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***  CELL ADHESION PROTEIN 30-SEP-95 1FNF  ***

LOGs for ID: 2605110701511632463

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2605110701511632463.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2605110701511632463.atom to be opened. Openam> File opened: 2605110701511632463.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 368 First residue number = 1142 Last residue number = 1509 Number of atoms found = 3443 Mean number per residue = 9.4 Pdbmat> Coordinate statistics: = 16.955800 +/- 7.391090 From: -4.009000 To: 38.219000 = 1.832203 +/- 19.315695 From: -36.522000 To: 41.917000 = 2.068432 +/- 38.082276 From: -67.451000 To: 75.087000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 2.6989 % Filled. Pdbmat> 1439864 non-zero elements. Pdbmat> 157719 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 91.62 +/- 27.33 Maximum number = 154 Minimum number = 12 Pdbmat> Matrix trace = 3.154380E+06 Pdbmat> Larger element = 589.067 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 368 non-zero elements, NRBL set to 2 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2605110701511632463.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 2 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2605110701511632463.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2605110701511632463.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 3443 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 2 residue(s) per block. Blocpdb> 368 residues. Blocpdb> 18 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 15 atoms in block 2 Block first atom: 19 Blocpdb> 16 atoms in block 3 Block first atom: 34 Blocpdb> 20 atoms in block 4 Block first atom: 50 Blocpdb> 22 atoms in block 5 Block first atom: 70 Blocpdb> 16 atoms in block 6 Block first atom: 92 Blocpdb> 18 atoms in block 7 Block first atom: 108 Blocpdb> 18 atoms in block 8 Block first atom: 126 Blocpdb> 13 atoms in block 9 Block first atom: 144 Blocpdb> 18 atoms in block 10 Block first atom: 157 Blocpdb> 16 atoms in block 11 Block first atom: 175 Blocpdb> 26 atoms in block 12 Block first atom: 191 Blocpdb> 25 atoms in block 13 Block first atom: 217 Blocpdb> 18 atoms in block 14 Block first atom: 242 Blocpdb> 16 atoms in block 15 Block first atom: 260 Blocpdb> 18 atoms in block 16 Block first atom: 276 Blocpdb> 19 atoms in block 17 Block first atom: 294 Blocpdb> 26 atoms in block 18 Block first atom: 313 Blocpdb> 18 atoms in block 19 Block first atom: 339 Blocpdb> 16 atoms in block 20 Block first atom: 357 Blocpdb> 20 atoms in block 21 Block first atom: 373 Blocpdb> 17 atoms in block 22 Block first atom: 393 Blocpdb> 17 atoms in block 23 Block first atom: 410 Blocpdb> 19 atoms in block 24 Block first atom: 427 Blocpdb> 19 atoms in block 25 Block first atom: 446 Blocpdb> 18 atoms in block 26 Block first atom: 465 Blocpdb> 21 atoms in block 27 Block first atom: 483 Blocpdb> 15 atoms in block 28 Block first atom: 504 Blocpdb> 20 atoms in block 29 Block first atom: 519 Blocpdb> 15 atoms in block 30 Block first atom: 539 Blocpdb> 21 atoms in block 31 Block first atom: 554 Blocpdb> 20 atoms in block 32 Block first atom: 575 Blocpdb> 17 atoms in block 33 Block first atom: 595 Blocpdb> 12 atoms in block 34 Block first atom: 612 Blocpdb> 19 atoms in block 35 Block first atom: 624 Blocpdb> 25 atoms in block 36 Block first atom: 643 Blocpdb> 16 atoms in block 37 Block first atom: 668 Blocpdb> 22 atoms in block 38 Block first atom: 684 Blocpdb> 17 atoms in block 39 Block first atom: 706 Blocpdb> 22 atoms in block 40 Block first atom: 723 Blocpdb> 22 atoms in block 41 Block first atom: 745 Blocpdb> 18 atoms in block 42 Block first atom: 767 Blocpdb> 15 atoms in block 43 Block first atom: 785 Blocpdb> 17 atoms in block 44 Block first atom: 800 Blocpdb> 18 atoms in block 45 Block first atom: 817 Blocpdb> 18 atoms in block 46 Block first atom: 835 Blocpdb> 13 atoms in block 47 Block first atom: 853 Blocpdb> 15 atoms in block 48 Block first atom: 866 Blocpdb> 14 atoms in block 49 Block first atom: 881 Blocpdb> 18 atoms in block 50 Block first atom: 895 Blocpdb> 26 atoms in block 51 Block first atom: 913 Blocpdb> 21 atoms in block 52 Block first atom: 939 Blocpdb> 20 atoms in block 53 Block first atom: 960 Blocpdb> 12 atoms in block 54 Block first atom: 980 Blocpdb> 18 atoms in block 55 Block first atom: 992 Blocpdb> 26 atoms in block 56 Block first atom: 1010 Blocpdb> 17 atoms in block 57 Block first atom: 1036 Blocpdb> 22 atoms in block 58 Block first atom: 1053 Blocpdb> 14 atoms in block 59 Block first atom: 1075 Blocpdb> 15 atoms in block 60 Block first atom: 1089 Blocpdb> 18 atoms in block 61 Block first atom: 1104 Blocpdb> 18 atoms in block 62 Block first atom: 1122 Blocpdb> 23 atoms in block 63 Block first atom: 1140 Blocpdb> 17 atoms in block 64 Block first atom: 1163 Blocpdb> 31 atoms in block 65 Block first atom: 1180 Blocpdb> 15 atoms in block 66 Block first atom: 1211 Blocpdb> 21 atoms in block 67 Block first atom: 1226 Blocpdb> 21 atoms in block 68 Block first atom: 1247 Blocpdb> 19 atoms in block 69 Block first atom: 1268 Blocpdb> 14 atoms in block 70 Block first atom: 1287 Blocpdb> 19 atoms in block 71 Block first atom: 1301 Blocpdb> 17 atoms in block 72 Block first atom: 1320 Blocpdb> 15 atoms in block 73 Block first atom: 1337 Blocpdb> 17 atoms in block 74 Block first atom: 1352 Blocpdb> 17 atoms in block 75 Block first atom: 1369 Blocpdb> 16 atoms in block 76 Block first atom: 1386 Blocpdb> 18 atoms in block 77 Block first atom: 1402 Blocpdb> 20 atoms in block 78 Block first atom: 1420 Blocpdb> 16 atoms in block 79 Block first atom: 1440 Blocpdb> 14 atoms in block 80 Block first atom: 1456 Blocpdb> 24 atoms in block 81 Block first atom: 1470 Blocpdb> 16 atoms in block 82 Block first atom: 1494 Blocpdb> 16 atoms in block 83 Block first atom: 1510 Blocpdb> 16 atoms in block 84 Block first atom: 1526 Blocpdb> 22 atoms in block 85 Block first atom: 1542 Blocpdb> 22 atoms in block 86 Block first atom: 1564 Blocpdb> 23 atoms in block 87 Block first atom: 1586 Blocpdb> 17 atoms in block 88 Block first atom: 1609 Blocpdb> 16 atoms in block 89 Block first atom: 1626 Blocpdb> 22 atoms in block 90 Block first atom: 1642 Blocpdb> 29 atoms in block 91 Block first atom: 1664 Blocpdb> 22 atoms in block 92 Block first atom: 1693 Blocpdb> 14 atoms in block 93 Block first atom: 1715 Blocpdb> 17 atoms in block 94 Block first atom: 1729 Blocpdb> 16 atoms in block 95 Block first atom: 1746 Blocpdb> 14 atoms in block 96 Block first atom: 1762 Blocpdb> 21 atoms in block 97 Block first atom: 1776 Blocpdb> 17 atoms in block 98 Block first atom: 1797 Blocpdb> 18 atoms in block 99 Block first atom: 1814 Blocpdb> 17 atoms in block 100 Block first atom: 1832 Blocpdb> 20 atoms in block 101 Block first atom: 1849 Blocpdb> 17 atoms in block 102 Block first atom: 1869 Blocpdb> 29 atoms in block 103 Block first atom: 1886 Blocpdb> 15 atoms in block 104 Block first atom: 1915 Blocpdb> 24 atoms in block 105 Block first atom: 1930 Blocpdb> 15 atoms in block 106 Block first atom: 1954 Blocpdb> 18 atoms in block 107 Block first atom: 1969 Blocpdb> 19 atoms in block 108 Block first atom: 1987 Blocpdb> 26 atoms in block 109 Block first atom: 2006 Blocpdb> 30 atoms in block 110 Block first atom: 2032 Blocpdb> 20 atoms in block 111 Block first atom: 2062 Blocpdb> 23 atoms in block 112 Block first atom: 2082 Blocpdb> 20 atoms in block 113 Block first atom: 2105 Blocpdb> 22 atoms in block 114 Block first atom: 2125 Blocpdb> 24 atoms in block 115 Block first atom: 2147 Blocpdb> 19 atoms in block 116 Block first atom: 2171 Blocpdb> 25 atoms in block 117 Block first atom: 2190 Blocpdb> 20 atoms in block 118 Block first atom: 2215 Blocpdb> 25 atoms in block 119 Block first atom: 2235 Blocpdb> 19 atoms in block 120 Block first atom: 2260 Blocpdb> 18 atoms in block 121 Block first atom: 2279 Blocpdb> 18 atoms in block 122 Block first atom: 2297 Blocpdb> 20 atoms in block 123 Block first atom: 2315 Blocpdb> 16 atoms in block 124 Block first atom: 2335 Blocpdb> 14 atoms in block 125 Block first atom: 2351 Blocpdb> 24 atoms in block 126 Block first atom: 2365 Blocpdb> 16 atoms in block 127 Block first atom: 2389 Blocpdb> 17 atoms in block 128 Block first atom: 2405 Blocpdb> 14 atoms in block 129 Block first atom: 2422 Blocpdb> 20 atoms in block 130 Block first atom: 2436 Blocpdb> 22 atoms in block 131 Block first atom: 2456 Blocpdb> 20 atoms in block 132 Block first atom: 2478 Blocpdb> 15 atoms in block 133 Block first atom: 2498 Blocpdb> 18 atoms in block 134 Block first atom: 2513 Blocpdb> 14 atoms in block 135 Block first atom: 2531 Blocpdb> 24 atoms in block 136 Block first atom: 2545 Blocpdb> 17 atoms in block 137 Block first atom: 2569 Blocpdb> 16 atoms in block 138 Block first atom: 2586 Blocpdb> 17 atoms in block 139 Block first atom: 2602 Blocpdb> 24 atoms in block 140 Block first atom: 2619 Blocpdb> 18 atoms in block 141 Block first atom: 2643 Blocpdb> 18 atoms in block 142 Block first atom: 2661 Blocpdb> 14 atoms in block 143 Block first atom: 2679 Blocpdb> 15 atoms in block 144 Block first atom: 2693 Blocpdb> 16 atoms in block 145 Block first atom: 2708 Blocpdb> 17 atoms in block 146 Block first atom: 2724 Blocpdb> 18 atoms in block 147 Block first atom: 2741 Blocpdb> 24 atoms in block 148 Block first atom: 2759 Blocpdb> 15 atoms in block 149 Block first atom: 2783 Blocpdb> 13 atoms in block 150 Block first atom: 2798 Blocpdb> 17 atoms in block 151 Block first atom: 2811 Blocpdb> 25 atoms in block 152 Block first atom: 2828 Blocpdb> 28 atoms in block 153 Block first atom: 2853 Blocpdb> 26 atoms in block 154 Block first atom: 2881 Blocpdb> 23 atoms in block 155 Block first atom: 2907 Blocpdb> 15 atoms in block 156 Block first atom: 2930 Blocpdb> 14 atoms in block 157 Block first atom: 2945 Blocpdb> 16 atoms in block 158 Block first atom: 2959 Blocpdb> 15 atoms in block 159 Block first atom: 2975 Blocpdb> 20 atoms in block 160 Block first atom: 2990 Blocpdb> 22 atoms in block 161 Block first atom: 3010 Blocpdb> 17 atoms in block 162 Block first atom: 3032 Blocpdb> 12 atoms in block 163 Block first atom: 3049 Blocpdb> 21 atoms in block 164 Block first atom: 3061 Blocpdb> 17 atoms in block 165 Block first atom: 3082 Blocpdb> 15 atoms in block 166 Block first atom: 3099 Blocpdb> 17 atoms in block 167 Block first atom: 3114 Blocpdb> 14 atoms in block 168 Block first atom: 3131 Blocpdb> 20 atoms in block 169 Block first atom: 3145 Blocpdb> 13 atoms in block 170 Block first atom: 3165 Blocpdb> 23 atoms in block 171 Block first atom: 3178 Blocpdb> 18 atoms in block 172 Block first atom: 3201 Blocpdb> 17 atoms in block 173 Block first atom: 3219 Blocpdb> 20 atoms in block 174 Block first atom: 3236 Blocpdb> 17 atoms in block 175 Block first atom: 3256 Blocpdb> 22 atoms in block 176 Block first atom: 3273 Blocpdb> 14 atoms in block 177 Block first atom: 3295 Blocpdb> 15 atoms in block 178 Block first atom: 3309 Blocpdb> 14 atoms in block 179 Block first atom: 3324 Blocpdb> 21 atoms in block 180 Block first atom: 3338 Blocpdb> 16 atoms in block 181 Block first atom: 3359 Blocpdb> 17 atoms in block 182 Block first atom: 3375 Blocpdb> 25 atoms in block 183 Block first atom: 3392 Blocpdb> 27 atoms in block 184 Block first atom: 3416 Blocpdb> 184 blocks. Blocpdb> At most, 31 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 12 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 1440048 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 10329 Prepmat> Matrix trace = 3154380.0000 Prepmat> Last element read: 10329 10329 303.2061 Prepmat> 17021 lines saved. Prepmat> 15222 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 3443 RTB> Total mass = 3443.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 3443 RTB> Number of blocks = 184 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 280882.7228 RTB> 61968 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1104 Diagstd> Nb of non-zero elements: 61968 Diagstd> Projected matrix trace = 280882.7228 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1104 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 280882.7228 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0396641 0.0478615 0.1281711 0.2407325 0.2961223 0.4590901 0.6590019 1.0466838 1.2555500 1.6576509 2.7696007 2.8402596 4.1648386 4.6356875 5.0205210 5.0805972 5.7492510 7.0111275 7.2281709 7.8315185 8.5051820 9.2595766 9.9329442 10.2840116 11.1226184 11.6188333 12.8448053 13.8342199 14.5559778 15.1097029 15.5102344 16.0900891 17.0549202 17.7261873 18.1537778 18.3932897 19.6606458 21.0601209 21.3004849 22.1377223 22.7498968 23.7186615 24.2936063 25.2628421 27.0579352 27.8616095 28.2105600 29.4713722 29.7348005 31.1511270 32.2581686 32.6712348 33.5936292 33.9287715 34.1173984 35.0493964 36.5417861 38.0760730 38.1792283 39.9181198 40.1838907 40.5996879 41.4973525 42.3117233 42.4535391 42.7751425 43.7221162 44.2999178 44.8843166 45.7781995 46.3703470 46.8621580 47.6508626 48.9723669 49.4483224 50.4630925 50.6408578 51.5054780 52.1388034 52.6051014 52.8880442 53.6458174 54.0528068 54.8871152 55.2242869 55.5541454 56.0060035 56.7830057 58.5403088 58.8007821 59.3632935 59.7014312 60.1767598 60.8939828 61.4887101 62.1091184 63.4929625 64.1301777 64.8487292 65.5451523 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034322 0.0034325 0.0034329 0.0034332 0.0034348 0.0034366 21.6268892 23.7568216 38.8767823 53.2798113 59.0922912 73.5773704 88.1533073 111.0971775 121.6780625 139.8111518 180.7190199 183.0097805 221.6125580 233.8042260 243.3154425 244.7668856 260.3759779 287.5340053 291.9506769 303.8913019 316.6919955 330.4386549 342.2427667 348.2383203 362.1585974 370.1489665 389.1876432 403.8988502 414.3009913 422.1076696 427.6657402 435.5865933 448.4562963 457.1965522 462.6779343 465.7201037 481.4976483 498.3399569 501.1757228 510.9304048 517.9466106 528.8595712 535.2310189 545.8035854 564.8623216 573.1897044 576.7679694 589.5158134 592.1446300 606.0830832 616.7584861 620.6947256 629.3956582 632.5274065 634.2832365 642.8883445 656.4326371 670.0718223 670.9788847 686.0887826 688.3689495 691.9211848 699.5286002 706.3592511 707.5420097 710.2169171 718.0354184 722.7643786 727.5160665 734.7246893 739.4613054 743.3723826 749.6018739 759.9251667 763.6090404 771.4045767 772.7620874 779.3310706 784.1078654 787.6063544 789.7216309 795.3590260 798.3703605 804.5082148 806.9754793 809.3819516 812.6669008 818.2847719 830.8503071 832.6966768 836.6701483 839.0496325 842.3831670 847.3883140 851.5163117 855.8013407 865.2828098 869.6139584 874.4722155 879.1552398 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 3443 Rtb_to_modes> Number of blocs = 184 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9899E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9912E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9937E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9957E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0005E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0015E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.9664E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.7861E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1282 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2407 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2961 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4591 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6590 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.047 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.256 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.658 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.770 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.840 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.165 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.636 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.021 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.081 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.749 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.011 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.228 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.832 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.505 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.260 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.933 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.55 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1104 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 0.99999 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00002 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 0.99998 0.99999 1.00000 1.00000 0.99996 0.99999 0.99999 0.99998 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 0.99998 1.00002 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000 0.99997 0.99996 1.00002 0.99998 0.99996 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 0.99999 0.99999 1.00001 1.00000 1.00001 0.99997 0.99999 0.99999 0.99999 0.99997 1.00003 1.00000 1.00001 1.00001 0.99997 0.99999 1.00000 0.99996 1.00000 0.99999 0.99998 0.99998 0.99999 1.00002 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00002 0.99999 0.99997 1.00002 0.99998 0.99996 1.00002 0.99998 1.00000 1.00000 1.00001 0.99997 0.99998 0.99999 1.00000 0.99998 1.00000 0.99999 0.99999 1.00002 0.99999 1.00000 0.99997 1.00000 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 61974 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 0.99999 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00002 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 0.99998 0.99999 1.00000 1.00000 0.99996 0.99999 0.99999 0.99998 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 0.99998 1.00002 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000 0.99997 0.99996 1.00002 0.99998 0.99996 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 0.99999 0.99999 1.00001 1.00000 1.00001 0.99997 0.99999 0.99999 0.99999 0.99997 1.00003 1.00000 1.00001 1.00001 0.99997 0.99999 1.00000 0.99996 1.00000 0.99999 0.99998 0.99998 0.99999 1.00002 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00002 0.99999 0.99997 1.00002 0.99998 0.99996 1.00002 0.99998 1.00000 1.00000 1.00001 0.99997 0.99998 0.99999 1.00000 0.99998 1.00000 0.99999 0.99999 1.00002 0.99999 1.00000 0.99997 1.00000 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3: 0.000-0.000 Vector 4: 0.000 0.000 0.000 Vector 5: 0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 6:-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 7:-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 8:-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 9:-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 10:-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2605110701511632463.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2605110701511632463.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2605110701511632463.atom Openam> file on opening on unit 11: 2605110701511632463.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 368 First residue number = 1142 Last residue number = 1509 Number of atoms found = 3443 Mean number per residue = 9.4 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9899E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9912E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9937E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9957E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0005E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0015E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.9664E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.7861E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1282 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2407 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2961 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4591 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6590 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.047 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.256 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.658 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.770 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.840 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.165 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.636 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.021 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.081 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.749 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.011 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.228 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.832 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.505 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.260 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.933 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.55 Bfactors> 106 vectors, 10329 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.039664 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.076 for 368 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.314 +/- 0.20 Bfactors> = 35.830 +/- 18.93 Bfactors> Shiftng-fct= 35.517 Bfactors> Scaling-fct= 92.782 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2605110701511632463.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2605110701511632463.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4321E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4323E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4327E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4331E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4347E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4364E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 21.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 23.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 38.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 53.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 59.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 73.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 88.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 111.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 121.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 139.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 180.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 183.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 221.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 233.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 243.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 244.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 260.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 287.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 291.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 303.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 316.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 330.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 342.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 348.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 362.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 370.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 389.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 403.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 414.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 422.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 427.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 435.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 448.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 457.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 462.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 465.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 481.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 498.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 501.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 510.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 517.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 528.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 535.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 545.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 564.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 573.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 576.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 589.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 592.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 606.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 616.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 620.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 629.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 632.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 634.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 642.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 656.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 670.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 671.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 686.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 688.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 691.9 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Chkmod> That is: 3443 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. Chkmod> Normal end. 0.0034 0.7060 0.0034 0.6093 0.0034 0.7458 0.0034 0.8052 0.0034 0.7278 0.0034 0.9340 21.6259 0.7037 23.7557 0.7440 38.8795 0.5135 53.2739 0.7538 59.0875 0.7116 73.5750 0.6824 88.1494 0.7530 111.1092 0.7425 121.6946 0.5549 139.8199 0.7798 180.7243 0.6860 182.9936 0.7947 221.6073 0.6447 233.8021 0.5098 243.3166 0.1445 244.7661 0.5832 260.3591 0.4211 287.5190 0.4307 291.9347 0.1991 303.8876 0.1517 316.6750 0.2776 330.4320 0.4779 342.2290 0.4565 348.1554 0.2843 362.1004 0.2492 370.1517 0.3400 389.0981 0.1434 403.8199 0.2420 414.3404 0.2450 422.0937 0.2691 427.6442 0.0981 435.5667 0.2215 448.3724 0.1961 457.2261 0.2646 462.6099 0.1631 465.6585 0.0499 481.4691 0.2435 498.3171 0.2694 501.1485 0.2622 510.9348 0.1008 517.9256 0.3116 528.8518 0.3509 535.1683 0.1688 545.7495 0.0692 564.8596 0.2992 573.1485 0.3516 576.7375 0.2236 589.4768 0.3962 592.0714 0.3397 606.0461 0.4948 616.7495 0.2751 620.6564 0.4472 629.3346 0.4422 632.5117 0.3131 634.2802 0.2369 642.8663 0.3515 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DQ=-80 2605110701511632463.eigenfacs 2605110701511632463.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2605110701511632463.eigenfacs 2605110701511632463.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2605110701511632463.eigenfacs 2605110701511632463.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2605110701511632463.eigenfacs 2605110701511632463.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2605110701511632463.eigenfacs 2605110701511632463.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2605110701511632463.eigenfacs 2605110701511632463.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2605110701511632463.eigenfacs 2605110701511632463.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2605110701511632463.eigenfacs 2605110701511632463.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2605110701511632463.eigenfacs 2605110701511632463.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2605110701511632463.eigenfacs 2605110701511632463.atom making animated gifs 11 models are in 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generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 2605110701511632463.eigenfacs 2605110701511632463.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2605110701511632463.eigenfacs 2605110701511632463.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2605110701511632463.eigenfacs 2605110701511632463.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2605110701511632463.eigenfacs 2605110701511632463.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2605110701511632463.eigenfacs 2605110701511632463.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2605110701511632463.eigenfacs 2605110701511632463.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2605110701511632463.eigenfacs 2605110701511632463.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2605110701511632463.eigenfacs 2605110701511632463.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2605110701511632463.eigenfacs 2605110701511632463.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2605110701511632463.eigenfacs 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animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 2605110701511632463 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 2605110701511632463.eigenfacs 2605110701511632463.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2605110701511632463.eigenfacs 2605110701511632463.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2605110701511632463.eigenfacs 2605110701511632463.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2605110701511632463.eigenfacs 2605110701511632463.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2605110701511632463.eigenfacs 2605110701511632463.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2605110701511632463.eigenfacs 2605110701511632463.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2605110701511632463.eigenfacs 2605110701511632463.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2605110701511632463.eigenfacs 2605110701511632463.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2605110701511632463.eigenfacs 2605110701511632463.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2605110701511632463.eigenfacs 2605110701511632463.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2605110701511632463.eigenfacs 2605110701511632463.atom making animated gifs 11 models are in 2605110701511632463.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2605110701511632463.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2605110701511632463.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 2605110701511632463 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 2605110701511632463.eigenfacs 2605110701511632463.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2605110701511632463.eigenfacs 2605110701511632463.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2605110701511632463.eigenfacs 2605110701511632463.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2605110701511632463.eigenfacs 2605110701511632463.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2605110701511632463.eigenfacs 2605110701511632463.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2605110701511632463.eigenfacs 2605110701511632463.atom calculating perturbed structure for DQ=20 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100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2605110701511632463.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 2605110701511632463 11 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-100 2605110701511632463.eigenfacs 2605110701511632463.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2605110701511632463.eigenfacs 2605110701511632463.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2605110701511632463.eigenfacs 2605110701511632463.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2605110701511632463.eigenfacs 2605110701511632463.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2605110701511632463.eigenfacs 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MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2605110701511632463.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 2605110701511632463.10.pdb 2605110701511632463.11.pdb 2605110701511632463.7.pdb 2605110701511632463.8.pdb 2605110701511632463.9.pdb STDERR: Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL real 0m20.007s user 0m19.892s sys 0m0.103s rm: cannot remove '2605110701511632463.sdijf': No such file or directory pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: 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