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***  BIOSYNTHETIC PROTEIN 11-MAY-21 7MSK  ***

LOGs for ID: 2605100314441296379

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2605100314441296379.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2605100314441296379.atom to be opened. Openam> File opened: 2605100314441296379.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 842 First residue number = 0 Last residue number = 419 Number of atoms found = 6966 Mean number per residue = 8.3 Pdbmat> Coordinate statistics: = -13.069464 +/- 11.368487 From: -44.697000 To: 13.613000 = 0.365104 +/- 26.063866 From: -50.864000 To: 51.708000 = -67.859473 +/- 30.958854 From: -134.366000 To: -2.302000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 1.2012 % Filled. Pdbmat> 2623103 non-zero elements. Pdbmat> 286863 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 82.36 +/- 21.07 Maximum number = 131 Minimum number = 13 Pdbmat> Matrix trace = 5.737260E+06 Pdbmat> Larger element = 510.475 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 842 non-zero elements, NRBL set to 5 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2605100314441296379.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 5 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2605100314441296379.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2605100314441296379.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 6966 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 5 residue(s) per block. Blocpdb> 842 residues. Blocpdb> 38 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 38 atoms in block 2 Block first atom: 39 Blocpdb> 44 atoms in block 3 Block first atom: 77 Blocpdb> 37 atoms in block 4 Block first atom: 121 Blocpdb> 41 atoms in block 5 Block first atom: 158 Blocpdb> 35 atoms in block 6 Block first atom: 199 Blocpdb> 46 atoms in block 7 Block first atom: 234 Blocpdb> 47 atoms in block 8 Block first atom: 280 Blocpdb> 36 atoms in block 9 Block first atom: 327 Blocpdb> 42 atoms in block 10 Block first atom: 363 Blocpdb> 47 atoms in block 11 Block first atom: 405 Blocpdb> 42 atoms in block 12 Block first atom: 452 Blocpdb> 34 atoms in block 13 Block first atom: 494 Blocpdb> 39 atoms in block 14 Block first atom: 528 Blocpdb> 43 atoms in block 15 Block first atom: 567 Blocpdb> 42 atoms in block 16 Block first atom: 610 Blocpdb> 32 atoms in block 17 Block first atom: 652 Blocpdb> 45 atoms in block 18 Block first atom: 684 Blocpdb> 37 atoms in block 19 Block first atom: 729 Blocpdb> 39 atoms in block 20 Block first atom: 766 Blocpdb> 39 atoms in block 21 Block first atom: 805 Blocpdb> 45 atoms in block 22 Block first atom: 844 Blocpdb> 39 atoms in block 23 Block first atom: 889 Blocpdb> 50 atoms in block 24 Block first atom: 928 Blocpdb> 44 atoms in block 25 Block first atom: 978 Blocpdb> 46 atoms in block 26 Block first atom: 1022 Blocpdb> 35 atoms in block 27 Block first atom: 1068 Blocpdb> 49 atoms in block 28 Block first atom: 1103 Blocpdb> 41 atoms in block 29 Block first atom: 1152 Blocpdb> 41 atoms in block 30 Block first atom: 1193 Blocpdb> 41 atoms in block 31 Block first atom: 1234 Blocpdb> 41 atoms in block 32 Block first atom: 1275 Blocpdb> 50 atoms in block 33 Block first atom: 1316 Blocpdb> 36 atoms in block 34 Block first atom: 1366 Blocpdb> 37 atoms in block 35 Block first atom: 1402 Blocpdb> 40 atoms in block 36 Block first atom: 1439 Blocpdb> 44 atoms in block 37 Block first atom: 1479 Blocpdb> 47 atoms in block 38 Block first atom: 1523 Blocpdb> 35 atoms in block 39 Block first atom: 1570 Blocpdb> 41 atoms in block 40 Block first atom: 1605 Blocpdb> 44 atoms in block 41 Block first atom: 1646 Blocpdb> 36 atoms in block 42 Block first atom: 1690 Blocpdb> 34 atoms in block 43 Block first atom: 1726 Blocpdb> 38 atoms in block 44 Block first atom: 1760 Blocpdb> 40 atoms in block 45 Block first atom: 1798 Blocpdb> 39 atoms in block 46 Block first atom: 1838 Blocpdb> 40 atoms in block 47 Block first atom: 1877 Blocpdb> 40 atoms in block 48 Block first atom: 1917 Blocpdb> 44 atoms in block 49 Block first atom: 1957 Blocpdb> 43 atoms in block 50 Block first atom: 2001 Blocpdb> 40 atoms in block 51 Block first atom: 2044 Blocpdb> 46 atoms in block 52 Block first atom: 2084 Blocpdb> 51 atoms in block 53 Block first atom: 2130 Blocpdb> 44 atoms in block 54 Block first atom: 2181 Blocpdb> 40 atoms in block 55 Block first atom: 2225 Blocpdb> 40 atoms in block 56 Block first atom: 2265 Blocpdb> 38 atoms in block 57 Block first atom: 2305 Blocpdb> 46 atoms in block 58 Block first atom: 2343 Blocpdb> 45 atoms in block 59 Block first atom: 2389 Blocpdb> 42 atoms in block 60 Block first atom: 2434 Blocpdb> 38 atoms in block 61 Block first atom: 2476 Blocpdb> 42 atoms in block 62 Block first atom: 2514 Blocpdb> 48 atoms in block 63 Block first atom: 2556 Blocpdb> 46 atoms in block 64 Block first atom: 2604 Blocpdb> 41 atoms in block 65 Block first atom: 2650 Blocpdb> 41 atoms in block 66 Block first atom: 2691 Blocpdb> 35 atoms in block 67 Block first atom: 2732 Blocpdb> 49 atoms in block 68 Block first atom: 2767 Blocpdb> 47 atoms in block 69 Block first atom: 2816 Blocpdb> 43 atoms in block 70 Block first atom: 2863 Blocpdb> 37 atoms in block 71 Block first atom: 2906 Blocpdb> 36 atoms in block 72 Block first atom: 2943 Blocpdb> 42 atoms in block 73 Block first atom: 2979 Blocpdb> 46 atoms in block 74 Block first atom: 3021 Blocpdb> 37 atoms in block 75 Block first atom: 3067 Blocpdb> 40 atoms in block 76 Block first atom: 3104 Blocpdb> 45 atoms in block 77 Block first atom: 3144 Blocpdb> 36 atoms in block 78 Block first atom: 3189 Blocpdb> 43 atoms in block 79 Block first atom: 3225 Blocpdb> 43 atoms in block 80 Block first atom: 3268 Blocpdb> 39 atoms in block 81 Block first atom: 3311 Blocpdb> 44 atoms in block 82 Block first atom: 3350 Blocpdb> 46 atoms in block 83 Block first atom: 3394 Blocpdb> 35 atoms in block 84 Block first atom: 3440 Blocpdb> 8 atoms in block 85 Block first atom: 3475 Blocpdb> 35 atoms in block 86 Block first atom: 3483 Blocpdb> 39 atoms in block 87 Block first atom: 3518 Blocpdb> 45 atoms in block 88 Block first atom: 3557 Blocpdb> 37 atoms in block 89 Block first atom: 3602 Blocpdb> 39 atoms in block 90 Block first atom: 3639 Blocpdb> 39 atoms in block 91 Block first atom: 3678 Blocpdb> 42 atoms in block 92 Block first atom: 3717 Blocpdb> 51 atoms in block 93 Block first atom: 3759 Blocpdb> 34 atoms in block 94 Block first atom: 3810 Blocpdb> 39 atoms in block 95 Block first atom: 3844 Blocpdb> 44 atoms in block 96 Block first atom: 3883 Blocpdb> 42 atoms in block 97 Block first atom: 3927 Blocpdb> 40 atoms in block 98 Block first atom: 3969 Blocpdb> 33 atoms in block 99 Block first atom: 4009 Blocpdb> 49 atoms in block 100 Block first atom: 4042 Blocpdb> 40 atoms in block 101 Block first atom: 4091 Blocpdb> 34 atoms in block 102 Block first atom: 4131 Blocpdb> 43 atoms in block 103 Block first atom: 4165 Blocpdb> 39 atoms in block 104 Block first atom: 4208 Blocpdb> 37 atoms in block 105 Block first atom: 4247 Blocpdb> 39 atoms in block 106 Block first atom: 4284 Blocpdb> 46 atoms in block 107 Block first atom: 4323 Blocpdb> 38 atoms in block 108 Block first atom: 4369 Blocpdb> 50 atoms in block 109 Block first atom: 4407 Blocpdb> 41 atoms in block 110 Block first atom: 4457 Blocpdb> 49 atoms in block 111 Block first atom: 4498 Blocpdb> 37 atoms in block 112 Block first atom: 4547 Blocpdb> 43 atoms in block 113 Block first atom: 4584 Blocpdb> 45 atoms in block 114 Block first atom: 4627 Blocpdb> 41 atoms in block 115 Block first atom: 4672 Blocpdb> 38 atoms in block 116 Block first atom: 4713 Blocpdb> 43 atoms in block 117 Block first atom: 4751 Blocpdb> 51 atoms in block 118 Block first atom: 4794 Blocpdb> 36 atoms in block 119 Block first atom: 4845 Blocpdb> 37 atoms in block 120 Block first atom: 4881 Blocpdb> 44 atoms in block 121 Block first atom: 4918 Blocpdb> 40 atoms in block 122 Block first atom: 4962 Blocpdb> 44 atoms in block 123 Block first atom: 5002 Blocpdb> 42 atoms in block 124 Block first atom: 5046 Blocpdb> 41 atoms in block 125 Block first atom: 5088 Blocpdb> 39 atoms in block 126 Block first atom: 5129 Blocpdb> 37 atoms in block 127 Block first atom: 5168 Blocpdb> 33 atoms in block 128 Block first atom: 5205 Blocpdb> 39 atoms in block 129 Block first atom: 5238 Blocpdb> 38 atoms in block 130 Block first atom: 5277 Blocpdb> 42 atoms in block 131 Block first atom: 5315 Blocpdb> 39 atoms in block 132 Block first atom: 5357 Blocpdb> 40 atoms in block 133 Block first atom: 5396 Blocpdb> 44 atoms in block 134 Block first atom: 5436 Blocpdb> 43 atoms in block 135 Block first atom: 5480 Blocpdb> 42 atoms in block 136 Block first atom: 5523 Blocpdb> 44 atoms in block 137 Block first atom: 5565 Blocpdb> 48 atoms in block 138 Block first atom: 5609 Blocpdb> 50 atoms in block 139 Block first atom: 5657 Blocpdb> 35 atoms in block 140 Block first atom: 5707 Blocpdb> 42 atoms in block 141 Block first atom: 5742 Blocpdb> 38 atoms in block 142 Block first atom: 5784 Blocpdb> 45 atoms in block 143 Block first atom: 5822 Blocpdb> 43 atoms in block 144 Block first atom: 5867 Blocpdb> 48 atoms in block 145 Block first atom: 5910 Blocpdb> 37 atoms in block 146 Block first atom: 5958 Blocpdb> 39 atoms in block 147 Block first atom: 5995 Blocpdb> 46 atoms in block 148 Block first atom: 6034 Blocpdb> 45 atoms in block 149 Block first atom: 6080 Blocpdb> 44 atoms in block 150 Block first atom: 6125 Blocpdb> 42 atoms in block 151 Block first atom: 6169 Blocpdb> 35 atoms in block 152 Block first atom: 6211 Blocpdb> 49 atoms in block 153 Block first atom: 6246 Blocpdb> 47 atoms in block 154 Block first atom: 6295 Blocpdb> 44 atoms in block 155 Block first atom: 6342 Blocpdb> 36 atoms in block 156 Block first atom: 6386 Blocpdb> 38 atoms in block 157 Block first atom: 6422 Blocpdb> 40 atoms in block 158 Block first atom: 6460 Blocpdb> 46 atoms in block 159 Block first atom: 6500 Blocpdb> 37 atoms in block 160 Block first atom: 6546 Blocpdb> 40 atoms in block 161 Block first atom: 6583 Blocpdb> 41 atoms in block 162 Block first atom: 6623 Blocpdb> 40 atoms in block 163 Block first atom: 6664 Blocpdb> 40 atoms in block 164 Block first atom: 6704 Blocpdb> 45 atoms in block 165 Block first atom: 6744 Blocpdb> 39 atoms in block 166 Block first atom: 6789 Blocpdb> 42 atoms in block 167 Block first atom: 6828 Blocpdb> 48 atoms in block 168 Block first atom: 6870 Blocpdb> 39 atoms in block 169 Block first atom: 6918 Blocpdb> 10 atoms in block 170 Block first atom: 6956 Blocpdb> 170 blocks. Blocpdb> At most, 51 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 8 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 2623273 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 20898 Prepmat> Matrix trace = 5737260.0000 Prepmat> Last element read: 20898 20898 158.8896 Prepmat> 14536 lines saved. Prepmat> 13158 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 6966 RTB> Total mass = 6966.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 6966 RTB> Number of blocks = 170 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 189319.9802 RTB> 47022 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1020 Diagstd> Nb of non-zero elements: 47022 Diagstd> Projected matrix trace = 189319.9802 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1020 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 189319.9802 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0819406 0.0962077 0.2112244 0.4330728 0.9297109 1.0626933 1.1384578 1.3653093 1.6727151 2.6694755 2.7956405 3.6255978 3.7843305 4.7130929 4.7903851 5.0641836 5.3218364 5.7745356 7.3316422 7.5039833 8.2242532 8.7908537 8.8428207 9.9932011 10.5722526 10.8467197 11.8778067 12.1644797 12.6356116 13.6566944 14.1814113 14.4717630 14.6832207 14.8522989 16.6523451 16.8526391 17.3689197 17.5143037 18.2526921 19.0037507 20.2158901 20.3401969 20.5365478 21.1408425 21.5302205 21.9633366 22.3957963 23.2630244 23.7397329 23.9497804 24.2704140 24.7902421 25.0604937 25.4818570 25.9333643 27.1579521 27.7900955 28.2166526 28.3677316 28.8131463 29.1353118 29.3572705 29.8359495 30.1377376 30.5194989 30.8656118 31.1833193 31.8574317 31.8883253 32.2685810 32.4732192 34.1078288 34.2961197 35.9061029 36.6352311 37.3222625 37.6997333 38.3142698 38.5566339 38.7955871 39.1498048 39.2682899 39.7998879 40.1946480 40.3147853 41.2709855 41.2785826 41.6444626 41.8391577 42.4626072 42.8332948 43.2644388 43.4006871 43.6689688 44.2516014 44.7547223 45.1793203 45.4426201 45.5638268 46.5756589 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034322 0.0034322 0.0034323 0.0034326 0.0034336 0.0034338 31.0845696 33.6821867 49.9076765 71.4620972 104.7054363 111.9435951 115.8653947 126.8851540 140.4449970 177.4223184 181.5665933 206.7688419 211.2466385 235.7481429 237.6733530 244.3711881 250.5105606 260.9479023 294.0328889 297.4686552 311.4178611 321.9665895 322.9168364 343.2792817 353.0848197 357.6386841 374.2513763 378.7407628 386.0054302 401.2989990 408.9356815 413.1007675 416.1078830 418.4967805 443.1318654 445.7888895 452.5657497 454.4558704 463.9367160 473.3854907 488.2493952 489.7482091 492.1063856 499.2940902 503.8711808 508.9140479 513.8999022 523.7552249 529.0944364 531.4299766 534.9754741 540.6742227 543.6133220 548.1643875 552.9994640 565.9053366 572.4536115 576.8302484 578.3724328 582.8953924 586.1450688 588.3735185 593.1509253 596.1432125 599.9070695 603.2991665 606.3961720 612.9155798 613.2126934 616.8580183 618.8108962 634.1942754 635.9423885 650.6979157 657.2714198 663.4057962 666.7521412 672.1644773 674.2870764 676.3732827 679.4540333 680.4814248 685.0719801 688.4610818 689.4891810 697.6180356 697.6822411 700.7674342 702.4036291 707.6175707 710.6995185 714.2673818 715.3911819 717.5988739 722.3701247 726.4650301 729.9029634 732.0267676 733.0023661 741.0965374 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 6966 Rtb_to_modes> Number of blocs = 170 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9896E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9896E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9901E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9919E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9976E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9992E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.1941E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.6208E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2112 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4331 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9297 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.063 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.138 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.365 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.673 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.669 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.796 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.626 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.784 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.713 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.790 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.064 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.322 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.775 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.332 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.504 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.224 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.791 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.843 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.993 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.58 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1020 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00003 1.00002 0.99998 0.99997 1.00000 1.00000 0.99999 1.00002 1.00000 0.99995 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 0.99998 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 1.00002 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00002 0.99999 0.99998 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 1.00001 1.00003 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00002 0.99998 1.00001 1.00000 0.99998 1.00001 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 0.99998 1.00001 0.99998 0.99999 1.00002 1.00003 1.00000 1.00002 1.00002 1.00001 1.00001 1.00001 1.00001 0.99997 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 1.00002 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00002 0.99998 1.00004 0.99998 1.00002 1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 0.99999 0.99998 0.99998 1.00001 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 1.00002 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 125388 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00003 1.00002 0.99998 0.99997 1.00000 1.00000 0.99999 1.00002 1.00000 0.99995 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 0.99998 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 1.00002 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00002 0.99999 0.99998 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 1.00001 1.00003 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00002 0.99998 1.00001 1.00000 0.99998 1.00001 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 0.99998 1.00001 0.99998 0.99999 1.00002 1.00003 1.00000 1.00002 1.00002 1.00001 1.00001 1.00001 1.00001 0.99997 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 1.00002 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00002 0.99998 1.00004 0.99998 1.00002 1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 0.99999 0.99998 0.99998 1.00001 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 1.00002 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3:-0.000 0.000 Vector 4: 0.000 0.000 0.000 Vector 5: 0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 6: 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 7: 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 8: 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 9:-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 10:-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2605100314441296379.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2605100314441296379.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2605100314441296379.atom Openam> file on opening on unit 11: 2605100314441296379.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 842 First residue number = 0 Last residue number = 419 Number of atoms found = 6966 Mean number per residue = 8.3 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9896E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9896E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9901E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9919E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9976E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9992E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.1941E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.6208E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2112 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4331 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9297 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.063 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.138 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.365 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.673 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.669 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.796 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.626 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.784 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.713 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.790 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.064 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.322 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.775 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.332 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.504 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.224 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.791 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.843 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.993 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.58 Bfactors> 106 vectors, 20898 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.081941 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.536 for 844 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.087 +/- 0.06 Bfactors> = 39.869 +/- 13.27 Bfactors> Shiftng-fct= 39.782 Bfactors> Scaling-fct= 210.573 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2605100314441296379.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2605100314441296379.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4320E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4320E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4321E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4324E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4334E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 31.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 33.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 49.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 71.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 104.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 112.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 115.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 126.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 140.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 177.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 181.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 206.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 211.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 235.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 237.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 244.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 250.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 260.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 294.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 297.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 311.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 322.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 322.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 343.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 353.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 357.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 374.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 378.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 386.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 401.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 408.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 413.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 416.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 418.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 443.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 445.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 452.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 454.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 463.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 473.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 488.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 489.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 492.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 499.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 503.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 508.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 513.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 523.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 529.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 531.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 534.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 540.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 543.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 548.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 552.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 565.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 572.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 576.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 578.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 582.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 586.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 588.4 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vecteur en lecture: 634.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 636.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 650.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 657.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 663.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 666.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 672.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 674.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 676.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 679.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 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CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 714.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 715.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 717.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 722.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 726.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 729.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 732.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 732.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 741.1 Chkmod> 106 vectors, 20898 coordinates in file. Chkmod> That is: 6966 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 10 is: 0.9999 (instead of 1.0000). Chkmod> Normal end. 0.0034 0.7260 0.0034 0.6856 0.0034 0.7323 0.0034 0.7242 0.0034 0.9715 0.0034 0.9200 31.0833 0.5793 33.6808 0.7130 49.9026 0.7121 71.4613 0.4421 104.7003 0.6899 111.9549 0.6098 115.8371 0.8678 126.8653 0.5077 140.4509 0.6929 177.3989 0.7019 181.5705 0.5504 206.7714 0.4867 211.2283 0.4563 235.7357 0.6048 237.6536 0.5760 244.3563 0.7498 250.5037 0.5837 260.9472 0.5640 294.0274 0.7256 297.4562 0.5638 311.3997 0.5673 321.9554 0.7669 322.9062 0.3808 343.2611 0.5443 353.0320 0.7036 357.6774 0.4947 374.2699 0.6835 378.6548 0.5233 386.0559 0.5042 401.3303 0.6358 408.8978 0.6794 413.0579 0.6684 416.0444 0.6740 418.4464 0.6118 443.0816 0.5139 445.7348 0.6596 452.5604 0.6635 454.3805 0.4276 463.8826 0.3792 473.3185 0.4285 488.2781 0.5337 489.7248 0.3350 492.1266 0.4441 499.2627 0.3379 503.8470 0.3159 508.8535 0.3641 513.9261 0.4884 523.6987 0.4312 529.0747 0.3199 531.4096 0.4148 534.9479 0.4680 540.6484 0.4696 543.5846 0.3796 548.1209 0.3634 552.9399 0.2940 565.9024 0.3867 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DQ=-80 2605100314441296379.eigenfacs 2605100314441296379.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2605100314441296379.eigenfacs 2605100314441296379.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2605100314441296379.eigenfacs 2605100314441296379.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2605100314441296379.eigenfacs 2605100314441296379.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2605100314441296379.eigenfacs 2605100314441296379.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2605100314441296379.eigenfacs 2605100314441296379.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2605100314441296379.eigenfacs 2605100314441296379.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2605100314441296379.eigenfacs 2605100314441296379.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2605100314441296379.eigenfacs 2605100314441296379.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2605100314441296379.eigenfacs 2605100314441296379.atom making animated gifs 11 models are in 2605100314441296379.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2605100314441296379.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2605100314441296379.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 2605100314441296379 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 2605100314441296379.eigenfacs 2605100314441296379.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2605100314441296379.eigenfacs 2605100314441296379.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2605100314441296379.eigenfacs 2605100314441296379.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2605100314441296379.eigenfacs 2605100314441296379.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2605100314441296379.eigenfacs 2605100314441296379.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2605100314441296379.eigenfacs 2605100314441296379.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2605100314441296379.eigenfacs 2605100314441296379.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2605100314441296379.eigenfacs 2605100314441296379.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2605100314441296379.eigenfacs 2605100314441296379.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2605100314441296379.eigenfacs 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animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 2605100314441296379 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 2605100314441296379.eigenfacs 2605100314441296379.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2605100314441296379.eigenfacs 2605100314441296379.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2605100314441296379.eigenfacs 2605100314441296379.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2605100314441296379.eigenfacs 2605100314441296379.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2605100314441296379.eigenfacs 2605100314441296379.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2605100314441296379.eigenfacs 2605100314441296379.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2605100314441296379.eigenfacs 2605100314441296379.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2605100314441296379.eigenfacs 2605100314441296379.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2605100314441296379.eigenfacs 2605100314441296379.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2605100314441296379.eigenfacs 2605100314441296379.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2605100314441296379.eigenfacs 2605100314441296379.atom making animated gifs 11 models are in 2605100314441296379.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2605100314441296379.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2605100314441296379.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 2605100314441296379 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 2605100314441296379.eigenfacs 2605100314441296379.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2605100314441296379.eigenfacs 2605100314441296379.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2605100314441296379.eigenfacs 2605100314441296379.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2605100314441296379.eigenfacs 2605100314441296379.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2605100314441296379.eigenfacs 2605100314441296379.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2605100314441296379.eigenfacs 2605100314441296379.atom calculating perturbed structure for DQ=20 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100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2605100314441296379.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 2605100314441296379 11 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-100 2605100314441296379.eigenfacs 2605100314441296379.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2605100314441296379.eigenfacs 2605100314441296379.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2605100314441296379.eigenfacs 2605100314441296379.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2605100314441296379.eigenfacs 2605100314441296379.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2605100314441296379.eigenfacs 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MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2605100314441296379.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 2605100314441296379.10.pdb 2605100314441296379.11.pdb 2605100314441296379.7.pdb 2605100314441296379.8.pdb 2605100314441296379.9.pdb STDERR: Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL real 0m31.110s user 0m30.911s sys 0m0.189s rm: cannot remove '2605100314441296379.sdijf': No such file or directory pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: 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