***  CELL ADHESION PROTEIN 30-SEP-95 1FNF  ***
Output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 2605110701511632463.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 2605110701511632463.atom to be opened.
Openam> File opened: 2605110701511632463.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 368
First residue number = 1142
Last residue number = 1509
Number of atoms found = 3443
Mean number per residue = 9.4
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 16.955800 +/- 7.391090 From: -4.009000 To: 38.219000
= 1.832203 +/- 19.315695 From: -36.522000 To: 41.917000
= 2.068432 +/- 38.082276 From: -67.451000 To: 75.087000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 2.6989 % Filled.
Pdbmat> 1439864 non-zero elements.
Pdbmat> 157719 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 91.62 +/- 27.33
Maximum number = 154
Minimum number = 12
Pdbmat> Matrix trace = 3.154380E+06
Pdbmat> Larger element = 589.067
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
368 non-zero elements, NRBL set to 2
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 2605110701511632463.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 2
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 2605110701511632463.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
2605110701511632463.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 3443 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 2 residue(s) per block.
Blocpdb> 368 residues.
Blocpdb> 18 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 15 atoms in block 2
Block first atom: 19
Blocpdb> 16 atoms in block 3
Block first atom: 34
Blocpdb> 20 atoms in block 4
Block first atom: 50
Blocpdb> 22 atoms in block 5
Block first atom: 70
Blocpdb> 16 atoms in block 6
Block first atom: 92
Blocpdb> 18 atoms in block 7
Block first atom: 108
Blocpdb> 18 atoms in block 8
Block first atom: 126
Blocpdb> 13 atoms in block 9
Block first atom: 144
Blocpdb> 18 atoms in block 10
Block first atom: 157
Blocpdb> 16 atoms in block 11
Block first atom: 175
Blocpdb> 26 atoms in block 12
Block first atom: 191
Blocpdb> 25 atoms in block 13
Block first atom: 217
Blocpdb> 18 atoms in block 14
Block first atom: 242
Blocpdb> 16 atoms in block 15
Block first atom: 260
Blocpdb> 18 atoms in block 16
Block first atom: 276
Blocpdb> 19 atoms in block 17
Block first atom: 294
Blocpdb> 26 atoms in block 18
Block first atom: 313
Blocpdb> 18 atoms in block 19
Block first atom: 339
Blocpdb> 16 atoms in block 20
Block first atom: 357
Blocpdb> 20 atoms in block 21
Block first atom: 373
Blocpdb> 17 atoms in block 22
Block first atom: 393
Blocpdb> 17 atoms in block 23
Block first atom: 410
Blocpdb> 19 atoms in block 24
Block first atom: 427
Blocpdb> 19 atoms in block 25
Block first atom: 446
Blocpdb> 18 atoms in block 26
Block first atom: 465
Blocpdb> 21 atoms in block 27
Block first atom: 483
Blocpdb> 15 atoms in block 28
Block first atom: 504
Blocpdb> 20 atoms in block 29
Block first atom: 519
Blocpdb> 15 atoms in block 30
Block first atom: 539
Blocpdb> 21 atoms in block 31
Block first atom: 554
Blocpdb> 20 atoms in block 32
Block first atom: 575
Blocpdb> 17 atoms in block 33
Block first atom: 595
Blocpdb> 12 atoms in block 34
Block first atom: 612
Blocpdb> 19 atoms in block 35
Block first atom: 624
Blocpdb> 25 atoms in block 36
Block first atom: 643
Blocpdb> 16 atoms in block 37
Block first atom: 668
Blocpdb> 22 atoms in block 38
Block first atom: 684
Blocpdb> 17 atoms in block 39
Block first atom: 706
Blocpdb> 22 atoms in block 40
Block first atom: 723
Blocpdb> 22 atoms in block 41
Block first atom: 745
Blocpdb> 18 atoms in block 42
Block first atom: 767
Blocpdb> 15 atoms in block 43
Block first atom: 785
Blocpdb> 17 atoms in block 44
Block first atom: 800
Blocpdb> 18 atoms in block 45
Block first atom: 817
Blocpdb> 18 atoms in block 46
Block first atom: 835
Blocpdb> 13 atoms in block 47
Block first atom: 853
Blocpdb> 15 atoms in block 48
Block first atom: 866
Blocpdb> 14 atoms in block 49
Block first atom: 881
Blocpdb> 18 atoms in block 50
Block first atom: 895
Blocpdb> 26 atoms in block 51
Block first atom: 913
Blocpdb> 21 atoms in block 52
Block first atom: 939
Blocpdb> 20 atoms in block 53
Block first atom: 960
Blocpdb> 12 atoms in block 54
Block first atom: 980
Blocpdb> 18 atoms in block 55
Block first atom: 992
Blocpdb> 26 atoms in block 56
Block first atom: 1010
Blocpdb> 17 atoms in block 57
Block first atom: 1036
Blocpdb> 22 atoms in block 58
Block first atom: 1053
Blocpdb> 14 atoms in block 59
Block first atom: 1075
Blocpdb> 15 atoms in block 60
Block first atom: 1089
Blocpdb> 18 atoms in block 61
Block first atom: 1104
Blocpdb> 18 atoms in block 62
Block first atom: 1122
Blocpdb> 23 atoms in block 63
Block first atom: 1140
Blocpdb> 17 atoms in block 64
Block first atom: 1163
Blocpdb> 31 atoms in block 65
Block first atom: 1180
Blocpdb> 15 atoms in block 66
Block first atom: 1211
Blocpdb> 21 atoms in block 67
Block first atom: 1226
Blocpdb> 21 atoms in block 68
Block first atom: 1247
Blocpdb> 19 atoms in block 69
Block first atom: 1268
Blocpdb> 14 atoms in block 70
Block first atom: 1287
Blocpdb> 19 atoms in block 71
Block first atom: 1301
Blocpdb> 17 atoms in block 72
Block first atom: 1320
Blocpdb> 15 atoms in block 73
Block first atom: 1337
Blocpdb> 17 atoms in block 74
Block first atom: 1352
Blocpdb> 17 atoms in block 75
Block first atom: 1369
Blocpdb> 16 atoms in block 76
Block first atom: 1386
Blocpdb> 18 atoms in block 77
Block first atom: 1402
Blocpdb> 20 atoms in block 78
Block first atom: 1420
Blocpdb> 16 atoms in block 79
Block first atom: 1440
Blocpdb> 14 atoms in block 80
Block first atom: 1456
Blocpdb> 24 atoms in block 81
Block first atom: 1470
Blocpdb> 16 atoms in block 82
Block first atom: 1494
Blocpdb> 16 atoms in block 83
Block first atom: 1510
Blocpdb> 16 atoms in block 84
Block first atom: 1526
Blocpdb> 22 atoms in block 85
Block first atom: 1542
Blocpdb> 22 atoms in block 86
Block first atom: 1564
Blocpdb> 23 atoms in block 87
Block first atom: 1586
Blocpdb> 17 atoms in block 88
Block first atom: 1609
Blocpdb> 16 atoms in block 89
Block first atom: 1626
Blocpdb> 22 atoms in block 90
Block first atom: 1642
Blocpdb> 29 atoms in block 91
Block first atom: 1664
Blocpdb> 22 atoms in block 92
Block first atom: 1693
Blocpdb> 14 atoms in block 93
Block first atom: 1715
Blocpdb> 17 atoms in block 94
Block first atom: 1729
Blocpdb> 16 atoms in block 95
Block first atom: 1746
Blocpdb> 14 atoms in block 96
Block first atom: 1762
Blocpdb> 21 atoms in block 97
Block first atom: 1776
Blocpdb> 17 atoms in block 98
Block first atom: 1797
Blocpdb> 18 atoms in block 99
Block first atom: 1814
Blocpdb> 17 atoms in block 100
Block first atom: 1832
Blocpdb> 20 atoms in block 101
Block first atom: 1849
Blocpdb> 17 atoms in block 102
Block first atom: 1869
Blocpdb> 29 atoms in block 103
Block first atom: 1886
Blocpdb> 15 atoms in block 104
Block first atom: 1915
Blocpdb> 24 atoms in block 105
Block first atom: 1930
Blocpdb> 15 atoms in block 106
Block first atom: 1954
Blocpdb> 18 atoms in block 107
Block first atom: 1969
Blocpdb> 19 atoms in block 108
Block first atom: 1987
Blocpdb> 26 atoms in block 109
Block first atom: 2006
Blocpdb> 30 atoms in block 110
Block first atom: 2032
Blocpdb> 20 atoms in block 111
Block first atom: 2062
Blocpdb> 23 atoms in block 112
Block first atom: 2082
Blocpdb> 20 atoms in block 113
Block first atom: 2105
Blocpdb> 22 atoms in block 114
Block first atom: 2125
Blocpdb> 24 atoms in block 115
Block first atom: 2147
Blocpdb> 19 atoms in block 116
Block first atom: 2171
Blocpdb> 25 atoms in block 117
Block first atom: 2190
Blocpdb> 20 atoms in block 118
Block first atom: 2215
Blocpdb> 25 atoms in block 119
Block first atom: 2235
Blocpdb> 19 atoms in block 120
Block first atom: 2260
Blocpdb> 18 atoms in block 121
Block first atom: 2279
Blocpdb> 18 atoms in block 122
Block first atom: 2297
Blocpdb> 20 atoms in block 123
Block first atom: 2315
Blocpdb> 16 atoms in block 124
Block first atom: 2335
Blocpdb> 14 atoms in block 125
Block first atom: 2351
Blocpdb> 24 atoms in block 126
Block first atom: 2365
Blocpdb> 16 atoms in block 127
Block first atom: 2389
Blocpdb> 17 atoms in block 128
Block first atom: 2405
Blocpdb> 14 atoms in block 129
Block first atom: 2422
Blocpdb> 20 atoms in block 130
Block first atom: 2436
Blocpdb> 22 atoms in block 131
Block first atom: 2456
Blocpdb> 20 atoms in block 132
Block first atom: 2478
Blocpdb> 15 atoms in block 133
Block first atom: 2498
Blocpdb> 18 atoms in block 134
Block first atom: 2513
Blocpdb> 14 atoms in block 135
Block first atom: 2531
Blocpdb> 24 atoms in block 136
Block first atom: 2545
Blocpdb> 17 atoms in block 137
Block first atom: 2569
Blocpdb> 16 atoms in block 138
Block first atom: 2586
Blocpdb> 17 atoms in block 139
Block first atom: 2602
Blocpdb> 24 atoms in block 140
Block first atom: 2619
Blocpdb> 18 atoms in block 141
Block first atom: 2643
Blocpdb> 18 atoms in block 142
Block first atom: 2661
Blocpdb> 14 atoms in block 143
Block first atom: 2679
Blocpdb> 15 atoms in block 144
Block first atom: 2693
Blocpdb> 16 atoms in block 145
Block first atom: 2708
Blocpdb> 17 atoms in block 146
Block first atom: 2724
Blocpdb> 18 atoms in block 147
Block first atom: 2741
Blocpdb> 24 atoms in block 148
Block first atom: 2759
Blocpdb> 15 atoms in block 149
Block first atom: 2783
Blocpdb> 13 atoms in block 150
Block first atom: 2798
Blocpdb> 17 atoms in block 151
Block first atom: 2811
Blocpdb> 25 atoms in block 152
Block first atom: 2828
Blocpdb> 28 atoms in block 153
Block first atom: 2853
Blocpdb> 26 atoms in block 154
Block first atom: 2881
Blocpdb> 23 atoms in block 155
Block first atom: 2907
Blocpdb> 15 atoms in block 156
Block first atom: 2930
Blocpdb> 14 atoms in block 157
Block first atom: 2945
Blocpdb> 16 atoms in block 158
Block first atom: 2959
Blocpdb> 15 atoms in block 159
Block first atom: 2975
Blocpdb> 20 atoms in block 160
Block first atom: 2990
Blocpdb> 22 atoms in block 161
Block first atom: 3010
Blocpdb> 17 atoms in block 162
Block first atom: 3032
Blocpdb> 12 atoms in block 163
Block first atom: 3049
Blocpdb> 21 atoms in block 164
Block first atom: 3061
Blocpdb> 17 atoms in block 165
Block first atom: 3082
Blocpdb> 15 atoms in block 166
Block first atom: 3099
Blocpdb> 17 atoms in block 167
Block first atom: 3114
Blocpdb> 14 atoms in block 168
Block first atom: 3131
Blocpdb> 20 atoms in block 169
Block first atom: 3145
Blocpdb> 13 atoms in block 170
Block first atom: 3165
Blocpdb> 23 atoms in block 171
Block first atom: 3178
Blocpdb> 18 atoms in block 172
Block first atom: 3201
Blocpdb> 17 atoms in block 173
Block first atom: 3219
Blocpdb> 20 atoms in block 174
Block first atom: 3236
Blocpdb> 17 atoms in block 175
Block first atom: 3256
Blocpdb> 22 atoms in block 176
Block first atom: 3273
Blocpdb> 14 atoms in block 177
Block first atom: 3295
Blocpdb> 15 atoms in block 178
Block first atom: 3309
Blocpdb> 14 atoms in block 179
Block first atom: 3324
Blocpdb> 21 atoms in block 180
Block first atom: 3338
Blocpdb> 16 atoms in block 181
Block first atom: 3359
Blocpdb> 17 atoms in block 182
Block first atom: 3375
Blocpdb> 25 atoms in block 183
Block first atom: 3392
Blocpdb> 27 atoms in block 184
Block first atom: 3416
Blocpdb> 184 blocks.
Blocpdb> At most, 31 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 12 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 1440048 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 10329
Prepmat> Matrix trace = 3154380.0000
Prepmat> Last element read: 10329 10329 303.2061
Prepmat> 17021 lines saved.
Prepmat> 15222 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 3443
RTB> Total mass = 3443.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 3443
RTB> Number of blocks = 184
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 280882.7228
RTB> 61968 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 1104
Diagstd> Nb of non-zero elements: 61968
Diagstd> Projected matrix trace = 280882.7228
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 1104 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 280882.7228
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.0396641 0.0478615 0.1281711 0.2407325
0.2961223 0.4590901 0.6590019 1.0466838 1.2555500
1.6576509 2.7696007 2.8402596 4.1648386 4.6356875
5.0205210 5.0805972 5.7492510 7.0111275 7.2281709
7.8315185 8.5051820 9.2595766 9.9329442 10.2840116
11.1226184 11.6188333 12.8448053 13.8342199 14.5559778
15.1097029 15.5102344 16.0900891 17.0549202 17.7261873
18.1537778 18.3932897 19.6606458 21.0601209 21.3004849
22.1377223 22.7498968 23.7186615 24.2936063 25.2628421
27.0579352 27.8616095 28.2105600 29.4713722 29.7348005
31.1511270 32.2581686 32.6712348 33.5936292 33.9287715
34.1173984 35.0493964 36.5417861 38.0760730 38.1792283
39.9181198 40.1838907 40.5996879 41.4973525 42.3117233
42.4535391 42.7751425 43.7221162 44.2999178 44.8843166
45.7781995 46.3703470 46.8621580 47.6508626 48.9723669
49.4483224 50.4630925 50.6408578 51.5054780 52.1388034
52.6051014 52.8880442 53.6458174 54.0528068 54.8871152
55.2242869 55.5541454 56.0060035 56.7830057 58.5403088
58.8007821 59.3632935 59.7014312 60.1767598 60.8939828
61.4887101 62.1091184 63.4929625 64.1301777 64.8487292
65.5451523
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034322 0.0034325 0.0034329 0.0034332 0.0034348
0.0034366 21.6268892 23.7568216 38.8767823 53.2798113
59.0922912 73.5773704 88.1533073 111.0971775 121.6780625
139.8111518 180.7190199 183.0097805 221.6125580 233.8042260
243.3154425 244.7668856 260.3759779 287.5340053 291.9506769
303.8913019 316.6919955 330.4386549 342.2427667 348.2383203
362.1585974 370.1489665 389.1876432 403.8988502 414.3009913
422.1076696 427.6657402 435.5865933 448.4562963 457.1965522
462.6779343 465.7201037 481.4976483 498.3399569 501.1757228
510.9304048 517.9466106 528.8595712 535.2310189 545.8035854
564.8623216 573.1897044 576.7679694 589.5158134 592.1446300
606.0830832 616.7584861 620.6947256 629.3956582 632.5274065
634.2832365 642.8883445 656.4326371 670.0718223 670.9788847
686.0887826 688.3689495 691.9211848 699.5286002 706.3592511
707.5420097 710.2169171 718.0354184 722.7643786 727.5160665
734.7246893 739.4613054 743.3723826 749.6018739 759.9251667
763.6090404 771.4045767 772.7620874 779.3310706 784.1078654
787.6063544 789.7216309 795.3590260 798.3703605 804.5082148
806.9754793 809.3819516 812.6669008 818.2847719 830.8503071
832.6966768 836.6701483 839.0496325 842.3831670 847.3883140
851.5163117 855.8013407 865.2828098 869.6139584 874.4722155
879.1552398
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 3443
Rtb_to_modes> Number of blocs = 184
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9899E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9912E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9937E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9957E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0005E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0015E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.9664E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.7861E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1282
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2407
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2961
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4591
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6590
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.047
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.256
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.658
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.770
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.840
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.165
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.636
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.021
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.081
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.749
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.011
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.228
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.832
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.505
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.260
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.933
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.28
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.12
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.62
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.84
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.83
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.56
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.11
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.51
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.05
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.73
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.15
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.39
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.66
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.06
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.30
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.14
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.75
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.72
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.29
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.26
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.06
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.86
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.21
Rdmodfacs> Eigenvector number: 54
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.47
Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.73
Rdmodfacs> Eigenvector number: 56
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.15
Rdmodfacs> Eigenvector number: 57
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.26
Rdmodfacs> Eigenvector number: 58
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.67
Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.59
Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.93
Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.12
Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.05
Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.54
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.08
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.18
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.92
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.18
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.60
Rdmodfacs> Eigenvector number: 69
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.50
Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.31
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.45
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.78
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.72
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.30
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.88
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.78
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.37
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.86
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.65
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.97
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.45
Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.46
Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.64
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.51
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.14
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.61
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.89
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.65
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.05
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.89
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.22
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.55
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.01
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.78
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.54
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.80
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.36
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.70
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.18
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.89
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.49
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.11
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.49
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.13
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.85
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.55
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1104 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
0.99999 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000
1.00000 1.00001 1.00000 1.00002 1.00001
1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000
1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001
0.99999 0.99998 0.99999 1.00000 1.00000
0.99996 0.99999 0.99999 0.99998 1.00001
0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000
0.99998 1.00002 0.99998 1.00000 1.00000
1.00000 0.99997 0.99996 1.00002 0.99998
0.99996 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000
1.00001 1.00001 0.99999 0.99999 0.99999
1.00001 1.00000 1.00001 0.99997 0.99999
0.99999 0.99999 0.99997 1.00003 1.00000
1.00001 1.00001 0.99997 0.99999 1.00000
0.99996 1.00000 0.99999 0.99998 0.99998
0.99999 1.00002 1.00000 0.99999 1.00000
1.00000 1.00001 1.00002 0.99999 0.99997
1.00002 0.99998 0.99996 1.00002 0.99998
1.00000 1.00000 1.00001 0.99997 0.99998
0.99999 1.00000 0.99998 1.00000 0.99999
0.99999 1.00002 0.99999 1.00000 0.99997
1.00000
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 61974 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
0.99999 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000
1.00000 1.00001 1.00000 1.00002 1.00001
1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000
1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001
0.99999 0.99998 0.99999 1.00000 1.00000
0.99996 0.99999 0.99999 0.99998 1.00001
0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000
0.99998 1.00002 0.99998 1.00000 1.00000
1.00000 0.99997 0.99996 1.00002 0.99998
0.99996 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000
1.00001 1.00001 0.99999 0.99999 0.99999
1.00001 1.00000 1.00001 0.99997 0.99999
0.99999 0.99999 0.99997 1.00003 1.00000
1.00001 1.00001 0.99997 0.99999 1.00000
0.99996 1.00000 0.99999 0.99998 0.99998
0.99999 1.00002 1.00000 0.99999 1.00000
1.00000 1.00001 1.00002 0.99999 0.99997
1.00002 0.99998 0.99996 1.00002 0.99998
1.00000 1.00000 1.00001 0.99997 0.99998
0.99999 1.00000 0.99998 1.00000 0.99999
0.99999 1.00002 0.99999 1.00000 0.99997
1.00000
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2:-0.000
Vector 3: 0.000-0.000
Vector 4: 0.000 0.000 0.000
Vector 5: 0.000 0.000-0.000-0.000
Vector 6:-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000
Vector 7:-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000
Vector 8:-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 9:-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000
Vector 10:-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2605110701511632463.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2605110701511632463.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 2605110701511632463.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2605110701511632463.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 368
First residue number = 1142
Last residue number = 1509
Number of atoms found = 3443
Mean number per residue = 9.4
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9899E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9912E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9937E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9957E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0005E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0015E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.9664E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.7861E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1282
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2407
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2961
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4591
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6590
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.047
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.256
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.658
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.770
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.840
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.165
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.636
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.021
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.081
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.749
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.011
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.228
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.832
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.505
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.260
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.933
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.28
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.84
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.83
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.11
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.51
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.75
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.29
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.86
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.47
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.67
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.54
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.08
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.18
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.18
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.31
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.45
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.86
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.65
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.97
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.45
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.51
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.65
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.54
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.80
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.18
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.49
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.11
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.49
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.85
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.55
Bfactors> 106 vectors, 10329 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.039664
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= 0.076 for 368 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.314 +/- 0.20
Bfactors> = 35.830 +/- 18.93
Bfactors> Shiftng-fct= 35.517
Bfactors> Scaling-fct= 92.782
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2605110701511632463.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2605110701511632463.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4321E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4323E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4327E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4331E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4347E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4364E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 21.63
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 23.76
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 38.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 53.27
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 59.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 73.58
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 88.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 111.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 121.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 139.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 180.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 183.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 221.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 233.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 243.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 244.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 260.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 287.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 291.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 303.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 316.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 330.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 342.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 348.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 362.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 370.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 389.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 403.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 414.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 422.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 427.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 435.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 448.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 457.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 462.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 465.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 481.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 498.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 501.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 510.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 517.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 528.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 535.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 545.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 564.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 573.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 576.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 589.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 592.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 606.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 616.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 620.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 629.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 632.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 634.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 642.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 656.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 670.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 671.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 686.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 688.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 691.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 699.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 706.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 707.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 710.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 718.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 722.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 727.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 734.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 739.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 743.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 749.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 759.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 763.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 771.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 772.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 779.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 784.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 787.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 789.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 795.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 798.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 804.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 806.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 809.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 812.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 818.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 830.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 832.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 836.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 839.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 842.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 847.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 851.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 855.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 865.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 869.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 874.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 879.2
Chkmod> 106 vectors, 10329 coordinates in file.
Chkmod> That is: 3443 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.7060
0.0034 0.6093
0.0034 0.7458
0.0034 0.8052
0.0034 0.7278
0.0034 0.9340
21.6259 0.7037
23.7557 0.7440
38.8795 0.5135
53.2739 0.7538
59.0875 0.7116
73.5750 0.6824
88.1494 0.7530
111.1092 0.7425
121.6946 0.5549
139.8199 0.7798
180.7243 0.6860
182.9936 0.7947
221.6073 0.6447
233.8021 0.5098
243.3166 0.1445
244.7661 0.5832
260.3591 0.4211
287.5190 0.4307
291.9347 0.1991
303.8876 0.1517
316.6750 0.2776
330.4320 0.4779
342.2290 0.4565
348.1554 0.2843
362.1004 0.2492
370.1517 0.3400
389.0981 0.1434
403.8199 0.2420
414.3404 0.2450
422.0937 0.2691
427.6442 0.0981
435.5667 0.2215
448.3724 0.1961
457.2261 0.2646
462.6099 0.1631
465.6585 0.0499
481.4691 0.2435
498.3171 0.2694
501.1485 0.2622
510.9348 0.1008
517.9256 0.3116
528.8518 0.3509
535.1683 0.1688
545.7495 0.0692
564.8596 0.2992
573.1485 0.3516
576.7375 0.2236
589.4768 0.3962
592.0714 0.3397
606.0461 0.4948
616.7495 0.2751
620.6564 0.4472
629.3346 0.4422
632.5117 0.3131
634.2802 0.2369
642.8663 0.3515
656.3884 0.2109
670.0776 0.5170
670.9569 0.5190
686.0755 0.4727
688.3061 0.4627
691.8941 0.2107
699.5209 0.3923
706.3145 0.2589
707.4821 0.1093
710.2268 0.3052
717.9872 0.3825
722.7340 0.2641
727.4499 0.3332
734.7076 0.1202
739.4268 0.2638
743.3234 0.3955
749.5629 0.4393
759.8742 0.2216
763.5892 0.2898
771.3478 0.1136
772.7224 0.2874
779.3318 0.3218
784.0832 0.3490
787.6092 0.2780
789.7023 0.2913
795.3559 0.2218
798.3154 0.4898
804.4948 0.1418
806.9095 0.2893
809.3170 0.3471
812.6610 0.1741
818.2280 0.2551
830.8124 0.3732
832.6554 0.4236
836.6110 0.2675
839.0036 0.4428
842.3697 0.4389
847.3242 0.2001
851.4887 0.2119
855.7707 0.4259
865.2255 0.3740
869.5754 0.4026
874.4432 0.2564
879.1500 0.2677
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2605110701511632463 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
2605110701511632463.eigenfacs
2605110701511632463.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2605110701511632463.eigenfacs
2605110701511632463.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2605110701511632463.eigenfacs
2605110701511632463.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2605110701511632463.eigenfacs
2605110701511632463.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2605110701511632463.eigenfacs
2605110701511632463.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2605110701511632463.eigenfacs
2605110701511632463.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2605110701511632463.eigenfacs
2605110701511632463.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2605110701511632463.eigenfacs
2605110701511632463.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2605110701511632463.eigenfacs
2605110701511632463.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2605110701511632463.eigenfacs
2605110701511632463.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2605110701511632463.eigenfacs
2605110701511632463.atom
making animated gifs
11 models are in 2605110701511632463.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2605110701511632463.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2605110701511632463.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 2605110701511632463 8 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
2605110701511632463.eigenfacs
2605110701511632463.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2605110701511632463.eigenfacs
2605110701511632463.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2605110701511632463.eigenfacs
2605110701511632463.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2605110701511632463.eigenfacs
2605110701511632463.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2605110701511632463.eigenfacs
2605110701511632463.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2605110701511632463.eigenfacs
2605110701511632463.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2605110701511632463.eigenfacs
2605110701511632463.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2605110701511632463.eigenfacs
2605110701511632463.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2605110701511632463.eigenfacs
2605110701511632463.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2605110701511632463.eigenfacs
2605110701511632463.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2605110701511632463.eigenfacs
2605110701511632463.atom
making animated gifs
11 models are in 2605110701511632463.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2605110701511632463.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2605110701511632463.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 2605110701511632463 9 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
2605110701511632463.eigenfacs
2605110701511632463.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2605110701511632463.eigenfacs
2605110701511632463.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2605110701511632463.eigenfacs
2605110701511632463.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2605110701511632463.eigenfacs
2605110701511632463.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2605110701511632463.eigenfacs
2605110701511632463.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2605110701511632463.eigenfacs
2605110701511632463.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2605110701511632463.eigenfacs
2605110701511632463.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2605110701511632463.eigenfacs
2605110701511632463.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2605110701511632463.eigenfacs
2605110701511632463.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2605110701511632463.eigenfacs
2605110701511632463.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2605110701511632463.eigenfacs
2605110701511632463.atom
making animated gifs
11 models are in 2605110701511632463.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2605110701511632463.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2605110701511632463.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 2605110701511632463 10 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
2605110701511632463.eigenfacs
2605110701511632463.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2605110701511632463.eigenfacs
2605110701511632463.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2605110701511632463.eigenfacs
2605110701511632463.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2605110701511632463.eigenfacs
2605110701511632463.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2605110701511632463.eigenfacs
2605110701511632463.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2605110701511632463.eigenfacs
2605110701511632463.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2605110701511632463.eigenfacs
2605110701511632463.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2605110701511632463.eigenfacs
2605110701511632463.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2605110701511632463.eigenfacs
2605110701511632463.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2605110701511632463.eigenfacs
2605110701511632463.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2605110701511632463.eigenfacs
2605110701511632463.atom
making animated gifs
11 models are in 2605110701511632463.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2605110701511632463.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2605110701511632463.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 2605110701511632463 11 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
2605110701511632463.eigenfacs
2605110701511632463.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2605110701511632463.eigenfacs
2605110701511632463.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2605110701511632463.eigenfacs
2605110701511632463.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2605110701511632463.eigenfacs
2605110701511632463.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2605110701511632463.eigenfacs
2605110701511632463.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2605110701511632463.eigenfacs
2605110701511632463.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2605110701511632463.eigenfacs
2605110701511632463.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2605110701511632463.eigenfacs
2605110701511632463.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2605110701511632463.eigenfacs
2605110701511632463.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2605110701511632463.eigenfacs
2605110701511632463.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2605110701511632463.eigenfacs
2605110701511632463.atom
making animated gifs
11 models are in 2605110701511632463.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2605110701511632463.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2605110701511632463.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
2605110701511632463.10.pdb
2605110701511632463.11.pdb
2605110701511632463.7.pdb
2605110701511632463.8.pdb
2605110701511632463.9.pdb
STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 0m20.007s
user 0m19.892s
sys 0m0.103s
rm: cannot remove '2605110701511632463.sdijf': No such file or directory
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:
elNémo
is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed
by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Between 2015 and 2025, it was hosted by US2B (Nantes).
Last modification: april 24th, 2026.
|