CNRS Nantes University US2B US2B
home |  start a new run |  job status |  references&downloads |  examples |  help  

Should you encounter any unexpected behaviour,
please let us know.
elNémo has been relocated.
**Some cleaning from time to time**
Sorry for the inconvenience.


***    ***

LOGs for ID: 2606181404432809667

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2606181404432809667.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2606181404432809667.atom to be opened. Openam> File opened: 2606181404432809667.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 381 First residue number = 4 Last residue number = 384 Number of atoms found = 2827 Mean number per residue = 7.4 Pdbmat> Coordinate statistics: = 9.299395 +/- 11.322530 From: -18.136000 To: 31.506000 = 5.440450 +/- 11.836661 From: -25.235000 To: 31.572000 = 1.345299 +/- 12.956108 From: -30.629000 To: 33.439000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 2.9139 % Filled. Pdbmat> 1048079 non-zero elements. Pdbmat> 114588 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 81.07 +/- 20.88 Maximum number = 127 Minimum number = 13 Pdbmat> Matrix trace = 2.291760E+06 Pdbmat> Larger element = 498.691 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 381 non-zero elements, NRBL set to 2 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2606181404432809667.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 2 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2606181404432809667.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2606181404432809667.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 2827 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 2 residue(s) per block. Blocpdb> 381 residues. Blocpdb> 10 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 13 atoms in block 2 Block first atom: 11 Blocpdb> 12 atoms in block 3 Block first atom: 24 Blocpdb> 16 atoms in block 4 Block first atom: 36 Blocpdb> 11 atoms in block 5 Block first atom: 52 Blocpdb> 19 atoms in block 6 Block first atom: 63 Blocpdb> 12 atoms in block 7 Block first atom: 82 Blocpdb> 11 atoms in block 8 Block first atom: 94 Blocpdb> 18 atoms in block 9 Block first atom: 105 Blocpdb> 19 atoms in block 10 Block first atom: 123 Blocpdb> 11 atoms in block 11 Block first atom: 142 Blocpdb> 16 atoms in block 12 Block first atom: 153 Blocpdb> 16 atoms in block 13 Block first atom: 169 Blocpdb> 13 atoms in block 14 Block first atom: 185 Blocpdb> 17 atoms in block 15 Block first atom: 198 Blocpdb> 12 atoms in block 16 Block first atom: 215 Blocpdb> 18 atoms in block 17 Block first atom: 227 Blocpdb> 14 atoms in block 18 Block first atom: 245 Blocpdb> 18 atoms in block 19 Block first atom: 259 Blocpdb> 12 atoms in block 20 Block first atom: 277 Blocpdb> 18 atoms in block 21 Block first atom: 289 Blocpdb> 15 atoms in block 22 Block first atom: 307 Blocpdb> 20 atoms in block 23 Block first atom: 322 Blocpdb> 16 atoms in block 24 Block first atom: 342 Blocpdb> 12 atoms in block 25 Block first atom: 358 Blocpdb> 10 atoms in block 26 Block first atom: 370 Blocpdb> 17 atoms in block 27 Block first atom: 380 Blocpdb> 16 atoms in block 28 Block first atom: 397 Blocpdb> 13 atoms in block 29 Block first atom: 413 Blocpdb> 15 atoms in block 30 Block first atom: 426 Blocpdb> 17 atoms in block 31 Block first atom: 441 Blocpdb> 14 atoms in block 32 Block first atom: 458 Blocpdb> 19 atoms in block 33 Block first atom: 472 Blocpdb> 14 atoms in block 34 Block first atom: 491 Blocpdb> 19 atoms in block 35 Block first atom: 505 Blocpdb> 12 atoms in block 36 Block first atom: 524 Blocpdb> 17 atoms in block 37 Block first atom: 536 Blocpdb> 15 atoms in block 38 Block first atom: 553 Blocpdb> 15 atoms in block 39 Block first atom: 568 Blocpdb> 13 atoms in block 40 Block first atom: 583 Blocpdb> 14 atoms in block 41 Block first atom: 596 Blocpdb> 16 atoms in block 42 Block first atom: 610 Blocpdb> 18 atoms in block 43 Block first atom: 626 Blocpdb> 21 atoms in block 44 Block first atom: 644 Blocpdb> 17 atoms in block 45 Block first atom: 665 Blocpdb> 15 atoms in block 46 Block first atom: 682 Blocpdb> 16 atoms in block 47 Block first atom: 697 Blocpdb> 12 atoms in block 48 Block first atom: 713 Blocpdb> 14 atoms in block 49 Block first atom: 725 Blocpdb> 16 atoms in block 50 Block first atom: 739 Blocpdb> 16 atoms in block 51 Block first atom: 755 Blocpdb> 18 atoms in block 52 Block first atom: 771 Blocpdb> 13 atoms in block 53 Block first atom: 789 Blocpdb> 16 atoms in block 54 Block first atom: 802 Blocpdb> 11 atoms in block 55 Block first atom: 818 Blocpdb> 23 atoms in block 56 Block first atom: 829 Blocpdb> 16 atoms in block 57 Block first atom: 852 Blocpdb> 17 atoms in block 58 Block first atom: 868 Blocpdb> 12 atoms in block 59 Block first atom: 885 Blocpdb> 15 atoms in block 60 Block first atom: 897 Blocpdb> 15 atoms in block 61 Block first atom: 912 Blocpdb> 17 atoms in block 62 Block first atom: 927 Blocpdb> 16 atoms in block 63 Block first atom: 944 Blocpdb> 13 atoms in block 64 Block first atom: 960 Blocpdb> 14 atoms in block 65 Block first atom: 973 Blocpdb> 20 atoms in block 66 Block first atom: 987 Blocpdb> 16 atoms in block 67 Block first atom: 1007 Blocpdb> 14 atoms in block 68 Block first atom: 1023 Blocpdb> 15 atoms in block 69 Block first atom: 1037 Blocpdb> 12 atoms in block 70 Block first atom: 1052 Blocpdb> 15 atoms in block 71 Block first atom: 1064 Blocpdb> 14 atoms in block 72 Block first atom: 1079 Blocpdb> 17 atoms in block 73 Block first atom: 1093 Blocpdb> 19 atoms in block 74 Block first atom: 1110 Blocpdb> 14 atoms in block 75 Block first atom: 1129 Blocpdb> 20 atoms in block 76 Block first atom: 1143 Blocpdb> 14 atoms in block 77 Block first atom: 1163 Blocpdb> 14 atoms in block 78 Block first atom: 1177 Blocpdb> 13 atoms in block 79 Block first atom: 1191 Blocpdb> 11 atoms in block 80 Block first atom: 1204 Blocpdb> 13 atoms in block 81 Block first atom: 1215 Blocpdb> 12 atoms in block 82 Block first atom: 1228 Blocpdb> 15 atoms in block 83 Block first atom: 1240 Blocpdb> 19 atoms in block 84 Block first atom: 1255 Blocpdb> 16 atoms in block 85 Block first atom: 1274 Blocpdb> 17 atoms in block 86 Block first atom: 1290 Blocpdb> 14 atoms in block 87 Block first atom: 1307 Blocpdb> 10 atoms in block 88 Block first atom: 1321 Blocpdb> 13 atoms in block 89 Block first atom: 1331 Blocpdb> 17 atoms in block 90 Block first atom: 1344 Blocpdb> 12 atoms in block 91 Block first atom: 1361 Blocpdb> 13 atoms in block 92 Block first atom: 1373 Blocpdb> 11 atoms in block 93 Block first atom: 1386 Blocpdb> 8 atoms in block 94 Block first atom: 1397 Blocpdb> 17 atoms in block 95 Block first atom: 1405 Blocpdb> 15 atoms in block 96 Block first atom: 1422 Blocpdb> 16 atoms in block 97 Block first atom: 1437 Blocpdb> 19 atoms in block 98 Block first atom: 1453 Blocpdb> 12 atoms in block 99 Block first atom: 1472 Blocpdb> 8 atoms in block 100 Block first atom: 1484 Blocpdb> 18 atoms in block 101 Block first atom: 1492 Blocpdb> 15 atoms in block 102 Block first atom: 1510 Blocpdb> 14 atoms in block 103 Block first atom: 1525 Blocpdb> 15 atoms in block 104 Block first atom: 1539 Blocpdb> 16 atoms in block 105 Block first atom: 1554 Blocpdb> 12 atoms in block 106 Block first atom: 1570 Blocpdb> 19 atoms in block 107 Block first atom: 1582 Blocpdb> 16 atoms in block 108 Block first atom: 1601 Blocpdb> 11 atoms in block 109 Block first atom: 1617 Blocpdb> 12 atoms in block 110 Block first atom: 1628 Blocpdb> 12 atoms in block 111 Block first atom: 1640 Blocpdb> 15 atoms in block 112 Block first atom: 1652 Blocpdb> 12 atoms in block 113 Block first atom: 1667 Blocpdb> 13 atoms in block 114 Block first atom: 1679 Blocpdb> 19 atoms in block 115 Block first atom: 1692 Blocpdb> 16 atoms in block 116 Block first atom: 1711 Blocpdb> 19 atoms in block 117 Block first atom: 1727 Blocpdb> 15 atoms in block 118 Block first atom: 1746 Blocpdb> 21 atoms in block 119 Block first atom: 1761 Blocpdb> 16 atoms in block 120 Block first atom: 1782 Blocpdb> 20 atoms in block 121 Block first atom: 1798 Blocpdb> 18 atoms in block 122 Block first atom: 1818 Blocpdb> 15 atoms in block 123 Block first atom: 1836 Blocpdb> 10 atoms in block 124 Block first atom: 1851 Blocpdb> 16 atoms in block 125 Block first atom: 1861 Blocpdb> 11 atoms in block 126 Block first atom: 1877 Blocpdb> 13 atoms in block 127 Block first atom: 1888 Blocpdb> 16 atoms in block 128 Block first atom: 1901 Blocpdb> 18 atoms in block 129 Block first atom: 1917 Blocpdb> 19 atoms in block 130 Block first atom: 1935 Blocpdb> 18 atoms in block 131 Block first atom: 1954 Blocpdb> 11 atoms in block 132 Block first atom: 1972 Blocpdb> 20 atoms in block 133 Block first atom: 1983 Blocpdb> 14 atoms in block 134 Block first atom: 2003 Blocpdb> 18 atoms in block 135 Block first atom: 2017 Blocpdb> 11 atoms in block 136 Block first atom: 2035 Blocpdb> 10 atoms in block 137 Block first atom: 2046 Blocpdb> 12 atoms in block 138 Block first atom: 2056 Blocpdb> 10 atoms in block 139 Block first atom: 2068 Blocpdb> 14 atoms in block 140 Block first atom: 2078 Blocpdb> 16 atoms in block 141 Block first atom: 2092 Blocpdb> 13 atoms in block 142 Block first atom: 2108 Blocpdb> 20 atoms in block 143 Block first atom: 2121 Blocpdb> 12 atoms in block 144 Block first atom: 2141 Blocpdb> 19 atoms in block 145 Block first atom: 2153 Blocpdb> 19 atoms in block 146 Block first atom: 2172 Blocpdb> 13 atoms in block 147 Block first atom: 2191 Blocpdb> 18 atoms in block 148 Block first atom: 2204 Blocpdb> 10 atoms in block 149 Block first atom: 2222 Blocpdb> 20 atoms in block 150 Block first atom: 2232 Blocpdb> 17 atoms in block 151 Block first atom: 2252 Blocpdb> 12 atoms in block 152 Block first atom: 2269 Blocpdb> 16 atoms in block 153 Block first atom: 2281 Blocpdb> 22 atoms in block 154 Block first atom: 2297 Blocpdb> 13 atoms in block 155 Block first atom: 2319 Blocpdb> 17 atoms in block 156 Block first atom: 2332 Blocpdb> 14 atoms in block 157 Block first atom: 2349 Blocpdb> 15 atoms in block 158 Block first atom: 2363 Blocpdb> 13 atoms in block 159 Block first atom: 2378 Blocpdb> 13 atoms in block 160 Block first atom: 2391 Blocpdb> 12 atoms in block 161 Block first atom: 2404 Blocpdb> 11 atoms in block 162 Block first atom: 2416 Blocpdb> 9 atoms in block 163 Block first atom: 2427 Blocpdb> 17 atoms in block 164 Block first atom: 2436 Blocpdb> 18 atoms in block 165 Block first atom: 2453 Blocpdb> 15 atoms in block 166 Block first atom: 2471 Blocpdb> 15 atoms in block 167 Block first atom: 2486 Blocpdb> 8 atoms in block 168 Block first atom: 2501 Blocpdb> 13 atoms in block 169 Block first atom: 2509 Blocpdb> 19 atoms in block 170 Block first atom: 2522 Blocpdb> 13 atoms in block 171 Block first atom: 2541 Blocpdb> 16 atoms in block 172 Block first atom: 2554 Blocpdb> 13 atoms in block 173 Block first atom: 2570 Blocpdb> 17 atoms in block 174 Block first atom: 2583 Blocpdb> 19 atoms in block 175 Block first atom: 2600 Blocpdb> 17 atoms in block 176 Block first atom: 2619 Blocpdb> 9 atoms in block 177 Block first atom: 2636 Blocpdb> 13 atoms in block 178 Block first atom: 2645 Blocpdb> 14 atoms in block 179 Block first atom: 2658 Blocpdb> 14 atoms in block 180 Block first atom: 2672 Blocpdb> 15 atoms in block 181 Block first atom: 2686 Blocpdb> 17 atoms in block 182 Block first atom: 2701 Blocpdb> 12 atoms in block 183 Block first atom: 2718 Blocpdb> 17 atoms in block 184 Block first atom: 2730 Blocpdb> 9 atoms in block 185 Block first atom: 2747 Blocpdb> 12 atoms in block 186 Block first atom: 2756 Blocpdb> 14 atoms in block 187 Block first atom: 2768 Blocpdb> 13 atoms in block 188 Block first atom: 2782 Blocpdb> 16 atoms in block 189 Block first atom: 2795 Blocpdb> 12 atoms in block 190 Block first atom: 2811 Blocpdb> 5 atoms in block 191 Block first atom: 2822 Blocpdb> 191 blocks. Blocpdb> At most, 23 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 5 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 1048270 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 8481 Prepmat> Matrix trace = 2291760.0000 Prepmat> Last element read: 8481 8481 48.7058 Prepmat> 18337 lines saved. Prepmat> 16216 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 2827 RTB> Total mass = 2827.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 2827 RTB> Number of blocks = 191 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 263950.7176 RTB> 73455 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1146 Diagstd> Nb of non-zero elements: 73455 Diagstd> Projected matrix trace = 263950.7176 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1146 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 263950.7176 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 1.3791916 1.6755064 2.9061378 3.7096569 4.0218554 4.3478793 5.2358469 5.7351404 6.1221402 6.7971824 7.5633156 8.3515424 8.7524209 9.2902808 10.5857411 10.9530310 11.7473563 12.7611642 13.6018288 14.4425884 15.0365848 16.1246017 16.9467107 17.8112497 18.9417460 19.4807573 19.8039604 20.9972688 21.8337814 23.3388550 24.3592220 24.8429686 25.4759117 26.0887546 26.7809287 27.6622149 28.5148214 28.7539809 29.3930015 30.6851373 30.8279990 31.7018866 32.9133009 33.0199603 33.5589642 35.0049697 35.6242600 36.1475333 37.1857006 37.7141836 38.3529065 38.7315659 39.4717696 40.0704887 40.5773245 41.1858963 41.4163293 42.2091329 43.2031565 43.7214229 44.2822324 45.1863152 46.0534890 46.8616620 47.3908113 47.6050762 48.2877417 48.6865067 49.0755018 49.8901935 50.6218170 51.1871707 51.2841218 52.0368338 53.1741867 53.8374289 54.5342924 55.1763330 55.3431013 56.3557862 56.5401839 56.7951835 57.1940114 58.1006464 59.1047346 59.4593086 59.7788987 60.4785894 61.1366509 61.8669551 62.9592640 63.6905034 64.3058650 65.0117950 65.1778864 66.0346874 66.3338896 66.6929568 66.7142967 67.5597319 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034331 0.0034332 0.0034334 0.0034342 0.0034347 0.0034356 127.5285991 140.5621295 185.1200175 209.1520632 217.7752428 226.4300283 248.4784621 260.0562560 268.6871626 283.1129551 298.6423486 313.8185609 321.2620145 330.9860582 353.3099867 359.3870622 372.1905578 387.9184437 400.4920801 412.6841582 421.0851089 436.0535013 447.0313577 458.2922113 472.6125873 479.2898131 483.2493792 497.5957755 507.4108608 524.6081742 535.9533468 541.2488983 548.1004362 554.6537509 561.9634848 571.1349749 579.8699568 582.2966209 588.7314671 601.5328032 602.9314640 611.4174567 622.9898925 623.9985113 629.0708399 642.4807702 648.1390768 652.8818771 662.1909853 666.8799117 672.5033022 675.8149707 682.2421995 687.3969486 691.7305942 696.8985183 698.8453545 705.5024002 713.7613370 718.0297259 722.6200935 729.9594646 736.9305297 743.3684487 747.5536253 749.2416521 754.5946605 757.7040133 760.7249403 767.0132645 772.6167959 776.9191799 777.6545937 783.3407370 791.8550822 796.7781863 801.9182951 806.6250358 807.8431123 815.2006862 816.5332767 818.3725121 821.2408790 827.7244088 834.8460875 837.3464966 839.5938238 844.4931024 849.0750949 854.1313281 861.6385108 866.6278094 870.8043153 875.5709803 876.6887158 882.4321925 884.4290766 886.8195655 886.9614331 892.5637386 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 2827 Rtb_to_modes> Number of blocs = 191 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9949E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9959E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9965E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0004E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0010E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.379 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.676 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.906 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.710 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.022 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.348 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.236 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.735 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.122 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.797 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.563 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.352 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.752 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.290 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.56 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1146 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 0.99996 1.00000 1.00002 0.99997 1.00000 0.99999 1.00000 0.99998 0.99999 1.00002 0.99998 1.00001 0.99998 0.99997 1.00000 0.99999 1.00001 1.00002 0.99999 0.99999 1.00001 0.99999 1.00002 0.99998 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 0.99998 0.99999 0.99998 0.99999 0.99998 1.00001 1.00000 1.00001 1.00002 1.00003 1.00000 1.00002 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00002 1.00000 0.99996 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 1.00002 0.99999 1.00000 1.00002 1.00002 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 0.99999 0.99996 0.99999 0.99999 0.99998 1.00000 1.00002 1.00001 1.00003 1.00001 1.00002 0.99998 0.99999 1.00002 1.00001 0.99999 0.99998 1.00000 0.99998 1.00000 0.99999 0.99999 0.99998 1.00001 1.00001 1.00001 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 0.99998 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 50886 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 0.99996 1.00000 1.00002 0.99997 1.00000 0.99999 1.00000 0.99998 0.99999 1.00002 0.99998 1.00001 0.99998 0.99997 1.00000 0.99999 1.00001 1.00002 0.99999 0.99999 1.00001 0.99999 1.00002 0.99998 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 0.99998 0.99999 0.99998 0.99999 0.99998 1.00001 1.00000 1.00001 1.00002 1.00003 1.00000 1.00002 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00002 1.00000 0.99996 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 1.00002 0.99999 1.00000 1.00002 1.00002 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 0.99999 0.99996 0.99999 0.99999 0.99998 1.00000 1.00002 1.00001 1.00003 1.00001 1.00002 0.99998 0.99999 1.00002 1.00001 0.99999 0.99998 1.00000 0.99998 1.00000 0.99999 0.99999 0.99998 1.00001 1.00001 1.00001 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 0.99998 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3:-0.000-0.000 Vector 4: 0.000 0.000-0.000 Vector 5: 0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 6:-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 7:-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 8:-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 9:-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 10:-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2606181404432809667.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2606181404432809667.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2606181404432809667.atom Openam> file on opening on unit 11: 2606181404432809667.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 381 First residue number = 4 Last residue number = 384 Number of atoms found = 2827 Mean number per residue = 7.4 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9949E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9959E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9965E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0004E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0010E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.379 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.676 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.906 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.710 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.022 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.348 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.236 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.735 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.122 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.797 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.563 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.352 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.752 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.290 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.56 Bfactors> 106 vectors, 8481 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 1.379000 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.392 for 381 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.033 +/- 0.12 Bfactors> = 53.818 +/- 17.27 Bfactors> Shiftng-fct= 53.785 Bfactors> Scaling-fct= 140.912 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2606181404432809667.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2606181404432809667.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4329E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4331E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4332E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4345E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4355E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 127.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 140.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 185.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 209.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 217.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 226.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 248.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 260.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 268.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 283.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 298.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 313.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 321.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 331.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 353.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 359.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 372.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 387.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 400.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 412.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 421.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 436.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 447.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 458.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 472.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 479.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 483.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 497.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 507.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 524.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 535.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 541.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 548.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 554.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 561.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 571.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 579.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 582.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 588.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 601.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 602.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 611.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 622.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 624.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 629.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 642.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 648.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 652.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 662.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 666.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 672.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 675.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 682.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 687.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 691.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 696.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 698.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 705.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 713.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 718.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 722.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 730.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 736.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 743.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 747.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 749.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 754.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 757.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 760.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 767.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 772.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 776.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 777.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 783.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 791.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 796.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 801.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 806.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 807.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 815.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 816.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 818.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 821.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 827.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 834.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 837.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 839.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 844.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 849.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 854.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 861.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 866.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 870.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 875.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 876.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 882.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 884.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 886.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 886.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 892.5 Chkmod> 106 vectors, 8481 coordinates in file. Chkmod> That is: 2827 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 7 is: 0.9999 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 10 is: 0.9999 (instead of 1.0000). Chkmod> Normal end. 0.0034 0.8561 0.0034 0.8357 0.0034 0.7629 0.0034 0.9516 0.0034 0.9178 0.0034 0.8733 127.5143 0.0814 140.5768 0.0554 185.1077 0.5211 209.1528 0.0140 217.7698 0.4164 226.4235 0.4273 248.4714 0.3428 260.0419 0.4342 268.6726 0.0157 283.0970 0.6035 298.6233 0.5728 313.8137 0.4228 321.2405 0.5794 330.9668 0.2558 353.3659 0.5908 359.3219 0.6172 372.2165 0.0666 387.8841 0.4849 400.4480 0.5898 412.6295 0.5125 421.1148 0.2815 435.9726 0.4402 447.0555 0.4432 458.2565 0.4199 472.5705 0.3404 479.2599 0.4543 483.1803 0.4047 497.6068 0.4613 507.3451 0.4356 524.5985 0.4388 535.9389 0.2108 541.1933 0.4057 548.1209 0.5069 554.6432 0.2562 561.9296 0.5669 571.0876 0.2121 579.7960 0.2517 582.2313 0.3906 588.6761 0.4026 601.5546 0.4237 602.9251 0.2761 611.3730 0.3192 622.9319 0.4915 623.9721 0.3199 629.0535 0.4205 642.4076 0.3954 648.0725 0.4618 652.8761 0.4512 662.2008 0.3751 666.8143 0.3744 672.4490 0.3642 675.7723 0.3701 682.1976 0.3785 687.3632 0.3504 691.7237 0.4559 696.9033 0.1454 698.8463 0.4243 705.4794 0.4515 713.7046 0.4311 717.9872 0.4095 722.5709 0.5208 729.9579 0.5009 736.8710 0.5860 743.3234 0.3663 747.5151 0.5257 749.2482 0.3459 754.5799 0.4937 757.6987 0.4941 760.7271 0.4474 766.9789 0.3847 772.5698 0.3922 776.9073 0.4345 777.5900 0.4110 783.3309 0.4923 791.7899 0.5099 796.7630 0.4483 801.8523 0.3593 806.6172 0.2810 807.7858 0.4822 815.1962 0.5699 816.4969 0.4689 818.3721 0.4248 821.1768 0.1377 827.6843 0.5323 834.7768 0.5019 837.3154 0.5053 839.5655 0.5467 844.4667 0.5615 849.0619 0.5582 854.1157 0.4762 861.6066 0.4875 866.5872 0.3796 870.7949 0.4931 875.5213 0.4206 876.6653 0.4918 882.3630 0.5250 884.3652 0.5612 886.7618 0.5125 886.8948 0.4302 892.5272 0.4504 getting mode 7 running: ../../bin/get_modes.sh 2606181404432809667 7 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 7 calculating perturbed structure for DQ=-100 2606181404432809667.eigenfacs 2606181404432809667.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2606181404432809667.eigenfacs 2606181404432809667.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2606181404432809667.eigenfacs 2606181404432809667.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2606181404432809667.eigenfacs 2606181404432809667.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2606181404432809667.eigenfacs 2606181404432809667.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2606181404432809667.eigenfacs 2606181404432809667.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2606181404432809667.eigenfacs 2606181404432809667.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2606181404432809667.eigenfacs 2606181404432809667.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2606181404432809667.eigenfacs 2606181404432809667.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2606181404432809667.eigenfacs 2606181404432809667.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2606181404432809667.eigenfacs 2606181404432809667.atom making animated gifs 11 models are in 2606181404432809667.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2606181404432809667.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2606181404432809667.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 2606181404432809667 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 2606181404432809667.eigenfacs 2606181404432809667.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2606181404432809667.eigenfacs 2606181404432809667.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2606181404432809667.eigenfacs 2606181404432809667.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2606181404432809667.eigenfacs 2606181404432809667.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2606181404432809667.eigenfacs 2606181404432809667.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2606181404432809667.eigenfacs 2606181404432809667.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2606181404432809667.eigenfacs 2606181404432809667.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2606181404432809667.eigenfacs 2606181404432809667.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2606181404432809667.eigenfacs 2606181404432809667.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2606181404432809667.eigenfacs 2606181404432809667.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2606181404432809667.eigenfacs 2606181404432809667.atom making animated gifs 11 models are in 2606181404432809667.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2606181404432809667.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2606181404432809667.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 2606181404432809667 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 2606181404432809667.eigenfacs 2606181404432809667.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2606181404432809667.eigenfacs 2606181404432809667.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2606181404432809667.eigenfacs 2606181404432809667.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2606181404432809667.eigenfacs 2606181404432809667.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2606181404432809667.eigenfacs 2606181404432809667.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2606181404432809667.eigenfacs 2606181404432809667.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2606181404432809667.eigenfacs 2606181404432809667.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2606181404432809667.eigenfacs 2606181404432809667.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2606181404432809667.eigenfacs 2606181404432809667.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2606181404432809667.eigenfacs 2606181404432809667.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2606181404432809667.eigenfacs 2606181404432809667.atom making animated gifs 11 models are in 2606181404432809667.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2606181404432809667.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2606181404432809667.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 2606181404432809667 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 2606181404432809667.eigenfacs 2606181404432809667.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2606181404432809667.eigenfacs 2606181404432809667.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2606181404432809667.eigenfacs 2606181404432809667.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2606181404432809667.eigenfacs 2606181404432809667.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2606181404432809667.eigenfacs 2606181404432809667.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2606181404432809667.eigenfacs 2606181404432809667.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2606181404432809667.eigenfacs 2606181404432809667.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2606181404432809667.eigenfacs 2606181404432809667.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2606181404432809667.eigenfacs 2606181404432809667.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2606181404432809667.eigenfacs 2606181404432809667.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2606181404432809667.eigenfacs 2606181404432809667.atom making animated gifs 11 models are in 2606181404432809667.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2606181404432809667.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2606181404432809667.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 2606181404432809667 11 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-100 2606181404432809667.eigenfacs 2606181404432809667.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2606181404432809667.eigenfacs 2606181404432809667.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2606181404432809667.eigenfacs 2606181404432809667.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2606181404432809667.eigenfacs 2606181404432809667.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2606181404432809667.eigenfacs 2606181404432809667.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2606181404432809667.eigenfacs 2606181404432809667.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2606181404432809667.eigenfacs 2606181404432809667.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2606181404432809667.eigenfacs 2606181404432809667.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2606181404432809667.eigenfacs 2606181404432809667.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2606181404432809667.eigenfacs 2606181404432809667.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2606181404432809667.eigenfacs 2606181404432809667.atom making animated gifs 11 models are in 2606181404432809667.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2606181404432809667.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2606181404432809667.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 2606181404432809667.10.pdb 2606181404432809667.11.pdb 2606181404432809667.7.pdb 2606181404432809667.8.pdb 2606181404432809667.9.pdb STDERR: Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL real 0m21.776s user 0m21.633s sys 0m0.134s rm: cannot remove '2606181404432809667.sdijf': No such file or directory pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format




If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:

elNémo is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Between 2015 and 2025, it was hosted by US2B (Nantes).
Last modification: april 24th, 2026.