*** ***
Output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 2604292046313457666.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 2604292046313457666.atom to be opened.
Openam> File opened: 2604292046313457666.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 1192
First residue number = 18
Last residue number = 315
Number of atoms found = 9024
Mean number per residue = 7.6
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 1.489573 +/- 23.722058 From: -52.410000 To: 52.399000
= -0.446772 +/- 14.285376 From: -38.178000 To: 33.639000
= 1.405778 +/- 21.126448 From: -51.371000 To: 51.069000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 0.9650 % Filled.
Pdbmat> 3536198 non-zero elements.
Pdbmat> 386956 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 85.76 +/- 22.67
Maximum number = 132
Minimum number = 17
Pdbmat> Matrix trace = 7.739120E+06
Pdbmat> Larger element = 507.389
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
1192 non-zero elements, NRBL set to 6
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 2604292046313457666.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 6
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 2604292046313457666.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
2604292046313457666.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 9024 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 6 residue(s) per block.
Blocpdb> 1192 residues.
Blocpdb> 47 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 47 atoms in block 2
Block first atom: 48
Blocpdb> 52 atoms in block 3
Block first atom: 95
Blocpdb> 50 atoms in block 4
Block first atom: 147
Blocpdb> 52 atoms in block 5
Block first atom: 197
Blocpdb> 47 atoms in block 6
Block first atom: 249
Blocpdb> 42 atoms in block 7
Block first atom: 296
Blocpdb> 50 atoms in block 8
Block first atom: 338
Blocpdb> 38 atoms in block 9
Block first atom: 388
Blocpdb> 48 atoms in block 10
Block first atom: 426
Blocpdb> 36 atoms in block 11
Block first atom: 474
Blocpdb> 43 atoms in block 12
Block first atom: 510
Blocpdb> 42 atoms in block 13
Block first atom: 553
Blocpdb> 45 atoms in block 14
Block first atom: 595
Blocpdb> 47 atoms in block 15
Block first atom: 640
Blocpdb> 47 atoms in block 16
Block first atom: 687
Blocpdb> 55 atoms in block 17
Block first atom: 734
Blocpdb> 50 atoms in block 18
Block first atom: 789
Blocpdb> 39 atoms in block 19
Block first atom: 839
Blocpdb> 45 atoms in block 20
Block first atom: 878
Blocpdb> 42 atoms in block 21
Block first atom: 923
Blocpdb> 38 atoms in block 22
Block first atom: 965
Blocpdb> 41 atoms in block 23
Block first atom: 1003
Blocpdb> 46 atoms in block 24
Block first atom: 1044
Blocpdb> 34 atoms in block 25
Block first atom: 1090
Blocpdb> 42 atoms in block 26
Block first atom: 1124
Blocpdb> 40 atoms in block 27
Block first atom: 1166
Blocpdb> 49 atoms in block 28
Block first atom: 1206
Blocpdb> 44 atoms in block 29
Block first atom: 1255
Blocpdb> 42 atoms in block 30
Block first atom: 1299
Blocpdb> 54 atoms in block 31
Block first atom: 1341
Blocpdb> 52 atoms in block 32
Block first atom: 1395
Blocpdb> 50 atoms in block 33
Block first atom: 1447
Blocpdb> 43 atoms in block 34
Block first atom: 1497
Blocpdb> 50 atoms in block 35
Block first atom: 1540
Blocpdb> 40 atoms in block 36
Block first atom: 1590
Blocpdb> 49 atoms in block 37
Block first atom: 1630
Blocpdb> 42 atoms in block 38
Block first atom: 1679
Blocpdb> 48 atoms in block 39
Block first atom: 1721
Blocpdb> 44 atoms in block 40
Block first atom: 1769
Blocpdb> 43 atoms in block 41
Block first atom: 1813
Blocpdb> 44 atoms in block 42
Block first atom: 1856
Blocpdb> 46 atoms in block 43
Block first atom: 1900
Blocpdb> 44 atoms in block 44
Block first atom: 1946
Blocpdb> 46 atoms in block 45
Block first atom: 1990
Blocpdb> 48 atoms in block 46
Block first atom: 2036
Blocpdb> 41 atoms in block 47
Block first atom: 2084
Blocpdb> 51 atoms in block 48
Block first atom: 2125
Blocpdb> 58 atoms in block 49
Block first atom: 2176
Blocpdb> 23 atoms in block 50
Block first atom: 2234
Blocpdb> 47 atoms in block 51
Block first atom: 2257
Blocpdb> 47 atoms in block 52
Block first atom: 2304
Blocpdb> 52 atoms in block 53
Block first atom: 2351
Blocpdb> 50 atoms in block 54
Block first atom: 2403
Blocpdb> 52 atoms in block 55
Block first atom: 2453
Blocpdb> 47 atoms in block 56
Block first atom: 2505
Blocpdb> 42 atoms in block 57
Block first atom: 2552
Blocpdb> 50 atoms in block 58
Block first atom: 2594
Blocpdb> 38 atoms in block 59
Block first atom: 2644
Blocpdb> 48 atoms in block 60
Block first atom: 2682
Blocpdb> 36 atoms in block 61
Block first atom: 2730
Blocpdb> 43 atoms in block 62
Block first atom: 2766
Blocpdb> 42 atoms in block 63
Block first atom: 2809
Blocpdb> 45 atoms in block 64
Block first atom: 2851
Blocpdb> 47 atoms in block 65
Block first atom: 2896
Blocpdb> 47 atoms in block 66
Block first atom: 2943
Blocpdb> 55 atoms in block 67
Block first atom: 2990
Blocpdb> 50 atoms in block 68
Block first atom: 3045
Blocpdb> 39 atoms in block 69
Block first atom: 3095
Blocpdb> 45 atoms in block 70
Block first atom: 3134
Blocpdb> 42 atoms in block 71
Block first atom: 3179
Blocpdb> 38 atoms in block 72
Block first atom: 3221
Blocpdb> 41 atoms in block 73
Block first atom: 3259
Blocpdb> 46 atoms in block 74
Block first atom: 3300
Blocpdb> 34 atoms in block 75
Block first atom: 3346
Blocpdb> 42 atoms in block 76
Block first atom: 3380
Blocpdb> 40 atoms in block 77
Block first atom: 3422
Blocpdb> 49 atoms in block 78
Block first atom: 3462
Blocpdb> 44 atoms in block 79
Block first atom: 3511
Blocpdb> 42 atoms in block 80
Block first atom: 3555
Blocpdb> 54 atoms in block 81
Block first atom: 3597
Blocpdb> 52 atoms in block 82
Block first atom: 3651
Blocpdb> 50 atoms in block 83
Block first atom: 3703
Blocpdb> 43 atoms in block 84
Block first atom: 3753
Blocpdb> 50 atoms in block 85
Block first atom: 3796
Blocpdb> 40 atoms in block 86
Block first atom: 3846
Blocpdb> 49 atoms in block 87
Block first atom: 3886
Blocpdb> 42 atoms in block 88
Block first atom: 3935
Blocpdb> 48 atoms in block 89
Block first atom: 3977
Blocpdb> 44 atoms in block 90
Block first atom: 4025
Blocpdb> 43 atoms in block 91
Block first atom: 4069
Blocpdb> 44 atoms in block 92
Block first atom: 4112
Blocpdb> 46 atoms in block 93
Block first atom: 4156
Blocpdb> 44 atoms in block 94
Block first atom: 4202
Blocpdb> 46 atoms in block 95
Block first atom: 4246
Blocpdb> 48 atoms in block 96
Block first atom: 4292
Blocpdb> 41 atoms in block 97
Block first atom: 4340
Blocpdb> 51 atoms in block 98
Block first atom: 4381
Blocpdb> 58 atoms in block 99
Block first atom: 4432
Blocpdb> 23 atoms in block 100
Block first atom: 4490
Blocpdb> 47 atoms in block 101
Block first atom: 4513
Blocpdb> 47 atoms in block 102
Block first atom: 4560
Blocpdb> 52 atoms in block 103
Block first atom: 4607
Blocpdb> 50 atoms in block 104
Block first atom: 4659
Blocpdb> 52 atoms in block 105
Block first atom: 4709
Blocpdb> 47 atoms in block 106
Block first atom: 4761
Blocpdb> 42 atoms in block 107
Block first atom: 4808
Blocpdb> 50 atoms in block 108
Block first atom: 4850
Blocpdb> 38 atoms in block 109
Block first atom: 4900
Blocpdb> 48 atoms in block 110
Block first atom: 4938
Blocpdb> 36 atoms in block 111
Block first atom: 4986
Blocpdb> 43 atoms in block 112
Block first atom: 5022
Blocpdb> 42 atoms in block 113
Block first atom: 5065
Blocpdb> 45 atoms in block 114
Block first atom: 5107
Blocpdb> 47 atoms in block 115
Block first atom: 5152
Blocpdb> 47 atoms in block 116
Block first atom: 5199
Blocpdb> 55 atoms in block 117
Block first atom: 5246
Blocpdb> 50 atoms in block 118
Block first atom: 5301
Blocpdb> 39 atoms in block 119
Block first atom: 5351
Blocpdb> 45 atoms in block 120
Block first atom: 5390
Blocpdb> 42 atoms in block 121
Block first atom: 5435
Blocpdb> 38 atoms in block 122
Block first atom: 5477
Blocpdb> 41 atoms in block 123
Block first atom: 5515
Blocpdb> 46 atoms in block 124
Block first atom: 5556
Blocpdb> 34 atoms in block 125
Block first atom: 5602
Blocpdb> 42 atoms in block 126
Block first atom: 5636
Blocpdb> 40 atoms in block 127
Block first atom: 5678
Blocpdb> 49 atoms in block 128
Block first atom: 5718
Blocpdb> 44 atoms in block 129
Block first atom: 5767
Blocpdb> 42 atoms in block 130
Block first atom: 5811
Blocpdb> 54 atoms in block 131
Block first atom: 5853
Blocpdb> 52 atoms in block 132
Block first atom: 5907
Blocpdb> 50 atoms in block 133
Block first atom: 5959
Blocpdb> 43 atoms in block 134
Block first atom: 6009
Blocpdb> 50 atoms in block 135
Block first atom: 6052
Blocpdb> 40 atoms in block 136
Block first atom: 6102
Blocpdb> 49 atoms in block 137
Block first atom: 6142
Blocpdb> 42 atoms in block 138
Block first atom: 6191
Blocpdb> 48 atoms in block 139
Block first atom: 6233
Blocpdb> 44 atoms in block 140
Block first atom: 6281
Blocpdb> 43 atoms in block 141
Block first atom: 6325
Blocpdb> 44 atoms in block 142
Block first atom: 6368
Blocpdb> 46 atoms in block 143
Block first atom: 6412
Blocpdb> 44 atoms in block 144
Block first atom: 6458
Blocpdb> 46 atoms in block 145
Block first atom: 6502
Blocpdb> 48 atoms in block 146
Block first atom: 6548
Blocpdb> 41 atoms in block 147
Block first atom: 6596
Blocpdb> 51 atoms in block 148
Block first atom: 6637
Blocpdb> 58 atoms in block 149
Block first atom: 6688
Blocpdb> 23 atoms in block 150
Block first atom: 6746
Blocpdb> 47 atoms in block 151
Block first atom: 6769
Blocpdb> 47 atoms in block 152
Block first atom: 6816
Blocpdb> 52 atoms in block 153
Block first atom: 6863
Blocpdb> 50 atoms in block 154
Block first atom: 6915
Blocpdb> 52 atoms in block 155
Block first atom: 6965
Blocpdb> 47 atoms in block 156
Block first atom: 7017
Blocpdb> 42 atoms in block 157
Block first atom: 7064
Blocpdb> 50 atoms in block 158
Block first atom: 7106
Blocpdb> 38 atoms in block 159
Block first atom: 7156
Blocpdb> 48 atoms in block 160
Block first atom: 7194
Blocpdb> 36 atoms in block 161
Block first atom: 7242
Blocpdb> 43 atoms in block 162
Block first atom: 7278
Blocpdb> 42 atoms in block 163
Block first atom: 7321
Blocpdb> 45 atoms in block 164
Block first atom: 7363
Blocpdb> 47 atoms in block 165
Block first atom: 7408
Blocpdb> 47 atoms in block 166
Block first atom: 7455
Blocpdb> 55 atoms in block 167
Block first atom: 7502
Blocpdb> 50 atoms in block 168
Block first atom: 7557
Blocpdb> 39 atoms in block 169
Block first atom: 7607
Blocpdb> 45 atoms in block 170
Block first atom: 7646
Blocpdb> 42 atoms in block 171
Block first atom: 7691
Blocpdb> 38 atoms in block 172
Block first atom: 7733
Blocpdb> 41 atoms in block 173
Block first atom: 7771
Blocpdb> 46 atoms in block 174
Block first atom: 7812
Blocpdb> 34 atoms in block 175
Block first atom: 7858
Blocpdb> 42 atoms in block 176
Block first atom: 7892
Blocpdb> 40 atoms in block 177
Block first atom: 7934
Blocpdb> 49 atoms in block 178
Block first atom: 7974
Blocpdb> 44 atoms in block 179
Block first atom: 8023
Blocpdb> 42 atoms in block 180
Block first atom: 8067
Blocpdb> 54 atoms in block 181
Block first atom: 8109
Blocpdb> 52 atoms in block 182
Block first atom: 8163
Blocpdb> 50 atoms in block 183
Block first atom: 8215
Blocpdb> 43 atoms in block 184
Block first atom: 8265
Blocpdb> 50 atoms in block 185
Block first atom: 8308
Blocpdb> 40 atoms in block 186
Block first atom: 8358
Blocpdb> 49 atoms in block 187
Block first atom: 8398
Blocpdb> 42 atoms in block 188
Block first atom: 8447
Blocpdb> 48 atoms in block 189
Block first atom: 8489
Blocpdb> 44 atoms in block 190
Block first atom: 8537
Blocpdb> 43 atoms in block 191
Block first atom: 8581
Blocpdb> 44 atoms in block 192
Block first atom: 8624
Blocpdb> 46 atoms in block 193
Block first atom: 8668
Blocpdb> 44 atoms in block 194
Block first atom: 8714
Blocpdb> 46 atoms in block 195
Block first atom: 8758
Blocpdb> 48 atoms in block 196
Block first atom: 8804
Blocpdb> 41 atoms in block 197
Block first atom: 8852
Blocpdb> 51 atoms in block 198
Block first atom: 8893
Blocpdb> 58 atoms in block 199
Block first atom: 8944
Blocpdb> 23 atoms in block 200
Block first atom: 9001
Blocpdb> 200 blocks.
Blocpdb> At most, 58 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 23 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 3536398 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 27072
Prepmat> Matrix trace = 7739120.0000
Prepmat> Last element read: 27072 27072 109.9359
Prepmat> 20101 lines saved.
Prepmat> 18340 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 9024
RTB> Total mass = 9024.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 9024
RTB> Number of blocks = 200
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 235008.6245
RTB> 60360 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 1200
Diagstd> Nb of non-zero elements: 60360
Diagstd> Projected matrix trace = 235008.6245
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 1200 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 235008.6245
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.0004590 0.0023907 0.0071732 0.0102342
0.0956570 0.1352382 1.4154060 1.4463078 1.5261657
1.5610789 3.0789178 3.1607918 6.4340104 6.5225568
6.6324819 6.7621851 7.0944757 7.1284093 11.8396015
11.8683491 11.9955531 12.1270946 13.5447726 13.5840889
13.5955788 13.6254042 15.4936612 15.5152337 16.3352692
16.3703279 18.4666623 18.5281744 18.5490836 18.6128827
19.2875217 19.3003157 19.6968234 19.7072531 19.8062463
19.8313814 21.1253942 21.1962065 21.4354475 21.5038685
21.9495228 21.9832793 23.2691654 23.3466063 23.8036641
23.8123003 24.1260757 24.1377369 25.1334597 25.2636862
25.5565255 25.6478517 27.0712738 27.1238712 27.8673712
27.9373300 28.4928167 28.5709909 29.0112873 29.0580787
29.3927747 29.4530886 29.9962923 30.0688736 30.8385561
30.8653905 32.1351438 32.3037292 32.7042059 32.8034689
32.8519083 32.9064051 34.0607314 34.3307390 34.9031161
35.0236231 35.8458830 35.9303149 36.1555831 36.1858441
37.7972244 37.8241295 37.9307058 37.9668635 38.2970624
38.3882573 39.3361174 39.6929844 40.2990613 40.5964702
40.6433053 40.7277451 40.7379207 40.9262057 41.4155006
41.4412135
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034306 0.0034324 0.0034336 0.0034337 0.0034346
0.0034362 2.3265658 5.3095299 9.1971406 10.9855434
33.5856343 39.9341977 129.1920528 130.5947290 134.1516827
135.6774623 190.5435842 193.0604116 275.4458034 277.3347014
279.6619092 282.3831692 289.2380560 289.9289587 373.6489992
374.1023493 376.1018063 378.1583221 399.6512163 400.2308283
400.4000570 400.8390068 427.4371920 427.7346582 438.8927711
439.3634941 466.6480810 467.4246330 467.6883043 468.4919155
476.9067777 477.0649249 481.9404469 482.0680261 483.2772679
483.5838225 499.1116313 499.9474431 502.7609720 503.5627281
508.7539828 509.1450423 523.8243507 524.6952828 529.8063839
529.9024847 533.3823291 533.5112174 544.4041376 545.8127034
548.9669321 549.9469240 565.0015324 565.5501433 573.2489679
573.9680645 579.6461728 580.4408000 584.8961733 585.3676639
588.7291957 589.3329216 594.7426292 595.4617375 603.0346926
603.2970040 615.5812800 617.1938794 621.0078419 621.9495622
622.4085948 622.9246260 633.7562642 636.2632746 641.5453791
642.6519291 650.1520286 650.9172665 652.9545696 653.2277622
667.6136917 667.8512621 668.7914963 669.1101852 672.0135211
672.8131622 681.0688632 684.1513011 689.3547065 691.8937657
692.2927601 693.0115351 693.0981020 694.6979573 698.8383630
699.0552676
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 9024
Rtb_to_modes> Number of blocs = 200
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9806E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9907E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9980E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9982E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0004E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0013E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.5903E-04
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.3907E-03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.1732E-03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0234E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.5657E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1352
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.415
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.446
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.526
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.561
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.079
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.161
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.434
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.523
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.632
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.762
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.094
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.128
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.84
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.87
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.00
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.13
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.54
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.58
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.60
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.63
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.49
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.52
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.34
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.37
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.47
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.53
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.55
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.61
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.29
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.30
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.70
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.71
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.81
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.83
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.13
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.20
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.44
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.50
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.95
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.98
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.27
Rdmodfacs> Eigenvector number: 54
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.35
Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.80
Rdmodfacs> Eigenvector number: 56
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.81
Rdmodfacs> Eigenvector number: 57
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.13
Rdmodfacs> Eigenvector number: 58
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.14
Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.13
Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.26
Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.56
Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.65
Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.07
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.12
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.87
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.94
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.49
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.57
Rdmodfacs> Eigenvector number: 69
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.01
Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.06
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.39
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.45
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.00
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.07
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.84
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.87
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.14
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.30
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.70
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.80
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.85
Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.91
Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.06
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.33
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.90
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.85
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.93
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.16
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.19
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.80
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.82
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.93
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.97
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.30
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.39
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.34
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.69
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.30
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.60
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.64
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.73
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.74
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.93
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.42
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.44
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1200 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000
1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001
1.00001 1.00000 1.00001 1.00002 1.00002
1.00001 1.00000 0.99999 1.00003 1.00001
1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 0.99998
1.00001 1.00002 0.99998 0.99999 0.99999
1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000
0.99999 1.00001 1.00002 1.00002 0.99998
0.99999 0.99999 1.00002 0.99998 1.00000
0.99998 0.99998 0.99996 0.99999 0.99999
1.00002 0.99997 1.00001 1.00002 1.00001
0.99999 1.00002 1.00001 1.00001 0.99999
1.00002 1.00001 1.00000 1.00002 1.00002
0.99996 1.00001 1.00000 1.00003 1.00000
1.00002 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002
0.99998 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000
0.99998 1.00000 1.00000 0.99998 0.99999
0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001
1.00001 0.99996 1.00000 1.00000 1.00001
1.00002 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001
0.99999 0.99999 0.99999 1.00001 1.00001
0.99999
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 162432 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000
1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001
1.00001 1.00000 1.00001 1.00002 1.00002
1.00001 1.00000 0.99999 1.00003 1.00001
1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 0.99998
1.00001 1.00002 0.99998 0.99999 0.99999
1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000
0.99999 1.00001 1.00002 1.00002 0.99998
0.99999 0.99999 1.00002 0.99998 1.00000
0.99998 0.99998 0.99996 0.99999 0.99999
1.00002 0.99997 1.00001 1.00002 1.00001
0.99999 1.00002 1.00001 1.00001 0.99999
1.00002 1.00001 1.00000 1.00002 1.00002
0.99996 1.00001 1.00000 1.00003 1.00000
1.00002 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002
0.99998 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000
0.99998 1.00000 1.00000 0.99998 0.99999
0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001
1.00001 0.99996 1.00000 1.00000 1.00001
1.00002 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001
0.99999 0.99999 0.99999 1.00001 1.00001
0.99999
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2: 0.000
Vector 3:-0.000-0.000
Vector 4:-0.000 0.000-0.000
Vector 5: 0.000 0.000-0.000-0.000
Vector 6:-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000
Vector 7: 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000
Vector 8:-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 9:-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000
Vector 10:-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2604292046313457666.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2604292046313457666.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 2604292046313457666.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2604292046313457666.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 1192
First residue number = 18
Last residue number = 315
Number of atoms found = 9024
Mean number per residue = 7.6
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9806E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9907E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9980E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9982E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0004E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0013E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.5903E-04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.3907E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.1732E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0234E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.5657E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1352
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.415
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.446
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.526
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.561
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.079
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.161
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.434
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.523
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.632
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.762
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.094
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.128
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.84
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.87
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.00
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.81
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.87
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.45
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.00
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.87
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.80
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.85
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.85
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.16
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.80
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.82
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.97
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.69
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.44
Bfactors> 106 vectors, 27072 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.000459
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= -0.159 for 1192 C-alpha atoms.
Bfactors> = 4.870 +/- 2.68
Bfactors> = 87.664 +/- 8.48
Bfactors> Shiftng-fct= 82.794
Bfactors> Scaling-fct= 3.159
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2604292046313457666.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2604292046313457666.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4305E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4322E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4335E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4335E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4345E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4360E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 2.326
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 5.309
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 9.197
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 10.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 33.58
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 39.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 129.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 130.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 134.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 135.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 190.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 193.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 275.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 277.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 279.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 282.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 289.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 289.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 373.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 374.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 376.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 378.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 399.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 400.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 400.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 400.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 427.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 427.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 438.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 439.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 466.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 467.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 467.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 468.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 476.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 477.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 482.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 482.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 483.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 483.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 499.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 500.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 502.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 503.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 508.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 509.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 523.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 524.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 529.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 529.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 533.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 533.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 544.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 545.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 549.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 549.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 565.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 565.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 573.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 574.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 579.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 580.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 584.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 585.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 588.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 589.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 594.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 595.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 603.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 603.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 615.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 617.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 620.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 621.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 622.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 622.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 633.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 636.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 641.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 642.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 650.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 650.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 653.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 653.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 667.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 667.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 668.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 669.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 672.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 672.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 681.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 684.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 689.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 691.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 692.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 693.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 693.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 694.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 698.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 699.0
Chkmod> 106 vectors, 27072 coordinates in file.
Chkmod> That is: 9024 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.9966
0.0034 0.8542
0.0034 0.6846
0.0034 0.7505
0.0034 0.8604
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making thumbnail 100x100
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STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 0m53.347s
user 0m52.990s
sys 0m0.326s
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