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LOGs for ID: 2604300009033496681

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2604300009033496681.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2604300009033496681.atom to be opened. Openam> File opened: 2604300009033496681.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 1288 First residue number = 1 Last residue number = 322 Number of atoms found = 9732 Mean number per residue = 7.6 Pdbmat> Coordinate statistics: = -1.083644 +/- 18.503620 From: -60.951000 To: 53.767000 = 0.033227 +/- 17.791474 From: -60.789000 To: 46.516000 = 0.375426 +/- 20.760361 From: -43.258000 To: 49.131000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 0.9061 % Filled. Pdbmat> 3862098 non-zero elements. Pdbmat> 422704 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 86.87 +/- 23.55 Maximum number = 135 Minimum number = 14 Pdbmat> Matrix trace = 8.454080E+06 Pdbmat> Larger element = 500.058 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 1288 non-zero elements, NRBL set to 7 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2604300009033496681.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 7 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2604300009033496681.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2604300009033496681.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 9732 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 7 residue(s) per block. Blocpdb> 1288 residues. Blocpdb> 56 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 43 atoms in block 2 Block first atom: 57 Blocpdb> 53 atoms in block 3 Block first atom: 100 Blocpdb> 53 atoms in block 4 Block first atom: 153 Blocpdb> 64 atoms in block 5 Block first atom: 206 Blocpdb> 57 atoms in block 6 Block first atom: 270 Blocpdb> 68 atoms in block 7 Block first atom: 327 Blocpdb> 43 atoms in block 8 Block first atom: 395 Blocpdb> 60 atoms in block 9 Block first atom: 438 Blocpdb> 44 atoms in block 10 Block first atom: 498 Blocpdb> 55 atoms in block 11 Block first atom: 542 Blocpdb> 46 atoms in block 12 Block first atom: 597 Blocpdb> 53 atoms in block 13 Block first atom: 643 Blocpdb> 57 atoms in block 14 Block first atom: 696 Blocpdb> 50 atoms in block 15 Block first atom: 753 Blocpdb> 53 atoms in block 16 Block first atom: 803 Blocpdb> 62 atoms in block 17 Block first atom: 856 Blocpdb> 55 atoms in block 18 Block first atom: 918 Blocpdb> 45 atoms in block 19 Block first atom: 973 Blocpdb> 56 atoms in block 20 Block first atom: 1018 Blocpdb> 46 atoms in block 21 Block first atom: 1074 Blocpdb> 44 atoms in block 22 Block first atom: 1120 Blocpdb> 55 atoms in block 23 Block first atom: 1164 Blocpdb> 42 atoms in block 24 Block first atom: 1219 Blocpdb> 47 atoms in block 25 Block first atom: 1261 Blocpdb> 47 atoms in block 26 Block first atom: 1308 Blocpdb> 57 atoms in block 27 Block first atom: 1355 Blocpdb> 50 atoms in block 28 Block first atom: 1412 Blocpdb> 62 atoms in block 29 Block first atom: 1462 Blocpdb> 59 atoms in block 30 Block first atom: 1524 Blocpdb> 54 atoms in block 31 Block first atom: 1583 Blocpdb> 58 atoms in block 32 Block first atom: 1637 Blocpdb> 53 atoms in block 33 Block first atom: 1695 Blocpdb> 49 atoms in block 34 Block first atom: 1748 Blocpdb> 53 atoms in block 35 Block first atom: 1797 Blocpdb> 56 atoms in block 36 Block first atom: 1850 Blocpdb> 46 atoms in block 37 Block first atom: 1906 Blocpdb> 55 atoms in block 38 Block first atom: 1952 Blocpdb> 53 atoms in block 39 Block first atom: 2007 Blocpdb> 50 atoms in block 40 Block first atom: 2060 Blocpdb> 55 atoms in block 41 Block first atom: 2110 Blocpdb> 54 atoms in block 42 Block first atom: 2165 Blocpdb> 53 atoms in block 43 Block first atom: 2219 Blocpdb> 66 atoms in block 44 Block first atom: 2272 Blocpdb> 48 atoms in block 45 Block first atom: 2338 Blocpdb> 48 atoms in block 46 Block first atom: 2386 Blocpdb> 56 atoms in block 47 Block first atom: 2434 Blocpdb> 43 atoms in block 48 Block first atom: 2490 Blocpdb> 53 atoms in block 49 Block first atom: 2533 Blocpdb> 53 atoms in block 50 Block first atom: 2586 Blocpdb> 64 atoms in block 51 Block first atom: 2639 Blocpdb> 57 atoms in block 52 Block first atom: 2703 Blocpdb> 68 atoms in block 53 Block first atom: 2760 Blocpdb> 43 atoms in block 54 Block first atom: 2828 Blocpdb> 60 atoms in block 55 Block first atom: 2871 Blocpdb> 44 atoms in block 56 Block first atom: 2931 Blocpdb> 55 atoms in block 57 Block first atom: 2975 Blocpdb> 46 atoms in block 58 Block first atom: 3030 Blocpdb> 53 atoms in block 59 Block first atom: 3076 Blocpdb> 57 atoms in block 60 Block first atom: 3129 Blocpdb> 50 atoms in block 61 Block first atom: 3186 Blocpdb> 53 atoms in block 62 Block first atom: 3236 Blocpdb> 62 atoms in block 63 Block first atom: 3289 Blocpdb> 55 atoms in block 64 Block first atom: 3351 Blocpdb> 45 atoms in block 65 Block first atom: 3406 Blocpdb> 56 atoms in block 66 Block first atom: 3451 Blocpdb> 46 atoms in block 67 Block first atom: 3507 Blocpdb> 44 atoms in block 68 Block first atom: 3553 Blocpdb> 55 atoms in block 69 Block first atom: 3597 Blocpdb> 42 atoms in block 70 Block first atom: 3652 Blocpdb> 47 atoms in block 71 Block first atom: 3694 Blocpdb> 47 atoms in block 72 Block first atom: 3741 Blocpdb> 57 atoms in block 73 Block first atom: 3788 Blocpdb> 50 atoms in block 74 Block first atom: 3845 Blocpdb> 62 atoms in block 75 Block first atom: 3895 Blocpdb> 59 atoms in block 76 Block first atom: 3957 Blocpdb> 54 atoms in block 77 Block first atom: 4016 Blocpdb> 58 atoms in block 78 Block first atom: 4070 Blocpdb> 53 atoms in block 79 Block first atom: 4128 Blocpdb> 49 atoms in block 80 Block first atom: 4181 Blocpdb> 53 atoms in block 81 Block first atom: 4230 Blocpdb> 56 atoms in block 82 Block first atom: 4283 Blocpdb> 46 atoms in block 83 Block first atom: 4339 Blocpdb> 55 atoms in block 84 Block first atom: 4385 Blocpdb> 53 atoms in block 85 Block first atom: 4440 Blocpdb> 50 atoms in block 86 Block first atom: 4493 Blocpdb> 55 atoms in block 87 Block first atom: 4543 Blocpdb> 54 atoms in block 88 Block first atom: 4598 Blocpdb> 53 atoms in block 89 Block first atom: 4652 Blocpdb> 66 atoms in block 90 Block first atom: 4705 Blocpdb> 48 atoms in block 91 Block first atom: 4771 Blocpdb> 48 atoms in block 92 Block first atom: 4819 Blocpdb> 56 atoms in block 93 Block first atom: 4867 Blocpdb> 43 atoms in block 94 Block first atom: 4923 Blocpdb> 53 atoms in block 95 Block first atom: 4966 Blocpdb> 53 atoms in block 96 Block first atom: 5019 Blocpdb> 64 atoms in block 97 Block first atom: 5072 Blocpdb> 57 atoms in block 98 Block first atom: 5136 Blocpdb> 68 atoms in block 99 Block first atom: 5193 Blocpdb> 43 atoms in block 100 Block first atom: 5261 Blocpdb> 60 atoms in block 101 Block first atom: 5304 Blocpdb> 44 atoms in block 102 Block first atom: 5364 Blocpdb> 55 atoms in block 103 Block first atom: 5408 Blocpdb> 46 atoms in block 104 Block first atom: 5463 Blocpdb> 53 atoms in block 105 Block first atom: 5509 Blocpdb> 57 atoms in block 106 Block first atom: 5562 Blocpdb> 50 atoms in block 107 Block first atom: 5619 Blocpdb> 53 atoms in block 108 Block first atom: 5669 Blocpdb> 62 atoms in block 109 Block first atom: 5722 Blocpdb> 55 atoms in block 110 Block first atom: 5784 Blocpdb> 45 atoms in block 111 Block first atom: 5839 Blocpdb> 56 atoms in block 112 Block first atom: 5884 Blocpdb> 46 atoms in block 113 Block first atom: 5940 Blocpdb> 44 atoms in block 114 Block first atom: 5986 Blocpdb> 55 atoms in block 115 Block first atom: 6030 Blocpdb> 42 atoms in block 116 Block first atom: 6085 Blocpdb> 47 atoms in block 117 Block first atom: 6127 Blocpdb> 47 atoms in block 118 Block first atom: 6174 Blocpdb> 57 atoms in block 119 Block first atom: 6221 Blocpdb> 50 atoms in block 120 Block first atom: 6278 Blocpdb> 62 atoms in block 121 Block first atom: 6328 Blocpdb> 59 atoms in block 122 Block first atom: 6390 Blocpdb> 54 atoms in block 123 Block first atom: 6449 Blocpdb> 58 atoms in block 124 Block first atom: 6503 Blocpdb> 53 atoms in block 125 Block first atom: 6561 Blocpdb> 49 atoms in block 126 Block first atom: 6614 Blocpdb> 53 atoms in block 127 Block first atom: 6663 Blocpdb> 56 atoms in block 128 Block first atom: 6716 Blocpdb> 46 atoms in block 129 Block first atom: 6772 Blocpdb> 55 atoms in block 130 Block first atom: 6818 Blocpdb> 53 atoms in block 131 Block first atom: 6873 Blocpdb> 50 atoms in block 132 Block first atom: 6926 Blocpdb> 55 atoms in block 133 Block first atom: 6976 Blocpdb> 54 atoms in block 134 Block first atom: 7031 Blocpdb> 53 atoms in block 135 Block first atom: 7085 Blocpdb> 66 atoms in block 136 Block first atom: 7138 Blocpdb> 48 atoms in block 137 Block first atom: 7204 Blocpdb> 48 atoms in block 138 Block first atom: 7252 Blocpdb> 56 atoms in block 139 Block first atom: 7300 Blocpdb> 43 atoms in block 140 Block first atom: 7356 Blocpdb> 53 atoms in block 141 Block first atom: 7399 Blocpdb> 53 atoms in block 142 Block first atom: 7452 Blocpdb> 64 atoms in block 143 Block first atom: 7505 Blocpdb> 57 atoms in block 144 Block first atom: 7569 Blocpdb> 68 atoms in block 145 Block first atom: 7626 Blocpdb> 43 atoms in block 146 Block first atom: 7694 Blocpdb> 60 atoms in block 147 Block first atom: 7737 Blocpdb> 44 atoms in block 148 Block first atom: 7797 Blocpdb> 55 atoms in block 149 Block first atom: 7841 Blocpdb> 46 atoms in block 150 Block first atom: 7896 Blocpdb> 53 atoms in block 151 Block first atom: 7942 Blocpdb> 57 atoms in block 152 Block first atom: 7995 Blocpdb> 50 atoms in block 153 Block first atom: 8052 Blocpdb> 53 atoms in block 154 Block first atom: 8102 Blocpdb> 62 atoms in block 155 Block first atom: 8155 Blocpdb> 55 atoms in block 156 Block first atom: 8217 Blocpdb> 45 atoms in block 157 Block first atom: 8272 Blocpdb> 56 atoms in block 158 Block first atom: 8317 Blocpdb> 46 atoms in block 159 Block first atom: 8373 Blocpdb> 44 atoms in block 160 Block first atom: 8419 Blocpdb> 55 atoms in block 161 Block first atom: 8463 Blocpdb> 42 atoms in block 162 Block first atom: 8518 Blocpdb> 47 atoms in block 163 Block first atom: 8560 Blocpdb> 47 atoms in block 164 Block first atom: 8607 Blocpdb> 57 atoms in block 165 Block first atom: 8654 Blocpdb> 50 atoms in block 166 Block first atom: 8711 Blocpdb> 62 atoms in block 167 Block first atom: 8761 Blocpdb> 59 atoms in block 168 Block first atom: 8823 Blocpdb> 54 atoms in block 169 Block first atom: 8882 Blocpdb> 58 atoms in block 170 Block first atom: 8936 Blocpdb> 53 atoms in block 171 Block first atom: 8994 Blocpdb> 49 atoms in block 172 Block first atom: 9047 Blocpdb> 53 atoms in block 173 Block first atom: 9096 Blocpdb> 56 atoms in block 174 Block first atom: 9149 Blocpdb> 46 atoms in block 175 Block first atom: 9205 Blocpdb> 55 atoms in block 176 Block first atom: 9251 Blocpdb> 53 atoms in block 177 Block first atom: 9306 Blocpdb> 50 atoms in block 178 Block first atom: 9359 Blocpdb> 55 atoms in block 179 Block first atom: 9409 Blocpdb> 54 atoms in block 180 Block first atom: 9464 Blocpdb> 53 atoms in block 181 Block first atom: 9518 Blocpdb> 66 atoms in block 182 Block first atom: 9571 Blocpdb> 48 atoms in block 183 Block first atom: 9637 Blocpdb> 48 atoms in block 184 Block first atom: 9684 Blocpdb> 184 blocks. Blocpdb> At most, 68 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 42 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 3862282 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 29196 Prepmat> Matrix trace = 8454080.0000 Prepmat> Last element read: 29196 29196 121.2950 Prepmat> 17021 lines saved. Prepmat> 15348 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 9732 RTB> Total mass = 9732.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 9732 RTB> Number of blocks = 184 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 212054.3754 RTB> 57432 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1104 Diagstd> Nb of non-zero elements: 57432 Diagstd> Projected matrix trace = 212054.3754 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1104 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 212054.3754 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.3345376 0.3505549 0.3557495 0.3764915 0.6296579 0.6593784 0.6832153 0.7392918 1.2285123 1.3315282 1.7065711 1.9962064 2.1318370 2.3410637 2.4793165 3.2662432 4.4301970 4.6596834 5.1310014 5.2525595 5.3981490 5.6120248 5.6502174 6.0892668 6.1833184 7.3884583 8.7868937 9.1688278 9.2098644 9.7544047 14.1240200 14.2562348 14.3144134 14.7353760 14.9494756 15.0240651 15.2220259 15.5177656 15.6064647 15.9753927 16.7247675 17.2245182 19.8643780 20.1660962 20.2954717 20.5689365 20.7603398 21.3715630 21.7000449 21.9653063 22.2913531 22.6978719 23.2372962 23.4328474 23.8713737 24.3217947 25.2127420 25.6554139 25.7097522 26.0028052 26.8584639 27.5201939 28.0017433 28.5343225 28.6130639 28.7808097 28.9654679 29.4502032 29.5829417 30.1277509 30.3409070 30.4319794 30.4895156 31.3841766 31.6422356 31.8507435 32.1954148 32.5985063 33.0688678 33.5329851 33.7495375 34.0073980 34.4969211 34.6947790 35.4413363 35.5264483 35.9868974 36.6675407 37.0129419 37.5763149 37.8007445 38.0412994 38.2228175 38.3868923 38.5394318 39.2453872 40.1192104 41.2735930 41.4948154 42.1115636 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034321 0.0034327 0.0034340 0.0034344 0.0034347 0.0034353 62.8083996 64.2944248 64.7690324 66.6304726 86.1683152 88.1784887 89.7581858 93.3691124 120.3607918 125.3055934 141.8591899 153.4256600 158.5522032 166.1505941 170.9862804 196.2544627 228.5634590 234.4085701 245.9780466 248.8747117 252.3002695 257.2498160 258.1236867 267.9648213 270.0263119 295.1699861 321.8940625 328.8154296 329.5504419 339.1530025 408.1073744 410.0130686 410.8488337 416.8462428 419.8636334 420.9097727 423.6737031 427.7695568 428.9903746 434.0313016 444.0944288 450.6805559 483.9859625 487.6477194 489.2094696 492.4942892 494.7804246 502.0112191 505.8544748 508.9368667 512.7002107 517.3540468 523.4655165 525.6634883 530.5593668 535.5414487 545.2621107 550.0279935 550.6101657 553.7393435 562.7763848 569.6669510 574.6293648 580.0682072 580.8680142 582.5682132 584.4341088 589.3040534 590.6306213 596.0444336 598.1492467 599.0462869 599.6123131 608.3459903 610.8419575 612.8512375 616.1582853 620.0034849 624.4604576 628.8273000 630.8544821 633.2598917 637.8013699 639.6278176 646.4729002 647.2486839 651.4295919 657.5611887 660.6509791 665.6598670 667.6447787 669.7657759 671.3618030 672.8011998 674.1366425 680.2829547 687.8147248 697.6400733 699.5072158 704.6865194 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 9732 Rtb_to_modes> Number of blocs = 184 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9893E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9927E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0005E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0008E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3345 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3506 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3557 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3765 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6297 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6594 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6832 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7393 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.229 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.332 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.707 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.996 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.132 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.341 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.479 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.266 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.430 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.660 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.131 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.253 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.398 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.612 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.650 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.089 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.183 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.388 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.787 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.169 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.210 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.754 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.11 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1104 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 1.00002 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 0.99997 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 0.99994 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 1.00001 0.99995 0.99999 0.99999 0.99996 1.00005 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 0.99997 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 1.00002 1.00003 0.99999 1.00001 1.00002 0.99997 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 1.00003 1.00001 0.99998 1.00000 1.00003 1.00001 0.99999 0.99998 1.00001 1.00001 0.99999 0.99997 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 0.99999 0.99999 0.99997 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 1.00002 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 0.99997 1.00000 1.00000 1.00002 1.00001 1.00001 1.00002 1.00000 1.00000 1.00002 0.99999 1.00000 1.00001 1.00003 1.00000 1.00002 1.00002 1.00002 1.00002 0.99999 1.00000 0.99998 1.00001 1.00000 0.99999 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 175176 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 1.00002 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 0.99997 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 0.99994 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 1.00001 0.99995 0.99999 0.99999 0.99996 1.00005 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 0.99997 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 1.00002 1.00003 0.99999 1.00001 1.00002 0.99997 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 1.00003 1.00001 0.99998 1.00000 1.00003 1.00001 0.99999 0.99998 1.00001 1.00001 0.99999 0.99997 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 0.99999 0.99999 0.99997 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 1.00002 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 0.99997 1.00000 1.00000 1.00002 1.00001 1.00001 1.00002 1.00000 1.00000 1.00002 0.99999 1.00000 1.00001 1.00003 1.00000 1.00002 1.00002 1.00002 1.00002 0.99999 1.00000 0.99998 1.00001 1.00000 0.99999 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3:-0.000-0.000 Vector 4: 0.000-0.000 0.000 Vector 5: 0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 6:-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 7:-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 8: 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 9:-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 10:-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2604300009033496681.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2604300009033496681.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2604300009033496681.atom Openam> file on opening on unit 11: 2604300009033496681.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 1288 First residue number = 1 Last residue number = 322 Number of atoms found = 9732 Mean number per residue = 7.6 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9893E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9927E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0005E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0008E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3345 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3506 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3557 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3765 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6297 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6594 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6832 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7393 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.229 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.332 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.707 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.996 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.132 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.341 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.479 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.266 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.430 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.660 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.131 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.253 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.398 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.612 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.650 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.089 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.183 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.388 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.787 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.169 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.210 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.754 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.11 Bfactors> 106 vectors, 29196 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.334500 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= -0.394 for 1288 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.040 +/- 0.23 Bfactors> = 83.572 +/- 17.72 Bfactors> Shiftng-fct= 83.532 Bfactors> Scaling-fct= 78.342 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2604300009033496681.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2604300009033496681.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4320E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4326E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4347E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4352E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 62.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 64.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 64.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 66.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 86.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 88.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 89.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 93.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 120.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 125.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 141.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 153.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 158.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 166.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 171.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 196.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 228.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 234.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 246.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 248.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 252.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 257.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 258.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 267.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 270.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 295.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 321.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 328.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 329.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 339.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 408.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 410.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 410.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 416.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 419.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 420.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 423.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 427.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 429.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 434.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 444.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 450.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 483.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 487.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 489.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 492.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 494.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 502.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 505.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 509.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 512.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 517.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 523.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 525.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 530.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 535.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 545.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 550.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 550.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 553.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 562.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 569.6 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vecteur en lecture: 599.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 599.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 608.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 610.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 612.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 616.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 620.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 624.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 628.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 630.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 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Chkmod> That is: 9732 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 14 is: 0.9999 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 26 is: 0.9999 (instead of 1.0000). Chkmod> Normal end. 0.0034 0.8119 0.0034 0.7339 0.0034 0.7476 0.0034 0.9906 0.0034 0.8217 0.0034 0.8882 62.8022 0.0049 64.2958 0.0086 64.7617 0.0107 66.6284 0.0058 86.1675 0.0260 88.1761 0.0119 89.7533 0.0110 93.3656 0.0224 120.3795 0.7135 125.3224 0.6014 141.8709 0.6948 153.4111 0.6946 158.5515 0.6863 166.1412 0.5852 170.9680 0.6833 196.2387 0.6727 228.5486 0.4798 234.4065 0.8197 245.9675 0.0419 248.8745 0.0255 252.2860 0.0374 257.2382 0.2073 258.1076 0.3384 267.9474 0.4610 270.0078 0.3189 295.1482 0.6969 321.8822 0.7248 328.8044 0.7870 329.5387 0.5573 339.1314 0.7200 408.0318 0.1987 410.0496 0.2268 410.7679 0.2395 416.8937 0.1462 419.8530 0.4520 420.8348 0.3248 423.6273 0.3222 427.7820 0.3947 429.0205 0.2514 434.0753 0.4315 444.0121 0.4706 450.6021 0.4407 483.9119 0.0598 487.6740 0.3893 489.2430 0.0735 492.4859 0.0783 494.7551 0.5899 501.9713 0.4307 505.8322 0.2970 508.9694 0.3132 512.6626 0.3569 517.3561 0.2271 523.4735 0.3223 525.6090 0.3658 530.5213 0.5504 535.4987 0.3110 545.2091 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perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 2604300009033496681.eigenfacs 2604300009033496681.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2604300009033496681.eigenfacs 2604300009033496681.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2604300009033496681.eigenfacs 2604300009033496681.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2604300009033496681.eigenfacs 2604300009033496681.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2604300009033496681.eigenfacs 2604300009033496681.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2604300009033496681.eigenfacs 2604300009033496681.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2604300009033496681.eigenfacs 2604300009033496681.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2604300009033496681.eigenfacs 2604300009033496681.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2604300009033496681.eigenfacs 2604300009033496681.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2604300009033496681.eigenfacs 2604300009033496681.atom 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animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 2604300009033496681 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 2604300009033496681.eigenfacs 2604300009033496681.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2604300009033496681.eigenfacs 2604300009033496681.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2604300009033496681.eigenfacs 2604300009033496681.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2604300009033496681.eigenfacs 2604300009033496681.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2604300009033496681.eigenfacs 2604300009033496681.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2604300009033496681.eigenfacs 2604300009033496681.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2604300009033496681.eigenfacs 2604300009033496681.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2604300009033496681.eigenfacs 2604300009033496681.atom calculating perturbed structure for DQ=60 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will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 2604300009033496681 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 2604300009033496681.eigenfacs 2604300009033496681.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2604300009033496681.eigenfacs 2604300009033496681.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2604300009033496681.eigenfacs 2604300009033496681.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2604300009033496681.eigenfacs 2604300009033496681.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2604300009033496681.eigenfacs 2604300009033496681.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2604300009033496681.eigenfacs 2604300009033496681.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2604300009033496681.eigenfacs 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gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2604300009033496681.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 2604300009033496681 11 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-100 2604300009033496681.eigenfacs 2604300009033496681.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2604300009033496681.eigenfacs 2604300009033496681.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2604300009033496681.eigenfacs 2604300009033496681.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2604300009033496681.eigenfacs 2604300009033496681.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2604300009033496681.eigenfacs 2604300009033496681.atom 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MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2604300009033496681.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 2604300009033496681.10.pdb 2604300009033496681.11.pdb 2604300009033496681.7.pdb 2604300009033496681.8.pdb 2604300009033496681.9.pdb STDERR: Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL real 0m49.995s user 0m49.658s sys 0m0.313s rm: cannot remove '2604300009033496681.sdijf': No such file or directory pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format 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