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LOGs for ID: 2604292046573457726

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2604292046573457726.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2604292046573457726.atom to be opened. Openam> File opened: 2604292046573457726.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 1192 First residue number = 18 Last residue number = 315 Number of atoms found = 9048 Mean number per residue = 7.6 Pdbmat> Coordinate statistics: = -1.092404 +/- 17.902450 From: -46.430000 To: 40.700000 = 0.035375 +/- 17.515146 From: -47.916000 To: 40.962000 = 0.379222 +/- 21.026826 From: -43.258000 To: 46.560000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 0.9718 % Filled. Pdbmat> 3580402 non-zero elements. Pdbmat> 391856 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 86.62 +/- 22.83 Maximum number = 135 Minimum number = 20 Pdbmat> Matrix trace = 7.837120E+06 Pdbmat> Larger element = 497.930 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 1192 non-zero elements, NRBL set to 6 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2604292046573457726.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 6 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2604292046573457726.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2604292046573457726.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 9048 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 6 residue(s) per block. Blocpdb> 1192 residues. Blocpdb> 47 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 47 atoms in block 2 Block first atom: 48 Blocpdb> 52 atoms in block 3 Block first atom: 95 Blocpdb> 50 atoms in block 4 Block first atom: 147 Blocpdb> 52 atoms in block 5 Block first atom: 197 Blocpdb> 47 atoms in block 6 Block first atom: 249 Blocpdb> 42 atoms in block 7 Block first atom: 296 Blocpdb> 50 atoms in block 8 Block first atom: 338 Blocpdb> 38 atoms in block 9 Block first atom: 388 Blocpdb> 48 atoms in block 10 Block first atom: 426 Blocpdb> 42 atoms in block 11 Block first atom: 474 Blocpdb> 43 atoms in block 12 Block first atom: 516 Blocpdb> 42 atoms in block 13 Block first atom: 559 Blocpdb> 45 atoms in block 14 Block first atom: 601 Blocpdb> 47 atoms in block 15 Block first atom: 646 Blocpdb> 47 atoms in block 16 Block first atom: 693 Blocpdb> 55 atoms in block 17 Block first atom: 740 Blocpdb> 50 atoms in block 18 Block first atom: 795 Blocpdb> 39 atoms in block 19 Block first atom: 845 Blocpdb> 45 atoms in block 20 Block first atom: 884 Blocpdb> 42 atoms in block 21 Block first atom: 929 Blocpdb> 38 atoms in block 22 Block first atom: 971 Blocpdb> 41 atoms in block 23 Block first atom: 1009 Blocpdb> 46 atoms in block 24 Block first atom: 1050 Blocpdb> 34 atoms in block 25 Block first atom: 1096 Blocpdb> 42 atoms in block 26 Block first atom: 1130 Blocpdb> 40 atoms in block 27 Block first atom: 1172 Blocpdb> 49 atoms in block 28 Block first atom: 1212 Blocpdb> 44 atoms in block 29 Block first atom: 1261 Blocpdb> 42 atoms in block 30 Block first atom: 1305 Blocpdb> 54 atoms in block 31 Block first atom: 1347 Blocpdb> 52 atoms in block 32 Block first atom: 1401 Blocpdb> 50 atoms in block 33 Block first atom: 1453 Blocpdb> 43 atoms in block 34 Block first atom: 1503 Blocpdb> 50 atoms in block 35 Block first atom: 1546 Blocpdb> 40 atoms in block 36 Block first atom: 1596 Blocpdb> 49 atoms in block 37 Block first atom: 1636 Blocpdb> 42 atoms in block 38 Block first atom: 1685 Blocpdb> 48 atoms in block 39 Block first atom: 1727 Blocpdb> 44 atoms in block 40 Block first atom: 1775 Blocpdb> 43 atoms in block 41 Block first atom: 1819 Blocpdb> 44 atoms in block 42 Block first atom: 1862 Blocpdb> 46 atoms in block 43 Block first atom: 1906 Blocpdb> 44 atoms in block 44 Block first atom: 1952 Blocpdb> 46 atoms in block 45 Block first atom: 1996 Blocpdb> 48 atoms in block 46 Block first atom: 2042 Blocpdb> 41 atoms in block 47 Block first atom: 2090 Blocpdb> 51 atoms in block 48 Block first atom: 2131 Blocpdb> 58 atoms in block 49 Block first atom: 2182 Blocpdb> 23 atoms in block 50 Block first atom: 2240 Blocpdb> 47 atoms in block 51 Block first atom: 2263 Blocpdb> 47 atoms in block 52 Block first atom: 2310 Blocpdb> 52 atoms in block 53 Block first atom: 2357 Blocpdb> 50 atoms in block 54 Block first atom: 2409 Blocpdb> 52 atoms in block 55 Block first atom: 2459 Blocpdb> 47 atoms in block 56 Block first atom: 2511 Blocpdb> 42 atoms in block 57 Block first atom: 2558 Blocpdb> 50 atoms in block 58 Block first atom: 2600 Blocpdb> 38 atoms in block 59 Block first atom: 2650 Blocpdb> 48 atoms in block 60 Block first atom: 2688 Blocpdb> 42 atoms in block 61 Block first atom: 2736 Blocpdb> 43 atoms in block 62 Block first atom: 2778 Blocpdb> 42 atoms in block 63 Block first atom: 2821 Blocpdb> 45 atoms in block 64 Block first atom: 2863 Blocpdb> 47 atoms in block 65 Block first atom: 2908 Blocpdb> 47 atoms in block 66 Block first atom: 2955 Blocpdb> 55 atoms in block 67 Block first atom: 3002 Blocpdb> 50 atoms in block 68 Block first atom: 3057 Blocpdb> 39 atoms in block 69 Block first atom: 3107 Blocpdb> 45 atoms in block 70 Block first atom: 3146 Blocpdb> 42 atoms in block 71 Block first atom: 3191 Blocpdb> 38 atoms in block 72 Block first atom: 3233 Blocpdb> 41 atoms in block 73 Block first atom: 3271 Blocpdb> 46 atoms in block 74 Block first atom: 3312 Blocpdb> 34 atoms in block 75 Block first atom: 3358 Blocpdb> 42 atoms in block 76 Block first atom: 3392 Blocpdb> 40 atoms in block 77 Block first atom: 3434 Blocpdb> 49 atoms in block 78 Block first atom: 3474 Blocpdb> 44 atoms in block 79 Block first atom: 3523 Blocpdb> 42 atoms in block 80 Block first atom: 3567 Blocpdb> 54 atoms in block 81 Block first atom: 3609 Blocpdb> 52 atoms in block 82 Block first atom: 3663 Blocpdb> 50 atoms in block 83 Block first atom: 3715 Blocpdb> 43 atoms in block 84 Block first atom: 3765 Blocpdb> 50 atoms in block 85 Block first atom: 3808 Blocpdb> 40 atoms in block 86 Block first atom: 3858 Blocpdb> 49 atoms in block 87 Block first atom: 3898 Blocpdb> 42 atoms in block 88 Block first atom: 3947 Blocpdb> 48 atoms in block 89 Block first atom: 3989 Blocpdb> 44 atoms in block 90 Block first atom: 4037 Blocpdb> 43 atoms in block 91 Block first atom: 4081 Blocpdb> 44 atoms in block 92 Block first atom: 4124 Blocpdb> 46 atoms in block 93 Block first atom: 4168 Blocpdb> 44 atoms in block 94 Block first atom: 4214 Blocpdb> 46 atoms in block 95 Block first atom: 4258 Blocpdb> 48 atoms in block 96 Block first atom: 4304 Blocpdb> 41 atoms in block 97 Block first atom: 4352 Blocpdb> 51 atoms in block 98 Block first atom: 4393 Blocpdb> 58 atoms in block 99 Block first atom: 4444 Blocpdb> 23 atoms in block 100 Block first atom: 4502 Blocpdb> 47 atoms in block 101 Block first atom: 4525 Blocpdb> 47 atoms in block 102 Block first atom: 4572 Blocpdb> 52 atoms in block 103 Block first atom: 4619 Blocpdb> 50 atoms in block 104 Block first atom: 4671 Blocpdb> 52 atoms in block 105 Block first atom: 4721 Blocpdb> 47 atoms in block 106 Block first atom: 4773 Blocpdb> 42 atoms in block 107 Block first atom: 4820 Blocpdb> 50 atoms in block 108 Block first atom: 4862 Blocpdb> 38 atoms in block 109 Block first atom: 4912 Blocpdb> 48 atoms in block 110 Block first atom: 4950 Blocpdb> 42 atoms in block 111 Block first atom: 4998 Blocpdb> 43 atoms in block 112 Block first atom: 5040 Blocpdb> 42 atoms in block 113 Block first atom: 5083 Blocpdb> 45 atoms in block 114 Block first atom: 5125 Blocpdb> 47 atoms in block 115 Block first atom: 5170 Blocpdb> 47 atoms in block 116 Block first atom: 5217 Blocpdb> 55 atoms in block 117 Block first atom: 5264 Blocpdb> 50 atoms in block 118 Block first atom: 5319 Blocpdb> 39 atoms in block 119 Block first atom: 5369 Blocpdb> 45 atoms in block 120 Block first atom: 5408 Blocpdb> 42 atoms in block 121 Block first atom: 5453 Blocpdb> 38 atoms in block 122 Block first atom: 5495 Blocpdb> 41 atoms in block 123 Block first atom: 5533 Blocpdb> 46 atoms in block 124 Block first atom: 5574 Blocpdb> 34 atoms in block 125 Block first atom: 5620 Blocpdb> 42 atoms in block 126 Block first atom: 5654 Blocpdb> 40 atoms in block 127 Block first atom: 5696 Blocpdb> 49 atoms in block 128 Block first atom: 5736 Blocpdb> 44 atoms in block 129 Block first atom: 5785 Blocpdb> 42 atoms in block 130 Block first atom: 5829 Blocpdb> 54 atoms in block 131 Block first atom: 5871 Blocpdb> 52 atoms in block 132 Block first atom: 5925 Blocpdb> 50 atoms in block 133 Block first atom: 5977 Blocpdb> 43 atoms in block 134 Block first atom: 6027 Blocpdb> 50 atoms in block 135 Block first atom: 6070 Blocpdb> 40 atoms in block 136 Block first atom: 6120 Blocpdb> 49 atoms in block 137 Block first atom: 6160 Blocpdb> 42 atoms in block 138 Block first atom: 6209 Blocpdb> 48 atoms in block 139 Block first atom: 6251 Blocpdb> 44 atoms in block 140 Block first atom: 6299 Blocpdb> 43 atoms in block 141 Block first atom: 6343 Blocpdb> 44 atoms in block 142 Block first atom: 6386 Blocpdb> 46 atoms in block 143 Block first atom: 6430 Blocpdb> 44 atoms in block 144 Block first atom: 6476 Blocpdb> 46 atoms in block 145 Block first atom: 6520 Blocpdb> 48 atoms in block 146 Block first atom: 6566 Blocpdb> 41 atoms in block 147 Block first atom: 6614 Blocpdb> 51 atoms in block 148 Block first atom: 6655 Blocpdb> 58 atoms in block 149 Block first atom: 6706 Blocpdb> 23 atoms in block 150 Block first atom: 6764 Blocpdb> 47 atoms in block 151 Block first atom: 6787 Blocpdb> 47 atoms in block 152 Block first atom: 6834 Blocpdb> 52 atoms in block 153 Block first atom: 6881 Blocpdb> 50 atoms in block 154 Block first atom: 6933 Blocpdb> 52 atoms in block 155 Block first atom: 6983 Blocpdb> 47 atoms in block 156 Block first atom: 7035 Blocpdb> 42 atoms in block 157 Block first atom: 7082 Blocpdb> 50 atoms in block 158 Block first atom: 7124 Blocpdb> 38 atoms in block 159 Block first atom: 7174 Blocpdb> 48 atoms in block 160 Block first atom: 7212 Blocpdb> 42 atoms in block 161 Block first atom: 7260 Blocpdb> 43 atoms in block 162 Block first atom: 7302 Blocpdb> 42 atoms in block 163 Block first atom: 7345 Blocpdb> 45 atoms in block 164 Block first atom: 7387 Blocpdb> 47 atoms in block 165 Block first atom: 7432 Blocpdb> 47 atoms in block 166 Block first atom: 7479 Blocpdb> 55 atoms in block 167 Block first atom: 7526 Blocpdb> 50 atoms in block 168 Block first atom: 7581 Blocpdb> 39 atoms in block 169 Block first atom: 7631 Blocpdb> 45 atoms in block 170 Block first atom: 7670 Blocpdb> 42 atoms in block 171 Block first atom: 7715 Blocpdb> 38 atoms in block 172 Block first atom: 7757 Blocpdb> 41 atoms in block 173 Block first atom: 7795 Blocpdb> 46 atoms in block 174 Block first atom: 7836 Blocpdb> 34 atoms in block 175 Block first atom: 7882 Blocpdb> 42 atoms in block 176 Block first atom: 7916 Blocpdb> 40 atoms in block 177 Block first atom: 7958 Blocpdb> 49 atoms in block 178 Block first atom: 7998 Blocpdb> 44 atoms in block 179 Block first atom: 8047 Blocpdb> 42 atoms in block 180 Block first atom: 8091 Blocpdb> 54 atoms in block 181 Block first atom: 8133 Blocpdb> 52 atoms in block 182 Block first atom: 8187 Blocpdb> 50 atoms in block 183 Block first atom: 8239 Blocpdb> 43 atoms in block 184 Block first atom: 8289 Blocpdb> 50 atoms in block 185 Block first atom: 8332 Blocpdb> 40 atoms in block 186 Block first atom: 8382 Blocpdb> 49 atoms in block 187 Block first atom: 8422 Blocpdb> 42 atoms in block 188 Block first atom: 8471 Blocpdb> 48 atoms in block 189 Block first atom: 8513 Blocpdb> 44 atoms in block 190 Block first atom: 8561 Blocpdb> 43 atoms in block 191 Block first atom: 8605 Blocpdb> 44 atoms in block 192 Block first atom: 8648 Blocpdb> 46 atoms in block 193 Block first atom: 8692 Blocpdb> 44 atoms in block 194 Block first atom: 8738 Blocpdb> 46 atoms in block 195 Block first atom: 8782 Blocpdb> 48 atoms in block 196 Block first atom: 8828 Blocpdb> 41 atoms in block 197 Block first atom: 8876 Blocpdb> 51 atoms in block 198 Block first atom: 8917 Blocpdb> 58 atoms in block 199 Block first atom: 8968 Blocpdb> 23 atoms in block 200 Block first atom: 9025 Blocpdb> 200 blocks. Blocpdb> At most, 58 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 23 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 3580602 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 27144 Prepmat> Matrix trace = 7837120.0000 Prepmat> Last element read: 27144 27144 124.9123 Prepmat> 20101 lines saved. Prepmat> 18332 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 9048 RTB> Total mass = 9048.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 9048 RTB> Number of blocks = 200 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 238221.4095 RTB> 60648 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1200 Diagstd> Nb of non-zero elements: 60648 Diagstd> Projected matrix trace = 238221.4095 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1200 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 238221.4095 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.7647343 0.8621736 0.9792979 1.4206289 1.4801080 1.6493584 1.9745882 2.8251680 3.2025993 3.5326566 3.9645905 4.1300490 4.4017805 5.5616730 5.9989693 7.7775624 7.9594968 8.0854951 11.4622752 11.8164910 12.3123740 12.7874340 13.1541921 14.4500892 14.5184433 14.6045387 15.8874957 16.3505266 16.5699110 17.0854053 17.2211666 18.3209925 18.9271179 19.4016750 20.3169559 20.5674976 20.6730689 20.7529107 20.9221837 21.1820248 21.7072666 22.3655248 22.3835432 22.6165382 22.7335939 23.9758690 24.1604315 25.0163958 25.0415911 25.5578500 25.6683921 25.8864520 26.7019822 27.4080815 27.7669431 28.1672522 28.2479960 28.3559698 28.8673202 28.9263853 28.9930518 29.2258017 30.3114451 30.3838373 30.7051351 31.3756674 31.7989887 31.9741465 32.1649729 33.0793740 33.1192870 33.4502078 33.4789604 34.1049107 34.7806833 35.3253307 35.4106074 35.6936745 35.7910237 35.8443429 36.3516348 37.1964433 37.6043609 37.6467676 38.1162902 38.4507214 38.5705855 38.7228998 39.1375376 39.7031117 40.2612759 40.7934960 40.9671109 41.2008841 41.4066102 41.7513654 42.0491124 42.5473689 42.9490123 43.4492257 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034336 0.0034339 0.0034341 0.0034346 0.0034350 0.0034356 94.9621581 100.8306653 107.4614493 129.4301921 132.1119143 139.4610073 152.5926256 182.5229246 194.3330120 204.1014026 216.2192960 220.6850335 227.8292455 256.0931752 265.9705794 302.8426469 306.3642500 308.7795921 367.6467206 373.2841460 381.0361488 388.3175180 393.8468449 412.7913087 413.7664822 414.9915012 432.8356297 439.0976896 442.0336869 448.8569179 450.6367061 464.8039158 472.4300608 478.3159831 489.4683321 492.4770629 493.7393673 494.6918883 496.7052900 499.7801653 505.9386412 513.5524757 513.7593008 516.4262924 517.7609937 531.7193424 533.7619649 543.1348254 543.4082654 548.9811576 550.1670953 552.4990621 561.1345776 568.5054063 572.2151022 576.3250830 577.1505343 578.2525179 583.4431093 584.0396921 584.7123216 587.0546023 597.8587655 598.5722664 601.7287837 608.2635142 612.3531191 614.0373098 615.8669167 624.5596478 624.9363256 628.0506799 628.3205467 634.1671457 640.4191878 645.4140252 646.1925821 648.7702248 649.6543347 650.1380614 654.7224816 662.2866297 665.9082363 666.2836052 670.4256048 673.3603292 674.4090604 675.7393602 679.3475749 684.2385724 689.0314530 693.5707081 695.0450410 697.0253098 698.7633517 701.6663055 704.1638029 708.3234738 711.6588767 715.7911116 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 9048 Rtb_to_modes> Number of blocs = 200 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9980E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9996E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0004E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0006E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0009E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7647 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8622 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9793 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.421 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.480 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.649 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.975 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.825 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.203 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.533 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.965 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.130 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.402 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.562 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.999 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.778 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.959 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.085 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.45 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1200 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 1.00002 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 0.99996 1.00000 1.00003 0.99999 1.00001 0.99998 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 1.00003 1.00000 0.99999 0.99998 0.99999 0.99999 1.00002 0.99999 1.00000 0.99997 1.00001 1.00000 1.00004 1.00000 0.99998 1.00005 0.99998 1.00000 0.99998 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 0.99998 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 0.99997 1.00003 1.00001 0.99999 1.00000 1.00003 1.00003 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999 1.00003 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 1.00002 1.00000 1.00001 1.00002 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 162864 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 1.00002 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 0.99996 1.00000 1.00003 0.99999 1.00001 0.99998 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 1.00003 1.00000 0.99999 0.99998 0.99999 0.99999 1.00002 0.99999 1.00000 0.99997 1.00001 1.00000 1.00004 1.00000 0.99998 1.00005 0.99998 1.00000 0.99998 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 0.99998 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 0.99997 1.00003 1.00001 0.99999 1.00000 1.00003 1.00003 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999 1.00003 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 1.00002 1.00000 1.00001 1.00002 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3: 0.000-0.000 Vector 4:-0.000-0.000-0.000 Vector 5:-0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 6:-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 7:-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 8:-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 9:-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 10:-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2604292046573457726.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2604292046573457726.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2604292046573457726.atom Openam> file on opening on unit 11: 2604292046573457726.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 1192 First residue number = 18 Last residue number = 315 Number of atoms found = 9048 Mean number per residue = 7.6 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9980E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9996E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0004E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0006E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0009E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7647 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8622 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9793 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.421 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.480 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.649 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.975 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.825 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.203 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.533 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.965 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.130 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.402 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.562 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.999 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.778 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.959 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.085 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.45 Bfactors> 106 vectors, 27144 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.764700 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= -0.162 for 1192 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.020 +/- 0.01 Bfactors> = 87.945 +/- 8.38 Bfactors> Shiftng-fct= 87.925 Bfactors> Scaling-fct= 612.392 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2604292046573457726.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2604292046573457726.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4335E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4345E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4348E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4354E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 94.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 100.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 107.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 129.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 132.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 139.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 152.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 182.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 194.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 204.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 216.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 220.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 227.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 256.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 266.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 302.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 306.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 308.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 367.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 373.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 381.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 388.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 393.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 412.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 413.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 414.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 432.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 439.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 442.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 448.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 450.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 464.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 472.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 478.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 489.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 492.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 493.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 494.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 496.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 499.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 505.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 513.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 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CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 561.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 568.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 572.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 576.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 577.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 578.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 583.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 584.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 584.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 587.1 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vecteur en lecture: 628.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 628.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 634.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 640.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 645.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 646.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 648.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 649.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 650.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 654.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 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CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 693.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 695.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 697.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 698.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 701.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 704.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 708.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 711.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 715.8 Chkmod> 106 vectors, 27144 coordinates in file. Chkmod> That is: 9048 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. Chkmod> Normal end. 0.0034 0.8971 0.0034 0.9332 0.0034 0.7658 0.0034 0.8250 0.0034 0.8063 0.0034 0.7513 94.9559 0.7468 100.8279 0.6648 107.4570 0.7179 129.4415 0.7073 132.1014 0.7223 139.4399 0.7307 152.6020 0.6486 182.5097 0.6884 194.3368 0.7116 204.1026 0.8667 216.2212 0.7106 220.6743 0.6889 227.8251 0.8248 256.0897 0.7419 265.9598 0.7401 302.8382 0.5720 306.3415 0.7012 308.7569 0.5797 367.5944 0.4519 373.3235 0.3198 380.9831 0.3090 388.3398 0.3773 393.7672 0.5456 412.7723 0.3992 413.7709 0.4071 414.9092 0.3704 432.8512 0.4711 439.0718 0.4700 442.0159 0.5332 448.8980 0.4830 450.6021 0.4689 464.7714 0.5337 472.4457 0.4004 478.2748 0.4489 489.4840 0.2145 492.4859 0.1869 493.6815 0.3137 494.6360 0.1691 496.6580 0.0764 499.7348 0.0667 505.9488 0.1276 513.5818 0.2364 513.6966 0.2493 516.4436 0.4266 517.6978 0.1677 531.7423 0.4270 533.7343 0.4656 543.1506 0.4986 543.3677 0.5538 548.9807 0.6011 550.1607 0.3464 552.5132 0.6859 561.0897 0.6051 568.5009 0.4624 572.2220 0.6829 576.3285 0.3979 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DQ=-80 2604292046573457726.eigenfacs 2604292046573457726.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2604292046573457726.eigenfacs 2604292046573457726.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2604292046573457726.eigenfacs 2604292046573457726.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2604292046573457726.eigenfacs 2604292046573457726.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2604292046573457726.eigenfacs 2604292046573457726.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2604292046573457726.eigenfacs 2604292046573457726.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2604292046573457726.eigenfacs 2604292046573457726.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2604292046573457726.eigenfacs 2604292046573457726.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2604292046573457726.eigenfacs 2604292046573457726.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2604292046573457726.eigenfacs 2604292046573457726.atom making animated gifs 11 models are in 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generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 2604292046573457726.eigenfacs 2604292046573457726.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2604292046573457726.eigenfacs 2604292046573457726.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2604292046573457726.eigenfacs 2604292046573457726.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2604292046573457726.eigenfacs 2604292046573457726.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2604292046573457726.eigenfacs 2604292046573457726.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2604292046573457726.eigenfacs 2604292046573457726.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2604292046573457726.eigenfacs 2604292046573457726.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2604292046573457726.eigenfacs 2604292046573457726.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2604292046573457726.eigenfacs 2604292046573457726.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2604292046573457726.eigenfacs 2604292046573457726.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2604292046573457726.eigenfacs 2604292046573457726.atom making animated gifs 11 models are in 2604292046573457726.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2604292046573457726.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2604292046573457726.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 2604292046573457726 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 2604292046573457726.eigenfacs 2604292046573457726.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2604292046573457726.eigenfacs 2604292046573457726.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2604292046573457726.eigenfacs 2604292046573457726.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2604292046573457726.eigenfacs 2604292046573457726.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2604292046573457726.eigenfacs 2604292046573457726.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2604292046573457726.eigenfacs 2604292046573457726.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2604292046573457726.eigenfacs 2604292046573457726.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2604292046573457726.eigenfacs 2604292046573457726.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2604292046573457726.eigenfacs 2604292046573457726.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2604292046573457726.eigenfacs 2604292046573457726.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2604292046573457726.eigenfacs 2604292046573457726.atom making animated gifs 11 models are in 2604292046573457726.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2604292046573457726.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2604292046573457726.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 2604292046573457726 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 2604292046573457726.eigenfacs 2604292046573457726.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2604292046573457726.eigenfacs 2604292046573457726.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2604292046573457726.eigenfacs 2604292046573457726.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2604292046573457726.eigenfacs 2604292046573457726.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2604292046573457726.eigenfacs 2604292046573457726.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2604292046573457726.eigenfacs 2604292046573457726.atom calculating perturbed structure for DQ=20 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