*** open ***
Output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 2604281148222846743.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 2604281148222846743.atom to be opened.
Openam> File opened: 2604281148222846743.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 311
First residue number = 2
Last residue number = 158
Number of atoms found = 311
Mean number per residue = 1.0
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 14.378077 +/- 8.637171 From: -5.678000 To: 33.518000
= 9.446650 +/- 13.022937 From: -19.313000 To: 36.543000
= 19.356074 +/- 12.528801 From: -8.665000 To: 48.110000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 3.4915 % Filled.
Pdbmat> 15213 non-zero elements.
Pdbmat> 1483 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 9.54 +/- 2.82
Maximum number = 16
Minimum number = 4
Pdbmat> Matrix trace = 29660.0
Pdbmat> Larger element = 69.7646
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
311 non-zero elements, NRBL set to 2
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 2604281148222846743.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 2
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 2604281148222846743.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
2604281148222846743.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 311 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 2 residue(s) per block.
Blocpdb> 311 residues.
%Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 1 i.e., less than what is required for a rigid body.
%Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 2th, in residue A 3
%Blocpdb-Wn> It will be merged with next block.
Blocpdb> 4 atoms in block 1
Block first atom: 1
%Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 2 i.e., less than what is required for a rigid body.
%Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 6th, in residue A 7
%Blocpdb-Wn> It will be merged with next block.
Blocpdb> 4 atoms in block 2
Block first atom: 5
%Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 3 i.e., less than what is required for a rigid body.
%Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 10th, in residue A 11
%Blocpdb-Wn> It will be merged with next block.
Blocpdb> 4 atoms in block 3
Block first atom: 9
%Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 4 i.e., less than what is required for a rigid body.
%Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 14th, in residue A 15
%Blocpdb-Wn> It will be merged with next block.
Blocpdb> 4 atoms in block 4
Block first atom: 13
%Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 5 i.e., less than what is required for a rigid body.
%Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 18th, in residue A 19
%Blocpdb-Wn> It will be merged with next block.
Blocpdb> 4 atoms in block 5
Block first atom: 17
%Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 6 i.e., less than what is required for a rigid body.
%Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 22th, in residue A 23
%Blocpdb-Wn> It will be merged with next block.
Blocpdb> 4 atoms in block 6
Block first atom: 21
%Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 7 i.e., less than what is required for a rigid body.
%Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 26th, in residue A 27
%Blocpdb-Wn> It will be merged with next block.
Blocpdb> 4 atoms in block 7
Block first atom: 25
%Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 8 i.e., less than what is required for a rigid body.
%Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 30th, in residue A 31
%Blocpdb-Wn> It will be merged with next block.
Blocpdb> 4 atoms in block 8
Block first atom: 29
%Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 9 i.e., less than what is required for a rigid body.
%Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 34th, in residue A 35
%Blocpdb-Wn> It will be merged with next block.
Blocpdb> 4 atoms in block 9
Block first atom: 33
%Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 10 i.e., less than what is required for a rigid body.
%Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 38th, in residue A 39
%Blocpdb-Wn> It will be merged with next block.
Blocpdb> 4 atoms in block 10
Block first atom: 37
%Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 11 i.e., less than what is required for a rigid body.
%Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 42th, in residue A 43
%Blocpdb-Wn> It will be merged with next block.
Blocpdb> 4 atoms in block 11
Block first atom: 41
%Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 12 i.e., less than what is required for a rigid body.
%Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 46th, in residue A 47
%Blocpdb-Wn> It will be merged with next block.
Blocpdb> 4 atoms in block 12
Block first atom: 45
%Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 13 i.e., less than what is required for a rigid body.
%Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 50th, in residue A 51
%Blocpdb-Wn> It will be merged with next block.
Blocpdb> 4 atoms in block 13
Block first atom: 49
%Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 14 i.e., less than what is required for a rigid body.
%Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 54th, in residue A 55
%Blocpdb-Wn> It will be merged with next block.
Blocpdb> 4 atoms in block 14
Block first atom: 53
%Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 15 i.e., less than what is required for a rigid body.
%Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 58th, in residue A 59
%Blocpdb-Wn> It will be merged with next block.
Blocpdb> 4 atoms in block 15
Block first atom: 57
%Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 16 i.e., less than what is required for a rigid body.
%Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 62th, in residue A 63
%Blocpdb-Wn> It will be merged with next block.
Blocpdb> 4 atoms in block 16
Block first atom: 61
%Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 17 i.e., less than what is required for a rigid body.
%Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 66th, in residue A 67
%Blocpdb-Wn> It will be merged with next block.
Blocpdb> 4 atoms in block 17
Block first atom: 65
%Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 18 i.e., less than what is required for a rigid body.
%Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 70th, in residue A 71
%Blocpdb-Wn> It will be merged with next block.
Blocpdb> 4 atoms in block 18
Block first atom: 69
%Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 19 i.e., less than what is required for a rigid body.
%Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 74th, in residue A 75
%Blocpdb-Wn> It will be merged with next block.
Blocpdb> 4 atoms in block 19
Block first atom: 73
%Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 20 i.e., less than what is required for a rigid body.
%Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 78th, in residue A 79
%Blocpdb-Wn> It will be merged with next block.
Blocpdb> 4 atoms in block 20
Block first atom: 77
%Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 21 i.e., less than what is required for a rigid body.
%Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 82th, in residue A 83
%Blocpdb-Wn> It will be merged with next block.
Blocpdb> 4 atoms in block 21
Block first atom: 81
%Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 22 i.e., less than what is required for a rigid body.
%Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 86th, in residue A 87
%Blocpdb-Wn> It will be merged with next block.
Blocpdb> 4 atoms in block 22
Block first atom: 85
%Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 23 i.e., less than what is required for a rigid body.
%Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 90th, in residue A 91
%Blocpdb-Wn> It will be merged with next block.
Blocpdb> 4 atoms in block 23
Block first atom: 89
%Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 24 i.e., less than what is required for a rigid body.
%Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 94th, in residue A 95
%Blocpdb-Wn> It will be merged with next block.
Blocpdb> 4 atoms in block 24
Block first atom: 93
%Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 25 i.e., less than what is required for a rigid body.
%Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 98th, in residue A 99
%Blocpdb-Wn> It will be merged with next block.
Blocpdb> 4 atoms in block 25
Block first atom: 97
%Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 26 i.e., less than what is required for a rigid body.
%Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 102th, in residue A 103
%Blocpdb-Wn> It will be merged with next block.
Blocpdb> 4 atoms in block 26
Block first atom: 101
%Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 27 i.e., less than what is required for a rigid body.
%Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 106th, in residue A 107
%Blocpdb-Wn> It will be merged with next block.
Blocpdb> 4 atoms in block 27
Block first atom: 105
%Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 28 i.e., less than what is required for a rigid body.
%Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 110th, in residue A 111
%Blocpdb-Wn> It will be merged with next block.
Blocpdb> 4 atoms in block 28
Block first atom: 109
%Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 29 i.e., less than what is required for a rigid body.
%Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 114th, in residue A 115
%Blocpdb-Wn> It will be merged with next block.
Blocpdb> 4 atoms in block 29
Block first atom: 113
%Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 30 i.e., less than what is required for a rigid body.
%Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 118th, in residue A 119
%Blocpdb-Wn> It will be merged with next block.
Blocpdb> 4 atoms in block 30
Block first atom: 117
%Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 31 i.e., less than what is required for a rigid body.
%Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 122th, in residue A 123
%Blocpdb-Wn> It will be merged with next block.
Blocpdb> 4 atoms in block 31
Block first atom: 121
%Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 32 i.e., less than what is required for a rigid body.
%Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 126th, in residue A 127
%Blocpdb-Wn> It will be merged with next block.
Blocpdb> 4 atoms in block 32
Block first atom: 125
%Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 33 i.e., less than what is required for a rigid body.
%Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 130th, in residue A 131
%Blocpdb-Wn> It will be merged with next block.
Blocpdb> 4 atoms in block 33
Block first atom: 129
%Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 34 i.e., less than what is required for a rigid body.
%Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 134th, in residue A 135
%Blocpdb-Wn> It will be merged with next block.
Blocpdb> 4 atoms in block 34
Block first atom: 133
%Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 35 i.e., less than what is required for a rigid body.
%Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 138th, in residue A 139
%Blocpdb-Wn> It will be merged with next block.
Blocpdb> 4 atoms in block 35
Block first atom: 137
%Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 36 i.e., less than what is required for a rigid body.
%Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 142th, in residue A 143
%Blocpdb-Wn> It will be merged with next block.
Blocpdb> 4 atoms in block 36
Block first atom: 141
%Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 37 i.e., less than what is required for a rigid body.
%Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 146th, in residue A 147
%Blocpdb-Wn> It will be merged with next block.
Blocpdb> 4 atoms in block 37
Block first atom: 145
%Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 38 i.e., less than what is required for a rigid body.
%Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 150th, in residue A 151
%Blocpdb-Wn> It will be merged with next block.
Blocpdb> 4 atoms in block 38
Block first atom: 149
%Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 39 i.e., less than what is required for a rigid body.
%Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 154th, in residue A 155
%Blocpdb-Wn> It will be merged with next block.
Blocpdb> 4 atoms in block 39
Block first atom: 153
%Blocpdb-Wn> 1 atoms in block 40 i.e., less than what is required for a rigid body.
%Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 157th, in residue A 158
%Blocpdb-Wn> It is merged with the previous one.
Blocpdb> 5 atoms in block 39
%Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 40 i.e., less than what is required for a rigid body.
%Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 159th, in residue B 3
%Blocpdb-Wn> It will be merged with next block.
Blocpdb> 4 atoms in block 40
Block first atom: 158
%Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 41 i.e., less than what is required for a rigid body.
%Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 163th, in residue B 7
%Blocpdb-Wn> It will be merged with next block.
Blocpdb> 4 atoms in block 41
Block first atom: 162
%Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 42 i.e., less than what is required for a rigid body.
%Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 167th, in residue B 11
%Blocpdb-Wn> It will be merged with next block.
Blocpdb> 4 atoms in block 42
Block first atom: 166
%Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 43 i.e., less than what is required for a rigid body.
%Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 171th, in residue B 15
%Blocpdb-Wn> It will be merged with next block.
Blocpdb> 4 atoms in block 43
Block first atom: 170
%Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 44 i.e., less than what is required for a rigid body.
%Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 175th, in residue B 19
%Blocpdb-Wn> It will be merged with next block.
Blocpdb> 4 atoms in block 44
Block first atom: 174
%Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 45 i.e., less than what is required for a rigid body.
%Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 179th, in residue B 23
%Blocpdb-Wn> It will be merged with next block.
Blocpdb> 4 atoms in block 45
Block first atom: 178
%Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 46 i.e., less than what is required for a rigid body.
%Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 183th, in residue B 27
%Blocpdb-Wn> It will be merged with next block.
Blocpdb> 4 atoms in block 46
Block first atom: 182
%Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 47 i.e., less than what is required for a rigid body.
%Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 187th, in residue B 31
%Blocpdb-Wn> It will be merged with next block.
Blocpdb> 4 atoms in block 47
Block first atom: 186
%Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 48 i.e., less than what is required for a rigid body.
%Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 191th, in residue B 35
%Blocpdb-Wn> It will be merged with next block.
Blocpdb> 4 atoms in block 48
Block first atom: 190
%Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 49 i.e., less than what is required for a rigid body.
%Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 195th, in residue B 39
%Blocpdb-Wn> It will be merged with next block.
Blocpdb> 4 atoms in block 49
Block first atom: 194
%Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 50 i.e., less than what is required for a rigid body.
%Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 199th, in residue B 43
%Blocpdb-Wn> It will be merged with next block.
Blocpdb> 4 atoms in block 50
Block first atom: 198
%Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 51 i.e., less than what is required for a rigid body.
%Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 203th, in residue B 47
%Blocpdb-Wn> It will be merged with next block.
Blocpdb> 4 atoms in block 51
Block first atom: 202
%Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 52 i.e., less than what is required for a rigid body.
%Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 207th, in residue B 51
%Blocpdb-Wn> It will be merged with next block.
Blocpdb> 4 atoms in block 52
Block first atom: 206
%Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 53 i.e., less than what is required for a rigid body.
%Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 211th, in residue B 55
%Blocpdb-Wn> It will be merged with next block.
Blocpdb> 4 atoms in block 53
Block first atom: 210
%Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 54 i.e., less than what is required for a rigid body.
%Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 215th, in residue B 59
%Blocpdb-Wn> It will be merged with next block.
Blocpdb> 4 atoms in block 54
Block first atom: 214
%Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 55 i.e., less than what is required for a rigid body.
%Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 219th, in residue B 63
%Blocpdb-Wn> It will be merged with next block.
Blocpdb> 4 atoms in block 55
Block first atom: 218
%Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 56 i.e., less than what is required for a rigid body.
%Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 223th, in residue B 67
%Blocpdb-Wn> It will be merged with next block.
Blocpdb> 4 atoms in block 56
Block first atom: 222
%Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 57 i.e., less than what is required for a rigid body.
%Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 227th, in residue B 71
%Blocpdb-Wn> It will be merged with next block.
Blocpdb> 4 atoms in block 57
Block first atom: 226
%Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 58 i.e., less than what is required for a rigid body.
%Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 231th, in residue B 75
%Blocpdb-Wn> It will be merged with next block.
Blocpdb> 4 atoms in block 58
Block first atom: 230
%Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 59 i.e., less than what is required for a rigid body.
%Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 235th, in residue B 79
%Blocpdb-Wn> It will be merged with next block.
Blocpdb> 4 atoms in block 59
Block first atom: 234
%Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 60 i.e., less than what is required for a rigid body.
%Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 239th, in residue B 83
%Blocpdb-Wn> It will be merged with next block.
Blocpdb> 4 atoms in block 60
Block first atom: 238
%Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 61 i.e., less than what is required for a rigid body.
%Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 243th, in residue B 87
%Blocpdb-Wn> It will be merged with next block.
Blocpdb> 4 atoms in block 61
Block first atom: 242
%Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 62 i.e., less than what is required for a rigid body.
%Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 247th, in residue B 91
%Blocpdb-Wn> It will be merged with next block.
Blocpdb> 4 atoms in block 62
Block first atom: 246
%Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 63 i.e., less than what is required for a rigid body.
%Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 251th, in residue B 95
%Blocpdb-Wn> It will be merged with next block.
Blocpdb> 4 atoms in block 63
Block first atom: 250
%Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 64 i.e., less than what is required for a rigid body.
%Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 255th, in residue B 99
%Blocpdb-Wn> It will be merged with next block.
Blocpdb> 4 atoms in block 64
Block first atom: 254
%Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 65 i.e., less than what is required for a rigid body.
%Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 259th, in residue B 103
%Blocpdb-Wn> It will be merged with next block.
Blocpdb> 4 atoms in block 65
Block first atom: 258
%Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 66 i.e., less than what is required for a rigid body.
%Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 263th, in residue B 107
%Blocpdb-Wn> It will be merged with next block.
Blocpdb> 4 atoms in block 66
Block first atom: 262
%Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 67 i.e., less than what is required for a rigid body.
%Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 267th, in residue B 111
%Blocpdb-Wn> It will be merged with next block.
Blocpdb> 4 atoms in block 67
Block first atom: 266
%Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 68 i.e., less than what is required for a rigid body.
%Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 271th, in residue B 115
%Blocpdb-Wn> It will be merged with next block.
Blocpdb> 4 atoms in block 68
Block first atom: 270
%Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 69 i.e., less than what is required for a rigid body.
%Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 275th, in residue B 119
%Blocpdb-Wn> It will be merged with next block.
Blocpdb> 4 atoms in block 69
Block first atom: 274
%Blocpdb-Wn> 1 atoms in block 70 i.e., less than what is required for a rigid body.
%Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 278th, in residue B 122
%Blocpdb-Wn> It will be merged with next block.
Blocpdb> 3 atoms in block 70
Block first atom: 278
%Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 71 i.e., less than what is required for a rigid body.
%Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 282th, in residue B 129
%Blocpdb-Wn> It will be merged with next block.
Blocpdb> 4 atoms in block 71
Block first atom: 281
%Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 72 i.e., less than what is required for a rigid body.
%Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 286th, in residue B 133
%Blocpdb-Wn> It will be merged with next block.
Blocpdb> 4 atoms in block 72
Block first atom: 285
%Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 73 i.e., less than what is required for a rigid body.
%Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 290th, in residue B 137
%Blocpdb-Wn> It will be merged with next block.
Blocpdb> 4 atoms in block 73
Block first atom: 289
%Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 74 i.e., less than what is required for a rigid body.
%Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 294th, in residue B 141
%Blocpdb-Wn> It will be merged with next block.
Blocpdb> 4 atoms in block 74
Block first atom: 293
%Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 75 i.e., less than what is required for a rigid body.
%Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 298th, in residue B 145
%Blocpdb-Wn> It will be merged with next block.
Blocpdb> 4 atoms in block 75
Block first atom: 297
%Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 76 i.e., less than what is required for a rigid body.
%Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 302th, in residue B 149
%Blocpdb-Wn> It will be merged with next block.
Blocpdb> 4 atoms in block 76
Block first atom: 301
%Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 77 i.e., less than what is required for a rigid body.
%Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 306th, in residue B 153
%Blocpdb-Wn> It will be merged with next block.
Blocpdb> 4 atoms in block 77
Block first atom: 305
Blocpdb> 3 atoms in block 78
Block first atom: 308
Blocpdb> 78 blocks.
Blocpdb> At most, 5 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 3 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 15291 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 933
Prepmat> Matrix trace = 29660.0000
Prepmat> Last element read: 933 933 18.9572
Prepmat> 3082 lines saved.
Prepmat> 2763 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 311
RTB> Total mass = 311.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 311
RTB> Number of blocks = 78
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 11363.2679
RTB> 10278 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 468
Diagstd> Nb of non-zero elements: 10278
Diagstd> Projected matrix trace = 11363.2679
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 468 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 11363.2679
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.0455290 0.0676608 0.1151845 0.1453260
0.1531307 0.1811011 0.2102882 0.2277841 0.2711778
0.2882791 0.3273155 0.3489373 0.3939085 0.4226649
0.4658758 0.5046979 0.5247123 0.5595313 0.5856476
0.6303940 0.6750049 0.6898781 0.7159118 0.7796572
0.8522242 0.8605327 0.9211933 0.9547039 1.0318586
1.0864851 1.1116854 1.1564599 1.1827369 1.2032169
1.3335178 1.3661416 1.3984435 1.4705567 1.5608564
1.5870723 1.6402634 1.7852890 1.8413850 1.8557906
1.9111553 1.9546106 2.0326259 2.0640728 2.1026207
2.1253491 2.2044938 2.2569864 2.3952454 2.4642696
2.5032210 2.5954958 2.6874066 2.7438076 2.8263456
2.8627037 2.9204711 2.9599647 3.0525540 3.1442558
3.1643619 3.2421536 3.3417967 3.3840284 3.5031059
3.6128862 3.6794840 3.6948014 3.7922208 3.8141938
3.8507242 3.9553283 3.9753025 4.1052224 4.2997820
4.3487128 4.4419405 4.5061517 4.5738171 4.6525689
4.6671442 4.7570706 4.8520003 4.9989356 5.0891514
5.1750860 5.2026955 5.3608898 5.4629224 5.5841285
5.6827171 5.7016700 5.7360836 5.8635037 5.9659741
6.0409501
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034333 0.0034338 0.0034339 0.0034340 0.0034340
0.0034340 23.1706979 28.2464528 36.8546495 41.3968112
42.4938881 46.2121072 49.7969467 51.8271110 56.5486597
58.3044676 62.1267391 64.1459093 68.1542500 70.5981606
74.1191406 77.1455777 78.6603542 81.2283213 83.1023824
86.2186691 89.2172306 90.1947907 91.8808562 95.8842145
100.2471917 100.7346719 104.2247004 106.1034792 110.3075847
113.1897666 114.4949229 116.7778733 118.0971347 119.1152165
125.3991767 126.9238219 128.4155874 131.6849554 135.6677910
136.8023730 139.0759636 145.0940320 147.3559183 147.9311938
150.1216290 151.8187459 154.8189090 156.0119221 157.4619948
158.3107561 161.2314355 163.1397342 168.0622929 170.4666358
171.8085919 174.9465761 178.0172020 179.8755385 182.5609610
183.7314393 185.5759674 186.8265281 189.7260480 192.5547401
193.1694087 195.5294025 198.5113282 199.7617246 203.2459560
206.4060480 208.2997453 208.7328643 211.4667479 212.0785083
213.0916767 215.9665794 216.5112007 220.0207420 225.1741323
226.4517312 228.8661948 230.5144647 232.2387464 234.2295522
234.5961558 236.8454680 239.1969794 242.7918202 244.9728569
247.0324835 247.6905779 251.4280450 253.8094548 256.6096481
258.8649774 259.2962988 260.0776409 262.9504287 265.2381322
266.8995893
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 311
Rtb_to_modes> Number of blocs = 78
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9960E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9990E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9998E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.5529E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.7661E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1152
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1453
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1531
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1811
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2103
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2278
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2712
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2883
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3273
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3489
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3939
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4227
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4659
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5047
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5247
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5595
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5856
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6304
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6750
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6899
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7159
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7797
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8522
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8605
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9212
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9547
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.032
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.086
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.112
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.156
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.183
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.203
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.334
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.366
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.398
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.471
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.561
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.587
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.640
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.785
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.841
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.856
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.911
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.955
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.033
Rdmodfacs> Eigenvector number: 54
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.064
Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.103
Rdmodfacs> Eigenvector number: 56
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.125
Rdmodfacs> Eigenvector number: 57
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.204
Rdmodfacs> Eigenvector number: 58
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.257
Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.395
Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.464
Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.503
Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.595
Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.687
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.744
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.826
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.863
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.920
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.960
Rdmodfacs> Eigenvector number: 69
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.053
Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.144
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.164
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.242
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.342
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.384
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.503
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.613
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.679
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.695
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.792
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.814
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.851
Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.955
Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.975
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.105
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.300
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.349
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.442
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.506
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.574
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.653
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.667
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.757
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.852
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.999
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.089
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.175
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.203
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.361
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.463
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.584
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.683
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.702
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.736
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.864
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.966
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.041
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 468 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
0.99999 0.99999 0.99999 1.00004 0.99997
1.00000 1.00000 1.00002 1.00003 0.99998
1.00001 0.99998 1.00001 0.99996 1.00000
1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 1.00002
1.00000 0.99998 0.99998 1.00001 0.99997
1.00000 1.00001 0.99996 1.00001 1.00000
1.00002 1.00000 0.99998 1.00000 0.99999
1.00001 1.00001 1.00003 1.00001 1.00001
0.99998 0.99999 1.00004 0.99997 0.99996
0.99999 0.99998 0.99998 1.00000 1.00000
1.00000 0.99999 0.99998 1.00000 1.00003
1.00002 1.00001 1.00002 1.00002 1.00001
1.00004 1.00002 1.00000 1.00002 0.99999
0.99999 0.99999 0.99998 1.00001 1.00002
1.00002 1.00003 1.00001 1.00000 1.00003
0.99999 1.00002 0.99995 0.99999 1.00003
1.00001 0.99999 1.00004 0.99997 1.00004
1.00000 1.00001 1.00002 0.99998 0.99998
1.00003 1.00003 0.99997 0.99998 0.99999
1.00000 1.00003 1.00002 1.00001 1.00001
1.00001 1.00001 1.00003 1.00000 1.00002
0.99999
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 5598 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
0.99999 0.99999 0.99999 1.00004 0.99997
1.00000 1.00000 1.00002 1.00003 0.99998
1.00001 0.99998 1.00001 0.99996 1.00000
1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 1.00002
1.00000 0.99998 0.99998 1.00001 0.99997
1.00000 1.00001 0.99996 1.00001 1.00000
1.00002 1.00000 0.99998 1.00000 0.99999
1.00001 1.00001 1.00003 1.00001 1.00001
0.99998 0.99999 1.00004 0.99997 0.99996
0.99999 0.99998 0.99998 1.00000 1.00000
1.00000 0.99999 0.99998 1.00000 1.00003
1.00002 1.00001 1.00002 1.00002 1.00001
1.00004 1.00002 1.00000 1.00002 0.99999
0.99999 0.99999 0.99998 1.00001 1.00002
1.00002 1.00003 1.00001 1.00000 1.00003
0.99999 1.00002 0.99995 0.99999 1.00003
1.00001 0.99999 1.00004 0.99997 1.00004
1.00000 1.00001 1.00002 0.99998 0.99998
1.00003 1.00003 0.99997 0.99998 0.99999
1.00000 1.00003 1.00002 1.00001 1.00001
1.00001 1.00001 1.00003 1.00000 1.00002
0.99999
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2:-0.000
Vector 3:-0.000-0.000
Vector 4: 0.000-0.000-0.000
Vector 5: 0.000 0.000-0.000-0.000
Vector 6:-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000
Vector 7:-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000
Vector 8: 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 9: 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000
Vector 10: 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2604281148222846743.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2604281148222846743.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 2604281148222846743.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2604281148222846743.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 311
First residue number = 2
Last residue number = 158
Number of atoms found = 311
Mean number per residue = 1.0
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9960E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9990E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9998E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.5529E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.7661E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1152
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1453
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1531
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1811
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2103
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2278
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2712
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2883
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3273
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3489
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3939
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4227
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4659
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5047
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5247
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5595
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5856
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6304
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6750
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6899
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7159
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7797
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8522
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8605
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9212
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9547
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.032
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.086
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.112
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.156
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.183
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.203
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.334
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.366
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.398
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.471
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.561
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.587
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.640
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.785
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.841
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.856
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.911
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.955
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.033
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.064
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.103
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.125
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.204
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.257
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.395
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.464
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.503
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.595
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.687
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.744
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.826
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.863
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.920
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.960
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.053
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.144
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.164
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.242
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.342
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.384
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.503
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.613
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.679
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.695
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.792
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.814
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.851
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.955
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.975
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.105
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.300
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.349
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.442
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.506
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.574
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.653
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.667
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.757
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.852
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.999
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.089
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.175
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.203
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.361
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.463
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.584
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.683
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.702
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.736
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.864
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.966
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.041
Bfactors> 106 vectors, 933 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.045529
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= 0.637 for 311 C-alpha atoms.
Bfactors> = 7.032 +/- 5.94
Bfactors> = 23.956 +/- 10.09
Bfactors> Shiftng-fct= 16.924
Bfactors> Scaling-fct= 1.699
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2604281148222846743.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2604281148222846743.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4331E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 23.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 28.25
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 36.86
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 41.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 42.49
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 46.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 49.80
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 51.83
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 56.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 58.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 62.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 64.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 68.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 70.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 74.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 77.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 78.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 81.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 83.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 86.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 89.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 90.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 91.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 95.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 100.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 100.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 104.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 106.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 110.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 113.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 114.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 116.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 118.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 119.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 125.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 126.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 128.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 131.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 135.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 136.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 139.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 145.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 147.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 147.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 150.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 151.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 154.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 253.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 256.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 258.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 259.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 260.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 263.0
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 265.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 266.9
Chkmod> 106 vectors, 933 coordinates in file.
Chkmod> That is: 311 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector 14 is: 0.9999 (instead of 1.0000).
%Chkmod-Wn> Norm of vector 55 is: 1.0001 (instead of 1.0000).
%Chkmod-Wn> Norm of vector 83 is: 1.0001 (instead of 1.0000).
%Chkmod-Wn> Norm of vector 85 is: 1.0001 (instead of 1.0000).
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.7169
0.0034 0.8694
0.0034 0.9504
0.0034 0.7016
0.0034 0.7554
0.0034 0.9813
23.1697 0.6954
28.2453 0.7114
36.8555 0.4624
41.3913 0.2821
42.4878 0.5377
46.2100 0.5551
49.7962 0.4279
51.8267 0.1858
56.5486 0.4081
58.3041 0.2985
62.1226 0.2235
64.1397 0.3571
68.1506 0.3218
70.5981 0.5645
74.1179 0.4919
77.1424 0.5406
78.6561 0.6779
81.2226 0.5489
83.0954 0.5242
86.2154 0.3725
89.2131 0.4537
90.1924 0.4997
91.8762 0.3047
95.8827 0.4011
100.2415 0.4288
100.7284 0.5093
104.2206 0.5328
106.0987 0.4747
110.3104 0.5663
113.1596 0.3112
114.5062 0.6697
116.7496 0.4059
118.1052 0.4646
119.0994 0.4821
125.4165 0.5109
126.9118 0.5448
128.3897 0.3862
131.6992 0.5255
135.6682 0.4947
136.7934 0.4387
139.0588 0.3983
145.0761 0.3614
147.3342 0.5070
147.9332 0.5588
150.1091 0.4586
151.8274 0.5148
154.8265 0.5172
156.0025 0.6394
157.4694 0.3614
158.2910 0.3270
161.2065 0.5170
163.1332 0.4570
168.0465 0.5443
170.4500 0.3275
171.7936 0.3850
174.9224 0.3434
177.9961 0.4383
179.8741 0.6007
182.5420 0.3976
183.7331 0.5324
185.5530 0.5503
186.8196 0.6626
189.7318 0.5466
192.5386 0.4911
193.1501 0.5553
195.5164 0.5099
198.5088 0.2966
199.7523 0.5198
203.2342 0.5395
206.4004 0.6128
208.2771 0.3880
208.7295 0.4397
211.4515 0.6036
212.0640 0.5020
213.0902 0.4539
215.9483 0.4947
216.4937 0.5594
220.0053 0.4919
225.1702 0.4626
226.4495 0.4895
228.8579 0.5067
230.5007 0.5871
232.2334 0.5061
234.2303 0.4266
234.5825 0.4682
236.8335 0.5323
239.1867 0.4830
242.7830 0.5296
244.9587 0.5890
247.0198 0.5670
247.6872 0.5333
251.4198 0.6234
253.8004 0.3898
256.5957 0.5722
258.8603 0.4510
259.2927 0.3033
260.0646 0.5372
262.9503 0.3237
265.2273 0.4873
266.8892 0.3796
Project conformational change on normal modes:
Projmod> Version 1.36, April 2003.
Projmod> Projection of a difference vector on a set of eigenvectors.
Getnam> CERFACS file with the eigenvectors ?
Getnam> 2604281148222846743.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2604281148222846743.eigenfacs
Getnam> Pdb file with the reference structure ?
Getnam> 2604281148222846743.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2604281148222846743.atom
Getnam> Pdb file with the other conformer ?
Getnam> 2604281148222846743.atom2
Openam> file on opening on unit 12:
2604281148222846743.atom2
Getrep> Are the masses given in the pdb file ? (y/n)
Getrep> F
Projmod> All masses will all be assumed to be of 1.
Getrep> Displacement along one mode ? (y/n)
Getrep> F
Openam> file on opening on unit 13:
projmod.res
Openam> file on opening on unit 14:
dr.res
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4331E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 23.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 28.25
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 36.86
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 41.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 42.49
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 46.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 49.80
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 51.83
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 56.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 58.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 62.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 64.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 68.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 70.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 74.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 77.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 78.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 81.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 83.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 86.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 89.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 90.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 91.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 95.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 100.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 100.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 104.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 106.1
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 113.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 114.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 116.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 118.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 119.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 125.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 126.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 128.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 131.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 135.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 136.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 139.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 145.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 147.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 147.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 150.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 151.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 154.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 156.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 157.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 158.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 161.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 163.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 168.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 170.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 171.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 174.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 178.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 179.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 182.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 183.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 185.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 186.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 189.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 192.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 193.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 195.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 198.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 199.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 203.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 206.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 208.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 208.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 211.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 212.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 213.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 215.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 216.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 220.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 225.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 226.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 228.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 230.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 232.2
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 234.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 234.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 236.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 239.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 242.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 245.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 247.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 247.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 251.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 253.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 256.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 258.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 259.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 260.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 263.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 265.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 266.9
Projmod> 106 vectors, 933 coordinates in file.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 311
First residue number = 2
Last residue number = 158
Number of atoms found = 311
Mean number per residue = 1.0
Projmod> Cartesian (eigen)vectors will be studied.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 311
First residue number = 1
Last residue number = 145
Number of atoms found = 311
Mean number per residue = 1.0
%Projmod-Wn> Atom 1 belongs to residue MET in a file and GLU in the other.
%Projmod-Wn> Atom 2 belongs to residue ILE in a file and LEU in the other.
%Projmod-Wn> Atom 5 belongs to residue PHE in a file and VAL in the other.
%Projmod-Wn> Atom 6 belongs to residue MET in a file and ALA in the other.
%Projmod-Wn> ...
%Projmod-Wn> 284 atoms belong to different residues in the two pdb files.
Projmod> File dr.res: displacement=f(atom number).
Projmod> 311 atoms are considered.
Projmod> Atomic r.m.s. displacements= 44.32
Projmod> Atomic average masses = 1.00 +/- 0.00
Projmod> File projmod.res: dr.vector=f(fqcy), and cumulative square sum.
Vector: 1 F= 0.00 Cos= -0.107 Sum= 0.011 q= -83.8117
Vector: 2 F= 0.00 Cos= -0.786 Sum= 0.630 q= -614.5959
Vector: 3 F= 0.00 Cos= 0.008 Sum= 0.630 q= 6.0537
Vector: 4 F= 0.00 Cos= -0.044 Sum= 0.632 q= -34.6743
Vector: 5 F= 0.00 Cos= -0.128 Sum= 0.648 q= -100.2000
Vector: 6 F= 0.00 Cos= 0.220 Sum= 0.697 q= 172.2635
Vector: 7 F= 23.17 Cos= -0.002 Sum= 0.697 q= -1.8349
Vector: 8 F= 28.25 Cos= -0.069 Sum= 0.702 q= -53.9667
Vector: 9 F= 36.86 Cos= -0.099 Sum= 0.711 q= -77.2849
Vector: 10 F= 41.39 Cos= -0.004 Sum= 0.711 q= -2.8764
Vector: 11 F= 42.49 Cos= 0.037 Sum= 0.713 q= 28.8439
Vector: 12 F= 46.21 Cos= 0.057 Sum= 0.716 q= 44.2228
Vector: 13 F= 49.80 Cos= 0.028 Sum= 0.717 q= 21.6876
%Projmod-Wn> Eigenvector 14 Norm= 0.9999
Vector: 14 F= 51.83 Cos= 0.007 Sum= 0.717 q= 5.2434
Vector: 15 F= 56.55 Cos= 0.028 Sum= 0.718 q= 22.1393
Vector: 16 F= 58.30 Cos= -0.066 Sum= 0.722 q= -51.5544
Vector: 17 F= 62.12 Cos= -0.057 Sum= 0.725 q= -44.6492
Vector: 18 F= 64.14 Cos= -0.035 Sum= 0.726 q= -27.0094
Vector: 19 F= 68.15 Cos= -0.121 Sum= 0.741 q= -94.8737
Vector: 20 F= 70.60 Cos= 0.024 Sum= 0.742 q= 18.9327
Vector: 21 F= 74.12 Cos= -0.071 Sum= 0.747 q= -55.4834
Vector: 22 F= 77.14 Cos= 0.094 Sum= 0.755 q= 73.3088
Vector: 23 F= 78.66 Cos= 0.081 Sum= 0.762 q= 63.3671
Vector: 24 F= 81.22 Cos= -0.043 Sum= 0.764 q= -33.7927
Vector: 25 F= 83.10 Cos= -0.030 Sum= 0.765 q= -23.2989
Vector: 26 F= 86.22 Cos= 0.018 Sum= 0.765 q= 14.3518
Vector: 27 F= 89.21 Cos= -0.016 Sum= 0.765 q= -12.7752
Vector: 28 F= 90.19 Cos= 0.033 Sum= 0.766 q= 25.6084
Vector: 29 F= 91.88 Cos= 0.006 Sum= 0.767 q= 4.3329
Vector: 30 F= 95.88 Cos= 0.019 Sum= 0.767 q= 14.5926
Vector: 31 F= 100.24 Cos= -0.002 Sum= 0.767 q= -1.1745
Vector: 32 F= 100.73 Cos= -0.027 Sum= 0.768 q= -21.4620
Vector: 33 F= 104.22 Cos= 0.008 Sum= 0.768 q= 6.1921
Vector: 34 F= 106.10 Cos= -0.001 Sum= 0.768 q= -0.4716
Vector: 35 F= 110.31 Cos= 0.007 Sum= 0.768 q= 5.2363
Vector: 36 F= 113.16 Cos= -0.007 Sum= 0.768 q= -5.5916
Vector: 37 F= 114.51 Cos= -0.087 Sum= 0.775 q= -68.3585
Vector: 38 F= 116.75 Cos= 0.067 Sum= 0.780 q= 52.7225
Vector: 39 F= 118.11 Cos= -0.048 Sum= 0.782 q= -37.9076
Vector: 40 F= 119.10 Cos= 0.078 Sum= 0.788 q= 60.6929
Vector: 41 F= 125.42 Cos= -0.006 Sum= 0.788 q= -4.9421
Vector: 42 F= 126.91 Cos= -0.027 Sum= 0.789 q= -21.1274
Vector: 43 F= 128.39 Cos= -0.094 Sum= 0.798 q= -73.6313
Vector: 44 F= 131.70 Cos= 0.017 Sum= 0.798 q= 13.0926
Vector: 45 F= 135.67 Cos= 0.073 Sum= 0.804 q= 57.0764
Vector: 46 F= 136.79 Cos= -0.002 Sum= 0.804 q= -1.7556
Vector: 47 F= 139.06 Cos= -0.027 Sum= 0.804 q= -20.7768
Vector: 48 F= 145.08 Cos= 0.060 Sum= 0.808 q= 46.6883
Vector: 49 F= 147.33 Cos= -0.071 Sum= 0.813 q= -55.6802
Vector: 50 F= 147.93 Cos= -0.076 Sum= 0.819 q= -59.1040
Vector: 51 F= 150.11 Cos= -0.026 Sum= 0.819 q= -20.4130
Vector: 52 F= 151.83 Cos= -0.071 Sum= 0.824 q= -55.7618
Vector: 53 F= 154.83 Cos= 0.005 Sum= 0.824 q= 3.8800
Vector: 54 F= 156.00 Cos= 0.027 Sum= 0.825 q= 21.1736
%Projmod-Wn> Eigenvector 55 Norm= 1.0001
Vector: 55 F= 157.47 Cos= 0.032 Sum= 0.826 q= 25.1937
Vector: 56 F= 158.29 Cos= -0.040 Sum= 0.828 q= -31.3953
Vector: 57 F= 161.21 Cos= -0.055 Sum= 0.831 q= -42.8745
Vector: 58 F= 163.13 Cos= -0.057 Sum= 0.834 q= -44.7486
Vector: 59 F= 168.05 Cos= 0.069 Sum= 0.839 q= 53.6760
Vector: 60 F= 170.45 Cos= -0.021 Sum= 0.839 q= -16.2380
Vector: 61 F= 171.79 Cos= -0.013 Sum= 0.839 q= -10.1197
Vector: 62 F= 174.92 Cos= -0.023 Sum= 0.840 q= -18.1514
Vector: 63 F= 178.00 Cos= 0.001 Sum= 0.840 q= 0.8002
Vector: 64 F= 179.87 Cos= -0.042 Sum= 0.842 q= -33.0708
Vector: 65 F= 182.54 Cos= 0.050 Sum= 0.844 q= 38.9751
Vector: 66 F= 183.73 Cos= 0.034 Sum= 0.845 q= 26.8329
Vector: 67 F= 185.55 Cos= 0.022 Sum= 0.846 q= 17.0766
Vector: 68 F= 186.82 Cos= 0.004 Sum= 0.846 q= 3.3760
Vector: 69 F= 189.73 Cos= 0.031 Sum= 0.847 q= 23.9783
Vector: 70 F= 192.54 Cos= -0.037 Sum= 0.848 q= -29.2748
Vector: 71 F= 193.15 Cos= 0.000 Sum= 0.848 q= 0.1031
Vector: 72 F= 195.52 Cos= 0.043 Sum= 0.850 q= 33.7989
Vector: 73 F= 198.51 Cos= -0.029 Sum= 0.851 q= -22.5284
Vector: 74 F= 199.75 Cos= -0.033 Sum= 0.852 q= -26.1126
Vector: 75 F= 203.23 Cos= 0.029 Sum= 0.853 q= 22.3386
Vector: 76 F= 206.40 Cos= 0.005 Sum= 0.853 q= 3.5619
Vector: 77 F= 208.28 Cos= 0.045 Sum= 0.855 q= 35.3380
Vector: 78 F= 208.73 Cos= -0.011 Sum= 0.855 q= -8.6297
Vector: 79 F= 211.45 Cos= -0.011 Sum= 0.855 q= -8.2224
Vector: 80 F= 212.06 Cos= -0.027 Sum= 0.856 q= -20.9411
Vector: 81 F= 213.09 Cos= -0.059 Sum= 0.859 q= -45.8201
Vector: 82 F= 215.95 Cos= -0.046 Sum= 0.862 q= -36.0768
%Projmod-Wn> Eigenvector 83 Norm= 1.0001
Vector: 83 F= 216.49 Cos= -0.059 Sum= 0.865 q= -46.2993
Vector: 84 F= 220.01 Cos= -0.016 Sum= 0.865 q= -12.5606
%Projmod-Wn> Eigenvector 85 Norm= 1.0001
Vector: 85 F= 225.17 Cos= 0.052 Sum= 0.868 q= 40.7217
Vector: 86 F= 226.45 Cos= -0.007 Sum= 0.868 q= -5.6785
Vector: 87 F= 228.86 Cos= -0.020 Sum= 0.868 q= -15.6927
Vector: 88 F= 230.50 Cos= 0.013 Sum= 0.869 q= 10.0901
Vector: 89 F= 232.23 Cos= 0.038 Sum= 0.870 q= 29.8406
Vector: 90 F= 234.23 Cos= -0.019 Sum= 0.870 q= -14.9223
Vector: 91 F= 234.58 Cos= 0.014 Sum= 0.871 q= 11.1519
Vector: 92 F= 236.83 Cos= -0.002 Sum= 0.871 q= -1.6749
Vector: 93 F= 239.19 Cos= -0.015 Sum= 0.871 q= -11.3967
Vector: 94 F= 242.78 Cos= -0.027 Sum= 0.872 q= -20.8398
Vector: 95 F= 244.96 Cos= -0.050 Sum= 0.874 q= -39.2439
Vector: 96 F= 247.02 Cos= -0.017 Sum= 0.874 q= -13.4387
Vector: 97 F= 247.69 Cos= 0.031 Sum= 0.875 q= 24.1845
Vector: 98 F= 251.42 Cos= -0.024 Sum= 0.876 q= -18.8683
Vector: 99 F= 253.80 Cos= -0.009 Sum= 0.876 q= -6.6998
Vector: 100 F= 256.60 Cos= -0.011 Sum= 0.876 q= -8.5068
Vector: 101 F= 258.86 Cos= -0.038 Sum= 0.878 q= -30.0071
Vector: 102 F= 259.29 Cos= -0.015 Sum= 0.878 q= -11.5843
Vector: 103 F= 260.06 Cos= -0.018 Sum= 0.878 q= -14.2764
Vector: 104 F= 262.95 Cos= 0.015 Sum= 0.878 q= 11.9597
Vector: 105 F= 265.23 Cos= -0.001 Sum= 0.878 q= -1.1472
Vector: 106 F= 266.89 Cos= 0.012 Sum= 0.879 q= 9.5143
Projmod> Best zero-frequency found : 0.003433
Projmod> 6 frequencies less than: 0.003434
Projmod> Lowest non-zero frequency : 23.169715
Projmod> Best overlap with diff.vect. = -0.79 for mode 2 with F= 0.00 cm-1.
Projmod> 1-3-6-9-12-all-best contrb. = 0.618 0.683 0.719 0.745 0.763 0.879
Projmod> Normal end.
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2604281148222846743 7 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
2604281148222846743.eigenfacs
2604281148222846743.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2604281148222846743.eigenfacs
2604281148222846743.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2604281148222846743.eigenfacs
2604281148222846743.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2604281148222846743.eigenfacs
2604281148222846743.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2604281148222846743.eigenfacs
2604281148222846743.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2604281148222846743.eigenfacs
2604281148222846743.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2604281148222846743.eigenfacs
2604281148222846743.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2604281148222846743.eigenfacs
2604281148222846743.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2604281148222846743.eigenfacs
2604281148222846743.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2604281148222846743.eigenfacs
2604281148222846743.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2604281148222846743.eigenfacs
2604281148222846743.atom
making animated gifs
11 models are in 2604281148222846743.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604281148222846743.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604281148222846743.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=7 DQ=-100 157 7.983 27 1.489
MODEL 2 MODE=7 DQ=-80 157 7.688 33 1.549
MODEL 3 MODE=7 DQ=-60 157 7.436 35 1.483
MODEL 4 MODE=7 DQ=-40 157 7.226 37 1.479
MODEL 5 MODE=7 DQ=-20 157 7.058 39 1.562
MODEL 6 MODE=7 DQ=0 157 6.932 37 1.571
MODEL 7 MODE=7 DQ=20 157 6.852 33 1.507
MODEL 8 MODE=7 DQ=40 157 6.820 19 1.987
MODEL 9 MODE=7 DQ=60 157 6.841 16 1.945
MODEL 10 MODE=7 DQ=80 157 6.920 32 1.747
MODEL 11 MODE=7 DQ=100 157 7.062 29 1.759
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 2604281148222846743 8 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
2604281148222846743.eigenfacs
2604281148222846743.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2604281148222846743.eigenfacs
2604281148222846743.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2604281148222846743.eigenfacs
2604281148222846743.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2604281148222846743.eigenfacs
2604281148222846743.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2604281148222846743.eigenfacs
2604281148222846743.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2604281148222846743.eigenfacs
2604281148222846743.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2604281148222846743.eigenfacs
2604281148222846743.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2604281148222846743.eigenfacs
2604281148222846743.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2604281148222846743.eigenfacs
2604281148222846743.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2604281148222846743.eigenfacs
2604281148222846743.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2604281148222846743.eigenfacs
2604281148222846743.atom
making animated gifs
11 models are in 2604281148222846743.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
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making small animated gif 100x100
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11 models are in 2604281148222846743.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
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making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604281148222846743.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=8 DQ=-100 157 7.760 21 1.683
MODEL 2 MODE=8 DQ=-80 157 7.500 20 1.936
MODEL 3 MODE=8 DQ=-60 157 7.292 20 1.566
MODEL 4 MODE=8 DQ=-40 157 7.131 27 1.330
MODEL 5 MODE=8 DQ=-20 157 7.012 38 1.748
MODEL 6 MODE=8 DQ=0 157 6.932 37 1.571
MODEL 7 MODE=8 DQ=20 157 6.892 27 1.558
MODEL 8 MODE=8 DQ=40 157 6.894 37 1.561
MODEL 9 MODE=8 DQ=60 157 6.944 39 1.553
MODEL 10 MODE=8 DQ=80 157 7.049 38 1.644
MODEL 11 MODE=8 DQ=100 157 7.217 29 1.757
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 2604281148222846743 9 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
2604281148222846743.eigenfacs
2604281148222846743.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2604281148222846743.eigenfacs
2604281148222846743.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2604281148222846743.eigenfacs
2604281148222846743.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2604281148222846743.eigenfacs
2604281148222846743.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2604281148222846743.eigenfacs
2604281148222846743.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2604281148222846743.eigenfacs
2604281148222846743.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2604281148222846743.eigenfacs
2604281148222846743.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2604281148222846743.eigenfacs
2604281148222846743.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2604281148222846743.eigenfacs
2604281148222846743.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2604281148222846743.eigenfacs
2604281148222846743.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2604281148222846743.eigenfacs
2604281148222846743.atom
making animated gifs
11 models are in 2604281148222846743.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604281148222846743.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604281148222846743.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=9 DQ=-100 157 7.098 32 2.113
MODEL 2 MODE=9 DQ=-80 157 6.821 30 1.883
MODEL 3 MODE=9 DQ=-60 157 6.659 29 1.760
MODEL 4 MODE=9 DQ=-40 157 6.623 18 2.119
MODEL 5 MODE=9 DQ=-20 157 6.715 21 2.068
MODEL 6 MODE=9 DQ=0 157 6.932 37 1.571
MODEL 7 MODE=9 DQ=20 157 7.265 28 1.471
MODEL 8 MODE=9 DQ=40 157 7.699 21 1.747
MODEL 9 MODE=9 DQ=60 157 8.219 19 1.906
MODEL 10 MODE=9 DQ=80 157 8.813 12 2.138
MODEL 11 MODE=9 DQ=100 157 9.467 11 2.257
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 2604281148222846743 10 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
2604281148222846743.eigenfacs
2604281148222846743.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2604281148222846743.eigenfacs
2604281148222846743.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2604281148222846743.eigenfacs
2604281148222846743.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2604281148222846743.eigenfacs
2604281148222846743.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2604281148222846743.eigenfacs
2604281148222846743.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2604281148222846743.eigenfacs
2604281148222846743.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2604281148222846743.eigenfacs
2604281148222846743.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2604281148222846743.eigenfacs
2604281148222846743.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2604281148222846743.eigenfacs
2604281148222846743.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2604281148222846743.eigenfacs
2604281148222846743.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2604281148222846743.eigenfacs
2604281148222846743.atom
making animated gifs
11 models are in 2604281148222846743.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604281148222846743.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604281148222846743.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=10 DQ=-100 157 10.329 10 1.948
MODEL 2 MODE=10 DQ=-80 157 9.428 12 2.142
MODEL 3 MODE=10 DQ=-60 157 8.610 21 1.613
MODEL 4 MODE=10 DQ=-40 157 7.899 21 1.610
MODEL 5 MODE=10 DQ=-20 157 7.329 21 1.905
MODEL 6 MODE=10 DQ=0 157 6.932 37 1.571
MODEL 7 MODE=10 DQ=20 157 6.741 37 1.597
MODEL 8 MODE=10 DQ=40 157 6.771 27 1.987
MODEL 9 MODE=10 DQ=60 157 7.020 27 1.670
MODEL 10 MODE=10 DQ=80 157 7.467 22 2.017
MODEL 11 MODE=10 DQ=100 157 8.077 21 2.065
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 2604281148222846743 11 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
2604281148222846743.eigenfacs
2604281148222846743.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2604281148222846743.eigenfacs
2604281148222846743.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2604281148222846743.eigenfacs
2604281148222846743.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2604281148222846743.eigenfacs
2604281148222846743.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2604281148222846743.eigenfacs
2604281148222846743.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2604281148222846743.eigenfacs
2604281148222846743.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2604281148222846743.eigenfacs
2604281148222846743.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2604281148222846743.eigenfacs
2604281148222846743.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2604281148222846743.eigenfacs
2604281148222846743.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2604281148222846743.eigenfacs
2604281148222846743.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2604281148222846743.eigenfacs
2604281148222846743.atom
making animated gifs
11 models are in 2604281148222846743.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604281148222846743.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604281148222846743.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=11 DQ=-100 157 8.069 32 1.808
MODEL 2 MODE=11 DQ=-80 157 7.650 32 1.694
MODEL 3 MODE=11 DQ=-60 157 7.320 38 1.641
MODEL 4 MODE=11 DQ=-40 157 7.086 41 1.608
MODEL 5 MODE=11 DQ=-20 157 6.956 38 1.576
MODEL 6 MODE=11 DQ=0 157 6.932 37 1.571
MODEL 7 MODE=11 DQ=20 157 7.014 30 1.760
MODEL 8 MODE=11 DQ=40 157 7.198 35 1.681
MODEL 9 MODE=11 DQ=60 157 7.475 26 2.069
MODEL 10 MODE=11 DQ=80 157 7.837 21 1.937
MODEL 11 MODE=11 DQ=100 157 8.275 20 1.967
getting mode 12
running: ../../bin/get_modes.sh 2604281148222846743 12 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 12
calculating perturbed structure for DQ=-100
2604281148222846743.eigenfacs
2604281148222846743.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2604281148222846743.eigenfacs
2604281148222846743.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2604281148222846743.eigenfacs
2604281148222846743.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2604281148222846743.eigenfacs
2604281148222846743.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2604281148222846743.eigenfacs
2604281148222846743.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2604281148222846743.eigenfacs
2604281148222846743.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2604281148222846743.eigenfacs
2604281148222846743.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2604281148222846743.eigenfacs
2604281148222846743.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2604281148222846743.eigenfacs
2604281148222846743.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2604281148222846743.eigenfacs
2604281148222846743.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2604281148222846743.eigenfacs
2604281148222846743.atom
making animated gifs
11 models are in 2604281148222846743.12.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604281148222846743.12.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604281148222846743.12.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=12 DQ=-100 157 8.124 15 2.012
MODEL 2 MODE=12 DQ=-80 157 7.607 19 2.107
MODEL 3 MODE=12 DQ=-60 157 7.212 25 1.945
MODEL 4 MODE=12 DQ=-40 157 6.959 28 1.995
MODEL 5 MODE=12 DQ=-20 157 6.863 36 1.707
MODEL 6 MODE=12 DQ=0 157 6.932 37 1.571
MODEL 7 MODE=12 DQ=20 157 7.161 28 1.583
MODEL 8 MODE=12 DQ=40 157 7.534 38 1.452
MODEL 9 MODE=12 DQ=60 157 8.032 32 1.768
MODEL 10 MODE=12 DQ=80 157 8.633 24 1.735
MODEL 11 MODE=12 DQ=100 157 9.317 22 1.779
getting mode 13
running: ../../bin/get_modes.sh 2604281148222846743 13 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 13
calculating perturbed structure for DQ=-100
2604281148222846743.eigenfacs
2604281148222846743.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2604281148222846743.eigenfacs
2604281148222846743.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2604281148222846743.eigenfacs
2604281148222846743.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2604281148222846743.eigenfacs
2604281148222846743.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2604281148222846743.eigenfacs
2604281148222846743.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2604281148222846743.eigenfacs
2604281148222846743.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2604281148222846743.eigenfacs
2604281148222846743.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2604281148222846743.eigenfacs
2604281148222846743.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2604281148222846743.eigenfacs
2604281148222846743.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2604281148222846743.eigenfacs
2604281148222846743.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2604281148222846743.eigenfacs
2604281148222846743.atom
making animated gifs
11 models are in 2604281148222846743.13.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604281148222846743.13.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604281148222846743.13.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=13 DQ=-100 157 8.706 28 1.605
MODEL 2 MODE=13 DQ=-80 157 8.174 24 1.782
MODEL 3 MODE=13 DQ=-60 157 7.717 36 1.431
MODEL 4 MODE=13 DQ=-40 157 7.349 36 1.245
MODEL 5 MODE=13 DQ=-20 157 7.083 29 1.681
MODEL 6 MODE=13 DQ=0 157 6.932 37 1.571
MODEL 7 MODE=13 DQ=20 157 6.904 34 1.565
MODEL 8 MODE=13 DQ=40 157 7.000 34 1.679
MODEL 9 MODE=13 DQ=60 157 7.215 30 1.805
MODEL 10 MODE=13 DQ=80 157 7.540 20 1.789
MODEL 11 MODE=13 DQ=100 157 7.960 18 1.808
getting mode 14
running: ../../bin/get_modes.sh 2604281148222846743 14 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 14
calculating perturbed structure for DQ=-100
2604281148222846743.eigenfacs
2604281148222846743.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2604281148222846743.eigenfacs
2604281148222846743.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2604281148222846743.eigenfacs
2604281148222846743.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
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2604281148222846743.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2604281148222846743.eigenfacs
2604281148222846743.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
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2604281148222846743.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2604281148222846743.eigenfacs
2604281148222846743.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2604281148222846743.eigenfacs
2604281148222846743.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2604281148222846743.eigenfacs
2604281148222846743.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
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calculating perturbed structure for DQ=100
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2604281148222846743.atom
making animated gifs
11 models are in 2604281148222846743.14.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604281148222846743.14.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604281148222846743.14.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=14 DQ=-100 157 7.854 22 1.761
MODEL 2 MODE=14 DQ=-80 157 7.537 28 1.860
MODEL 3 MODE=14 DQ=-60 157 7.281 33 1.840
MODEL 4 MODE=14 DQ=-40 157 7.091 35 1.705
MODEL 5 MODE=14 DQ=-20 157 6.974 29 1.379
MODEL 6 MODE=14 DQ=0 157 6.932 37 1.571
MODEL 7 MODE=14 DQ=20 157 6.969 40 1.722
MODEL 8 MODE=14 DQ=40 157 7.082 27 1.735
MODEL 9 MODE=14 DQ=60 157 7.268 27 1.749
MODEL 10 MODE=14 DQ=80 157 7.522 39 1.701
MODEL 11 MODE=14 DQ=100 157 7.836 28 1.954
getting mode 15
running: ../../bin/get_modes.sh 2604281148222846743 15 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 15
calculating perturbed structure for DQ=-100
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2604281148222846743.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
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calculating perturbed structure for DQ=-60
2604281148222846743.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=-40
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calculating perturbed structure for DQ=0
2604281148222846743.eigenfacs
2604281148222846743.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2604281148222846743.eigenfacs
2604281148222846743.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2604281148222846743.eigenfacs
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2604281148222846743.eigenfacs
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604281148222846743.15.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=15 DQ=-100 157 8.242 25 2.174
MODEL 2 MODE=15 DQ=-80 157 7.677 29 2.125
MODEL 3 MODE=15 DQ=-60 157 7.242 28 1.761
MODEL 4 MODE=15 DQ=-40 157 6.962 18 1.747
MODEL 5 MODE=15 DQ=-20 157 6.856 34 1.728
MODEL 6 MODE=15 DQ=0 157 6.932 37 1.571
MODEL 7 MODE=15 DQ=20 157 7.185 28 1.575
MODEL 8 MODE=15 DQ=40 157 7.597 31 1.488
MODEL 9 MODE=15 DQ=60 157 8.143 29 1.546
MODEL 10 MODE=15 DQ=80 157 8.799 28 1.713
MODEL 11 MODE=15 DQ=100 157 9.543 25 1.679
getting mode 16
running: ../../bin/get_modes.sh 2604281148222846743 16 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 16
calculating perturbed structure for DQ=-100
2604281148222846743.eigenfacs
2604281148222846743.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2604281148222846743.eigenfacs
2604281148222846743.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2604281148222846743.eigenfacs
2604281148222846743.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2604281148222846743.eigenfacs
2604281148222846743.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2604281148222846743.eigenfacs
2604281148222846743.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2604281148222846743.eigenfacs
2604281148222846743.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2604281148222846743.eigenfacs
2604281148222846743.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2604281148222846743.eigenfacs
2604281148222846743.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2604281148222846743.eigenfacs
2604281148222846743.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2604281148222846743.eigenfacs
2604281148222846743.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2604281148222846743.eigenfacs
2604281148222846743.atom
making animated gifs
11 models are in 2604281148222846743.16.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604281148222846743.16.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604281148222846743.16.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=16 DQ=-100 157 8.183 18 1.923
MODEL 2 MODE=16 DQ=-80 157 7.745 18 2.021
MODEL 3 MODE=16 DQ=-60 157 7.391 19 1.778
MODEL 4 MODE=16 DQ=-40 157 7.130 22 1.863
MODEL 5 MODE=16 DQ=-20 157 6.976 17 1.935
MODEL 6 MODE=16 DQ=0 157 6.932 37 1.571
MODEL 7 MODE=16 DQ=20 157 7.003 39 1.424
MODEL 8 MODE=16 DQ=40 157 7.184 35 1.391
MODEL 9 MODE=16 DQ=60 157 7.468 31 1.640
MODEL 10 MODE=16 DQ=80 157 7.844 29 1.575
MODEL 11 MODE=16 DQ=100 157 8.299 26 1.635
2604281148222846743.10.pdb
2604281148222846743.11.pdb
2604281148222846743.12.pdb
2604281148222846743.13.pdb
2604281148222846743.14.pdb
2604281148222846743.15.pdb
2604281148222846743.16.pdb
2604281148222846743.7.pdb
2604281148222846743.8.pdb
2604281148222846743.9.pdb
STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 0m1.360s
user 0m1.346s
sys 0m0.013s
rm: cannot remove '2604281148222846743.sdijf': No such file or directory
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