CNRS Nantes University US2B US2B
home |  start a new run |  job status |  references&downloads |  examples |  help  

Should you encounter any unexpected behaviour,
please let us know.
elNémo has been relocated.
**Some cleaning from time to time**
Sorry for the inconvenience.


***    ***

LOGs for ID: 2604292047163457862

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2604292047163457862.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2604292047163457862.atom to be opened. Openam> File opened: 2604292047163457862.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 1209 First residue number = 18 Last residue number = 315 Number of atoms found = 9171 Mean number per residue = 7.6 Pdbmat> Coordinate statistics: = 0.791874 +/- 19.932061 From: -46.183000 To: 45.229000 = 1.749498 +/- 18.734870 From: -40.930000 To: 46.398000 = -1.339026 +/- 16.311465 From: -40.942000 To: 41.630000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 0.9673 % Filled. Pdbmat> 3661195 non-zero elements. Pdbmat> 400746 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 87.39 +/- 22.57 Maximum number = 134 Minimum number = 8 Pdbmat> Matrix trace = 8.014920E+06 Pdbmat> Larger element = 503.128 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 1209 non-zero elements, NRBL set to 7 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2604292047163457862.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 7 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2604292047163457862.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2604292047163457862.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 9171 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 7 residue(s) per block. Blocpdb> 1209 residues. Blocpdb> 52 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 57 atoms in block 2 Block first atom: 53 Blocpdb> 62 atoms in block 3 Block first atom: 110 Blocpdb> 59 atoms in block 4 Block first atom: 172 Blocpdb> 58 atoms in block 5 Block first atom: 231 Blocpdb> 49 atoms in block 6 Block first atom: 289 Blocpdb> 57 atoms in block 7 Block first atom: 338 Blocpdb> 46 atoms in block 8 Block first atom: 395 Blocpdb> 46 atoms in block 9 Block first atom: 441 Blocpdb> 55 atoms in block 10 Block first atom: 487 Blocpdb> 51 atoms in block 11 Block first atom: 542 Blocpdb> 53 atoms in block 12 Block first atom: 593 Blocpdb> 58 atoms in block 13 Block first atom: 646 Blocpdb> 56 atoms in block 14 Block first atom: 704 Blocpdb> 56 atoms in block 15 Block first atom: 760 Blocpdb> 55 atoms in block 16 Block first atom: 816 Blocpdb> 50 atoms in block 17 Block first atom: 871 Blocpdb> 50 atoms in block 18 Block first atom: 921 Blocpdb> 45 atoms in block 19 Block first atom: 971 Blocpdb> 50 atoms in block 20 Block first atom: 1016 Blocpdb> 51 atoms in block 21 Block first atom: 1066 Blocpdb> 40 atoms in block 22 Block first atom: 1117 Blocpdb> 47 atoms in block 23 Block first atom: 1157 Blocpdb> 57 atoms in block 24 Block first atom: 1204 Blocpdb> 51 atoms in block 25 Block first atom: 1261 Blocpdb> 57 atoms in block 26 Block first atom: 1312 Blocpdb> 59 atoms in block 27 Block first atom: 1369 Blocpdb> 51 atoms in block 28 Block first atom: 1428 Blocpdb> 60 atoms in block 29 Block first atom: 1479 Blocpdb> 57 atoms in block 30 Block first atom: 1539 Blocpdb> 46 atoms in block 31 Block first atom: 1596 Blocpdb> 55 atoms in block 32 Block first atom: 1642 Blocpdb> 53 atoms in block 33 Block first atom: 1697 Blocpdb> 50 atoms in block 34 Block first atom: 1750 Blocpdb> 51 atoms in block 35 Block first atom: 1800 Blocpdb> 55 atoms in block 36 Block first atom: 1851 Blocpdb> 53 atoms in block 37 Block first atom: 1906 Blocpdb> 51 atoms in block 38 Block first atom: 1959 Blocpdb> 61 atoms in block 39 Block first atom: 2010 Blocpdb> 42 atoms in block 40 Block first atom: 2071 Blocpdb> 61 atoms in block 41 Block first atom: 2113 Blocpdb> 66 atoms in block 42 Block first atom: 2174 Blocpdb> 23 atoms in block 43 Block first atom: 2240 Blocpdb> 56 atoms in block 44 Block first atom: 2263 Blocpdb> 43 atoms in block 45 Block first atom: 2319 Blocpdb> 53 atoms in block 46 Block first atom: 2362 Blocpdb> 53 atoms in block 47 Block first atom: 2415 Blocpdb> 64 atoms in block 48 Block first atom: 2468 Blocpdb> 57 atoms in block 49 Block first atom: 2532 Blocpdb> 68 atoms in block 50 Block first atom: 2589 Blocpdb> 43 atoms in block 51 Block first atom: 2657 Blocpdb> 60 atoms in block 52 Block first atom: 2700 Blocpdb> 44 atoms in block 53 Block first atom: 2760 Blocpdb> 55 atoms in block 54 Block first atom: 2804 Blocpdb> 46 atoms in block 55 Block first atom: 2859 Blocpdb> 53 atoms in block 56 Block first atom: 2905 Blocpdb> 57 atoms in block 57 Block first atom: 2958 Blocpdb> 50 atoms in block 58 Block first atom: 3015 Blocpdb> 53 atoms in block 59 Block first atom: 3065 Blocpdb> 62 atoms in block 60 Block first atom: 3118 Blocpdb> 55 atoms in block 61 Block first atom: 3180 Blocpdb> 45 atoms in block 62 Block first atom: 3235 Blocpdb> 56 atoms in block 63 Block first atom: 3280 Blocpdb> 46 atoms in block 64 Block first atom: 3336 Blocpdb> 44 atoms in block 65 Block first atom: 3382 Blocpdb> 55 atoms in block 66 Block first atom: 3426 Blocpdb> 42 atoms in block 67 Block first atom: 3481 Blocpdb> 47 atoms in block 68 Block first atom: 3523 Blocpdb> 47 atoms in block 69 Block first atom: 3570 Blocpdb> 57 atoms in block 70 Block first atom: 3617 Blocpdb> 50 atoms in block 71 Block first atom: 3674 Blocpdb> 62 atoms in block 72 Block first atom: 3724 Blocpdb> 59 atoms in block 73 Block first atom: 3786 Blocpdb> 54 atoms in block 74 Block first atom: 3845 Blocpdb> 58 atoms in block 75 Block first atom: 3899 Blocpdb> 53 atoms in block 76 Block first atom: 3957 Blocpdb> 49 atoms in block 77 Block first atom: 4010 Blocpdb> 53 atoms in block 78 Block first atom: 4059 Blocpdb> 56 atoms in block 79 Block first atom: 4112 Blocpdb> 46 atoms in block 80 Block first atom: 4168 Blocpdb> 55 atoms in block 81 Block first atom: 4214 Blocpdb> 53 atoms in block 82 Block first atom: 4269 Blocpdb> 50 atoms in block 83 Block first atom: 4322 Blocpdb> 55 atoms in block 84 Block first atom: 4372 Blocpdb> 54 atoms in block 85 Block first atom: 4427 Blocpdb> 53 atoms in block 86 Block first atom: 4481 Blocpdb> 66 atoms in block 87 Block first atom: 4534 Blocpdb> 48 atoms in block 88 Block first atom: 4600 Blocpdb> 52 atoms in block 89 Block first atom: 4648 Blocpdb> 57 atoms in block 90 Block first atom: 4700 Blocpdb> 62 atoms in block 91 Block first atom: 4757 Blocpdb> 59 atoms in block 92 Block first atom: 4819 Blocpdb> 58 atoms in block 93 Block first atom: 4878 Blocpdb> 49 atoms in block 94 Block first atom: 4936 Blocpdb> 57 atoms in block 95 Block first atom: 4985 Blocpdb> 46 atoms in block 96 Block first atom: 5042 Blocpdb> 46 atoms in block 97 Block first atom: 5088 Blocpdb> 55 atoms in block 98 Block first atom: 5134 Blocpdb> 51 atoms in block 99 Block first atom: 5189 Blocpdb> 53 atoms in block 100 Block first atom: 5240 Blocpdb> 58 atoms in block 101 Block first atom: 5293 Blocpdb> 56 atoms in block 102 Block first atom: 5351 Blocpdb> 56 atoms in block 103 Block first atom: 5407 Blocpdb> 55 atoms in block 104 Block first atom: 5463 Blocpdb> 50 atoms in block 105 Block first atom: 5518 Blocpdb> 50 atoms in block 106 Block first atom: 5568 Blocpdb> 45 atoms in block 107 Block first atom: 5618 Blocpdb> 50 atoms in block 108 Block first atom: 5663 Blocpdb> 51 atoms in block 109 Block first atom: 5713 Blocpdb> 40 atoms in block 110 Block first atom: 5764 Blocpdb> 47 atoms in block 111 Block first atom: 5804 Blocpdb> 57 atoms in block 112 Block first atom: 5851 Blocpdb> 51 atoms in block 113 Block first atom: 5908 Blocpdb> 57 atoms in block 114 Block first atom: 5959 Blocpdb> 59 atoms in block 115 Block first atom: 6016 Blocpdb> 51 atoms in block 116 Block first atom: 6075 Blocpdb> 60 atoms in block 117 Block first atom: 6126 Blocpdb> 57 atoms in block 118 Block first atom: 6186 Blocpdb> 46 atoms in block 119 Block first atom: 6243 Blocpdb> 55 atoms in block 120 Block first atom: 6289 Blocpdb> 53 atoms in block 121 Block first atom: 6344 Blocpdb> 50 atoms in block 122 Block first atom: 6397 Blocpdb> 51 atoms in block 123 Block first atom: 6447 Blocpdb> 55 atoms in block 124 Block first atom: 6498 Blocpdb> 53 atoms in block 125 Block first atom: 6553 Blocpdb> 51 atoms in block 126 Block first atom: 6606 Blocpdb> 61 atoms in block 127 Block first atom: 6657 Blocpdb> 42 atoms in block 128 Block first atom: 6718 Blocpdb> 61 atoms in block 129 Block first atom: 6760 Blocpdb> 66 atoms in block 130 Block first atom: 6821 Blocpdb> 23 atoms in block 131 Block first atom: 6887 Blocpdb> 52 atoms in block 132 Block first atom: 6910 Blocpdb> 57 atoms in block 133 Block first atom: 6962 Blocpdb> 62 atoms in block 134 Block first atom: 7019 Blocpdb> 59 atoms in block 135 Block first atom: 7081 Blocpdb> 58 atoms in block 136 Block first atom: 7140 Blocpdb> 49 atoms in block 137 Block first atom: 7198 Blocpdb> 57 atoms in block 138 Block first atom: 7247 Blocpdb> 46 atoms in block 139 Block first atom: 7304 Blocpdb> 46 atoms in block 140 Block first atom: 7350 Blocpdb> 55 atoms in block 141 Block first atom: 7396 Blocpdb> 51 atoms in block 142 Block first atom: 7451 Blocpdb> 53 atoms in block 143 Block first atom: 7502 Blocpdb> 58 atoms in block 144 Block first atom: 7555 Blocpdb> 56 atoms in block 145 Block first atom: 7613 Blocpdb> 56 atoms in block 146 Block first atom: 7669 Blocpdb> 55 atoms in block 147 Block first atom: 7725 Blocpdb> 50 atoms in block 148 Block first atom: 7780 Blocpdb> 50 atoms in block 149 Block first atom: 7830 Blocpdb> 45 atoms in block 150 Block first atom: 7880 Blocpdb> 50 atoms in block 151 Block first atom: 7925 Blocpdb> 51 atoms in block 152 Block first atom: 7975 Blocpdb> 40 atoms in block 153 Block first atom: 8026 Blocpdb> 47 atoms in block 154 Block first atom: 8066 Blocpdb> 57 atoms in block 155 Block first atom: 8113 Blocpdb> 51 atoms in block 156 Block first atom: 8170 Blocpdb> 57 atoms in block 157 Block first atom: 8221 Blocpdb> 59 atoms in block 158 Block first atom: 8278 Blocpdb> 51 atoms in block 159 Block first atom: 8337 Blocpdb> 60 atoms in block 160 Block first atom: 8388 Blocpdb> 57 atoms in block 161 Block first atom: 8448 Blocpdb> 46 atoms in block 162 Block first atom: 8505 Blocpdb> 55 atoms in block 163 Block first atom: 8551 Blocpdb> 53 atoms in block 164 Block first atom: 8606 Blocpdb> 50 atoms in block 165 Block first atom: 8659 Blocpdb> 51 atoms in block 166 Block first atom: 8709 Blocpdb> 55 atoms in block 167 Block first atom: 8760 Blocpdb> 53 atoms in block 168 Block first atom: 8815 Blocpdb> 51 atoms in block 169 Block first atom: 8868 Blocpdb> 61 atoms in block 170 Block first atom: 8919 Blocpdb> 42 atoms in block 171 Block first atom: 8980 Blocpdb> 61 atoms in block 172 Block first atom: 9022 Blocpdb> 66 atoms in block 173 Block first atom: 9083 Blocpdb> 23 atoms in block 174 Block first atom: 9148 Blocpdb> 174 blocks. Blocpdb> At most, 68 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 23 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 3661369 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 27513 Prepmat> Matrix trace = 8014920.0000 Prepmat> Last element read: 27513 27513 53.8411 Prepmat> 15226 lines saved. Prepmat> 13650 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 9171 RTB> Total mass = 9171.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 9171 RTB> Number of blocks = 174 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 203262.8231 RTB> 54090 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1044 Diagstd> Nb of non-zero elements: 54090 Diagstd> Projected matrix trace = 203262.8231 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1044 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 203262.8231 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.7212103 1.4593674 1.9724174 2.4234765 3.1465343 3.2687114 4.2090249 4.3961363 4.6900246 5.7841733 6.0727193 6.2877452 6.4254165 6.6765600 8.8006189 9.4552104 9.7883203 9.8983200 12.3594008 14.7747810 15.7656762 15.9957933 16.2696894 16.4665484 17.1260294 18.0294995 18.5439757 18.7667484 21.2009468 21.5493499 21.7256546 22.1755060 22.4914657 22.6438083 22.8924363 23.3246749 23.4862980 24.2616014 24.3663862 24.5791959 25.3630492 25.7907734 26.0946682 26.5144309 26.8575624 27.4143176 27.8251326 28.2983081 29.3244420 29.6538229 29.7354809 29.9653754 31.4402168 31.8606262 32.5916818 32.7116018 32.7919495 33.3133710 33.6042443 33.7517310 33.9694840 34.6706085 35.4883055 35.6349825 35.9047550 36.0882927 36.1885151 36.4305960 36.7066767 36.9782927 37.8301346 38.1780324 38.6245300 38.7942412 39.1441469 39.2361727 39.5862885 40.0287611 40.6093844 41.1922590 41.2919084 42.3456252 42.4469746 42.9458335 43.5994583 44.0099925 44.0573121 44.4400515 44.9499308 45.2895144 45.7056587 46.1116342 46.5798329 46.7775767 47.1122640 47.4928213 47.8410151 48.7582678 48.8107618 49.3843339 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034339 0.0034341 0.0034350 0.0034351 0.0034353 0.0034357 92.2202369 131.1830115 152.5087266 169.0498093 192.6244975 196.3285988 222.7850424 227.6831316 235.1704978 261.1655730 267.6004778 272.2969307 275.2617843 280.5896568 322.1453647 333.9111183 339.7421002 341.6457529 381.7631347 417.4032316 431.1730238 434.3083434 438.0108930 440.6528338 449.3902268 461.0914999 467.6239056 470.4243528 500.0033439 504.0949727 506.1528836 511.3662365 514.9963596 516.7375417 519.5666749 524.4487801 526.2626687 534.8783410 536.0321539 538.3678480 546.8850005 551.4770748 554.7166090 559.1604367 562.7669407 568.5700779 572.8143664 577.6642825 588.0444546 591.3377780 592.1514040 594.4360527 608.8888852 612.9463086 619.9385827 621.0780571 621.8403490 626.7647612 629.4950897 630.8749824 632.9067906 639.4049771 646.9011327 648.2366107 650.6857022 652.3466680 653.2518708 655.4331732 657.9120088 660.3416771 667.9042753 670.9683755 674.8805067 676.3615506 679.4049344 680.2030874 683.2311725 687.0389432 692.0038060 696.9523471 697.7948472 706.6421765 707.4873041 711.6325397 717.0275239 720.3953944 720.7825755 723.9066351 728.0476328 730.7925520 734.1423311 737.3955921 741.1297445 742.7012249 745.3534532 748.3577578 751.0960414 758.2622138 758.6702832 763.1148074 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 9171 Rtb_to_modes> Number of blocs = 174 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9998E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0006E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0007E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0008E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0010E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7212 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.459 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.972 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.423 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.147 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.269 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.209 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.396 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.690 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.784 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.073 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.288 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.425 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.677 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.801 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.455 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.788 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.898 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.38 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1044 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00003 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 0.99998 0.99997 1.00000 1.00004 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 0.99998 1.00001 0.99999 0.99998 0.99999 1.00002 0.99996 0.99998 1.00002 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 0.99998 1.00000 1.00002 1.00000 0.99998 1.00001 1.00000 1.00002 0.99998 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 0.99999 0.99997 0.99999 0.99998 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 0.99999 0.99998 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 0.99997 1.00002 1.00001 0.99999 1.00002 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00002 1.00001 1.00002 1.00000 1.00004 1.00000 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 165078 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00003 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 0.99998 0.99997 1.00000 1.00004 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 0.99998 1.00001 0.99999 0.99998 0.99999 1.00002 0.99996 0.99998 1.00002 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 0.99998 1.00000 1.00002 1.00000 0.99998 1.00001 1.00000 1.00002 0.99998 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 0.99999 0.99997 0.99999 0.99998 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 0.99999 0.99998 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 0.99997 1.00002 1.00001 0.99999 1.00002 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00002 1.00001 1.00002 1.00000 1.00004 1.00000 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3: 0.000 0.000 Vector 4:-0.000 0.000 0.000 Vector 5: 0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 6:-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 7:-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 8: 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 9: 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 10: 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2604292047163457862.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2604292047163457862.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2604292047163457862.atom Openam> file on opening on unit 11: 2604292047163457862.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 1209 First residue number = 18 Last residue number = 315 Number of atoms found = 9171 Mean number per residue = 7.6 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9998E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0006E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0007E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0008E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0010E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7212 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.459 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.972 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.423 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.147 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.269 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.209 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.396 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.690 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.784 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.073 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.288 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.425 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.677 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.801 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.455 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.788 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.898 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.38 Bfactors> 106 vectors, 27513 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.721200 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= -0.386 for 1209 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.014 +/- 0.01 Bfactors> = 87.468 +/- 9.50 Bfactors> Shiftng-fct= 87.454 Bfactors> Scaling-fct= 941.609 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2604292047163457862.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2604292047163457862.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4348E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4350E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4352E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4355E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 92.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 131.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 152.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 169.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 192.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 196.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 222.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 227.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 235.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 261.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 267.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 272.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 275.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 280.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 322.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 333.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 339.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 341.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 381.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 417.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 431.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 434.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 438.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 440.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 449.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 461.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 467.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 470.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 500.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 504.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 506.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 511.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 515.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 516.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 519.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 524.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 526.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 534.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 536.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 538.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 546.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 551.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 554.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 559.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 562.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 568.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 572.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 577.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 588.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 591.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 592.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 594.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 608.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 612.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 619.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 621.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 621.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 626.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 629.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 630.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 632.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 639.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 646.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 648.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 650.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 652.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 653.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 655.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 657.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 660.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 667.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 671.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 674.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 676.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 679.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 680.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 683.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 687.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 692.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 696.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 697.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 706.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 707.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 711.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 717.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 720.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 720.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 723.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 728.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 730.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 734.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 737.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 741.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 742.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 745.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 748.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 751.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 758.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 758.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 763.0 Chkmod> 106 vectors, 27513 coordinates in file. Chkmod> That is: 9171 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. Chkmod> Normal end. 0.0034 0.8723 0.0034 0.7350 0.0034 0.8038 0.0034 0.8037 0.0034 0.9604 0.0034 0.9381 92.2156 0.7135 131.1609 0.7125 152.4860 0.6962 169.0259 0.8795 192.6305 0.6793 196.3288 0.6713 222.7748 0.6009 227.6698 0.7666 235.1598 0.6300 261.1505 0.6659 267.5952 0.6824 272.2908 0.8086 275.2410 0.8305 280.5869 0.8529 322.1385 0.5575 333.8931 0.7532 339.7220 0.7409 341.6256 0.5720 381.7560 0.0760 417.3178 0.1329 431.2136 0.3620 434.3468 0.4182 437.9963 0.4852 440.6801 0.3925 449.4230 0.5101 461.0781 0.3051 467.5537 0.2431 470.4449 0.4180 499.9707 0.4554 504.0809 0.3266 506.1818 0.2333 511.3961 0.2095 514.9575 0.1008 516.6719 0.1349 519.5167 0.2454 524.3737 0.4007 526.2815 0.3608 534.8377 0.5058 536.0489 0.4607 538.3535 0.4916 546.8287 0.5316 551.4451 0.6049 554.6432 0.4474 559.0897 0.6583 562.7683 0.5108 568.5009 0.3127 572.8399 0.4369 577.6568 0.4056 587.9747 0.4972 591.2743 0.6052 592.1710 0.5090 594.4564 0.5405 608.8606 0.3658 612.9140 0.4023 619.8960 0.4131 621.0362 0.4743 621.7952 0.5040 626.7061 0.5198 629.4283 0.4856 630.8317 0.4551 632.8844 0.4379 639.3719 0.5070 646.8888 0.2970 648.1635 0.4117 650.6147 0.3556 652.3341 0.5037 653.2372 0.3280 655.3997 0.5033 657.9135 0.4348 660.3286 0.4982 667.8744 0.4467 670.9569 0.5057 674.8120 0.4669 676.2955 0.4532 679.3398 0.4895 680.2071 0.3324 683.2339 0.4067 687.0201 0.5433 691.9793 0.4643 696.9033 0.4621 697.7488 0.5132 706.6483 0.5972 707.4821 0.5210 711.6365 0.3410 717.0012 0.4737 720.3645 0.3913 720.7736 0.4483 723.8751 0.3999 728.0169 0.4748 730.7651 0.4773 734.1457 0.3954 737.3509 0.3960 741.0993 0.4603 742.6886 0.4033 745.3035 0.3286 748.3034 0.4096 751.0558 0.3784 758.2431 0.3877 758.6318 0.3350 763.0486 0.5060 getting mode 7 running: ../../bin/get_modes.sh 2604292047163457862 7 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 7 calculating perturbed structure for DQ=-100 2604292047163457862.eigenfacs 2604292047163457862.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2604292047163457862.eigenfacs 2604292047163457862.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2604292047163457862.eigenfacs 2604292047163457862.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2604292047163457862.eigenfacs 2604292047163457862.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2604292047163457862.eigenfacs 2604292047163457862.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2604292047163457862.eigenfacs 2604292047163457862.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2604292047163457862.eigenfacs 2604292047163457862.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2604292047163457862.eigenfacs 2604292047163457862.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2604292047163457862.eigenfacs 2604292047163457862.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2604292047163457862.eigenfacs 2604292047163457862.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2604292047163457862.eigenfacs 2604292047163457862.atom making animated gifs 11 models are in 2604292047163457862.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2604292047163457862.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2604292047163457862.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 2604292047163457862 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 2604292047163457862.eigenfacs 2604292047163457862.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2604292047163457862.eigenfacs 2604292047163457862.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2604292047163457862.eigenfacs 2604292047163457862.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2604292047163457862.eigenfacs 2604292047163457862.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2604292047163457862.eigenfacs 2604292047163457862.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2604292047163457862.eigenfacs 2604292047163457862.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2604292047163457862.eigenfacs 2604292047163457862.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2604292047163457862.eigenfacs 2604292047163457862.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2604292047163457862.eigenfacs 2604292047163457862.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2604292047163457862.eigenfacs 2604292047163457862.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2604292047163457862.eigenfacs 2604292047163457862.atom making animated gifs 11 models are in 2604292047163457862.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2604292047163457862.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2604292047163457862.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 2604292047163457862 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 2604292047163457862.eigenfacs 2604292047163457862.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2604292047163457862.eigenfacs 2604292047163457862.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2604292047163457862.eigenfacs 2604292047163457862.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2604292047163457862.eigenfacs 2604292047163457862.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2604292047163457862.eigenfacs 2604292047163457862.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2604292047163457862.eigenfacs 2604292047163457862.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2604292047163457862.eigenfacs 2604292047163457862.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2604292047163457862.eigenfacs 2604292047163457862.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2604292047163457862.eigenfacs 2604292047163457862.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2604292047163457862.eigenfacs 2604292047163457862.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2604292047163457862.eigenfacs 2604292047163457862.atom making animated gifs 11 models are in 2604292047163457862.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2604292047163457862.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2604292047163457862.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 2604292047163457862 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 2604292047163457862.eigenfacs 2604292047163457862.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2604292047163457862.eigenfacs 2604292047163457862.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2604292047163457862.eigenfacs 2604292047163457862.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2604292047163457862.eigenfacs 2604292047163457862.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2604292047163457862.eigenfacs 2604292047163457862.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2604292047163457862.eigenfacs 2604292047163457862.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2604292047163457862.eigenfacs 2604292047163457862.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2604292047163457862.eigenfacs 2604292047163457862.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2604292047163457862.eigenfacs 2604292047163457862.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2604292047163457862.eigenfacs 2604292047163457862.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2604292047163457862.eigenfacs 2604292047163457862.atom making animated gifs 11 models are in 2604292047163457862.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2604292047163457862.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2604292047163457862.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 2604292047163457862 11 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-100 2604292047163457862.eigenfacs 2604292047163457862.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2604292047163457862.eigenfacs 2604292047163457862.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2604292047163457862.eigenfacs 2604292047163457862.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2604292047163457862.eigenfacs 2604292047163457862.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2604292047163457862.eigenfacs 2604292047163457862.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2604292047163457862.eigenfacs 2604292047163457862.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2604292047163457862.eigenfacs 2604292047163457862.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2604292047163457862.eigenfacs 2604292047163457862.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2604292047163457862.eigenfacs 2604292047163457862.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2604292047163457862.eigenfacs 2604292047163457862.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2604292047163457862.eigenfacs 2604292047163457862.atom making animated gifs 11 models are in 2604292047163457862.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2604292047163457862.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2604292047163457862.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 2604292047163457862.10.pdb 2604292047163457862.11.pdb 2604292047163457862.7.pdb 2604292047163457862.8.pdb 2604292047163457862.9.pdb STDERR: Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL real 0m48.496s user 0m48.169s sys 0m0.303s rm: cannot remove '2604292047163457862.sdijf': No such file or directory pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format




If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:

elNémo is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Between 2015 and 2025, it was hosted by US2B (Nantes).
Last modification: april 24th, 2026.