CNRS Nantes University US2B US2B
home |  start a new run |  job status |  references&downloads |  examples |  help  

Should you encounter any unexpected behaviour,
please let us know.
elNémo has been relocated.
**Some cleaning from time to time**
Sorry for the inconvenience.


***    ***

LOGs for ID: 2605021839343985898

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2605021839343985898.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2605021839343985898.atom to be opened. Openam> File opened: 2605021839343985898.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 134 First residue number = 11 Last residue number = 144 Number of atoms found = 1024 Mean number per residue = 7.6 Pdbmat> Coordinate statistics: = 1.559474 +/- 8.047903 From: -18.804000 To: 21.762000 = 0.409567 +/- 8.408445 From: -20.399000 To: 22.657000 = 1.052662 +/- 8.255538 From: -15.957000 To: 20.147000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 7.2063 % Filled. Pdbmat> 340145 non-zero elements. Pdbmat> 37114 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 72.49 +/- 21.31 Maximum number = 121 Minimum number = 14 Pdbmat> Matrix trace = 742280. Pdbmat> Larger element = 465.722 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 134 non-zero elements, NRBL set to 1 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2605021839343985898.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 1 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2605021839343985898.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2605021839343985898.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 1024 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 1 residue(s) per block. Blocpdb> 134 residues. Blocpdb> 9 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 9 atoms in block 2 Block first atom: 10 Blocpdb> 5 atoms in block 3 Block first atom: 19 Blocpdb> 7 atoms in block 4 Block first atom: 24 Blocpdb> 4 atoms in block 5 Block first atom: 31 Blocpdb> 7 atoms in block 6 Block first atom: 35 Blocpdb> 14 atoms in block 7 Block first atom: 42 Blocpdb> 9 atoms in block 8 Block first atom: 56 Blocpdb> 8 atoms in block 9 Block first atom: 65 Blocpdb> 5 atoms in block 10 Block first atom: 73 Blocpdb> 8 atoms in block 11 Block first atom: 78 Blocpdb> 6 atoms in block 12 Block first atom: 86 Blocpdb> 10 atoms in block 13 Block first atom: 92 Blocpdb> 8 atoms in block 14 Block first atom: 102 Blocpdb> 9 atoms in block 15 Block first atom: 110 Blocpdb> 4 atoms in block 16 Block first atom: 119 Blocpdb> 9 atoms in block 17 Block first atom: 123 Blocpdb> 6 atoms in block 18 Block first atom: 132 Blocpdb> 7 atoms in block 19 Block first atom: 138 Blocpdb> 9 atoms in block 20 Block first atom: 145 Blocpdb> 5 atoms in block 21 Block first atom: 154 Blocpdb> 8 atoms in block 22 Block first atom: 159 Blocpdb> 4 atoms in block 23 Block first atom: 167 Blocpdb> 5 atoms in block 24 Block first atom: 171 Blocpdb> 7 atoms in block 25 Block first atom: 176 Blocpdb> 9 atoms in block 26 Block first atom: 183 Blocpdb> 9 atoms in block 27 Block first atom: 192 Blocpdb> 6 atoms in block 28 Block first atom: 201 Blocpdb> 6 atoms in block 29 Block first atom: 207 Blocpdb> 8 atoms in block 30 Block first atom: 213 Blocpdb> 4 atoms in block 31 Block first atom: 221 Blocpdb> 7 atoms in block 32 Block first atom: 225 Blocpdb> 8 atoms in block 33 Block first atom: 232 Blocpdb> 5 atoms in block 34 Block first atom: 240 Blocpdb> 8 atoms in block 35 Block first atom: 245 Blocpdb> 7 atoms in block 36 Block first atom: 253 Blocpdb> 9 atoms in block 37 Block first atom: 260 Blocpdb> 7 atoms in block 38 Block first atom: 269 Blocpdb> 6 atoms in block 39 Block first atom: 276 Blocpdb> 12 atoms in block 40 Block first atom: 282 Blocpdb> 7 atoms in block 41 Block first atom: 294 Blocpdb> 6 atoms in block 42 Block first atom: 301 Blocpdb> 9 atoms in block 43 Block first atom: 307 Blocpdb> 9 atoms in block 44 Block first atom: 316 Blocpdb> 8 atoms in block 45 Block first atom: 325 Blocpdb> 4 atoms in block 46 Block first atom: 333 Blocpdb> 8 atoms in block 47 Block first atom: 337 Blocpdb> 9 atoms in block 48 Block first atom: 345 Blocpdb> 7 atoms in block 49 Block first atom: 354 Blocpdb> 7 atoms in block 50 Block first atom: 361 Blocpdb> 8 atoms in block 51 Block first atom: 368 Blocpdb> 9 atoms in block 52 Block first atom: 376 Blocpdb> 6 atoms in block 53 Block first atom: 385 Blocpdb> 9 atoms in block 54 Block first atom: 391 Blocpdb> 7 atoms in block 55 Block first atom: 400 Blocpdb> 4 atoms in block 56 Block first atom: 407 Blocpdb> 7 atoms in block 57 Block first atom: 411 Blocpdb> 7 atoms in block 58 Block first atom: 418 Blocpdb> 8 atoms in block 59 Block first atom: 425 Blocpdb> 8 atoms in block 60 Block first atom: 433 Blocpdb> 11 atoms in block 61 Block first atom: 441 Blocpdb> 4 atoms in block 62 Block first atom: 452 Blocpdb> 8 atoms in block 63 Block first atom: 456 Blocpdb> 9 atoms in block 64 Block first atom: 464 Blocpdb> 6 atoms in block 65 Block first atom: 473 Blocpdb> 9 atoms in block 66 Block first atom: 479 Blocpdb> 11 atoms in block 67 Block first atom: 488 Blocpdb> 9 atoms in block 68 Block first atom: 499 Blocpdb> 8 atoms in block 69 Block first atom: 508 Blocpdb> 4 atoms in block 70 Block first atom: 516 Blocpdb> 9 atoms in block 71 Block first atom: 520 Blocpdb> 9 atoms in block 72 Block first atom: 529 Blocpdb> 7 atoms in block 73 Block first atom: 538 Blocpdb> 8 atoms in block 74 Block first atom: 545 Blocpdb> 9 atoms in block 75 Block first atom: 553 Blocpdb> 8 atoms in block 76 Block first atom: 562 Blocpdb> 7 atoms in block 77 Block first atom: 570 Blocpdb> 5 atoms in block 78 Block first atom: 577 Blocpdb> 8 atoms in block 79 Block first atom: 582 Blocpdb> 8 atoms in block 80 Block first atom: 590 Blocpdb> 6 atoms in block 81 Block first atom: 598 Blocpdb> 9 atoms in block 82 Block first atom: 604 Blocpdb> 4 atoms in block 83 Block first atom: 613 Blocpdb> 7 atoms in block 84 Block first atom: 617 Blocpdb> 9 atoms in block 85 Block first atom: 624 Blocpdb> 6 atoms in block 86 Block first atom: 633 Blocpdb> 7 atoms in block 87 Block first atom: 639 Blocpdb> 7 atoms in block 88 Block first atom: 646 Blocpdb> 8 atoms in block 89 Block first atom: 653 Blocpdb> 8 atoms in block 90 Block first atom: 661 Blocpdb> 7 atoms in block 91 Block first atom: 669 Blocpdb> 4 atoms in block 92 Block first atom: 676 Blocpdb> 9 atoms in block 93 Block first atom: 680 Blocpdb> 9 atoms in block 94 Block first atom: 689 Blocpdb> 10 atoms in block 95 Block first atom: 698 Blocpdb> 7 atoms in block 96 Block first atom: 708 Blocpdb> 9 atoms in block 97 Block first atom: 715 Blocpdb> 7 atoms in block 98 Block first atom: 724 Blocpdb> 9 atoms in block 99 Block first atom: 731 Blocpdb> 9 atoms in block 100 Block first atom: 740 Blocpdb> 14 atoms in block 101 Block first atom: 749 Blocpdb> 8 atoms in block 102 Block first atom: 763 Blocpdb> 4 atoms in block 103 Block first atom: 771 Blocpdb> 9 atoms in block 104 Block first atom: 775 Blocpdb> 9 atoms in block 105 Block first atom: 784 Blocpdb> 7 atoms in block 106 Block first atom: 793 Blocpdb> 7 atoms in block 107 Block first atom: 800 Blocpdb> 11 atoms in block 108 Block first atom: 807 Blocpdb> 7 atoms in block 109 Block first atom: 818 Blocpdb> 8 atoms in block 110 Block first atom: 825 Blocpdb> 9 atoms in block 111 Block first atom: 833 Blocpdb> 8 atoms in block 112 Block first atom: 842 Blocpdb> 9 atoms in block 113 Block first atom: 850 Blocpdb> 8 atoms in block 114 Block first atom: 859 Blocpdb> 4 atoms in block 115 Block first atom: 867 Blocpdb> 9 atoms in block 116 Block first atom: 871 Blocpdb> 8 atoms in block 117 Block first atom: 880 Blocpdb> 7 atoms in block 118 Block first atom: 888 Blocpdb> 12 atoms in block 119 Block first atom: 895 Blocpdb> 7 atoms in block 120 Block first atom: 907 Blocpdb> 10 atoms in block 121 Block first atom: 914 Blocpdb> 7 atoms in block 122 Block first atom: 924 Blocpdb> 8 atoms in block 123 Block first atom: 931 Blocpdb> 4 atoms in block 124 Block first atom: 939 Blocpdb> 8 atoms in block 125 Block first atom: 943 Blocpdb> 7 atoms in block 126 Block first atom: 951 Blocpdb> 7 atoms in block 127 Block first atom: 958 Blocpdb> 5 atoms in block 128 Block first atom: 965 Blocpdb> 7 atoms in block 129 Block first atom: 970 Blocpdb> 8 atoms in block 130 Block first atom: 977 Blocpdb> 6 atoms in block 131 Block first atom: 985 Blocpdb> 12 atoms in block 132 Block first atom: 991 Blocpdb> 11 atoms in block 133 Block first atom: 1003 Blocpdb> 11 atoms in block 134 Block first atom: 1013 Blocpdb> 134 blocks. Blocpdb> At most, 14 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 4 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 340279 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 3072 Prepmat> Matrix trace = 742280.0000 Prepmat> Last element read: 3072 3072 248.3176 Prepmat> 9046 lines saved. Prepmat> 7528 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 1024 RTB> Total mass = 1024.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 1024 RTB> Number of blocks = 134 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 177730.3143 RTB> 52602 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 804 Diagstd> Nb of non-zero elements: 52602 Diagstd> Projected matrix trace = 177730.3143 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 804 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 177730.3143 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 6.0879557 7.6712164 9.2681533 9.8100757 10.7077770 11.1126263 12.2497208 12.7369419 13.5008350 14.0160447 15.7554700 16.6710750 16.9450296 17.4868965 18.8452615 19.6617273 21.0322199 21.1957818 22.0045594 23.1766758 24.2368231 24.3799377 25.9991655 26.3996663 27.7732506 29.8180773 30.8065635 31.3040185 32.1043314 33.9708409 36.1433150 36.4301032 37.2511918 37.6496075 38.6956283 39.7918329 40.1882238 40.8385510 41.5895723 43.2793859 43.6777968 44.3881965 45.6638158 46.0915921 46.5597229 47.1262135 47.5516440 48.9641732 50.2580900 50.9604195 51.5855372 52.3967095 53.4718349 53.8606213 54.4886436 55.6003925 56.9526018 58.4830762 60.1685989 60.6494772 60.9691052 62.2633889 63.7729295 64.9377239 65.0725899 65.4452090 66.3322936 67.4990265 68.4129011 69.7332678 69.8896256 71.0219104 71.8947074 72.8346869 73.1810921 74.0430179 74.4091019 75.2051688 75.7485093 75.7706765 76.4414922 78.1371649 79.3687523 80.5311943 80.9454193 81.3203265 82.1470893 82.7293548 83.0584550 85.1752523 85.5844769 86.0510574 86.6825968 87.4540139 88.3411776 88.6941170 90.1201927 90.2589722 90.9710026 92.2144931 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034319 0.0034331 0.0034333 0.0034336 0.0034339 0.0034343 267.9359712 300.7650699 330.5916539 340.1194437 355.3406876 361.9958868 380.0654363 387.5501095 399.0024806 406.5444313 431.0334377 443.3810039 447.0091847 454.1001552 471.4073661 481.5108911 498.0097410 499.9424345 509.3914115 522.7822736 534.6051365 536.1811927 553.7005880 557.9489938 572.2800898 592.9732449 602.7218109 607.5686071 615.2860878 632.9194305 652.8437818 655.4287400 662.7738519 666.3087352 675.5013663 685.0026511 688.4060624 693.9536153 700.3054523 714.3907539 717.6714041 723.4841651 733.8062054 737.2353231 740.9697424 745.4637907 748.8210568 759.8615919 769.8360955 775.1964543 779.9365249 786.0447786 794.0682357 796.9497888 801.5825950 809.7187742 819.5058624 830.4440629 842.3260454 845.6853577 847.9108468 856.8635281 867.1884079 875.0720479 875.9802733 878.4847158 884.4184367 892.1626441 898.1818691 906.8078874 907.8239523 915.1482537 920.7542675 926.7538716 928.9551003 934.4096954 936.7168047 941.7142134 945.1099283 945.2482081 949.4232406 959.8958301 967.4311273 974.4899179 976.9929251 979.2528338 984.2181510 987.7001024 989.6627049 1002.1944532 1004.5990900 1007.3337521 1011.0234689 1015.5122201 1020.6500761 1022.6868873 1030.8757796 1031.6692168 1035.7305125 1042.7852316 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 1024 Rtb_to_modes> Number of blocs = 134 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9880E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9947E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9964E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9978E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9995E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.088 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.671 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.268 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.810 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 68.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 69.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 69.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 71.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 71.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 72.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 73.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 74.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 74.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 75.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 75.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 75.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 76.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 78.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 79.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 80.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 80.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 81.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 82.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 82.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 83.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 85.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 85.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 86.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 86.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 87.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 88.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 88.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 90.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 90.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 90.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 92.21 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 804 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 0.99999 1.00001 1.00000 1.00002 1.00000 0.99998 1.00001 0.99996 0.99995 1.00003 0.99999 0.99997 0.99999 1.00001 0.99999 1.00001 0.99997 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 0.99999 1.00002 1.00002 1.00001 1.00000 0.99998 1.00003 0.99998 1.00000 1.00001 0.99997 1.00000 1.00000 0.99997 1.00001 0.99998 1.00000 0.99998 1.00003 1.00001 0.99998 1.00002 1.00000 1.00000 1.00002 1.00001 1.00001 0.99998 1.00001 1.00000 0.99998 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 0.99998 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00002 0.99999 1.00002 1.00001 1.00002 1.00000 0.99998 1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 0.99999 0.99999 1.00005 1.00001 1.00000 1.00001 1.00001 1.00002 1.00001 1.00000 0.99998 0.99998 1.00003 0.99998 0.99997 0.99998 0.99998 1.00002 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 0.99996 1.00000 0.99999 0.99998 1.00001 0.99999 0.99999 1.00002 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 18432 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 0.99999 1.00001 1.00000 1.00002 1.00000 0.99998 1.00001 0.99996 0.99995 1.00003 0.99999 0.99997 0.99999 1.00001 0.99999 1.00001 0.99997 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 0.99999 1.00002 1.00002 1.00001 1.00000 0.99998 1.00003 0.99998 1.00000 1.00001 0.99997 1.00000 1.00000 0.99997 1.00001 0.99998 1.00000 0.99998 1.00003 1.00001 0.99998 1.00002 1.00000 1.00000 1.00002 1.00001 1.00001 0.99998 1.00001 1.00000 0.99998 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 0.99998 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00002 0.99999 1.00002 1.00001 1.00002 1.00000 0.99998 1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 0.99999 0.99999 1.00005 1.00001 1.00000 1.00001 1.00001 1.00002 1.00001 1.00000 0.99998 0.99998 1.00003 0.99998 0.99997 0.99998 0.99998 1.00002 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 0.99996 1.00000 0.99999 0.99998 1.00001 0.99999 0.99999 1.00002 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3:-0.000-0.000 Vector 4:-0.000 0.000 0.000 Vector 5: 0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 6:-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 7: 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 8: 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 9: 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 10:-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2605021839343985898.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2605021839343985898.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2605021839343985898.atom Openam> file on opening on unit 11: 2605021839343985898.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 134 First residue number = 11 Last residue number = 144 Number of atoms found = 1024 Mean number per residue = 7.6 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9880E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9947E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9964E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9978E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9995E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.088 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.671 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.268 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.810 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 73.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 75.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 75.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 75.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 78.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 79.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 80.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 80.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 81.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 82.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 82.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 83.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 85.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 85.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 86.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 86.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 87.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 88.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 88.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 90.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 90.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 90.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 92.21 Bfactors> 106 vectors, 3072 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 6.088000 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= -0.126 for 134 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.034 +/- 0.03 Bfactors> = 79.261 +/- 11.91 Bfactors> Shiftng-fct= 79.226 Bfactors> Scaling-fct= 372.264 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2605021839343985898.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2605021839343985898.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4318E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4329E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4332E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4334E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 267.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 300.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 330.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 340.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 355.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 361.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 380.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 387.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 399.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 406.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 431.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 443.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 447.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 454.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 471.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 481.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 498.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 500.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 509.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 522.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 534.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 536.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 553.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 557.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 572.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 593.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 602.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 607.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 615.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 632.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 652.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 655.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 662.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 666.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 675.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 685.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 688.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 693.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 700.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 714.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 717.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 723.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 733.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 737.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 740.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 745.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 748.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 759.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 769.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 775.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 779.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 786.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 794.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 796.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 801.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 809.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 819.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 830.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 842.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 845.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 847.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 856.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 867.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 875.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 875.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 878.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 884.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 892.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 898.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 906.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 907.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 915.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 920.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 926.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 928.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 934.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 936.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 941.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 945.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 945.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 949.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 959.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 967.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 974.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 977.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 979.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 984.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 987.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 989.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1002. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1005. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1007. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1011. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1015. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1021. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1023. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1031. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1032. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1036. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1043. Chkmod> 106 vectors, 3072 coordinates in file. Chkmod> That is: 1024 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 8 is: 0.9999 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 9 is: 0.9999 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 78 is: 1.0001 (instead of 1.0000). Chkmod> Normal end. 0.0034 0.7754 0.0034 0.7688 0.0034 0.8981 0.0034 0.7399 0.0034 0.9430 0.0034 0.8667 267.9254 0.4821 300.7479 0.4154 330.5747 0.0610 340.1035 0.0515 355.3623 0.1648 361.9376 0.3473 380.0535 0.4418 387.5800 0.2651 398.9730 0.3066 406.5843 0.2587 431.0769 0.5627 443.3477 0.7146 447.0555 0.4121 454.1210 0.5723 471.4464 0.5652 481.4691 0.5646 497.9621 0.5372 499.9707 0.4069 509.3168 0.1442 522.7973 0.3248 534.6172 0.4273 536.1589 0.0492 553.6857 0.1818 557.9286 0.2738 572.2220 0.3561 592.9669 0.3763 602.7296 0.3382 607.5035 0.3908 615.2182 0.3488 632.8844 0.3771 652.7858 0.3151 655.3997 0.4881 662.7348 0.5948 666.2836 0.4473 675.5105 0.4824 684.9575 0.4234 688.3917 0.3746 693.9361 0.3887 700.2790 0.4001 714.3652 0.3031 717.6587 0.1466 723.4678 0.4325 733.7440 0.3122 737.1909 0.4427 740.9401 0.3442 745.4617 0.1725 748.7760 0.3303 759.7966 0.4252 769.8177 0.4658 775.1600 0.2890 779.9368 0.5776 786.0357 0.4009 794.0205 0.4607 796.9110 0.4459 801.5582 0.3121 809.6812 0.3789 819.4520 0.3240 830.3866 0.4427 842.2997 0.5250 845.6527 0.4020 847.8807 0.3105 856.8034 0.5302 867.1313 0.4790 875.0498 0.4519 875.9252 0.2673 878.4792 0.2816 884.3652 0.3762 892.1308 0.5295 898.1243 0.3671 906.7477 0.2419 907.7874 0.3984 915.0967 0.2636 920.6846 0.3799 926.6843 0.2370 928.9083 0.3101 934.3505 0.5409 936.6822 0.3886 941.7040 0.4133 945.0787 0.3429 945.2034 0.4561 949.3732 0.4649 959.8720 0.4214 967.3972 0.4897 974.4409 0.2877 976.9786 0.4872 979.2088 0.4018 984.1933 0.4864 987.6616 0.3223 989.6294 0.4723 1002.1794 0.4132 1004.5297 0.3091 1007.2843 0.3240 1010.9649 0.1831 1015.4453 0.3108 1020.5995 0.4357 1022.6193 0.4071 1030.8304 0.4605 1031.6308 0.2104 1035.6803 0.2200 1042.7151 0.2653 getting mode 7 running: ../../bin/get_modes.sh 2605021839343985898 7 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 7 calculating perturbed structure for DQ=-100 2605021839343985898.eigenfacs 2605021839343985898.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2605021839343985898.eigenfacs 2605021839343985898.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2605021839343985898.eigenfacs 2605021839343985898.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2605021839343985898.eigenfacs 2605021839343985898.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2605021839343985898.eigenfacs 2605021839343985898.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2605021839343985898.eigenfacs 2605021839343985898.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2605021839343985898.eigenfacs 2605021839343985898.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2605021839343985898.eigenfacs 2605021839343985898.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2605021839343985898.eigenfacs 2605021839343985898.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2605021839343985898.eigenfacs 2605021839343985898.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2605021839343985898.eigenfacs 2605021839343985898.atom making animated gifs 11 models are in 2605021839343985898.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2605021839343985898.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2605021839343985898.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 2605021839343985898 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 2605021839343985898.eigenfacs 2605021839343985898.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2605021839343985898.eigenfacs 2605021839343985898.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2605021839343985898.eigenfacs 2605021839343985898.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2605021839343985898.eigenfacs 2605021839343985898.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2605021839343985898.eigenfacs 2605021839343985898.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2605021839343985898.eigenfacs 2605021839343985898.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2605021839343985898.eigenfacs 2605021839343985898.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2605021839343985898.eigenfacs 2605021839343985898.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2605021839343985898.eigenfacs 2605021839343985898.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2605021839343985898.eigenfacs 2605021839343985898.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2605021839343985898.eigenfacs 2605021839343985898.atom making animated gifs 11 models are in 2605021839343985898.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2605021839343985898.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2605021839343985898.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 2605021839343985898 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 2605021839343985898.eigenfacs 2605021839343985898.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2605021839343985898.eigenfacs 2605021839343985898.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2605021839343985898.eigenfacs 2605021839343985898.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2605021839343985898.eigenfacs 2605021839343985898.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2605021839343985898.eigenfacs 2605021839343985898.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2605021839343985898.eigenfacs 2605021839343985898.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2605021839343985898.eigenfacs 2605021839343985898.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2605021839343985898.eigenfacs 2605021839343985898.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2605021839343985898.eigenfacs 2605021839343985898.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2605021839343985898.eigenfacs 2605021839343985898.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2605021839343985898.eigenfacs 2605021839343985898.atom making animated gifs 11 models are in 2605021839343985898.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2605021839343985898.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2605021839343985898.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 2605021839343985898 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 2605021839343985898.eigenfacs 2605021839343985898.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2605021839343985898.eigenfacs 2605021839343985898.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2605021839343985898.eigenfacs 2605021839343985898.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2605021839343985898.eigenfacs 2605021839343985898.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2605021839343985898.eigenfacs 2605021839343985898.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2605021839343985898.eigenfacs 2605021839343985898.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2605021839343985898.eigenfacs 2605021839343985898.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2605021839343985898.eigenfacs 2605021839343985898.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2605021839343985898.eigenfacs 2605021839343985898.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2605021839343985898.eigenfacs 2605021839343985898.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2605021839343985898.eigenfacs 2605021839343985898.atom making animated gifs 11 models are in 2605021839343985898.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2605021839343985898.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2605021839343985898.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 2605021839343985898 11 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-100 2605021839343985898.eigenfacs 2605021839343985898.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2605021839343985898.eigenfacs 2605021839343985898.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2605021839343985898.eigenfacs 2605021839343985898.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2605021839343985898.eigenfacs 2605021839343985898.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2605021839343985898.eigenfacs 2605021839343985898.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2605021839343985898.eigenfacs 2605021839343985898.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2605021839343985898.eigenfacs 2605021839343985898.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2605021839343985898.eigenfacs 2605021839343985898.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2605021839343985898.eigenfacs 2605021839343985898.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2605021839343985898.eigenfacs 2605021839343985898.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2605021839343985898.eigenfacs 2605021839343985898.atom making animated gifs 11 models are in 2605021839343985898.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2605021839343985898.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2605021839343985898.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 2605021839343985898.10.pdb 2605021839343985898.11.pdb 2605021839343985898.7.pdb 2605021839343985898.8.pdb 2605021839343985898.9.pdb STDERR: Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL real 0m6.971s user 0m6.933s sys 0m0.034s rm: cannot remove '2605021839343985898.sdijf': No such file or directory pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format




If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:

elNémo is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Between 2015 and 2025, it was hosted by US2B (Nantes).
Last modification: april 24th, 2026.