*** open_cutoff8 ***
Output from eigenvector calculation:
STDOUT:
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 2604281510402900129.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 2604281510402900129.atom to be opened.
Openam> File opened: 2604281510402900129.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 400
First residue number = 1
Last residue number = 429
Number of atoms found = 400
Mean number per residue = 1.0
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 36.944335 +/- 13.167314 From: 4.195000 To: 65.719000
= 42.308003 +/- 10.661547 From: 14.831000 To: 63.680000
= 15.579035 +/- 13.343983 From: -14.909000 To: 42.062000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijf
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 2.6549 % Filled.
Pdbmat> 19131 non-zero elements.
Pdbmat> 1859 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 9.29 +/- 2.85
Maximum number = 15
Minimum number = 2
Pdbmat> Matrix trace = 37180.0
Pdbmat> Larger element = 69.4388
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
using diagstd (there are 400 atoms in your structure)
Diagstd> Version 1.05, August 2004.
Diagstd> Matrix to be read from file: pdbmat.sdijf
Diagstd> Lecture de la matrice -Format CERFACS-
Diagstd> Matrix dimension (Nord) = 1200
Diagstd> Number of non-zero elements 19131
Diagstd> Nb of elements found twice: 0
Diagstd> Nb of elements > 1E+10 : 0
Diagstd> Matrix trace: 37180.0000012
%Diagstd-Wn: Nb on non-zero elements there: 1200
Openam> file on opening on unit 11:
pdbmat.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 1200 eigenvectors are about to be computed.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 37180.0000012
Diagstd> Eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.0004483 0.0022927 0.0036600 0.0089127
0.0215735 0.0450746 0.0530059 0.0694786 0.0807740
0.0989218 0.1163183 0.1358562 0.1565107 0.1611534
0.1799319 0.2034572 0.2216069 0.2562516 0.2616814
0.2832674 0.2984923 0.3335355 0.3777668 0.3929497
0.4014472 0.4102663 0.4461943 0.4539591 0.4575733
0.4813426 0.5075210 0.5325748 0.5532346 0.5945212
0.6185257 0.6424636 0.6613388 0.6809927 0.7187462
0.7388517 0.7760100 0.7827980 0.8011107 0.8285375
0.8403195 0.8749377 0.8865954 0.9005296 0.9299326
0.9637738 0.9815305 1.0166791 1.0285163 1.0473120
1.0953591 1.1582302 1.1713334 1.1780712 1.2056449
1.2130502 1.2564880 1.2931827 1.3218246 1.3539731
1.3832851 1.3927510 1.4492810 1.4624999 1.4935843
1.5034502 1.5903086 1.5947549 1.6487116 1.6686107
1.6806525 1.7441951 1.7528533 1.7596984 1.7916899
1.8220830 1.8540308 1.8808929 1.9188586 1.9270098
1.9493058 1.9585806 1.9934308 2.0239209 2.0483962
2.0624768 2.1134510 2.1678183 2.2099328 2.2548758
2.2840662 2.3143091 2.3869521 2.3902305 2.3970101
2.4540373 2.5049722 2.5400074 2.5831394 2.5989148
2.6413765 2.6917371 2.7249202 2.7643952 2.8240062
2.8810672 2.9026073 2.9296291 2.9579493 2.9947306
3.0786686 3.1104442 3.1232513 3.1541644 3.1752365
3.2245609 3.2647854 3.2807802 3.3244184 3.3318293
3.3703297 3.4399312 3.4907373 3.5488448 3.5898618
3.6336541 3.6447367 3.7197618 3.7474807 3.7861425
3.8772371 3.9168272 3.9896189 4.0004104 4.0141958
4.0916033 4.1267885 4.1530585 4.1949099 4.2436964
4.2659539 4.2912432 4.3399043 4.4217709 4.4450079
4.5212546 4.5536004 4.5738690 4.6173574 4.6618510
4.7530908 4.7989919 4.8232398 4.8984947 4.9497736
4.9797562 5.0329656 5.0777840 5.1523976 5.1670680
5.2007328 5.2645808 5.3005680 5.3476793 5.4039661
5.4783505 5.4852191 5.5908521 5.6628853 5.7078534
5.7339756 5.8108449 5.8756482 5.9071568 5.9180974
6.0381271 6.0998496 6.1547669 6.1843603 6.2407189
6.2863288 6.3179663 6.3377156 6.3818043 6.4107874
6.4501176 6.4971986 6.5636462 6.6129021 6.6315752
6.6903558 6.7538545 6.7803082 6.8040314 6.8889021
6.9403862 6.9988280 7.0352623 7.0537915 7.0873603
7.1593957 7.1864188 7.2619244 7.2781715 7.3282801
7.3739085 7.4011632 7.4551372 7.5188875 7.5491146
7.5849001 7.6171837 7.6888940 7.7339288 7.7702400
7.7785040 7.7966553 7.8349956 7.8540164 7.8821133
7.9667482 8.0007163 8.0110170 8.0992852 8.1079856
8.1778875 8.2455698 8.3671228 8.4042575 8.4123858
8.4306453 8.5251003 8.5759660 8.5995740 8.6589895
8.6693989 8.7271023 8.7574586 8.7851854 8.8474783
8.9128611 8.9625983 9.0169634 9.0664526 9.1076102
9.1707664 9.2270194 9.2958282 9.3043093 9.4301580
9.5145230 9.5646716 9.5827692 9.6073694 9.6430937
9.6863606 9.7673353 9.7858372 9.8236394 9.9341731
9.9811073 10.0140496 10.0992423 10.1677128 10.1820684
10.2057351 10.2496885 10.2726349 10.3477824 10.4730244
10.4802473 10.5635298 10.6119971 10.6812111 10.7198635
10.7784873 10.8583030 10.9193611 10.9807962 11.0074817
11.0288233 11.1269542 11.1780197 11.2715139 11.2926526
11.4011219 11.4577408 11.4961765 11.5807741 11.5956054
11.6581823 11.7245223 11.7962866 11.8792871 11.9118383
11.9181535 11.9727733 12.0248391 12.0803858 12.1927083
12.2446299 12.2588143 12.3117411 12.3650693 12.3913547
12.4178750 12.5250517 12.5482375 12.5804149 12.6573381
12.7012633 12.7788349 12.8071649 12.8857148 12.9395620
12.9729860 13.0029384 13.1013760 13.1857224 13.2160279
13.2462356 13.2985393 13.3207793 13.3586187 13.4386941
13.5031734 13.5227594 13.5334112 13.6172864 13.6616405
13.6941419 13.7624765 13.8233521 13.8788167 13.8986051
13.9594423 13.9999048 14.1043500 14.1263547 14.2089422
14.2753990 14.3004268 14.3645867 14.4414448 14.4742710
14.5038467 14.5448341 14.5793763 14.6434462 14.6867876
14.7790810 14.8145913 14.8670506 14.9577497 14.9869514
15.0321152 15.0590830 15.1093380 15.1588641 15.1772390
15.2993954 15.3182745 15.4323204 15.4949945 15.5193799
15.6650289 15.6675949 15.7176023 15.8377123 15.8863077
16.0138267 16.0312733 16.0479894 16.1389381 16.1855932
16.2343238 16.2626253 16.4075714 16.5035716 16.5398594
16.5660798 16.6710284 16.6848380 16.7105058 16.7913698
16.8194332 16.9215731 17.1523699 17.1959497 17.2361727
17.2405440 17.3544324 17.4231413 17.4741599 17.4985655
17.5889914 17.6544096 17.7065347 17.8078610 17.8340508
17.8719955 17.9283919 17.9925949 18.0873219 18.1232666
18.1984337 18.2736770 18.2920348 18.3768525 18.5086506
18.5097059 18.5931265 18.6824504 18.7085376 18.7987005
18.8088233 18.8937362 18.9470735 19.0307513 19.0416925
19.1160621 19.1440321 19.1641785 19.2228260 19.2660609
19.3131478 19.3867738 19.5007490 19.5742001 19.6073920
19.6498263 19.7106062 19.7250856 19.7406140 19.8322550
19.8788309 19.9138524 19.9497366 19.9932680 20.0782510
20.1036542 20.1983189 20.2342329 20.2761611 20.3906594
20.4416071 20.5120667 20.5475478 20.6072872 20.6357427
20.7062981 20.7266970 20.7726526 20.8087401 20.8343707
20.9005234 20.9262436 20.9338601 21.0253114 21.0605879
21.1318944 21.1503561 21.2337622 21.3102981 21.4145644
21.4866561 21.5403988 21.5536338 21.6024798 21.6724030
21.6802110 21.8071131 21.8883294 21.9277371 21.9725388
22.0133773 22.0235846 22.0789543 22.1353735 22.1842988
22.2719582 22.2973965 22.3920663 22.4195728 22.4703672
22.5437983 22.5860221 22.6679208 22.6953074 22.7132425
22.7430308 22.8376526 22.8842373 22.9092844 22.9446847
22.9788500 23.0000676 23.1051326 23.1755089 23.2180806
23.2703245 23.3124257 23.3244449 23.3713614 23.4819627
23.5456865 23.6076290 23.6215867 23.6857088 23.7313483
23.7695960 23.8013360 23.8600156 23.9266303 23.9530908
23.9813446 24.0147860 24.0481603 24.0897473 24.1829687
24.1993991 24.2232876 24.2837901 24.3758304 24.4065717
24.4529683 24.4839602 24.5311249 24.5919074 24.6126527
24.6472786 24.6897770 24.7527895 24.7916663 24.8489661
24.9023506 24.9470870 25.1023670 25.1539027 25.1760857
25.2169424 25.2889712 25.2950546 25.3726278 25.3980160
25.4388254 25.4931332 25.5059756 25.5284916 25.6291949
25.7165831 25.7455986 25.7866225 25.8421723 25.8988907
25.9864045 26.0266750 26.0556868 26.0909837 26.1415791
26.1951883 26.2017922 26.2740549 26.2881899 26.3308299
26.3852077 26.4672277 26.5051043 26.5616111 26.6538381
26.7071740 26.7154551 26.7874281 26.8516780 26.8712663
26.9397168 26.9545716 27.0361828 27.0689200 27.1519150
27.1621241 27.2411469 27.3212819 27.3641042 27.3842550
27.4210915 27.4607132 27.5491719 27.5830984 27.6331629
27.6941039 27.7146140 27.7711262 27.7956117 27.8366562
27.9066662 27.9633794 28.0447930 28.0816838 28.1155219
28.1529401 28.2069407 28.2597748 28.2747823 28.3365914
28.3694813 28.4372033 28.4788742 28.5173225 28.5679697
28.6169668 28.6681172 28.7675036 28.7732228 28.8725651
28.8985409 28.9619087 29.0055912 29.0667279 29.1191452
29.1787140 29.1893469 29.2353102 29.2936626 29.3496896
29.3648021 29.4414982 29.5080208 29.5653175 29.6387899
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680.6585166 681.1476039 681.2638607 682.1007430 682.9158039
683.9040581 685.2289135 685.6959126 685.8953578 686.2308948
686.5710740 687.1459660 688.0443736 688.4795440 688.7533896
689.4073646 690.5936307 690.9529764 692.0233441 692.4826070
693.3290321 694.2621175 694.7917642 695.3396696 695.6738278
696.1819653 696.5881608 697.5470510 698.0541155 698.4710953
699.1383594 699.7310869 700.2972617 700.7326167 701.0314975
702.0372742 703.0923593 704.1722516 704.6372883 705.1474314
705.9487337 706.3972369 707.7380918 707.9186639 708.7908094
709.2124589 710.1803421 710.7748714 711.4519415 711.6843151
712.4507268 713.4926846 713.9601718 714.7962838 715.2512168
715.6071120 716.3907854 717.0946097 717.3673656 718.1647608
719.1228951 720.2194122 720.8117802 721.6493534 722.0021094
722.2543411 722.5391862 723.4155694 724.1350524 725.1857422
725.7920050 727.1017634 727.2715603 728.3212999 728.7629157
729.3979987 729.8268493 730.6842755 731.1675196 731.9691794
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769.7545857 770.5650945 771.0046325 771.0378935 771.5539685
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881.1013626 881.7798429 883.0556132 883.6568229 884.9336435
887.4877660 888.5997762 888.8267141 889.9941173 890.4829220
893.1785843 894.7231828 895.0468200 895.9682822 897.4338279
897.5924044 898.8695205 899.7182987 902.3751882 903.8074070
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914.9891045 916.8274626 918.3241007 919.9984933 921.6824318
922.1194957 922.9808219 924.4134418 925.7284452 927.8921647
928.5938690 929.9110698 930.6470994 932.0207314 932.9312593
933.6898124 934.0840450 934.6252375 937.4913864 939.3555509
940.1516039 941.5700506 942.9202012 943.6385440 946.1620115
946.5508319 946.9100207 948.9942175 950.1592473 951.6368628
952.2980363 953.8883447 955.4211770 957.0481657 958.2957132
958.6463020 960.5260262 961.8364167 963.0314518 964.4230994
965.4570992 966.0907063 966.5124708 969.1655278 972.3545530
974.0378691 975.0260700 976.1792667 978.4084892 978.9501936
979.6026786 981.7059187 982.7575262 984.7874699 987.3732422
988.2514070 989.9562091 990.8955867 991.7644042 993.5069270
994.8084703 995.7566429 999.9011396 1001.0599546 1002.0467177
1003.0825672 1005.2842157 1007.3423570 1008.5192960 1010.6434647
1012.8888531 1015.2189465 1016.7983846 1018.9109627 1020.5747575
1022.6146559 1024.7778230 1030.2678236 1033.9479480 1036.2986159
1043.6562879 1046.1109143 1048.1105860 1057.4864810 1065.4023083
1069.0038837 1074.0241778 1075.4474737 1080.6185884 1093.5546529
Diagstd> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2604281510402900129.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2604281510402900129.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 2604281510402900129.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2604281510402900129.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 400
First residue number = 1
Last residue number = 429
Number of atoms found = 400
Mean number per residue = 1.0
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8011
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.744
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.753
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.760
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.792
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.822
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.854
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.881
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.919
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.927
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.949
%Rdmodfacs-Wn> More than 106 vectors in file.
Bfactors> 106 vectors, 1200 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 21 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.000448
Bfactors> 85 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= 0.073 for 400 C-alpha atoms.
Bfactors> = 128.464 +/- ******
Bfactors> = 19.268 +/- 6.95
Bfactors> Shiftng-fct= -109.196
Bfactors> Scaling-fct= 0.005
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2604281510402900129.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2604281510402900129.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.3839E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4126E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4195E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4200E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4226E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4247E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4302E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4307E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4314E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4321E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4347E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4347E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4355E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4367E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4372E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4388E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4525E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4566E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4790E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 2.299
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 5.199
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 6.569
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 10.25
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 37.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 40.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 42.96
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 43.60
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 48.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 51.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 54.97
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 55.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 57.80
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 59.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 62.71
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 68.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 68.80
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 69.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 72.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 73.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 73.45
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 75.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 77.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 79.25
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 80.76
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 83.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 85.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 87.04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 88.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 89.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 92.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 93.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 95.65
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 96.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 97.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 98.84
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 99.54
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 101.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 102.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 103.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 104.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 106.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 107.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 109.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 110.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 111.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 113.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 116.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 117.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 117.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 119.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 119.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 121.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 123.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 124.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 126.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 127.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 128.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 130.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 131.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 132.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 133.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 136.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 137.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 139.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 140.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 140.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 143.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 143.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 144.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 145.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 146.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 147.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 148.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 150.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 150.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 151.6
%Rdmodfacs-Err> More than 106 vectors in file.
Chkmod> 106 vectors, 1200 coordinates in file.
Chkmod> That is: 400 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector 20 is: 1.0001 (instead of 1.0000).
%Chkmod-Wn> Norm of vector 22 is: 1.0001 (instead of 1.0000).
%Chkmod-Wn> Norm of vector 24 is: 0.9999 (instead of 1.0000).
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.0135
0.0034 0.0124
0.0034 0.0396
0.0034 0.0167
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0.0034 0.3084
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0.0035 0.0375
0.0035 0.0557
0.0035 0.0319
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5.1994 0.0646
6.5693 0.0395
10.2514 0.0117
15.9489 0.0604
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25.0000 0.2862
28.6222 0.2583
30.8612 0.0499
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37.0311 0.3988
40.0301 0.3579
42.9570 0.0911
43.5973 0.5126
46.0566 0.3889
48.9845 0.6025
51.1165 0.2858
54.9732 0.0290
55.5493 0.3608
57.7963 0.4651
59.3265 0.2090
62.7082 0.0700
66.7433 0.3023
68.0640 0.3304
68.7963 0.4414
69.5548 0.0457
72.5340 0.4005
73.1652 0.2509
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75.3329 0.2636
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80.7640 0.3141
83.7245 0.2844
85.3978 0.2195
87.0389 0.3595
88.3031 0.4201
89.6087 0.4619
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93.3404 0.3693
95.6550 0.4152
96.0732 0.2608
97.1896 0.4544
98.8378 0.3396
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101.5678 0.3168
102.2446 0.3070
103.0430 0.4329
104.7116 0.4473
106.6032 0.3642
107.5776 0.2737
109.5058 0.4164
110.1500 0.5287
111.1092 0.3292
113.6276 0.4170
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119.5934 0.3719
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123.4741 0.4014
124.8511 0.2009
126.3531 0.4931
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139.4399 0.5283
140.2829 0.2930
140.7863 0.4953
143.4002 0.2866
143.7698 0.4793
144.0565 0.5228
145.3602 0.4542
146.5719 0.4671
147.8535 0.3500
148.9262 0.3593
150.4230 0.3851
150.7362 0.3586
151.5942 0.3857
Project conformational change on normal modes:
Projmod> Version 1.36, April 2003.
Projmod> Projection of a difference vector on a set of eigenvectors.
Getnam> CERFACS file with the eigenvectors ?
Getnam> 2604281510402900129.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2604281510402900129.eigenfacs
Getnam> Pdb file with the reference structure ?
Getnam> 2604281510402900129.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2604281510402900129.atom
Getnam> Pdb file with the other conformer ?
Getnam> 2604281510402900129.atom2
Openam> file on opening on unit 12:
2604281510402900129.atom2
Getrep> Are the masses given in the pdb file ? (y/n)
Getrep> F
Projmod> All masses will all be assumed to be of 1.
Getrep> Displacement along one mode ? (y/n)
Getrep> F
Openam> file on opening on unit 13:
projmod.res
Openam> file on opening on unit 14:
dr.res
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.3839E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4126E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4195E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4200E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4226E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4247E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4302E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4307E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4314E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4321E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4347E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4347E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4355E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4367E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4372E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4388E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4396E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4412E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4525E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4566E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4790E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 2.299
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 5.199
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 6.569
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 10.25
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 15.95
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 23.05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 25.00
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 28.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 30.86
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 34.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 37.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 40.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 42.96
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 43.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 46.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 48.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 51.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 54.97
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 55.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 57.80
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 59.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 62.71
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 66.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 68.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 68.80
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 69.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 72.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 73.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 73.45
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 75.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 77.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 79.25
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 80.76
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 83.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 85.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 87.04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 88.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 89.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 92.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 93.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 95.65
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 96.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 97.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 98.84
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 99.54
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 101.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 102.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 103.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 104.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 106.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 107.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 109.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 110.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 111.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 113.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 116.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 117.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 117.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 119.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 119.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 121.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 123.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 124.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 126.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 127.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 128.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 130.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 131.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 132.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 133.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 136.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 137.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 139.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 140.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 140.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 143.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 143.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 144.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 145.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 146.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 147.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 148.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 150.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 150.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 151.6
%Rdmodfacs-Err> More than 106 vectors in file.
Projmod> 106 vectors, 1200 coordinates in file.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 400
First residue number = 1
Last residue number = 429
Number of atoms found = 400
Mean number per residue = 1.0
Projmod> Cartesian (eigen)vectors will be studied.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 400
First residue number = 1
Last residue number = 429
Number of atoms found = 400
Mean number per residue = 1.0
Projmod> File dr.res: displacement=f(atom number).
Projmod> 400 atoms are considered.
Projmod> Atomic r.m.s. displacements= 2.32
Projmod> Atomic average masses = 1.00 +/- 0.00
Projmod> File projmod.res: dr.vector=f(fqcy), and cumulative square sum.
Vector: 1 F= 0.00 Cos= -0.084 Sum= 0.007 q= -3.8939
Vector: 2 F= 0.00 Cos= -0.068 Sum= 0.012 q= -3.1444
Vector: 3 F= 0.00 Cos= -0.054 Sum= 0.015 q= -2.5083
Vector: 4 F= 0.00 Cos= -0.047 Sum= 0.017 q= -2.1698
Vector: 5 F= 0.00 Cos= 0.020 Sum= 0.017 q= 0.9487
Vector: 6 F= 0.00 Cos= -0.091 Sum= 0.025 q= -4.2259
Vector: 7 F= 0.00 Cos= 0.026 Sum= 0.026 q= 1.1897
Vector: 8 F= 0.00 Cos= -0.202 Sum= 0.067 q= -9.3622
Vector: 9 F= 0.00 Cos= 0.203 Sum= 0.108 q= 9.4283
Vector: 10 F= 0.00 Cos= 0.061 Sum= 0.111 q= 2.8118
Vector: 11 F= 0.00 Cos= 0.029 Sum= 0.112 q= 1.3275
Vector: 12 F= 0.00 Cos= 0.011 Sum= 0.112 q= 0.5298
Vector: 13 F= 0.00 Cos= 0.104 Sum= 0.123 q= 4.8498
Vector: 14 F= 0.00 Cos= 0.102 Sum= 0.134 q= 4.7421
Vector: 15 F= 0.00 Cos= -0.003 Sum= 0.134 q= -0.1487
Vector: 16 F= 0.00 Cos= 0.035 Sum= 0.135 q= 1.6447
Vector: 17 F= 0.00 Cos= 0.037 Sum= 0.136 q= 1.7154
Vector: 18 F= 0.00 Cos= -0.128 Sum= 0.153 q= -5.9421
Vector: 19 F= 0.00 Cos= -0.083 Sum= 0.160 q= -3.8530
%Projmod-Wn> Eigenvector 20 Norm= 1.0001
Vector: 20 F= 0.00 Cos= 0.116 Sum= 0.173 q= 5.3746
Vector: 21 F= 0.00 Cos= -0.171 Sum= 0.202 q= -7.9312
%Projmod-Wn> Eigenvector 22 Norm= 1.0001
Vector: 22 F= 2.30 Cos= -0.137 Sum= 0.221 q= -6.3426
Vector: 23 F= 5.20 Cos= 0.020 Sum= 0.221 q= 0.9221
%Projmod-Wn> Eigenvector 24 Norm= 0.9999
Vector: 24 F= 6.57 Cos= 0.019 Sum= 0.222 q= 0.8859
Vector: 25 F= 10.25 Cos= -0.075 Sum= 0.227 q= -3.5021
Vector: 26 F= 15.95 Cos= 0.120 Sum= 0.241 q= 5.5537
Vector: 27 F= 23.05 Cos= -0.049 Sum= 0.244 q= -2.2935
Vector: 28 F= 25.00 Cos= 0.349 Sum= 0.366 q= 16.2218
Vector: 29 F= 28.62 Cos= -0.387 Sum= 0.516 q= -17.9776
Vector: 30 F= 30.86 Cos= -0.221 Sum= 0.565 q= -10.2787
Vector: 31 F= 34.15 Cos= -0.110 Sum= 0.577 q= -5.0998
Vector: 32 F= 37.03 Cos= 0.120 Sum= 0.591 q= 5.5821
Vector: 33 F= 40.03 Cos= -0.054 Sum= 0.594 q= -2.4987
Vector: 34 F= 42.96 Cos= -0.027 Sum= 0.595 q= -1.2769
Vector: 35 F= 43.60 Cos= 0.070 Sum= 0.599 q= 3.2391
Vector: 36 F= 46.06 Cos= 0.036 Sum= 0.601 q= 1.6628
Vector: 37 F= 48.98 Cos= 0.073 Sum= 0.606 q= 3.4059
Vector: 38 F= 51.12 Cos= 0.089 Sum= 0.614 q= 4.1320
Vector: 39 F= 54.97 Cos= 0.016 Sum= 0.614 q= 0.7310
Vector: 40 F= 55.55 Cos= 0.142 Sum= 0.635 q= 6.6101
Vector: 41 F= 57.80 Cos= -0.124 Sum= 0.650 q= -5.7842
Vector: 42 F= 59.33 Cos= 0.017 Sum= 0.650 q= 0.7735
Vector: 43 F= 62.71 Cos= 0.085 Sum= 0.657 q= 3.9261
Vector: 44 F= 66.74 Cos= 0.001 Sum= 0.657 q= 0.0375
Vector: 45 F= 68.06 Cos= -0.039 Sum= 0.659 q= -1.8129
Vector: 46 F= 68.80 Cos= 0.038 Sum= 0.660 q= 1.7697
Vector: 47 F= 69.55 Cos= -0.023 Sum= 0.661 q= -1.0852
Vector: 48 F= 72.53 Cos= 0.084 Sum= 0.668 q= 3.9153
Vector: 49 F= 73.17 Cos= 0.027 Sum= 0.669 q= 1.2360
Vector: 50 F= 73.45 Cos= 0.024 Sum= 0.669 q= 1.1162
Vector: 51 F= 75.33 Cos= 0.064 Sum= 0.674 q= 2.9915
Vector: 52 F= 77.36 Cos= 0.083 Sum= 0.680 q= 3.8371
Vector: 53 F= 79.25 Cos= 0.050 Sum= 0.683 q= 2.3419
Vector: 54 F= 80.76 Cos= -0.021 Sum= 0.683 q= -0.9529
Vector: 55 F= 83.72 Cos= 0.078 Sum= 0.689 q= 3.6224
Vector: 56 F= 85.40 Cos= -0.060 Sum= 0.693 q= -2.7775
Vector: 57 F= 87.04 Cos= -0.065 Sum= 0.697 q= -3.0232
Vector: 58 F= 88.30 Cos= 0.001 Sum= 0.697 q= 0.0581
Vector: 59 F= 89.61 Cos= -0.065 Sum= 0.701 q= -3.0233
Vector: 60 F= 92.06 Cos= -0.048 Sum= 0.704 q= -2.2226
Vector: 61 F= 93.34 Cos= 0.051 Sum= 0.706 q= 2.3585
Vector: 62 F= 95.65 Cos= -0.032 Sum= 0.707 q= -1.5032
Vector: 63 F= 96.07 Cos= 0.028 Sum= 0.708 q= 1.3058
Vector: 64 F= 97.19 Cos= 0.027 Sum= 0.709 q= 1.2508
Vector: 65 F= 98.84 Cos= -0.051 Sum= 0.711 q= -2.3600
Vector: 66 F= 99.54 Cos= 0.001 Sum= 0.711 q= 0.0291
Vector: 67 F= 101.57 Cos= -0.029 Sum= 0.712 q= -1.3262
Vector: 68 F= 102.24 Cos= 0.112 Sum= 0.725 q= 5.1965
Vector: 69 F= 103.04 Cos= 0.071 Sum= 0.730 q= 3.2778
Vector: 70 F= 104.71 Cos= 0.075 Sum= 0.735 q= 3.4999
Vector: 71 F= 106.60 Cos= -0.034 Sum= 0.737 q= -1.5632
Vector: 72 F= 107.58 Cos= -0.043 Sum= 0.738 q= -1.9897
Vector: 73 F= 109.51 Cos= 0.009 Sum= 0.738 q= 0.4266
Vector: 74 F= 110.15 Cos= -0.039 Sum= 0.740 q= -1.8182
Vector: 75 F= 111.11 Cos= -0.013 Sum= 0.740 q= -0.5988
Vector: 76 F= 113.63 Cos= 0.137 Sum= 0.759 q= 6.3670
Vector: 77 F= 116.85 Cos= 0.075 Sum= 0.765 q= 3.4801
Vector: 78 F= 117.50 Cos= -0.093 Sum= 0.773 q= -4.3057
Vector: 79 F= 117.86 Cos= -0.059 Sum= 0.777 q= -2.7214
Vector: 80 F= 119.25 Cos= -0.021 Sum= 0.777 q= -0.9711
Vector: 81 F= 119.59 Cos= -0.050 Sum= 0.780 q= -2.3446
Vector: 82 F= 121.69 Cos= 0.059 Sum= 0.783 q= 2.7388
Vector: 83 F= 123.47 Cos= 0.051 Sum= 0.786 q= 2.3473
Vector: 84 F= 124.85 Cos= -0.013 Sum= 0.786 q= -0.6241
Vector: 85 F= 126.35 Cos= -0.038 Sum= 0.787 q= -1.7697
Vector: 86 F= 127.70 Cos= -0.062 Sum= 0.791 q= -2.8924
Vector: 87 F= 128.16 Cos= -0.038 Sum= 0.793 q= -1.7668
Vector: 88 F= 130.71 Cos= -0.054 Sum= 0.795 q= -2.5167
Vector: 89 F= 131.30 Cos= -0.008 Sum= 0.796 q= -0.3759
Vector: 90 F= 132.72 Cos= -0.004 Sum= 0.796 q= -0.2079
Vector: 91 F= 133.12 Cos= 0.120 Sum= 0.810 q= 5.5976
Vector: 92 F= 136.92 Cos= 0.007 Sum= 0.810 q= 0.3194
Vector: 93 F= 137.14 Cos= 0.049 Sum= 0.813 q= 2.2838
Vector: 94 F= 139.44 Cos= -0.006 Sum= 0.813 q= -0.2894
Vector: 95 F= 140.28 Cos= 0.005 Sum= 0.813 q= 0.2501
Vector: 96 F= 140.79 Cos= 0.015 Sum= 0.813 q= 0.7149
Vector: 97 F= 143.40 Cos= 0.048 Sum= 0.815 q= 2.2246
Vector: 98 F= 143.77 Cos= 0.002 Sum= 0.815 q= 0.0836
Vector: 99 F= 144.06 Cos= 0.008 Sum= 0.815 q= 0.3770
Vector: 100 F= 145.36 Cos= 0.032 Sum= 0.816 q= 1.4869
Vector: 101 F= 146.57 Cos= -0.012 Sum= 0.816 q= -0.5578
Vector: 102 F= 147.85 Cos= 0.000 Sum= 0.816 q= 0.0135
Vector: 103 F= 148.93 Cos= -0.030 Sum= 0.817 q= -1.3896
Vector: 104 F= 150.42 Cos= 0.002 Sum= 0.817 q= 0.0811
Vector: 105 F= 150.74 Cos= 0.032 Sum= 0.818 q= 1.4851
Vector: 106 F= 151.59 Cos= -0.024 Sum= 0.819 q= -1.1320
Projmod> Best zero-frequency found : 0.003384
Projmod> 21 frequencies less than: 0.003479
Projmod> Lowest non-zero frequency : 2.299245
Projmod> Best overlap with diff.vect. = -0.39 for mode 29 with F= 28.62 cm-1.
Projmod> 1-3-6-9-12-all-best contrb. = 0.150 0.321 0.431 0.489 0.536 0.819
Projmod> Normal end.
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2604281510402900129 7 -20 20 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-20
2604281510402900129.eigenfacs
2604281510402900129.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2604281510402900129.eigenfacs
2604281510402900129.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2604281510402900129.eigenfacs
2604281510402900129.atom
making animated gifs
3 models are in 2604281510402900129.7.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
3 models are in 2604281510402900129.7.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
3 models are in 2604281510402900129.7.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=7 DQ=-20 400 2.319 351 1.285
MODEL 2 MODE=7 DQ=0 400 2.256 355 1.293
MODEL 3 MODE=7 DQ=20 400 2.355 353 1.287
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 2604281510402900129 8 -20 20 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-20
2604281510402900129.eigenfacs
2604281510402900129.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2604281510402900129.eigenfacs
2604281510402900129.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2604281510402900129.eigenfacs
2604281510402900129.atom
making animated gifs
3 models are in 2604281510402900129.8.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
3 models are in 2604281510402900129.8.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
3 models are in 2604281510402900129.8.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=8 DQ=-20 400 2.236 357 1.266
MODEL 2 MODE=8 DQ=0 400 2.256 355 1.293
MODEL 3 MODE=8 DQ=20 400 2.564 341 1.208
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 2604281510402900129 9 -20 20 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-20
2604281510402900129.eigenfacs
2604281510402900129.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2604281510402900129.eigenfacs
2604281510402900129.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2604281510402900129.eigenfacs
2604281510402900129.atom
making animated gifs
3 models are in 2604281510402900129.9.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
3 models are in 2604281510402900129.9.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
3 models are in 2604281510402900129.9.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=9 DQ=-20 400 2.399 344 1.245
MODEL 2 MODE=9 DQ=0 400 2.256 355 1.293
MODEL 3 MODE=9 DQ=20 400 2.182 365 1.274
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 2604281510402900129 10 -20 20 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-20
2604281510402900129.eigenfacs
2604281510402900129.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2604281510402900129.eigenfacs
2604281510402900129.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2604281510402900129.eigenfacs
2604281510402900129.atom
making animated gifs
3 models are in 2604281510402900129.10.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
3 models are in 2604281510402900129.10.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
3 models are in 2604281510402900129.10.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=10 DQ=-20 400 2.465 343 1.267
MODEL 2 MODE=10 DQ=0 400 2.256 355 1.293
MODEL 3 MODE=10 DQ=20 400 2.412 357 1.279
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 2604281510402900129 11 -20 20 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-20
2604281510402900129.eigenfacs
2604281510402900129.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2604281510402900129.eigenfacs
2604281510402900129.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2604281510402900129.eigenfacs
2604281510402900129.atom
making animated gifs
3 models are in 2604281510402900129.11.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
3 models are in 2604281510402900129.11.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
3 models are in 2604281510402900129.11.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=11 DQ=-20 400 2.469 350 1.269
MODEL 2 MODE=11 DQ=0 400 2.256 355 1.293
MODEL 3 MODE=11 DQ=20 400 2.403 348 1.279
getting mode 12
running: ../../bin/get_modes.sh 2604281510402900129 12 -20 20 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 12
calculating perturbed structure for DQ=-20
2604281510402900129.eigenfacs
2604281510402900129.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2604281510402900129.eigenfacs
2604281510402900129.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2604281510402900129.eigenfacs
2604281510402900129.atom
making animated gifs
3 models are in 2604281510402900129.12.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
3 models are in 2604281510402900129.12.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
3 models are in 2604281510402900129.12.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=12 DQ=-20 400 2.318 350 1.256
MODEL 2 MODE=12 DQ=0 400 2.256 355 1.293
MODEL 3 MODE=12 DQ=20 400 2.368 346 1.269
getting mode 13
running: ../../bin/get_modes.sh 2604281510402900129 13 -20 20 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 13
calculating perturbed structure for DQ=-20
2604281510402900129.eigenfacs
2604281510402900129.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2604281510402900129.eigenfacs
2604281510402900129.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2604281510402900129.eigenfacs
2604281510402900129.atom
making animated gifs
3 models are in 2604281510402900129.13.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
3 models are in 2604281510402900129.13.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
3 models are in 2604281510402900129.13.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=13 DQ=-20 400 2.283 352 1.294
MODEL 2 MODE=13 DQ=0 400 2.256 355 1.293
MODEL 3 MODE=13 DQ=20 400 2.268 351 1.171
getting mode 14
running: ../../bin/get_modes.sh 2604281510402900129 14 -20 20 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 14
calculating perturbed structure for DQ=-20
2604281510402900129.eigenfacs
2604281510402900129.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2604281510402900129.eigenfacs
2604281510402900129.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2604281510402900129.eigenfacs
2604281510402900129.atom
making animated gifs
3 models are in 2604281510402900129.14.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
3 models are in 2604281510402900129.14.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
3 models are in 2604281510402900129.14.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=14 DQ=-20 400 2.545 349 1.252
MODEL 2 MODE=14 DQ=0 400 2.256 355 1.293
MODEL 3 MODE=14 DQ=20 400 2.370 348 1.268
getting mode 15
running: ../../bin/get_modes.sh 2604281510402900129 15 -20 20 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 15
calculating perturbed structure for DQ=-20
2604281510402900129.eigenfacs
2604281510402900129.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2604281510402900129.eigenfacs
2604281510402900129.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2604281510402900129.eigenfacs
2604281510402900129.atom
making animated gifs
3 models are in 2604281510402900129.15.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
3 models are in 2604281510402900129.15.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
3 models are in 2604281510402900129.15.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=15 DQ=-20 400 2.359 353 1.287
MODEL 2 MODE=15 DQ=0 400 2.256 355 1.293
MODEL 3 MODE=15 DQ=20 400 2.299 351 1.298
getting mode 16
running: ../../bin/get_modes.sh 2604281510402900129 16 -20 20 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 16
calculating perturbed structure for DQ=-20
2604281510402900129.eigenfacs
2604281510402900129.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2604281510402900129.eigenfacs
2604281510402900129.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2604281510402900129.eigenfacs
2604281510402900129.atom
making animated gifs
3 models are in 2604281510402900129.16.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
3 models are in 2604281510402900129.16.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
3 models are in 2604281510402900129.16.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=16 DQ=-20 400 2.506 351 1.284
MODEL 2 MODE=16 DQ=0 400 2.256 355 1.293
MODEL 3 MODE=16 DQ=20 400 2.420 354 1.285
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2604281510402900129.9.pdb
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user 0m22.897s
sys 0m0.051s
rm: cannot remove '2604281510402900129.sdijb': No such file or directory
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