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***  TRANSFERASE 05-JAN-24 8VIW  ***

LOGs for ID: 2605100325241299485

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2605100325241299485.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2605100325241299485.atom to be opened. Openam> File opened: 2605100325241299485.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 2180 First residue number = 101 Last residue number = 651 Number of atoms found = 17704 Mean number per residue = 8.1 Pdbmat> Coordinate statistics: = 164.302939 +/- 20.431587 From: 119.130000 To: 209.483000 = 164.290664 +/- 22.933728 From: 115.603000 To: 212.946000 = 164.277462 +/- 26.637364 From: 111.037000 To: 217.495000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is -0.9442 % Filled. Pdbmat> 6958628 non-zero elements. Pdbmat> 761496 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 86.03 +/- 22.01 Maximum number = 130 Minimum number = 14 Pdbmat> Matrix trace = 1.522992E+07 Pdbmat> Larger element = 488.917 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 2180 non-zero elements, NRBL set to 11 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2605100325241299485.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 11 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2605100325241299485.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2605100325241299485.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 17704 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 11 residue(s) per block. Blocpdb> 2180 residues. Blocpdb> 87 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 47 atoms in block 2 Block first atom: 88 Blocpdb> 78 atoms in block 3 Block first atom: 135 Blocpdb> 86 atoms in block 4 Block first atom: 213 Blocpdb> 91 atoms in block 5 Block first atom: 299 Blocpdb> 84 atoms in block 6 Block first atom: 390 Blocpdb> 86 atoms in block 7 Block first atom: 474 Blocpdb> 92 atoms in block 8 Block first atom: 560 Blocpdb> 85 atoms in block 9 Block first atom: 652 Blocpdb> 83 atoms in block 10 Block first atom: 737 Blocpdb> 92 atoms in block 11 Block first atom: 820 Blocpdb> 89 atoms in block 12 Block first atom: 912 Blocpdb> 84 atoms in block 13 Block first atom: 1001 Blocpdb> 88 atoms in block 14 Block first atom: 1085 Blocpdb> 94 atoms in block 15 Block first atom: 1173 Blocpdb> 92 atoms in block 16 Block first atom: 1267 Blocpdb> 84 atoms in block 17 Block first atom: 1359 Blocpdb> 96 atoms in block 18 Block first atom: 1443 Blocpdb> 96 atoms in block 19 Block first atom: 1539 Blocpdb> 98 atoms in block 20 Block first atom: 1635 Blocpdb> 94 atoms in block 21 Block first atom: 1733 Blocpdb> 86 atoms in block 22 Block first atom: 1827 Blocpdb> 95 atoms in block 23 Block first atom: 1913 Blocpdb> 91 atoms in block 24 Block first atom: 2008 Blocpdb> 98 atoms in block 25 Block first atom: 2099 Blocpdb> 84 atoms in block 26 Block first atom: 2197 Blocpdb> 86 atoms in block 27 Block first atom: 2281 Blocpdb> 92 atoms in block 28 Block first atom: 2367 Blocpdb> 89 atoms in block 29 Block first atom: 2459 Blocpdb> 89 atoms in block 30 Block first atom: 2548 Blocpdb> 82 atoms in block 31 Block first atom: 2637 Blocpdb> 86 atoms in block 32 Block first atom: 2719 Blocpdb> 93 atoms in block 33 Block first atom: 2805 Blocpdb> 95 atoms in block 34 Block first atom: 2898 Blocpdb> 86 atoms in block 35 Block first atom: 2993 Blocpdb> 94 atoms in block 36 Block first atom: 3079 Blocpdb> 83 atoms in block 37 Block first atom: 3173 Blocpdb> 98 atoms in block 38 Block first atom: 3256 Blocpdb> 95 atoms in block 39 Block first atom: 3354 Blocpdb> 85 atoms in block 40 Block first atom: 3449 Blocpdb> 78 atoms in block 41 Block first atom: 3534 Blocpdb> 91 atoms in block 42 Block first atom: 3612 Blocpdb> 84 atoms in block 43 Block first atom: 3703 Blocpdb> 87 atoms in block 44 Block first atom: 3787 Blocpdb> 91 atoms in block 45 Block first atom: 3874 Blocpdb> 103 atoms in block 46 Block first atom: 3965 Blocpdb> 91 atoms in block 47 Block first atom: 4068 Blocpdb> 90 atoms in block 48 Block first atom: 4159 Blocpdb> 91 atoms in block 49 Block first atom: 4249 Blocpdb> 87 atoms in block 50 Block first atom: 4340 Blocpdb> 87 atoms in block 51 Block first atom: 4427 Blocpdb> 47 atoms in block 52 Block first atom: 4514 Blocpdb> 78 atoms in block 53 Block first atom: 4561 Blocpdb> 86 atoms in block 54 Block first atom: 4639 Blocpdb> 91 atoms in block 55 Block first atom: 4725 Blocpdb> 84 atoms in block 56 Block first atom: 4816 Blocpdb> 86 atoms in block 57 Block first atom: 4900 Blocpdb> 92 atoms in block 58 Block first atom: 4986 Blocpdb> 85 atoms in block 59 Block first atom: 5078 Blocpdb> 83 atoms in block 60 Block first atom: 5163 Blocpdb> 92 atoms in block 61 Block first atom: 5246 Blocpdb> 89 atoms in block 62 Block first atom: 5338 Blocpdb> 84 atoms in block 63 Block first atom: 5427 Blocpdb> 88 atoms in block 64 Block first atom: 5511 Blocpdb> 94 atoms in block 65 Block first atom: 5599 Blocpdb> 92 atoms in block 66 Block first atom: 5693 Blocpdb> 84 atoms in block 67 Block first atom: 5785 Blocpdb> 96 atoms in block 68 Block first atom: 5869 Blocpdb> 96 atoms in block 69 Block first atom: 5965 Blocpdb> 98 atoms in block 70 Block first atom: 6061 Blocpdb> 94 atoms in block 71 Block first atom: 6159 Blocpdb> 86 atoms in block 72 Block first atom: 6253 Blocpdb> 95 atoms in block 73 Block first atom: 6339 Blocpdb> 91 atoms in block 74 Block first atom: 6434 Blocpdb> 98 atoms in block 75 Block first atom: 6525 Blocpdb> 84 atoms in block 76 Block first atom: 6623 Blocpdb> 86 atoms in block 77 Block first atom: 6707 Blocpdb> 92 atoms in block 78 Block first atom: 6793 Blocpdb> 89 atoms in block 79 Block first atom: 6885 Blocpdb> 89 atoms in block 80 Block first atom: 6974 Blocpdb> 82 atoms in block 81 Block first atom: 7063 Blocpdb> 86 atoms in block 82 Block first atom: 7145 Blocpdb> 93 atoms in block 83 Block first atom: 7231 Blocpdb> 95 atoms in block 84 Block first atom: 7324 Blocpdb> 86 atoms in block 85 Block first atom: 7419 Blocpdb> 94 atoms in block 86 Block first atom: 7505 Blocpdb> 83 atoms in block 87 Block first atom: 7599 Blocpdb> 98 atoms in block 88 Block first atom: 7682 Blocpdb> 95 atoms in block 89 Block first atom: 7780 Blocpdb> 85 atoms in block 90 Block first atom: 7875 Blocpdb> 78 atoms in block 91 Block first atom: 7960 Blocpdb> 91 atoms in block 92 Block first atom: 8038 Blocpdb> 84 atoms in block 93 Block first atom: 8129 Blocpdb> 87 atoms in block 94 Block first atom: 8213 Blocpdb> 91 atoms in block 95 Block first atom: 8300 Blocpdb> 103 atoms in block 96 Block first atom: 8391 Blocpdb> 91 atoms in block 97 Block first atom: 8494 Blocpdb> 90 atoms in block 98 Block first atom: 8585 Blocpdb> 91 atoms in block 99 Block first atom: 8675 Blocpdb> 87 atoms in block 100 Block first atom: 8766 Blocpdb> 87 atoms in block 101 Block first atom: 8853 Blocpdb> 47 atoms in block 102 Block first atom: 8940 Blocpdb> 78 atoms in block 103 Block first atom: 8987 Blocpdb> 86 atoms in block 104 Block first atom: 9065 Blocpdb> 91 atoms in block 105 Block first atom: 9151 Blocpdb> 84 atoms in block 106 Block first atom: 9242 Blocpdb> 86 atoms in block 107 Block first atom: 9326 Blocpdb> 92 atoms in block 108 Block first atom: 9412 Blocpdb> 85 atoms in block 109 Block first atom: 9504 Blocpdb> 83 atoms in block 110 Block first atom: 9589 Blocpdb> 92 atoms in block 111 Block first atom: 9672 Blocpdb> 89 atoms in block 112 Block first atom: 9764 Blocpdb> 84 atoms in block 113 Block first atom: 9853 Blocpdb> 88 atoms in block 114 Block first atom: 9937 Blocpdb> 94 atoms in block 115 Block first atom: 10025 Blocpdb> 92 atoms in block 116 Block first atom: 10119 Blocpdb> 84 atoms in block 117 Block first atom: 10211 Blocpdb> 96 atoms in block 118 Block first atom: 10295 Blocpdb> 96 atoms in block 119 Block first atom: 10391 Blocpdb> 98 atoms in block 120 Block first atom: 10487 Blocpdb> 94 atoms in block 121 Block first atom: 10585 Blocpdb> 86 atoms in block 122 Block first atom: 10679 Blocpdb> 95 atoms in block 123 Block first atom: 10765 Blocpdb> 91 atoms in block 124 Block first atom: 10860 Blocpdb> 98 atoms in block 125 Block first atom: 10951 Blocpdb> 84 atoms in block 126 Block first atom: 11049 Blocpdb> 86 atoms in block 127 Block first atom: 11133 Blocpdb> 92 atoms in block 128 Block first atom: 11219 Blocpdb> 89 atoms in block 129 Block first atom: 11311 Blocpdb> 89 atoms in block 130 Block first atom: 11400 Blocpdb> 82 atoms in block 131 Block first atom: 11489 Blocpdb> 86 atoms in block 132 Block first atom: 11571 Blocpdb> 93 atoms in block 133 Block first atom: 11657 Blocpdb> 95 atoms in block 134 Block first atom: 11750 Blocpdb> 86 atoms in block 135 Block first atom: 11845 Blocpdb> 94 atoms in block 136 Block first atom: 11931 Blocpdb> 83 atoms in block 137 Block first atom: 12025 Blocpdb> 98 atoms in block 138 Block first atom: 12108 Blocpdb> 95 atoms in block 139 Block first atom: 12206 Blocpdb> 85 atoms in block 140 Block first atom: 12301 Blocpdb> 78 atoms in block 141 Block first atom: 12386 Blocpdb> 91 atoms in block 142 Block first atom: 12464 Blocpdb> 84 atoms in block 143 Block first atom: 12555 Blocpdb> 87 atoms in block 144 Block first atom: 12639 Blocpdb> 91 atoms in block 145 Block first atom: 12726 Blocpdb> 103 atoms in block 146 Block first atom: 12817 Blocpdb> 91 atoms in block 147 Block first atom: 12920 Blocpdb> 90 atoms in block 148 Block first atom: 13011 Blocpdb> 91 atoms in block 149 Block first atom: 13101 Blocpdb> 87 atoms in block 150 Block first atom: 13192 Blocpdb> 87 atoms in block 151 Block first atom: 13279 Blocpdb> 47 atoms in block 152 Block first atom: 13366 Blocpdb> 78 atoms in block 153 Block first atom: 13413 Blocpdb> 86 atoms in block 154 Block first atom: 13491 Blocpdb> 91 atoms in block 155 Block first atom: 13577 Blocpdb> 84 atoms in block 156 Block first atom: 13668 Blocpdb> 86 atoms in block 157 Block first atom: 13752 Blocpdb> 92 atoms in block 158 Block first atom: 13838 Blocpdb> 85 atoms in block 159 Block first atom: 13930 Blocpdb> 83 atoms in block 160 Block first atom: 14015 Blocpdb> 92 atoms in block 161 Block first atom: 14098 Blocpdb> 89 atoms in block 162 Block first atom: 14190 Blocpdb> 84 atoms in block 163 Block first atom: 14279 Blocpdb> 88 atoms in block 164 Block first atom: 14363 Blocpdb> 94 atoms in block 165 Block first atom: 14451 Blocpdb> 92 atoms in block 166 Block first atom: 14545 Blocpdb> 84 atoms in block 167 Block first atom: 14637 Blocpdb> 96 atoms in block 168 Block first atom: 14721 Blocpdb> 96 atoms in block 169 Block first atom: 14817 Blocpdb> 98 atoms in block 170 Block first atom: 14913 Blocpdb> 94 atoms in block 171 Block first atom: 15011 Blocpdb> 86 atoms in block 172 Block first atom: 15105 Blocpdb> 95 atoms in block 173 Block first atom: 15191 Blocpdb> 91 atoms in block 174 Block first atom: 15286 Blocpdb> 98 atoms in block 175 Block first atom: 15377 Blocpdb> 84 atoms in block 176 Block first atom: 15475 Blocpdb> 86 atoms in block 177 Block first atom: 15559 Blocpdb> 92 atoms in block 178 Block first atom: 15645 Blocpdb> 89 atoms in block 179 Block first atom: 15737 Blocpdb> 89 atoms in block 180 Block first atom: 15826 Blocpdb> 82 atoms in block 181 Block first atom: 15915 Blocpdb> 86 atoms in block 182 Block first atom: 15997 Blocpdb> 93 atoms in block 183 Block first atom: 16083 Blocpdb> 95 atoms in block 184 Block first atom: 16176 Blocpdb> 86 atoms in block 185 Block first atom: 16271 Blocpdb> 94 atoms in block 186 Block first atom: 16357 Blocpdb> 83 atoms in block 187 Block first atom: 16451 Blocpdb> 98 atoms in block 188 Block first atom: 16534 Blocpdb> 95 atoms in block 189 Block first atom: 16632 Blocpdb> 85 atoms in block 190 Block first atom: 16727 Blocpdb> 78 atoms in block 191 Block first atom: 16812 Blocpdb> 91 atoms in block 192 Block first atom: 16890 Blocpdb> 84 atoms in block 193 Block first atom: 16981 Blocpdb> 87 atoms in block 194 Block first atom: 17065 Blocpdb> 91 atoms in block 195 Block first atom: 17152 Blocpdb> 103 atoms in block 196 Block first atom: 17243 Blocpdb> 91 atoms in block 197 Block first atom: 17346 Blocpdb> 90 atoms in block 198 Block first atom: 17437 Blocpdb> 91 atoms in block 199 Block first atom: 17527 Blocpdb> 87 atoms in block 200 Block first atom: 17617 Blocpdb> 200 blocks. Blocpdb> At most, 103 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 47 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 6958828 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 53112 Prepmat> Matrix trace = 15229920.0001 Prepmat> Last element read: 53112 53112 264.8332 Prepmat> 20101 lines saved. Prepmat> 18520 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 17704 RTB> Total mass = 17704.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 17704 RTB> Number of blocks = 200 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 204217.5668 RTB> 53880 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1200 Diagstd> Nb of non-zero elements: 53880 Diagstd> Projected matrix trace = 204217.5668 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1200 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 204217.5668 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.5535910 0.6843863 0.9485581 1.0697863 1.1073823 1.2549326 1.2650676 1.8061113 1.9426921 2.2168099 2.5164188 2.7479735 2.9832897 3.4035409 3.7211639 3.8596211 4.1208994 4.2642955 4.3855354 4.8849762 5.1902582 5.2844861 6.1794318 6.3454374 6.5544584 6.6090624 6.9508334 7.7745445 7.7975125 8.0493169 8.5405855 9.2425540 9.3832750 10.1860055 12.4184381 12.9800950 13.1195114 13.5668102 13.9493803 14.5610858 14.9357277 15.6227226 16.5964140 17.4182272 17.6994998 17.9274026 18.7147434 18.9757973 19.4549381 19.4655705 19.7610516 19.8388328 19.9343890 20.1284293 21.3038870 21.5917248 22.0448348 22.1067844 22.8687369 23.2656557 23.7321890 24.3719329 25.7590906 25.8039994 26.1661263 26.3709084 27.2258278 27.2286573 27.6479108 27.7235354 28.4885152 28.7834412 28.9178440 29.1671819 29.7561484 29.8237603 29.9268313 30.0388811 30.2034750 30.5036720 31.7248954 31.8709371 32.5261115 33.0968594 33.1853850 33.2326465 33.2378529 33.4281923 33.4737978 33.9641340 34.4895291 34.7131206 35.0226649 35.1157941 35.5813616 35.6081670 35.6662748 35.7901031 35.9364304 36.1747811 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034311 0.0034335 0.0034335 0.0034336 0.0034340 0.0034345 80.7959891 89.8350731 105.7614156 112.3165592 114.2731162 121.6481421 122.1383789 145.9377130 151.3551713 161.6811944 172.2609129 180.0120376 187.5611976 200.3368149 209.4761971 213.3377042 220.4404475 224.2430159 227.4084463 240.0084354 247.3943421 249.6299337 269.9414356 273.5432878 278.0120918 279.1677252 286.2949714 302.7838859 303.2308063 308.0880068 317.3504386 330.1347787 332.6384907 346.5750011 382.6738342 391.2318619 393.3273178 399.9762042 405.5764577 414.3736791 419.6705304 429.2137643 442.3870551 453.2076744 456.8522597 459.7841185 469.7720988 473.0372014 478.9720894 479.1029535 482.7255723 483.6746648 484.8381045 487.1920849 501.2157447 504.5903587 509.8573737 510.5732630 519.2976647 523.7848456 529.0103631 536.0931612 551.1382385 551.6184605 555.4756129 557.6450165 566.6120768 566.6415196 570.9872891 571.7676590 579.6024172 582.5948448 583.9534597 586.4655624 592.3571546 593.0297491 594.0536213 595.1646885 596.7930220 599.7514985 611.6392958 613.0454826 619.3146501 624.7246939 625.5596247 626.0049172 626.0539515 627.8439677 628.2721003 632.8569491 637.7330324 639.7968664 642.6431379 643.4970007 647.7487176 647.9926641 648.5211681 649.6459793 650.9726586 653.1279003 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 17704 Rtb_to_modes> Number of blocs = 200 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9831E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9971E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9972E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9978E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5536 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6844 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9486 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.070 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.107 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.255 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.265 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.806 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.943 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.217 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.516 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.748 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.983 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.404 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.721 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.860 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.121 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.264 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.386 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.885 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.190 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.284 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.179 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.345 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.554 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.609 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.951 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.775 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.798 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.049 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.541 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.243 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.383 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.17 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1200 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 0.99997 1.00000 1.00000 1.00001 1.00003 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 0.99997 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99997 1.00001 1.00000 0.99998 0.99998 1.00002 1.00002 1.00002 1.00001 0.99999 1.00001 1.00002 1.00000 1.00000 1.00002 0.99998 1.00000 1.00002 1.00001 1.00000 0.99997 1.00000 1.00003 1.00001 1.00003 1.00002 1.00001 1.00001 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 0.99998 1.00002 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 1.00001 0.99998 1.00000 0.99998 1.00002 0.99999 0.99999 1.00001 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 318672 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 0.99997 1.00000 1.00000 1.00001 1.00003 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 0.99997 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99997 1.00001 1.00000 0.99998 0.99998 1.00002 1.00002 1.00002 1.00001 0.99999 1.00001 1.00002 1.00000 1.00000 1.00002 0.99998 1.00000 1.00002 1.00001 1.00000 0.99997 1.00000 1.00003 1.00001 1.00003 1.00002 1.00001 1.00001 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 0.99998 1.00002 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 1.00001 0.99998 1.00000 0.99998 1.00002 0.99999 0.99999 1.00001 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3:-0.000 0.000 Vector 4:-0.000 0.000-0.000 Vector 5:-0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 6:-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 7: 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 8: 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 9:-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 10:-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2605100325241299485.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2605100325241299485.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2605100325241299485.atom Openam> file on opening on unit 11: 2605100325241299485.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 2180 First residue number = 101 Last residue number = 651 Number of atoms found = 17704 Mean number per residue = 8.1 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9831E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9971E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9972E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9978E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5536 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6844 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9486 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.070 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.107 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.255 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.265 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.806 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.943 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.217 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.516 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.748 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.983 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.404 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.721 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.860 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.121 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.264 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.386 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.885 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.190 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.284 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.179 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.345 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.554 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.609 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.951 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.775 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.798 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.049 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.541 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.243 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.383 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.17 Bfactors> 106 vectors, 53112 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.553600 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.868 for 2180 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.015 +/- 0.01 Bfactors> = 83.456 +/- 7.18 Bfactors> Shiftng-fct= 83.442 Bfactors> Scaling-fct= 866.503 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2605100325241299485.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2605100325241299485.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4309E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4333E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4333E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4334E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 80.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 89.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 105.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 112.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 114.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 121.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 122.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 145.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 151.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 161.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 172.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 180.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 187.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 200.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 209.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 213.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 220.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 224.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 227.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 240.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 247.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 249.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 269.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 273.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 278.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 279.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 286.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 302.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 303.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 308.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 317.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 330.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 332.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 346.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 382.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 391.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 393.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 400.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 405.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 414.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 419.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 429.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 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CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 484.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 487.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 501.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 504.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 509.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 510.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 519.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 523.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 529.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 536.0 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vecteur en lecture: 582.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 584.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 586.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 592.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 593.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 594.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 595.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 596.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 599.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 611.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 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CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 639.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 642.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 643.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 647.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 648.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 648.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 649.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 651.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 653.1 Chkmod> 106 vectors, 53112 coordinates in file. Chkmod> That is: 17704 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. Chkmod> Normal end. 0.0034 0.8151 0.0034 0.8479 0.0034 0.9291 0.0034 0.9941 0.0034 0.8485 0.0034 0.8550 80.7932 0.7813 89.8321 0.6815 105.7592 0.6455 112.3230 0.7476 114.2485 0.6094 121.6462 0.8998 122.1299 0.4588 145.9270 0.8621 151.3607 0.7899 161.6812 0.6412 172.2392 0.5932 180.0052 0.7759 187.5440 0.6476 200.3417 0.7199 209.4626 0.8279 213.3390 0.6905 220.4337 0.6900 224.2256 0.6660 227.4107 0.6315 239.9987 0.7823 247.3776 0.7950 249.6077 0.6322 269.9204 0.6102 273.5221 0.7244 277.9904 0.5697 279.1544 0.5344 286.2861 0.7001 302.7798 0.7495 303.2273 0.7821 308.0687 0.6829 317.3445 0.6508 330.1286 0.5845 332.6193 0.6733 346.6281 0.7647 382.6815 0.7536 391.2136 0.6649 393.3178 0.7295 400.0061 0.5946 405.5681 0.7046 414.3404 0.5411 419.7125 0.7292 429.1579 0.4558 442.4159 0.3303 453.2113 0.4417 456.8391 0.5354 459.7977 0.3137 469.6924 0.3502 473.0693 0.3175 478.8907 0.3877 479.1369 0.3528 482.6920 0.3734 483.6681 0.3896 484.7639 0.3468 487.1902 0.3895 501.1485 0.3400 504.5485 0.3178 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DQ=-80 2605100325241299485.eigenfacs 2605100325241299485.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2605100325241299485.eigenfacs 2605100325241299485.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2605100325241299485.eigenfacs 2605100325241299485.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2605100325241299485.eigenfacs 2605100325241299485.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2605100325241299485.eigenfacs 2605100325241299485.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2605100325241299485.eigenfacs 2605100325241299485.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2605100325241299485.eigenfacs 2605100325241299485.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2605100325241299485.eigenfacs 2605100325241299485.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2605100325241299485.eigenfacs 2605100325241299485.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2605100325241299485.eigenfacs 2605100325241299485.atom making animated gifs 11 models are in 2605100325241299485.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2605100325241299485.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2605100325241299485.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 2605100325241299485 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 2605100325241299485.eigenfacs 2605100325241299485.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2605100325241299485.eigenfacs 2605100325241299485.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2605100325241299485.eigenfacs 2605100325241299485.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2605100325241299485.eigenfacs 2605100325241299485.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2605100325241299485.eigenfacs 2605100325241299485.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2605100325241299485.eigenfacs 2605100325241299485.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2605100325241299485.eigenfacs 2605100325241299485.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2605100325241299485.eigenfacs 2605100325241299485.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2605100325241299485.eigenfacs 2605100325241299485.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2605100325241299485.eigenfacs 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animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 2605100325241299485 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 2605100325241299485.eigenfacs 2605100325241299485.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2605100325241299485.eigenfacs 2605100325241299485.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2605100325241299485.eigenfacs 2605100325241299485.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2605100325241299485.eigenfacs 2605100325241299485.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2605100325241299485.eigenfacs 2605100325241299485.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2605100325241299485.eigenfacs 2605100325241299485.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2605100325241299485.eigenfacs 2605100325241299485.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2605100325241299485.eigenfacs 2605100325241299485.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2605100325241299485.eigenfacs 2605100325241299485.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2605100325241299485.eigenfacs 2605100325241299485.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2605100325241299485.eigenfacs 2605100325241299485.atom making animated gifs 11 models are in 2605100325241299485.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2605100325241299485.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2605100325241299485.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 2605100325241299485 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 2605100325241299485.eigenfacs 2605100325241299485.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2605100325241299485.eigenfacs 2605100325241299485.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2605100325241299485.eigenfacs 2605100325241299485.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2605100325241299485.eigenfacs 2605100325241299485.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2605100325241299485.eigenfacs 2605100325241299485.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2605100325241299485.eigenfacs 2605100325241299485.atom calculating perturbed structure for DQ=20 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MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2605100325241299485.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 2605100325241299485.10.pdb 2605100325241299485.11.pdb 2605100325241299485.7.pdb 2605100325241299485.8.pdb 2605100325241299485.9.pdb STDERR: Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL real 2m25.296s user 2m24.693s sys 0m0.551s rm: cannot remove '2605100325241299485.sdijf': No such file or directory pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: 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