CNRS Nantes University US2B US2B
home |  start a new run |  job status |  references&downloads |  examples |  help  

Should you encounter any unexpected behaviour,
please let us know.
elNémo has been relocated.
**Some cleaning from time to time**
Sorry for the inconvenience.


***  TRANSFERASE 20-MAR-20 7BOV  ***

LOGs for ID: 260508073110911165

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 260508073110911165.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 260508073110911165.atom to be opened. Openam> File opened: 260508073110911165.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 357 First residue number = 4 Last residue number = 388 Number of atoms found = 2799 Mean number per residue = 7.8 Pdbmat> Coordinate statistics: = -9.007854 +/- 11.541787 From: -37.548000 To: 23.609000 = -18.776268 +/- 9.881895 From: -47.505000 To: 7.902000 = -27.736809 +/- 15.131097 From: -58.772000 To: 8.056000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 2.8033 % Filled. Pdbmat> 988421 non-zero elements. Pdbmat> 107973 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 77.15 +/- 24.54 Maximum number = 126 Minimum number = 9 Pdbmat> Matrix trace = 2.159460E+06 Pdbmat> Larger element = 498.947 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 357 non-zero elements, NRBL set to 2 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 260508073110911165.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 2 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 260508073110911165.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 260508073110911165.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 2799 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 2 residue(s) per block. Blocpdb> 357 residues. Blocpdb> 22 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 14 atoms in block 2 Block first atom: 23 Blocpdb> 16 atoms in block 3 Block first atom: 37 Blocpdb> 16 atoms in block 4 Block first atom: 53 Blocpdb> 12 atoms in block 5 Block first atom: 69 Blocpdb> 16 atoms in block 6 Block first atom: 81 Blocpdb> 17 atoms in block 7 Block first atom: 97 Blocpdb> 15 atoms in block 8 Block first atom: 114 Blocpdb> 15 atoms in block 9 Block first atom: 129 Blocpdb> 13 atoms in block 10 Block first atom: 144 Blocpdb> 16 atoms in block 11 Block first atom: 157 Blocpdb> 17 atoms in block 12 Block first atom: 173 Blocpdb> 15 atoms in block 13 Block first atom: 190 Blocpdb> 13 atoms in block 14 Block first atom: 205 Blocpdb> 21 atoms in block 15 Block first atom: 218 Blocpdb> 14 atoms in block 16 Block first atom: 239 Blocpdb> 17 atoms in block 17 Block first atom: 253 Blocpdb> 14 atoms in block 18 Block first atom: 270 Blocpdb> 18 atoms in block 19 Block first atom: 284 Blocpdb> 16 atoms in block 20 Block first atom: 302 Blocpdb> 12 atoms in block 21 Block first atom: 318 Blocpdb> 16 atoms in block 22 Block first atom: 330 Blocpdb> 14 atoms in block 23 Block first atom: 346 Blocpdb> 8 atoms in block 24 Block first atom: 360 Blocpdb> 14 atoms in block 25 Block first atom: 368 Blocpdb> 16 atoms in block 26 Block first atom: 382 Blocpdb> 12 atoms in block 27 Block first atom: 398 Blocpdb> 18 atoms in block 28 Block first atom: 410 Blocpdb> 16 atoms in block 29 Block first atom: 428 Blocpdb> 12 atoms in block 30 Block first atom: 444 Blocpdb> 14 atoms in block 31 Block first atom: 456 Blocpdb> 16 atoms in block 32 Block first atom: 470 Blocpdb> 18 atoms in block 33 Block first atom: 486 Blocpdb> 14 atoms in block 34 Block first atom: 504 Blocpdb> 14 atoms in block 35 Block first atom: 518 Blocpdb> 15 atoms in block 36 Block first atom: 532 Blocpdb> 17 atoms in block 37 Block first atom: 547 Blocpdb> 18 atoms in block 38 Block first atom: 564 Blocpdb> 20 atoms in block 39 Block first atom: 582 Blocpdb> 17 atoms in block 40 Block first atom: 602 Blocpdb> 17 atoms in block 41 Block first atom: 619 Blocpdb> 15 atoms in block 42 Block first atom: 636 Blocpdb> 16 atoms in block 43 Block first atom: 651 Blocpdb> 20 atoms in block 44 Block first atom: 667 Blocpdb> 19 atoms in block 45 Block first atom: 687 Blocpdb> 12 atoms in block 46 Block first atom: 706 Blocpdb> 13 atoms in block 47 Block first atom: 718 Blocpdb> 13 atoms in block 48 Block first atom: 731 Blocpdb> 19 atoms in block 49 Block first atom: 744 Blocpdb> 14 atoms in block 50 Block first atom: 763 Blocpdb> 17 atoms in block 51 Block first atom: 777 Blocpdb> 15 atoms in block 52 Block first atom: 794 Blocpdb> 14 atoms in block 53 Block first atom: 809 Blocpdb> 17 atoms in block 54 Block first atom: 823 Blocpdb> 14 atoms in block 55 Block first atom: 840 Blocpdb> 12 atoms in block 56 Block first atom: 854 Blocpdb> 17 atoms in block 57 Block first atom: 866 Blocpdb> 17 atoms in block 58 Block first atom: 883 Blocpdb> 15 atoms in block 59 Block first atom: 900 Blocpdb> 20 atoms in block 60 Block first atom: 915 Blocpdb> 12 atoms in block 61 Block first atom: 935 Blocpdb> 17 atoms in block 62 Block first atom: 947 Blocpdb> 16 atoms in block 63 Block first atom: 964 Blocpdb> 17 atoms in block 64 Block first atom: 980 Blocpdb> 17 atoms in block 65 Block first atom: 997 Blocpdb> 20 atoms in block 66 Block first atom: 1014 Blocpdb> 14 atoms in block 67 Block first atom: 1034 Blocpdb> 14 atoms in block 68 Block first atom: 1048 Blocpdb> 20 atoms in block 69 Block first atom: 1062 Blocpdb> 18 atoms in block 70 Block first atom: 1082 Blocpdb> 13 atoms in block 71 Block first atom: 1100 Blocpdb> 14 atoms in block 72 Block first atom: 1113 Blocpdb> 14 atoms in block 73 Block first atom: 1127 Blocpdb> 16 atoms in block 74 Block first atom: 1141 Blocpdb> 15 atoms in block 75 Block first atom: 1157 Blocpdb> 19 atoms in block 76 Block first atom: 1172 Blocpdb> 16 atoms in block 77 Block first atom: 1191 Blocpdb> 17 atoms in block 78 Block first atom: 1207 Blocpdb> 17 atoms in block 79 Block first atom: 1224 Blocpdb> 19 atoms in block 80 Block first atom: 1241 Blocpdb> 16 atoms in block 81 Block first atom: 1260 Blocpdb> 19 atoms in block 82 Block first atom: 1276 Blocpdb> 19 atoms in block 83 Block first atom: 1295 Blocpdb> 17 atoms in block 84 Block first atom: 1314 Blocpdb> 18 atoms in block 85 Block first atom: 1331 Blocpdb> 11 atoms in block 86 Block first atom: 1349 Blocpdb> 14 atoms in block 87 Block first atom: 1360 Blocpdb> 13 atoms in block 88 Block first atom: 1374 Blocpdb> 20 atoms in block 89 Block first atom: 1387 Blocpdb> 18 atoms in block 90 Block first atom: 1407 Blocpdb> 11 atoms in block 91 Block first atom: 1425 Blocpdb> 16 atoms in block 92 Block first atom: 1436 Blocpdb> 16 atoms in block 93 Block first atom: 1452 Blocpdb> 17 atoms in block 94 Block first atom: 1468 Blocpdb> 19 atoms in block 95 Block first atom: 1485 Blocpdb> 15 atoms in block 96 Block first atom: 1504 Blocpdb> 16 atoms in block 97 Block first atom: 1519 Blocpdb> 14 atoms in block 98 Block first atom: 1535 Blocpdb> 12 atoms in block 99 Block first atom: 1549 Blocpdb> 12 atoms in block 100 Block first atom: 1561 Blocpdb> 19 atoms in block 101 Block first atom: 1573 Blocpdb> 19 atoms in block 102 Block first atom: 1592 Blocpdb> 16 atoms in block 103 Block first atom: 1611 Blocpdb> 23 atoms in block 104 Block first atom: 1627 Blocpdb> 17 atoms in block 105 Block first atom: 1650 Blocpdb> 14 atoms in block 106 Block first atom: 1667 Blocpdb> 14 atoms in block 107 Block first atom: 1681 Blocpdb> 22 atoms in block 108 Block first atom: 1695 Blocpdb> 14 atoms in block 109 Block first atom: 1717 Blocpdb> 20 atoms in block 110 Block first atom: 1731 Blocpdb> 16 atoms in block 111 Block first atom: 1751 Blocpdb> 16 atoms in block 112 Block first atom: 1767 Blocpdb> 13 atoms in block 113 Block first atom: 1783 Blocpdb> 13 atoms in block 114 Block first atom: 1796 Blocpdb> 15 atoms in block 115 Block first atom: 1809 Blocpdb> 15 atoms in block 116 Block first atom: 1824 Blocpdb> 15 atoms in block 117 Block first atom: 1839 Blocpdb> 17 atoms in block 118 Block first atom: 1854 Blocpdb> 16 atoms in block 119 Block first atom: 1871 Blocpdb> 12 atoms in block 120 Block first atom: 1887 Blocpdb> 19 atoms in block 121 Block first atom: 1899 Blocpdb> 15 atoms in block 122 Block first atom: 1918 Blocpdb> 20 atoms in block 123 Block first atom: 1933 Blocpdb> 13 atoms in block 124 Block first atom: 1953 Blocpdb> 16 atoms in block 125 Block first atom: 1966 Blocpdb> 17 atoms in block 126 Block first atom: 1982 Blocpdb> 15 atoms in block 127 Block first atom: 1999 Blocpdb> 18 atoms in block 128 Block first atom: 2014 Blocpdb> 13 atoms in block 129 Block first atom: 2032 Blocpdb> 19 atoms in block 130 Block first atom: 2045 Blocpdb> 14 atoms in block 131 Block first atom: 2064 Blocpdb> 14 atoms in block 132 Block first atom: 2078 Blocpdb> 12 atoms in block 133 Block first atom: 2092 Blocpdb> 14 atoms in block 134 Block first atom: 2104 Blocpdb> 15 atoms in block 135 Block first atom: 2118 Blocpdb> 14 atoms in block 136 Block first atom: 2133 Blocpdb> 16 atoms in block 137 Block first atom: 2147 Blocpdb> 9 atoms in block 138 Block first atom: 2163 Blocpdb> 14 atoms in block 139 Block first atom: 2172 Blocpdb> 15 atoms in block 140 Block first atom: 2186 Blocpdb> 15 atoms in block 141 Block first atom: 2201 Blocpdb> 16 atoms in block 142 Block first atom: 2216 Blocpdb> 20 atoms in block 143 Block first atom: 2232 Blocpdb> 18 atoms in block 144 Block first atom: 2252 Blocpdb> 17 atoms in block 145 Block first atom: 2270 Blocpdb> 12 atoms in block 146 Block first atom: 2287 Blocpdb> 19 atoms in block 147 Block first atom: 2299 Blocpdb> 15 atoms in block 148 Block first atom: 2318 Blocpdb> 17 atoms in block 149 Block first atom: 2333 Blocpdb> 12 atoms in block 150 Block first atom: 2350 Blocpdb> 11 atoms in block 151 Block first atom: 2362 Blocpdb> 20 atoms in block 152 Block first atom: 2373 Blocpdb> 16 atoms in block 153 Block first atom: 2393 Blocpdb> 18 atoms in block 154 Block first atom: 2409 Blocpdb> 14 atoms in block 155 Block first atom: 2427 Blocpdb> 13 atoms in block 156 Block first atom: 2441 Blocpdb> 14 atoms in block 157 Block first atom: 2454 Blocpdb> 18 atoms in block 158 Block first atom: 2468 Blocpdb> 12 atoms in block 159 Block first atom: 2486 Blocpdb> 14 atoms in block 160 Block first atom: 2498 Blocpdb> 13 atoms in block 161 Block first atom: 2512 Blocpdb> 14 atoms in block 162 Block first atom: 2525 Blocpdb> 18 atoms in block 163 Block first atom: 2539 Blocpdb> 16 atoms in block 164 Block first atom: 2557 Blocpdb> 17 atoms in block 165 Block first atom: 2573 Blocpdb> 16 atoms in block 166 Block first atom: 2590 Blocpdb> 16 atoms in block 167 Block first atom: 2606 Blocpdb> 18 atoms in block 168 Block first atom: 2622 Blocpdb> 15 atoms in block 169 Block first atom: 2640 Blocpdb> 18 atoms in block 170 Block first atom: 2655 Blocpdb> 9 atoms in block 171 Block first atom: 2673 Blocpdb> 9 atoms in block 172 Block first atom: 2682 Blocpdb> 20 atoms in block 173 Block first atom: 2691 Blocpdb> 10 atoms in block 174 Block first atom: 2711 Blocpdb> 14 atoms in block 175 Block first atom: 2721 Blocpdb> 17 atoms in block 176 Block first atom: 2735 Blocpdb> 16 atoms in block 177 Block first atom: 2752 Blocpdb> 17 atoms in block 178 Block first atom: 2768 Blocpdb> 15 atoms in block 179 Block first atom: 2784 Blocpdb> 179 blocks. Blocpdb> At most, 23 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 8 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 988600 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 8397 Prepmat> Matrix trace = 2159460.0000 Prepmat> Last element read: 8397 8397 132.4118 Prepmat> 16111 lines saved. Prepmat> 14212 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 2799 RTB> Total mass = 2799.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 2799 RTB> Number of blocks = 179 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 232227.7009 RTB> 65643 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1074 Diagstd> Nb of non-zero elements: 65643 Diagstd> Projected matrix trace = 232227.7009 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1074 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 232227.7009 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 1.0271562 1.2618330 1.9380494 2.5061525 2.9336161 3.2048727 3.9539706 4.9850970 5.2233049 5.5111621 5.9256676 6.4029321 6.4359070 6.8892561 7.0421339 7.3616915 8.2052819 8.5275675 8.8916561 9.4268642 9.4989887 10.7181150 11.6968668 12.0527620 12.8389322 13.1534912 13.6952988 13.8623021 14.1029964 14.6402760 15.1630652 15.6905131 16.6136780 16.9650763 17.5342676 18.0480541 18.1567260 18.7110449 19.5064302 19.8236592 20.3398979 21.1104178 21.4344278 21.9463701 22.0104554 22.1113218 22.9131884 23.3126627 23.8485674 24.2443199 24.8680095 25.2882452 25.8454622 26.1483974 26.6564704 27.0134411 27.3087524 27.8087527 28.0711006 28.9007449 28.9841339 29.1138051 29.6847431 29.9711068 30.6099119 30.9334202 31.0949794 31.3823848 32.1676226 32.3459258 32.8584020 33.2953966 33.6643043 33.8712233 33.9380848 34.6653579 35.0990789 35.3484091 35.6066991 36.0194204 36.2982480 36.4311841 37.7869431 38.1824502 38.6320465 39.4233562 39.9732930 40.2237556 40.8792415 41.6498517 41.9995801 42.0535995 43.1090174 43.4050206 43.9618887 44.5127336 45.3739471 45.6852865 45.8339305 46.8726228 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034314 0.0034331 0.0034332 0.0034337 0.0034341 0.0034353 110.0559473 121.9821306 151.1742077 171.9091639 185.9931361 194.4019742 215.9295091 242.4555265 248.1806782 254.9276086 264.3406325 274.7797531 275.4863969 285.0240088 288.1691072 294.6348314 311.0584709 317.1084848 323.8072797 333.4102190 334.6832403 355.5121818 371.3898686 376.9975872 389.0986586 393.8363517 401.8657897 404.3085821 407.8035267 415.4989320 422.8523815 430.1439838 442.6170862 447.2735216 454.7148057 461.3286987 462.7155024 469.7256765 479.6055270 483.4896615 489.7446093 498.9346828 502.7490136 508.7174441 509.4596517 510.6256571 519.8021168 524.3137173 530.3058622 534.6878106 541.5216103 546.0779333 552.0614625 555.2873990 560.6561653 564.3977000 567.4743165 572.6457414 575.3405719 583.7807877 584.6223900 585.9286925 591.6459934 594.4928977 600.7950143 603.9614943 605.5366264 608.3286239 615.8922837 617.5968511 622.4701065 626.5956517 630.0573786 631.9907495 632.6142136 639.3565582 643.3438296 645.6248185 647.9793078 651.7238894 654.2415351 655.4384640 667.5228856 671.0071955 674.9461707 681.8236753 686.5627606 688.7103175 694.2992481 700.8127754 703.7489410 704.2013728 712.9832747 715.4268969 720.0015836 724.4983705 731.4734385 733.9786994 735.1717857 743.4553794 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 2799 Rtb_to_modes> Number of blocs = 179 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9848E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9948E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9957E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9985E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0008E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.027 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.262 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.938 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.506 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.934 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.205 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.954 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.985 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.223 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.511 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.926 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.403 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.436 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.889 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.042 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.362 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.205 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.528 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.892 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.427 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.499 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.87 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1074 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00001 0.99998 0.99999 1.00001 1.00000 0.99998 0.99999 0.99998 0.99999 1.00000 1.00003 1.00002 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 0.99997 1.00000 0.99995 1.00000 0.99997 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 0.99998 0.99997 1.00001 0.99997 0.99999 0.99999 0.99999 0.99997 0.99999 1.00002 1.00000 0.99999 1.00000 1.00002 0.99995 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00002 1.00002 1.00001 1.00000 1.00001 0.99998 0.99998 1.00003 1.00001 1.00002 0.99999 0.99999 0.99999 0.99999 1.00001 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 1.00001 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 1.00003 0.99998 1.00004 1.00004 0.99999 1.00001 0.99999 1.00001 1.00002 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 0.99999 0.99999 1.00002 0.99998 0.99998 0.99996 0.99999 0.99999 1.00002 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 50382 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00001 0.99998 0.99999 1.00001 1.00000 0.99998 0.99999 0.99998 0.99999 1.00000 1.00003 1.00002 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 0.99997 1.00000 0.99995 1.00000 0.99997 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 0.99998 0.99997 1.00001 0.99997 0.99999 0.99999 0.99999 0.99997 0.99999 1.00002 1.00000 0.99999 1.00000 1.00002 0.99995 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00002 1.00002 1.00001 1.00000 1.00001 0.99998 0.99998 1.00003 1.00001 1.00002 0.99999 0.99999 0.99999 0.99999 1.00001 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 1.00001 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 1.00003 0.99998 1.00004 1.00004 0.99999 1.00001 0.99999 1.00001 1.00002 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 0.99999 0.99999 1.00002 0.99998 0.99998 0.99996 0.99999 0.99999 1.00002 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3:-0.000-0.000 Vector 4: 0.000 0.000-0.000 Vector 5: 0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 6:-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 7:-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 8:-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 9: 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 10: 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 260508073110911165.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 260508073110911165.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 260508073110911165.atom Openam> file on opening on unit 11: 260508073110911165.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 357 First residue number = 4 Last residue number = 388 Number of atoms found = 2799 Mean number per residue = 7.8 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9848E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9948E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9957E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9985E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0008E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.027 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.262 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.938 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.506 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.934 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.205 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.954 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.985 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.223 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.511 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.926 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.403 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.436 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.889 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.042 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.362 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.205 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.528 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.892 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.427 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.499 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.87 Bfactors> 106 vectors, 8397 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 1.027000 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.531 for 357 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.040 +/- 0.05 Bfactors> = 93.234 +/- 53.18 Bfactors> Shiftng-fct= 93.194 Bfactors> Scaling-fct= 981.837 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 260508073110911165.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 260508073110911165.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4312E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4329E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4331E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4352E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 110.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 122.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 151.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 171.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 186.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 194.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 215.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 242.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 248.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 254.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 264.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 274.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 275.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 285.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 288.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 294.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 311.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 317.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 323.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 333.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 334.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 355.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 371.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 376.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 389.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 393.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 401.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 404.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 407.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 415.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 422.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 430.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 442.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 447.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 454.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 461.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 462.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 469.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 479.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 483.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 489.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 498.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 502.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 508.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 509.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 510.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 519.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 524.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 530.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 534.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 541.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 546.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 552.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 555.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 560.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 564.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 567.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 572.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 575.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 583.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 584.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 585.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 591.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 594.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 600.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 603.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 605.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 608.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 615.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 617.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 622.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 626.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 630.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 632.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 632.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 639.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 643.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 645.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 648.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 651.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 654.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 655.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 667.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 671.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 674.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 681.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 686.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 688.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 694.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 700.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 703.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 704.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 713.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 715.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 720.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 724.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 731.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 734.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 735.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 743.4 Chkmod> 106 vectors, 8397 coordinates in file. Chkmod> That is: 2799 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 21 is: 0.9999 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 44 is: 0.9999 (instead of 1.0000). Chkmod> Normal end. 0.0034 0.9169 0.0034 0.9124 0.0034 0.7389 0.0034 0.8884 0.0034 0.9313 0.0034 0.7514 110.0429 0.5753 121.9850 0.5627 151.1658 0.5575 171.8966 0.0379 185.9973 0.0503 194.3975 0.3336 215.9210 0.2675 242.4428 0.5425 248.1628 0.3632 254.9129 0.0429 264.3367 0.1435 274.7694 0.0429 275.4766 0.1270 285.0065 0.2062 288.1540 0.0671 294.6284 0.2758 311.0398 0.1217 317.1029 0.3009 323.7996 0.4124 333.3983 0.2281 334.6691 0.2985 355.5282 0.2998 371.4237 0.2755 376.9382 0.1307 389.0981 0.1439 393.7672 0.3562 401.9175 0.3157 404.2577 0.2550 407.7427 0.2853 415.4772 0.2686 422.7915 0.1518 430.1185 0.3770 442.5491 0.2921 447.3192 0.3802 454.6399 0.2791 461.3338 0.3550 462.7374 0.4183 469.6924 0.3179 479.6288 0.2237 483.4243 0.3031 489.7248 0.2630 498.9083 0.3048 502.6755 0.2016 508.7377 0.3513 509.4325 0.1225 510.5885 0.3979 519.7436 0.2662 524.2613 0.3646 530.2990 0.2999 534.6172 0.4813 541.5200 0.3945 546.0734 0.2970 552.0862 0.3255 555.2806 0.1070 560.6692 0.3162 564.3375 0.3108 567.4629 0.3911 572.6340 0.2097 575.3046 0.3502 583.7482 0.4420 584.5556 0.4434 585.8653 0.3538 591.5733 0.3065 594.4564 0.3928 600.7701 0.2677 603.9022 0.3392 605.4621 0.2985 608.2794 0.4055 615.8886 0.3799 617.6092 0.2841 622.4585 0.3430 626.6121 0.2987 629.9901 0.5024 631.9522 0.4479 632.6049 0.2583 639.3719 0.3951 643.3247 0.2611 645.6116 0.4338 647.9815 0.3057 651.7012 0.2742 654.2292 0.2607 655.3997 0.1567 667.5212 0.4361 670.9569 0.4158 674.8993 0.3034 681.7654 0.3425 686.5050 0.4081 688.6486 0.4022 694.2759 0.1983 700.7839 0.3691 703.7222 0.4155 704.1410 0.3070 712.9608 0.3515 715.4372 0.3072 719.9552 0.3817 724.4450 0.3423 731.4102 0.3719 733.9851 0.3633 735.1087 0.3054 743.4027 0.3532 getting mode 7 running: ../../bin/get_modes.sh 260508073110911165 7 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 7 calculating perturbed structure for DQ=-100 260508073110911165.eigenfacs 260508073110911165.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 260508073110911165.eigenfacs 260508073110911165.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 260508073110911165.eigenfacs 260508073110911165.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 260508073110911165.eigenfacs 260508073110911165.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 260508073110911165.eigenfacs 260508073110911165.atom calculating perturbed structure for DQ=0 260508073110911165.eigenfacs 260508073110911165.atom calculating perturbed structure for DQ=20 260508073110911165.eigenfacs 260508073110911165.atom calculating perturbed structure for DQ=40 260508073110911165.eigenfacs 260508073110911165.atom calculating perturbed structure for DQ=60 260508073110911165.eigenfacs 260508073110911165.atom calculating perturbed structure for DQ=80 260508073110911165.eigenfacs 260508073110911165.atom calculating perturbed structure for DQ=100 260508073110911165.eigenfacs 260508073110911165.atom making animated gifs 11 models are in 260508073110911165.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260508073110911165.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260508073110911165.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 260508073110911165 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 260508073110911165.eigenfacs 260508073110911165.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 260508073110911165.eigenfacs 260508073110911165.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 260508073110911165.eigenfacs 260508073110911165.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 260508073110911165.eigenfacs 260508073110911165.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 260508073110911165.eigenfacs 260508073110911165.atom calculating perturbed structure for DQ=0 260508073110911165.eigenfacs 260508073110911165.atom calculating perturbed structure for DQ=20 260508073110911165.eigenfacs 260508073110911165.atom calculating perturbed structure for DQ=40 260508073110911165.eigenfacs 260508073110911165.atom calculating perturbed structure for DQ=60 260508073110911165.eigenfacs 260508073110911165.atom calculating perturbed structure for DQ=80 260508073110911165.eigenfacs 260508073110911165.atom calculating perturbed structure for DQ=100 260508073110911165.eigenfacs 260508073110911165.atom making animated gifs 11 models are in 260508073110911165.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260508073110911165.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260508073110911165.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 260508073110911165 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 260508073110911165.eigenfacs 260508073110911165.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 260508073110911165.eigenfacs 260508073110911165.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 260508073110911165.eigenfacs 260508073110911165.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 260508073110911165.eigenfacs 260508073110911165.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 260508073110911165.eigenfacs 260508073110911165.atom calculating perturbed structure for DQ=0 260508073110911165.eigenfacs 260508073110911165.atom calculating perturbed structure for DQ=20 260508073110911165.eigenfacs 260508073110911165.atom calculating perturbed structure for DQ=40 260508073110911165.eigenfacs 260508073110911165.atom calculating perturbed structure for DQ=60 260508073110911165.eigenfacs 260508073110911165.atom calculating perturbed structure for DQ=80 260508073110911165.eigenfacs 260508073110911165.atom calculating perturbed structure for DQ=100 260508073110911165.eigenfacs 260508073110911165.atom making animated gifs 11 models are in 260508073110911165.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260508073110911165.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260508073110911165.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 260508073110911165 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 260508073110911165.eigenfacs 260508073110911165.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 260508073110911165.eigenfacs 260508073110911165.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 260508073110911165.eigenfacs 260508073110911165.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 260508073110911165.eigenfacs 260508073110911165.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 260508073110911165.eigenfacs 260508073110911165.atom calculating perturbed structure for DQ=0 260508073110911165.eigenfacs 260508073110911165.atom calculating perturbed structure for DQ=20 260508073110911165.eigenfacs 260508073110911165.atom calculating perturbed structure for DQ=40 260508073110911165.eigenfacs 260508073110911165.atom calculating perturbed structure for DQ=60 260508073110911165.eigenfacs 260508073110911165.atom calculating perturbed structure for DQ=80 260508073110911165.eigenfacs 260508073110911165.atom calculating perturbed structure for DQ=100 260508073110911165.eigenfacs 260508073110911165.atom making animated gifs 11 models are in 260508073110911165.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260508073110911165.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260508073110911165.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 260508073110911165 11 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-100 260508073110911165.eigenfacs 260508073110911165.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 260508073110911165.eigenfacs 260508073110911165.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 260508073110911165.eigenfacs 260508073110911165.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 260508073110911165.eigenfacs 260508073110911165.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 260508073110911165.eigenfacs 260508073110911165.atom calculating perturbed structure for DQ=0 260508073110911165.eigenfacs 260508073110911165.atom calculating perturbed structure for DQ=20 260508073110911165.eigenfacs 260508073110911165.atom calculating perturbed structure for DQ=40 260508073110911165.eigenfacs 260508073110911165.atom calculating perturbed structure for DQ=60 260508073110911165.eigenfacs 260508073110911165.atom calculating perturbed structure for DQ=80 260508073110911165.eigenfacs 260508073110911165.atom calculating perturbed structure for DQ=100 260508073110911165.eigenfacs 260508073110911165.atom making animated gifs 11 models are in 260508073110911165.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260508073110911165.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260508073110911165.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 260508073110911165.10.pdb 260508073110911165.11.pdb 260508073110911165.7.pdb 260508073110911165.8.pdb 260508073110911165.9.pdb STDERR: Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL real 0m18.634s user 0m18.499s sys 0m0.112s rm: cannot remove '260508073110911165.sdijf': No such file or directory pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format




If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:

elNémo is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Between 2015 and 2025, it was hosted by US2B (Nantes).
Last modification: april 24th, 2026.