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***  METAL BINDING PROTEIN 02-NOV-15 5EJZ  ***

LOGs for ID: 2605100247221291788

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2605100247221291788.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2605100247221291788.atom to be opened. Openam> File opened: 2605100247221291788.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 1392 First residue number = 13 Last residue number = 177 Number of atoms found = 10671 Mean number per residue = 7.7 Pdbmat> Coordinate statistics: = 7.007071 +/- 14.663128 From: -29.981000 To: 45.732000 = -10.997695 +/- 25.461161 From: -70.313000 To: 61.446000 = -58.752477 +/- 34.754443 From: -123.521000 To: 8.656000 Pdbmat> Masses are all set to one. %Pdbmat-W> residue:'UNK ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'UNK ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'UNK ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'UNK ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'UNK ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'UNK ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'UNK ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'UNK ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'UNK ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> 9 residue(s) not known. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 0.7777 % Filled. Pdbmat> 3985333 non-zero elements. Pdbmat> 435768 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 81.67 +/- 21.46 Maximum number = 131 Minimum number = 12 Pdbmat> Matrix trace = 8.715360E+06 Pdbmat> Larger element = 491.096 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 1392 non-zero elements, NRBL set to 7 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2605100247221291788.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 7 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2605100247221291788.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2605100247221291788.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 10671 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 7 residue(s) per block. Blocpdb> 1392 residues. Blocpdb> 55 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 58 atoms in block 2 Block first atom: 56 Blocpdb> 50 atoms in block 3 Block first atom: 114 Blocpdb> 42 atoms in block 4 Block first atom: 164 Blocpdb> 47 atoms in block 5 Block first atom: 206 Blocpdb> 45 atoms in block 6 Block first atom: 253 Blocpdb> 56 atoms in block 7 Block first atom: 298 Blocpdb> 61 atoms in block 8 Block first atom: 354 Blocpdb> 46 atoms in block 9 Block first atom: 415 Blocpdb> 71 atoms in block 10 Block first atom: 461 Blocpdb> 68 atoms in block 11 Block first atom: 532 Blocpdb> 47 atoms in block 12 Block first atom: 600 Blocpdb> 57 atoms in block 13 Block first atom: 647 Blocpdb> 58 atoms in block 14 Block first atom: 704 Blocpdb> 58 atoms in block 15 Block first atom: 762 Blocpdb> 50 atoms in block 16 Block first atom: 820 Blocpdb> 58 atoms in block 17 Block first atom: 870 Blocpdb> 60 atoms in block 18 Block first atom: 928 Blocpdb> 53 atoms in block 19 Block first atom: 988 Blocpdb> 56 atoms in block 20 Block first atom: 1041 Blocpdb> 49 atoms in block 21 Block first atom: 1097 Blocpdb> 48 atoms in block 22 Block first atom: 1146 Blocpdb> 62 atoms in block 23 Block first atom: 1194 Blocpdb> 51 atoms in block 24 Block first atom: 1256 Blocpdb> 49 atoms in block 25 Block first atom: 1307 Blocpdb> 53 atoms in block 26 Block first atom: 1356 Blocpdb> 57 atoms in block 27 Block first atom: 1409 Blocpdb> 65 atoms in block 28 Block first atom: 1466 Blocpdb> 52 atoms in block 29 Block first atom: 1531 Blocpdb> 64 atoms in block 30 Block first atom: 1583 Blocpdb> 50 atoms in block 31 Block first atom: 1647 Blocpdb> 52 atoms in block 32 Block first atom: 1697 Blocpdb> 52 atoms in block 33 Block first atom: 1749 Blocpdb> 56 atoms in block 34 Block first atom: 1801 Blocpdb> 56 atoms in block 35 Block first atom: 1857 Blocpdb> 59 atoms in block 36 Block first atom: 1913 Blocpdb> 59 atoms in block 37 Block first atom: 1972 Blocpdb> 62 atoms in block 38 Block first atom: 2031 Blocpdb> 55 atoms in block 39 Block first atom: 2093 Blocpdb> 52 atoms in block 40 Block first atom: 2148 Blocpdb> 57 atoms in block 41 Block first atom: 2200 Blocpdb> 62 atoms in block 42 Block first atom: 2257 Blocpdb> 60 atoms in block 43 Block first atom: 2319 Blocpdb> 47 atoms in block 44 Block first atom: 2379 Blocpdb> 58 atoms in block 45 Block first atom: 2426 Blocpdb> 43 atoms in block 46 Block first atom: 2484 Blocpdb> 51 atoms in block 47 Block first atom: 2527 Blocpdb> 51 atoms in block 48 Block first atom: 2578 Blocpdb> 62 atoms in block 49 Block first atom: 2629 Blocpdb> 62 atoms in block 50 Block first atom: 2691 Blocpdb> 47 atoms in block 51 Block first atom: 2753 Blocpdb> 56 atoms in block 52 Block first atom: 2800 Blocpdb> 66 atoms in block 53 Block first atom: 2856 Blocpdb> 49 atoms in block 54 Block first atom: 2922 Blocpdb> 56 atoms in block 55 Block first atom: 2971 Blocpdb> 57 atoms in block 56 Block first atom: 3027 Blocpdb> 59 atoms in block 57 Block first atom: 3084 Blocpdb> 64 atoms in block 58 Block first atom: 3143 Blocpdb> 65 atoms in block 59 Block first atom: 3207 Blocpdb> 54 atoms in block 60 Block first atom: 3272 Blocpdb> 63 atoms in block 61 Block first atom: 3326 Blocpdb> 58 atoms in block 62 Block first atom: 3389 Blocpdb> 56 atoms in block 63 Block first atom: 3447 Blocpdb> 53 atoms in block 64 Block first atom: 3503 Blocpdb> 56 atoms in block 65 Block first atom: 3556 Blocpdb> 65 atoms in block 66 Block first atom: 3612 Blocpdb> 57 atoms in block 67 Block first atom: 3677 Blocpdb> 51 atoms in block 68 Block first atom: 3734 Blocpdb> 53 atoms in block 69 Block first atom: 3785 Blocpdb> 59 atoms in block 70 Block first atom: 3838 Blocpdb> 52 atoms in block 71 Block first atom: 3897 Blocpdb> 59 atoms in block 72 Block first atom: 3949 Blocpdb> 59 atoms in block 73 Block first atom: 4008 Blocpdb> 61 atoms in block 74 Block first atom: 4067 Blocpdb> 44 atoms in block 75 Block first atom: 4128 Blocpdb> 59 atoms in block 76 Block first atom: 4172 Blocpdb> 54 atoms in block 77 Block first atom: 4231 Blocpdb> 52 atoms in block 78 Block first atom: 4285 Blocpdb> 51 atoms in block 79 Block first atom: 4337 Blocpdb> 51 atoms in block 80 Block first atom: 4388 Blocpdb> 59 atoms in block 81 Block first atom: 4439 Blocpdb> 55 atoms in block 82 Block first atom: 4498 Blocpdb> 50 atoms in block 83 Block first atom: 4553 Blocpdb> 52 atoms in block 84 Block first atom: 4603 Blocpdb> 51 atoms in block 85 Block first atom: 4655 Blocpdb> 44 atoms in block 86 Block first atom: 4706 Blocpdb> 60 atoms in block 87 Block first atom: 4750 Blocpdb> 47 atoms in block 88 Block first atom: 4810 Blocpdb> 42 atoms in block 89 Block first atom: 4857 Blocpdb> 61 atoms in block 90 Block first atom: 4899 Blocpdb> 55 atoms in block 91 Block first atom: 4960 Blocpdb> 61 atoms in block 92 Block first atom: 5015 Blocpdb> 61 atoms in block 93 Block first atom: 5076 Blocpdb> 41 atoms in block 94 Block first atom: 5137 Blocpdb> 53 atoms in block 95 Block first atom: 5178 Blocpdb> 54 atoms in block 96 Block first atom: 5231 Blocpdb> 55 atoms in block 97 Block first atom: 5285 Blocpdb> 62 atoms in block 98 Block first atom: 5340 Blocpdb> 59 atoms in block 99 Block first atom: 5402 Blocpdb> 49 atoms in block 100 Block first atom: 5461 Blocpdb> 62 atoms in block 101 Block first atom: 5510 Blocpdb> 45 atoms in block 102 Block first atom: 5572 Blocpdb> 58 atoms in block 103 Block first atom: 5617 Blocpdb> 65 atoms in block 104 Block first atom: 5675 Blocpdb> 63 atoms in block 105 Block first atom: 5740 Blocpdb> 50 atoms in block 106 Block first atom: 5803 Blocpdb> 56 atoms in block 107 Block first atom: 5853 Blocpdb> 52 atoms in block 108 Block first atom: 5909 Blocpdb> 61 atoms in block 109 Block first atom: 5961 Blocpdb> 43 atoms in block 110 Block first atom: 6022 Blocpdb> 54 atoms in block 111 Block first atom: 6065 Blocpdb> 54 atoms in block 112 Block first atom: 6119 Blocpdb> 55 atoms in block 113 Block first atom: 6173 Blocpdb> 54 atoms in block 114 Block first atom: 6228 Blocpdb> 67 atoms in block 115 Block first atom: 6282 Blocpdb> 40 atoms in block 116 Block first atom: 6349 Blocpdb> 48 atoms in block 117 Block first atom: 6389 Blocpdb> 51 atoms in block 118 Block first atom: 6437 Blocpdb> 59 atoms in block 119 Block first atom: 6488 Blocpdb> 56 atoms in block 120 Block first atom: 6547 Blocpdb> 63 atoms in block 121 Block first atom: 6603 Blocpdb> 54 atoms in block 122 Block first atom: 6666 Blocpdb> 42 atoms in block 123 Block first atom: 6720 Blocpdb> 45 atoms in block 124 Block first atom: 6762 Blocpdb> 50 atoms in block 125 Block first atom: 6807 Blocpdb> 45 atoms in block 126 Block first atom: 6857 Blocpdb> 60 atoms in block 127 Block first atom: 6902 Blocpdb> 50 atoms in block 128 Block first atom: 6962 Blocpdb> 55 atoms in block 129 Block first atom: 7012 Blocpdb> 50 atoms in block 130 Block first atom: 7067 Blocpdb> 50 atoms in block 131 Block first atom: 7117 Blocpdb> 55 atoms in block 132 Block first atom: 7167 Blocpdb> 51 atoms in block 133 Block first atom: 7222 Blocpdb> 55 atoms in block 134 Block first atom: 7273 Blocpdb> 53 atoms in block 135 Block first atom: 7328 Blocpdb> 47 atoms in block 136 Block first atom: 7381 Blocpdb> 56 atoms in block 137 Block first atom: 7428 Blocpdb> 48 atoms in block 138 Block first atom: 7484 Blocpdb> 47 atoms in block 139 Block first atom: 7532 Blocpdb> 46 atoms in block 140 Block first atom: 7579 Blocpdb> 52 atoms in block 141 Block first atom: 7625 Blocpdb> 51 atoms in block 142 Block first atom: 7677 Blocpdb> 47 atoms in block 143 Block first atom: 7728 Blocpdb> 54 atoms in block 144 Block first atom: 7775 Blocpdb> 69 atoms in block 145 Block first atom: 7829 Blocpdb> 59 atoms in block 146 Block first atom: 7898 Blocpdb> 58 atoms in block 147 Block first atom: 7957 Blocpdb> 51 atoms in block 148 Block first atom: 8015 Blocpdb> 48 atoms in block 149 Block first atom: 8066 Blocpdb> 49 atoms in block 150 Block first atom: 8114 Blocpdb> 49 atoms in block 151 Block first atom: 8163 Blocpdb> 57 atoms in block 152 Block first atom: 8212 Blocpdb> 52 atoms in block 153 Block first atom: 8269 Blocpdb> 64 atoms in block 154 Block first atom: 8321 Blocpdb> 56 atoms in block 155 Block first atom: 8385 Blocpdb> 55 atoms in block 156 Block first atom: 8441 Blocpdb> 49 atoms in block 157 Block first atom: 8496 Blocpdb> 51 atoms in block 158 Block first atom: 8545 Blocpdb> 44 atoms in block 159 Block first atom: 8596 Blocpdb> 51 atoms in block 160 Block first atom: 8640 Blocpdb> 51 atoms in block 161 Block first atom: 8691 Blocpdb> 57 atoms in block 162 Block first atom: 8742 Blocpdb> 53 atoms in block 163 Block first atom: 8799 Blocpdb> 49 atoms in block 164 Block first atom: 8852 Blocpdb> 44 atoms in block 165 Block first atom: 8901 Blocpdb> 57 atoms in block 166 Block first atom: 8945 Blocpdb> 58 atoms in block 167 Block first atom: 9002 Blocpdb> 47 atoms in block 168 Block first atom: 9060 Blocpdb> 50 atoms in block 169 Block first atom: 9107 Blocpdb> 51 atoms in block 170 Block first atom: 9157 Blocpdb> 54 atoms in block 171 Block first atom: 9208 Blocpdb> 51 atoms in block 172 Block first atom: 9262 Blocpdb> 13 atoms in block 173 Block first atom: 9313 Blocpdb> 44 atoms in block 174 Block first atom: 9326 Blocpdb> 41 atoms in block 175 Block first atom: 9370 Blocpdb> 46 atoms in block 176 Block first atom: 9411 Blocpdb> 58 atoms in block 177 Block first atom: 9457 Blocpdb> 58 atoms in block 178 Block first atom: 9515 Blocpdb> 52 atoms in block 179 Block first atom: 9573 Blocpdb> 61 atoms in block 180 Block first atom: 9625 Blocpdb> 50 atoms in block 181 Block first atom: 9686 Blocpdb> 56 atoms in block 182 Block first atom: 9736 Blocpdb> 52 atoms in block 183 Block first atom: 9792 Blocpdb> 49 atoms in block 184 Block first atom: 9844 Blocpdb> 56 atoms in block 185 Block first atom: 9893 Blocpdb> 53 atoms in block 186 Block first atom: 9949 Blocpdb> 45 atoms in block 187 Block first atom: 10002 Blocpdb> 46 atoms in block 188 Block first atom: 10047 Blocpdb> 51 atoms in block 189 Block first atom: 10093 Blocpdb> 53 atoms in block 190 Block first atom: 10144 Blocpdb> 54 atoms in block 191 Block first atom: 10197 Blocpdb> 59 atoms in block 192 Block first atom: 10251 Blocpdb> 55 atoms in block 193 Block first atom: 10310 Blocpdb> 44 atoms in block 194 Block first atom: 10365 Blocpdb> 52 atoms in block 195 Block first atom: 10409 Blocpdb> 44 atoms in block 196 Block first atom: 10461 Blocpdb> 51 atoms in block 197 Block first atom: 10505 Blocpdb> 53 atoms in block 198 Block first atom: 10556 Blocpdb> 18 atoms in block 199 Block first atom: 10609 Blocpdb> 35 atoms in block 200 Block first atom: 10627 Blocpdb> 10 atoms in block 201 Block first atom: 10661 Blocpdb> 201 blocks. Blocpdb> At most, 71 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 10 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 3985534 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 32013 Prepmat> Matrix trace = 8715360.0000 Prepmat> Last element read: 32013 32013 93.5077 Prepmat> 20302 lines saved. Prepmat> 18628 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 10671 RTB> Total mass = 10671.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 10671 RTB> Number of blocks = 201 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 210073.8344 RTB> 57213 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1206 Diagstd> Nb of non-zero elements: 57213 Diagstd> Projected matrix trace = 210073.8344 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1206 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 210073.8344 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.1123697 0.2209111 0.2629640 0.6967641 1.0077004 1.2157708 1.4563466 1.6547402 1.9140815 2.4864889 2.6858989 3.1309507 3.2747595 3.5932993 4.2514380 4.3932862 4.8254160 5.1243273 5.3451528 6.0741300 6.1717292 6.4444438 7.0910504 7.2661784 7.3870488 7.7865660 7.9775134 8.0705495 8.7069460 9.1308843 9.7739361 10.1526855 10.6748205 11.1319941 11.2192740 11.4145356 11.8242290 11.8377803 12.4236605 12.6472013 12.9586202 13.2760685 13.5727688 13.6894565 14.0315689 14.2202817 14.3949749 14.7033897 15.0911269 15.2000906 15.4564134 16.3590000 16.7576271 17.0907236 17.3740750 17.9611656 18.1003054 18.4679474 18.5598913 19.4580653 19.9823954 20.2060593 20.3988728 20.7929536 20.8982257 21.5785779 21.7004173 22.0546150 22.5759618 22.9147916 23.3890081 23.5331532 24.0264431 24.3059525 24.5934987 24.9219556 25.7424988 26.1945005 26.6340058 26.9306523 27.2783849 27.4695365 28.2117829 28.7161797 28.8468901 29.1554323 29.5027002 29.7318302 30.2214491 30.4526217 30.4983066 30.8047963 31.1674799 31.4983645 32.0924523 32.5085129 32.7575708 33.1956016 33.9591114 34.1191275 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034323 0.0034334 0.0034336 0.0034339 0.0034342 0.0034361 36.4015525 51.0392221 55.6856704 90.6438117 109.0086604 119.7350059 131.0471701 139.6883501 150.2365119 171.2334256 177.9672575 192.1469060 196.5101481 205.8457829 223.9046978 227.6093139 238.5407930 245.8180161 251.0587389 267.6315569 269.7731421 275.6690452 289.1682235 292.7172441 295.1418284 303.0178867 306.7107872 308.4940795 320.4263369 328.1343535 339.4923781 346.0076860 354.7934311 362.3112037 363.7287736 366.8803102 373.4063480 373.6202597 382.7542899 386.1824166 390.9080920 395.6671753 400.0640310 401.7800634 406.7695141 409.4957323 412.0033397 416.3935698 421.8481182 423.3683308 426.9230887 439.2114531 444.5304763 448.9267726 452.6329088 460.2168745 461.9960171 466.6643173 467.8245350 479.0105826 485.4215521 488.1306655 490.4540949 495.1689140 496.4208208 504.4367162 505.8588155 509.9704600 515.9628236 519.8203012 525.1715396 526.7873542 532.2798442 535.3670059 538.5244660 542.1086530 550.9607115 555.7767063 560.4198702 563.5321743 567.1587105 569.1424072 576.7804706 581.9137392 583.2366148 586.3474263 589.8290565 592.1150537 596.9705712 599.2494227 599.6987492 602.7045237 606.2421446 609.4516855 615.1722444 619.1470842 621.5142987 625.6559112 632.8101543 634.2993098 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 10671 Rtb_to_modes> Number of blocs = 201 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9901E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9968E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9978E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9995E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0013E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1124 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2209 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2630 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6968 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.008 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.216 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.456 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.655 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.914 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.486 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.686 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.131 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.275 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.593 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.251 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.393 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.825 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.124 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.345 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.074 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.172 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.444 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.091 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.266 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.387 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.787 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.978 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.071 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.707 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.131 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.774 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.12 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1206 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 1.00002 1.00000 0.99999 1.00002 1.00000 0.99998 1.00000 0.99999 1.00002 1.00000 1.00003 1.00000 1.00002 1.00000 0.99998 1.00002 1.00001 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 1.00003 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 0.99997 1.00000 0.99997 1.00000 0.99999 1.00004 1.00000 1.00003 0.99996 1.00002 0.99999 1.00001 0.99999 1.00003 1.00001 1.00001 1.00002 0.99997 0.99999 0.99999 0.99999 1.00002 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00004 0.99999 1.00000 1.00000 1.00004 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 0.99998 0.99999 1.00002 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 1.00002 0.99999 0.99998 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 192078 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 1.00002 1.00000 0.99999 1.00002 1.00000 0.99998 1.00000 0.99999 1.00002 1.00000 1.00003 1.00000 1.00002 1.00000 0.99998 1.00002 1.00001 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 1.00003 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 0.99997 1.00000 0.99997 1.00000 0.99999 1.00004 1.00000 1.00003 0.99996 1.00002 0.99999 1.00001 0.99999 1.00003 1.00001 1.00001 1.00002 0.99997 0.99999 0.99999 0.99999 1.00002 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00004 0.99999 1.00000 1.00000 1.00004 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 0.99998 0.99999 1.00002 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 1.00002 0.99999 0.99998 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3:-0.000-0.000 Vector 4:-0.000-0.000 0.000 Vector 5:-0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 6:-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 7:-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 8: 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 9: 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 10:-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2605100247221291788.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2605100247221291788.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2605100247221291788.atom Openam> file on opening on unit 11: 2605100247221291788.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 1392 First residue number = 13 Last residue number = 177 Number of atoms found = 10671 Mean number per residue = 7.7 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9901E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9968E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9978E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9995E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0013E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1124 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2209 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2630 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6968 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.008 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.216 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.456 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.655 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.914 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.486 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.686 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.131 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.275 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.593 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.251 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.393 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.825 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.124 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.345 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.074 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.172 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.444 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.091 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.266 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.387 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.787 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.978 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.071 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.707 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.131 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.774 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.12 Bfactors> 106 vectors, 32013 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.112400 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.369 for 1393 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.044 +/- 0.04 Bfactors> = 78.350 +/- 21.70 Bfactors> Shiftng-fct= 78.306 Bfactors> Scaling-fct= 614.316 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2605100247221291788.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2605100247221291788.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4321E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4333E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4334E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4360E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 36.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 51.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 55.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 90.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 109.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 119.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 131.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 139.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 150.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 171.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 178.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 192.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 196.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 205.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 223.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 227.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 238.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 245.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 251.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 267.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 269.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 275.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 289.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 292.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 295.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 303.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 306.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 308.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 320.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 328.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 339.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 345.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 354.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 362.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 363.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 366.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 373.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 373.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 382.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 386.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 390.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 395.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 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CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 444.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 448.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 452.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 460.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 462.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 466.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 467.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 479.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 485.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 488.2 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vecteur en lecture: 526.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 532.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 535.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 538.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 542.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 550.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 555.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 560.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 563.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 567.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 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Chkmod> That is: 10671 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. Chkmod> Normal end. 0.0034 0.7252 0.0034 0.7814 0.0034 0.8131 0.0034 0.7228 0.0034 0.7692 0.0034 0.9965 36.4049 0.6909 51.0357 0.5970 55.6871 0.7486 90.6423 0.4798 109.0202 0.7629 119.7411 0.4748 131.0260 0.6420 139.6933 0.5307 150.2269 0.4555 171.2092 0.5195 177.9630 0.2796 192.1402 0.4313 196.5089 0.2902 205.8284 0.2389 223.8836 0.3247 227.5921 0.3952 238.5203 0.2923 245.7996 0.3077 251.0444 0.5169 267.6172 0.4109 269.7675 0.4346 275.6477 0.4069 289.1548 0.3799 292.7011 0.4382 295.1282 0.2946 303.0133 0.5546 306.7070 0.4135 308.4894 0.4502 320.4136 0.3932 328.1223 0.4711 339.4789 0.3326 345.9471 0.0351 354.6981 0.2943 362.2632 0.4827 363.7249 0.5201 366.7917 0.4556 373.3235 0.2042 373.6392 0.3933 382.6815 0.3465 386.2086 0.3073 390.9121 0.1129 395.7088 0.3026 400.0061 0.0227 401.7708 0.1643 406.7293 0.3867 409.4741 0.2516 411.9145 0.4572 416.3277 0.2569 421.8143 0.3109 423.3489 0.2369 426.9543 0.2541 439.2060 0.4671 444.5429 0.3987 448.8980 0.4087 452.5604 0.1789 460.1822 0.5032 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DQ=-80 2605100247221291788.eigenfacs 2605100247221291788.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2605100247221291788.eigenfacs 2605100247221291788.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2605100247221291788.eigenfacs 2605100247221291788.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2605100247221291788.eigenfacs 2605100247221291788.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2605100247221291788.eigenfacs 2605100247221291788.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2605100247221291788.eigenfacs 2605100247221291788.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2605100247221291788.eigenfacs 2605100247221291788.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2605100247221291788.eigenfacs 2605100247221291788.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2605100247221291788.eigenfacs 2605100247221291788.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2605100247221291788.eigenfacs 2605100247221291788.atom making animated gifs 11 models are in 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generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 2605100247221291788.eigenfacs 2605100247221291788.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2605100247221291788.eigenfacs 2605100247221291788.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2605100247221291788.eigenfacs 2605100247221291788.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2605100247221291788.eigenfacs 2605100247221291788.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2605100247221291788.eigenfacs 2605100247221291788.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2605100247221291788.eigenfacs 2605100247221291788.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2605100247221291788.eigenfacs 2605100247221291788.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2605100247221291788.eigenfacs 2605100247221291788.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2605100247221291788.eigenfacs 2605100247221291788.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2605100247221291788.eigenfacs 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animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 2605100247221291788 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 2605100247221291788.eigenfacs 2605100247221291788.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2605100247221291788.eigenfacs 2605100247221291788.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2605100247221291788.eigenfacs 2605100247221291788.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2605100247221291788.eigenfacs 2605100247221291788.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2605100247221291788.eigenfacs 2605100247221291788.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2605100247221291788.eigenfacs 2605100247221291788.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2605100247221291788.eigenfacs 2605100247221291788.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2605100247221291788.eigenfacs 2605100247221291788.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2605100247221291788.eigenfacs 2605100247221291788.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2605100247221291788.eigenfacs 2605100247221291788.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2605100247221291788.eigenfacs 2605100247221291788.atom making animated gifs 11 models are in 2605100247221291788.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2605100247221291788.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2605100247221291788.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 2605100247221291788 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 2605100247221291788.eigenfacs 2605100247221291788.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2605100247221291788.eigenfacs 2605100247221291788.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2605100247221291788.eigenfacs 2605100247221291788.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2605100247221291788.eigenfacs 2605100247221291788.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2605100247221291788.eigenfacs 2605100247221291788.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2605100247221291788.eigenfacs 2605100247221291788.atom calculating perturbed structure for DQ=20 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