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***  BIOSYNTHETIC PROTEIN 11-MAY-21 7MSP  ***

LOGs for ID: 2605100231101288398

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2605100231101288398.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2605100231101288398.atom to be opened. Openam> File opened: 2605100231101288398.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 666 First residue number = 3 Last residue number = 334 Number of atoms found = 5550 Mean number per residue = 8.3 Pdbmat> Coordinate statistics: = -23.677437 +/- 12.902242 From: -56.370000 To: 8.060000 = 7.986699 +/- 17.050761 From: -31.526000 To: 54.244000 = -14.616104 +/- 18.742011 From: -56.623000 To: 29.559000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 1.5101 % Filled. Pdbmat> 2093337 non-zero elements. Pdbmat> 228933 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 82.50 +/- 22.11 Maximum number = 135 Minimum number = 18 Pdbmat> Matrix trace = 4.578660E+06 Pdbmat> Larger element = 502.732 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 666 non-zero elements, NRBL set to 4 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2605100231101288398.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 4 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2605100231101288398.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2605100231101288398.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 5550 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 4 residue(s) per block. Blocpdb> 666 residues. Blocpdb> 30 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 37 atoms in block 2 Block first atom: 31 Blocpdb> 34 atoms in block 3 Block first atom: 68 Blocpdb> 27 atoms in block 4 Block first atom: 102 Blocpdb> 34 atoms in block 5 Block first atom: 129 Blocpdb> 30 atoms in block 6 Block first atom: 163 Blocpdb> 31 atoms in block 7 Block first atom: 193 Blocpdb> 39 atoms in block 8 Block first atom: 224 Blocpdb> 31 atoms in block 9 Block first atom: 263 Blocpdb> 31 atoms in block 10 Block first atom: 294 Blocpdb> 26 atoms in block 11 Block first atom: 325 Blocpdb> 34 atoms in block 12 Block first atom: 351 Blocpdb> 28 atoms in block 13 Block first atom: 385 Blocpdb> 28 atoms in block 14 Block first atom: 413 Blocpdb> 27 atoms in block 15 Block first atom: 441 Blocpdb> 35 atoms in block 16 Block first atom: 468 Blocpdb> 37 atoms in block 17 Block first atom: 503 Blocpdb> 31 atoms in block 18 Block first atom: 540 Blocpdb> 30 atoms in block 19 Block first atom: 571 Blocpdb> 36 atoms in block 20 Block first atom: 601 Blocpdb> 31 atoms in block 21 Block first atom: 637 Blocpdb> 32 atoms in block 22 Block first atom: 668 Blocpdb> 30 atoms in block 23 Block first atom: 700 Blocpdb> 31 atoms in block 24 Block first atom: 730 Blocpdb> 34 atoms in block 25 Block first atom: 761 Blocpdb> 31 atoms in block 26 Block first atom: 795 Blocpdb> 38 atoms in block 27 Block first atom: 826 Blocpdb> 40 atoms in block 28 Block first atom: 864 Blocpdb> 37 atoms in block 29 Block first atom: 904 Blocpdb> 33 atoms in block 30 Block first atom: 941 Blocpdb> 37 atoms in block 31 Block first atom: 974 Blocpdb> 27 atoms in block 32 Block first atom: 1011 Blocpdb> 45 atoms in block 33 Block first atom: 1038 Blocpdb> 29 atoms in block 34 Block first atom: 1083 Blocpdb> 34 atoms in block 35 Block first atom: 1112 Blocpdb> 35 atoms in block 36 Block first atom: 1146 Blocpdb> 26 atoms in block 37 Block first atom: 1181 Blocpdb> 32 atoms in block 38 Block first atom: 1207 Blocpdb> 35 atoms in block 39 Block first atom: 1239 Blocpdb> 33 atoms in block 40 Block first atom: 1274 Blocpdb> 26 atoms in block 41 Block first atom: 1307 Blocpdb> 36 atoms in block 42 Block first atom: 1333 Blocpdb> 32 atoms in block 43 Block first atom: 1369 Blocpdb> 36 atoms in block 44 Block first atom: 1401 Blocpdb> 37 atoms in block 45 Block first atom: 1437 Blocpdb> 38 atoms in block 46 Block first atom: 1474 Blocpdb> 28 atoms in block 47 Block first atom: 1512 Blocpdb> 34 atoms in block 48 Block first atom: 1540 Blocpdb> 35 atoms in block 49 Block first atom: 1574 Blocpdb> 32 atoms in block 50 Block first atom: 1609 Blocpdb> 36 atoms in block 51 Block first atom: 1641 Blocpdb> 34 atoms in block 52 Block first atom: 1677 Blocpdb> 34 atoms in block 53 Block first atom: 1711 Blocpdb> 36 atoms in block 54 Block first atom: 1745 Blocpdb> 34 atoms in block 55 Block first atom: 1781 Blocpdb> 30 atoms in block 56 Block first atom: 1815 Blocpdb> 33 atoms in block 57 Block first atom: 1845 Blocpdb> 33 atoms in block 58 Block first atom: 1878 Blocpdb> 35 atoms in block 59 Block first atom: 1911 Blocpdb> 33 atoms in block 60 Block first atom: 1946 Blocpdb> 35 atoms in block 61 Block first atom: 1979 Blocpdb> 33 atoms in block 62 Block first atom: 2014 Blocpdb> 38 atoms in block 63 Block first atom: 2047 Blocpdb> 37 atoms in block 64 Block first atom: 2085 Blocpdb> 38 atoms in block 65 Block first atom: 2122 Blocpdb> 33 atoms in block 66 Block first atom: 2160 Blocpdb> 31 atoms in block 67 Block first atom: 2193 Blocpdb> 36 atoms in block 68 Block first atom: 2224 Blocpdb> 32 atoms in block 69 Block first atom: 2260 Blocpdb> 37 atoms in block 70 Block first atom: 2292 Blocpdb> 36 atoms in block 71 Block first atom: 2329 Blocpdb> 41 atoms in block 72 Block first atom: 2365 Blocpdb> 29 atoms in block 73 Block first atom: 2406 Blocpdb> 29 atoms in block 74 Block first atom: 2435 Blocpdb> 31 atoms in block 75 Block first atom: 2464 Blocpdb> 36 atoms in block 76 Block first atom: 2495 Blocpdb> 35 atoms in block 77 Block first atom: 2531 Blocpdb> 35 atoms in block 78 Block first atom: 2566 Blocpdb> 33 atoms in block 79 Block first atom: 2601 Blocpdb> 35 atoms in block 80 Block first atom: 2634 Blocpdb> 32 atoms in block 81 Block first atom: 2669 Blocpdb> 38 atoms in block 82 Block first atom: 2701 Blocpdb> 30 atoms in block 83 Block first atom: 2739 Blocpdb> 5 atoms in block 84 Block first atom: 2769 Blocpdb> 31 atoms in block 85 Block first atom: 2774 Blocpdb> 37 atoms in block 86 Block first atom: 2805 Blocpdb> 30 atoms in block 87 Block first atom: 2842 Blocpdb> 31 atoms in block 88 Block first atom: 2872 Blocpdb> 34 atoms in block 89 Block first atom: 2903 Blocpdb> 30 atoms in block 90 Block first atom: 2937 Blocpdb> 31 atoms in block 91 Block first atom: 2967 Blocpdb> 38 atoms in block 92 Block first atom: 2998 Blocpdb> 33 atoms in block 93 Block first atom: 3036 Blocpdb> 29 atoms in block 94 Block first atom: 3069 Blocpdb> 30 atoms in block 95 Block first atom: 3098 Blocpdb> 30 atoms in block 96 Block first atom: 3128 Blocpdb> 30 atoms in block 97 Block first atom: 3158 Blocpdb> 29 atoms in block 98 Block first atom: 3188 Blocpdb> 26 atoms in block 99 Block first atom: 3217 Blocpdb> 36 atoms in block 100 Block first atom: 3243 Blocpdb> 34 atoms in block 101 Block first atom: 3279 Blocpdb> 32 atoms in block 102 Block first atom: 3313 Blocpdb> 30 atoms in block 103 Block first atom: 3345 Blocpdb> 35 atoms in block 104 Block first atom: 3375 Blocpdb> 32 atoms in block 105 Block first atom: 3410 Blocpdb> 34 atoms in block 106 Block first atom: 3442 Blocpdb> 29 atoms in block 107 Block first atom: 3476 Blocpdb> 30 atoms in block 108 Block first atom: 3505 Blocpdb> 31 atoms in block 109 Block first atom: 3535 Blocpdb> 33 atoms in block 110 Block first atom: 3566 Blocpdb> 38 atoms in block 111 Block first atom: 3599 Blocpdb> 41 atoms in block 112 Block first atom: 3637 Blocpdb> 33 atoms in block 113 Block first atom: 3678 Blocpdb> 36 atoms in block 114 Block first atom: 3711 Blocpdb> 34 atoms in block 115 Block first atom: 3747 Blocpdb> 30 atoms in block 116 Block first atom: 3781 Blocpdb> 43 atoms in block 117 Block first atom: 3811 Blocpdb> 32 atoms in block 118 Block first atom: 3854 Blocpdb> 36 atoms in block 119 Block first atom: 3886 Blocpdb> 32 atoms in block 120 Block first atom: 3922 Blocpdb> 30 atoms in block 121 Block first atom: 3954 Blocpdb> 26 atoms in block 122 Block first atom: 3984 Blocpdb> 35 atoms in block 123 Block first atom: 4010 Blocpdb> 36 atoms in block 124 Block first atom: 4045 Blocpdb> 28 atoms in block 125 Block first atom: 4081 Blocpdb> 33 atoms in block 126 Block first atom: 4109 Blocpdb> 37 atoms in block 127 Block first atom: 4142 Blocpdb> 34 atoms in block 128 Block first atom: 4179 Blocpdb> 32 atoms in block 129 Block first atom: 4213 Blocpdb> 41 atoms in block 130 Block first atom: 4245 Blocpdb> 29 atoms in block 131 Block first atom: 4286 Blocpdb> 37 atoms in block 132 Block first atom: 4315 Blocpdb> 30 atoms in block 133 Block first atom: 4352 Blocpdb> 33 atoms in block 134 Block first atom: 4382 Blocpdb> 38 atoms in block 135 Block first atom: 4415 Blocpdb> 32 atoms in block 136 Block first atom: 4453 Blocpdb> 34 atoms in block 137 Block first atom: 4485 Blocpdb> 32 atoms in block 138 Block first atom: 4519 Blocpdb> 34 atoms in block 139 Block first atom: 4551 Blocpdb> 33 atoms in block 140 Block first atom: 4585 Blocpdb> 33 atoms in block 141 Block first atom: 4618 Blocpdb> 31 atoms in block 142 Block first atom: 4651 Blocpdb> 38 atoms in block 143 Block first atom: 4682 Blocpdb> 32 atoms in block 144 Block first atom: 4720 Blocpdb> 36 atoms in block 145 Block first atom: 4752 Blocpdb> 33 atoms in block 146 Block first atom: 4788 Blocpdb> 38 atoms in block 147 Block first atom: 4821 Blocpdb> 41 atoms in block 148 Block first atom: 4859 Blocpdb> 32 atoms in block 149 Block first atom: 4900 Blocpdb> 34 atoms in block 150 Block first atom: 4932 Blocpdb> 35 atoms in block 151 Block first atom: 4966 Blocpdb> 33 atoms in block 152 Block first atom: 5001 Blocpdb> 32 atoms in block 153 Block first atom: 5034 Blocpdb> 36 atoms in block 154 Block first atom: 5066 Blocpdb> 37 atoms in block 155 Block first atom: 5102 Blocpdb> 38 atoms in block 156 Block first atom: 5139 Blocpdb> 32 atoms in block 157 Block first atom: 5177 Blocpdb> 31 atoms in block 158 Block first atom: 5209 Blocpdb> 29 atoms in block 159 Block first atom: 5240 Blocpdb> 36 atoms in block 160 Block first atom: 5269 Blocpdb> 35 atoms in block 161 Block first atom: 5305 Blocpdb> 35 atoms in block 162 Block first atom: 5340 Blocpdb> 32 atoms in block 163 Block first atom: 5375 Blocpdb> 37 atoms in block 164 Block first atom: 5407 Blocpdb> 31 atoms in block 165 Block first atom: 5444 Blocpdb> 35 atoms in block 166 Block first atom: 5475 Blocpdb> 33 atoms in block 167 Block first atom: 5510 Blocpdb> 8 atoms in block 168 Block first atom: 5542 Blocpdb> 168 blocks. Blocpdb> At most, 45 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 5 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 2093505 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 16650 Prepmat> Matrix trace = 4578660.0000 Prepmat> Last element read: 16650 16650 252.1348 Prepmat> 14197 lines saved. Prepmat> 12729 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 5550 RTB> Total mass = 5550.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 5550 RTB> Number of blocks = 168 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 200952.5040 RTB> 50292 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1008 Diagstd> Nb of non-zero elements: 50292 Diagstd> Projected matrix trace = 200952.5040 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1008 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 200952.5040 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.2516157 0.5161314 1.0356803 1.7225254 1.9578597 2.1312423 2.6774810 2.9261402 3.7543387 4.9384820 5.0710264 5.8204206 6.1228449 6.2336728 6.5358755 6.9789995 7.6723342 7.7103042 9.5181126 9.9682084 9.9967338 10.3983690 11.2815965 13.0055712 13.2943186 14.3276270 14.8662234 15.8895147 16.2022368 16.6021944 17.1160248 17.3293625 17.6425384 18.1321822 19.4866904 19.7363136 20.1000197 20.6764514 21.7952900 22.5191604 22.9442116 23.3651718 23.6393302 24.3131561 24.6924898 25.5564034 25.6721730 25.9788974 26.6241966 27.6706010 28.2817512 28.8181154 29.1469526 29.6566106 30.3180788 30.6556949 31.0272842 31.9542717 32.5265064 32.6404642 33.2758111 34.0361160 34.4779977 34.5576340 35.5028637 35.8553840 36.0391899 36.4155497 36.9006586 37.2341957 37.5507065 37.8190603 38.4160909 39.1596419 39.4013782 39.5968088 40.0043008 40.2859984 40.7654935 41.0820285 41.5544238 42.5288546 43.1321972 43.2340955 44.0580703 44.1977751 44.2968166 44.8406871 45.5602095 45.7646956 46.1482729 46.6961545 47.1876105 47.4851196 48.3052255 48.3783565 49.5677972 49.6880808 50.3757154 50.5200543 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034329 0.0034330 0.0034337 0.0034339 0.0034341 0.0034344 54.4708531 78.0145150 110.5116677 142.5207497 151.9448792 158.5300858 177.6881557 185.7559974 210.4078817 241.3192779 244.5362314 261.9826091 268.7026245 271.1235745 277.6177088 286.8744468 300.7869823 301.5303538 335.0199726 342.8497478 343.3399538 350.1691581 364.7376214 391.6156104 395.9390361 411.0384158 418.6929107 432.8631315 437.1019734 442.4640886 449.2589460 452.0501038 456.1165342 462.4026539 479.3627943 482.4233265 486.8481469 493.7797580 506.9633990 515.3133307 520.1538891 524.9038640 527.9743978 535.4463336 539.6071828 548.9656215 550.2076135 553.4847220 560.3166611 571.2215411 577.4952668 582.9456528 586.2621515 591.3655724 597.9241832 601.2441486 604.8771272 613.8464404 619.3184097 620.4023633 626.4113313 633.5272181 637.6264119 638.3623735 647.0338068 650.2381848 651.9027161 655.2978081 659.6481350 662.6226374 665.4330030 667.8065083 673.0570310 679.5393899 681.6335944 683.3219529 686.8289970 689.2429707 693.3326179 696.0191997 700.0094659 708.1693457 713.1749355 714.0168638 720.7887770 721.9306564 722.7390805 727.1623922 732.9732687 734.6163152 737.6884883 742.0545614 745.9492353 748.2970766 754.7312579 755.3023490 764.5309825 765.4580440 770.7364414 771.8398273 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 5550 Rtb_to_modes> Number of blocs = 168 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9941E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9946E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9983E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9999E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2516 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5161 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.036 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.723 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.958 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.131 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.677 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.926 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.754 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.938 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.071 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.820 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.123 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.234 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.536 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.979 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.672 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.710 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.518 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.968 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.997 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.52 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1008 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 1.00002 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 1.00003 1.00000 1.00001 0.99999 0.99998 1.00001 0.99998 0.99998 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 1.00001 1.00001 0.99997 0.99998 1.00000 0.99998 1.00002 0.99997 0.99999 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 0.99997 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 0.99998 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 0.99995 0.99999 0.99996 1.00000 1.00000 1.00001 0.99998 1.00000 1.00001 1.00002 1.00001 0.99998 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 1.00004 1.00002 1.00000 0.99999 0.99998 0.99999 0.99999 1.00001 0.99998 1.00002 0.99998 0.99998 0.99998 0.99999 1.00002 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 1.00002 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 0.99998 1.00001 1.00000 1.00002 1.00001 1.00002 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 99900 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 1.00002 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 1.00003 1.00000 1.00001 0.99999 0.99998 1.00001 0.99998 0.99998 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 1.00001 1.00001 0.99997 0.99998 1.00000 0.99998 1.00002 0.99997 0.99999 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 0.99997 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 0.99998 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 0.99995 0.99999 0.99996 1.00000 1.00000 1.00001 0.99998 1.00000 1.00001 1.00002 1.00001 0.99998 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 1.00004 1.00002 1.00000 0.99999 0.99998 0.99999 0.99999 1.00001 0.99998 1.00002 0.99998 0.99998 0.99998 0.99999 1.00002 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 1.00002 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 0.99998 1.00001 1.00000 1.00002 1.00001 1.00002 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3: 0.000 0.000 Vector 4: 0.000 0.000-0.000 Vector 5:-0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 6:-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 7: 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 8:-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 9:-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 10:-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2605100231101288398.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2605100231101288398.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2605100231101288398.atom Openam> file on opening on unit 11: 2605100231101288398.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 666 First residue number = 3 Last residue number = 334 Number of atoms found = 5550 Mean number per residue = 8.3 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9941E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9946E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9983E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9999E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2516 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5161 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.036 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.723 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.958 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.131 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.677 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.926 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.754 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.938 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.071 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.820 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.123 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.234 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.536 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.979 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.672 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.710 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.518 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.968 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.997 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.52 Bfactors> 106 vectors, 16650 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.251600 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.760 for 666 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.038 +/- 0.03 Bfactors> = 47.240 +/- 17.72 Bfactors> Shiftng-fct= 47.202 Bfactors> Scaling-fct= 515.579 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2605100231101288398.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2605100231101288398.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4328E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4329E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4335E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 54.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 78.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 110.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 142.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 151.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 158.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 177.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 185.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 210.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 241.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 244.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 262.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 268.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 271.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 277.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 286.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 300.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 301.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 335.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 342.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 343.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 350.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 364.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 391.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 395.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 411.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 418.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 432.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 437.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 442.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 449.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 452.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 456.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 462.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 479.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 482.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 486.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 493.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 507.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 515.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 520.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 524.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 528.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 535.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 539.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 549.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 550.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 553.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 560.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 571.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 577.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 582.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 586.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 591.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 597.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 601.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 604.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 613.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 619.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 620.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 626.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 633.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 637.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 638.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 647.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 650.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 651.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 655.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 659.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 662.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 665.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 667.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 673.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 679.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 681.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 683.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 686.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 689.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 693.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 696.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 699.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 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animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 2605100231101288398 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 2605100231101288398.eigenfacs 2605100231101288398.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2605100231101288398.eigenfacs 2605100231101288398.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2605100231101288398.eigenfacs 2605100231101288398.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2605100231101288398.eigenfacs 2605100231101288398.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2605100231101288398.eigenfacs 2605100231101288398.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2605100231101288398.eigenfacs 2605100231101288398.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2605100231101288398.eigenfacs 2605100231101288398.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2605100231101288398.eigenfacs 2605100231101288398.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2605100231101288398.eigenfacs 2605100231101288398.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2605100231101288398.eigenfacs 2605100231101288398.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2605100231101288398.eigenfacs 2605100231101288398.atom making animated gifs 11 models are in 2605100231101288398.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2605100231101288398.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2605100231101288398.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 2605100231101288398 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 2605100231101288398.eigenfacs 2605100231101288398.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2605100231101288398.eigenfacs 2605100231101288398.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2605100231101288398.eigenfacs 2605100231101288398.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2605100231101288398.eigenfacs 2605100231101288398.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2605100231101288398.eigenfacs 2605100231101288398.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2605100231101288398.eigenfacs 2605100231101288398.atom calculating perturbed structure for DQ=20 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MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2605100231101288398.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 2605100231101288398.10.pdb 2605100231101288398.11.pdb 2605100231101288398.7.pdb 2605100231101288398.8.pdb 2605100231101288398.9.pdb STDERR: Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL real 0m21.466s user 0m21.254s sys 0m0.204s rm: cannot remove '2605100231101288398.sdijf': No such file or directory pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: 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