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LOGs for ID: 26050316040642746

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 26050316040642746.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 26050316040642746.atom to be opened. Openam> File opened: 26050316040642746.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 196 First residue number = 43 Last residue number = 167 Number of atoms found = 1555 Mean number per residue = 7.9 Pdbmat> Coordinate statistics: = 0.325629 +/- 10.608472 From: -25.705000 To: 23.134000 = -17.050063 +/- 9.713994 From: -40.547000 To: 10.898000 = 13.936363 +/- 8.026813 From: -4.225000 To: 38.094000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 5.3312 % Filled. Pdbmat> 580219 non-zero elements. Pdbmat> 63446 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 81.60 +/- 26.10 Maximum number = 135 Minimum number = 11 Pdbmat> Matrix trace = 1.268920E+06 Pdbmat> Larger element = 532.353 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 196 non-zero elements, NRBL set to 1 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 26050316040642746.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 1 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 26050316040642746.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 26050316040642746.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 1555 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 1 residue(s) per block. Blocpdb> 196 residues. Blocpdb> 4 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 6 atoms in block 2 Block first atom: 5 Blocpdb> 10 atoms in block 3 Block first atom: 11 Blocpdb> 13 atoms in block 4 Block first atom: 21 Blocpdb> 8 atoms in block 5 Block first atom: 34 Blocpdb> 5 atoms in block 6 Block first atom: 42 Blocpdb> 5 atoms in block 7 Block first atom: 47 Blocpdb> 8 atoms in block 8 Block first atom: 52 Blocpdb> 8 atoms in block 9 Block first atom: 60 Blocpdb> 9 atoms in block 10 Block first atom: 68 Blocpdb> 8 atoms in block 11 Block first atom: 77 Blocpdb> 9 atoms in block 12 Block first atom: 85 Blocpdb> 11 atoms in block 13 Block first atom: 94 Blocpdb> 5 atoms in block 14 Block first atom: 105 Blocpdb> 5 atoms in block 15 Block first atom: 110 Blocpdb> 8 atoms in block 16 Block first atom: 115 Blocpdb> 7 atoms in block 17 Block first atom: 123 Blocpdb> 19 atoms in block 18 Block first atom: 130 Blocpdb> 14 atoms in block 19 Block first atom: 149 Blocpdb> 9 atoms in block 20 Block first atom: 163 Blocpdb> 6 atoms in block 21 Block first atom: 172 Blocpdb> 9 atoms in block 22 Block first atom: 178 Blocpdb> 5 atoms in block 23 Block first atom: 187 Blocpdb> 9 atoms in block 24 Block first atom: 192 Blocpdb> 8 atoms in block 25 Block first atom: 201 Blocpdb> 9 atoms in block 26 Block first atom: 209 Blocpdb> 4 atoms in block 27 Block first atom: 218 Blocpdb> 6 atoms in block 28 Block first atom: 222 Blocpdb> 9 atoms in block 29 Block first atom: 228 Blocpdb> 11 atoms in block 30 Block first atom: 237 Blocpdb> 8 atoms in block 31 Block first atom: 248 Blocpdb> 8 atoms in block 32 Block first atom: 256 Blocpdb> 9 atoms in block 33 Block first atom: 264 Blocpdb> 8 atoms in block 34 Block first atom: 273 Blocpdb> 6 atoms in block 35 Block first atom: 281 Blocpdb> 8 atoms in block 36 Block first atom: 287 Blocpdb> 9 atoms in block 37 Block first atom: 295 Blocpdb> 8 atoms in block 38 Block first atom: 304 Blocpdb> 9 atoms in block 39 Block first atom: 312 Blocpdb> 9 atoms in block 40 Block first atom: 321 Blocpdb> 9 atoms in block 41 Block first atom: 330 Blocpdb> 9 atoms in block 42 Block first atom: 339 Blocpdb> 9 atoms in block 43 Block first atom: 348 Blocpdb> 7 atoms in block 44 Block first atom: 357 Blocpdb> 8 atoms in block 45 Block first atom: 364 Blocpdb> 4 atoms in block 46 Block first atom: 372 Blocpdb> 16 atoms in block 47 Block first atom: 376 Blocpdb> 9 atoms in block 48 Block first atom: 392 Blocpdb> 8 atoms in block 49 Block first atom: 401 Blocpdb> 4 atoms in block 50 Block first atom: 409 Blocpdb> 5 atoms in block 51 Block first atom: 413 Blocpdb> 12 atoms in block 52 Block first atom: 418 Blocpdb> 11 atoms in block 53 Block first atom: 430 Blocpdb> 8 atoms in block 54 Block first atom: 441 Blocpdb> 9 atoms in block 55 Block first atom: 449 Blocpdb> 9 atoms in block 56 Block first atom: 458 Blocpdb> 9 atoms in block 57 Block first atom: 467 Blocpdb> 4 atoms in block 58 Block first atom: 476 Blocpdb> 8 atoms in block 59 Block first atom: 480 Blocpdb> 8 atoms in block 60 Block first atom: 488 Blocpdb> 4 atoms in block 61 Block first atom: 496 Blocpdb> 12 atoms in block 62 Block first atom: 500 Blocpdb> 6 atoms in block 63 Block first atom: 512 Blocpdb> 9 atoms in block 64 Block first atom: 518 Blocpdb> 8 atoms in block 65 Block first atom: 527 Blocpdb> 4 atoms in block 66 Block first atom: 535 Blocpdb> 5 atoms in block 67 Block first atom: 539 Blocpdb> 4 atoms in block 68 Block first atom: 544 Blocpdb> 7 atoms in block 69 Block first atom: 548 Blocpdb> 21 atoms in block 70 Block first atom: 555 Blocpdb> 9 atoms in block 71 Block first atom: 576 Blocpdb> 9 atoms in block 72 Block first atom: 585 Blocpdb> 4 atoms in block 73 Block first atom: 594 Blocpdb> 7 atoms in block 74 Block first atom: 598 Blocpdb> 11 atoms in block 75 Block first atom: 605 Blocpdb> 10 atoms in block 76 Block first atom: 616 Blocpdb> 7 atoms in block 77 Block first atom: 626 Blocpdb> 8 atoms in block 78 Block first atom: 633 Blocpdb> 14 atoms in block 79 Block first atom: 641 Blocpdb> 10 atoms in block 80 Block first atom: 655 Blocpdb> 7 atoms in block 81 Block first atom: 665 Blocpdb> 7 atoms in block 82 Block first atom: 672 Blocpdb> 27 atoms in block 83 Block first atom: 679 Blocpdb> 4 atoms in block 84 Block first atom: 706 Blocpdb> 5 atoms in block 85 Block first atom: 710 Blocpdb> 7 atoms in block 86 Block first atom: 715 Blocpdb> 8 atoms in block 87 Block first atom: 722 Blocpdb> 8 atoms in block 88 Block first atom: 730 Blocpdb> 10 atoms in block 89 Block first atom: 738 Blocpdb> 9 atoms in block 90 Block first atom: 748 Blocpdb> 4 atoms in block 91 Block first atom: 757 Blocpdb> 9 atoms in block 92 Block first atom: 761 Blocpdb> 11 atoms in block 93 Block first atom: 770 Blocpdb> 8 atoms in block 94 Block first atom: 781 Blocpdb> 9 atoms in block 95 Block first atom: 789 Blocpdb> 7 atoms in block 96 Block first atom: 798 Blocpdb> 6 atoms in block 97 Block first atom: 805 Blocpdb> 14 atoms in block 98 Block first atom: 811 Blocpdb> 5 atoms in block 99 Block first atom: 825 Blocpdb> 8 atoms in block 100 Block first atom: 830 Blocpdb> 7 atoms in block 101 Block first atom: 838 Blocpdb> 5 atoms in block 102 Block first atom: 845 Blocpdb> 9 atoms in block 103 Block first atom: 850 Blocpdb> 8 atoms in block 104 Block first atom: 859 Blocpdb> 8 atoms in block 105 Block first atom: 867 Blocpdb> 8 atoms in block 106 Block first atom: 875 Blocpdb> 6 atoms in block 107 Block first atom: 883 Blocpdb> 12 atoms in block 108 Block first atom: 889 Blocpdb> 8 atoms in block 109 Block first atom: 901 Blocpdb> 4 atoms in block 110 Block first atom: 909 Blocpdb> 4 atoms in block 111 Block first atom: 913 Blocpdb> 14 atoms in block 112 Block first atom: 917 Blocpdb> 9 atoms in block 113 Block first atom: 931 Blocpdb> 8 atoms in block 114 Block first atom: 940 Blocpdb> 9 atoms in block 115 Block first atom: 948 Blocpdb> 4 atoms in block 116 Block first atom: 957 Blocpdb> 9 atoms in block 117 Block first atom: 961 Blocpdb> 14 atoms in block 118 Block first atom: 970 Blocpdb> 5 atoms in block 119 Block first atom: 984 Blocpdb> 9 atoms in block 120 Block first atom: 989 Blocpdb> 4 atoms in block 121 Block first atom: 998 Blocpdb> 9 atoms in block 122 Block first atom: 1002 Blocpdb> 9 atoms in block 123 Block first atom: 1011 Blocpdb> 7 atoms in block 124 Block first atom: 1020 Blocpdb> 9 atoms in block 125 Block first atom: 1027 Blocpdb> 7 atoms in block 126 Block first atom: 1036 Blocpdb> 13 atoms in block 127 Block first atom: 1043 Blocpdb> 5 atoms in block 128 Block first atom: 1056 Blocpdb> 8 atoms in block 129 Block first atom: 1061 Blocpdb> 9 atoms in block 130 Block first atom: 1069 Blocpdb> 7 atoms in block 131 Block first atom: 1078 Blocpdb> 4 atoms in block 132 Block first atom: 1085 Blocpdb> 9 atoms in block 133 Block first atom: 1089 Blocpdb> 8 atoms in block 134 Block first atom: 1098 Blocpdb> 7 atoms in block 135 Block first atom: 1106 Blocpdb> 11 atoms in block 136 Block first atom: 1113 Blocpdb> 5 atoms in block 137 Block first atom: 1124 Blocpdb> 7 atoms in block 138 Block first atom: 1129 Blocpdb> 9 atoms in block 139 Block first atom: 1136 Blocpdb> 7 atoms in block 140 Block first atom: 1145 Blocpdb> 9 atoms in block 141 Block first atom: 1152 Blocpdb> 7 atoms in block 142 Block first atom: 1161 Blocpdb> 4 atoms in block 143 Block first atom: 1168 Blocpdb> 8 atoms in block 144 Block first atom: 1172 Blocpdb> 11 atoms in block 145 Block first atom: 1180 Blocpdb> 9 atoms in block 146 Block first atom: 1191 Blocpdb> 7 atoms in block 147 Block first atom: 1200 Blocpdb> 8 atoms in block 148 Block first atom: 1207 Blocpdb> 7 atoms in block 149 Block first atom: 1215 Blocpdb> 4 atoms in block 150 Block first atom: 1222 Blocpdb> 7 atoms in block 151 Block first atom: 1226 Blocpdb> 8 atoms in block 152 Block first atom: 1233 Blocpdb> 4 atoms in block 153 Block first atom: 1241 Blocpdb> 5 atoms in block 154 Block first atom: 1245 Blocpdb> 7 atoms in block 155 Block first atom: 1250 Blocpdb> 6 atoms in block 156 Block first atom: 1257 Blocpdb> 8 atoms in block 157 Block first atom: 1263 Blocpdb> 8 atoms in block 158 Block first atom: 1271 Blocpdb> 11 atoms in block 159 Block first atom: 1279 Blocpdb> 6 atoms in block 160 Block first atom: 1290 Blocpdb> 7 atoms in block 161 Block first atom: 1296 Blocpdb> 4 atoms in block 162 Block first atom: 1303 Blocpdb> 7 atoms in block 163 Block first atom: 1307 Blocpdb> 6 atoms in block 164 Block first atom: 1314 Blocpdb> 4 atoms in block 165 Block first atom: 1320 Blocpdb> 6 atoms in block 166 Block first atom: 1324 Blocpdb> 7 atoms in block 167 Block first atom: 1330 Blocpdb> 8 atoms in block 168 Block first atom: 1337 Blocpdb> 7 atoms in block 169 Block first atom: 1345 Blocpdb> 8 atoms in block 170 Block first atom: 1352 Blocpdb> 9 atoms in block 171 Block first atom: 1360 Blocpdb> 9 atoms in block 172 Block first atom: 1369 Blocpdb> 8 atoms in block 173 Block first atom: 1378 Blocpdb> 9 atoms in block 174 Block first atom: 1386 Blocpdb> 7 atoms in block 175 Block first atom: 1395 Blocpdb> 7 atoms in block 176 Block first atom: 1402 Blocpdb> 4 atoms in block 177 Block first atom: 1409 Blocpdb> 8 atoms in block 178 Block first atom: 1413 Blocpdb> 12 atoms in block 179 Block first atom: 1421 Blocpdb> 4 atoms in block 180 Block first atom: 1433 Blocpdb> 8 atoms in block 181 Block first atom: 1437 Blocpdb> 4 atoms in block 182 Block first atom: 1445 Blocpdb> 11 atoms in block 183 Block first atom: 1449 Blocpdb> 11 atoms in block 184 Block first atom: 1460 Blocpdb> 7 atoms in block 185 Block first atom: 1471 Blocpdb> 5 atoms in block 186 Block first atom: 1478 Blocpdb> 6 atoms in block 187 Block first atom: 1483 Blocpdb> 4 atoms in block 188 Block first atom: 1489 Blocpdb> 5 atoms in block 189 Block first atom: 1493 Blocpdb> 21 atoms in block 190 Block first atom: 1498 Blocpdb> 7 atoms in block 191 Block first atom: 1519 Blocpdb> 6 atoms in block 192 Block first atom: 1526 Blocpdb> 5 atoms in block 193 Block first atom: 1532 Blocpdb> 8 atoms in block 194 Block first atom: 1537 Blocpdb> 5 atoms in block 195 Block first atom: 1545 Blocpdb> 6 atoms in block 196 Block first atom: 1549 Blocpdb> 196 blocks. Blocpdb> At most, 27 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 4 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 580415 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 4665 Prepmat> Matrix trace = 1268920.0000 Prepmat> Last element read: 4665 4665 92.7221 Prepmat> 19307 lines saved. Prepmat> 16797 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 1555 RTB> Total mass = 1555.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 1555 RTB> Number of blocks = 196 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 294326.3191 RTB> 87384 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1176 Diagstd> Nb of non-zero elements: 87384 Diagstd> Projected matrix trace = 294326.3191 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1176 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 294326.3191 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.2780749 0.7397598 1.3299802 2.9756783 3.6246912 3.9811805 4.9111417 5.3413944 5.5841519 6.6864157 8.3545539 9.0692891 9.4687822 9.6441838 10.2397915 11.3938461 11.9940823 12.3144656 12.8851554 13.5832762 14.4227373 15.1648069 16.4022683 16.8338990 17.8488812 18.5104241 18.9728821 19.8503307 20.4977894 20.9450713 22.9399379 23.8954235 24.2932164 25.4821169 26.6688602 27.4976388 28.3266044 28.8495153 29.3902323 30.5211783 31.6324973 32.0987560 32.8681728 33.5232365 33.7110682 34.5784982 35.5850644 36.0855961 37.1559347 37.5534257 38.5695198 39.9599223 40.7537756 41.5561768 41.7932213 42.9841263 43.3226247 43.4979923 44.4968084 45.2489508 46.0018556 47.3780155 47.5527485 49.4335917 49.5363774 50.4538747 50.5509996 51.2327691 51.9078773 52.8167620 54.1091045 54.7092305 56.0100725 56.5102484 56.9353635 57.5640179 58.4695227 59.1171304 59.4116361 60.2332822 61.2203988 61.5916851 62.8383484 62.9949727 64.0977608 64.5678144 65.6223596 66.2178114 66.6775901 66.9874236 67.9228911 68.9761830 69.3700054 69.7539376 69.8289931 70.2258106 71.4918149 71.5734084 71.9783965 72.7420318 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034317 0.0034324 0.0034327 0.0034333 0.0034343 0.0034346 57.2632785 93.3986595 125.2327352 187.3217781 206.7429881 216.6712127 240.6503589 250.9704580 256.6101860 280.7966789 313.8751346 327.0257140 334.1506754 337.2314112 347.4888202 366.5476623 376.0787484 381.0685125 389.7984522 400.2188565 412.4004466 422.8766665 439.7919093 445.5409629 458.7760943 467.2006790 473.0008647 483.8148041 491.6417922 496.9768991 520.1054433 530.8265621 535.2267235 548.1671827 560.7864448 569.4334585 577.9530224 583.2631528 588.7037327 599.9235741 610.7479529 615.2326584 622.5626484 628.7358886 630.4948408 638.5550498 647.7824215 652.3222951 661.9259016 665.4570959 674.3997433 686.4479273 693.2329628 700.0242309 702.0179286 711.9497338 714.7475255 716.1926936 724.3687579 730.4652110 736.5173054 747.4526965 748.8297534 763.4952919 764.2886356 771.3341195 772.0761809 777.2651492 782.3695062 789.1892605 798.7860162 803.2034837 812.6964220 816.3170896 819.3818298 823.8930326 830.3478288 834.9336271 837.0107514 842.7786884 849.6564475 852.2290295 860.8107087 861.8828243 869.3941418 872.5761197 879.6728766 883.6549029 886.7173942 888.7751794 894.9594576 901.8719074 904.4428804 906.9422719 907.4300773 910.0047529 918.1707247 918.6945286 921.2900143 926.1642088 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 1555 Rtb_to_modes> Number of blocs = 196 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9870E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9909E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9928E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9963E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0004E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2781 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7398 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.330 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.976 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.625 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.981 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.911 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.341 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.584 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.686 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.355 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.069 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.469 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.644 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 68.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 69.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 69.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 69.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 70.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 71.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 71.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 71.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 72.74 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1176 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 0.99995 0.99999 0.99995 1.00002 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 1.00001 0.99999 0.99997 1.00002 0.99998 0.99998 1.00001 0.99997 0.99999 0.99998 1.00000 1.00000 1.00003 1.00001 0.99998 1.00001 0.99999 1.00001 0.99998 1.00000 0.99998 1.00001 0.99997 0.99998 0.99999 0.99999 1.00006 1.00003 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 1.00002 1.00000 0.99999 0.99997 1.00001 1.00003 0.99998 0.99999 1.00000 1.00001 0.99998 1.00002 0.99999 0.99996 1.00002 1.00002 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 1.00002 1.00000 0.99996 0.99998 1.00001 1.00000 1.00001 0.99994 1.00005 1.00003 1.00000 1.00003 1.00001 0.99998 1.00001 1.00003 0.99997 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 1.00002 1.00001 1.00001 1.00003 1.00006 1.00001 1.00001 1.00003 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 27990 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 0.99995 0.99999 0.99995 1.00002 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 1.00001 0.99999 0.99997 1.00002 0.99998 0.99998 1.00001 0.99997 0.99999 0.99998 1.00000 1.00000 1.00003 1.00001 0.99998 1.00001 0.99999 1.00001 0.99998 1.00000 0.99998 1.00001 0.99997 0.99998 0.99999 0.99999 1.00006 1.00003 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 1.00002 1.00000 0.99999 0.99997 1.00001 1.00003 0.99998 0.99999 1.00000 1.00001 0.99998 1.00002 0.99999 0.99996 1.00002 1.00002 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 1.00002 1.00000 0.99996 0.99998 1.00001 1.00000 1.00001 0.99994 1.00005 1.00003 1.00000 1.00003 1.00001 0.99998 1.00001 1.00003 0.99997 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 1.00002 1.00001 1.00001 1.00003 1.00006 1.00001 1.00001 1.00003 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3:-0.000 0.000 Vector 4: 0.000-0.000 0.000 Vector 5:-0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 6: 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 7:-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 8:-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 9:-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 10:-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 26050316040642746.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 26050316040642746.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 26050316040642746.atom Openam> file on opening on unit 11: 26050316040642746.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 196 First residue number = 43 Last residue number = 167 Number of atoms found = 1555 Mean number per residue = 7.9 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9870E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9909E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9928E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9963E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0004E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2781 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7398 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.330 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.976 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.625 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.981 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.911 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.341 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.584 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.686 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.355 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.069 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.469 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.644 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.74 Bfactors> 106 vectors, 4665 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.278100 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= -0.058 for 211 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.104 +/- 0.61 Bfactors> = 11.891 +/- 4.24 Bfactors> Shiftng-fct= 11.787 Bfactors> Scaling-fct= 7.006 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 26050316040642746.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 26050316040642746.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4316E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4323E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4326E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4332E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4345E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 57.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 93.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 125.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 187.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 206.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 216.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 240.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 251.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 256.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 280.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 313.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 327.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 334.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 337.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 347.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 366.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 376.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 381.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 389.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 400.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 412.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 422.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 439.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 445.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 458.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 467.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 472.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 483.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 491.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 497.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 520.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 530.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 535.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 548.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 560.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 569.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 578.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 583.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 588.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 599.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 610.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 615.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 622.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 628.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 630.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 638.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 647.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 652.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 661.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 665.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 674.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 686.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 693.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 700.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 702.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 711.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 714.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 716.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 724.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 730.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 736.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 747.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 748.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 763.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 764.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 771.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 772.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 777.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 782.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 789.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 798.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 803.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 812.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 816.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 819.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 823.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 830.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 834.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 837.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 842.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 849.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 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Chkmod> That is: 1555 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 7 is: 0.9999 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 41 is: 1.0001 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 73 is: 0.9999 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 96 is: 1.0001 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 99 is: 1.0001 (instead of 1.0000). 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plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 26050316040642746.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 26050316040642746.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 26050316040642746 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure 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