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LOGs for ID: 2604292047043457830

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2604292047043457830.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2604292047043457830.atom to be opened. Openam> File opened: 2604292047043457830.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 1199 First residue number = 18 Last residue number = 315 Number of atoms found = 9096 Mean number per residue = 7.6 Pdbmat> Coordinate statistics: = 0.397063 +/- 20.473544 From: -45.591000 To: 44.595000 = -0.517037 +/- 14.805805 From: -37.810000 To: 39.454000 = 0.814305 +/- 19.294964 From: -42.104000 To: 57.264000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 0.9769 % Filled. Pdbmat> 3637335 non-zero elements. Pdbmat> 398146 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 87.54 +/- 22.95 Maximum number = 133 Minimum number = 15 Pdbmat> Matrix trace = 7.962920E+06 Pdbmat> Larger element = 499.544 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 1199 non-zero elements, NRBL set to 6 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2604292047043457830.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 6 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2604292047043457830.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2604292047043457830.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 9096 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 6 residue(s) per block. Blocpdb> 1199 residues. Blocpdb> 47 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 47 atoms in block 2 Block first atom: 48 Blocpdb> 52 atoms in block 3 Block first atom: 95 Blocpdb> 50 atoms in block 4 Block first atom: 147 Blocpdb> 52 atoms in block 5 Block first atom: 197 Blocpdb> 47 atoms in block 6 Block first atom: 249 Blocpdb> 42 atoms in block 7 Block first atom: 296 Blocpdb> 50 atoms in block 8 Block first atom: 338 Blocpdb> 38 atoms in block 9 Block first atom: 388 Blocpdb> 48 atoms in block 10 Block first atom: 426 Blocpdb> 42 atoms in block 11 Block first atom: 474 Blocpdb> 43 atoms in block 12 Block first atom: 516 Blocpdb> 42 atoms in block 13 Block first atom: 559 Blocpdb> 45 atoms in block 14 Block first atom: 601 Blocpdb> 47 atoms in block 15 Block first atom: 646 Blocpdb> 47 atoms in block 16 Block first atom: 693 Blocpdb> 55 atoms in block 17 Block first atom: 740 Blocpdb> 50 atoms in block 18 Block first atom: 795 Blocpdb> 39 atoms in block 19 Block first atom: 845 Blocpdb> 45 atoms in block 20 Block first atom: 884 Blocpdb> 42 atoms in block 21 Block first atom: 929 Blocpdb> 38 atoms in block 22 Block first atom: 971 Blocpdb> 41 atoms in block 23 Block first atom: 1009 Blocpdb> 46 atoms in block 24 Block first atom: 1050 Blocpdb> 34 atoms in block 25 Block first atom: 1096 Blocpdb> 42 atoms in block 26 Block first atom: 1130 Blocpdb> 40 atoms in block 27 Block first atom: 1172 Blocpdb> 49 atoms in block 28 Block first atom: 1212 Blocpdb> 44 atoms in block 29 Block first atom: 1261 Blocpdb> 42 atoms in block 30 Block first atom: 1305 Blocpdb> 54 atoms in block 31 Block first atom: 1347 Blocpdb> 52 atoms in block 32 Block first atom: 1401 Blocpdb> 50 atoms in block 33 Block first atom: 1453 Blocpdb> 43 atoms in block 34 Block first atom: 1503 Blocpdb> 50 atoms in block 35 Block first atom: 1546 Blocpdb> 40 atoms in block 36 Block first atom: 1596 Blocpdb> 49 atoms in block 37 Block first atom: 1636 Blocpdb> 42 atoms in block 38 Block first atom: 1685 Blocpdb> 48 atoms in block 39 Block first atom: 1727 Blocpdb> 44 atoms in block 40 Block first atom: 1775 Blocpdb> 43 atoms in block 41 Block first atom: 1819 Blocpdb> 44 atoms in block 42 Block first atom: 1862 Blocpdb> 46 atoms in block 43 Block first atom: 1906 Blocpdb> 44 atoms in block 44 Block first atom: 1952 Blocpdb> 46 atoms in block 45 Block first atom: 1996 Blocpdb> 48 atoms in block 46 Block first atom: 2042 Blocpdb> 41 atoms in block 47 Block first atom: 2090 Blocpdb> 51 atoms in block 48 Block first atom: 2131 Blocpdb> 58 atoms in block 49 Block first atom: 2182 Blocpdb> 35 atoms in block 50 Block first atom: 2240 Blocpdb> 36 atoms in block 51 Block first atom: 2275 Blocpdb> 47 atoms in block 52 Block first atom: 2311 Blocpdb> 47 atoms in block 53 Block first atom: 2358 Blocpdb> 52 atoms in block 54 Block first atom: 2405 Blocpdb> 50 atoms in block 55 Block first atom: 2457 Blocpdb> 52 atoms in block 56 Block first atom: 2507 Blocpdb> 47 atoms in block 57 Block first atom: 2559 Blocpdb> 42 atoms in block 58 Block first atom: 2606 Blocpdb> 50 atoms in block 59 Block first atom: 2648 Blocpdb> 38 atoms in block 60 Block first atom: 2698 Blocpdb> 48 atoms in block 61 Block first atom: 2736 Blocpdb> 42 atoms in block 62 Block first atom: 2784 Blocpdb> 43 atoms in block 63 Block first atom: 2826 Blocpdb> 42 atoms in block 64 Block first atom: 2869 Blocpdb> 45 atoms in block 65 Block first atom: 2911 Blocpdb> 47 atoms in block 66 Block first atom: 2956 Blocpdb> 47 atoms in block 67 Block first atom: 3003 Blocpdb> 55 atoms in block 68 Block first atom: 3050 Blocpdb> 50 atoms in block 69 Block first atom: 3105 Blocpdb> 39 atoms in block 70 Block first atom: 3155 Blocpdb> 45 atoms in block 71 Block first atom: 3194 Blocpdb> 42 atoms in block 72 Block first atom: 3239 Blocpdb> 38 atoms in block 73 Block first atom: 3281 Blocpdb> 41 atoms in block 74 Block first atom: 3319 Blocpdb> 46 atoms in block 75 Block first atom: 3360 Blocpdb> 34 atoms in block 76 Block first atom: 3406 Blocpdb> 42 atoms in block 77 Block first atom: 3440 Blocpdb> 40 atoms in block 78 Block first atom: 3482 Blocpdb> 49 atoms in block 79 Block first atom: 3522 Blocpdb> 44 atoms in block 80 Block first atom: 3571 Blocpdb> 42 atoms in block 81 Block first atom: 3615 Blocpdb> 54 atoms in block 82 Block first atom: 3657 Blocpdb> 52 atoms in block 83 Block first atom: 3711 Blocpdb> 50 atoms in block 84 Block first atom: 3763 Blocpdb> 43 atoms in block 85 Block first atom: 3813 Blocpdb> 50 atoms in block 86 Block first atom: 3856 Blocpdb> 40 atoms in block 87 Block first atom: 3906 Blocpdb> 49 atoms in block 88 Block first atom: 3946 Blocpdb> 42 atoms in block 89 Block first atom: 3995 Blocpdb> 48 atoms in block 90 Block first atom: 4037 Blocpdb> 44 atoms in block 91 Block first atom: 4085 Blocpdb> 43 atoms in block 92 Block first atom: 4129 Blocpdb> 44 atoms in block 93 Block first atom: 4172 Blocpdb> 46 atoms in block 94 Block first atom: 4216 Blocpdb> 44 atoms in block 95 Block first atom: 4262 Blocpdb> 46 atoms in block 96 Block first atom: 4306 Blocpdb> 48 atoms in block 97 Block first atom: 4352 Blocpdb> 41 atoms in block 98 Block first atom: 4400 Blocpdb> 51 atoms in block 99 Block first atom: 4441 Blocpdb> 58 atoms in block 100 Block first atom: 4492 Blocpdb> 23 atoms in block 101 Block first atom: 4550 Blocpdb> 47 atoms in block 102 Block first atom: 4573 Blocpdb> 47 atoms in block 103 Block first atom: 4620 Blocpdb> 52 atoms in block 104 Block first atom: 4667 Blocpdb> 50 atoms in block 105 Block first atom: 4719 Blocpdb> 52 atoms in block 106 Block first atom: 4769 Blocpdb> 47 atoms in block 107 Block first atom: 4821 Blocpdb> 42 atoms in block 108 Block first atom: 4868 Blocpdb> 50 atoms in block 109 Block first atom: 4910 Blocpdb> 38 atoms in block 110 Block first atom: 4960 Blocpdb> 48 atoms in block 111 Block first atom: 4998 Blocpdb> 42 atoms in block 112 Block first atom: 5046 Blocpdb> 43 atoms in block 113 Block first atom: 5088 Blocpdb> 42 atoms in block 114 Block first atom: 5131 Blocpdb> 45 atoms in block 115 Block first atom: 5173 Blocpdb> 47 atoms in block 116 Block first atom: 5218 Blocpdb> 47 atoms in block 117 Block first atom: 5265 Blocpdb> 55 atoms in block 118 Block first atom: 5312 Blocpdb> 50 atoms in block 119 Block first atom: 5367 Blocpdb> 39 atoms in block 120 Block first atom: 5417 Blocpdb> 45 atoms in block 121 Block first atom: 5456 Blocpdb> 42 atoms in block 122 Block first atom: 5501 Blocpdb> 38 atoms in block 123 Block first atom: 5543 Blocpdb> 41 atoms in block 124 Block first atom: 5581 Blocpdb> 46 atoms in block 125 Block first atom: 5622 Blocpdb> 34 atoms in block 126 Block first atom: 5668 Blocpdb> 42 atoms in block 127 Block first atom: 5702 Blocpdb> 40 atoms in block 128 Block first atom: 5744 Blocpdb> 49 atoms in block 129 Block first atom: 5784 Blocpdb> 44 atoms in block 130 Block first atom: 5833 Blocpdb> 42 atoms in block 131 Block first atom: 5877 Blocpdb> 54 atoms in block 132 Block first atom: 5919 Blocpdb> 52 atoms in block 133 Block first atom: 5973 Blocpdb> 50 atoms in block 134 Block first atom: 6025 Blocpdb> 43 atoms in block 135 Block first atom: 6075 Blocpdb> 50 atoms in block 136 Block first atom: 6118 Blocpdb> 40 atoms in block 137 Block first atom: 6168 Blocpdb> 49 atoms in block 138 Block first atom: 6208 Blocpdb> 42 atoms in block 139 Block first atom: 6257 Blocpdb> 48 atoms in block 140 Block first atom: 6299 Blocpdb> 44 atoms in block 141 Block first atom: 6347 Blocpdb> 43 atoms in block 142 Block first atom: 6391 Blocpdb> 44 atoms in block 143 Block first atom: 6434 Blocpdb> 46 atoms in block 144 Block first atom: 6478 Blocpdb> 44 atoms in block 145 Block first atom: 6524 Blocpdb> 46 atoms in block 146 Block first atom: 6568 Blocpdb> 48 atoms in block 147 Block first atom: 6614 Blocpdb> 41 atoms in block 148 Block first atom: 6662 Blocpdb> 51 atoms in block 149 Block first atom: 6703 Blocpdb> 58 atoms in block 150 Block first atom: 6754 Blocpdb> 23 atoms in block 151 Block first atom: 6812 Blocpdb> 47 atoms in block 152 Block first atom: 6835 Blocpdb> 47 atoms in block 153 Block first atom: 6882 Blocpdb> 52 atoms in block 154 Block first atom: 6929 Blocpdb> 50 atoms in block 155 Block first atom: 6981 Blocpdb> 52 atoms in block 156 Block first atom: 7031 Blocpdb> 47 atoms in block 157 Block first atom: 7083 Blocpdb> 42 atoms in block 158 Block first atom: 7130 Blocpdb> 50 atoms in block 159 Block first atom: 7172 Blocpdb> 38 atoms in block 160 Block first atom: 7222 Blocpdb> 48 atoms in block 161 Block first atom: 7260 Blocpdb> 42 atoms in block 162 Block first atom: 7308 Blocpdb> 43 atoms in block 163 Block first atom: 7350 Blocpdb> 42 atoms in block 164 Block first atom: 7393 Blocpdb> 45 atoms in block 165 Block first atom: 7435 Blocpdb> 47 atoms in block 166 Block first atom: 7480 Blocpdb> 47 atoms in block 167 Block first atom: 7527 Blocpdb> 55 atoms in block 168 Block first atom: 7574 Blocpdb> 50 atoms in block 169 Block first atom: 7629 Blocpdb> 39 atoms in block 170 Block first atom: 7679 Blocpdb> 45 atoms in block 171 Block first atom: 7718 Blocpdb> 42 atoms in block 172 Block first atom: 7763 Blocpdb> 38 atoms in block 173 Block first atom: 7805 Blocpdb> 41 atoms in block 174 Block first atom: 7843 Blocpdb> 46 atoms in block 175 Block first atom: 7884 Blocpdb> 34 atoms in block 176 Block first atom: 7930 Blocpdb> 42 atoms in block 177 Block first atom: 7964 Blocpdb> 40 atoms in block 178 Block first atom: 8006 Blocpdb> 49 atoms in block 179 Block first atom: 8046 Blocpdb> 44 atoms in block 180 Block first atom: 8095 Blocpdb> 42 atoms in block 181 Block first atom: 8139 Blocpdb> 54 atoms in block 182 Block first atom: 8181 Blocpdb> 52 atoms in block 183 Block first atom: 8235 Blocpdb> 50 atoms in block 184 Block first atom: 8287 Blocpdb> 43 atoms in block 185 Block first atom: 8337 Blocpdb> 50 atoms in block 186 Block first atom: 8380 Blocpdb> 40 atoms in block 187 Block first atom: 8430 Blocpdb> 49 atoms in block 188 Block first atom: 8470 Blocpdb> 42 atoms in block 189 Block first atom: 8519 Blocpdb> 48 atoms in block 190 Block first atom: 8561 Blocpdb> 44 atoms in block 191 Block first atom: 8609 Blocpdb> 43 atoms in block 192 Block first atom: 8653 Blocpdb> 44 atoms in block 193 Block first atom: 8696 Blocpdb> 46 atoms in block 194 Block first atom: 8740 Blocpdb> 44 atoms in block 195 Block first atom: 8786 Blocpdb> 46 atoms in block 196 Block first atom: 8830 Blocpdb> 48 atoms in block 197 Block first atom: 8876 Blocpdb> 41 atoms in block 198 Block first atom: 8924 Blocpdb> 51 atoms in block 199 Block first atom: 8965 Blocpdb> 58 atoms in block 200 Block first atom: 9016 Blocpdb> 23 atoms in block 201 Block first atom: 9073 Blocpdb> 201 blocks. Blocpdb> At most, 58 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 23 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 3637536 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 27288 Prepmat> Matrix trace = 7962920.0000 Prepmat> Last element read: 27288 27288 53.9559 Prepmat> 20302 lines saved. Prepmat> 18435 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 9096 RTB> Total mass = 9096.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 9096 RTB> Number of blocks = 201 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 242701.2233 RTB> 64161 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1206 Diagstd> Nb of non-zero elements: 64161 Diagstd> Projected matrix trace = 242701.2233 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1206 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 242701.2233 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.2015538 0.2453554 0.6910265 1.4800802 1.8916537 2.0804814 2.4870857 3.1825726 3.2225628 3.9380376 4.1400306 4.4169996 4.8418217 5.6952120 5.8668632 6.5646245 6.6397737 6.8415259 9.2123817 9.3118630 9.3388881 10.2165435 10.5974160 14.2067178 14.6788924 14.9568514 15.0008300 15.3541818 16.5789925 16.6706605 16.7254857 18.6995988 19.5773099 20.0456556 20.1077242 20.2697847 20.4424086 20.5615211 20.7608887 20.8062040 20.9660564 21.2498574 21.9093891 22.3430571 22.4340332 23.0359809 23.5361917 23.7045798 23.9136483 24.4872224 25.0210748 26.1148542 26.3329727 26.5020771 26.8426983 27.7399357 27.9065567 27.9534331 28.5790431 29.0848300 29.2386438 29.3550335 29.8291907 30.1509028 30.2276521 30.5776503 31.1610359 31.4792478 32.1558501 32.8151276 32.8356907 33.1037399 33.2870632 33.4770493 33.9242661 34.1570897 34.9282064 35.1252237 35.1543747 35.6477319 36.4340344 36.9700997 37.2167598 37.4829921 37.7915461 38.0169698 38.2476819 38.9769027 39.1735803 39.4679679 39.5946042 39.8942601 40.5524462 40.9083170 41.3939550 42.4504894 42.6451480 42.9970922 43.2890312 43.5262420 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034323 0.0034325 0.0034340 0.0034341 0.0034341 0.0034347 48.7518083 53.7889531 90.2698286 132.1106739 149.3537368 156.6308107 171.2539715 193.7244504 194.9377629 215.4940123 220.9515508 228.2227639 238.9459505 259.1494129 263.0257454 278.2276105 279.8155968 284.0349397 329.5954754 331.3702907 331.8507975 347.0941343 353.5047651 409.3003894 416.0465485 419.9671969 420.5841727 425.5088714 442.1548041 443.3754918 444.1039632 469.5819827 480.4760976 486.1893173 486.9414455 488.8997877 490.9771859 492.4055059 494.7869662 495.3266632 497.2257999 500.5797657 508.2886523 513.2944612 514.3384118 521.1930732 526.8213622 528.7025573 531.0289509 537.3596381 543.1856161 554.9311236 557.2437737 559.0301572 562.6111897 571.9367532 573.6518613 574.1334590 580.5225870 585.6370510 587.1835666 588.3511014 593.0837373 596.2734071 597.0318326 600.4783243 606.1794696 609.2667161 615.7795726 622.0600758 622.2549479 624.7896272 626.5172320 628.3026133 632.4854085 634.6520840 641.7759272 643.5833939 643.8503991 648.3525629 655.4641030 660.2685190 662.4674739 664.8327520 667.5635422 669.5515643 671.5801322 677.9519946 679.6603165 682.2093439 683.3029308 685.8837093 691.5185089 694.5461150 698.6565607 707.5165950 709.1369139 712.0571037 714.4703551 716.4252216 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 9096 Rtb_to_modes> Number of blocs = 201 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9902E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9913E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0004E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2016 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2454 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6910 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.480 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.892 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.080 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.487 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.183 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.223 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.938 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.140 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.417 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.842 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.695 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.867 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.565 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.640 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.842 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.212 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.312 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.339 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.53 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1206 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 0.99997 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 0.99998 1.00001 1.00001 0.99997 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 1.00002 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 1.00003 1.00003 1.00001 0.99998 0.99999 1.00002 1.00001 1.00001 0.99998 1.00001 1.00000 0.99998 1.00000 1.00000 1.00002 1.00002 1.00002 1.00002 1.00001 1.00002 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 0.99997 1.00000 1.00001 1.00000 0.99998 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 1.00002 1.00001 1.00000 1.00001 1.00003 1.00000 1.00001 0.99999 1.00002 1.00000 1.00000 0.99998 1.00002 1.00003 1.00000 1.00003 0.99997 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 0.99998 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 0.99998 0.99999 1.00000 0.99997 1.00000 0.99999 1.00000 0.99996 0.99999 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 163728 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 0.99997 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 0.99998 1.00001 1.00001 0.99997 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 1.00002 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 1.00003 1.00003 1.00001 0.99998 0.99999 1.00002 1.00001 1.00001 0.99998 1.00001 1.00000 0.99998 1.00000 1.00000 1.00002 1.00002 1.00002 1.00002 1.00001 1.00002 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 0.99997 1.00000 1.00001 1.00000 0.99998 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 1.00002 1.00001 1.00000 1.00001 1.00003 1.00000 1.00001 0.99999 1.00002 1.00000 1.00000 0.99998 1.00002 1.00003 1.00000 1.00003 0.99997 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 0.99998 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 0.99998 0.99999 1.00000 0.99997 1.00000 0.99999 1.00000 0.99996 0.99999 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3: 0.000 0.000 Vector 4: 0.000 0.000-0.000 Vector 5:-0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 6:-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 7: 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 8: 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 9:-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 10: 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2604292047043457830.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2604292047043457830.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2604292047043457830.atom Openam> file on opening on unit 11: 2604292047043457830.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 1199 First residue number = 18 Last residue number = 315 Number of atoms found = 9096 Mean number per residue = 7.6 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9902E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9913E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0004E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2016 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2454 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6910 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.480 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.892 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.080 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.487 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.183 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.223 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.938 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.140 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.417 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.842 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.695 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.867 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.565 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.640 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.842 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.212 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.312 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.339 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.53 Bfactors> 106 vectors, 27288 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.201600 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= -0.387 for 1199 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.028 +/- 0.26 Bfactors> = 87.656 +/- 9.12 Bfactors> Shiftng-fct= 87.627 Bfactors> Scaling-fct= 35.067 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2604292047043457830.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2604292047043457830.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4321E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4323E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4345E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 48.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 53.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 90.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 132.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 149.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 156.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 171.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 193.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 194.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 215.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 220.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 228.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 238.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 259.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 263.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 278.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 279.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 284.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 329.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 331.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 331.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 347.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 353.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 409.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 416.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 420.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 420.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 425.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 442.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 443.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 444.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 469.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 480.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 486.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 486.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 488.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 490.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 492.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 494.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 495.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 497.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 500.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 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CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 557.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 559.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 562.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 571.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 573.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 574.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 580.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 585.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 587.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 588.4 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vecteur en lecture: 624.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 626.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 628.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 632.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 634.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 641.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 643.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 643.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 648.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 655.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 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Chkmod> That is: 9096 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. Chkmod> Normal end. 0.0034 0.7517 0.0034 0.8614 0.0034 0.6958 0.0034 0.7032 0.0034 0.9139 0.0034 0.7287 48.7553 0.0034 53.7915 0.0033 90.2642 0.6985 132.1014 0.6220 149.3610 0.2662 156.6060 0.0435 171.2437 0.9049 193.7291 0.6249 194.9426 0.6423 215.4837 0.2736 220.9413 0.6555 228.2130 0.2916 238.9401 0.2809 259.1335 0.7161 263.0175 0.6642 278.2236 0.7250 279.8084 0.7240 284.0326 0.8327 329.5745 0.6341 331.3585 0.5588 331.8385 0.7426 347.1379 0.7057 353.5327 0.0255 409.3301 0.5354 416.0444 0.5649 419.9934 0.4805 420.5545 0.5030 425.4327 0.5176 442.1493 0.3531 443.3477 0.3563 444.1448 0.3885 469.5669 0.1452 480.4885 0.4379 486.2211 0.3873 486.9481 0.3353 488.8814 0.3570 490.9272 0.1046 492.3662 0.1928 494.7551 0.1467 495.3506 0.3836 497.2512 0.1656 500.5600 0.2976 508.2739 0.3958 513.2373 0.4773 514.2701 0.4754 521.2162 0.5071 526.8414 0.3799 528.6288 0.3400 530.9656 0.3554 537.3670 0.4727 543.1506 0.3377 554.8557 0.5052 557.1884 0.4795 558.9843 0.3834 562.5588 0.3460 571.9129 0.2774 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DQ=-80 2604292047043457830.eigenfacs 2604292047043457830.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2604292047043457830.eigenfacs 2604292047043457830.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2604292047043457830.eigenfacs 2604292047043457830.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2604292047043457830.eigenfacs 2604292047043457830.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2604292047043457830.eigenfacs 2604292047043457830.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2604292047043457830.eigenfacs 2604292047043457830.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2604292047043457830.eigenfacs 2604292047043457830.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2604292047043457830.eigenfacs 2604292047043457830.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2604292047043457830.eigenfacs 2604292047043457830.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2604292047043457830.eigenfacs 2604292047043457830.atom making animated gifs 11 models are in 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generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 2604292047043457830.eigenfacs 2604292047043457830.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2604292047043457830.eigenfacs 2604292047043457830.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2604292047043457830.eigenfacs 2604292047043457830.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2604292047043457830.eigenfacs 2604292047043457830.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2604292047043457830.eigenfacs 2604292047043457830.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2604292047043457830.eigenfacs 2604292047043457830.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2604292047043457830.eigenfacs 2604292047043457830.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2604292047043457830.eigenfacs 2604292047043457830.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2604292047043457830.eigenfacs 2604292047043457830.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2604292047043457830.eigenfacs 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animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 2604292047043457830 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 2604292047043457830.eigenfacs 2604292047043457830.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2604292047043457830.eigenfacs 2604292047043457830.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2604292047043457830.eigenfacs 2604292047043457830.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2604292047043457830.eigenfacs 2604292047043457830.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2604292047043457830.eigenfacs 2604292047043457830.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2604292047043457830.eigenfacs 2604292047043457830.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2604292047043457830.eigenfacs 2604292047043457830.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2604292047043457830.eigenfacs 2604292047043457830.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2604292047043457830.eigenfacs 2604292047043457830.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2604292047043457830.eigenfacs 2604292047043457830.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2604292047043457830.eigenfacs 2604292047043457830.atom making animated gifs 11 models are in 2604292047043457830.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2604292047043457830.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2604292047043457830.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 2604292047043457830 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 2604292047043457830.eigenfacs 2604292047043457830.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2604292047043457830.eigenfacs 2604292047043457830.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2604292047043457830.eigenfacs 2604292047043457830.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2604292047043457830.eigenfacs 2604292047043457830.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2604292047043457830.eigenfacs 2604292047043457830.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2604292047043457830.eigenfacs 2604292047043457830.atom calculating perturbed structure for DQ=20 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