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please let us know.
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Some cleaning from time to time
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* WT Pentamer different chains *

LOGs for ID: 2605010821103745296

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:

CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
 Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
 Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.    

 Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.

 Pdbmat> Coordinate filename     = 2605010821103745296.atom

 Pdbmat> Distance cutoff         =       8.00
         Force constant          =      10.00
         Origin of mass values   =       CONS
 Pdbmat> Levelshift              =    1.0E-09
         PRINTing level          =          2

 Pdbmat> Coordinate file 2605010821103745296.atom to be opened.

 Openam> File opened: 2605010821103745296.atom

 Pdbmat> Coordinate file in PDB format.

 Rdatompdb> Reading pdb file.
 Rdatompdb> End of file reached.
 Rdatompdb> Number of I/O errors:      0

 Rdatompdb> Number of residues found =    645
            First residue number     =      1
            Last  residue number     =    129
            Number of atoms found    =   4825
            Mean number per residue  =      7.5

 Pdbmat> Coordinate statistics: 
 =   -62.410712 +/-    21.706751 From:  -109.015000 To:   -11.982000
 =    36.032946 +/-    23.923823 From:   -19.706000 To:    85.640000
 =    94.335221 +/-    16.620212 From:    49.689000 To:   130.413000
 Pdbmat> Masses are all set to one.

 Openam> File opened: pdbmat.xyzm
 Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.

 Openam> File opened: pdbmat.sdijb

 Pdbmat> Matrix statistics:

 Pdbmat> The matrix is   1.4542 % Filled.
 Pdbmat>      1523607  non-zero elements.
 Pdbmat>       166103 atom-atom interactions.

 Pdbmat> Number per atom=     68.85 +/-     19.23
         Maximum number =    118
         Minimum number =     15

 Pdbmat> Matrix trace   = 3.322060E+06
 Pdbmat> Larger element =  469.192    
 Pdbmat>      0 elements larger than +/-  1.0E+10

 Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
645 non-zero elements, NRBL set to 4
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
 Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
 Diagrtb> Version 2.52, November 2004. 
 Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.

 Diagrtb> Options taken into account:

 MATRix filename          = pdbmat.sdijb
 COORdinates filename     = 2605010821103745296.atom
 Eigenvector OUTPut file  = matrix.eigenrtb
 Nb of VECTors required   =        106
 EigeNVALues chosen       =       LOWE
 Type of SUBStructuring   =       NONE
 Nb of residues per BLOck =          4
 Origin of MASS values    =       CONS
 MATRix FORMat            =       BINA
 Temporary files cleaning =       ALL 
 Output PRINting level    =          2

 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.

 Blocpdb> Entering in.

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.xyzm   

 Blocpdb> Coordinate file 2605010821103745296.atom to be opened.

 Openam> file on opening on unit     11:
 2605010821103745296.atom                                                                                                        

 Blocpdb> Coordinate file in PDB format.

 Blocpdb>  4825 atoms picked in pdb file.
 Blocpdb>   All masses set to unity.
 Blocpdb> Coordinate file is rewritten.

 Blocpdb> Substructuring:
 Blocpdb>     4 residue(s) per block.
 Blocpdb>   645 residues.
 Blocpdb>    30 atoms in block      1
 Block first atom:      1
 Blocpdb>    34 atoms in block      2
 Block first atom:     31
 Blocpdb>    31 atoms in block      3
 Block first atom:     65
 Blocpdb>    19 atoms in block      4
 Block first atom:     96
 Blocpdb>    29 atoms in block      5
 Block first atom:    115
 Blocpdb>    26 atoms in block      6
 Block first atom:    144
 Blocpdb>    28 atoms in block      7
 Block first atom:    170
 Blocpdb>    35 atoms in block      8
 Block first atom:    198
 Blocpdb>    28 atoms in block      9
 Block first atom:    233
 Blocpdb>    32 atoms in block     10
 Block first atom:    261
 Blocpdb>    33 atoms in block     11
 Block first atom:    293
 Blocpdb>    26 atoms in block     12
 Block first atom:    326
 Blocpdb>    32 atoms in block     13
 Block first atom:    352
 Blocpdb>    33 atoms in block     14
 Block first atom:    384
 Blocpdb>    36 atoms in block     15
 Block first atom:    417
 Blocpdb>    32 atoms in block     16
 Block first atom:    453
 Blocpdb>    28 atoms in block     17
 Block first atom:    485
 Blocpdb>    30 atoms in block     18
 Block first atom:    513
 Blocpdb>    24 atoms in block     19
 Block first atom:    543
 Blocpdb>    27 atoms in block     20
 Block first atom:    567
 Blocpdb>    36 atoms in block     21
 Block first atom:    594
 Blocpdb>    36 atoms in block     22
 Block first atom:    630
 Blocpdb>    32 atoms in block     23
 Block first atom:    666
 Blocpdb>    31 atoms in block     24
 Block first atom:    698
 Blocpdb>    29 atoms in block     25
 Block first atom:    729
 Blocpdb>    31 atoms in block     26
 Block first atom:    758
 Blocpdb>    29 atoms in block     27
 Block first atom:    789
 Blocpdb>    29 atoms in block     28
 Block first atom:    818
 Blocpdb>    29 atoms in block     29
 Block first atom:    847
 Blocpdb>    28 atoms in block     30
 Block first atom:    876
 Blocpdb>    23 atoms in block     31
 Block first atom:    904
 Blocpdb>    26 atoms in block     32
 Block first atom:    927
 Blocpdb>    13 atoms in block     33
 Block first atom:    953
 Blocpdb>    30 atoms in block     34
 Block first atom:    966
 Blocpdb>    34 atoms in block     35
 Block first atom:    996
 Blocpdb>    31 atoms in block     36
 Block first atom:   1030
 Blocpdb>    19 atoms in block     37
 Block first atom:   1061
 Blocpdb>    29 atoms in block     38
 Block first atom:   1080
 Blocpdb>    26 atoms in block     39
 Block first atom:   1109
 Blocpdb>    28 atoms in block     40
 Block first atom:   1135
 Blocpdb>    35 atoms in block     41
 Block first atom:   1163
 Blocpdb>    28 atoms in block     42
 Block first atom:   1198
 Blocpdb>    32 atoms in block     43
 Block first atom:   1226
 Blocpdb>    33 atoms in block     44
 Block first atom:   1258
 Blocpdb>    26 atoms in block     45
 Block first atom:   1291
 Blocpdb>    32 atoms in block     46
 Block first atom:   1317
 Blocpdb>    33 atoms in block     47
 Block first atom:   1349
 Blocpdb>    36 atoms in block     48
 Block first atom:   1382
 Blocpdb>    32 atoms in block     49
 Block first atom:   1418
 Blocpdb>    28 atoms in block     50
 Block first atom:   1450
 Blocpdb>    30 atoms in block     51
 Block first atom:   1478
 Blocpdb>    24 atoms in block     52
 Block first atom:   1508
 Blocpdb>    27 atoms in block     53
 Block first atom:   1532
 Blocpdb>    36 atoms in block     54
 Block first atom:   1559
 Blocpdb>    36 atoms in block     55
 Block first atom:   1595
 Blocpdb>    32 atoms in block     56
 Block first atom:   1631
 Blocpdb>    31 atoms in block     57
 Block first atom:   1663
 Blocpdb>    29 atoms in block     58
 Block first atom:   1694
 Blocpdb>    31 atoms in block     59
 Block first atom:   1723
 Blocpdb>    29 atoms in block     60
 Block first atom:   1754
 Blocpdb>    29 atoms in block     61
 Block first atom:   1783
 Blocpdb>    29 atoms in block     62
 Block first atom:   1812
 Blocpdb>    28 atoms in block     63
 Block first atom:   1841
 Blocpdb>    23 atoms in block     64
 Block first atom:   1869
 Blocpdb>    26 atoms in block     65
 Block first atom:   1892
 Blocpdb>    13 atoms in block     66
 Block first atom:   1918
 Blocpdb>    30 atoms in block     67
 Block first atom:   1931
 Blocpdb>    34 atoms in block     68
 Block first atom:   1961
 Blocpdb>    31 atoms in block     69
 Block first atom:   1995
 Blocpdb>    19 atoms in block     70
 Block first atom:   2026
 Blocpdb>    29 atoms in block     71
 Block first atom:   2045
 Blocpdb>    26 atoms in block     72
 Block first atom:   2074
 Blocpdb>    28 atoms in block     73
 Block first atom:   2100
 Blocpdb>    35 atoms in block     74
 Block first atom:   2128
 Blocpdb>    28 atoms in block     75
 Block first atom:   2163
 Blocpdb>    32 atoms in block     76
 Block first atom:   2191
 Blocpdb>    33 atoms in block     77
 Block first atom:   2223
 Blocpdb>    26 atoms in block     78
 Block first atom:   2256
 Blocpdb>    32 atoms in block     79
 Block first atom:   2282
 Blocpdb>    33 atoms in block     80
 Block first atom:   2314
 Blocpdb>    36 atoms in block     81
 Block first atom:   2347
 Blocpdb>    32 atoms in block     82
 Block first atom:   2383
 Blocpdb>    28 atoms in block     83
 Block first atom:   2415
 Blocpdb>    30 atoms in block     84
 Block first atom:   2443
 Blocpdb>    24 atoms in block     85
 Block first atom:   2473
 Blocpdb>    27 atoms in block     86
 Block first atom:   2497
 Blocpdb>    36 atoms in block     87
 Block first atom:   2524
 Blocpdb>    36 atoms in block     88
 Block first atom:   2560
 Blocpdb>    32 atoms in block     89
 Block first atom:   2596
 Blocpdb>    31 atoms in block     90
 Block first atom:   2628
 Blocpdb>    29 atoms in block     91
 Block first atom:   2659
 Blocpdb>    31 atoms in block     92
 Block first atom:   2688
 Blocpdb>    29 atoms in block     93
 Block first atom:   2719
 Blocpdb>    29 atoms in block     94
 Block first atom:   2748
 Blocpdb>    29 atoms in block     95
 Block first atom:   2777
 Blocpdb>    28 atoms in block     96
 Block first atom:   2806
 Blocpdb>    23 atoms in block     97
 Block first atom:   2834
 Blocpdb>    26 atoms in block     98
 Block first atom:   2857
 Blocpdb>    13 atoms in block     99
 Block first atom:   2883
 Blocpdb>    30 atoms in block    100
 Block first atom:   2896
 Blocpdb>    34 atoms in block    101
 Block first atom:   2926
 Blocpdb>    31 atoms in block    102
 Block first atom:   2960
 Blocpdb>    19 atoms in block    103
 Block first atom:   2991
 Blocpdb>    29 atoms in block    104
 Block first atom:   3010
 Blocpdb>    26 atoms in block    105
 Block first atom:   3039
 Blocpdb>    28 atoms in block    106
 Block first atom:   3065
 Blocpdb>    35 atoms in block    107
 Block first atom:   3093
 Blocpdb>    28 atoms in block    108
 Block first atom:   3128
 Blocpdb>    32 atoms in block    109
 Block first atom:   3156
 Blocpdb>    33 atoms in block    110
 Block first atom:   3188
 Blocpdb>    26 atoms in block    111
 Block first atom:   3221
 Blocpdb>    32 atoms in block    112
 Block first atom:   3247
 Blocpdb>    33 atoms in block    113
 Block first atom:   3279
 Blocpdb>    36 atoms in block    114
 Block first atom:   3312
 Blocpdb>    32 atoms in block    115
 Block first atom:   3348
 Blocpdb>    28 atoms in block    116
 Block first atom:   3380
 Blocpdb>    30 atoms in block    117
 Block first atom:   3408
 Blocpdb>    24 atoms in block    118
 Block first atom:   3438
 Blocpdb>    27 atoms in block    119
 Block first atom:   3462
 Blocpdb>    36 atoms in block    120
 Block first atom:   3489
 Blocpdb>    36 atoms in block    121
 Block first atom:   3525
 Blocpdb>    32 atoms in block    122
 Block first atom:   3561
 Blocpdb>    31 atoms in block    123
 Block first atom:   3593
 Blocpdb>    29 atoms in block    124
 Block first atom:   3624
 Blocpdb>    31 atoms in block    125
 Block first atom:   3653
 Blocpdb>    29 atoms in block    126
 Block first atom:   3684
 Blocpdb>    29 atoms in block    127
 Block first atom:   3713
 Blocpdb>    29 atoms in block    128
 Block first atom:   3742
 Blocpdb>    28 atoms in block    129
 Block first atom:   3771
 Blocpdb>    23 atoms in block    130
 Block first atom:   3799
 Blocpdb>    26 atoms in block    131
 Block first atom:   3822
 Blocpdb>    13 atoms in block    132
 Block first atom:   3848
 Blocpdb>    30 atoms in block    133
 Block first atom:   3861
 Blocpdb>    34 atoms in block    134
 Block first atom:   3891
 Blocpdb>    31 atoms in block    135
 Block first atom:   3925
 Blocpdb>    19 atoms in block    136
 Block first atom:   3956
 Blocpdb>    29 atoms in block    137
 Block first atom:   3975
 Blocpdb>    26 atoms in block    138
 Block first atom:   4004
 Blocpdb>    28 atoms in block    139
 Block first atom:   4030
 Blocpdb>    35 atoms in block    140
 Block first atom:   4058
 Blocpdb>    28 atoms in block    141
 Block first atom:   4093
 Blocpdb>    32 atoms in block    142
 Block first atom:   4121
 Blocpdb>    33 atoms in block    143
 Block first atom:   4153
 Blocpdb>    26 atoms in block    144
 Block first atom:   4186
 Blocpdb>    32 atoms in block    145
 Block first atom:   4212
 Blocpdb>    33 atoms in block    146
 Block first atom:   4244
 Blocpdb>    36 atoms in block    147
 Block first atom:   4277
 Blocpdb>    32 atoms in block    148
 Block first atom:   4313
 Blocpdb>    28 atoms in block    149
 Block first atom:   4345
 Blocpdb>    30 atoms in block    150
 Block first atom:   4373
 Blocpdb>    24 atoms in block    151
 Block first atom:   4403
 Blocpdb>    27 atoms in block    152
 Block first atom:   4427
 Blocpdb>    36 atoms in block    153
 Block first atom:   4454
 Blocpdb>    36 atoms in block    154
 Block first atom:   4490
 Blocpdb>    32 atoms in block    155
 Block first atom:   4526
 Blocpdb>    31 atoms in block    156
 Block first atom:   4558
 Blocpdb>    29 atoms in block    157
 Block first atom:   4589
 Blocpdb>    31 atoms in block    158
 Block first atom:   4618
 Blocpdb>    29 atoms in block    159
 Block first atom:   4649
 Blocpdb>    29 atoms in block    160
 Block first atom:   4678
 Blocpdb>    29 atoms in block    161
 Block first atom:   4707
 Blocpdb>    28 atoms in block    162
 Block first atom:   4736
 Blocpdb>    23 atoms in block    163
 Block first atom:   4764
 Blocpdb>    26 atoms in block    164
 Block first atom:   4787
 Blocpdb>    13 atoms in block    165
 Block first atom:   4812

 Blocpdb>   165 blocks.

 Blocpdb> At most,     36 atoms in each of them.
 Blocpdb> At least,    13 atoms in each of them.

 Blocpdb> Normal end of Blocpdb.

 Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
 Diagrtb> Memory allocation for RTB.
 Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
 Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.

 Prepmat> Entering in.
 Prepmat> Rewriting of the matrix begins.

 Prepmat>      1523772 matrix lines read.

 Prepmat> Matrix order    =      14475

 Prepmat> Matrix trace    =    3322060.0000
 Prepmat> Last element read:   14475  14475       190.0426
 Prepmat>        13696 lines saved.
 Prepmat>        12710 empty lines.
 Prepmat> Number of lines on output is as expected.
 Prepmat> Normal end of Prepmat.

 RTB> Entering in.
 RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file:  4825
 RTB> Total mass =        4825.0000
 RTB> Number of atoms found in matrix:  4825
 RTB> Number of blocks =   165
 RTB> Projection begins.
 RTB> Projected matrix is being saved.
 RTB> Projected matrix trace =  154247.4433
 RTB>     32985 non-zero elements.
 RTB> Normal end of RTB.

 Diagstd> Entering in.

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.sdijb                      
 Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb                      
 Diagstd> CERFACS matrix format.
 Diagstd> Projected matrix order =      990
 Diagstd> Nb of non-zero elements:    32985
 Diagstd> Projected matrix trace =  154247.4433

 Openam> file on opening on unit     11:
 diagrtb_work.eigenfacs                  
 Diagstd> Diagonalization.

 Diagstd>    990 eigenvectors are computed. 
 Diagstd>    106 of them to be saved. 

 Diagstd> Sum of eigenvalues = 154247.4433
 Diagstd> Best zero-eigenvalue found  :     0.000000

 Diagstd>      6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to:    0.0000000

 Diagstd> Selected eigenvalues: 
      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000
      0.0000000      0.0417352      0.0417366      0.1640367      0.1842775
      0.1843016      0.2451463      0.2451740      0.5153276      0.5153892
      0.5554407      0.5554550      0.7128723      0.8286593      0.8424482
      0.8425401      0.9144700      0.9145394      1.1001457      1.1002443
      1.4717949      1.4719548      1.7870935      1.8985684      1.8988481
      2.1120269      2.2105988      2.2110176      2.3993740      2.3999726
      2.4252365      2.6691873      2.6696779      2.6942078      2.6947001
      3.3977937      3.3981677      3.5058396      3.5065117      3.7185269
      3.9516406      3.9523160      3.9749323      4.0419883      4.0421419
      5.0683514      5.3930828      5.3934106      5.8181400      5.8696961
      5.8697133      5.9224104      5.9227839      6.0912035      6.0914332
      6.2338012      7.2931487      7.2935699      7.4146954      7.4151029
      8.1073606      8.1074870      8.1515749      8.1519079      8.1655253
      8.7271308      9.0321467      9.0328107      9.8525126      9.8526779
     10.1384889     10.1399200     10.2089029     11.1601337     11.1917627
     11.1922857     11.2209890     11.2217784     11.4305040     11.4309749
     12.5819431     12.8010555     12.8047301     13.3182432     14.0696691
     14.0724607     14.3735516     14.3804846     14.3826863     15.0580572
     15.0622616     15.3024604     15.3050067     16.1815594     16.1816252
     16.9300299     16.9319699     17.1260748     17.4910230     17.4911829
     17.5830051

 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
      0.0034317      0.0034332      0.0034334      0.0034342      0.0034345
      0.0034347     22.1843443     22.1847093     43.9810741     46.6156108
     46.6186616     53.7660325     53.7690609     77.9537421     77.9584046
     80.9308570     80.9318947     91.6856035     98.8515065     99.6705583
     99.6759914    103.8436683    103.8476079    113.8991248    113.9042294
    131.7403835    131.7475407    145.1673392    149.6264600    149.6374830
    157.8138110    161.4545347    161.4698268    168.2070731    168.2280528
    169.1111830    177.4127411    177.4290453    178.2423188    178.2586046
    200.1675998    200.1786154    203.3252438    203.3447326    209.4019613
    215.8658797    215.8843256    216.5011203    218.3196408    218.3237868
    244.4717264    252.1818494    252.1895138    261.9312790    263.0892421
    263.0896257    264.2679705    264.2763029    268.0074314    268.0124838
    271.1263664    293.2599885    293.2684569    295.6936097    295.7017346
    309.1968252    309.1992356    310.0387964    310.0451293    310.3039784
    320.7975349    326.3553768    326.3673722    340.8543013    340.8571612
    345.7656884    345.7900911    346.9643199    362.7688419    363.2825420
    363.2910286    363.7565728    363.7693676    367.1368443    367.1444066
    385.1847974    388.5242855    388.5800452    396.2951437    407.3213953
    407.3618016    411.6966441    411.7959221    411.8274443    421.3856599
    421.4444838    424.7915925    424.8269334    436.8229691    436.8238570
    446.8112941    446.8368935    449.3908217    454.1537306    454.1558063
    455.3463199

 Diagstd> Normal end.

 Rtb_to_modes> Entering in.

 Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file =   4825
 Rtb_to_modes> Number of blocs =    165

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.eigenfacs                  

 Openam> file on opening on unit     11:
 matrix.eigenrtb                         

 Rdmodfacs> Entering in.

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     1
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9867E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     2
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9956E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     3
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9965E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     4
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0002E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     5
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0003E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     6
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0005E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     7
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  4.1735E-02

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     8
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  4.1737E-02

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     9
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  0.1640    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    10
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  0.1843    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    11
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  0.1843    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    12
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  0.2451    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    13
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  0.2452    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    14
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  0.5153    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    15
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  0.5154    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    16
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  0.5554    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    17
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  0.5555    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    18
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  0.7129    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    19
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  0.8287    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    20
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  0.8424    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    21
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  0.8425    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    22
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  0.9145    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    23
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  0.9145    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    24
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   1.100    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    25
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   1.100    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    26
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   1.472    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    27
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   1.472    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    28
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   1.787    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    29
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   1.899    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    30
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   1.899    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    31
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   2.112    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    32
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   2.211    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    33
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   2.211    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    34
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   2.399    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    35
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   2.400    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    36
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   2.425    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    37
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   2.669    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    38
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   2.670    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    39
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   2.694    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    40
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   2.695    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    41
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   3.398    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    42
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   3.398    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    43
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   3.506    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    44
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   3.507    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    45
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   3.719    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    46
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   3.952    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    47
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   3.952    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    48
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   3.975    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    49
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   4.042    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    50
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   4.042    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    51
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   5.068    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    52
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   5.393    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    53
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   5.393    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    54
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   5.818    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    55
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   5.870    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    56
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   5.870    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    57
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   5.922    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    58
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   5.923    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    59
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   6.091    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    60
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   6.091    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    61
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   6.234    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    62
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   7.293    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    63
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   7.294    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    64
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   7.415    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    65
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   7.415    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    66
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   8.107    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    67
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   8.107    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    68
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   8.152    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    69
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   8.152    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    70
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   8.166    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    71
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   8.727    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    72
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   9.032    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    73
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   9.033    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    74
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   9.853    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    75
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   9.853    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    76
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   10.14    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    77
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   10.14    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    78
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   10.21    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    79
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   11.16    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    80
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   11.19    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    81
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   11.19    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    82
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   11.22    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    83
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   11.22    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    84
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   11.43    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    85
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   11.43    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    86
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   12.58    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    87
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   12.80    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    88
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   12.80    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    89
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   13.32    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    90
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   14.07    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    91
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   14.07    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    92
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   14.37    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    93
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   14.38    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    94
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   14.38    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    95
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   15.06    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    96
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   15.06    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    97
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   15.30    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    98
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   15.31    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    99
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   16.18    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   100
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   16.18    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   101
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   16.93    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   102
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   16.93    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   103
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   17.13    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   104
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   17.49    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   105
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   17.49    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   106
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   17.58    

 Rtb_to_modes>  106 vectors, with    990 coordinates in vector file.

 Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00004
 0.99999 1.00002 0.99999 1.00000 0.99997
 1.00001 1.00000 0.99998 1.00001 0.99998
 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 0.99997
 0.99998 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999
 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000
 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 0.99997
 1.00001 0.99998 1.00000 1.00001 1.00000
 1.00004 1.00002 1.00000 0.99999 0.99998
 1.00000 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000
 0.99998 0.99998 0.99998 1.00003 1.00003
 1.00003 0.99998 1.00000 1.00001 1.00001
 1.00001 0.99997 1.00001 1.00001 1.00000
 0.99999 0.99999 0.99998 1.00000 1.00000
 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000
 1.00000 1.00002 0.99999 1.00001 1.00001
 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00003
 1.00002 0.99999 0.99999 0.99999 0.99998
 1.00000 1.00000 0.99999 1.00003 0.99998
 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002
 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999
 0.99999

 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
 Rtb_to_modes>    86850 lines found in RTB file.

 Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00004
 0.99999 1.00002 0.99999 1.00000 0.99997
 1.00001 1.00000 0.99998 1.00001 0.99998
 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 0.99997
 0.99998 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999
 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000
 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 0.99997
 1.00001 0.99998 1.00000 1.00001 1.00000
 1.00004 1.00002 1.00000 0.99999 0.99998
 1.00000 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000
 0.99998 0.99998 0.99998 1.00003 1.00003
 1.00003 0.99998 1.00000 1.00001 1.00001
 1.00001 0.99997 1.00001 1.00001 1.00000
 0.99999 0.99999 0.99998 1.00000 1.00000
 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000
 1.00000 1.00002 0.99999 1.00001 1.00001
 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00003
 1.00002 0.99999 0.99999 0.99999 0.99998
 1.00000 1.00000 0.99999 1.00003 0.99998
 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002
 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999
 0.99999

 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
 Vector   2: 0.000
 Vector   3:-0.000-0.000
 Vector   4:-0.000 0.000-0.000
 Vector   5: 0.000 0.000 0.000 0.000
 Vector   6:-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000
 Vector   7: 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000
 Vector   8:-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000
 Vector   9:-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000
 Vector  10: 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000

 Rtb_to_modes>   106 eigenvectors saved.

 Rtb_to_modes> Normal end.

 Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
 Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.                
 Getnam> Eigenvector filename ?
 Getnam> 2605010821103745296.eigenfacs

 Openam> file on opening on unit     10:
 2605010821103745296.eigenfacs                                   
 Getnam> Corresponding pdb filename ?
 Getnam> 2605010821103745296.atom

 Openam> file on opening on unit     11:
 2605010821103745296.atom                                        
 Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
 Getnum>            0
 Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
 Getnum>        10000
%Getnum-Err: number larger than    106 This is not allowed. Sorry.

 Rdatompdb> Reading pdb file.
 Rdatompdb> End of file reached.
 Rdatompdb> Number of I/O errors:            0

 Rdatompdb> Number of residues found =    645
            First residue number     =      1
            Last  residue number     =    129
            Number of atoms found    =   4825
            Mean number per residue  =      7.5

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     1
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9867E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     2
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9956E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     3
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9965E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     4
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0002E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     5
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0003E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     6
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0005E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     7
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  4.1735E-02

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     8
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  4.1737E-02

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     9
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  0.1640    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    10
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  0.1843    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    11
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  0.1843    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    12
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  0.2451    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    13
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  0.2452    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    14
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  0.5153    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    15
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  0.5154    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    16
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  0.5554    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    17
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  0.5555    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    18
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  0.7129    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    19
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  0.8287    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    20
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  0.8424    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    21
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  0.8425    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    22
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  0.9145    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    23
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  0.9145    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    24
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   1.100    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    25
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   1.100    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    26
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   1.472    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    27
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   1.472    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    28
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   1.787    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    29
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   1.899    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    30
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   1.899    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    31
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   2.112    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    32
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   2.211    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    33
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   2.211    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    34
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   2.399    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    35
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   2.400    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    36
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   2.425    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    37
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   2.669    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    38
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   2.670    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    39
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   2.694    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    40
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   2.695    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    41
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   3.398    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    42
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   3.398    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    43
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   3.506    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    44
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   3.507    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    45
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   3.719    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    46
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   3.952    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    47
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   3.952    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    48
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   3.975    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    49
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   4.042    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    50
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   4.042    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    51
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   5.068    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    52
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   5.393    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    53
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   5.393    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    54
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   5.818    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    55
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   5.870    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    56
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   5.870    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    57
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   5.922    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    58
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   5.923    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    59
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   6.091    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    60
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   6.091    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    61
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   6.234    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    62
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   7.293    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    63
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   7.294    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    64
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   7.415    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    65
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   7.415    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    66
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   8.107    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    67
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   8.107    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    68
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   8.152    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    69
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   8.152    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    70
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   8.166    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    71
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   8.727    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    72
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   9.032    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    73
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   9.033    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    74
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   9.853    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    75
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   9.853    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    76
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   10.14    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    77
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   10.14    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    78
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   10.21    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    79
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   11.16    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    80
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   11.19    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    81
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   11.19    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    82
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   11.22    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    83
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   11.22    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    84
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   11.43    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    85
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   11.43    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    86
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   12.58    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    87
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   12.80    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    88
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   12.80    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    89
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   13.32    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    90
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   14.07    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    91
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   14.07    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    92
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   14.37    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    93
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   14.38    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    94
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   14.38    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    95
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   15.06    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    96
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   15.06    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    97
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   15.30    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    98
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   15.31    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    99
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   16.18    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   100
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   16.18    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   101
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   16.93    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   102
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   16.93    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   103
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   17.13    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   104
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   17.49    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   105
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   17.49    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   106
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   17.58    

 Bfactors>  106 vectors,  14475 coordinates in file.

 Openam> file on opening on unit     12:
 bfactors.pred                                                   

 Bfactors> Best zero-eigenvalue found  :     0.000000
 Bfactors>     6 eigenvalues less than :     0.000000
 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue  :     0.041735
 Bfactors>   100 eigenvectors will be considered.
 Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.

 Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
          (CHARMM units assumed for eigenvalues)

 Bfactors> Correlation=      0.455 for    645 C-alpha atoms.
 Bfactors> =      0.330 +/-   0.25
 Bfactors> =      9.808 +/-  12.77
 Bfactors> Shiftng-fct=      9.478
 Bfactors> Scaling-fct=     51.328

 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.

 Bfactors> Normal end.
check_modes
 Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.                
 Getnam> Eigenvector filename ?
 Getnam> 2605010821103745296.eigenfacs

 Openam> file on opening on unit     10:
 2605010821103745296.eigenfacs                                   

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     1
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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   177.4    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   200.2    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   252.2    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   263.1    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   264.2    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   264.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    59
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   268.0    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   268.0    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   271.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    62
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 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    63
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   293.3    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   295.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    65
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   295.7    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   309.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    68
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   310.0    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   310.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    70
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   310.3    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   326.3    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   326.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    74
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   340.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    75
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   340.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    76
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   345.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    77
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   345.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    78
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   347.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    79
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   362.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    80
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   363.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    81
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   363.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    82
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   363.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    83
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   363.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    84
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   367.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    85
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   367.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    86
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   385.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    87
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   388.5    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   388.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    89
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   396.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    90
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   407.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    91
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   407.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    92
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   411.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    93
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 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    94
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   411.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    95
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   421.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    96
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   421.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    97
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   424.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    98
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   424.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    99
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   436.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   100
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   436.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   101
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   446.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   102
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   446.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   103
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   449.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   104
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   454.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   105
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   454.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   106
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   455.3    

 Chkmod>  106 vectors,  14475 coordinates in file.
 Chkmod>      That is:   4825 cartesian points.

 Openam> file on opening on unit     11:
 Chkmod.res                                                      
 Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.

 Chkmod> Normal end.
      0.0034      0.7655
      0.0034      0.9399
      0.0034      0.9158
      0.0034      0.6794
      0.0034      0.7653
      0.0034      0.8982
     22.1833      0.5256
     22.1839      0.5234
     43.9743      0.5930
     46.6165      0.5336
     46.6165      0.5324
     53.7586      0.6438
     53.7696      0.6438
     77.9483      0.5426
     77.9559      0.5447
     80.9244      0.4767
     80.9317      0.4783
     91.6834      0.6603
     98.8497      0.5654
     99.6634      0.6291
     99.6693      0.6238
    103.8409      0.5361
    103.8409      0.5361
    113.8867      0.5730
    113.8867      0.5785
    131.7439      0.5699
    131.7439      0.5691
    145.1573      0.5699
    149.6370      0.4947
    149.6370      0.4938
    157.8060      0.6283
    161.4623      0.3945
    161.4623      0.3964
    168.1867      0.4868
    168.2218      0.4868
    169.0957      0.5216
    177.3989      0.5159
    177.4321      0.5155
    178.2278      0.4205
    178.2609      0.4195
    200.1651      0.4316
    200.1651      0.4329
    203.3212      0.2462
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    209.4063      0.2943
    215.8664      0.3386
    215.8664      0.3352
    216.4937      0.6087
    218.3106      0.2979
    218.3106      0.2948
    244.4528      0.4542
    252.1691      0.3926
    252.1691      0.3927
    261.9169      0.4014
    263.0848      0.3491
    263.0848      0.3479
    264.2475      0.2392
    264.2698      0.2387
    267.9914      0.2634
    267.9914      0.2641
    271.1191      0.5027
    293.2444      0.4051
    293.2645      0.4063
    295.6870      0.5823
    295.6870      0.5833
    309.1767      0.4875
    309.1767      0.4892
    310.0336      0.3904
    310.0336      0.3903
    310.2997      0.5692
    320.7814      0.6029
    326.3387      0.4917
    326.3568      0.4926
    340.8481      0.4910
    340.8481      0.4910
    345.7766      0.5141
    345.7766      0.5151
    346.9681      0.5353
    362.7511      0.6124
    363.2383      0.3965
    363.2383      0.3964
    363.7249      0.6136
    363.7249      0.6130
    367.1130      0.2408
    367.1130      0.2433
    385.1385      0.4016
    388.4916      0.4608
    388.4916      0.4610
    396.3043      0.4028
    407.3087      0.5190
    407.3087      0.5171
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    411.7713      0.5009
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    421.3948      0.5600
    424.7392      0.5051
    424.8780      0.5037
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    446.7917      0.3356
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    454.1210      0.5005
    454.1210      0.5022
    455.2879      0.4477
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2605010821103745296 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
2605010821103745296.eigenfacs
2605010821103745296.atom
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STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL

real	0m21.306s
user	0m21.132s
sys	0m0.167s
rm: cannot remove '2605010821103745296.sdijf': No such file or directory
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K. Suhre & Y.H. Sanejouand, ElNemo: a normal mode web-server for protein movement analysis and the generation of templates for molecular replacement. Nucleic Acids Research, 32, W610-W614, 2004.
K. Suhre & Y.H. Sanejouand, On the potential of normal mode analysis for solving difficult molecular replacement problems. Acta Cryst. D vol.60, p796-799, 2004 © International Union of Crystallography.
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