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LOGs for ID: 260504085705148180

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 260504085705148180.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 260504085705148180.atom to be opened. Openam> File opened: 260504085705148180.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 196 First residue number = 43 Last residue number = 167 Number of atoms found = 1558 Mean number per residue = 7.9 Pdbmat> Coordinate statistics: = 0.333581 +/- 10.599414 From: -25.705000 To: 23.134000 = -17.080453 +/- 9.729042 From: -40.547000 To: 10.898000 = 13.915268 +/- 8.033386 From: -4.225000 To: 38.094000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 5.3179 % Filled. Pdbmat> 581002 non-zero elements. Pdbmat> 63531 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 81.55 +/- 26.10 Maximum number = 135 Minimum number = 11 Pdbmat> Matrix trace = 1.270620E+06 Pdbmat> Larger element = 532.353 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 196 non-zero elements, NRBL set to 1 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 260504085705148180.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 1 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 260504085705148180.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 260504085705148180.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 1558 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 1 residue(s) per block. Blocpdb> 196 residues. Blocpdb> 4 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 6 atoms in block 2 Block first atom: 5 Blocpdb> 10 atoms in block 3 Block first atom: 11 Blocpdb> 13 atoms in block 4 Block first atom: 21 Blocpdb> 8 atoms in block 5 Block first atom: 34 Blocpdb> 5 atoms in block 6 Block first atom: 42 Blocpdb> 5 atoms in block 7 Block first atom: 47 Blocpdb> 8 atoms in block 8 Block first atom: 52 Blocpdb> 8 atoms in block 9 Block first atom: 60 Blocpdb> 9 atoms in block 10 Block first atom: 68 Blocpdb> 8 atoms in block 11 Block first atom: 77 Blocpdb> 9 atoms in block 12 Block first atom: 85 Blocpdb> 11 atoms in block 13 Block first atom: 94 Blocpdb> 5 atoms in block 14 Block first atom: 105 Blocpdb> 5 atoms in block 15 Block first atom: 110 Blocpdb> 8 atoms in block 16 Block first atom: 115 Blocpdb> 7 atoms in block 17 Block first atom: 123 Blocpdb> 19 atoms in block 18 Block first atom: 130 Blocpdb> 14 atoms in block 19 Block first atom: 149 Blocpdb> 9 atoms in block 20 Block first atom: 163 Blocpdb> 6 atoms in block 21 Block first atom: 172 Blocpdb> 9 atoms in block 22 Block first atom: 178 Blocpdb> 5 atoms in block 23 Block first atom: 187 Blocpdb> 9 atoms in block 24 Block first atom: 192 Blocpdb> 8 atoms in block 25 Block first atom: 201 Blocpdb> 9 atoms in block 26 Block first atom: 209 Blocpdb> 4 atoms in block 27 Block first atom: 218 Blocpdb> 6 atoms in block 28 Block first atom: 222 Blocpdb> 9 atoms in block 29 Block first atom: 228 Blocpdb> 11 atoms in block 30 Block first atom: 237 Blocpdb> 8 atoms in block 31 Block first atom: 248 Blocpdb> 8 atoms in block 32 Block first atom: 256 Blocpdb> 9 atoms in block 33 Block first atom: 264 Blocpdb> 8 atoms in block 34 Block first atom: 273 Blocpdb> 6 atoms in block 35 Block first atom: 281 Blocpdb> 8 atoms in block 36 Block first atom: 287 Blocpdb> 9 atoms in block 37 Block first atom: 295 Blocpdb> 8 atoms in block 38 Block first atom: 304 Blocpdb> 9 atoms in block 39 Block first atom: 312 Blocpdb> 9 atoms in block 40 Block first atom: 321 Blocpdb> 9 atoms in block 41 Block first atom: 330 Blocpdb> 9 atoms in block 42 Block first atom: 339 Blocpdb> 9 atoms in block 43 Block first atom: 348 Blocpdb> 7 atoms in block 44 Block first atom: 357 Blocpdb> 8 atoms in block 45 Block first atom: 364 Blocpdb> 4 atoms in block 46 Block first atom: 372 Blocpdb> 16 atoms in block 47 Block first atom: 376 Blocpdb> 9 atoms in block 48 Block first atom: 392 Blocpdb> 8 atoms in block 49 Block first atom: 401 Blocpdb> 4 atoms in block 50 Block first atom: 409 Blocpdb> 5 atoms in block 51 Block first atom: 413 Blocpdb> 12 atoms in block 52 Block first atom: 418 Blocpdb> 11 atoms in block 53 Block first atom: 430 Blocpdb> 8 atoms in block 54 Block first atom: 441 Blocpdb> 9 atoms in block 55 Block first atom: 449 Blocpdb> 9 atoms in block 56 Block first atom: 458 Blocpdb> 9 atoms in block 57 Block first atom: 467 Blocpdb> 4 atoms in block 58 Block first atom: 476 Blocpdb> 8 atoms in block 59 Block first atom: 480 Blocpdb> 8 atoms in block 60 Block first atom: 488 Blocpdb> 4 atoms in block 61 Block first atom: 496 Blocpdb> 12 atoms in block 62 Block first atom: 500 Blocpdb> 6 atoms in block 63 Block first atom: 512 Blocpdb> 9 atoms in block 64 Block first atom: 518 Blocpdb> 8 atoms in block 65 Block first atom: 527 Blocpdb> 4 atoms in block 66 Block first atom: 535 Blocpdb> 5 atoms in block 67 Block first atom: 539 Blocpdb> 4 atoms in block 68 Block first atom: 544 Blocpdb> 7 atoms in block 69 Block first atom: 548 Blocpdb> 21 atoms in block 70 Block first atom: 555 Blocpdb> 9 atoms in block 71 Block first atom: 576 Blocpdb> 9 atoms in block 72 Block first atom: 585 Blocpdb> 4 atoms in block 73 Block first atom: 594 Blocpdb> 7 atoms in block 74 Block first atom: 598 Blocpdb> 11 atoms in block 75 Block first atom: 605 Blocpdb> 10 atoms in block 76 Block first atom: 616 Blocpdb> 7 atoms in block 77 Block first atom: 626 Blocpdb> 8 atoms in block 78 Block first atom: 633 Blocpdb> 14 atoms in block 79 Block first atom: 641 Blocpdb> 10 atoms in block 80 Block first atom: 655 Blocpdb> 7 atoms in block 81 Block first atom: 665 Blocpdb> 7 atoms in block 82 Block first atom: 672 Blocpdb> 27 atoms in block 83 Block first atom: 679 Blocpdb> 4 atoms in block 84 Block first atom: 706 Blocpdb> 5 atoms in block 85 Block first atom: 710 Blocpdb> 7 atoms in block 86 Block first atom: 715 Blocpdb> 8 atoms in block 87 Block first atom: 722 Blocpdb> 8 atoms in block 88 Block first atom: 730 Blocpdb> 10 atoms in block 89 Block first atom: 738 Blocpdb> 9 atoms in block 90 Block first atom: 748 Blocpdb> 4 atoms in block 91 Block first atom: 757 Blocpdb> 9 atoms in block 92 Block first atom: 761 Blocpdb> 11 atoms in block 93 Block first atom: 770 Blocpdb> 8 atoms in block 94 Block first atom: 781 Blocpdb> 9 atoms in block 95 Block first atom: 789 Blocpdb> 7 atoms in block 96 Block first atom: 798 Blocpdb> 6 atoms in block 97 Block first atom: 805 Blocpdb> 14 atoms in block 98 Block first atom: 811 Blocpdb> 5 atoms in block 99 Block first atom: 825 Blocpdb> 8 atoms in block 100 Block first atom: 830 Blocpdb> 7 atoms in block 101 Block first atom: 838 Blocpdb> 5 atoms in block 102 Block first atom: 845 Blocpdb> 9 atoms in block 103 Block first atom: 850 Blocpdb> 8 atoms in block 104 Block first atom: 859 Blocpdb> 8 atoms in block 105 Block first atom: 867 Blocpdb> 8 atoms in block 106 Block first atom: 875 Blocpdb> 6 atoms in block 107 Block first atom: 883 Blocpdb> 12 atoms in block 108 Block first atom: 889 Blocpdb> 8 atoms in block 109 Block first atom: 901 Blocpdb> 4 atoms in block 110 Block first atom: 909 Blocpdb> 4 atoms in block 111 Block first atom: 913 Blocpdb> 14 atoms in block 112 Block first atom: 917 Blocpdb> 9 atoms in block 113 Block first atom: 931 Blocpdb> 8 atoms in block 114 Block first atom: 940 Blocpdb> 9 atoms in block 115 Block first atom: 948 Blocpdb> 4 atoms in block 116 Block first atom: 957 Blocpdb> 9 atoms in block 117 Block first atom: 961 Blocpdb> 14 atoms in block 118 Block first atom: 970 Blocpdb> 5 atoms in block 119 Block first atom: 984 Blocpdb> 9 atoms in block 120 Block first atom: 989 Blocpdb> 4 atoms in block 121 Block first atom: 998 Blocpdb> 9 atoms in block 122 Block first atom: 1002 Blocpdb> 9 atoms in block 123 Block first atom: 1011 Blocpdb> 7 atoms in block 124 Block first atom: 1020 Blocpdb> 9 atoms in block 125 Block first atom: 1027 Blocpdb> 7 atoms in block 126 Block first atom: 1036 Blocpdb> 13 atoms in block 127 Block first atom: 1043 Blocpdb> 5 atoms in block 128 Block first atom: 1056 Blocpdb> 8 atoms in block 129 Block first atom: 1061 Blocpdb> 9 atoms in block 130 Block first atom: 1069 Blocpdb> 7 atoms in block 131 Block first atom: 1078 Blocpdb> 4 atoms in block 132 Block first atom: 1085 Blocpdb> 9 atoms in block 133 Block first atom: 1089 Blocpdb> 8 atoms in block 134 Block first atom: 1098 Blocpdb> 7 atoms in block 135 Block first atom: 1106 Blocpdb> 11 atoms in block 136 Block first atom: 1113 Blocpdb> 5 atoms in block 137 Block first atom: 1124 Blocpdb> 7 atoms in block 138 Block first atom: 1129 Blocpdb> 9 atoms in block 139 Block first atom: 1136 Blocpdb> 7 atoms in block 140 Block first atom: 1145 Blocpdb> 9 atoms in block 141 Block first atom: 1152 Blocpdb> 7 atoms in block 142 Block first atom: 1161 Blocpdb> 4 atoms in block 143 Block first atom: 1168 Blocpdb> 8 atoms in block 144 Block first atom: 1172 Blocpdb> 11 atoms in block 145 Block first atom: 1180 Blocpdb> 9 atoms in block 146 Block first atom: 1191 Blocpdb> 7 atoms in block 147 Block first atom: 1200 Blocpdb> 8 atoms in block 148 Block first atom: 1207 Blocpdb> 7 atoms in block 149 Block first atom: 1215 Blocpdb> 4 atoms in block 150 Block first atom: 1222 Blocpdb> 7 atoms in block 151 Block first atom: 1226 Blocpdb> 8 atoms in block 152 Block first atom: 1233 Blocpdb> 4 atoms in block 153 Block first atom: 1241 Blocpdb> 5 atoms in block 154 Block first atom: 1245 Blocpdb> 7 atoms in block 155 Block first atom: 1250 Blocpdb> 6 atoms in block 156 Block first atom: 1257 Blocpdb> 8 atoms in block 157 Block first atom: 1263 Blocpdb> 8 atoms in block 158 Block first atom: 1271 Blocpdb> 11 atoms in block 159 Block first atom: 1279 Blocpdb> 6 atoms in block 160 Block first atom: 1290 Blocpdb> 7 atoms in block 161 Block first atom: 1296 Blocpdb> 4 atoms in block 162 Block first atom: 1303 Blocpdb> 7 atoms in block 163 Block first atom: 1307 Blocpdb> 6 atoms in block 164 Block first atom: 1314 Blocpdb> 4 atoms in block 165 Block first atom: 1320 Blocpdb> 6 atoms in block 166 Block first atom: 1324 Blocpdb> 7 atoms in block 167 Block first atom: 1330 Blocpdb> 8 atoms in block 168 Block first atom: 1337 Blocpdb> 7 atoms in block 169 Block first atom: 1345 Blocpdb> 8 atoms in block 170 Block first atom: 1352 Blocpdb> 9 atoms in block 171 Block first atom: 1360 Blocpdb> 9 atoms in block 172 Block first atom: 1369 Blocpdb> 11 atoms in block 173 Block first atom: 1378 Blocpdb> 9 atoms in block 174 Block first atom: 1389 Blocpdb> 7 atoms in block 175 Block first atom: 1398 Blocpdb> 7 atoms in block 176 Block first atom: 1405 Blocpdb> 4 atoms in block 177 Block first atom: 1412 Blocpdb> 8 atoms in block 178 Block first atom: 1416 Blocpdb> 12 atoms in block 179 Block first atom: 1424 Blocpdb> 4 atoms in block 180 Block first atom: 1436 Blocpdb> 8 atoms in block 181 Block first atom: 1440 Blocpdb> 4 atoms in block 182 Block first atom: 1448 Blocpdb> 11 atoms in block 183 Block first atom: 1452 Blocpdb> 11 atoms in block 184 Block first atom: 1463 Blocpdb> 7 atoms in block 185 Block first atom: 1474 Blocpdb> 5 atoms in block 186 Block first atom: 1481 Blocpdb> 6 atoms in block 187 Block first atom: 1486 Blocpdb> 4 atoms in block 188 Block first atom: 1492 Blocpdb> 5 atoms in block 189 Block first atom: 1496 Blocpdb> 21 atoms in block 190 Block first atom: 1501 Blocpdb> 7 atoms in block 191 Block first atom: 1522 Blocpdb> 6 atoms in block 192 Block first atom: 1529 Blocpdb> 5 atoms in block 193 Block first atom: 1535 Blocpdb> 8 atoms in block 194 Block first atom: 1540 Blocpdb> 5 atoms in block 195 Block first atom: 1548 Blocpdb> 6 atoms in block 196 Block first atom: 1552 Blocpdb> 196 blocks. Blocpdb> At most, 27 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 4 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 581198 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 4674 Prepmat> Matrix trace = 1270620.0000 Prepmat> Last element read: 4674 4674 92.7221 Prepmat> 19307 lines saved. Prepmat> 16798 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 1558 RTB> Total mass = 1558.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 1558 RTB> Number of blocks = 196 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 294094.8716 RTB> 87348 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1176 Diagstd> Nb of non-zero elements: 87348 Diagstd> Projected matrix trace = 294094.8716 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1176 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 294094.8716 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.2780619 0.7396196 1.3296326 2.9759591 3.6246238 3.9811542 4.9102403 5.3389242 5.5801253 6.6763683 8.3504361 9.0603949 9.4499209 9.6396846 10.2326048 11.3931201 11.9974903 12.2916544 12.8550194 13.5780585 14.4250303 15.1212557 16.4037372 16.8192135 17.8380227 18.5022879 18.9627431 19.8020951 20.4932641 20.9098336 22.9696288 23.8702143 24.2810760 25.4124256 26.6507137 27.4072158 28.3156457 28.7818351 29.3642301 30.5220310 31.6380774 32.0964077 32.8782164 33.4948229 33.6663747 34.5731906 35.4389407 36.0879273 37.1085988 37.5103021 38.5091437 39.9737895 40.7391303 41.5290103 41.7702161 42.9932601 43.3103674 43.4434685 44.4837863 45.1759084 46.0167654 47.3677921 47.4717743 49.4138231 49.4801181 50.4267134 50.4868849 51.0759126 51.8882961 52.4770197 54.0026626 54.5992442 55.9459060 56.4957127 56.9313601 57.5446042 58.3884188 59.1021089 59.3683428 60.1874815 61.2366968 61.7989987 62.3489828 62.8637110 63.3202341 64.6213647 65.1594819 65.8005029 66.4213354 66.6082566 67.8859640 68.9270656 69.0192755 69.3635130 69.7900317 70.0477800 71.1939231 71.3860237 71.9661927 72.3409194 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034331 0.0034335 0.0034337 0.0034338 0.0034342 0.0034348 57.2619348 93.3898067 125.2163699 187.3306160 206.7410663 216.6704967 240.6282717 250.9124195 256.5176519 280.5856287 313.7977742 326.8653192 333.8177041 337.1527386 347.3668578 366.5359847 376.1321735 380.7154061 389.3423517 400.1419817 412.4332282 422.2690094 439.8116024 445.3465811 458.6365236 467.0979892 472.8744624 483.2266202 491.5875199 496.5586699 520.4419179 530.5464821 535.0929685 547.4170762 560.5956223 568.4964279 577.8412155 582.5785911 588.4432552 599.9319543 610.8018197 615.2101534 622.6577598 628.4693803 630.0767537 638.5060412 646.4510514 652.3433653 661.5041271 665.0749050 673.8716894 686.5670250 693.1083920 699.7953802 701.8246884 712.0253723 714.6464067 715.7436873 724.2627567 729.8754021 736.6366529 747.3720486 748.1919176 763.3426149 763.8545043 771.1264713 771.5864064 776.0743821 782.2219260 786.6469470 797.9999547 802.3957058 812.2307662 816.2120952 819.3530224 823.7540902 829.7717354 834.8275430 836.7057307 842.4582074 849.7695369 853.6620979 857.4522936 860.9844102 864.1050361 872.9378872 876.5649309 880.8660802 885.0118413 886.2562553 894.7161465 901.5507422 902.1535833 904.4005556 907.1768897 908.8505371 916.2558127 917.4911339 921.2119095 923.6071626 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 1558 Rtb_to_modes> Number of blocs = 196 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9949E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9976E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9983E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9990E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0005E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2781 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7396 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.330 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.976 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.625 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.981 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.910 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.339 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.580 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.676 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.350 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.060 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.450 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.640 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 68.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 69.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 69.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 69.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 70.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 71.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 71.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 71.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 72.34 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1176 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00003 0.99999 1.00001 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 1.00002 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00003 1.00001 1.00000 1.00002 1.00002 1.00000 1.00001 0.99999 0.99997 0.99999 0.99999 0.99998 1.00000 0.99998 1.00000 0.99998 0.99999 1.00004 0.99999 0.99999 0.99998 0.99999 1.00000 1.00003 0.99999 0.99998 1.00003 0.99997 0.99998 0.99999 0.99999 1.00000 1.00002 1.00002 1.00002 1.00003 1.00000 1.00000 1.00002 1.00001 0.99999 1.00000 0.99996 1.00000 0.99998 1.00000 1.00001 1.00000 0.99998 1.00001 1.00001 0.99999 0.99998 0.99999 0.99995 0.99999 0.99998 0.99999 1.00000 1.00001 0.99997 0.99998 0.99997 1.00001 1.00002 1.00002 1.00001 1.00003 1.00003 1.00001 0.99999 0.99998 0.99999 0.99999 1.00000 1.00002 1.00001 1.00002 1.00002 0.99999 1.00002 0.99999 1.00002 1.00003 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00002 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 28044 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00003 0.99999 1.00001 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 1.00002 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00003 1.00001 1.00000 1.00002 1.00002 1.00000 1.00001 0.99999 0.99997 0.99999 0.99999 0.99998 1.00000 0.99998 1.00000 0.99998 0.99999 1.00004 0.99999 0.99999 0.99998 0.99999 1.00000 1.00003 0.99999 0.99998 1.00003 0.99997 0.99998 0.99999 0.99999 1.00000 1.00002 1.00002 1.00002 1.00003 1.00000 1.00000 1.00002 1.00001 0.99999 1.00000 0.99996 1.00000 0.99998 1.00000 1.00001 1.00000 0.99998 1.00001 1.00001 0.99999 0.99998 0.99999 0.99995 0.99999 0.99998 0.99999 1.00000 1.00001 0.99997 0.99998 0.99997 1.00001 1.00002 1.00002 1.00001 1.00003 1.00003 1.00001 0.99999 0.99998 0.99999 0.99999 1.00000 1.00002 1.00001 1.00002 1.00002 0.99999 1.00002 0.99999 1.00002 1.00003 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00002 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3:-0.000-0.000 Vector 4: 0.000 0.000 0.000 Vector 5:-0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 6: 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 7:-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 8:-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 9: 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 10: 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 260504085705148180.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 260504085705148180.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 260504085705148180.atom Openam> file on opening on unit 11: 260504085705148180.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 196 First residue number = 43 Last residue number = 167 Number of atoms found = 1558 Mean number per residue = 7.9 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9949E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9976E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9983E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9990E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0005E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2781 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7396 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.330 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.976 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.625 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.981 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.910 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.339 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.580 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.676 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.350 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.060 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.450 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.640 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.34 Bfactors> 106 vectors, 4674 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.278100 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= -0.058 for 211 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.104 +/- 0.61 Bfactors> = 11.891 +/- 4.24 Bfactors> Shiftng-fct= 11.787 Bfactors> Scaling-fct= 7.006 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 260504085705148180.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 260504085705148180.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4329E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4334E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4335E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4347E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 57.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 93.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 125.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 187.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 206.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 216.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 240.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 250.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 256.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 280.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 313.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 326.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 333.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 337.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 347.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 366.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 376.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 380.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 389.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 400.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 412.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 422.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 439.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 445.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 458.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 467.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 472.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 483.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 491.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 496.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 520.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 530.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 535.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 547.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 560.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 568.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 577.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 582.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 588.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 599.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 610.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 615.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 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CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 693.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 699.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 701.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 712.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 714.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 715.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 724.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 729.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 736.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 747.4 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Chkmod> That is: 1558 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 18 is: 1.0001 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 26 is: 0.9999 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 35 is: 1.0001 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 72 is: 0.9999 (instead of 1.0000). 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../../bin/get_modes.sh 260504085705148180 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 260504085705148180.eigenfacs 260504085705148180.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 260504085705148180.eigenfacs 260504085705148180.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 260504085705148180.eigenfacs 260504085705148180.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 260504085705148180.eigenfacs 260504085705148180.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 260504085705148180.eigenfacs 260504085705148180.atom calculating perturbed structure for DQ=0 260504085705148180.eigenfacs 260504085705148180.atom calculating perturbed structure for DQ=20 260504085705148180.eigenfacs 260504085705148180.atom calculating perturbed structure for DQ=40 260504085705148180.eigenfacs 260504085705148180.atom calculating perturbed structure for DQ=60 260504085705148180.eigenfacs 260504085705148180.atom 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MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 260504085705148180 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 260504085705148180.eigenfacs 260504085705148180.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 260504085705148180.eigenfacs 260504085705148180.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 260504085705148180.eigenfacs 260504085705148180.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 260504085705148180.eigenfacs 260504085705148180.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 260504085705148180.eigenfacs 260504085705148180.atom calculating perturbed structure for DQ=0 260504085705148180.eigenfacs 260504085705148180.atom calculating perturbed structure for DQ=20 260504085705148180.eigenfacs 260504085705148180.atom calculating perturbed structure for DQ=40 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be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260504085705148180.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 260504085705148180.10.pdb 260504085705148180.11.pdb 260504085705148180.7.pdb 260504085705148180.8.pdb 260504085705148180.9.pdb STDERR: Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL real 0m21.068s user 0m21.008s sys 0m0.050s rm: cannot remove '260504085705148180.sdijf': No such file or directory pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format 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