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***  530  ***

LOGs for ID: 2604291714313431110

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2604291714313431110.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2604291714313431110.atom to be opened. Openam> File opened: 2604291714313431110.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 1102 First residue number = 33 Last residue number = 583 Number of atoms found = 8945 Mean number per residue = 8.1 Pdbmat> Coordinate statistics: = 22.557049 +/- 14.884173 From: -14.320000 To: 58.417000 = 41.028037 +/- 14.928489 From: 3.272000 To: 75.965000 = 39.574718 +/- 23.028021 From: -10.218000 To: 89.748000 Pdbmat> Masses are all set to one. %Pdbmat-W> residue:'OAS ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> 1 residue(s) not known. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 0.9892 % Filled. Pdbmat> 3561947 non-zero elements. Pdbmat> 389873 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 87.17 +/- 21.22 Maximum number = 134 Minimum number = 10 Pdbmat> Matrix trace = 7.797460E+06 Pdbmat> Larger element = 530.765 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 1102 non-zero elements, NRBL set to 6 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2604291714313431110.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 6 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2604291714313431110.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2604291714313431110.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 8945 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 6 residue(s) per block. Blocpdb> 1102 residues. Blocpdb> 42 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 51 atoms in block 2 Block first atom: 43 Blocpdb> 38 atoms in block 3 Block first atom: 94 Blocpdb> 53 atoms in block 4 Block first atom: 132 Blocpdb> 45 atoms in block 5 Block first atom: 185 Blocpdb> 48 atoms in block 6 Block first atom: 230 Blocpdb> 40 atoms in block 7 Block first atom: 278 Blocpdb> 51 atoms in block 8 Block first atom: 318 Blocpdb> 43 atoms in block 9 Block first atom: 369 Blocpdb> 52 atoms in block 10 Block first atom: 412 Blocpdb> 49 atoms in block 11 Block first atom: 464 Blocpdb> 55 atoms in block 12 Block first atom: 513 Blocpdb> 61 atoms in block 13 Block first atom: 568 Blocpdb> 46 atoms in block 14 Block first atom: 629 Blocpdb> 48 atoms in block 15 Block first atom: 675 Blocpdb> 44 atoms in block 16 Block first atom: 723 Blocpdb> 52 atoms in block 17 Block first atom: 767 Blocpdb> 54 atoms in block 18 Block first atom: 819 Blocpdb> 44 atoms in block 19 Block first atom: 873 Blocpdb> 55 atoms in block 20 Block first atom: 917 Blocpdb> 44 atoms in block 21 Block first atom: 972 Blocpdb> 39 atoms in block 22 Block first atom: 1016 Blocpdb> 47 atoms in block 23 Block first atom: 1055 Blocpdb> 46 atoms in block 24 Block first atom: 1102 Blocpdb> 49 atoms in block 25 Block first atom: 1148 Blocpdb> 58 atoms in block 26 Block first atom: 1197 Blocpdb> 41 atoms in block 27 Block first atom: 1255 Blocpdb> 51 atoms in block 28 Block first atom: 1296 Blocpdb> 53 atoms in block 29 Block first atom: 1347 Blocpdb> 57 atoms in block 30 Block first atom: 1400 Blocpdb> 49 atoms in block 31 Block first atom: 1457 Blocpdb> 43 atoms in block 32 Block first atom: 1506 Blocpdb> 41 atoms in block 33 Block first atom: 1549 Blocpdb> 51 atoms in block 34 Block first atom: 1590 Blocpdb> 51 atoms in block 35 Block first atom: 1641 Blocpdb> 56 atoms in block 36 Block first atom: 1692 Blocpdb> 50 atoms in block 37 Block first atom: 1748 Blocpdb> 46 atoms in block 38 Block first atom: 1798 Blocpdb> 48 atoms in block 39 Block first atom: 1844 Blocpdb> 44 atoms in block 40 Block first atom: 1892 Blocpdb> 51 atoms in block 41 Block first atom: 1936 Blocpdb> 49 atoms in block 42 Block first atom: 1987 Blocpdb> 45 atoms in block 43 Block first atom: 2036 Blocpdb> 44 atoms in block 44 Block first atom: 2081 Blocpdb> 45 atoms in block 45 Block first atom: 2125 Blocpdb> 57 atoms in block 46 Block first atom: 2170 Blocpdb> 50 atoms in block 47 Block first atom: 2227 Blocpdb> 52 atoms in block 48 Block first atom: 2277 Blocpdb> 51 atoms in block 49 Block first atom: 2329 Blocpdb> 50 atoms in block 50 Block first atom: 2380 Blocpdb> 47 atoms in block 51 Block first atom: 2430 Blocpdb> 48 atoms in block 52 Block first atom: 2477 Blocpdb> 53 atoms in block 53 Block first atom: 2525 Blocpdb> 50 atoms in block 54 Block first atom: 2578 Blocpdb> 56 atoms in block 55 Block first atom: 2628 Blocpdb> 51 atoms in block 56 Block first atom: 2684 Blocpdb> 59 atoms in block 57 Block first atom: 2735 Blocpdb> 46 atoms in block 58 Block first atom: 2794 Blocpdb> 56 atoms in block 59 Block first atom: 2840 Blocpdb> 64 atoms in block 60 Block first atom: 2896 Blocpdb> 53 atoms in block 61 Block first atom: 2960 Blocpdb> 58 atoms in block 62 Block first atom: 3013 Blocpdb> 57 atoms in block 63 Block first atom: 3071 Blocpdb> 47 atoms in block 64 Block first atom: 3128 Blocpdb> 49 atoms in block 65 Block first atom: 3175 Blocpdb> 47 atoms in block 66 Block first atom: 3224 Blocpdb> 44 atoms in block 67 Block first atom: 3271 Blocpdb> 39 atoms in block 68 Block first atom: 3315 Blocpdb> 44 atoms in block 69 Block first atom: 3354 Blocpdb> 41 atoms in block 70 Block first atom: 3398 Blocpdb> 57 atoms in block 71 Block first atom: 3439 Blocpdb> 55 atoms in block 72 Block first atom: 3496 Blocpdb> 63 atoms in block 73 Block first atom: 3551 Blocpdb> 47 atoms in block 74 Block first atom: 3614 Blocpdb> 50 atoms in block 75 Block first atom: 3661 Blocpdb> 42 atoms in block 76 Block first atom: 3711 Blocpdb> 41 atoms in block 77 Block first atom: 3753 Blocpdb> 45 atoms in block 78 Block first atom: 3794 Blocpdb> 48 atoms in block 79 Block first atom: 3839 Blocpdb> 48 atoms in block 80 Block first atom: 3887 Blocpdb> 50 atoms in block 81 Block first atom: 3935 Blocpdb> 44 atoms in block 82 Block first atom: 3985 Blocpdb> 41 atoms in block 83 Block first atom: 4029 Blocpdb> 41 atoms in block 84 Block first atom: 4070 Blocpdb> 42 atoms in block 85 Block first atom: 4111 Blocpdb> 53 atoms in block 86 Block first atom: 4153 Blocpdb> 42 atoms in block 87 Block first atom: 4206 Blocpdb> 48 atoms in block 88 Block first atom: 4248 Blocpdb> 41 atoms in block 89 Block first atom: 4296 Blocpdb> 45 atoms in block 90 Block first atom: 4337 Blocpdb> 44 atoms in block 91 Block first atom: 4382 Blocpdb> 37 atoms in block 92 Block first atom: 4426 Blocpdb> 42 atoms in block 93 Block first atom: 4463 Blocpdb> 51 atoms in block 94 Block first atom: 4505 Blocpdb> 38 atoms in block 95 Block first atom: 4556 Blocpdb> 53 atoms in block 96 Block first atom: 4594 Blocpdb> 45 atoms in block 97 Block first atom: 4647 Blocpdb> 48 atoms in block 98 Block first atom: 4692 Blocpdb> 46 atoms in block 99 Block first atom: 4740 Blocpdb> 51 atoms in block 100 Block first atom: 4786 Blocpdb> 49 atoms in block 101 Block first atom: 4837 Blocpdb> 52 atoms in block 102 Block first atom: 4886 Blocpdb> 49 atoms in block 103 Block first atom: 4938 Blocpdb> 55 atoms in block 104 Block first atom: 4987 Blocpdb> 61 atoms in block 105 Block first atom: 5042 Blocpdb> 46 atoms in block 106 Block first atom: 5103 Blocpdb> 48 atoms in block 107 Block first atom: 5149 Blocpdb> 44 atoms in block 108 Block first atom: 5197 Blocpdb> 52 atoms in block 109 Block first atom: 5241 Blocpdb> 57 atoms in block 110 Block first atom: 5293 Blocpdb> 44 atoms in block 111 Block first atom: 5350 Blocpdb> 55 atoms in block 112 Block first atom: 5394 Blocpdb> 42 atoms in block 113 Block first atom: 5449 Blocpdb> 39 atoms in block 114 Block first atom: 5491 Blocpdb> 47 atoms in block 115 Block first atom: 5530 Blocpdb> 46 atoms in block 116 Block first atom: 5577 Blocpdb> 49 atoms in block 117 Block first atom: 5623 Blocpdb> 58 atoms in block 118 Block first atom: 5672 Blocpdb> 41 atoms in block 119 Block first atom: 5730 Blocpdb> 51 atoms in block 120 Block first atom: 5771 Blocpdb> 53 atoms in block 121 Block first atom: 5822 Blocpdb> 57 atoms in block 122 Block first atom: 5875 Blocpdb> 49 atoms in block 123 Block first atom: 5932 Blocpdb> 43 atoms in block 124 Block first atom: 5981 Blocpdb> 41 atoms in block 125 Block first atom: 6024 Blocpdb> 51 atoms in block 126 Block first atom: 6065 Blocpdb> 51 atoms in block 127 Block first atom: 6116 Blocpdb> 53 atoms in block 128 Block first atom: 6167 Blocpdb> 50 atoms in block 129 Block first atom: 6220 Blocpdb> 46 atoms in block 130 Block first atom: 6270 Blocpdb> 48 atoms in block 131 Block first atom: 6316 Blocpdb> 45 atoms in block 132 Block first atom: 6364 Blocpdb> 51 atoms in block 133 Block first atom: 6409 Blocpdb> 52 atoms in block 134 Block first atom: 6460 Blocpdb> 45 atoms in block 135 Block first atom: 6512 Blocpdb> 44 atoms in block 136 Block first atom: 6557 Blocpdb> 45 atoms in block 137 Block first atom: 6601 Blocpdb> 57 atoms in block 138 Block first atom: 6646 Blocpdb> 50 atoms in block 139 Block first atom: 6703 Blocpdb> 52 atoms in block 140 Block first atom: 6753 Blocpdb> 51 atoms in block 141 Block first atom: 6805 Blocpdb> 50 atoms in block 142 Block first atom: 6856 Blocpdb> 47 atoms in block 143 Block first atom: 6906 Blocpdb> 48 atoms in block 144 Block first atom: 6953 Blocpdb> 53 atoms in block 145 Block first atom: 7001 Blocpdb> 50 atoms in block 146 Block first atom: 7054 Blocpdb> 56 atoms in block 147 Block first atom: 7104 Blocpdb> 51 atoms in block 148 Block first atom: 7160 Blocpdb> 59 atoms in block 149 Block first atom: 7211 Blocpdb> 46 atoms in block 150 Block first atom: 7270 Blocpdb> 56 atoms in block 151 Block first atom: 7316 Blocpdb> 64 atoms in block 152 Block first atom: 7372 Blocpdb> 53 atoms in block 153 Block first atom: 7436 Blocpdb> 58 atoms in block 154 Block first atom: 7489 Blocpdb> 57 atoms in block 155 Block first atom: 7547 Blocpdb> 47 atoms in block 156 Block first atom: 7604 Blocpdb> 49 atoms in block 157 Block first atom: 7651 Blocpdb> 51 atoms in block 158 Block first atom: 7700 Blocpdb> 44 atoms in block 159 Block first atom: 7751 Blocpdb> 39 atoms in block 160 Block first atom: 7795 Blocpdb> 44 atoms in block 161 Block first atom: 7834 Blocpdb> 41 atoms in block 162 Block first atom: 7878 Blocpdb> 51 atoms in block 163 Block first atom: 7919 Blocpdb> 55 atoms in block 164 Block first atom: 7970 Blocpdb> 63 atoms in block 165 Block first atom: 8025 Blocpdb> 53 atoms in block 166 Block first atom: 8088 Blocpdb> 50 atoms in block 167 Block first atom: 8141 Blocpdb> 42 atoms in block 168 Block first atom: 8191 Blocpdb> 42 atoms in block 169 Block first atom: 8233 Blocpdb> 45 atoms in block 170 Block first atom: 8275 Blocpdb> 48 atoms in block 171 Block first atom: 8320 Blocpdb> 48 atoms in block 172 Block first atom: 8368 Blocpdb> 50 atoms in block 173 Block first atom: 8416 Blocpdb> 44 atoms in block 174 Block first atom: 8466 Blocpdb> 43 atoms in block 175 Block first atom: 8510 Blocpdb> 41 atoms in block 176 Block first atom: 8553 Blocpdb> 42 atoms in block 177 Block first atom: 8594 Blocpdb> 53 atoms in block 178 Block first atom: 8636 Blocpdb> 42 atoms in block 179 Block first atom: 8689 Blocpdb> 48 atoms in block 180 Block first atom: 8731 Blocpdb> 41 atoms in block 181 Block first atom: 8779 Blocpdb> 45 atoms in block 182 Block first atom: 8820 Blocpdb> 44 atoms in block 183 Block first atom: 8865 Blocpdb> 37 atoms in block 184 Block first atom: 8908 Blocpdb> 184 blocks. Blocpdb> At most, 64 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 37 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 3562131 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 26835 Prepmat> Matrix trace = 7797460.0000 Prepmat> Last element read: 26835 26835 221.1823 Prepmat> 17021 lines saved. Prepmat> 15330 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 8945 RTB> Total mass = 8945.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 8945 RTB> Number of blocks = 184 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 215967.6627 RTB> 58080 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1104 Diagstd> Nb of non-zero elements: 58080 Diagstd> Projected matrix trace = 215967.6627 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1104 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 215967.6627 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.9446834 1.4156441 2.9368702 3.0513717 3.9643033 4.1640309 4.4295847 4.8734308 5.3234602 5.3842957 6.2186881 7.4191149 7.6591979 7.9012565 8.2657528 8.3035944 8.7792476 9.3723702 11.0754163 11.2888095 12.0440581 12.3621370 12.4699539 12.8346371 13.7530587 13.9028638 14.3611939 14.6201122 15.4296882 16.0936316 16.4968846 16.9862634 18.0768049 18.9581419 19.4550493 19.7723158 20.3072891 20.8077171 21.4823531 21.6384362 22.5415705 22.7670843 23.4164802 23.6006815 23.9733428 24.1791792 24.4771983 24.8334807 25.8292729 26.4061243 26.9268744 27.3236754 28.2068442 28.6226668 28.7944456 29.2603644 30.2060659 30.6331673 30.9033166 31.2173833 31.7254071 32.2167264 32.5841417 32.7646811 33.0170855 33.7082486 34.0761964 34.6511049 34.8732964 35.5941454 36.1302428 36.6085778 36.8983482 37.3550632 37.8154029 38.0084936 38.6384313 38.8145041 38.9320570 39.6253567 39.7688626 40.5372077 40.6986555 41.2702750 41.8744992 42.9462351 43.3933866 43.9440028 44.4113539 44.5312424 44.9824483 45.5306105 45.7585765 45.8586933 46.7847020 47.2173129 47.8082315 48.2401260 48.3536442 48.9930083 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034325 0.0034326 0.0034331 0.0034350 0.0034357 0.0034359 105.5451839 129.2029157 186.0962639 189.6893016 216.2114641 221.5910681 228.5476646 239.7246435 250.5487762 251.9763216 270.7975107 295.7817198 300.5293730 305.2413466 312.2025791 312.9164128 321.7539801 332.4451474 361.3893173 364.8542025 376.8614389 381.8053918 383.4667427 389.0335682 402.7123318 404.8996622 411.5196268 415.2127047 426.5538398 435.6345417 441.0585527 447.5527267 461.6960041 472.8170891 478.9734584 482.8631349 489.3518745 495.3446734 503.3107497 505.1358774 515.5696758 518.1422280 525.4798750 527.5426201 531.6913288 533.9690158 537.2496405 541.1455327 551.8885335 558.0172333 563.4926459 567.6293443 576.7299828 580.9654792 582.7062025 587.4016274 596.8186184 601.0231935 603.6675432 606.7272885 611.6442289 616.3621827 619.8668667 621.5817476 623.9713470 630.4684729 633.9001239 639.2251062 641.2712662 647.8650697 652.7257113 657.0322827 659.6274841 663.6972500 667.7742164 669.4769196 675.0019434 676.5381648 677.5618658 683.5682344 684.8049101 691.3885695 692.7640004 697.6120309 702.7002263 711.6358672 715.3310110 719.8551024 723.6728618 724.6489820 728.3109255 732.7351357 734.5672016 735.3703553 742.7577875 746.1839686 750.8386488 754.2225220 755.1094158 760.0853006 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 8945 Rtb_to_modes> Number of blocs = 184 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9913E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9919E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9948E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0006E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0010E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0012E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9447 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.416 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.937 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.051 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.964 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.164 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.430 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.873 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.323 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.384 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.219 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.419 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.659 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.901 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.266 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.304 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.779 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.372 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.99 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1104 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00002 0.99998 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 0.99998 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 0.99998 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00002 0.99999 1.00000 0.99998 0.99999 0.99998 1.00001 1.00002 1.00002 1.00001 0.99998 1.00004 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 1.00002 0.99999 0.99999 0.99999 1.00001 1.00003 0.99998 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 1.00002 0.99998 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99997 1.00003 0.99999 1.00001 1.00001 1.00001 1.00001 1.00003 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00002 1.00000 0.99998 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 161010 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00002 0.99998 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 0.99998 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 0.99998 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00002 0.99999 1.00000 0.99998 0.99999 0.99998 1.00001 1.00002 1.00002 1.00001 0.99998 1.00004 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 1.00002 0.99999 0.99999 0.99999 1.00001 1.00003 0.99998 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 1.00002 0.99998 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99997 1.00003 0.99999 1.00001 1.00001 1.00001 1.00001 1.00003 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00002 1.00000 0.99998 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3: 0.000-0.000 Vector 4: 0.000 0.000-0.000 Vector 5:-0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 6: 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 7: 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 8: 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 9: 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 10:-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2604291714313431110.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2604291714313431110.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2604291714313431110.atom Openam> file on opening on unit 11: 2604291714313431110.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 1102 First residue number = 33 Last residue number = 583 Number of atoms found = 8945 Mean number per residue = 8.1 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9913E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9919E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9948E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0006E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0010E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0012E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9447 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.416 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.937 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.051 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.964 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.164 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.430 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.873 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.323 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.384 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.219 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.419 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.659 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.901 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.266 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.304 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.779 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.372 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.99 Bfactors> 106 vectors, 26835 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.944700 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.654 for 1109 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.013 +/- 0.01 Bfactors> = 27.556 +/- 10.03 Bfactors> Shiftng-fct= 27.543 Bfactors> Scaling-fct= 868.727 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2604291714313431110.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2604291714313431110.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4323E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4324E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4329E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4348E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4355E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4359E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 105.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 129.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 186.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 189.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 216.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 221.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 228.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 239.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 250.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 252.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 270.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 295.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 300.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 305.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 312.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 312.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 321.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 332.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 361.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 364.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 376.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 381.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 383.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 388.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 402.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 404.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 411.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 415.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 426.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 435.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 441.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 447.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 461.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 472.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 479.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 482.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 489.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 495.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 503.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 505.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 515.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 518.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 525.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 527.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 531.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 534.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 537.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 541.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 551.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 558.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 563.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 567.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 576.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 580.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 582.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 587.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 596.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 601.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 603.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 606.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 611.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 616.4 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vecteur en lecture: 657.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 659.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 663.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 667.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 669.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 675.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 676.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 677.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 683.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 684.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 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Chkmod> That is: 8945 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. 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2604291714313431110.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2604291714313431110.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2604291714313431110.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 2604291714313431110 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 2604291714313431110.eigenfacs 2604291714313431110.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2604291714313431110.eigenfacs 2604291714313431110.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2604291714313431110.eigenfacs 2604291714313431110.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2604291714313431110.eigenfacs 2604291714313431110.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2604291714313431110.eigenfacs 2604291714313431110.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2604291714313431110.eigenfacs 2604291714313431110.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2604291714313431110.eigenfacs 2604291714313431110.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2604291714313431110.eigenfacs 2604291714313431110.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2604291714313431110.eigenfacs 2604291714313431110.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2604291714313431110.eigenfacs 2604291714313431110.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2604291714313431110.eigenfacs 2604291714313431110.atom making animated gifs 11 models are in 2604291714313431110.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2604291714313431110.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2604291714313431110.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 2604291714313431110 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 2604291714313431110.eigenfacs 2604291714313431110.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2604291714313431110.eigenfacs 2604291714313431110.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2604291714313431110.eigenfacs 2604291714313431110.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2604291714313431110.eigenfacs 2604291714313431110.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2604291714313431110.eigenfacs 2604291714313431110.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2604291714313431110.eigenfacs 2604291714313431110.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2604291714313431110.eigenfacs 2604291714313431110.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2604291714313431110.eigenfacs 2604291714313431110.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2604291714313431110.eigenfacs 2604291714313431110.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2604291714313431110.eigenfacs 2604291714313431110.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2604291714313431110.eigenfacs 2604291714313431110.atom making animated gifs 11 models are in 2604291714313431110.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2604291714313431110.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2604291714313431110.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 2604291714313431110 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 2604291714313431110.eigenfacs 2604291714313431110.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2604291714313431110.eigenfacs 2604291714313431110.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2604291714313431110.eigenfacs 2604291714313431110.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2604291714313431110.eigenfacs 2604291714313431110.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2604291714313431110.eigenfacs 2604291714313431110.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2604291714313431110.eigenfacs 2604291714313431110.atom calculating perturbed structure for DQ=20 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100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2604291714313431110.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 2604291714313431110 11 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-100 2604291714313431110.eigenfacs 2604291714313431110.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2604291714313431110.eigenfacs 2604291714313431110.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2604291714313431110.eigenfacs 2604291714313431110.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2604291714313431110.eigenfacs 2604291714313431110.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2604291714313431110.eigenfacs 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MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2604291714313431110.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 2604291714313431110.10.pdb 2604291714313431110.11.pdb 2604291714313431110.7.pdb 2604291714313431110.8.pdb 2604291714313431110.9.pdb STDERR: Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL real 0m57.226s user 0m56.841s sys 0m0.335s rm: cannot remove '2604291714313431110.sdijf': No such file or directory pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: 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