*** OXIDOREDUCTASE 21-OCT-88 5DFR ***
Output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 2604281704282925999.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 2604281704282925999.atom to be opened.
Openam> File opened: 2604281704282925999.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 154
First residue number = 1
Last residue number = 159
Number of atoms found = 1220
Mean number per residue = 7.9
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 6.482241 +/- 8.564276 From: -13.372000 To: 28.273000
= 29.974054 +/- 9.421244 From: 10.693000 To: 56.331000
= 20.776577 +/- 8.751534 From: 0.483000 To: 40.396000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 6.3886 % Filled.
Pdbmat> 428010 non-zero elements.
Pdbmat> 46750 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 76.64 +/- 23.10
Maximum number = 123
Minimum number = 16
Pdbmat> Matrix trace = 935000.
Pdbmat> Larger element = 495.825
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
154 non-zero elements, NRBL set to 1
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 2604281704282925999.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 1
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 2604281704282925999.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
2604281704282925999.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 1220 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 1 residue(s) per block.
Blocpdb> 154 residues.
Blocpdb> 8 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 8 atoms in block 2
Block first atom: 9
Blocpdb> 6 atoms in block 3
Block first atom: 17
Blocpdb> 8 atoms in block 4
Block first atom: 23
Blocpdb> 8 atoms in block 5
Block first atom: 31
Blocpdb> 5 atoms in block 6
Block first atom: 39
Blocpdb> 5 atoms in block 7
Block first atom: 44
Blocpdb> 8 atoms in block 8
Block first atom: 49
Blocpdb> 5 atoms in block 9
Block first atom: 57
Blocpdb> 7 atoms in block 10
Block first atom: 62
Blocpdb> 8 atoms in block 11
Block first atom: 69
Blocpdb> 11 atoms in block 12
Block first atom: 77
Blocpdb> 7 atoms in block 13
Block first atom: 88
Blocpdb> 8 atoms in block 14
Block first atom: 95
Blocpdb> 4 atoms in block 15
Block first atom: 103
Blocpdb> 7 atoms in block 16
Block first atom: 107
Blocpdb> 14 atoms in block 17
Block first atom: 114
Blocpdb> 8 atoms in block 18
Block first atom: 128
Blocpdb> 8 atoms in block 19
Block first atom: 136
Blocpdb> 7 atoms in block 20
Block first atom: 144
Blocpdb> 5 atoms in block 21
Block first atom: 151
Blocpdb> 8 atoms in block 22
Block first atom: 156
Blocpdb> 8 atoms in block 23
Block first atom: 164
Blocpdb> 5 atoms in block 24
Block first atom: 172
Blocpdb> 14 atoms in block 25
Block first atom: 177
Blocpdb> 11 atoms in block 26
Block first atom: 191
Blocpdb> 9 atoms in block 27
Block first atom: 202
Blocpdb> 11 atoms in block 28
Block first atom: 211
Blocpdb> 8 atoms in block 29
Block first atom: 222
Blocpdb> 7 atoms in block 30
Block first atom: 230
Blocpdb> 8 atoms in block 31
Block first atom: 237
Blocpdb> 8 atoms in block 32
Block first atom: 245
Blocpdb> 9 atoms in block 33
Block first atom: 253
Blocpdb> 7 atoms in block 34
Block first atom: 262
Blocpdb> 7 atoms in block 35
Block first atom: 269
Blocpdb> 8 atoms in block 36
Block first atom: 276
Blocpdb> 8 atoms in block 37
Block first atom: 284
Blocpdb> 4 atoms in block 38
Block first atom: 292
Blocpdb> 11 atoms in block 39
Block first atom: 296
Blocpdb> 10 atoms in block 40
Block first atom: 307
Blocpdb> 7 atoms in block 41
Block first atom: 317
Blocpdb> 14 atoms in block 42
Block first atom: 324
Blocpdb> 9 atoms in block 43
Block first atom: 338
Blocpdb> 6 atoms in block 44
Block first atom: 347
Blocpdb> 8 atoms in block 45
Block first atom: 353
Blocpdb> 4 atoms in block 46
Block first atom: 361
Blocpdb> 11 atoms in block 47
Block first atom: 365
Blocpdb> 7 atoms in block 48
Block first atom: 376
Blocpdb> 8 atoms in block 49
Block first atom: 383
Blocpdb> 7 atoms in block 50
Block first atom: 391
Blocpdb> 4 atoms in block 51
Block first atom: 398
Blocpdb> 11 atoms in block 52
Block first atom: 402
Blocpdb> 9 atoms in block 53
Block first atom: 413
Blocpdb> 8 atoms in block 54
Block first atom: 422
Blocpdb> 8 atoms in block 55
Block first atom: 430
Blocpdb> 8 atoms in block 56
Block first atom: 438
Blocpdb> 8 atoms in block 57
Block first atom: 446
Blocpdb> 6 atoms in block 58
Block first atom: 454
Blocpdb> 6 atoms in block 59
Block first atom: 460
Blocpdb> 9 atoms in block 60
Block first atom: 466
Blocpdb> 7 atoms in block 61
Block first atom: 475
Blocpdb> 4 atoms in block 62
Block first atom: 482
Blocpdb> 7 atoms in block 63
Block first atom: 486
Blocpdb> 8 atoms in block 64
Block first atom: 493
Blocpdb> 8 atoms in block 65
Block first atom: 501
Blocpdb> 11 atoms in block 66
Block first atom: 509
Blocpdb> 7 atoms in block 67
Block first atom: 520
Blocpdb> 7 atoms in block 68
Block first atom: 527
Blocpdb> 14 atoms in block 69
Block first atom: 534
Blocpdb> 7 atoms in block 70
Block first atom: 548
Blocpdb> 9 atoms in block 71
Block first atom: 555
Blocpdb> 6 atoms in block 72
Block first atom: 564
Blocpdb> 7 atoms in block 73
Block first atom: 570
Blocpdb> 8 atoms in block 74
Block first atom: 577
Blocpdb> 9 atoms in block 75
Block first atom: 585
Blocpdb> 5 atoms in block 76
Block first atom: 594
Blocpdb> 8 atoms in block 77
Block first atom: 599
Blocpdb> 5 atoms in block 78
Block first atom: 607
Blocpdb> 5 atoms in block 79
Block first atom: 612
Blocpdb> 6 atoms in block 80
Block first atom: 617
Blocpdb> 4 atoms in block 81
Block first atom: 623
Blocpdb> 8 atoms in block 82
Block first atom: 627
Blocpdb> 7 atoms in block 83
Block first atom: 635
Blocpdb> 7 atoms in block 84
Block first atom: 642
Blocpdb> 9 atoms in block 85
Block first atom: 649
Blocpdb> 8 atoms in block 86
Block first atom: 658
Blocpdb> 8 atoms in block 87
Block first atom: 666
Blocpdb> 7 atoms in block 88
Block first atom: 674
Blocpdb> 8 atoms in block 89
Block first atom: 681
Blocpdb> 4 atoms in block 90
Block first atom: 689
Blocpdb> 4 atoms in block 91
Block first atom: 693
Blocpdb> 4 atoms in block 92
Block first atom: 697
Blocpdb> 11 atoms in block 93
Block first atom: 701
Blocpdb> 7 atoms in block 94
Block first atom: 712
Blocpdb> 12 atoms in block 95
Block first atom: 719
Blocpdb> 9 atoms in block 96
Block first atom: 731
Blocpdb> 9 atoms in block 97
Block first atom: 740
Blocpdb> 11 atoms in block 98
Block first atom: 749
Blocpdb> 8 atoms in block 99
Block first atom: 760
Blocpdb> 7 atoms in block 100
Block first atom: 768
Blocpdb> 9 atoms in block 101
Block first atom: 775
Blocpdb> 5 atoms in block 102
Block first atom: 784
Blocpdb> 9 atoms in block 103
Block first atom: 789
Blocpdb> 9 atoms in block 104
Block first atom: 798
Blocpdb> 8 atoms in block 105
Block first atom: 807
Blocpdb> 12 atoms in block 106
Block first atom: 815
Blocpdb> 8 atoms in block 107
Block first atom: 827
Blocpdb> 7 atoms in block 108
Block first atom: 835
Blocpdb> 10 atoms in block 109
Block first atom: 842
Blocpdb> 8 atoms in block 110
Block first atom: 852
Blocpdb> 8 atoms in block 111
Block first atom: 860
Blocpdb> 5 atoms in block 112
Block first atom: 868
Blocpdb> 9 atoms in block 113
Block first atom: 873
Blocpdb> 7 atoms in block 114
Block first atom: 882
Blocpdb> 6 atoms in block 115
Block first atom: 889
Blocpdb> 4 atoms in block 116
Block first atom: 895
Blocpdb> 4 atoms in block 117
Block first atom: 899
Blocpdb> 7 atoms in block 118
Block first atom: 903
Blocpdb> 10 atoms in block 119
Block first atom: 910
Blocpdb> 11 atoms in block 120
Block first atom: 920
Blocpdb> 7 atoms in block 121
Block first atom: 931
Blocpdb> 5 atoms in block 122
Block first atom: 938
Blocpdb> 12 atoms in block 123
Block first atom: 943
Blocpdb> 9 atoms in block 124
Block first atom: 955
Blocpdb> 7 atoms in block 125
Block first atom: 964
Blocpdb> 8 atoms in block 126
Block first atom: 971
Blocpdb> 8 atoms in block 127
Block first atom: 979
Blocpdb> 14 atoms in block 128
Block first atom: 987
Blocpdb> 9 atoms in block 129
Block first atom: 1001
Blocpdb> 6 atoms in block 130
Block first atom: 1010
Blocpdb> 7 atoms in block 131
Block first atom: 1016
Blocpdb> 11 atoms in block 132
Block first atom: 1023
Blocpdb> 6 atoms in block 133
Block first atom: 1034
Blocpdb> 9 atoms in block 134
Block first atom: 1040
Blocpdb> 11 atoms in block 135
Block first atom: 1049
Blocpdb> 10 atoms in block 136
Block first atom: 1060
Blocpdb> 8 atoms in block 137
Block first atom: 1070
Blocpdb> 5 atoms in block 138
Block first atom: 1078
Blocpdb> 8 atoms in block 139
Block first atom: 1083
Blocpdb> 5 atoms in block 140
Block first atom: 1091
Blocpdb> 9 atoms in block 141
Block first atom: 1096
Blocpdb> 8 atoms in block 142
Block first atom: 1105
Blocpdb> 6 atoms in block 143
Block first atom: 1113
Blocpdb> 10 atoms in block 144
Block first atom: 1119
Blocpdb> 6 atoms in block 145
Block first atom: 1129
Blocpdb> 12 atoms in block 146
Block first atom: 1135
Blocpdb> 6 atoms in block 147
Block first atom: 1147
Blocpdb> 11 atoms in block 148
Block first atom: 1153
Blocpdb> 9 atoms in block 149
Block first atom: 1164
Blocpdb> 8 atoms in block 150
Block first atom: 1173
Blocpdb> 8 atoms in block 151
Block first atom: 1181
Blocpdb> 9 atoms in block 152
Block first atom: 1189
Blocpdb> 11 atoms in block 153
Block first atom: 1198
Blocpdb> 12 atoms in block 154
Block first atom: 1208
Blocpdb> 154 blocks.
Blocpdb> At most, 14 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 4 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 428164 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 3660
Prepmat> Matrix trace = 935000.0000
Prepmat> Last element read: 3660 3660 119.0910
Prepmat> 11936 lines saved.
Prepmat> 10109 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 1220
RTB> Total mass = 1220.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 1220
RTB> Number of blocks = 154
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 212546.8575
RTB> 63426 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 924
Diagstd> Nb of non-zero elements: 63426
Diagstd> Projected matrix trace = 212546.8575
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 924 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 212546.8575
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 2.2301298 3.0553175 4.9308268 5.3488656
7.0131126 8.0094501 11.0808917 12.4145031 12.4683891
13.1097196 14.4548644 15.5939699 15.9705725 17.4758935
18.4810495 19.6148130 20.6148096 21.7241028 22.7013701
23.9965724 24.6658046 25.7705041 26.0910386 26.5351279
27.7781681 28.5033206 29.7414353 29.7697387 31.0190518
31.2470760 33.4005661 33.8558481 34.3331690 36.2144093
36.4194707 36.9976985 38.0194275 39.5020074 39.8273329
40.7859668 41.3169337 43.2070973 43.6160113 43.9840509
44.7878314 45.8831291 46.7789485 48.4039018 49.3951691
49.9716685 50.6300795 51.1852986 51.7481674 52.2219096
53.6869631 54.7332112 55.6800854 56.6149457 57.6028359
58.2018982 59.1952175 59.6673874 60.2697605 61.6515034
62.5346744 62.9818905 63.9775789 64.3984772 64.9509872
65.5402699 66.1590644 67.1800687 67.4791258 68.1602665
69.1168557 69.5832174 70.2767184 70.3542607 71.2771162
72.0902554 72.5581142 73.5884141 74.2228102 74.6752736
75.7142812 76.3905472 76.9000587 77.2612922 77.6607603
78.4228485 79.4470757 80.9864893 81.4858789 81.9602077
82.3273441 82.6703599 82.9267843 83.7416452 84.9411809
85.4495144
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034337 0.0034337 0.0034342 0.0034345 0.0034346
0.0034351 162.1662050 189.8119072 241.1321701 251.1459176
287.5747069 307.3241086 361.4786366 382.6132017 383.4426825
393.1805097 412.8595088 428.8186114 433.9658181 453.9572698
466.8298262 480.9360874 493.0431669 506.1348076 517.3939127
531.9488648 539.3155266 551.2603259 554.6780295 559.3786325
572.3307510 579.7530057 592.2106896 592.4924102 604.7968765
607.0157671 627.5844790 631.8472924 636.2857920 653.4855416
655.3330868 660.5149243 669.5732068 682.5034689 685.3081430
693.5067001 698.0062671 713.7938892 717.1636244 720.1830452
726.7336968 735.5662499 742.7121148 755.5017346 763.1985184
767.6393081 772.6798468 776.9049721 781.1649835 784.7325270
795.6639828 803.3794982 810.2988577 817.0729406 824.1707796
828.4453309 835.4848722 838.8103707 843.0338500 852.6427746
858.7282036 861.7933259 868.5787115 871.4311485 875.1614081
879.1224953 883.2628363 890.0522494 892.0311168 896.5219360
902.7910951 905.8317379 910.3345318 910.8366181 916.7909981
922.0056076 924.9926325 931.5367695 935.5434809 938.3906927
944.8963732 949.1068129 952.2667400 954.5007283 956.9650992
961.6490050 967.9083541 977.2407467 980.2491113 983.0979840
985.2973913 987.3478718 988.8779491 993.7245627 1000.8164326
1003.8066760
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 1220
Rtb_to_modes> Number of blocs = 154
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9982E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9985E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0003E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0004E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0006E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.230
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.055
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.931
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.349
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.013
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.009
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.08
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.41
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.47
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.11
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.45
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.59
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.97
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.48
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.48
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.61
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.61
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.72
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.70
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.00
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.67
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.77
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.54
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.78
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.50
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.74
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.77
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.25
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.40
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.86
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.33
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.21
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.42
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.00
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.50
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.83
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.79
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.32
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.21
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.62
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.98
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.79
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.88
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.78
Rdmodfacs> Eigenvector number: 54
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.40
Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.40
Rdmodfacs> Eigenvector number: 56
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.97
Rdmodfacs> Eigenvector number: 57
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.63
Rdmodfacs> Eigenvector number: 58
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.19
Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.75
Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.22
Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.69
Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.73
Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.68
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.61
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.60
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.20
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.20
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.67
Rdmodfacs> Eigenvector number: 69
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.27
Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.65
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.53
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.98
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.98
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.40
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.95
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.54
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.16
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.18
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.48
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 68.16
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 69.12
Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 69.58
Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 70.28
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 70.35
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 71.28
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 72.09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 72.56
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 73.59
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 74.22
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 74.68
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 75.71
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 76.39
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 76.90
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 77.26
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 77.66
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 78.42
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 79.45
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 80.99
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 81.49
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 81.96
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 82.33
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 82.67
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 82.93
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 83.74
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 84.94
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 85.45
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 924 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
1.00001 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000
1.00000 1.00001 1.00001 0.99996 1.00000
0.99997 0.99997 0.99998 1.00003 1.00002
0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 0.99998
1.00000 0.99999 1.00001 1.00002 0.99999
0.99999 1.00001 1.00002 1.00004 1.00003
0.99998 1.00002 1.00000 0.99998 0.99998
1.00004 1.00000 1.00007 1.00001 1.00003
0.99999 1.00000 0.99996 0.99998 0.99998
0.99999 1.00000 0.99998 0.99998 0.99999
1.00001 1.00000 0.99998 0.99999 1.00002
0.99999 1.00002 0.99997 1.00003 0.99999
1.00000 1.00001 1.00001 0.99998 0.99999
1.00000 1.00004 0.99999 1.00001 1.00001
0.99999 1.00002 0.99998 1.00002 1.00001
0.99998 1.00000 1.00002 0.99998 1.00000
0.99999 1.00001 1.00001 0.99998 1.00000
1.00002 0.99999 1.00001 0.99998 0.99997
1.00000 0.99998 0.99996 1.00000 1.00000
1.00002 0.99999 0.99997 0.99999 1.00000
1.00001 0.99997 1.00001 1.00001 1.00002
1.00002
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 21960 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00001 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000
1.00000 1.00001 1.00001 0.99996 1.00000
0.99997 0.99997 0.99998 1.00003 1.00002
0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 0.99998
1.00000 0.99999 1.00001 1.00002 0.99999
0.99999 1.00001 1.00002 1.00004 1.00003
0.99998 1.00002 1.00000 0.99998 0.99998
1.00004 1.00000 1.00007 1.00001 1.00003
0.99999 1.00000 0.99996 0.99998 0.99998
0.99999 1.00000 0.99998 0.99998 0.99999
1.00001 1.00000 0.99998 0.99999 1.00002
0.99999 1.00002 0.99997 1.00003 0.99999
1.00000 1.00001 1.00001 0.99998 0.99999
1.00000 1.00004 0.99999 1.00001 1.00001
0.99999 1.00002 0.99998 1.00002 1.00001
0.99998 1.00000 1.00002 0.99998 1.00000
0.99999 1.00001 1.00001 0.99998 1.00000
1.00002 0.99999 1.00001 0.99998 0.99997
1.00000 0.99998 0.99996 1.00000 1.00000
1.00002 0.99999 0.99997 0.99999 1.00000
1.00001 0.99997 1.00001 1.00001 1.00002
1.00002
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2: 0.000
Vector 3: 0.000-0.000
Vector 4:-0.000 0.000 0.000
Vector 5: 0.000-0.000 0.000 0.000
Vector 6:-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000
Vector 7:-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 8: 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000
Vector 9:-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000
Vector 10:-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2604281704282925999.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2604281704282925999.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 2604281704282925999.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2604281704282925999.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 154
First residue number = 1
Last residue number = 159
Number of atoms found = 1220
Mean number per residue = 7.9
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9982E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9985E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0003E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0004E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0006E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.230
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.055
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.931
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.349
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.013
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.009
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.08
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.41
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.47
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.11
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.45
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.97
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.00
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.67
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.54
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.25
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.86
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.00
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.83
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.32
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.97
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.63
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.75
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.69
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.67
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.27
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.65
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.95
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.54
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.16
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.18
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.16
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.58
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.28
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.28
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 73.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 75.71
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 77.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 77.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 78.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 79.45
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 80.99
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 81.49
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 81.96
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 82.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 82.67
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 82.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 83.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 84.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 85.45
Bfactors> 106 vectors, 3660 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 2.230000
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= 0.593 for 154 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.040 +/- 0.04
Bfactors> = 26.752 +/- 12.38
Bfactors> Shiftng-fct= 26.712
Bfactors> Scaling-fct= 292.374
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2604281704282925999.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2604281704282925999.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4335E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4345E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4348E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 162.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 189.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 241.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 251.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 287.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 307.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 361.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 382.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 383.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 393.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 412.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 428.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 433.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 454.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 466.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 480.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 493.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 506.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 517.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 532.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 539.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 551.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 554.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 559.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 572.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 579.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 592.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 592.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 604.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 607.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 627.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 631.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 636.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 653.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 655.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 660.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 669.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 682.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 685.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 693.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 698.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 713.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 717.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 720.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 726.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 735.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 742.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 755.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 763.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 767.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 772.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 776.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 781.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 784.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 795.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 803.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 810.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 817.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 824.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 828.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 835.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 838.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 843.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 852.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 858.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 861.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 868.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 871.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 875.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 879.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 883.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 890.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 892.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 896.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 902.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 905.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 910.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 910.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 916.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 922.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 925.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 931.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 935.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 938.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 944.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 949.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 952.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 954.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 956.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 961.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 967.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 977.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 980.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 983.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 985.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 987.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 988.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 993.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1001.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1004.
Chkmod> 106 vectors, 3660 coordinates in file.
Chkmod> That is: 1220 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector 29 is: 1.0001 (instead of 1.0000).
%Chkmod-Wn> Norm of vector 38 is: 1.0002 (instead of 1.0000).
%Chkmod-Wn> Norm of vector 43 is: 0.9999 (instead of 1.0000).
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.8673
0.0034 0.7719
0.0034 0.9491
0.0034 0.7361
0.0034 0.8016
0.0034 0.9907
162.1545 0.5478
189.7939 0.4836
241.1261 0.0834
251.1383 0.1483
287.5601 0.2607
307.3023 0.4041
361.4486 0.3369
382.5274 0.2535
383.4510 0.3731
393.1678 0.1839
412.7723 0.3913
428.7456 0.3742
433.9394 0.4016
453.9911 0.1192
466.7965 0.3017
480.8564 0.3581
492.9645 0.3110
506.0653 0.3762
517.3561 0.4332
531.9640 0.3772
539.3382 0.5164
551.2313 0.1462
554.6432 0.3548
559.4060 0.3191
572.3251 0.2794
579.6943 0.4099
592.1710 0.4192
592.4696 0.2307
604.7802 0.4123
607.0181 0.2824
627.5522 0.1802
631.8589 0.2209
636.2291 0.3334
653.4177 0.3058
655.3097 0.3585
660.5071 0.3448
669.5495 0.1909
682.4568 0.1417
685.3017 0.3052
693.5112 0.3927
698.0022 0.3334
713.7872 0.3272
717.1656 0.3283
720.1190 0.4583
726.7201 0.3931
735.5096 0.4537
742.6886 0.3865
755.4389 0.4766
763.2031 0.3540
767.5935 0.3542
772.6461 0.4817
776.9073 0.3961
781.1453 0.4604
784.6845 0.3306
795.6523 0.4272
803.3214 0.2102
810.2635 0.3512
817.0022 0.3059
824.1151 0.3096
828.3963 0.3464
835.4828 0.1634
838.7927 0.2020
842.9993 0.4877
852.5958 0.2710
858.6592 0.3971
861.7434 0.3202
868.5579 0.4117
871.4040 0.2118
875.1172 0.4205
879.0829 0.3530
883.2312 0.2656
890.0136 0.4256
891.9986 0.3553
896.4817 0.3149
902.7729 0.2863
905.7719 0.3231
910.3167 0.2696
910.7699 0.3567
916.7702 0.5085
921.9644 0.3359
924.9649 0.2092
931.5068 0.2142
935.4856 0.2608
938.3801 0.1228
944.8291 0.0856
949.0627 0.2425
952.2255 0.2979
954.4518 0.2518
956.9193 0.3843
961.5903 0.4322
967.8846 0.1887
977.2200 0.2611
980.2318 0.2935
983.0545 0.3276
985.2710 0.3835
987.3033 0.2023
988.8547 0.2548
993.6721 0.2507
1000.7665 0.2552
1003.7664 0.3114
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2604281704282925999 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
2604281704282925999.eigenfacs
2604281704282925999.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2604281704282925999.eigenfacs
2604281704282925999.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2604281704282925999.eigenfacs
2604281704282925999.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2604281704282925999.eigenfacs
2604281704282925999.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2604281704282925999.eigenfacs
2604281704282925999.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2604281704282925999.eigenfacs
2604281704282925999.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2604281704282925999.eigenfacs
2604281704282925999.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2604281704282925999.eigenfacs
2604281704282925999.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2604281704282925999.eigenfacs
2604281704282925999.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2604281704282925999.eigenfacs
2604281704282925999.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2604281704282925999.eigenfacs
2604281704282925999.atom
making animated gifs
11 models are in 2604281704282925999.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604281704282925999.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604281704282925999.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 2604281704282925999 8 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
2604281704282925999.eigenfacs
2604281704282925999.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2604281704282925999.eigenfacs
2604281704282925999.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2604281704282925999.eigenfacs
2604281704282925999.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2604281704282925999.eigenfacs
2604281704282925999.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2604281704282925999.eigenfacs
2604281704282925999.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2604281704282925999.eigenfacs
2604281704282925999.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2604281704282925999.eigenfacs
2604281704282925999.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2604281704282925999.eigenfacs
2604281704282925999.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2604281704282925999.eigenfacs
2604281704282925999.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2604281704282925999.eigenfacs
2604281704282925999.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2604281704282925999.eigenfacs
2604281704282925999.atom
making animated gifs
11 models are in 2604281704282925999.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604281704282925999.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604281704282925999.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 2604281704282925999 9 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
2604281704282925999.eigenfacs
2604281704282925999.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2604281704282925999.eigenfacs
2604281704282925999.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2604281704282925999.eigenfacs
2604281704282925999.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2604281704282925999.eigenfacs
2604281704282925999.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2604281704282925999.eigenfacs
2604281704282925999.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2604281704282925999.eigenfacs
2604281704282925999.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2604281704282925999.eigenfacs
2604281704282925999.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2604281704282925999.eigenfacs
2604281704282925999.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2604281704282925999.eigenfacs
2604281704282925999.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2604281704282925999.eigenfacs
2604281704282925999.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2604281704282925999.eigenfacs
2604281704282925999.atom
making animated gifs
11 models are in 2604281704282925999.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604281704282925999.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604281704282925999.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 2604281704282925999 10 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
2604281704282925999.eigenfacs
2604281704282925999.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2604281704282925999.eigenfacs
2604281704282925999.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2604281704282925999.eigenfacs
2604281704282925999.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2604281704282925999.eigenfacs
2604281704282925999.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2604281704282925999.eigenfacs
2604281704282925999.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2604281704282925999.eigenfacs
2604281704282925999.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2604281704282925999.eigenfacs
2604281704282925999.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2604281704282925999.eigenfacs
2604281704282925999.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2604281704282925999.eigenfacs
2604281704282925999.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2604281704282925999.eigenfacs
2604281704282925999.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2604281704282925999.eigenfacs
2604281704282925999.atom
making animated gifs
11 models are in 2604281704282925999.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604281704282925999.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604281704282925999.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 2604281704282925999 11 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
2604281704282925999.eigenfacs
2604281704282925999.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2604281704282925999.eigenfacs
2604281704282925999.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2604281704282925999.eigenfacs
2604281704282925999.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2604281704282925999.eigenfacs
2604281704282925999.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2604281704282925999.eigenfacs
2604281704282925999.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2604281704282925999.eigenfacs
2604281704282925999.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2604281704282925999.eigenfacs
2604281704282925999.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2604281704282925999.eigenfacs
2604281704282925999.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2604281704282925999.eigenfacs
2604281704282925999.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2604281704282925999.eigenfacs
2604281704282925999.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2604281704282925999.eigenfacs
2604281704282925999.atom
making animated gifs
11 models are in 2604281704282925999.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604281704282925999.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604281704282925999.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
2604281704282925999.10.pdb
2604281704282925999.11.pdb
2604281704282925999.7.pdb
2604281704282925999.8.pdb
2604281704282925999.9.pdb
STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 0m10.645s
user 0m10.582s
sys 0m0.060s
rm: cannot remove '2604281704282925999.sdijf': No such file or directory
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:
elNémo
is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed
by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Between 2015 and 2025, it was hosted by US2B (Nantes).
Last modification: april 24th, 2026.
|
