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LOGs for ID: 2604292046453457696

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2604292046453457696.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2604292046453457696.atom to be opened. Openam> File opened: 2604292046453457696.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 1192 First residue number = 18 Last residue number = 315 Number of atoms found = 9024 Mean number per residue = 7.6 Pdbmat> Coordinate statistics: = 0.111877 +/- 18.969960 From: -41.523000 To: 42.083000 = -0.236558 +/- 19.055016 From: -40.190000 To: 40.367000 = 1.225199 +/- 18.004937 From: -39.614000 To: 41.341000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 0.9897 % Filled. Pdbmat> 3626757 non-zero elements. Pdbmat> 397012 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 87.99 +/- 22.36 Maximum number = 134 Minimum number = 17 Pdbmat> Matrix trace = 7.940240E+06 Pdbmat> Larger element = 493.759 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 1192 non-zero elements, NRBL set to 6 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2604292046453457696.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 6 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2604292046453457696.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2604292046453457696.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 9024 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 6 residue(s) per block. Blocpdb> 1192 residues. Blocpdb> 47 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 47 atoms in block 2 Block first atom: 48 Blocpdb> 52 atoms in block 3 Block first atom: 95 Blocpdb> 50 atoms in block 4 Block first atom: 147 Blocpdb> 52 atoms in block 5 Block first atom: 197 Blocpdb> 47 atoms in block 6 Block first atom: 249 Blocpdb> 42 atoms in block 7 Block first atom: 296 Blocpdb> 50 atoms in block 8 Block first atom: 338 Blocpdb> 38 atoms in block 9 Block first atom: 388 Blocpdb> 48 atoms in block 10 Block first atom: 426 Blocpdb> 36 atoms in block 11 Block first atom: 474 Blocpdb> 43 atoms in block 12 Block first atom: 510 Blocpdb> 42 atoms in block 13 Block first atom: 553 Blocpdb> 45 atoms in block 14 Block first atom: 595 Blocpdb> 47 atoms in block 15 Block first atom: 640 Blocpdb> 47 atoms in block 16 Block first atom: 687 Blocpdb> 55 atoms in block 17 Block first atom: 734 Blocpdb> 50 atoms in block 18 Block first atom: 789 Blocpdb> 39 atoms in block 19 Block first atom: 839 Blocpdb> 45 atoms in block 20 Block first atom: 878 Blocpdb> 42 atoms in block 21 Block first atom: 923 Blocpdb> 38 atoms in block 22 Block first atom: 965 Blocpdb> 41 atoms in block 23 Block first atom: 1003 Blocpdb> 46 atoms in block 24 Block first atom: 1044 Blocpdb> 34 atoms in block 25 Block first atom: 1090 Blocpdb> 42 atoms in block 26 Block first atom: 1124 Blocpdb> 40 atoms in block 27 Block first atom: 1166 Blocpdb> 49 atoms in block 28 Block first atom: 1206 Blocpdb> 44 atoms in block 29 Block first atom: 1255 Blocpdb> 42 atoms in block 30 Block first atom: 1299 Blocpdb> 54 atoms in block 31 Block first atom: 1341 Blocpdb> 52 atoms in block 32 Block first atom: 1395 Blocpdb> 50 atoms in block 33 Block first atom: 1447 Blocpdb> 43 atoms in block 34 Block first atom: 1497 Blocpdb> 50 atoms in block 35 Block first atom: 1540 Blocpdb> 40 atoms in block 36 Block first atom: 1590 Blocpdb> 49 atoms in block 37 Block first atom: 1630 Blocpdb> 42 atoms in block 38 Block first atom: 1679 Blocpdb> 48 atoms in block 39 Block first atom: 1721 Blocpdb> 44 atoms in block 40 Block first atom: 1769 Blocpdb> 43 atoms in block 41 Block first atom: 1813 Blocpdb> 44 atoms in block 42 Block first atom: 1856 Blocpdb> 46 atoms in block 43 Block first atom: 1900 Blocpdb> 44 atoms in block 44 Block first atom: 1946 Blocpdb> 46 atoms in block 45 Block first atom: 1990 Blocpdb> 48 atoms in block 46 Block first atom: 2036 Blocpdb> 41 atoms in block 47 Block first atom: 2084 Blocpdb> 51 atoms in block 48 Block first atom: 2125 Blocpdb> 58 atoms in block 49 Block first atom: 2176 Blocpdb> 23 atoms in block 50 Block first atom: 2234 Blocpdb> 47 atoms in block 51 Block first atom: 2257 Blocpdb> 47 atoms in block 52 Block first atom: 2304 Blocpdb> 52 atoms in block 53 Block first atom: 2351 Blocpdb> 50 atoms in block 54 Block first atom: 2403 Blocpdb> 52 atoms in block 55 Block first atom: 2453 Blocpdb> 47 atoms in block 56 Block first atom: 2505 Blocpdb> 42 atoms in block 57 Block first atom: 2552 Blocpdb> 50 atoms in block 58 Block first atom: 2594 Blocpdb> 38 atoms in block 59 Block first atom: 2644 Blocpdb> 48 atoms in block 60 Block first atom: 2682 Blocpdb> 36 atoms in block 61 Block first atom: 2730 Blocpdb> 43 atoms in block 62 Block first atom: 2766 Blocpdb> 42 atoms in block 63 Block first atom: 2809 Blocpdb> 45 atoms in block 64 Block first atom: 2851 Blocpdb> 47 atoms in block 65 Block first atom: 2896 Blocpdb> 47 atoms in block 66 Block first atom: 2943 Blocpdb> 55 atoms in block 67 Block first atom: 2990 Blocpdb> 50 atoms in block 68 Block first atom: 3045 Blocpdb> 39 atoms in block 69 Block first atom: 3095 Blocpdb> 45 atoms in block 70 Block first atom: 3134 Blocpdb> 42 atoms in block 71 Block first atom: 3179 Blocpdb> 38 atoms in block 72 Block first atom: 3221 Blocpdb> 41 atoms in block 73 Block first atom: 3259 Blocpdb> 46 atoms in block 74 Block first atom: 3300 Blocpdb> 34 atoms in block 75 Block first atom: 3346 Blocpdb> 42 atoms in block 76 Block first atom: 3380 Blocpdb> 40 atoms in block 77 Block first atom: 3422 Blocpdb> 49 atoms in block 78 Block first atom: 3462 Blocpdb> 44 atoms in block 79 Block first atom: 3511 Blocpdb> 42 atoms in block 80 Block first atom: 3555 Blocpdb> 54 atoms in block 81 Block first atom: 3597 Blocpdb> 52 atoms in block 82 Block first atom: 3651 Blocpdb> 50 atoms in block 83 Block first atom: 3703 Blocpdb> 43 atoms in block 84 Block first atom: 3753 Blocpdb> 50 atoms in block 85 Block first atom: 3796 Blocpdb> 40 atoms in block 86 Block first atom: 3846 Blocpdb> 49 atoms in block 87 Block first atom: 3886 Blocpdb> 42 atoms in block 88 Block first atom: 3935 Blocpdb> 48 atoms in block 89 Block first atom: 3977 Blocpdb> 44 atoms in block 90 Block first atom: 4025 Blocpdb> 43 atoms in block 91 Block first atom: 4069 Blocpdb> 44 atoms in block 92 Block first atom: 4112 Blocpdb> 46 atoms in block 93 Block first atom: 4156 Blocpdb> 44 atoms in block 94 Block first atom: 4202 Blocpdb> 46 atoms in block 95 Block first atom: 4246 Blocpdb> 48 atoms in block 96 Block first atom: 4292 Blocpdb> 41 atoms in block 97 Block first atom: 4340 Blocpdb> 51 atoms in block 98 Block first atom: 4381 Blocpdb> 58 atoms in block 99 Block first atom: 4432 Blocpdb> 23 atoms in block 100 Block first atom: 4490 Blocpdb> 47 atoms in block 101 Block first atom: 4513 Blocpdb> 47 atoms in block 102 Block first atom: 4560 Blocpdb> 52 atoms in block 103 Block first atom: 4607 Blocpdb> 50 atoms in block 104 Block first atom: 4659 Blocpdb> 52 atoms in block 105 Block first atom: 4709 Blocpdb> 47 atoms in block 106 Block first atom: 4761 Blocpdb> 42 atoms in block 107 Block first atom: 4808 Blocpdb> 50 atoms in block 108 Block first atom: 4850 Blocpdb> 38 atoms in block 109 Block first atom: 4900 Blocpdb> 48 atoms in block 110 Block first atom: 4938 Blocpdb> 36 atoms in block 111 Block first atom: 4986 Blocpdb> 43 atoms in block 112 Block first atom: 5022 Blocpdb> 42 atoms in block 113 Block first atom: 5065 Blocpdb> 45 atoms in block 114 Block first atom: 5107 Blocpdb> 47 atoms in block 115 Block first atom: 5152 Blocpdb> 47 atoms in block 116 Block first atom: 5199 Blocpdb> 55 atoms in block 117 Block first atom: 5246 Blocpdb> 50 atoms in block 118 Block first atom: 5301 Blocpdb> 39 atoms in block 119 Block first atom: 5351 Blocpdb> 45 atoms in block 120 Block first atom: 5390 Blocpdb> 42 atoms in block 121 Block first atom: 5435 Blocpdb> 38 atoms in block 122 Block first atom: 5477 Blocpdb> 41 atoms in block 123 Block first atom: 5515 Blocpdb> 46 atoms in block 124 Block first atom: 5556 Blocpdb> 34 atoms in block 125 Block first atom: 5602 Blocpdb> 42 atoms in block 126 Block first atom: 5636 Blocpdb> 40 atoms in block 127 Block first atom: 5678 Blocpdb> 49 atoms in block 128 Block first atom: 5718 Blocpdb> 44 atoms in block 129 Block first atom: 5767 Blocpdb> 42 atoms in block 130 Block first atom: 5811 Blocpdb> 54 atoms in block 131 Block first atom: 5853 Blocpdb> 52 atoms in block 132 Block first atom: 5907 Blocpdb> 50 atoms in block 133 Block first atom: 5959 Blocpdb> 43 atoms in block 134 Block first atom: 6009 Blocpdb> 50 atoms in block 135 Block first atom: 6052 Blocpdb> 40 atoms in block 136 Block first atom: 6102 Blocpdb> 49 atoms in block 137 Block first atom: 6142 Blocpdb> 42 atoms in block 138 Block first atom: 6191 Blocpdb> 48 atoms in block 139 Block first atom: 6233 Blocpdb> 44 atoms in block 140 Block first atom: 6281 Blocpdb> 43 atoms in block 141 Block first atom: 6325 Blocpdb> 44 atoms in block 142 Block first atom: 6368 Blocpdb> 46 atoms in block 143 Block first atom: 6412 Blocpdb> 44 atoms in block 144 Block first atom: 6458 Blocpdb> 46 atoms in block 145 Block first atom: 6502 Blocpdb> 48 atoms in block 146 Block first atom: 6548 Blocpdb> 41 atoms in block 147 Block first atom: 6596 Blocpdb> 51 atoms in block 148 Block first atom: 6637 Blocpdb> 58 atoms in block 149 Block first atom: 6688 Blocpdb> 23 atoms in block 150 Block first atom: 6746 Blocpdb> 47 atoms in block 151 Block first atom: 6769 Blocpdb> 47 atoms in block 152 Block first atom: 6816 Blocpdb> 52 atoms in block 153 Block first atom: 6863 Blocpdb> 50 atoms in block 154 Block first atom: 6915 Blocpdb> 52 atoms in block 155 Block first atom: 6965 Blocpdb> 47 atoms in block 156 Block first atom: 7017 Blocpdb> 42 atoms in block 157 Block first atom: 7064 Blocpdb> 50 atoms in block 158 Block first atom: 7106 Blocpdb> 38 atoms in block 159 Block first atom: 7156 Blocpdb> 48 atoms in block 160 Block first atom: 7194 Blocpdb> 36 atoms in block 161 Block first atom: 7242 Blocpdb> 43 atoms in block 162 Block first atom: 7278 Blocpdb> 42 atoms in block 163 Block first atom: 7321 Blocpdb> 45 atoms in block 164 Block first atom: 7363 Blocpdb> 47 atoms in block 165 Block first atom: 7408 Blocpdb> 47 atoms in block 166 Block first atom: 7455 Blocpdb> 55 atoms in block 167 Block first atom: 7502 Blocpdb> 50 atoms in block 168 Block first atom: 7557 Blocpdb> 39 atoms in block 169 Block first atom: 7607 Blocpdb> 45 atoms in block 170 Block first atom: 7646 Blocpdb> 42 atoms in block 171 Block first atom: 7691 Blocpdb> 38 atoms in block 172 Block first atom: 7733 Blocpdb> 41 atoms in block 173 Block first atom: 7771 Blocpdb> 46 atoms in block 174 Block first atom: 7812 Blocpdb> 34 atoms in block 175 Block first atom: 7858 Blocpdb> 42 atoms in block 176 Block first atom: 7892 Blocpdb> 40 atoms in block 177 Block first atom: 7934 Blocpdb> 49 atoms in block 178 Block first atom: 7974 Blocpdb> 44 atoms in block 179 Block first atom: 8023 Blocpdb> 42 atoms in block 180 Block first atom: 8067 Blocpdb> 54 atoms in block 181 Block first atom: 8109 Blocpdb> 52 atoms in block 182 Block first atom: 8163 Blocpdb> 50 atoms in block 183 Block first atom: 8215 Blocpdb> 43 atoms in block 184 Block first atom: 8265 Blocpdb> 50 atoms in block 185 Block first atom: 8308 Blocpdb> 40 atoms in block 186 Block first atom: 8358 Blocpdb> 49 atoms in block 187 Block first atom: 8398 Blocpdb> 42 atoms in block 188 Block first atom: 8447 Blocpdb> 48 atoms in block 189 Block first atom: 8489 Blocpdb> 44 atoms in block 190 Block first atom: 8537 Blocpdb> 43 atoms in block 191 Block first atom: 8581 Blocpdb> 44 atoms in block 192 Block first atom: 8624 Blocpdb> 46 atoms in block 193 Block first atom: 8668 Blocpdb> 44 atoms in block 194 Block first atom: 8714 Blocpdb> 46 atoms in block 195 Block first atom: 8758 Blocpdb> 48 atoms in block 196 Block first atom: 8804 Blocpdb> 41 atoms in block 197 Block first atom: 8852 Blocpdb> 51 atoms in block 198 Block first atom: 8893 Blocpdb> 58 atoms in block 199 Block first atom: 8944 Blocpdb> 23 atoms in block 200 Block first atom: 9001 Blocpdb> 200 blocks. Blocpdb> At most, 58 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 23 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 3626957 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 27072 Prepmat> Matrix trace = 7940240.0000 Prepmat> Last element read: 27072 27072 147.2112 Prepmat> 20101 lines saved. Prepmat> 18242 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 9024 RTB> Total mass = 9024.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 9024 RTB> Number of blocks = 200 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 243233.1843 RTB> 63888 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1200 Diagstd> Nb of non-zero elements: 63888 Diagstd> Projected matrix trace = 243233.1843 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1200 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 243233.1843 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.4672005 0.6406925 1.3445286 1.9966870 2.3596934 2.6067147 3.1113265 3.5253172 3.6937301 4.0687141 4.3437536 5.2504449 8.0164310 8.1067770 10.4350937 10.6698223 11.1935476 11.5456608 13.7239250 13.7637028 14.3111744 14.4756936 14.7167637 14.8591578 15.3001422 15.6009601 16.9313031 17.2277986 17.2456945 17.3264163 19.8812250 20.1213205 20.2646395 20.6348489 20.7493246 20.8206906 20.8952547 21.1883405 21.8006348 21.8802954 22.0054712 22.1900858 23.7127554 23.7250986 23.8291386 24.2139208 25.0997072 25.2213317 25.4510744 25.5001999 26.0626128 27.0272657 27.8128263 28.9034011 29.2263183 29.2650378 29.6981430 29.7172596 29.8778898 30.1089546 30.6669758 31.1177082 31.3947406 32.1800356 32.3895200 33.8424640 33.8922887 34.0777000 34.1775518 34.4891782 35.1669288 35.9112331 35.9661270 36.1756771 36.3518699 36.6509822 36.8740734 37.0964264 38.6692739 38.7570485 38.9375496 39.0666353 39.9313550 40.2239235 40.4928045 40.5765536 40.6995007 40.7816101 40.8855188 41.4001786 41.6223983 42.3280072 42.6273025 43.2795729 43.9236206 45.0158278 45.2277193 45.3523340 46.4586398 46.7416151 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034324 0.0034330 0.0034333 0.0034340 0.0034342 0.0034357 74.2244425 86.9200738 125.9158235 153.4441292 166.8103790 175.3242676 191.5437886 203.8892747 208.7026008 219.0402209 226.3225723 248.8246113 307.4580077 309.1856953 350.7869732 354.7103612 363.3115089 368.9815718 402.2855633 402.8681403 410.8023475 413.1568637 416.5829000 418.5934016 424.7594151 428.9147124 446.8280948 450.7234700 450.9575102 452.0116750 484.1911536 487.1060452 488.8377330 493.2827485 494.6491454 495.4990715 496.3855323 499.8546679 507.0255565 507.9510592 509.4019655 511.5343137 528.7937227 528.9313310 530.0898055 534.3524924 544.0384669 545.3549849 547.8331901 548.3616482 554.3757906 564.5421022 572.6876824 583.8076145 587.0597904 587.4485350 591.7795151 591.9699473 593.5676740 595.8584718 601.3547633 605.7578940 608.4483669 616.0111039 618.0128944 631.7223878 632.1872445 633.9141092 634.8421528 637.7297885 643.9653521 650.7443994 651.2415734 653.1359888 654.7245987 657.4126992 659.4104693 661.3956247 675.2712953 676.0372535 677.6096607 678.7319363 686.2025130 688.7117544 691.0098030 691.7240234 692.7711939 693.4696589 694.3525527 698.7090805 700.5817677 706.4951611 708.9885242 714.3922974 719.6881405 728.5810994 730.2938179 731.2992056 740.1649674 742.4156834 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 9024 Rtb_to_modes> Number of blocs = 200 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9906E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9942E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9964E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0010E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4672 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6407 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.345 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.997 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.360 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.607 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.111 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.525 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.694 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.069 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.344 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.250 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.016 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.107 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.74 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1200 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00002 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 0.99997 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 0.99997 1.00001 0.99998 0.99998 1.00000 0.99998 0.99999 0.99997 1.00002 1.00003 1.00000 1.00002 1.00001 1.00002 0.99997 1.00001 0.99997 0.99996 1.00002 0.99997 1.00000 1.00001 1.00003 0.99999 0.99995 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 1.00002 1.00002 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00003 1.00000 1.00001 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 1.00002 1.00002 0.99998 0.99998 0.99999 1.00000 0.99998 1.00000 0.99998 1.00002 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 162432 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00002 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 0.99997 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 0.99997 1.00001 0.99998 0.99998 1.00000 0.99998 0.99999 0.99997 1.00002 1.00003 1.00000 1.00002 1.00001 1.00002 0.99997 1.00001 0.99997 0.99996 1.00002 0.99997 1.00000 1.00001 1.00003 0.99999 0.99995 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 1.00002 1.00002 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00003 1.00000 1.00001 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 1.00002 1.00002 0.99998 0.99998 0.99999 1.00000 0.99998 1.00000 0.99998 1.00002 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3:-0.000 0.000 Vector 4:-0.000 0.000-0.000 Vector 5: 0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 6:-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 7:-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 8:-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 9: 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 10: 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2604292046453457696.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2604292046453457696.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2604292046453457696.atom Openam> file on opening on unit 11: 2604292046453457696.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 1192 First residue number = 18 Last residue number = 315 Number of atoms found = 9024 Mean number per residue = 7.6 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9906E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9942E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9964E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0010E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4672 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6407 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.345 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.997 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.360 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.607 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.111 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.525 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.694 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.069 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.344 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.250 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.016 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.107 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.74 Bfactors> 106 vectors, 27072 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.467200 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= -0.034 for 1192 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.019 +/- 0.01 Bfactors> = 87.003 +/- 9.04 Bfactors> Shiftng-fct= 86.984 Bfactors> Scaling-fct= 702.151 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2604292046453457696.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2604292046453457696.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4322E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4328E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4332E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4355E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 74.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 86.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 125.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 153.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 166.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 175.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 191.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 203.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 208.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 219.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 226.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 248.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 307.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 309.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 350.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 354.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 363.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 369.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 402.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 402.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 410.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 413.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 416.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 418.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 424.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 428.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 446.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 450.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 451.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 452.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 484.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 487.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 488.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 493.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 494.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 495.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 496.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 499.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 507.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 507.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 509.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 511.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 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CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 572.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 583.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 587.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 587.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 591.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 592.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 593.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 595.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 601.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 605.8 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vecteur en lecture: 650.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 651.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 653.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 654.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 657.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 659.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 661.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 675.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 676.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 677.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 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Chkmod> That is: 9024 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. Chkmod> Normal end. 0.0034 0.7147 0.0034 0.7368 0.0034 0.9960 0.0034 0.9730 0.0034 0.8079 0.0034 0.7756 74.2212 0.7495 86.9169 0.7960 125.9325 0.7236 153.4496 0.9047 166.8141 0.5566 175.3263 0.6775 191.5255 0.7718 203.8713 0.6204 208.7013 0.6192 219.0385 0.7672 226.3193 0.6676 248.8034 0.7385 307.4365 0.7533 309.1767 0.6646 350.8544 0.6683 354.6981 0.7292 363.2383 0.7044 369.0351 0.7468 402.2108 0.3320 402.7967 0.2856 410.7679 0.5025 413.2006 0.4053 416.6108 0.2396 418.5873 0.3736 424.7392 0.4278 428.8831 0.4298 446.7917 0.4240 450.7329 0.2682 450.9944 0.2826 452.0390 0.2307 484.1555 0.3193 487.0692 0.2657 488.7608 0.2600 493.2036 0.3174 494.6360 0.4711 495.4696 0.4497 496.4206 0.4400 499.8528 0.3264 506.9964 0.0859 507.9258 0.0839 509.4325 0.1730 511.5114 0.2040 528.7403 0.4479 528.9633 0.2575 530.0766 0.2691 534.2863 0.3579 544.0183 0.5564 545.3172 0.4367 547.7981 0.5404 548.3360 0.5742 554.3242 0.5752 564.5464 0.5723 572.6340 0.5758 583.7482 0.7184 587.0716 0.6869 587.4731 0.5161 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DQ=-80 2604292046453457696.eigenfacs 2604292046453457696.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2604292046453457696.eigenfacs 2604292046453457696.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2604292046453457696.eigenfacs 2604292046453457696.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2604292046453457696.eigenfacs 2604292046453457696.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2604292046453457696.eigenfacs 2604292046453457696.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2604292046453457696.eigenfacs 2604292046453457696.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2604292046453457696.eigenfacs 2604292046453457696.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2604292046453457696.eigenfacs 2604292046453457696.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2604292046453457696.eigenfacs 2604292046453457696.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2604292046453457696.eigenfacs 2604292046453457696.atom making animated gifs 11 models are in 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generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 2604292046453457696.eigenfacs 2604292046453457696.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2604292046453457696.eigenfacs 2604292046453457696.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2604292046453457696.eigenfacs 2604292046453457696.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2604292046453457696.eigenfacs 2604292046453457696.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2604292046453457696.eigenfacs 2604292046453457696.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2604292046453457696.eigenfacs 2604292046453457696.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2604292046453457696.eigenfacs 2604292046453457696.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2604292046453457696.eigenfacs 2604292046453457696.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2604292046453457696.eigenfacs 2604292046453457696.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2604292046453457696.eigenfacs 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animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 2604292046453457696 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 2604292046453457696.eigenfacs 2604292046453457696.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2604292046453457696.eigenfacs 2604292046453457696.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2604292046453457696.eigenfacs 2604292046453457696.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2604292046453457696.eigenfacs 2604292046453457696.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2604292046453457696.eigenfacs 2604292046453457696.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2604292046453457696.eigenfacs 2604292046453457696.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2604292046453457696.eigenfacs 2604292046453457696.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2604292046453457696.eigenfacs 2604292046453457696.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2604292046453457696.eigenfacs 2604292046453457696.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2604292046453457696.eigenfacs 2604292046453457696.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2604292046453457696.eigenfacs 2604292046453457696.atom making animated gifs 11 models are in 2604292046453457696.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2604292046453457696.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2604292046453457696.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 2604292046453457696 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 2604292046453457696.eigenfacs 2604292046453457696.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2604292046453457696.eigenfacs 2604292046453457696.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2604292046453457696.eigenfacs 2604292046453457696.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2604292046453457696.eigenfacs 2604292046453457696.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2604292046453457696.eigenfacs 2604292046453457696.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2604292046453457696.eigenfacs 2604292046453457696.atom calculating perturbed structure for DQ=20 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