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LOGs for ID: 26050316063746603

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 26050316063746603.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 26050316063746603.atom to be opened. Openam> File opened: 26050316063746603.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 196 First residue number = 43 Last residue number = 167 Number of atoms found = 1555 Mean number per residue = 7.9 Pdbmat> Coordinate statistics: = 0.326259 +/- 10.608541 From: -25.705000 To: 23.134000 = -17.050030 +/- 9.713949 From: -40.547000 To: 10.898000 = 13.936671 +/- 8.026429 From: -4.225000 To: 38.094000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 5.3312 % Filled. Pdbmat> 580223 non-zero elements. Pdbmat> 63447 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 81.60 +/- 26.10 Maximum number = 135 Minimum number = 11 Pdbmat> Matrix trace = 1.268940E+06 Pdbmat> Larger element = 532.353 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 196 non-zero elements, NRBL set to 1 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 26050316063746603.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 1 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 26050316063746603.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 26050316063746603.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 1555 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 1 residue(s) per block. Blocpdb> 196 residues. Blocpdb> 4 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 6 atoms in block 2 Block first atom: 5 Blocpdb> 10 atoms in block 3 Block first atom: 11 Blocpdb> 13 atoms in block 4 Block first atom: 21 Blocpdb> 8 atoms in block 5 Block first atom: 34 Blocpdb> 5 atoms in block 6 Block first atom: 42 Blocpdb> 5 atoms in block 7 Block first atom: 47 Blocpdb> 8 atoms in block 8 Block first atom: 52 Blocpdb> 8 atoms in block 9 Block first atom: 60 Blocpdb> 9 atoms in block 10 Block first atom: 68 Blocpdb> 8 atoms in block 11 Block first atom: 77 Blocpdb> 9 atoms in block 12 Block first atom: 85 Blocpdb> 11 atoms in block 13 Block first atom: 94 Blocpdb> 5 atoms in block 14 Block first atom: 105 Blocpdb> 5 atoms in block 15 Block first atom: 110 Blocpdb> 8 atoms in block 16 Block first atom: 115 Blocpdb> 7 atoms in block 17 Block first atom: 123 Blocpdb> 19 atoms in block 18 Block first atom: 130 Blocpdb> 14 atoms in block 19 Block first atom: 149 Blocpdb> 9 atoms in block 20 Block first atom: 163 Blocpdb> 6 atoms in block 21 Block first atom: 172 Blocpdb> 9 atoms in block 22 Block first atom: 178 Blocpdb> 5 atoms in block 23 Block first atom: 187 Blocpdb> 9 atoms in block 24 Block first atom: 192 Blocpdb> 8 atoms in block 25 Block first atom: 201 Blocpdb> 9 atoms in block 26 Block first atom: 209 Blocpdb> 4 atoms in block 27 Block first atom: 218 Blocpdb> 6 atoms in block 28 Block first atom: 222 Blocpdb> 9 atoms in block 29 Block first atom: 228 Blocpdb> 11 atoms in block 30 Block first atom: 237 Blocpdb> 8 atoms in block 31 Block first atom: 248 Blocpdb> 8 atoms in block 32 Block first atom: 256 Blocpdb> 9 atoms in block 33 Block first atom: 264 Blocpdb> 8 atoms in block 34 Block first atom: 273 Blocpdb> 6 atoms in block 35 Block first atom: 281 Blocpdb> 8 atoms in block 36 Block first atom: 287 Blocpdb> 9 atoms in block 37 Block first atom: 295 Blocpdb> 8 atoms in block 38 Block first atom: 304 Blocpdb> 9 atoms in block 39 Block first atom: 312 Blocpdb> 9 atoms in block 40 Block first atom: 321 Blocpdb> 9 atoms in block 41 Block first atom: 330 Blocpdb> 9 atoms in block 42 Block first atom: 339 Blocpdb> 9 atoms in block 43 Block first atom: 348 Blocpdb> 7 atoms in block 44 Block first atom: 357 Blocpdb> 8 atoms in block 45 Block first atom: 364 Blocpdb> 4 atoms in block 46 Block first atom: 372 Blocpdb> 16 atoms in block 47 Block first atom: 376 Blocpdb> 9 atoms in block 48 Block first atom: 392 Blocpdb> 8 atoms in block 49 Block first atom: 401 Blocpdb> 4 atoms in block 50 Block first atom: 409 Blocpdb> 5 atoms in block 51 Block first atom: 413 Blocpdb> 12 atoms in block 52 Block first atom: 418 Blocpdb> 11 atoms in block 53 Block first atom: 430 Blocpdb> 8 atoms in block 54 Block first atom: 441 Blocpdb> 9 atoms in block 55 Block first atom: 449 Blocpdb> 9 atoms in block 56 Block first atom: 458 Blocpdb> 9 atoms in block 57 Block first atom: 467 Blocpdb> 4 atoms in block 58 Block first atom: 476 Blocpdb> 8 atoms in block 59 Block first atom: 480 Blocpdb> 8 atoms in block 60 Block first atom: 488 Blocpdb> 4 atoms in block 61 Block first atom: 496 Blocpdb> 12 atoms in block 62 Block first atom: 500 Blocpdb> 6 atoms in block 63 Block first atom: 512 Blocpdb> 9 atoms in block 64 Block first atom: 518 Blocpdb> 8 atoms in block 65 Block first atom: 527 Blocpdb> 4 atoms in block 66 Block first atom: 535 Blocpdb> 5 atoms in block 67 Block first atom: 539 Blocpdb> 4 atoms in block 68 Block first atom: 544 Blocpdb> 7 atoms in block 69 Block first atom: 548 Blocpdb> 21 atoms in block 70 Block first atom: 555 Blocpdb> 9 atoms in block 71 Block first atom: 576 Blocpdb> 9 atoms in block 72 Block first atom: 585 Blocpdb> 4 atoms in block 73 Block first atom: 594 Blocpdb> 7 atoms in block 74 Block first atom: 598 Blocpdb> 11 atoms in block 75 Block first atom: 605 Blocpdb> 10 atoms in block 76 Block first atom: 616 Blocpdb> 7 atoms in block 77 Block first atom: 626 Blocpdb> 8 atoms in block 78 Block first atom: 633 Blocpdb> 14 atoms in block 79 Block first atom: 641 Blocpdb> 10 atoms in block 80 Block first atom: 655 Blocpdb> 7 atoms in block 81 Block first atom: 665 Blocpdb> 7 atoms in block 82 Block first atom: 672 Blocpdb> 27 atoms in block 83 Block first atom: 679 Blocpdb> 4 atoms in block 84 Block first atom: 706 Blocpdb> 5 atoms in block 85 Block first atom: 710 Blocpdb> 7 atoms in block 86 Block first atom: 715 Blocpdb> 8 atoms in block 87 Block first atom: 722 Blocpdb> 8 atoms in block 88 Block first atom: 730 Blocpdb> 10 atoms in block 89 Block first atom: 738 Blocpdb> 9 atoms in block 90 Block first atom: 748 Blocpdb> 4 atoms in block 91 Block first atom: 757 Blocpdb> 9 atoms in block 92 Block first atom: 761 Blocpdb> 11 atoms in block 93 Block first atom: 770 Blocpdb> 8 atoms in block 94 Block first atom: 781 Blocpdb> 9 atoms in block 95 Block first atom: 789 Blocpdb> 7 atoms in block 96 Block first atom: 798 Blocpdb> 6 atoms in block 97 Block first atom: 805 Blocpdb> 14 atoms in block 98 Block first atom: 811 Blocpdb> 5 atoms in block 99 Block first atom: 825 Blocpdb> 8 atoms in block 100 Block first atom: 830 Blocpdb> 7 atoms in block 101 Block first atom: 838 Blocpdb> 5 atoms in block 102 Block first atom: 845 Blocpdb> 9 atoms in block 103 Block first atom: 850 Blocpdb> 8 atoms in block 104 Block first atom: 859 Blocpdb> 8 atoms in block 105 Block first atom: 867 Blocpdb> 8 atoms in block 106 Block first atom: 875 Blocpdb> 6 atoms in block 107 Block first atom: 883 Blocpdb> 12 atoms in block 108 Block first atom: 889 Blocpdb> 8 atoms in block 109 Block first atom: 901 Blocpdb> 4 atoms in block 110 Block first atom: 909 Blocpdb> 4 atoms in block 111 Block first atom: 913 Blocpdb> 14 atoms in block 112 Block first atom: 917 Blocpdb> 9 atoms in block 113 Block first atom: 931 Blocpdb> 8 atoms in block 114 Block first atom: 940 Blocpdb> 9 atoms in block 115 Block first atom: 948 Blocpdb> 4 atoms in block 116 Block first atom: 957 Blocpdb> 9 atoms in block 117 Block first atom: 961 Blocpdb> 14 atoms in block 118 Block first atom: 970 Blocpdb> 5 atoms in block 119 Block first atom: 984 Blocpdb> 9 atoms in block 120 Block first atom: 989 Blocpdb> 4 atoms in block 121 Block first atom: 998 Blocpdb> 9 atoms in block 122 Block first atom: 1002 Blocpdb> 9 atoms in block 123 Block first atom: 1011 Blocpdb> 7 atoms in block 124 Block first atom: 1020 Blocpdb> 9 atoms in block 125 Block first atom: 1027 Blocpdb> 7 atoms in block 126 Block first atom: 1036 Blocpdb> 13 atoms in block 127 Block first atom: 1043 Blocpdb> 5 atoms in block 128 Block first atom: 1056 Blocpdb> 8 atoms in block 129 Block first atom: 1061 Blocpdb> 9 atoms in block 130 Block first atom: 1069 Blocpdb> 7 atoms in block 131 Block first atom: 1078 Blocpdb> 4 atoms in block 132 Block first atom: 1085 Blocpdb> 9 atoms in block 133 Block first atom: 1089 Blocpdb> 8 atoms in block 134 Block first atom: 1098 Blocpdb> 7 atoms in block 135 Block first atom: 1106 Blocpdb> 11 atoms in block 136 Block first atom: 1113 Blocpdb> 5 atoms in block 137 Block first atom: 1124 Blocpdb> 7 atoms in block 138 Block first atom: 1129 Blocpdb> 9 atoms in block 139 Block first atom: 1136 Blocpdb> 7 atoms in block 140 Block first atom: 1145 Blocpdb> 9 atoms in block 141 Block first atom: 1152 Blocpdb> 7 atoms in block 142 Block first atom: 1161 Blocpdb> 4 atoms in block 143 Block first atom: 1168 Blocpdb> 8 atoms in block 144 Block first atom: 1172 Blocpdb> 11 atoms in block 145 Block first atom: 1180 Blocpdb> 9 atoms in block 146 Block first atom: 1191 Blocpdb> 7 atoms in block 147 Block first atom: 1200 Blocpdb> 8 atoms in block 148 Block first atom: 1207 Blocpdb> 7 atoms in block 149 Block first atom: 1215 Blocpdb> 4 atoms in block 150 Block first atom: 1222 Blocpdb> 7 atoms in block 151 Block first atom: 1226 Blocpdb> 8 atoms in block 152 Block first atom: 1233 Blocpdb> 4 atoms in block 153 Block first atom: 1241 Blocpdb> 5 atoms in block 154 Block first atom: 1245 Blocpdb> 7 atoms in block 155 Block first atom: 1250 Blocpdb> 6 atoms in block 156 Block first atom: 1257 Blocpdb> 8 atoms in block 157 Block first atom: 1263 Blocpdb> 8 atoms in block 158 Block first atom: 1271 Blocpdb> 11 atoms in block 159 Block first atom: 1279 Blocpdb> 6 atoms in block 160 Block first atom: 1290 Blocpdb> 7 atoms in block 161 Block first atom: 1296 Blocpdb> 4 atoms in block 162 Block first atom: 1303 Blocpdb> 7 atoms in block 163 Block first atom: 1307 Blocpdb> 6 atoms in block 164 Block first atom: 1314 Blocpdb> 4 atoms in block 165 Block first atom: 1320 Blocpdb> 6 atoms in block 166 Block first atom: 1324 Blocpdb> 7 atoms in block 167 Block first atom: 1330 Blocpdb> 8 atoms in block 168 Block first atom: 1337 Blocpdb> 7 atoms in block 169 Block first atom: 1345 Blocpdb> 8 atoms in block 170 Block first atom: 1352 Blocpdb> 9 atoms in block 171 Block first atom: 1360 Blocpdb> 9 atoms in block 172 Block first atom: 1369 Blocpdb> 8 atoms in block 173 Block first atom: 1378 Blocpdb> 9 atoms in block 174 Block first atom: 1386 Blocpdb> 7 atoms in block 175 Block first atom: 1395 Blocpdb> 7 atoms in block 176 Block first atom: 1402 Blocpdb> 4 atoms in block 177 Block first atom: 1409 Blocpdb> 8 atoms in block 178 Block first atom: 1413 Blocpdb> 12 atoms in block 179 Block first atom: 1421 Blocpdb> 4 atoms in block 180 Block first atom: 1433 Blocpdb> 8 atoms in block 181 Block first atom: 1437 Blocpdb> 4 atoms in block 182 Block first atom: 1445 Blocpdb> 11 atoms in block 183 Block first atom: 1449 Blocpdb> 11 atoms in block 184 Block first atom: 1460 Blocpdb> 7 atoms in block 185 Block first atom: 1471 Blocpdb> 5 atoms in block 186 Block first atom: 1478 Blocpdb> 6 atoms in block 187 Block first atom: 1483 Blocpdb> 4 atoms in block 188 Block first atom: 1489 Blocpdb> 5 atoms in block 189 Block first atom: 1493 Blocpdb> 21 atoms in block 190 Block first atom: 1498 Blocpdb> 7 atoms in block 191 Block first atom: 1519 Blocpdb> 6 atoms in block 192 Block first atom: 1526 Blocpdb> 5 atoms in block 193 Block first atom: 1532 Blocpdb> 8 atoms in block 194 Block first atom: 1537 Blocpdb> 5 atoms in block 195 Block first atom: 1545 Blocpdb> 6 atoms in block 196 Block first atom: 1549 Blocpdb> 196 blocks. Blocpdb> At most, 27 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 4 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 580419 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 4665 Prepmat> Matrix trace = 1268940.0000 Prepmat> Last element read: 4665 4665 92.7221 Prepmat> 19307 lines saved. Prepmat> 16797 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 1555 RTB> Total mass = 1555.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 1555 RTB> Number of blocks = 196 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 294317.6513 RTB> 87384 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1176 Diagstd> Nb of non-zero elements: 87384 Diagstd> Projected matrix trace = 294317.6513 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1176 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 294317.6513 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.2780753 0.7397616 1.3299933 2.9757492 3.6251086 3.9811890 4.9111612 5.3414367 5.5839284 6.6870271 8.3546317 9.0693258 9.4684617 9.6449285 10.2401024 11.3938025 11.9941369 12.3166590 12.8845679 13.5830312 14.4241149 15.1661459 16.4021796 16.8338880 17.8491499 18.5106238 18.9725862 19.8533274 20.5001661 20.9520132 22.9415024 23.8964317 24.2940232 25.4857788 26.6688834 27.4952062 28.3275685 28.8503989 29.4009593 30.5220434 31.6335612 32.1041036 32.8682632 33.5255125 33.7114741 34.5791987 35.5864340 36.0889038 37.1502884 37.5564541 38.5724540 39.9602896 40.7538964 41.5552953 41.7959931 42.9973332 43.3292167 43.4948743 44.5014191 45.2467750 46.0105935 47.3863068 47.5721952 49.4353106 49.5608287 50.4576295 50.5518705 51.2459498 51.9101480 52.8186365 54.1525826 54.7058637 56.0126760 56.5225535 56.9477822 57.5860645 58.4705793 59.1171215 59.4148446 60.2338853 61.2412262 61.6166121 62.8406963 63.0134601 64.1155642 64.5857239 65.6268190 66.2115238 66.6761791 66.9836512 67.9291588 68.9761218 69.3748038 69.7541497 69.8356359 70.2303534 71.4943138 71.6074181 71.9791551 72.7490073 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034316 0.0034327 0.0034333 0.0034338 0.0034341 0.0034348 57.2633145 93.3987760 125.2333508 187.3240094 206.7548893 216.6714449 240.6508361 250.9714529 256.6050516 280.8095160 313.8765961 327.0263769 334.1450206 337.2444312 347.4940957 366.5469611 376.0796040 381.1024485 389.7895667 400.2152462 412.4201412 422.8953360 439.7907203 445.5408168 458.7795475 467.2031992 472.9971764 483.8513227 491.6702952 497.0592493 520.1231787 530.8377601 535.2356119 548.2065690 560.7866893 569.4082708 577.9628575 583.2720841 588.8111574 599.9320769 610.7582238 615.2839047 622.5635044 628.7572316 630.4986368 638.5615180 647.7948869 652.3521917 661.8756057 665.4839279 674.4253957 686.4510822 693.2339903 700.0168062 702.0412079 712.0590992 714.8019017 716.1670247 724.4062865 730.4476487 736.5872513 747.5180968 748.9828554 763.5085663 764.4772400 771.3628199 772.0828312 777.3651262 782.3866186 789.2032645 799.1068746 803.1787690 812.7153097 816.4059607 819.4711869 824.0507899 830.3553314 834.9335646 837.0333521 842.7829072 849.8009636 852.4014663 860.8267903 862.0092857 869.5148720 872.6971271 879.7027655 883.6129491 886.7080114 888.7501533 895.0007484 901.8715074 904.4741602 906.9436505 907.4732378 910.0341859 918.1867711 918.9127717 921.2948690 926.2086143 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 1555 Rtb_to_modes> Number of blocs = 196 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9862E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9928E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9963E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9989E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0005E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2781 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7398 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.330 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.976 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.625 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.981 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.911 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.341 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.584 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.687 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.355 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.069 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.468 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.645 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 68.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 69.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 69.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 69.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 70.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 71.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 71.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 71.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 72.75 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1176 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99995 0.99999 1.00000 1.00004 0.99999 0.99995 1.00001 0.99998 1.00001 0.99999 1.00002 0.99998 1.00001 0.99999 1.00001 0.99999 1.00002 0.99999 0.99997 0.99998 1.00002 1.00001 0.99999 1.00003 1.00000 1.00003 0.99999 1.00001 0.99999 0.99999 1.00001 0.99999 0.99997 1.00000 1.00002 1.00000 0.99997 1.00002 0.99998 1.00002 1.00003 1.00001 1.00001 1.00001 0.99998 1.00000 1.00002 1.00002 0.99999 0.99999 1.00000 1.00002 1.00000 0.99998 0.99997 1.00001 0.99998 0.99998 0.99999 1.00001 1.00003 0.99999 1.00000 1.00004 1.00000 0.99998 0.99999 1.00001 0.99999 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 1.00002 0.99999 1.00001 1.00003 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 0.99999 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 1.00001 0.99998 0.99999 1.00004 1.00002 1.00000 0.99999 1.00000 0.99998 1.00001 0.99999 0.99998 1.00002 0.99999 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 27990 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99995 0.99999 1.00000 1.00004 0.99999 0.99995 1.00001 0.99998 1.00001 0.99999 1.00002 0.99998 1.00001 0.99999 1.00001 0.99999 1.00002 0.99999 0.99997 0.99998 1.00002 1.00001 0.99999 1.00003 1.00000 1.00003 0.99999 1.00001 0.99999 0.99999 1.00001 0.99999 0.99997 1.00000 1.00002 1.00000 0.99997 1.00002 0.99998 1.00002 1.00003 1.00001 1.00001 1.00001 0.99998 1.00000 1.00002 1.00002 0.99999 0.99999 1.00000 1.00002 1.00000 0.99998 0.99997 1.00001 0.99998 0.99998 0.99999 1.00001 1.00003 0.99999 1.00000 1.00004 1.00000 0.99998 0.99999 1.00001 0.99999 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 1.00002 0.99999 1.00001 1.00003 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 0.99999 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 1.00001 0.99998 0.99999 1.00004 1.00002 1.00000 0.99999 1.00000 0.99998 1.00001 0.99999 0.99998 1.00002 0.99999 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3:-0.000-0.000 Vector 4: 0.000-0.000-0.000 Vector 5:-0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 6:-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 7: 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 8:-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 9:-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 10:-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 26050316063746603.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 26050316063746603.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 26050316063746603.atom Openam> file on opening on unit 11: 26050316063746603.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 196 First residue number = 43 Last residue number = 167 Number of atoms found = 1555 Mean number per residue = 7.9 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9862E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9928E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9963E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9989E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0005E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2781 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7398 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.330 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.976 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.625 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.981 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.911 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.341 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.584 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.687 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.355 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.069 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.468 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.645 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.75 Bfactors> 106 vectors, 4665 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.278100 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= -0.058 for 211 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.104 +/- 0.61 Bfactors> = 11.891 +/- 4.24 Bfactors> Shiftng-fct= 11.787 Bfactors> Scaling-fct= 7.006 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 26050316063746603.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 26050316063746603.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4314E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4326E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4332E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4347E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 57.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 93.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 125.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 187.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 206.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 216.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 240.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 251.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 256.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 280.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 313.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 327.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 334.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 337.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 347.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 366.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 376.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 381.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 389.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 400.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 412.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 422.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 439.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 445.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 458.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 467.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 472.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 483.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 491.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 497.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 520.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 530.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 535.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 548.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 560.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 569.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 578.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 583.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 588.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 599.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 610.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 615.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 622.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 628.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 630.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 638.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 647.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 652.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 661.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 665.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 674.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 686.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 693.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 700.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 702.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 712.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 714.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 716.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 724.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 730.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 736.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 747.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 748.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 763.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 764.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 771.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 772.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 777.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 782.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 789.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 799.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 803.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 812.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 816.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 819.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 824.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 830.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 834.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 837.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 842.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 849.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 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Chkmod> That is: 1555 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 7 is: 0.9999 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 8 is: 0.9999 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 25 is: 0.9999 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 26 is: 0.9999 (instead of 1.0000). 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plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 26050316063746603.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 26050316063746603.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 26050316063746603 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure 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