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***  TRANSFERASE 02-MAY-08 3D0Q  ***

LOGs for ID: 260508084400943806

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 260508084400943806.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 260508084400943806.atom to be opened. Openam> File opened: 260508084400943806.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 738 First residue number = -2 Last residue number = 374 Number of atoms found = 5588 Mean number per residue = 7.6 Pdbmat> Coordinate statistics: = -27.653494 +/- 10.828657 From: -60.302000 To: -2.705000 = -31.868113 +/- 15.203904 From: -66.792000 To: 6.898000 = -4.735707 +/- 20.589506 From: -48.153000 To: 40.759000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 1.4463 % Filled. Pdbmat> 2032389 non-zero elements. Pdbmat> 222129 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 79.50 +/- 20.87 Maximum number = 128 Minimum number = 8 Pdbmat> Matrix trace = 4.442580E+06 Pdbmat> Larger element = 474.718 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 738 non-zero elements, NRBL set to 4 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 260508084400943806.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 4 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 260508084400943806.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 260508084400943806.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 5588 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 4 residue(s) per block. Blocpdb> 738 residues. Blocpdb> 10 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 37 atoms in block 2 Block first atom: 11 Blocpdb> 26 atoms in block 3 Block first atom: 48 Blocpdb> 26 atoms in block 4 Block first atom: 74 Blocpdb> 34 atoms in block 5 Block first atom: 100 Blocpdb> 30 atoms in block 6 Block first atom: 134 Blocpdb> 40 atoms in block 7 Block first atom: 164 Blocpdb> 26 atoms in block 8 Block first atom: 204 Blocpdb> 31 atoms in block 9 Block first atom: 230 Blocpdb> 26 atoms in block 10 Block first atom: 261 Blocpdb> 34 atoms in block 11 Block first atom: 287 Blocpdb> 20 atoms in block 12 Block first atom: 321 Blocpdb> 28 atoms in block 13 Block first atom: 341 Blocpdb> 27 atoms in block 14 Block first atom: 369 Blocpdb> 33 atoms in block 15 Block first atom: 396 Blocpdb> 28 atoms in block 16 Block first atom: 429 Blocpdb> 36 atoms in block 17 Block first atom: 457 Blocpdb> 30 atoms in block 18 Block first atom: 493 Blocpdb> 34 atoms in block 19 Block first atom: 523 Blocpdb> 28 atoms in block 20 Block first atom: 557 Blocpdb> 30 atoms in block 21 Block first atom: 585 Blocpdb> 33 atoms in block 22 Block first atom: 615 Blocpdb> 34 atoms in block 23 Block first atom: 648 Blocpdb> 27 atoms in block 24 Block first atom: 682 Blocpdb> 33 atoms in block 25 Block first atom: 709 Blocpdb> 27 atoms in block 26 Block first atom: 742 Blocpdb> 7 atoms in block 27 Block first atom: 769 Blocpdb> 28 atoms in block 28 Block first atom: 776 Blocpdb> 38 atoms in block 29 Block first atom: 804 Blocpdb> 30 atoms in block 30 Block first atom: 842 Blocpdb> 34 atoms in block 31 Block first atom: 872 Blocpdb> 23 atoms in block 32 Block first atom: 906 Blocpdb> 26 atoms in block 33 Block first atom: 929 Blocpdb> 28 atoms in block 34 Block first atom: 955 Blocpdb> 26 atoms in block 35 Block first atom: 983 Blocpdb> 37 atoms in block 36 Block first atom: 1009 Blocpdb> 36 atoms in block 37 Block first atom: 1046 Blocpdb> 22 atoms in block 38 Block first atom: 1082 Blocpdb> 35 atoms in block 39 Block first atom: 1104 Blocpdb> 30 atoms in block 40 Block first atom: 1139 Blocpdb> 23 atoms in block 41 Block first atom: 1169 Blocpdb> 36 atoms in block 42 Block first atom: 1192 Blocpdb> 28 atoms in block 43 Block first atom: 1228 Blocpdb> 28 atoms in block 44 Block first atom: 1256 Blocpdb> 30 atoms in block 45 Block first atom: 1284 Blocpdb> 31 atoms in block 46 Block first atom: 1314 Blocpdb> 33 atoms in block 47 Block first atom: 1345 Blocpdb> 30 atoms in block 48 Block first atom: 1378 Blocpdb> 29 atoms in block 49 Block first atom: 1408 Blocpdb> 39 atoms in block 50 Block first atom: 1437 Blocpdb> 24 atoms in block 51 Block first atom: 1476 Blocpdb> 24 atoms in block 52 Block first atom: 1500 Blocpdb> 34 atoms in block 53 Block first atom: 1524 Blocpdb> 26 atoms in block 54 Block first atom: 1558 Blocpdb> 34 atoms in block 55 Block first atom: 1584 Blocpdb> 20 atoms in block 56 Block first atom: 1618 Blocpdb> 28 atoms in block 57 Block first atom: 1638 Blocpdb> 33 atoms in block 58 Block first atom: 1666 Blocpdb> 21 atoms in block 59 Block first atom: 1699 Blocpdb> 31 atoms in block 60 Block first atom: 1720 Blocpdb> 23 atoms in block 61 Block first atom: 1751 Blocpdb> 28 atoms in block 62 Block first atom: 1774 Blocpdb> 31 atoms in block 63 Block first atom: 1802 Blocpdb> 25 atoms in block 64 Block first atom: 1833 Blocpdb> 32 atoms in block 65 Block first atom: 1858 Blocpdb> 25 atoms in block 66 Block first atom: 1890 Blocpdb> 33 atoms in block 67 Block first atom: 1915 Blocpdb> 31 atoms in block 68 Block first atom: 1948 Blocpdb> 32 atoms in block 69 Block first atom: 1979 Blocpdb> 32 atoms in block 70 Block first atom: 2011 Blocpdb> 34 atoms in block 71 Block first atom: 2043 Blocpdb> 25 atoms in block 72 Block first atom: 2077 Blocpdb> 31 atoms in block 73 Block first atom: 2102 Blocpdb> 19 atoms in block 74 Block first atom: 2133 Blocpdb> 7 atoms in block 75 Block first atom: 2152 Blocpdb> 28 atoms in block 76 Block first atom: 2159 Blocpdb> 24 atoms in block 77 Block first atom: 2187 Blocpdb> 30 atoms in block 78 Block first atom: 2211 Blocpdb> 33 atoms in block 79 Block first atom: 2241 Blocpdb> 37 atoms in block 80 Block first atom: 2274 Blocpdb> 33 atoms in block 81 Block first atom: 2311 Blocpdb> 27 atoms in block 82 Block first atom: 2344 Blocpdb> 34 atoms in block 83 Block first atom: 2371 Blocpdb> 25 atoms in block 84 Block first atom: 2405 Blocpdb> 30 atoms in block 85 Block first atom: 2430 Blocpdb> 28 atoms in block 86 Block first atom: 2460 Blocpdb> 38 atoms in block 87 Block first atom: 2488 Blocpdb> 28 atoms in block 88 Block first atom: 2526 Blocpdb> 34 atoms in block 89 Block first atom: 2554 Blocpdb> 28 atoms in block 90 Block first atom: 2588 Blocpdb> 36 atoms in block 91 Block first atom: 2616 Blocpdb> 9 atoms in block 92 Block first atom: 2652 Blocpdb> 27 atoms in block 93 Block first atom: 2661 Blocpdb> 28 atoms in block 94 Block first atom: 2688 Blocpdb> 36 atoms in block 95 Block first atom: 2716 Blocpdb> 35 atoms in block 96 Block first atom: 2752 Blocpdb> 8 atoms in block 97 Block first atom: 2787 Blocpdb> 10 atoms in block 98 Block first atom: 2795 Blocpdb> 37 atoms in block 99 Block first atom: 2805 Blocpdb> 26 atoms in block 100 Block first atom: 2842 Blocpdb> 26 atoms in block 101 Block first atom: 2868 Blocpdb> 34 atoms in block 102 Block first atom: 2894 Blocpdb> 30 atoms in block 103 Block first atom: 2928 Blocpdb> 40 atoms in block 104 Block first atom: 2958 Blocpdb> 26 atoms in block 105 Block first atom: 2998 Blocpdb> 31 atoms in block 106 Block first atom: 3024 Blocpdb> 26 atoms in block 107 Block first atom: 3055 Blocpdb> 34 atoms in block 108 Block first atom: 3081 Blocpdb> 20 atoms in block 109 Block first atom: 3115 Blocpdb> 28 atoms in block 110 Block first atom: 3135 Blocpdb> 27 atoms in block 111 Block first atom: 3163 Blocpdb> 33 atoms in block 112 Block first atom: 3190 Blocpdb> 28 atoms in block 113 Block first atom: 3223 Blocpdb> 36 atoms in block 114 Block first atom: 3251 Blocpdb> 30 atoms in block 115 Block first atom: 3287 Blocpdb> 34 atoms in block 116 Block first atom: 3317 Blocpdb> 28 atoms in block 117 Block first atom: 3351 Blocpdb> 30 atoms in block 118 Block first atom: 3379 Blocpdb> 33 atoms in block 119 Block first atom: 3409 Blocpdb> 34 atoms in block 120 Block first atom: 3442 Blocpdb> 27 atoms in block 121 Block first atom: 3476 Blocpdb> 33 atoms in block 122 Block first atom: 3503 Blocpdb> 27 atoms in block 123 Block first atom: 3536 Blocpdb> 7 atoms in block 124 Block first atom: 3563 Blocpdb> 28 atoms in block 125 Block first atom: 3570 Blocpdb> 38 atoms in block 126 Block first atom: 3598 Blocpdb> 30 atoms in block 127 Block first atom: 3636 Blocpdb> 34 atoms in block 128 Block first atom: 3666 Blocpdb> 23 atoms in block 129 Block first atom: 3700 Blocpdb> 26 atoms in block 130 Block first atom: 3723 Blocpdb> 28 atoms in block 131 Block first atom: 3749 Blocpdb> 26 atoms in block 132 Block first atom: 3777 Blocpdb> 37 atoms in block 133 Block first atom: 3803 Blocpdb> 36 atoms in block 134 Block first atom: 3840 Blocpdb> 22 atoms in block 135 Block first atom: 3876 Blocpdb> 35 atoms in block 136 Block first atom: 3898 Blocpdb> 30 atoms in block 137 Block first atom: 3933 Blocpdb> 23 atoms in block 138 Block first atom: 3963 Blocpdb> 36 atoms in block 139 Block first atom: 3986 Blocpdb> 28 atoms in block 140 Block first atom: 4022 Blocpdb> 28 atoms in block 141 Block first atom: 4050 Blocpdb> 30 atoms in block 142 Block first atom: 4078 Blocpdb> 31 atoms in block 143 Block first atom: 4108 Blocpdb> 33 atoms in block 144 Block first atom: 4139 Blocpdb> 30 atoms in block 145 Block first atom: 4172 Blocpdb> 29 atoms in block 146 Block first atom: 4202 Blocpdb> 39 atoms in block 147 Block first atom: 4231 Blocpdb> 24 atoms in block 148 Block first atom: 4270 Blocpdb> 24 atoms in block 149 Block first atom: 4294 Blocpdb> 34 atoms in block 150 Block first atom: 4318 Blocpdb> 26 atoms in block 151 Block first atom: 4352 Blocpdb> 34 atoms in block 152 Block first atom: 4378 Blocpdb> 20 atoms in block 153 Block first atom: 4412 Blocpdb> 28 atoms in block 154 Block first atom: 4432 Blocpdb> 33 atoms in block 155 Block first atom: 4460 Blocpdb> 21 atoms in block 156 Block first atom: 4493 Blocpdb> 31 atoms in block 157 Block first atom: 4514 Blocpdb> 23 atoms in block 158 Block first atom: 4545 Blocpdb> 28 atoms in block 159 Block first atom: 4568 Blocpdb> 31 atoms in block 160 Block first atom: 4596 Blocpdb> 25 atoms in block 161 Block first atom: 4627 Blocpdb> 32 atoms in block 162 Block first atom: 4652 Blocpdb> 25 atoms in block 163 Block first atom: 4684 Blocpdb> 33 atoms in block 164 Block first atom: 4709 Blocpdb> 31 atoms in block 165 Block first atom: 4742 Blocpdb> 32 atoms in block 166 Block first atom: 4773 Blocpdb> 32 atoms in block 167 Block first atom: 4805 Blocpdb> 34 atoms in block 168 Block first atom: 4837 Blocpdb> 25 atoms in block 169 Block first atom: 4871 Blocpdb> 31 atoms in block 170 Block first atom: 4896 Blocpdb> 19 atoms in block 171 Block first atom: 4927 Blocpdb> 7 atoms in block 172 Block first atom: 4946 Blocpdb> 28 atoms in block 173 Block first atom: 4953 Blocpdb> 24 atoms in block 174 Block first atom: 4981 Blocpdb> 30 atoms in block 175 Block first atom: 5005 Blocpdb> 33 atoms in block 176 Block first atom: 5035 Blocpdb> 37 atoms in block 177 Block first atom: 5068 Blocpdb> 33 atoms in block 178 Block first atom: 5105 Blocpdb> 27 atoms in block 179 Block first atom: 5138 Blocpdb> 34 atoms in block 180 Block first atom: 5165 Blocpdb> 25 atoms in block 181 Block first atom: 5199 Blocpdb> 30 atoms in block 182 Block first atom: 5224 Blocpdb> 28 atoms in block 183 Block first atom: 5254 Blocpdb> 38 atoms in block 184 Block first atom: 5282 Blocpdb> 28 atoms in block 185 Block first atom: 5320 Blocpdb> 34 atoms in block 186 Block first atom: 5348 Blocpdb> 28 atoms in block 187 Block first atom: 5382 Blocpdb> 36 atoms in block 188 Block first atom: 5410 Blocpdb> 9 atoms in block 189 Block first atom: 5446 Blocpdb> 27 atoms in block 190 Block first atom: 5455 Blocpdb> 28 atoms in block 191 Block first atom: 5482 Blocpdb> 36 atoms in block 192 Block first atom: 5510 Blocpdb> 35 atoms in block 193 Block first atom: 5546 Blocpdb> 8 atoms in block 194 Block first atom: 5580 Blocpdb> 194 blocks. Blocpdb> At most, 40 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 7 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 2032583 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 16764 Prepmat> Matrix trace = 4442580.0000 Prepmat> Last element read: 16764 16764 161.9579 Prepmat> 18916 lines saved. Prepmat> 17089 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 5588 RTB> Total mass = 5588.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 5588 RTB> Number of blocks = 194 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 229056.6615 RTB> 62826 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1164 Diagstd> Nb of non-zero elements: 62826 Diagstd> Projected matrix trace = 229056.6615 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1164 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 229056.6615 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.9365341 1.3246965 2.0511250 3.0989344 3.2116607 3.8423765 4.1963262 4.9787017 5.9090225 6.2506324 6.5908482 6.9265337 8.3655005 10.0288580 10.2496081 11.2298846 11.3428289 12.0697198 12.1718868 12.8710393 13.8754058 14.3116141 14.7714725 15.2487244 16.3336646 16.6128174 16.7938663 17.9199527 18.3209005 18.6969025 19.0872624 19.2925242 19.8337908 19.8790228 20.6236028 21.0930650 21.7306989 22.4977291 22.9067153 23.0977374 23.8094284 24.0132232 24.8518792 25.4779474 25.8889906 26.2833100 26.7251625 27.4935702 27.8176070 28.1456306 28.9243394 29.3054484 29.7514797 30.4813812 30.8320458 31.5548823 31.8775611 32.0937003 32.4885270 32.7387296 33.2953974 33.4232980 33.9565973 34.4966493 34.8739829 35.3674246 35.5823095 36.1779411 36.5239973 36.9794951 37.2033640 37.9252124 38.3302971 38.8170841 39.1512072 39.8028862 40.1587973 40.5001714 41.1419344 41.2417755 41.6188295 42.1804110 42.3322296 42.4469788 42.9169005 43.3303124 43.3732329 43.8888579 44.2407400 44.8358160 45.7025102 45.9869151 46.6756990 46.8881480 47.0062063 47.4747916 47.7534292 48.3193368 48.4985714 49.1033645 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034325 0.0034328 0.0034336 0.0034339 0.0034339 0.0034340 105.0889564 124.9837283 155.5218240 191.1619599 194.6077397 212.8605777 222.4487157 242.2999544 263.9691072 271.4921399 278.7827743 285.7940984 314.0806954 343.8911678 347.6553443 363.9007302 365.7261138 377.2627042 378.8560543 389.5848750 404.4996285 410.8086587 417.3564935 424.0450892 438.8712150 442.6056213 445.0108771 459.6885743 464.8027489 469.5481259 474.4244929 476.9686192 483.6131984 484.1643370 493.1483087 498.7295778 506.2116400 515.0680626 519.7286871 521.8912315 529.8705292 532.1333876 541.3459563 548.1223342 552.5261528 556.7180588 561.3780889 569.3913296 572.7368991 576.1038422 584.0190384 587.8539843 592.3106822 599.5323218 602.9710368 609.9982132 613.1091866 615.1842056 618.9567323 621.3355341 626.5956589 627.7980044 632.7867288 637.7988579 641.2775783 645.7984503 647.7573459 653.1564256 656.2728400 660.3524129 662.3482388 668.7430651 672.3050495 676.5606496 679.4662021 685.0977844 688.1539847 691.0726587 696.5264837 697.3711184 700.5517321 705.2623235 706.5303983 707.4873395 711.3927826 714.8109397 715.1648774 719.4032906 722.2814674 727.1228946 734.1170445 736.3976923 741.8920129 743.5784928 744.5140220 748.2156950 750.4081845 754.8414888 756.2401887 760.9408607 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 5588 Rtb_to_modes> Number of blocs = 194 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9912E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9932E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9982E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9994E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9998E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9365 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.325 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.051 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.099 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.212 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.842 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.196 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.979 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.909 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.251 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.591 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.927 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.366 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.10 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1164 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00002 1.00001 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 1.00002 0.99997 0.99998 1.00000 0.99998 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00002 1.00000 1.00003 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 0.99998 0.99997 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00003 1.00003 1.00000 0.99998 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 0.99998 0.99998 1.00001 0.99997 0.99996 0.99999 1.00001 1.00001 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00002 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00003 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 0.99998 0.99999 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 0.99998 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00002 1.00003 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 0.99998 1.00000 0.99999 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 100584 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00002 1.00001 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 1.00002 0.99997 0.99998 1.00000 0.99998 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00002 1.00000 1.00003 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 0.99998 0.99997 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00003 1.00003 1.00000 0.99998 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 0.99998 0.99998 1.00001 0.99997 0.99996 0.99999 1.00001 1.00001 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00002 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00003 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 0.99998 0.99999 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 0.99998 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00002 1.00003 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 0.99998 1.00000 0.99999 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3: 0.000-0.000 Vector 4:-0.000-0.000 0.000 Vector 5: 0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 6: 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 7: 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 8: 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 9:-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 10:-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 260508084400943806.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 260508084400943806.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 260508084400943806.atom Openam> file on opening on unit 11: 260508084400943806.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 738 First residue number = -2 Last residue number = 374 Number of atoms found = 5588 Mean number per residue = 7.6 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9912E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9932E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9982E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9994E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9998E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9365 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.325 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.051 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.099 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.212 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.842 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.196 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.979 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.909 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.251 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.591 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.927 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.366 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.10 Bfactors> 106 vectors, 16764 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.936500 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.368 for 738 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.020 +/- 0.02 Bfactors> = 9.760 +/- 5.68 Bfactors> Shiftng-fct= 9.740 Bfactors> Scaling-fct= 369.848 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 260508084400943806.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 260508084400943806.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4323E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4326E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4335E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 105.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 125.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 155.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 191.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 194.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 212.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 222.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 242.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 264.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 271.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 278.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 285.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 314.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 343.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 347.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 363.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 365.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 377.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 378.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 389.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 404.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 410.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 417.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 424.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 438.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 442.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 444.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 459.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 464.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 469.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 474.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 476.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 483.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 484.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 493.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 498.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 506.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 515.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 519.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 521.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 529.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 532.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 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CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 592.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 599.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 602.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 609.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 613.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 615.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 618.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 621.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 626.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 627.7 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vecteur en lecture: 668.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 672.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 676.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 679.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 685.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 688.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 691.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 696.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 697.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 700.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 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CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 736.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 741.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 743.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 744.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 748.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 750.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 754.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 756.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 760.9 Chkmod> 106 vectors, 16764 coordinates in file. Chkmod> That is: 5588 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 38 is: 0.9999 (instead of 1.0000). Chkmod> Normal end. 0.0034 0.6896 0.0034 0.9122 0.0034 0.6798 0.0034 0.9691 0.0034 0.7629 0.0034 0.8875 105.0825 0.6192 124.9927 0.6605 155.5104 0.7436 191.1558 0.3605 194.6097 0.3226 212.8410 0.4813 222.4305 0.7346 242.2968 0.6770 263.9573 0.5879 271.4885 0.5638 278.7740 0.5162 285.7914 0.4365 314.0766 0.3576 343.8960 0.5379 347.6471 0.5347 363.8870 0.6982 365.6648 0.4560 377.2509 0.6032 378.8104 0.5832 389.5524 0.5204 404.5492 0.5459 410.7679 0.4925 417.3178 0.2765 424.0446 0.2480 438.8031 0.5239 442.5491 0.5476 444.9405 0.6407 459.6694 0.4708 464.7714 0.6160 469.5669 0.2628 474.4381 0.4510 476.9169 0.1735 483.5462 0.3485 484.1555 0.4162 493.0841 0.5386 498.6719 0.3564 506.1818 0.3357 515.0719 0.5682 519.7436 0.4018 521.8944 0.5509 529.8541 0.5142 532.0748 0.5189 541.3023 0.6127 548.1209 0.5374 552.5132 0.4969 556.6591 0.4249 561.4048 0.5464 569.3299 0.4053 572.7369 0.3842 576.1238 0.4527 583.9502 0.6089 587.8744 0.3778 592.2705 0.5351 599.4930 0.4580 602.9251 0.4262 609.9248 0.5259 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MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260508084400943806.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260508084400943806.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 260508084400943806 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 260508084400943806.eigenfacs 260508084400943806.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 260508084400943806.eigenfacs 260508084400943806.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 260508084400943806.eigenfacs 260508084400943806.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 260508084400943806.eigenfacs 260508084400943806.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 260508084400943806.eigenfacs 260508084400943806.atom calculating perturbed structure for DQ=0 260508084400943806.eigenfacs 260508084400943806.atom calculating perturbed structure for DQ=20 260508084400943806.eigenfacs 260508084400943806.atom calculating perturbed structure for DQ=40 260508084400943806.eigenfacs 260508084400943806.atom calculating perturbed structure for DQ=60 260508084400943806.eigenfacs 260508084400943806.atom calculating perturbed structure for DQ=80 260508084400943806.eigenfacs 260508084400943806.atom calculating perturbed structure for DQ=100 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../../bin/get_modes.sh 260508084400943806 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 260508084400943806.eigenfacs 260508084400943806.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 260508084400943806.eigenfacs 260508084400943806.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 260508084400943806.eigenfacs 260508084400943806.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 260508084400943806.eigenfacs 260508084400943806.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 260508084400943806.eigenfacs 260508084400943806.atom calculating perturbed structure for DQ=0 260508084400943806.eigenfacs 260508084400943806.atom calculating perturbed structure for DQ=20 260508084400943806.eigenfacs 260508084400943806.atom calculating perturbed structure for DQ=40 260508084400943806.eigenfacs 260508084400943806.atom calculating perturbed structure for DQ=60 260508084400943806.eigenfacs 260508084400943806.atom 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