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***  01-AUG-25  ***

LOGs for ID: 2605111523081729925

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2605111523081729925.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2605111523081729925.atom to be opened. Openam> File opened: 2605111523081729925.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 1657 First residue number = 1 Last residue number = 1657 Number of atoms found = 12926 Mean number per residue = 7.8 Pdbmat> Coordinate statistics: = 5.120204 +/- 28.887150 From: -55.595000 To: 90.776000 = -0.906702 +/- 24.702732 From: -61.073000 To: 60.414000 = -2.948224 +/- 24.540618 From: -71.837000 To: 60.842000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 0.5704 % Filled. Pdbmat> 4289103 non-zero elements. Pdbmat> 468028 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 72.42 +/- 27.73 Maximum number = 134 Minimum number = 8 Pdbmat> Matrix trace = 9.360560E+06 Pdbmat> Larger element = 502.287 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 1657 non-zero elements, NRBL set to 9 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2605111523081729925.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 9 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2605111523081729925.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2605111523081729925.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 12926 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 9 residue(s) per block. Blocpdb> 1657 residues. Blocpdb> 70 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 66 atoms in block 2 Block first atom: 71 Blocpdb> 71 atoms in block 3 Block first atom: 137 Blocpdb> 75 atoms in block 4 Block first atom: 208 Blocpdb> 66 atoms in block 5 Block first atom: 283 Blocpdb> 59 atoms in block 6 Block first atom: 349 Blocpdb> 72 atoms in block 7 Block first atom: 408 Blocpdb> 74 atoms in block 8 Block first atom: 480 Blocpdb> 60 atoms in block 9 Block first atom: 554 Blocpdb> 64 atoms in block 10 Block first atom: 614 Blocpdb> 66 atoms in block 11 Block first atom: 678 Blocpdb> 64 atoms in block 12 Block first atom: 744 Blocpdb> 71 atoms in block 13 Block first atom: 808 Blocpdb> 55 atoms in block 14 Block first atom: 879 Blocpdb> 76 atoms in block 15 Block first atom: 934 Blocpdb> 61 atoms in block 16 Block first atom: 1010 Blocpdb> 68 atoms in block 17 Block first atom: 1071 Blocpdb> 67 atoms in block 18 Block first atom: 1139 Blocpdb> 69 atoms in block 19 Block first atom: 1206 Blocpdb> 71 atoms in block 20 Block first atom: 1275 Blocpdb> 64 atoms in block 21 Block first atom: 1346 Blocpdb> 75 atoms in block 22 Block first atom: 1410 Blocpdb> 63 atoms in block 23 Block first atom: 1485 Blocpdb> 63 atoms in block 24 Block first atom: 1548 Blocpdb> 68 atoms in block 25 Block first atom: 1611 Blocpdb> 73 atoms in block 26 Block first atom: 1679 Blocpdb> 67 atoms in block 27 Block first atom: 1752 Blocpdb> 73 atoms in block 28 Block first atom: 1819 Blocpdb> 62 atoms in block 29 Block first atom: 1892 Blocpdb> 68 atoms in block 30 Block first atom: 1954 Blocpdb> 60 atoms in block 31 Block first atom: 2022 Blocpdb> 77 atoms in block 32 Block first atom: 2082 Blocpdb> 70 atoms in block 33 Block first atom: 2159 Blocpdb> 67 atoms in block 34 Block first atom: 2229 Blocpdb> 59 atoms in block 35 Block first atom: 2296 Blocpdb> 66 atoms in block 36 Block first atom: 2355 Blocpdb> 60 atoms in block 37 Block first atom: 2421 Blocpdb> 74 atoms in block 38 Block first atom: 2481 Blocpdb> 78 atoms in block 39 Block first atom: 2555 Blocpdb> 73 atoms in block 40 Block first atom: 2633 Blocpdb> 68 atoms in block 41 Block first atom: 2706 Blocpdb> 69 atoms in block 42 Block first atom: 2774 Blocpdb> 67 atoms in block 43 Block first atom: 2843 Blocpdb> 61 atoms in block 44 Block first atom: 2910 Blocpdb> 53 atoms in block 45 Block first atom: 2971 Blocpdb> 65 atoms in block 46 Block first atom: 3024 Blocpdb> 68 atoms in block 47 Block first atom: 3089 Blocpdb> 72 atoms in block 48 Block first atom: 3157 Blocpdb> 52 atoms in block 49 Block first atom: 3229 Blocpdb> 66 atoms in block 50 Block first atom: 3281 Blocpdb> 75 atoms in block 51 Block first atom: 3347 Blocpdb> 64 atoms in block 52 Block first atom: 3422 Blocpdb> 74 atoms in block 53 Block first atom: 3486 Blocpdb> 65 atoms in block 54 Block first atom: 3560 Blocpdb> 70 atoms in block 55 Block first atom: 3625 Blocpdb> 72 atoms in block 56 Block first atom: 3695 Blocpdb> 73 atoms in block 57 Block first atom: 3767 Blocpdb> 60 atoms in block 58 Block first atom: 3840 Blocpdb> 83 atoms in block 59 Block first atom: 3900 Blocpdb> 60 atoms in block 60 Block first atom: 3983 Blocpdb> 72 atoms in block 61 Block first atom: 4043 Blocpdb> 63 atoms in block 62 Block first atom: 4115 Blocpdb> 69 atoms in block 63 Block first atom: 4178 Blocpdb> 65 atoms in block 64 Block first atom: 4247 Blocpdb> 73 atoms in block 65 Block first atom: 4312 Blocpdb> 67 atoms in block 66 Block first atom: 4385 Blocpdb> 73 atoms in block 67 Block first atom: 4452 Blocpdb> 62 atoms in block 68 Block first atom: 4525 Blocpdb> 73 atoms in block 69 Block first atom: 4587 Blocpdb> 72 atoms in block 70 Block first atom: 4660 Blocpdb> 73 atoms in block 71 Block first atom: 4732 Blocpdb> 71 atoms in block 72 Block first atom: 4805 Blocpdb> 67 atoms in block 73 Block first atom: 4876 Blocpdb> 64 atoms in block 74 Block first atom: 4943 Blocpdb> 68 atoms in block 75 Block first atom: 5007 Blocpdb> 67 atoms in block 76 Block first atom: 5075 Blocpdb> 70 atoms in block 77 Block first atom: 5142 Blocpdb> 69 atoms in block 78 Block first atom: 5212 Blocpdb> 82 atoms in block 79 Block first atom: 5281 Blocpdb> 74 atoms in block 80 Block first atom: 5363 Blocpdb> 65 atoms in block 81 Block first atom: 5437 Blocpdb> 71 atoms in block 82 Block first atom: 5502 Blocpdb> 74 atoms in block 83 Block first atom: 5573 Blocpdb> 62 atoms in block 84 Block first atom: 5647 Blocpdb> 70 atoms in block 85 Block first atom: 5709 Blocpdb> 72 atoms in block 86 Block first atom: 5779 Blocpdb> 72 atoms in block 87 Block first atom: 5851 Blocpdb> 74 atoms in block 88 Block first atom: 5923 Blocpdb> 67 atoms in block 89 Block first atom: 5997 Blocpdb> 69 atoms in block 90 Block first atom: 6064 Blocpdb> 76 atoms in block 91 Block first atom: 6133 Blocpdb> 71 atoms in block 92 Block first atom: 6209 Blocpdb> 75 atoms in block 93 Block first atom: 6280 Blocpdb> 82 atoms in block 94 Block first atom: 6355 Blocpdb> 71 atoms in block 95 Block first atom: 6437 Blocpdb> 67 atoms in block 96 Block first atom: 6508 Blocpdb> 73 atoms in block 97 Block first atom: 6575 Blocpdb> 72 atoms in block 98 Block first atom: 6648 Blocpdb> 79 atoms in block 99 Block first atom: 6720 Blocpdb> 78 atoms in block 100 Block first atom: 6799 Blocpdb> 70 atoms in block 101 Block first atom: 6877 Blocpdb> 75 atoms in block 102 Block first atom: 6947 Blocpdb> 71 atoms in block 103 Block first atom: 7022 Blocpdb> 77 atoms in block 104 Block first atom: 7093 Blocpdb> 73 atoms in block 105 Block first atom: 7170 Blocpdb> 76 atoms in block 106 Block first atom: 7243 Blocpdb> 70 atoms in block 107 Block first atom: 7319 Blocpdb> 60 atoms in block 108 Block first atom: 7389 Blocpdb> 68 atoms in block 109 Block first atom: 7449 Blocpdb> 69 atoms in block 110 Block first atom: 7517 Blocpdb> 81 atoms in block 111 Block first atom: 7586 Blocpdb> 65 atoms in block 112 Block first atom: 7667 Blocpdb> 71 atoms in block 113 Block first atom: 7732 Blocpdb> 62 atoms in block 114 Block first atom: 7803 Blocpdb> 68 atoms in block 115 Block first atom: 7865 Blocpdb> 85 atoms in block 116 Block first atom: 7933 Blocpdb> 78 atoms in block 117 Block first atom: 8018 Blocpdb> 63 atoms in block 118 Block first atom: 8096 Blocpdb> 74 atoms in block 119 Block first atom: 8159 Blocpdb> 72 atoms in block 120 Block first atom: 8233 Blocpdb> 77 atoms in block 121 Block first atom: 8305 Blocpdb> 71 atoms in block 122 Block first atom: 8382 Blocpdb> 79 atoms in block 123 Block first atom: 8453 Blocpdb> 65 atoms in block 124 Block first atom: 8532 Blocpdb> 67 atoms in block 125 Block first atom: 8597 Blocpdb> 75 atoms in block 126 Block first atom: 8664 Blocpdb> 68 atoms in block 127 Block first atom: 8739 Blocpdb> 65 atoms in block 128 Block first atom: 8807 Blocpdb> 73 atoms in block 129 Block first atom: 8872 Blocpdb> 69 atoms in block 130 Block first atom: 8945 Blocpdb> 79 atoms in block 131 Block first atom: 9014 Blocpdb> 63 atoms in block 132 Block first atom: 9093 Blocpdb> 72 atoms in block 133 Block first atom: 9156 Blocpdb> 79 atoms in block 134 Block first atom: 9228 Blocpdb> 61 atoms in block 135 Block first atom: 9307 Blocpdb> 74 atoms in block 136 Block first atom: 9368 Blocpdb> 72 atoms in block 137 Block first atom: 9442 Blocpdb> 62 atoms in block 138 Block first atom: 9514 Blocpdb> 74 atoms in block 139 Block first atom: 9576 Blocpdb> 69 atoms in block 140 Block first atom: 9650 Blocpdb> 76 atoms in block 141 Block first atom: 9719 Blocpdb> 74 atoms in block 142 Block first atom: 9795 Blocpdb> 71 atoms in block 143 Block first atom: 9869 Blocpdb> 73 atoms in block 144 Block first atom: 9940 Blocpdb> 80 atoms in block 145 Block first atom: 10013 Blocpdb> 59 atoms in block 146 Block first atom: 10093 Blocpdb> 78 atoms in block 147 Block first atom: 10152 Blocpdb> 74 atoms in block 148 Block first atom: 10230 Blocpdb> 74 atoms in block 149 Block first atom: 10304 Blocpdb> 69 atoms in block 150 Block first atom: 10378 Blocpdb> 70 atoms in block 151 Block first atom: 10447 Blocpdb> 78 atoms in block 152 Block first atom: 10517 Blocpdb> 76 atoms in block 153 Block first atom: 10595 Blocpdb> 70 atoms in block 154 Block first atom: 10671 Blocpdb> 73 atoms in block 155 Block first atom: 10741 Blocpdb> 62 atoms in block 156 Block first atom: 10814 Blocpdb> 77 atoms in block 157 Block first atom: 10876 Blocpdb> 80 atoms in block 158 Block first atom: 10953 Blocpdb> 83 atoms in block 159 Block first atom: 11033 Blocpdb> 67 atoms in block 160 Block first atom: 11116 Blocpdb> 64 atoms in block 161 Block first atom: 11183 Blocpdb> 69 atoms in block 162 Block first atom: 11247 Blocpdb> 69 atoms in block 163 Block first atom: 11316 Blocpdb> 61 atoms in block 164 Block first atom: 11385 Blocpdb> 72 atoms in block 165 Block first atom: 11446 Blocpdb> 78 atoms in block 166 Block first atom: 11518 Blocpdb> 77 atoms in block 167 Block first atom: 11596 Blocpdb> 83 atoms in block 168 Block first atom: 11673 Blocpdb> 66 atoms in block 169 Block first atom: 11756 Blocpdb> 84 atoms in block 170 Block first atom: 11822 Blocpdb> 62 atoms in block 171 Block first atom: 11906 Blocpdb> 69 atoms in block 172 Block first atom: 11968 Blocpdb> 62 atoms in block 173 Block first atom: 12037 Blocpdb> 71 atoms in block 174 Block first atom: 12099 Blocpdb> 69 atoms in block 175 Block first atom: 12170 Blocpdb> 77 atoms in block 176 Block first atom: 12239 Blocpdb> 67 atoms in block 177 Block first atom: 12316 Blocpdb> 82 atoms in block 178 Block first atom: 12383 Blocpdb> 81 atoms in block 179 Block first atom: 12465 Blocpdb> 70 atoms in block 180 Block first atom: 12546 Blocpdb> 74 atoms in block 181 Block first atom: 12616 Blocpdb> 72 atoms in block 182 Block first atom: 12690 Blocpdb> 69 atoms in block 183 Block first atom: 12762 Blocpdb> 87 atoms in block 184 Block first atom: 12831 Blocpdb> 9 atoms in block 185 Block first atom: 12917 Blocpdb> 185 blocks. Blocpdb> At most, 87 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 9 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 4289288 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 38778 Prepmat> Matrix trace = 9360560.0000 Prepmat> Last element read: 38778 38778 92.8804 Prepmat> 17206 lines saved. Prepmat> 15999 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 12926 RTB> Total mass = 12926.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 12926 RTB> Number of blocks = 185 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 147856.2866 RTB> 40641 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1110 Diagstd> Nb of non-zero elements: 40641 Diagstd> Projected matrix trace = 147856.2866 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1110 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 147856.2866 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0001132 0.0005094 0.0010889 0.0013720 0.0020555 0.0034817 0.0056143 0.0092613 0.0134052 0.0148432 0.0177050 0.0213291 0.0272048 0.0321708 0.0387668 0.0511060 0.0609905 0.0733041 0.0894026 0.0943577 0.0964674 0.1060404 0.1143409 0.1292155 0.1393033 0.1422469 0.1672896 0.1754918 0.1951044 0.2068583 0.2487413 0.2595813 0.2726328 0.2786956 0.2857775 0.3130281 0.3337884 0.3654096 0.3902064 0.4079054 0.4443225 0.4637896 0.5023018 0.5665203 0.6805014 0.6882173 0.7186333 0.7372203 0.7557942 0.7670145 0.9181536 0.9394742 0.9859300 1.0840335 1.1223153 1.1315083 1.1727988 1.2810322 1.3163805 1.3375456 1.3550863 1.4983263 1.5742516 1.6127945 1.6459842 1.6661556 1.7018525 1.7702622 1.9019030 2.0260119 2.2023200 2.2350187 2.2460722 2.4894799 2.5340706 2.6181481 2.7418172 2.8377284 2.9701494 3.1273143 3.1441192 3.2831499 3.3712125 3.4457796 3.4616290 3.6394356 3.7457642 3.7942450 4.0348792 4.1702406 4.2371675 4.4827356 4.5214651 4.6054521 4.6299470 4.6634354 4.8147746 4.9738721 4.9838890 5.0808021 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034327 0.0034338 0.0034339 0.0034339 0.0034340 0.0034341 1.1552960 2.4509322 3.5833620 4.0222402 4.9233150 6.4075799 8.1366206 10.4503485 12.5727804 13.2299854 14.4491615 15.8591918 17.9109314 19.4771863 21.3808565 24.5488532 26.8180037 29.4008092 32.4691125 33.3567635 33.7276181 35.3615261 36.7194440 39.0348536 40.5299426 40.9559140 44.4150134 45.4908131 47.9654805 49.3891737 54.1588280 55.3263419 56.7001685 57.3271444 58.0509481 60.7556892 62.7380371 65.6425247 67.8332260 69.3545538 72.3843122 73.9530014 76.9622291 81.7340494 89.5797387 90.0861563 92.0553295 93.2382064 94.4054483 95.1036248 104.0526062 105.2537799 107.8247168 113.0619941 115.0410218 115.5112163 117.5999230 122.9066292 124.5908055 125.5884152 126.4092240 132.9224924 136.2486942 137.9065177 139.3182827 140.1693498 141.6629377 144.4821129 149.7578041 154.5668225 161.1519226 162.3438579 162.7448054 171.3363815 172.8640303 175.7083436 179.8102846 182.9282146 187.1476724 192.0352891 192.5505568 196.7617318 199.3831011 201.5760950 202.0391540 207.1630527 210.1674694 211.5231791 218.1275642 221.7562336 223.5285984 229.9147533 230.9058171 233.0405065 233.6594171 234.5029246 238.2776251 242.1824053 242.4261471 244.7718227 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 12926 Rtb_to_modes> Number of blocs = 185 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9925E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9991E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9996E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9999E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.1319E-04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.0942E-04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0889E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.3720E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.0555E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.4817E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.6143E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.2613E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.3405E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.4843E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.7705E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.1329E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.7205E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.2171E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.8767E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.1106E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.0991E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.3304E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.9403E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.4358E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.6467E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1060 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1143 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1292 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1393 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1422 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1673 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1755 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1951 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2069 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2487 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2596 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2726 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2787 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2858 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3130 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3338 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3654 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3902 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4079 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4443 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4638 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5023 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5665 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6805 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6882 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7186 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7372 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7558 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7670 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9182 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9395 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9859 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.084 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.122 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.132 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.173 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.281 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.316 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.338 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.355 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.498 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.574 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.613 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.646 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.666 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.702 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.770 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.902 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.026 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.202 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.235 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.246 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.489 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.534 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.618 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.742 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.838 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.970 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.127 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.144 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.283 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.371 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.446 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.462 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.639 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.746 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.794 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.035 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.170 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.237 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.483 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.521 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.605 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.630 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.663 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.815 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.974 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.984 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.081 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1110 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00002 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 1.00001 1.00003 0.99995 1.00000 0.99996 0.99999 0.99999 0.99999 1.00002 0.99998 1.00000 0.99999 1.00003 0.99999 0.99996 1.00001 1.00001 1.00000 1.00002 0.99999 0.99999 0.99998 0.99995 0.99998 0.99998 0.99996 0.99999 1.00001 0.99997 1.00003 1.00002 1.00000 0.99999 0.99999 0.99997 0.99996 1.00000 1.00001 1.00000 0.99997 1.00002 0.99999 1.00002 0.99997 0.99997 0.99996 0.99996 0.99999 1.00001 1.00000 1.00003 1.00002 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 0.99998 1.00000 0.99998 0.99998 0.99997 1.00004 0.99999 0.99999 1.00002 0.99992 0.99998 1.00005 1.00004 0.99999 0.99999 1.00000 0.99997 1.00000 1.00002 1.00002 1.00000 1.00002 1.00001 0.99997 0.99998 0.99998 1.00002 1.00001 1.00003 0.99999 1.00002 1.00001 0.99998 1.00001 1.00000 1.00000 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 232668 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00002 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 1.00001 1.00003 0.99995 1.00000 0.99996 0.99999 0.99999 0.99999 1.00002 0.99998 1.00000 0.99999 1.00003 0.99999 0.99996 1.00001 1.00001 1.00000 1.00002 0.99999 0.99999 0.99998 0.99995 0.99998 0.99998 0.99996 0.99999 1.00001 0.99997 1.00003 1.00002 1.00000 0.99999 0.99999 0.99997 0.99996 1.00000 1.00001 1.00000 0.99997 1.00002 0.99999 1.00002 0.99997 0.99997 0.99996 0.99996 0.99999 1.00001 1.00000 1.00003 1.00002 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 0.99998 1.00000 0.99998 0.99998 0.99997 1.00004 0.99999 0.99999 1.00002 0.99992 0.99998 1.00005 1.00004 0.99999 0.99999 1.00000 0.99997 1.00000 1.00002 1.00002 1.00000 1.00002 1.00001 0.99997 0.99998 0.99998 1.00002 1.00001 1.00003 0.99999 1.00002 1.00001 0.99998 1.00001 1.00000 1.00000 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3:-0.000 0.000 Vector 4:-0.000 0.000 0.000 Vector 5:-0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 6: 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 7: 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 8: 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 9:-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 10:-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2605111523081729925.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2605111523081729925.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2605111523081729925.atom Openam> file on opening on unit 11: 2605111523081729925.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 1657 First residue number = 1 Last residue number = 1657 Number of atoms found = 12926 Mean number per residue = 7.8 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9925E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9991E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9996E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9999E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.1319E-04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.0942E-04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0889E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.3720E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.0555E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.4817E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.6143E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.2613E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.3405E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.4843E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.7705E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.1329E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.7205E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.2171E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.8767E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.1106E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.0991E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.3304E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.9403E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.4358E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.6467E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1060 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1143 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1292 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1393 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1422 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1673 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1755 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1951 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2069 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2487 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2596 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2726 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2787 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2858 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3130 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3338 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3654 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3902 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4079 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4443 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4638 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5023 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5665 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6805 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6882 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7186 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7372 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7558 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7670 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9182 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9395 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9859 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.084 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.122 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.132 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.173 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.281 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.316 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.338 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.355 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.498 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.574 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.613 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.646 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.666 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.702 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.770 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.902 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.026 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.202 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.235 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.246 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.489 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.534 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.618 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.742 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.838 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.970 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.127 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.144 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.283 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.371 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.446 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.462 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.639 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.746 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.794 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.035 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.170 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.237 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.483 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.521 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.605 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.630 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.663 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.815 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.974 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.984 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.081 Bfactors> 106 vectors, 38778 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.000113 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= -0.451 for 1657 C-alpha atoms. Bfactors> = 16.997 +/- 67.23 Bfactors> = 74.045 +/- 25.58 Bfactors> Shiftng-fct= 57.049 Bfactors> Scaling-fct= 0.380 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2605111523081729925.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2605111523081729925.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4325E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1.155 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 2.451 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.583 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 4.022 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 4.923 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 6.407 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 8.136 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 10.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 12.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 13.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 14.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 15.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 17.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 19.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 21.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 24.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 26.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 29.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 32.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 33.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 33.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 35.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 36.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 39.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 40.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 40.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 44.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 45.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 47.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 49.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 54.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 55.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 56.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 57.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 58.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 60.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 62.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 65.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 67.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 69.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 72.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 73.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 76.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 81.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 89.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 90.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 92.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 93.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 94.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 95.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 104.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 105.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur 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Chkmod> That is: 12926 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 35 is: 0.9998 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 76 is: 1.0001 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 80 is: 0.9998 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 83 is: 1.0001 (instead of 1.0000). Chkmod> Normal end. 0.0034 0.7583 0.0034 0.9580 0.0034 0.7959 0.0034 0.7959 0.0034 0.9763 0.0034 0.7849 1.1553 0.0890 2.4508 0.0737 3.5832 0.1045 4.0221 0.0579 4.9231 0.0659 6.4073 0.0494 8.1363 0.0387 10.4499 0.0558 12.5722 0.0456 13.2293 0.0534 14.4486 0.0946 15.8585 0.4641 17.9102 0.1260 19.4764 0.0879 21.3800 0.0175 24.5478 0.4073 26.8170 0.1087 29.3995 0.0954 32.4678 0.2006 33.3554 0.0937 33.7261 0.0775 35.3533 0.1327 36.7113 0.1194 39.0308 0.1101 40.5277 0.0718 40.9474 0.0918 44.4145 0.1753 45.4899 0.0976 47.9629 0.0330 49.3920 0.5477 54.1520 0.0152 55.3260 0.1075 56.6943 0.1098 57.3251 0.1879 58.0507 0.1046 60.7504 0.2375 62.7364 0.0999 65.6388 0.4494 67.8298 0.0459 69.3511 0.0509 72.3794 0.0261 73.9507 0.0482 76.9588 0.0421 81.7291 0.0737 89.5758 0.3263 90.0812 0.0342 92.0492 0.2762 93.2329 0.0392 94.4018 0.0673 95.0986 0.1040 104.0508 0.0447 105.2507 0.0248 107.8184 0.0172 113.0554 0.0238 115.0199 0.1491 115.5314 0.0522 117.6050 0.0261 122.8998 0.3008 124.5675 0.1064 125.6044 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DQ=-100 2605111523081729925.eigenfacs 2605111523081729925.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2605111523081729925.eigenfacs 2605111523081729925.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2605111523081729925.eigenfacs 2605111523081729925.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2605111523081729925.eigenfacs 2605111523081729925.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2605111523081729925.eigenfacs 2605111523081729925.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2605111523081729925.eigenfacs 2605111523081729925.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2605111523081729925.eigenfacs 2605111523081729925.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2605111523081729925.eigenfacs 2605111523081729925.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2605111523081729925.eigenfacs 2605111523081729925.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2605111523081729925.eigenfacs 2605111523081729925.atom calculating perturbed structure for DQ=100 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running: ../../bin/get_modes.sh 2605111523081729925 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 2605111523081729925.eigenfacs 2605111523081729925.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2605111523081729925.eigenfacs 2605111523081729925.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2605111523081729925.eigenfacs 2605111523081729925.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2605111523081729925.eigenfacs 2605111523081729925.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2605111523081729925.eigenfacs 2605111523081729925.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2605111523081729925.eigenfacs 2605111523081729925.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2605111523081729925.eigenfacs 2605111523081729925.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2605111523081729925.eigenfacs 2605111523081729925.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2605111523081729925.eigenfacs 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