.5642046 32.7036929
33.0007842 33.7076989 34.0729370 34.5129496 34.8222801
35.5283008 35.8848807 36.5638714 36.8446261 37.3343925
37.8018604 37.9509916 38.5438620 38.7718101 38.8526461
39.5600600 39.7426299 40.3409554 40.5467882 41.2635462
41.8786845 42.8926861 43.3509069 43.7628639 44.2280637
44.4902405 44.8504851 45.3507615 45.7751717 45.8977725
46.7814560 47.1991578 47.7792518 48.1266652 48.3805313
48.8608729
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034288 0.0034309 0.0034326 0.0034329 0.0034351
0.0034366 105.4534164 128.9193709 185.7490393 189.7224893
216.0224681 221.3921308 228.4843180 239.4866863 250.3157713
251.6639332 269.7745795 295.7582391 300.4464891 304.9014104
312.0534972 312.8738055 320.9719814 332.0933703 361.1900205
364.6428785 376.0808651 381.8026869 382.0229998 388.8316669
402.1180995 405.0549047 411.7619040 415.6610046 426.8833186
435.3745772 439.7553553 446.3497780 461.1282995 472.8406087
478.8555883 482.7609365 489.2589206 495.5070787 503.5532610
504.4313238 514.8483529 517.6121772 525.0689327 527.2413731
531.5175110 533.6135624 536.9612610 540.8632092 551.8203812
557.8766406 562.5382739 567.2289129 576.2346019 579.5866351
582.4015702 587.1347043 596.9197023 599.3211478 603.6589052
606.6442306 611.4752420 615.1285459 619.6772006 621.0029710
623.8172942 630.4633327 633.8698071 637.9495259 640.8020354
647.2655590 650.5055910 656.6309762 659.1471172 663.5135937
667.6546330 668.9703114 674.1753886 676.1659840 676.8704915
683.0047925 684.5790138 689.7129334 691.4702655 697.5551581
702.7353423 711.1920652 714.9807907 718.3699345 722.1779826
724.3152964 727.2418331 731.2865271 734.7003912 735.6836170
742.7320207 746.0405006 750.6110480 753.3350346 755.3193260
759.0596239
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 8946
Rtb_to_modes> Number of blocs = 184
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9697E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9825E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9923E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9940E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0007E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0015E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9430
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.409
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.926
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.052
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.957
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.157
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.427
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.864
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.314
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.371
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.172
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.418
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.655
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.884
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.258
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.301
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.737
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.353
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.06
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.28
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.99
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.36
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.38
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.82
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.71
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.91
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.38
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.65
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.45
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.07
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.40
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.90
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.96
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.45
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.76
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.30
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.82
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.50
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.58
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.48
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.72
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.38
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.57
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.96
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.15
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.45
Rdmodfacs> Eigenvector number: 54
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.81
Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.82
Rdmodfacs> Eigenvector number: 56
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.39
Rdmodfacs> Eigenvector number: 57
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.84
Rdmodfacs> Eigenvector number: 58
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.29
Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.16
Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.49
Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.76
Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.23
Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.22
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.46
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.90
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.21
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.71
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 69
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.56
Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.70
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.00
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.71
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.07
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.51
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.82
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.53
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.88
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.56
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.84
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.33
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.80
Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.95
Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.54
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.77
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.85
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.56
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.74
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.34
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.55
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.26
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.88
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.89
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.35
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.76
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.23
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.49
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.85
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.35
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.78
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.90
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.78
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.20
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.78
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.13
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.38
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.86
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1104 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000
1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 0.99998
1.00002 1.00001 1.00000 0.99998 1.00000
1.00004 0.99998 0.99998 0.99999 1.00002
1.00001 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000
0.99999 0.99998 0.99998 1.00000 1.00001
1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000
0.99999 0.99999 0.99999 0.99999 0.99999
0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001
1.00002 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000
0.99997 0.99998 1.00000 0.99999 1.00000
0.99997 1.00001 0.99999 1.00000 0.99997
0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999
1.00002 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000
1.00003 1.00001 0.99999 1.00000 1.00002
1.00002 1.00000 0.99998 0.99999 1.00002
0.99999 1.00001 1.00000 1.00001 1.00001
1.00002 0.99999 1.00001 0.99998 1.00000
0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 0.99998
1.00000 1.00002 0.99999 0.99998 0.99998
0.99998 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001
0.99998
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 161028 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000
1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 0.99998
1.00002 1.00001 1.00000 0.99998 1.00000
1.00004 0.99998 0.99998 0.99999 1.00002
1.00001 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000
0.99999 0.99998 0.99998 1.00000 1.00001
1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000
0.99999 0.99999 0.99999 0.99999 0.99999
0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001
1.00002 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000
0.99997 0.99998 1.00000 0.99999 1.00000
0.99997 1.00001 0.99999 1.00000 0.99997
0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999
1.00002 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000
1.00003 1.00001 0.99999 1.00000 1.00002
1.00002 1.00000 0.99998 0.99999 1.00002
0.99999 1.00001 1.00000 1.00001 1.00001
1.00002 0.99999 1.00001 0.99998 1.00000
0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 0.99998
1.00000 1.00002 0.99999 0.99998 0.99998
0.99998 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001
0.99998
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2:-0.000
Vector 3: 0.000-0.000
Vector 4:-0.000 0.000-0.000
Vector 5:-0.000-0.000-0.000 0.000
Vector 6: 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000
Vector 7: 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000
Vector 8:-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 9:-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000
Vector 10:-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2604280955002834926.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2604280955002834926.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 2604280955002834926.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2604280955002834926.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 1102
First residue number = 33
Last residue number = 583
Number of atoms found = 8946
Mean number per residue = 8.1
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9697E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9825E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9923E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9940E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0007E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0015E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9430
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.409
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.926
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.052
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.957
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.157
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.427
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.864
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.314
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.371
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.172
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.418
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.655
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.884
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.258
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.301
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.737
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.353
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.28
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.99
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.82
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.71
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.65
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.45
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.96
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.45
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.76
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.82
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.58
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.96
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.45
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.82
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.84
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.29
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.16
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.49
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.76
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.71
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.00
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.71
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.51
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.82
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.84
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.80
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.95
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.54
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.85
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.76
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.49
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.85
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.86
Bfactors> 106 vectors, 26838 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.943000
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= 0.656 for 1109 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.013 +/- 0.01
Bfactors> = 27.556 +/- 10.03
Bfactors> Shiftng-fct= 27.543
Bfactors> Scaling-fct= 865.537
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2604280955002834926.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2604280955002834926.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4286E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4308E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4325E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4328E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4350E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4364E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 105.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 128.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 185.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 189.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 216.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 221.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 228.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 239.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 250.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 251.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 269.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 295.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 300.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 304.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 312.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 312.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 321.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 332.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 361.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 364.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 376.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 381.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 382.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 388.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 402.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 405.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 411.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 415.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 426.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 435.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 439.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 446.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 461.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 472.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 478.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 482.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 489.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 495.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 503.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 504.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 514.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 517.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 525.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 527.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 531.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 533.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 536.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 540.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 551.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 557.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 562.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 567.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 576.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 579.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 582.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 587.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 596.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 599.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 603.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 606.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 611.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 615.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 619.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 620.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 623.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 630.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 633.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 637.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 640.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 647.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 650.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 656.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 659.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 663.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 667.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 668.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 674.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 676.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 676.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 683.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 684.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 689.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 691.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 697.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 702.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 711.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 714.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 718.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 722.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 724.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 727.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 731.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 734.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 735.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 742.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 746.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 750.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 753.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 755.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 759.0
Chkmod> 106 vectors, 26838 coordinates in file.
Chkmod> That is: 8946 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.7552
0.0034 0.8851
0.0034 0.8857
0.0034 0.8519
0.0034 0.7383
0.0034 0.7838
105.4466 0.7174
128.8938 0.6484
185.7436 0.3892
189.7007 0.4544
216.0029 0.5247
221.3944 0.3168
228.4712 0.5468
239.4823 0.2675
250.3153 0.6483
251.6542 0.4895
269.7675 0.4969
295.7468 0.2876
300.4341 0.4057
304.8947 0.3882
312.0427 0.4265
312.8541 0.5148
320.9651 0.3272
332.0872 0.4867
361.1222 0.6578
364.6962 0.5885
375.9986 0.3228
381.7560 0.2986
382.0647 0.4833
388.7950 0.2033
402.0642 0.6130
404.9862 0.6316
411.7713 0.6161
415.6191 0.5859
426.8162 0.6275
435.2959 0.4514
439.7426 0.6339
446.3957 0.4869
461.0781 0.4146
472.8200 0.3401
478.8907 0.5479
482.6920 0.6014
489.2430 0.3644
495.4696 0.4534
503.4958 0.4636
504.4317 0.6277
514.8430 0.4577
517.5839 0.5596
525.0479 0.4280
527.1770 0.5401
531.5205 0.3810
533.6238 0.3709
536.9280 0.3951
540.8664 0.4291
551.7658 0.4409
557.8229 0.4477
562.5588 0.3145
567.2551 0.3638
576.2261 0.4326
579.5926 0.2931
582.3326 0.3871
587.0716 0.4206
596.9306 0.4154
599.2963 0.4452
603.6092 0.2687
606.6295 0.4027
611.4694 0.3561
615.1223 0.4545
619.6106 0.4892
620.9413 0.5688
623.7831 0.4310
630.4578 0.4583
633.8153 0.5282
637.8949 0.3902
640.7535 0.5584
647.2533 0.4067
650.4334 0.5918
656.5680 0.5514
659.0774 0.5020
663.4461 0.5254
667.6095 0.5756
668.9329 0.5205
674.1127 0.5706
676.1212 0.4942
676.8184 0.4594
682.9750 0.5685
684.5270 0.5452
689.6752 0.4242
691.4680 0.4390
697.4952 0.5804
702.7162 0.5001
711.1393 0.5390
714.9426 0.4994
718.3156 0.5182
722.1628 0.5225
724.2822 0.5485
727.2067 0.4633
731.2490 0.5629
734.7076 0.4910
735.6699 0.5164
742.6886 0.4991
746.0151 0.3914
750.5847 0.4502
753.3288 0.4942
755.2828 0.5402
759.0203 0.4503
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2604280955002834926 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
2604280955002834926.eigenfacs
2604280955002834926.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2604280955002834926.eigenfacs
2604280955002834926.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2604280955002834926.eigenfacs
2604280955002834926.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2604280955002834926.eigenfacs
2604280955002834926.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2604280955002834926.eigenfacs
2604280955002834926.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2604280955002834926.eigenfacs
2604280955002834926.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2604280955002834926.eigenfacs
2604280955002834926.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2604280955002834926.eigenfacs
2604280955002834926.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2604280955002834926.eigenfacs
2604280955002834926.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2604280955002834926.eigenfacs
2604280955002834926.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2604280955002834926.eigenfacs
2604280955002834926.atom
making animated gifs
11 models are in 2604280955002834926.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604280955002834926.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604280955002834926.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 2604280955002834926 8 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
2604280955002834926.eigenfacs
2604280955002834926.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2604280955002834926.eigenfacs
2604280955002834926.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2604280955002834926.eigenfacs
2604280955002834926.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2604280955002834926.eigenfacs
2604280955002834926.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2604280955002834926.eigenfacs
2604280955002834926.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2604280955002834926.eigenfacs
2604280955002834926.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2604280955002834926.eigenfacs
2604280955002834926.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2604280955002834926.eigenfacs
2604280955002834926.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2604280955002834926.eigenfacs
2604280955002834926.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2604280955002834926.eigenfacs
2604280955002834926.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2604280955002834926.eigenfacs
2604280955002834926.atom
making animated gifs
11 models are in 2604280955002834926.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604280955002834926.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604280955002834926.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 2604280955002834926 9 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
2604280955002834926.eigenfacs
2604280955002834926.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2604280955002834926.eigenfacs
2604280955002834926.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2604280955002834926.eigenfacs
2604280955002834926.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2604280955002834926.eigenfacs
2604280955002834926.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2604280955002834926.eigenfacs
2604280955002834926.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2604280955002834926.eigenfacs
2604280955002834926.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2604280955002834926.eigenfacs
2604280955002834926.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2604280955002834926.eigenfacs
2604280955002834926.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2604280955002834926.eigenfacs
2604280955002834926.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2604280955002834926.eigenfacs
2604280955002834926.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2604280955002834926.eigenfacs
2604280955002834926.atom
making animated gifs
11 models are in 2604280955002834926.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604280955002834926.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604280955002834926.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 2604280955002834926 10 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
2604280955002834926.eigenfacs
2604280955002834926.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2604280955002834926.eigenfacs
2604280955002834926.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2604280955002834926.eigenfacs
2604280955002834926.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2604280955002834926.eigenfacs
2604280955002834926.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2604280955002834926.eigenfacs
2604280955002834926.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2604280955002834926.eigenfacs
2604280955002834926.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2604280955002834926.eigenfacs
2604280955002834926.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2604280955002834926.eigenfacs
2604280955002834926.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2604280955002834926.eigenfacs
2604280955002834926.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2604280955002834926.eigenfacs
2604280955002834926.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2604280955002834926.eigenfacs
2604280955002834926.atom
making animated gifs
11 models are in 2604280955002834926.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604280955002834926.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604280955002834926.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 2604280955002834926 11 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
2604280955002834926.eigenfacs
2604280955002834926.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2604280955002834926.eigenfacs
2604280955002834926.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2604280955002834926.eigenfacs
2604280955002834926.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2604280955002834926.eigenfacs
2604280955002834926.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2604280955002834926.eigenfacs
2604280955002834926.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2604280955002834926.eigenfacs
2604280955002834926.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2604280955002834926.eigenfacs
2604280955002834926.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2604280955002834926.eigenfacs
2604280955002834926.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2604280955002834926.eigenfacs
2604280955002834926.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2604280955002834926.eigenfacs
2604280955002834926.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2604280955002834926.eigenfacs
2604280955002834926.atom
making animated gifs
11 models are in 2604280955002834926.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604280955002834926.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604280955002834926.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
2604280955002834926.10.pdb
2604280955002834926.11.pdb
2604280955002834926.7.pdb
2604280955002834926.8.pdb
2604280955002834926.9.pdb
STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 0m55.095s
user 0m54.780s
sys 0m0.294s
rm: cannot remove '2604280955002834926.sdijf': No such file or directory
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:
elNémo
is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed
by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Between 2015 and 2025, it was hosted by US2B (Nantes).
Last modification: april 24th, 2026.
|