CNRS Nantes University US2B US2B
home |  start a new run |  job status |  references&downloads |  examples |  help  

Should you encounter any unexpected behaviour,
please let us know.
elNémo has been relocated.
**Some cleaning from time to time**
Sorry for the inconvenience.


***  rhamnosidase_6gsz  ***

LOGs for ID: 2606171002082554050

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2606171002082554050.atom Pdbmat> Distance cutoff = 5.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2606171002082554050.atom to be opened. Openam> File opened: 2606171002082554050.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 871 First residue number = 1 Last residue number = 871 Number of atoms found = 6867 Mean number per residue = 7.9 Pdbmat> Coordinate statistics: = -0.473328 +/- 17.552220 From: -46.777000 To: 38.971000 = -0.351447 +/- 13.846509 From: -32.688000 To: 37.818000 = 1.098818 +/- 17.120890 From: -41.562000 To: 37.840000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 0.3695 % Filled. Pdbmat> 784203 non-zero elements. Pdbmat> 82574 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 24.05 +/- 6.22 Maximum number = 41 Minimum number = 3 Pdbmat> Matrix trace = 1.651480E+06 Pdbmat> Larger element = 166.999 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 871 non-zero elements, NRBL set to 5 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2606171002082554050.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 5 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2606171002082554050.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2606171002082554050.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 6867 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 5 residue(s) per block. Blocpdb> 871 residues. Blocpdb> 35 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 38 atoms in block 2 Block first atom: 36 Blocpdb> 47 atoms in block 3 Block first atom: 74 Blocpdb> 29 atoms in block 4 Block first atom: 121 Blocpdb> 43 atoms in block 5 Block first atom: 150 Blocpdb> 49 atoms in block 6 Block first atom: 193 Blocpdb> 33 atoms in block 7 Block first atom: 242 Blocpdb> 51 atoms in block 8 Block first atom: 275 Blocpdb> 43 atoms in block 9 Block first atom: 326 Blocpdb> 36 atoms in block 10 Block first atom: 369 Blocpdb> 38 atoms in block 11 Block first atom: 405 Blocpdb> 43 atoms in block 12 Block first atom: 443 Blocpdb> 35 atoms in block 13 Block first atom: 486 Blocpdb> 41 atoms in block 14 Block first atom: 521 Blocpdb> 36 atoms in block 15 Block first atom: 562 Blocpdb> 34 atoms in block 16 Block first atom: 598 Blocpdb> 42 atoms in block 17 Block first atom: 632 Blocpdb> 33 atoms in block 18 Block first atom: 674 Blocpdb> 41 atoms in block 19 Block first atom: 707 Blocpdb> 40 atoms in block 20 Block first atom: 748 Blocpdb> 34 atoms in block 21 Block first atom: 788 Blocpdb> 38 atoms in block 22 Block first atom: 822 Blocpdb> 45 atoms in block 23 Block first atom: 860 Blocpdb> 33 atoms in block 24 Block first atom: 905 Blocpdb> 42 atoms in block 25 Block first atom: 938 Blocpdb> 37 atoms in block 26 Block first atom: 980 Blocpdb> 46 atoms in block 27 Block first atom: 1017 Blocpdb> 46 atoms in block 28 Block first atom: 1063 Blocpdb> 41 atoms in block 29 Block first atom: 1109 Blocpdb> 37 atoms in block 30 Block first atom: 1150 Blocpdb> 40 atoms in block 31 Block first atom: 1187 Blocpdb> 38 atoms in block 32 Block first atom: 1227 Blocpdb> 44 atoms in block 33 Block first atom: 1265 Blocpdb> 40 atoms in block 34 Block first atom: 1309 Blocpdb> 31 atoms in block 35 Block first atom: 1349 Blocpdb> 50 atoms in block 36 Block first atom: 1380 Blocpdb> 54 atoms in block 37 Block first atom: 1430 Blocpdb> 42 atoms in block 38 Block first atom: 1484 Blocpdb> 40 atoms in block 39 Block first atom: 1526 Blocpdb> 33 atoms in block 40 Block first atom: 1566 Blocpdb> 33 atoms in block 41 Block first atom: 1599 Blocpdb> 43 atoms in block 42 Block first atom: 1632 Blocpdb> 33 atoms in block 43 Block first atom: 1675 Blocpdb> 37 atoms in block 44 Block first atom: 1708 Blocpdb> 43 atoms in block 45 Block first atom: 1745 Blocpdb> 35 atoms in block 46 Block first atom: 1788 Blocpdb> 37 atoms in block 47 Block first atom: 1823 Blocpdb> 37 atoms in block 48 Block first atom: 1860 Blocpdb> 39 atoms in block 49 Block first atom: 1897 Blocpdb> 35 atoms in block 50 Block first atom: 1936 Blocpdb> 41 atoms in block 51 Block first atom: 1971 Blocpdb> 34 atoms in block 52 Block first atom: 2012 Blocpdb> 41 atoms in block 53 Block first atom: 2046 Blocpdb> 42 atoms in block 54 Block first atom: 2087 Blocpdb> 42 atoms in block 55 Block first atom: 2129 Blocpdb> 42 atoms in block 56 Block first atom: 2171 Blocpdb> 39 atoms in block 57 Block first atom: 2213 Blocpdb> 39 atoms in block 58 Block first atom: 2252 Blocpdb> 38 atoms in block 59 Block first atom: 2291 Blocpdb> 42 atoms in block 60 Block first atom: 2329 Blocpdb> 37 atoms in block 61 Block first atom: 2371 Blocpdb> 33 atoms in block 62 Block first atom: 2408 Blocpdb> 43 atoms in block 63 Block first atom: 2441 Blocpdb> 40 atoms in block 64 Block first atom: 2484 Blocpdb> 35 atoms in block 65 Block first atom: 2524 Blocpdb> 33 atoms in block 66 Block first atom: 2559 Blocpdb> 40 atoms in block 67 Block first atom: 2592 Blocpdb> 41 atoms in block 68 Block first atom: 2632 Blocpdb> 45 atoms in block 69 Block first atom: 2673 Blocpdb> 33 atoms in block 70 Block first atom: 2718 Blocpdb> 46 atoms in block 71 Block first atom: 2751 Blocpdb> 40 atoms in block 72 Block first atom: 2797 Blocpdb> 38 atoms in block 73 Block first atom: 2837 Blocpdb> 37 atoms in block 74 Block first atom: 2875 Blocpdb> 42 atoms in block 75 Block first atom: 2912 Blocpdb> 41 atoms in block 76 Block first atom: 2954 Blocpdb> 34 atoms in block 77 Block first atom: 2995 Blocpdb> 43 atoms in block 78 Block first atom: 3029 Blocpdb> 40 atoms in block 79 Block first atom: 3072 Blocpdb> 48 atoms in block 80 Block first atom: 3112 Blocpdb> 43 atoms in block 81 Block first atom: 3160 Blocpdb> 38 atoms in block 82 Block first atom: 3203 Blocpdb> 39 atoms in block 83 Block first atom: 3241 Blocpdb> 33 atoms in block 84 Block first atom: 3280 Blocpdb> 38 atoms in block 85 Block first atom: 3313 Blocpdb> 43 atoms in block 86 Block first atom: 3351 Blocpdb> 42 atoms in block 87 Block first atom: 3394 Blocpdb> 37 atoms in block 88 Block first atom: 3436 Blocpdb> 42 atoms in block 89 Block first atom: 3473 Blocpdb> 44 atoms in block 90 Block first atom: 3515 Blocpdb> 42 atoms in block 91 Block first atom: 3559 Blocpdb> 39 atoms in block 92 Block first atom: 3601 Blocpdb> 41 atoms in block 93 Block first atom: 3640 Blocpdb> 40 atoms in block 94 Block first atom: 3681 Blocpdb> 41 atoms in block 95 Block first atom: 3721 Blocpdb> 43 atoms in block 96 Block first atom: 3762 Blocpdb> 39 atoms in block 97 Block first atom: 3805 Blocpdb> 36 atoms in block 98 Block first atom: 3844 Blocpdb> 49 atoms in block 99 Block first atom: 3880 Blocpdb> 41 atoms in block 100 Block first atom: 3929 Blocpdb> 40 atoms in block 101 Block first atom: 3970 Blocpdb> 42 atoms in block 102 Block first atom: 4010 Blocpdb> 41 atoms in block 103 Block first atom: 4052 Blocpdb> 38 atoms in block 104 Block first atom: 4093 Blocpdb> 34 atoms in block 105 Block first atom: 4131 Blocpdb> 40 atoms in block 106 Block first atom: 4165 Blocpdb> 31 atoms in block 107 Block first atom: 4205 Blocpdb> 50 atoms in block 108 Block first atom: 4236 Blocpdb> 38 atoms in block 109 Block first atom: 4286 Blocpdb> 41 atoms in block 110 Block first atom: 4324 Blocpdb> 38 atoms in block 111 Block first atom: 4365 Blocpdb> 43 atoms in block 112 Block first atom: 4403 Blocpdb> 36 atoms in block 113 Block first atom: 4446 Blocpdb> 38 atoms in block 114 Block first atom: 4482 Blocpdb> 47 atoms in block 115 Block first atom: 4520 Blocpdb> 46 atoms in block 116 Block first atom: 4567 Blocpdb> 45 atoms in block 117 Block first atom: 4613 Blocpdb> 34 atoms in block 118 Block first atom: 4658 Blocpdb> 32 atoms in block 119 Block first atom: 4692 Blocpdb> 43 atoms in block 120 Block first atom: 4724 Blocpdb> 34 atoms in block 121 Block first atom: 4767 Blocpdb> 44 atoms in block 122 Block first atom: 4801 Blocpdb> 36 atoms in block 123 Block first atom: 4845 Blocpdb> 35 atoms in block 124 Block first atom: 4881 Blocpdb> 36 atoms in block 125 Block first atom: 4916 Blocpdb> 40 atoms in block 126 Block first atom: 4952 Blocpdb> 45 atoms in block 127 Block first atom: 4992 Blocpdb> 42 atoms in block 128 Block first atom: 5037 Blocpdb> 48 atoms in block 129 Block first atom: 5079 Blocpdb> 33 atoms in block 130 Block first atom: 5127 Blocpdb> 37 atoms in block 131 Block first atom: 5160 Blocpdb> 35 atoms in block 132 Block first atom: 5197 Blocpdb> 40 atoms in block 133 Block first atom: 5232 Blocpdb> 45 atoms in block 134 Block first atom: 5272 Blocpdb> 34 atoms in block 135 Block first atom: 5317 Blocpdb> 34 atoms in block 136 Block first atom: 5351 Blocpdb> 42 atoms in block 137 Block first atom: 5385 Blocpdb> 42 atoms in block 138 Block first atom: 5427 Blocpdb> 39 atoms in block 139 Block first atom: 5469 Blocpdb> 31 atoms in block 140 Block first atom: 5508 Blocpdb> 40 atoms in block 141 Block first atom: 5539 Blocpdb> 42 atoms in block 142 Block first atom: 5579 Blocpdb> 32 atoms in block 143 Block first atom: 5621 Blocpdb> 45 atoms in block 144 Block first atom: 5653 Blocpdb> 43 atoms in block 145 Block first atom: 5698 Blocpdb> 47 atoms in block 146 Block first atom: 5741 Blocpdb> 39 atoms in block 147 Block first atom: 5788 Blocpdb> 39 atoms in block 148 Block first atom: 5827 Blocpdb> 48 atoms in block 149 Block first atom: 5866 Blocpdb> 35 atoms in block 150 Block first atom: 5914 Blocpdb> 33 atoms in block 151 Block first atom: 5949 Blocpdb> 41 atoms in block 152 Block first atom: 5982 Blocpdb> 42 atoms in block 153 Block first atom: 6023 Blocpdb> 27 atoms in block 154 Block first atom: 6065 Blocpdb> 48 atoms in block 155 Block first atom: 6092 Blocpdb> 30 atoms in block 156 Block first atom: 6140 Blocpdb> 32 atoms in block 157 Block first atom: 6170 Blocpdb> 52 atoms in block 158 Block first atom: 6202 Blocpdb> 38 atoms in block 159 Block first atom: 6254 Blocpdb> 33 atoms in block 160 Block first atom: 6292 Blocpdb> 36 atoms in block 161 Block first atom: 6325 Blocpdb> 45 atoms in block 162 Block first atom: 6361 Blocpdb> 30 atoms in block 163 Block first atom: 6406 Blocpdb> 53 atoms in block 164 Block first atom: 6436 Blocpdb> 36 atoms in block 165 Block first atom: 6489 Blocpdb> 33 atoms in block 166 Block first atom: 6525 Blocpdb> 41 atoms in block 167 Block first atom: 6558 Blocpdb> 38 atoms in block 168 Block first atom: 6599 Blocpdb> 37 atoms in block 169 Block first atom: 6637 Blocpdb> 35 atoms in block 170 Block first atom: 6674 Blocpdb> 33 atoms in block 171 Block first atom: 6709 Blocpdb> 29 atoms in block 172 Block first atom: 6742 Blocpdb> 48 atoms in block 173 Block first atom: 6771 Blocpdb> 40 atoms in block 174 Block first atom: 6819 Blocpdb> 9 atoms in block 175 Block first atom: 6858 Blocpdb> 175 blocks. Blocpdb> At most, 54 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 9 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 784378 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 20601 Prepmat> Matrix trace = 1651480.0000 Prepmat> Last element read: 20601 20601 19.3467 Prepmat> 15401 lines saved. Prepmat> 14297 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 6867 RTB> Total mass = 6867.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 6867 RTB> Number of blocks = 175 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 40513.8704 RTB> 37083 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1050 Diagstd> Nb of non-zero elements: 37083 Diagstd> Projected matrix trace = 40513.8704 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1050 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 40513.8704 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.1790341 0.2086354 0.3248932 0.3776200 0.4169001 0.4672224 0.6110396 0.6510527 0.7636416 0.8499771 0.8939567 1.0464986 1.1279002 1.2042440 1.2666485 1.2883423 1.3121901 1.3782632 1.4826191 1.6179999 1.7867452 1.8896906 1.9115695 1.9677005 1.9886134 2.1004305 2.2067825 2.3081730 2.3911992 2.4368956 2.5536083 2.6428469 2.7480940 2.8675256 2.9589265 2.9698827 3.0599945 3.1554971 3.2012646 3.2602931 3.3242367 3.4060500 3.4733025 3.5047349 3.6538872 3.7423038 3.8344309 3.9078345 3.9401541 4.0158725 4.1250008 4.1471712 4.3361454 4.3924871 4.4395268 4.5062743 4.5625731 4.6438669 4.6796309 4.8001424 4.8224384 4.9163309 4.9432144 5.0109565 5.0927098 5.1438364 5.2709724 5.3142670 5.4138553 5.4266448 5.5084702 5.5132134 5.6419296 5.7047117 5.7384871 5.7870557 5.8809362 5.9442856 6.0649097 6.1258484 6.1734741 6.2710485 6.3668334 6.4263043 6.4930517 6.6288695 6.6713473 6.7643840 6.7774680 6.8580382 6.9419087 6.9677500 7.0368076 7.1531066 7.1923604 7.2217026 7.2635719 7.3606280 7.4105464 7.4858808 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034335 0.0034336 0.0034337 0.0034338 0.0034340 0.0034342 45.9476378 49.6008658 61.8964305 66.7302503 70.1150592 74.2261807 84.8848063 87.6200182 94.8942879 100.1149386 102.6723543 111.0873520 115.3269006 119.1660439 122.2146696 123.2568049 124.3923442 127.4856665 132.2239346 138.1288908 145.1531942 149.2762211 150.1378962 152.3262598 153.1335898 157.3799632 161.3151107 164.9793025 167.9202825 169.5171906 173.5291428 176.5351868 180.0159870 183.8861143 186.7937625 187.1392692 189.9571302 192.8986425 194.2925142 196.0756234 197.9890854 200.4106482 202.3795297 203.2932068 207.5739499 210.0703696 212.6403781 214.6660477 215.5519133 217.6132027 220.5501206 221.1420159 226.1242806 227.5886116 228.8040041 230.5176012 231.9531090 234.0104011 234.9097703 237.9152829 238.4671842 240.7774621 241.4348757 243.0835652 245.0584859 246.2855065 249.3105457 250.3323442 252.6670462 252.9653165 254.8653432 254.9750488 257.9343090 259.3654549 260.1321217 261.2306375 263.3410204 264.7555750 267.4283524 268.7685216 269.8112763 271.9351573 274.0040756 275.2808006 276.7067223 279.5857377 280.4801005 282.4290781 282.7020886 284.3774979 286.1111153 286.6431456 288.0601072 290.4307726 291.2265743 291.8200179 292.6647379 294.6135479 295.6108671 297.1096335 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 6867 Rtb_to_modes> Number of blocs = 175 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9974E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9978E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9985E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9991E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1790 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2086 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3249 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3776 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4169 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4672 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6110 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6511 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7636 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8500 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8940 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.046 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.128 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.204 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.267 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.288 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.312 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.378 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.483 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.618 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.787 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.890 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.912 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.968 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.989 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.100 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.207 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.308 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.391 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.437 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.554 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.643 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.748 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.868 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.959 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.970 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.060 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.155 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.201 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.260 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.324 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.406 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.473 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.505 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.654 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.742 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.834 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.908 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.940 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.016 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.125 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.147 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.336 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.392 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.440 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.506 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.563 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.644 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.680 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.800 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.822 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.916 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.943 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.011 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.093 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.144 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.271 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.314 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.414 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.427 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.508 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.513 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.642 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.705 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.738 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.787 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.881 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.944 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.065 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.126 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.173 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.271 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.367 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.426 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.493 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.629 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.671 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.764 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.777 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.858 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.942 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.968 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.037 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.153 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.192 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.222 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.264 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.361 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.411 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.486 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1050 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 0.99999 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00002 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 0.99998 1.00001 1.00000 1.00001 0.99998 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 0.99998 1.00000 0.99998 1.00000 0.99998 1.00000 1.00002 1.00000 1.00002 1.00002 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 1.00002 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00002 1.00001 0.99997 0.99998 0.99999 1.00002 0.99998 1.00001 0.99999 1.00001 1.00002 1.00002 1.00001 0.99998 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000 1.00002 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00002 1.00001 1.00001 1.00002 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 1.00002 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 0.99999 0.99998 0.99999 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 123606 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 0.99999 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00002 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 0.99998 1.00001 1.00000 1.00001 0.99998 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 0.99998 1.00000 0.99998 1.00000 0.99998 1.00000 1.00002 1.00000 1.00002 1.00002 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 1.00002 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00002 1.00001 0.99997 0.99998 0.99999 1.00002 0.99998 1.00001 0.99999 1.00001 1.00002 1.00002 1.00001 0.99998 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000 1.00002 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00002 1.00001 1.00001 1.00002 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 1.00002 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 0.99999 0.99998 0.99999 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3:-0.000 0.000 Vector 4: 0.000 0.000-0.000 Vector 5: 0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 6:-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 7:-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 8:-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 9:-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 10: 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2606171002082554050.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2606171002082554050.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2606171002082554050.atom Openam> file on opening on unit 11: 2606171002082554050.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 871 First residue number = 1 Last residue number = 871 Number of atoms found = 6867 Mean number per residue = 7.9 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9974E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9978E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9985E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9991E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1790 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2086 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3249 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3776 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4169 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4672 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6110 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6511 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7636 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8500 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8940 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.046 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.128 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.204 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.267 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.288 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.312 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.378 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.483 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.618 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.787 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.890 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.912 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.968 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.989 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.100 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.207 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.308 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.391 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.437 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.554 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.643 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.748 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.868 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.959 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.970 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.060 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.155 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.201 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.260 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.324 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.406 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.473 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.505 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.654 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.742 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.834 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.908 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.940 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.016 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.125 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.147 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.336 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.392 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.440 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.506 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.563 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.644 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.680 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.800 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.822 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.916 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.943 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.011 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.093 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.144 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.271 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.314 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.414 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.427 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.508 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.513 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.642 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.705 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.738 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.787 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.881 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.944 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.065 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.126 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.173 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.271 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.367 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.426 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.493 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.629 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.671 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.764 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.777 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.858 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.942 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.968 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.037 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.153 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.192 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.222 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.264 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.361 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.411 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.486 Bfactors> 106 vectors, 20601 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.179000 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= -0.624 for 871 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.121 +/- 0.13 Bfactors> = 96.313 +/- 4.16 Bfactors> Shiftng-fct= 96.193 Bfactors> Scaling-fct= 32.760 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2606171002082554050.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2606171002082554050.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4334E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4334E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 45.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 49.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 61.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 66.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 70.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 74.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 84.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 87.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 94.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 100.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 102.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 111.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 115.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 119.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 122.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 123.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 124.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 127.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 132.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 138.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 145.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 149.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 150.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 152.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 153.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 157.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 161.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 165.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 167.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 169.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 173.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 176.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 180.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 183.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 186.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 187.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 189.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 192.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 194.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 196.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 198.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 200.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 202.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 203.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 207.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 210.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 212.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 214.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 215.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 217.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 220.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 221.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 226.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 227.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 228.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 230.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 232.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 234.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 234.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 237.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 238.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 240.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 241.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 243.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 245.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 246.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 249.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 250.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 252.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 253.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 254.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 255.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 257.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 259.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 260.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 261.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 263.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 264.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 267.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 268.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 269.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 271.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 274.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 275.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 276.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 279.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 280.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 282.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 282.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 284.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 286.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 286.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 288.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 290.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 291.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 291.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 292.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 294.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 295.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 297.1 Chkmod> 106 vectors, 20601 coordinates in file. Chkmod> That is: 6867 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. Chkmod> Normal end. 0.0034 0.7320 0.0034 0.7509 0.0034 0.9685 0.0034 0.8279 0.0034 0.9274 0.0034 0.7257 45.9413 0.3901 49.5945 0.4503 61.8944 0.5536 66.7256 0.4215 70.1120 0.6240 74.2212 0.4833 84.8784 0.3940 87.6194 0.2218 94.8876 0.4934 100.1120 0.5808 102.6704 0.4411 111.0561 0.5337 115.3271 0.5796 119.1489 0.4249 122.2264 0.4217 123.2351 0.6200 124.3780 0.4186 127.4680 0.4899 132.2352 0.3489 138.1230 0.4817 145.1573 0.6710 149.2820 0.3017 150.1484 0.4623 152.3313 0.3528 153.1419 0.4075 157.3571 0.6531 161.3161 0.4655 164.9660 0.3804 167.9061 0.2355 169.5135 0.3389 173.5350 0.5257 176.5327 0.5047 180.0052 0.3422 183.8934 0.5253 186.7881 0.4517 187.1349 0.4086 189.9491 0.4727 192.8752 0.4386 194.2761 0.4038 196.0584 0.5127 197.9735 0.4499 200.4006 0.3811 202.3620 0.4217 203.2922 0.4424 207.5682 0.3882 210.0528 0.3384 212.6193 0.3772 214.6614 0.4793 215.5384 0.4892 217.6073 0.2347 220.5406 0.4954 221.1280 0.4700 226.1108 0.5276 227.5662 0.5049 228.8064 0.4583 230.5007 0.5170 231.9540 0.4234 234.0037 0.5068 234.9089 0.4544 237.9015 0.5220 238.4461 0.4738 240.7590 0.3234 241.4193 0.5082 243.0742 0.5459 245.0549 0.4889 246.2788 0.4952 249.3005 0.4640 250.3153 0.5313 252.6596 0.5190 252.9627 0.4376 254.8435 0.5609 254.9592 0.4931 257.9248 0.4318 259.3609 0.5404 260.1099 0.4732 261.2182 0.5425 263.3311 0.5136 264.7378 0.5736 267.4189 0.6193 268.7603 0.5668 269.7893 0.3090 271.9224 0.4300 273.9959 0.6168 275.2625 0.3702 276.6937 0.4799 279.5765 0.4959 280.4608 0.5110 282.4089 0.5235 282.6802 0.3913 284.3645 0.5211 286.1007 0.5133 286.6360 0.2753 288.0517 0.4657 290.4161 0.5191 291.2068 0.4115 291.8135 0.5593 292.6608 0.5183 294.6083 0.4476 295.6072 0.5150 297.0992 0.5248 getting mode 7 running: ../../bin/get_modes.sh 2606171002082554050 7 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 7 calculating perturbed structure for DQ=-100 2606171002082554050.eigenfacs 2606171002082554050.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2606171002082554050.eigenfacs 2606171002082554050.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2606171002082554050.eigenfacs 2606171002082554050.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2606171002082554050.eigenfacs 2606171002082554050.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2606171002082554050.eigenfacs 2606171002082554050.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2606171002082554050.eigenfacs 2606171002082554050.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2606171002082554050.eigenfacs 2606171002082554050.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2606171002082554050.eigenfacs 2606171002082554050.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2606171002082554050.eigenfacs 2606171002082554050.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2606171002082554050.eigenfacs 2606171002082554050.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2606171002082554050.eigenfacs 2606171002082554050.atom making animated gifs 11 models are in 2606171002082554050.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2606171002082554050.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2606171002082554050.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 2606171002082554050 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 2606171002082554050.eigenfacs 2606171002082554050.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2606171002082554050.eigenfacs 2606171002082554050.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2606171002082554050.eigenfacs 2606171002082554050.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2606171002082554050.eigenfacs 2606171002082554050.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2606171002082554050.eigenfacs 2606171002082554050.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2606171002082554050.eigenfacs 2606171002082554050.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2606171002082554050.eigenfacs 2606171002082554050.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2606171002082554050.eigenfacs 2606171002082554050.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2606171002082554050.eigenfacs 2606171002082554050.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2606171002082554050.eigenfacs 2606171002082554050.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2606171002082554050.eigenfacs 2606171002082554050.atom making animated gifs 11 models are in 2606171002082554050.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2606171002082554050.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2606171002082554050.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 2606171002082554050 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 2606171002082554050.eigenfacs 2606171002082554050.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2606171002082554050.eigenfacs 2606171002082554050.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2606171002082554050.eigenfacs 2606171002082554050.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2606171002082554050.eigenfacs 2606171002082554050.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2606171002082554050.eigenfacs 2606171002082554050.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2606171002082554050.eigenfacs 2606171002082554050.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2606171002082554050.eigenfacs 2606171002082554050.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2606171002082554050.eigenfacs 2606171002082554050.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2606171002082554050.eigenfacs 2606171002082554050.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2606171002082554050.eigenfacs 2606171002082554050.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2606171002082554050.eigenfacs 2606171002082554050.atom making animated gifs 11 models are in 2606171002082554050.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2606171002082554050.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2606171002082554050.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 2606171002082554050 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 2606171002082554050.eigenfacs 2606171002082554050.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2606171002082554050.eigenfacs 2606171002082554050.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2606171002082554050.eigenfacs 2606171002082554050.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2606171002082554050.eigenfacs 2606171002082554050.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2606171002082554050.eigenfacs 2606171002082554050.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2606171002082554050.eigenfacs 2606171002082554050.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2606171002082554050.eigenfacs 2606171002082554050.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2606171002082554050.eigenfacs 2606171002082554050.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2606171002082554050.eigenfacs 2606171002082554050.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2606171002082554050.eigenfacs 2606171002082554050.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2606171002082554050.eigenfacs 2606171002082554050.atom making animated gifs 11 models are in 2606171002082554050.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2606171002082554050.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2606171002082554050.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 2606171002082554050 11 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-100 2606171002082554050.eigenfacs 2606171002082554050.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2606171002082554050.eigenfacs 2606171002082554050.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2606171002082554050.eigenfacs 2606171002082554050.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2606171002082554050.eigenfacs 2606171002082554050.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2606171002082554050.eigenfacs 2606171002082554050.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2606171002082554050.eigenfacs 2606171002082554050.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2606171002082554050.eigenfacs 2606171002082554050.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2606171002082554050.eigenfacs 2606171002082554050.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2606171002082554050.eigenfacs 2606171002082554050.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2606171002082554050.eigenfacs 2606171002082554050.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2606171002082554050.eigenfacs 2606171002082554050.atom making animated gifs 11 models are in 2606171002082554050.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2606171002082554050.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2606171002082554050.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 2606171002082554050.10.pdb 2606171002082554050.11.pdb 2606171002082554050.7.pdb 2606171002082554050.8.pdb 2606171002082554050.9.pdb STDERR: Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL real 0m29.302s user 0m29.143s sys 0m0.126s rm: cannot remove '2606171002082554050.sdijf': No such file or directory pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format




If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:

elNémo is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Between 2015 and 2025, it was hosted by US2B (Nantes).
Last modification: april 24th, 2026.