***  5GY7  ***
Output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 2606190142442927379.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 2606190142442927379.atom to be opened.
Openam> File opened: 2606190142442927379.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 676
First residue number = 1
Last residue number = 338
Number of atoms found = 5142
Mean number per residue = 7.6
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 9.332244 +/- 11.443354 From: -16.834000 To: 38.004000
= 3.086037 +/- 11.262626 From: -23.419000 To: 31.056000
= -0.554400 +/- 22.204285 From: -44.379000 To: 45.175000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 1.7171 % Filled.
Pdbmat> 2043156 non-zero elements.
Pdbmat> 223621 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 86.98 +/- 21.24
Maximum number = 133
Minimum number = 19
Pdbmat> Matrix trace = 4.472420E+06
Pdbmat> Larger element = 510.444
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
676 non-zero elements, NRBL set to 4
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 2606190142442927379.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 4
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 2606190142442927379.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
2606190142442927379.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 5142 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 4 residue(s) per block.
Blocpdb> 676 residues.
Blocpdb> 34 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 22 atoms in block 2
Block first atom: 35
Blocpdb> 30 atoms in block 3
Block first atom: 57
Blocpdb> 27 atoms in block 4
Block first atom: 87
Blocpdb> 26 atoms in block 5
Block first atom: 114
Blocpdb> 29 atoms in block 6
Block first atom: 140
Blocpdb> 33 atoms in block 7
Block first atom: 169
Blocpdb> 32 atoms in block 8
Block first atom: 202
Blocpdb> 28 atoms in block 9
Block first atom: 234
Blocpdb> 33 atoms in block 10
Block first atom: 262
Blocpdb> 30 atoms in block 11
Block first atom: 295
Blocpdb> 32 atoms in block 12
Block first atom: 325
Blocpdb> 30 atoms in block 13
Block first atom: 357
Blocpdb> 34 atoms in block 14
Block first atom: 387
Blocpdb> 31 atoms in block 15
Block first atom: 421
Blocpdb> 30 atoms in block 16
Block first atom: 452
Blocpdb> 32 atoms in block 17
Block first atom: 482
Blocpdb> 36 atoms in block 18
Block first atom: 514
Blocpdb> 28 atoms in block 19
Block first atom: 550
Blocpdb> 36 atoms in block 20
Block first atom: 578
Blocpdb> 26 atoms in block 21
Block first atom: 614
Blocpdb> 25 atoms in block 22
Block first atom: 640
Blocpdb> 31 atoms in block 23
Block first atom: 665
Blocpdb> 36 atoms in block 24
Block first atom: 696
Blocpdb> 36 atoms in block 25
Block first atom: 732
Blocpdb> 26 atoms in block 26
Block first atom: 768
Blocpdb> 35 atoms in block 27
Block first atom: 794
Blocpdb> 24 atoms in block 28
Block first atom: 829
Blocpdb> 22 atoms in block 29
Block first atom: 853
Blocpdb> 32 atoms in block 30
Block first atom: 875
Blocpdb> 29 atoms in block 31
Block first atom: 907
Blocpdb> 31 atoms in block 32
Block first atom: 936
Blocpdb> 28 atoms in block 33
Block first atom: 967
Blocpdb> 36 atoms in block 34
Block first atom: 995
Blocpdb> 33 atoms in block 35
Block first atom: 1031
Blocpdb> 25 atoms in block 36
Block first atom: 1064
Blocpdb> 29 atoms in block 37
Block first atom: 1089
Blocpdb> 31 atoms in block 38
Block first atom: 1118
Blocpdb> 32 atoms in block 39
Block first atom: 1149
Blocpdb> 34 atoms in block 40
Block first atom: 1181
Blocpdb> 32 atoms in block 41
Block first atom: 1215
Blocpdb> 26 atoms in block 42
Block first atom: 1247
Blocpdb> 36 atoms in block 43
Block first atom: 1273
Blocpdb> 32 atoms in block 44
Block first atom: 1309
Blocpdb> 38 atoms in block 45
Block first atom: 1341
Blocpdb> 26 atoms in block 46
Block first atom: 1379
Blocpdb> 25 atoms in block 47
Block first atom: 1405
Blocpdb> 26 atoms in block 48
Block first atom: 1430
Blocpdb> 28 atoms in block 49
Block first atom: 1456
Blocpdb> 31 atoms in block 50
Block first atom: 1484
Blocpdb> 35 atoms in block 51
Block first atom: 1515
Blocpdb> 26 atoms in block 52
Block first atom: 1550
Blocpdb> 33 atoms in block 53
Block first atom: 1576
Blocpdb> 24 atoms in block 54
Block first atom: 1609
Blocpdb> 31 atoms in block 55
Block first atom: 1633
Blocpdb> 34 atoms in block 56
Block first atom: 1664
Blocpdb> 24 atoms in block 57
Block first atom: 1698
Blocpdb> 30 atoms in block 58
Block first atom: 1722
Blocpdb> 37 atoms in block 59
Block first atom: 1752
Blocpdb> 29 atoms in block 60
Block first atom: 1789
Blocpdb> 27 atoms in block 61
Block first atom: 1818
Blocpdb> 29 atoms in block 62
Block first atom: 1845
Blocpdb> 30 atoms in block 63
Block first atom: 1874
Blocpdb> 27 atoms in block 64
Block first atom: 1904
Blocpdb> 38 atoms in block 65
Block first atom: 1931
Blocpdb> 21 atoms in block 66
Block first atom: 1969
Blocpdb> 25 atoms in block 67
Block first atom: 1990
Blocpdb> 30 atoms in block 68
Block first atom: 2015
Blocpdb> 31 atoms in block 69
Block first atom: 2045
Blocpdb> 22 atoms in block 70
Block first atom: 2076
Blocpdb> 23 atoms in block 71
Block first atom: 2098
Blocpdb> 41 atoms in block 72
Block first atom: 2121
Blocpdb> 34 atoms in block 73
Block first atom: 2162
Blocpdb> 29 atoms in block 74
Block first atom: 2196
Blocpdb> 38 atoms in block 75
Block first atom: 2225
Blocpdb> 24 atoms in block 76
Block first atom: 2263
Blocpdb> 33 atoms in block 77
Block first atom: 2287
Blocpdb> 39 atoms in block 78
Block first atom: 2320
Blocpdb> 36 atoms in block 79
Block first atom: 2359
Blocpdb> 32 atoms in block 80
Block first atom: 2395
Blocpdb> 30 atoms in block 81
Block first atom: 2427
Blocpdb> 45 atoms in block 82
Block first atom: 2457
Blocpdb> 36 atoms in block 83
Block first atom: 2502
Blocpdb> 32 atoms in block 84
Block first atom: 2538
Blocpdb> 12 atoms in block 85
Block first atom: 2570
Blocpdb> 34 atoms in block 86
Block first atom: 2582
Blocpdb> 22 atoms in block 87
Block first atom: 2616
Blocpdb> 30 atoms in block 88
Block first atom: 2638
Blocpdb> 27 atoms in block 89
Block first atom: 2668
Blocpdb> 30 atoms in block 90
Block first atom: 2695
Blocpdb> 29 atoms in block 91
Block first atom: 2725
Blocpdb> 33 atoms in block 92
Block first atom: 2754
Blocpdb> 32 atoms in block 93
Block first atom: 2787
Blocpdb> 28 atoms in block 94
Block first atom: 2819
Blocpdb> 33 atoms in block 95
Block first atom: 2847
Blocpdb> 30 atoms in block 96
Block first atom: 2880
Blocpdb> 32 atoms in block 97
Block first atom: 2910
Blocpdb> 30 atoms in block 98
Block first atom: 2942
Blocpdb> 34 atoms in block 99
Block first atom: 2972
Blocpdb> 31 atoms in block 100
Block first atom: 3006
Blocpdb> 30 atoms in block 101
Block first atom: 3037
Blocpdb> 28 atoms in block 102
Block first atom: 3067
Blocpdb> 31 atoms in block 103
Block first atom: 3095
Blocpdb> 28 atoms in block 104
Block first atom: 3126
Blocpdb> 36 atoms in block 105
Block first atom: 3154
Blocpdb> 26 atoms in block 106
Block first atom: 3190
Blocpdb> 25 atoms in block 107
Block first atom: 3216
Blocpdb> 31 atoms in block 108
Block first atom: 3241
Blocpdb> 36 atoms in block 109
Block first atom: 3272
Blocpdb> 36 atoms in block 110
Block first atom: 3308
Blocpdb> 26 atoms in block 111
Block first atom: 3344
Blocpdb> 35 atoms in block 112
Block first atom: 3370
Blocpdb> 24 atoms in block 113
Block first atom: 3405
Blocpdb> 22 atoms in block 114
Block first atom: 3429
Blocpdb> 32 atoms in block 115
Block first atom: 3451
Blocpdb> 29 atoms in block 116
Block first atom: 3483
Blocpdb> 31 atoms in block 117
Block first atom: 3512
Blocpdb> 25 atoms in block 118
Block first atom: 3543
Blocpdb> 32 atoms in block 119
Block first atom: 3568
Blocpdb> 27 atoms in block 120
Block first atom: 3600
Blocpdb> 25 atoms in block 121
Block first atom: 3627
Blocpdb> 29 atoms in block 122
Block first atom: 3652
Blocpdb> 31 atoms in block 123
Block first atom: 3681
Blocpdb> 32 atoms in block 124
Block first atom: 3712
Blocpdb> 34 atoms in block 125
Block first atom: 3744
Blocpdb> 32 atoms in block 126
Block first atom: 3778
Blocpdb> 26 atoms in block 127
Block first atom: 3810
Blocpdb> 36 atoms in block 128
Block first atom: 3836
Blocpdb> 32 atoms in block 129
Block first atom: 3872
Blocpdb> 38 atoms in block 130
Block first atom: 3904
Blocpdb> 26 atoms in block 131
Block first atom: 3942
Blocpdb> 25 atoms in block 132
Block first atom: 3968
Blocpdb> 26 atoms in block 133
Block first atom: 3993
Blocpdb> 28 atoms in block 134
Block first atom: 4019
Blocpdb> 31 atoms in block 135
Block first atom: 4047
Blocpdb> 35 atoms in block 136
Block first atom: 4078
Blocpdb> 26 atoms in block 137
Block first atom: 4113
Blocpdb> 33 atoms in block 138
Block first atom: 4139
Blocpdb> 24 atoms in block 139
Block first atom: 4172
Blocpdb> 31 atoms in block 140
Block first atom: 4196
Blocpdb> 34 atoms in block 141
Block first atom: 4227
Blocpdb> 28 atoms in block 142
Block first atom: 4261
Blocpdb> 30 atoms in block 143
Block first atom: 4289
Blocpdb> 37 atoms in block 144
Block first atom: 4319
Blocpdb> 29 atoms in block 145
Block first atom: 4356
Blocpdb> 27 atoms in block 146
Block first atom: 4385
Blocpdb> 29 atoms in block 147
Block first atom: 4412
Blocpdb> 30 atoms in block 148
Block first atom: 4441
Blocpdb> 23 atoms in block 149
Block first atom: 4471
Blocpdb> 38 atoms in block 150
Block first atom: 4494
Blocpdb> 21 atoms in block 151
Block first atom: 4532
Blocpdb> 25 atoms in block 152
Block first atom: 4553
Blocpdb> 30 atoms in block 153
Block first atom: 4578
Blocpdb> 31 atoms in block 154
Block first atom: 4608
Blocpdb> 26 atoms in block 155
Block first atom: 4639
Blocpdb> 23 atoms in block 156
Block first atom: 4665
Blocpdb> 41 atoms in block 157
Block first atom: 4688
Blocpdb> 34 atoms in block 158
Block first atom: 4729
Blocpdb> 29 atoms in block 159
Block first atom: 4763
Blocpdb> 38 atoms in block 160
Block first atom: 4792
Blocpdb> 24 atoms in block 161
Block first atom: 4830
Blocpdb> 33 atoms in block 162
Block first atom: 4854
Blocpdb> 39 atoms in block 163
Block first atom: 4887
Blocpdb> 30 atoms in block 164
Block first atom: 4926
Blocpdb> 32 atoms in block 165
Block first atom: 4956
Blocpdb> 30 atoms in block 166
Block first atom: 4988
Blocpdb> 45 atoms in block 167
Block first atom: 5018
Blocpdb> 36 atoms in block 168
Block first atom: 5063
Blocpdb> 32 atoms in block 169
Block first atom: 5099
Blocpdb> 12 atoms in block 170
Block first atom: 5130
Blocpdb> 170 blocks.
Blocpdb> At most, 45 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 12 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 2043326 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 15426
Prepmat> Matrix trace = 4472420.0000
Prepmat> Last element read: 15426 15426 114.5133
Prepmat> 14536 lines saved.
Prepmat> 12853 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 5142
RTB> Total mass = 5142.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 5142
RTB> Number of blocks = 170
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 223784.1120
RTB> 58002 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 1020
Diagstd> Nb of non-zero elements: 58002
Diagstd> Projected matrix trace = 223784.1120
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 1020 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 223784.1120
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.6509829 1.0217929 1.2798877 2.6505973
4.7483433 5.5639790 8.1140178 8.8156358 10.8465348
11.5709306 11.6147178 13.8952656 15.5835162 16.2547203
16.6502177 16.9022373 17.9878658 18.1369691 19.1497868
19.6318020 20.3009723 20.4796509 21.0855871 21.4816871
21.5329959 22.8580322 23.1447073 24.5970723 25.4987920
25.8542306 26.2571546 27.1465356 27.8734722 28.6270153
29.3156765 29.8681221 30.5308680 30.7724839 31.2892379
31.6461354 32.8212114 34.5314166 35.0786727 35.5197887
35.6759395 36.0292393 37.2374405 37.8231497 38.0531622
38.7442326 39.3712140 39.7507048 40.0575154 40.6863138
40.8721053 41.1708245 42.5134927 43.1723455 43.5373185
44.2309365 45.0838723 45.1538398 46.4366118 47.1746380
47.4636846 48.9463620 49.4159878 49.8413151 50.0608023
50.6668364 50.8715519 51.3955119 51.8395763 53.0608297
53.9416687 54.3269277 55.2566185 55.5681950 55.8567382
56.5583304 56.8565705 57.3020546 57.7194543 58.8651070
58.9748303 59.6496116 60.0799092 60.5115731 61.2488890
61.8185786 62.2228836 62.5276466 63.6493854 63.9357799
64.8198886 65.1345576 65.1864234 65.4432854 65.8436979
66.1505718
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034320 0.0034321 0.0034322 0.0034329 0.0034343
0.0034346 87.6153224 109.7682450 122.8517139 176.7938497
236.6281099 256.1462619 309.3237442 322.4200945 357.6356370
369.3851440 370.0834052 404.7890038 428.6748540 437.8093488
443.1035591 446.4443978 460.5588153 462.4636861 475.2008971
481.1443200 489.2757591 491.4242179 498.6411654 503.3029477
503.9036553 519.1761099 522.4216017 538.5635903 548.3465095
552.1551014 556.4409853 565.7863779 573.3117148 581.0096093
587.9565600 593.4706411 600.0187968 602.3883395 607.4251549
610.8795985 622.1177372 638.1201781 643.1567866 647.1880164
648.6090284 651.8127132 662.6515095 667.8426121 669.8701972
675.9254706 681.3726282 684.6485570 687.2856631 692.6589533
694.2386440 696.7709933 708.0414345 713.5067771 716.5163731
722.2014363 729.1315413 729.6971069 739.9894747 745.8466927
748.1281649 759.7233753 763.3593350 766.6374431 768.3236175
772.9602747 774.5202438 778.4986756 781.8546112 791.0105914
797.5491729 800.3922096 807.2116710 809.4842915 811.5832324
816.6642991 818.8146613 822.0162013 825.0046348 833.1520153
833.9281425 838.6854147 841.7050133 844.7233552 849.8541273
853.7973210 856.5847676 858.6799487 866.3480205 868.2949271
874.2777391 876.3972661 876.7461284 878.4718048 881.1551566
883.2061442
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 5142
Rtb_to_modes> Number of blocs = 170
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9888E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9894E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9896E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9936E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0004E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6510
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.022
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.280
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.651
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.748
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.564
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.114
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.816
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.85
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.57
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.61
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.90
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.58
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.25
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.65
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.90
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.99
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.14
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.15
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.63
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.30
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.48
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.48
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.53
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.86
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.14
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.60
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.50
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.85
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.26
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.15
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.87
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.63
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.32
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.87
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.53
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.77
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.29
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.65
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.82
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.53
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.08
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.52
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.68
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.24
Rdmodfacs> Eigenvector number: 54
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.82
Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.05
Rdmodfacs> Eigenvector number: 56
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.74
Rdmodfacs> Eigenvector number: 57
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.37
Rdmodfacs> Eigenvector number: 58
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.75
Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.06
Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.69
Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.87
Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.17
Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.51
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.17
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.54
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.23
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.08
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.15
Rdmodfacs> Eigenvector number: 69
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.44
Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.17
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.46
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.95
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.42
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.84
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.06
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.67
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.87
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.40
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.84
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.06
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.94
Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.33
Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.26
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.57
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.86
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.56
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.86
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.30
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.72
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.87
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.97
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.65
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.08
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.51
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.25
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.82
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.22
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.53
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.65
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.94
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.82
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.13
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.19
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.44
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.84
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.15
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1020 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999
1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 0.99998
1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00002
1.00002 1.00000 0.99999 0.99999 0.99998
1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000
1.00000 1.00000 1.00002 0.99998 1.00000
1.00001 1.00000 0.99998 1.00000 1.00003
1.00000 0.99997 1.00000 1.00000 1.00001
0.99999 1.00002 1.00001 1.00000 1.00000
1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001
1.00002 1.00000 1.00003 0.99998 1.00001
1.00000 0.99999 0.99997 1.00001 1.00003
1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 1.00003
1.00001 1.00002 1.00000 1.00000 1.00001
1.00002 0.99997 1.00002 1.00000 0.99999
1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000
1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002
0.99999 0.99998 1.00003 0.99997 1.00000
1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000
1.00000 1.00002 0.99999 1.00000 0.99997
1.00002 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000
0.99999
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 92556 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999
1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 0.99998
1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00002
1.00002 1.00000 0.99999 0.99999 0.99998
1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000
1.00000 1.00000 1.00002 0.99998 1.00000
1.00001 1.00000 0.99998 1.00000 1.00003
1.00000 0.99997 1.00000 1.00000 1.00001
0.99999 1.00002 1.00001 1.00000 1.00000
1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001
1.00002 1.00000 1.00003 0.99998 1.00001
1.00000 0.99999 0.99997 1.00001 1.00003
1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 1.00003
1.00001 1.00002 1.00000 1.00000 1.00001
1.00002 0.99997 1.00002 1.00000 0.99999
1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000
1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002
0.99999 0.99998 1.00003 0.99997 1.00000
1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000
1.00000 1.00002 0.99999 1.00000 0.99997
1.00002 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000
0.99999
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2:-0.000
Vector 3:-0.000 0.000
Vector 4: 0.000 0.000-0.000
Vector 5: 0.000 0.000-0.000-0.000
Vector 6:-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000
Vector 7:-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000
Vector 8: 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000
Vector 9:-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000
Vector 10:-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2606190142442927379.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2606190142442927379.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 2606190142442927379.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2606190142442927379.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 676
First residue number = 1
Last residue number = 338
Number of atoms found = 5142
Mean number per residue = 7.6
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9888E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9894E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9896E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9936E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0004E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6510
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.022
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.280
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.651
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.748
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.564
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.114
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.816
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.85
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.58
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.25
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.65
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.99
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.63
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.86
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.85
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.87
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.63
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.32
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.87
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.29
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.65
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.82
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.08
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.24
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.82
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.75
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.69
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.87
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.51
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.54
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.08
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.44
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.95
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.84
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.67
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.87
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.84
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.86
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.86
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.87
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.97
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.65
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.08
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.51
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.25
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.82
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.65
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.82
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.44
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.84
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.15
Bfactors> 106 vectors, 15426 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.651000
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= 0.675 for 676 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.021 +/- 0.01
Bfactors> = 8.930 +/- 2.70
Bfactors> Shiftng-fct= 8.909
Bfactors> Scaling-fct= 199.037
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2606190142442927379.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2606190142442927379.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4319E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4320E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4320E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4327E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4345E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 87.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 109.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 122.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 176.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 236.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 256.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 309.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 322.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 357.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 369.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 370.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 404.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 428.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 437.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 443.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 446.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 460.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 462.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 475.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 481.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 489.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 491.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 498.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 503.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 503.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 519.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 522.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 538.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 548.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 552.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 556.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 565.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 573.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 581.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 588.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 593.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 600.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 602.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 607.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 610.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 622.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 638.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 643.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 647.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 648.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 651.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 662.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 667.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 669.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 675.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 681.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 684.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 687.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 692.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 694.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 696.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 708.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 713.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 716.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 722.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 729.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 729.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 740.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 745.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 748.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 759.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 763.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 766.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 768.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 773.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 774.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 778.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 781.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 791.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 797.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 800.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 807.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 809.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 811.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 816.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 818.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 822.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 825.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 833.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 833.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 838.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 841.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 844.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 849.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 853.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 856.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 858.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 866.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 868.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 874.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 876.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 876.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 878.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 881.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 883.2
Chkmod> 106 vectors, 15426 coordinates in file.
Chkmod> That is: 5142 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.9291
0.0034 0.8877
0.0034 0.7676
0.0034 0.7151
0.0034 0.8047
0.0034 0.8914
87.6127 0.7738
109.7747 0.7405
122.8518 0.7444
176.7997 0.6813
236.6094 0.7229
256.1357 0.7706
309.3101 0.6280
322.4129 0.5900
357.6774 0.6602
369.3544 0.5612
369.9924 0.5797
404.8406 0.7307
428.6081 0.6397
437.7270 0.6041
443.0816 0.7123
446.3957 0.6986
460.5664 0.6173
462.4825 0.6538
475.1831 0.5062
481.1016 0.6377
489.2430 0.6425
491.4073 0.3804
498.6719 0.6518
503.2616 0.7045
503.8470 0.6062
519.1762 0.6522
522.3460 0.5739
538.5725 0.4979
548.3360 0.1728
552.0862 0.6309
556.4472 0.5020
565.7982 0.3297
573.2514 0.2389
581.0150 0.4949
587.9747 0.6456
593.4638 0.3550
599.9845 0.4580
602.3382 0.4964
607.4065 0.5264
610.8907 0.4170
622.0796 0.4809
638.0797 0.2317
643.1413 0.5776
647.1622 0.2445
648.6181 0.4552
651.7916 0.5592
662.6458 0.4458
667.7861 0.5589
669.8136 0.5244
675.8595 0.3991
681.3329 0.4551
684.6131 0.3054
687.2775 0.4459
692.6606 0.3045
694.1910 0.3969
696.7341 0.4947
707.9820 0.4873
713.4568 0.4913
716.5077 0.4955
722.1628 0.4875
729.0689 0.3793
729.6348 0.5465
739.9847 0.4472
745.7780 0.3296
748.0670 0.5449
759.7190 0.4285
763.3576 0.3408
766.5944 0.5099
768.2845 0.4709
772.9512 0.5423
774.4752 0.5645
778.4992 0.6263
781.8242 0.4938
790.9705 0.5599
797.5026 0.5062
800.3805 0.5662
807.2017 0.5933
809.4627 0.5889
811.5721 0.6536
816.6413 0.5585
818.8042 0.5521
821.9662 0.4845
824.9731 0.5181
833.1509 0.5933
833.8582 0.5453
838.6521 0.5182
841.6695 0.6024
844.6761 0.6002
849.8254 0.4259
853.7705 0.5715
856.5281 0.5821
858.6592 0.5521
866.3150 0.5902
868.2863 0.3212
874.2410 0.4783
876.3290 0.5763
876.7325 0.6007
878.4120 0.5035
881.0926 0.5094
883.1644 0.4364
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2606190142442927379 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
2606190142442927379.eigenfacs
2606190142442927379.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2606190142442927379.eigenfacs
2606190142442927379.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2606190142442927379.eigenfacs
2606190142442927379.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2606190142442927379.eigenfacs
2606190142442927379.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2606190142442927379.eigenfacs
2606190142442927379.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2606190142442927379.eigenfacs
2606190142442927379.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2606190142442927379.eigenfacs
2606190142442927379.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2606190142442927379.eigenfacs
2606190142442927379.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2606190142442927379.eigenfacs
2606190142442927379.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2606190142442927379.eigenfacs
2606190142442927379.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2606190142442927379.eigenfacs
2606190142442927379.atom
making animated gifs
11 models are in 2606190142442927379.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2606190142442927379.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2606190142442927379.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 2606190142442927379 8 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
2606190142442927379.eigenfacs
2606190142442927379.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2606190142442927379.eigenfacs
2606190142442927379.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2606190142442927379.eigenfacs
2606190142442927379.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2606190142442927379.eigenfacs
2606190142442927379.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2606190142442927379.eigenfacs
2606190142442927379.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2606190142442927379.eigenfacs
2606190142442927379.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2606190142442927379.eigenfacs
2606190142442927379.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2606190142442927379.eigenfacs
2606190142442927379.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2606190142442927379.eigenfacs
2606190142442927379.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2606190142442927379.eigenfacs
2606190142442927379.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2606190142442927379.eigenfacs
2606190142442927379.atom
making animated gifs
11 models are in 2606190142442927379.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2606190142442927379.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2606190142442927379.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 2606190142442927379 9 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
2606190142442927379.eigenfacs
2606190142442927379.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2606190142442927379.eigenfacs
2606190142442927379.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2606190142442927379.eigenfacs
2606190142442927379.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2606190142442927379.eigenfacs
2606190142442927379.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2606190142442927379.eigenfacs
2606190142442927379.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2606190142442927379.eigenfacs
2606190142442927379.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2606190142442927379.eigenfacs
2606190142442927379.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2606190142442927379.eigenfacs
2606190142442927379.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2606190142442927379.eigenfacs
2606190142442927379.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2606190142442927379.eigenfacs
2606190142442927379.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2606190142442927379.eigenfacs
2606190142442927379.atom
making animated gifs
11 models are in 2606190142442927379.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2606190142442927379.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2606190142442927379.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 2606190142442927379 10 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
2606190142442927379.eigenfacs
2606190142442927379.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2606190142442927379.eigenfacs
2606190142442927379.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2606190142442927379.eigenfacs
2606190142442927379.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2606190142442927379.eigenfacs
2606190142442927379.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2606190142442927379.eigenfacs
2606190142442927379.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2606190142442927379.eigenfacs
2606190142442927379.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2606190142442927379.eigenfacs
2606190142442927379.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2606190142442927379.eigenfacs
2606190142442927379.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2606190142442927379.eigenfacs
2606190142442927379.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2606190142442927379.eigenfacs
2606190142442927379.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2606190142442927379.eigenfacs
2606190142442927379.atom
making animated gifs
11 models are in 2606190142442927379.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2606190142442927379.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2606190142442927379.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 2606190142442927379 11 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
2606190142442927379.eigenfacs
2606190142442927379.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2606190142442927379.eigenfacs
2606190142442927379.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2606190142442927379.eigenfacs
2606190142442927379.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2606190142442927379.eigenfacs
2606190142442927379.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2606190142442927379.eigenfacs
2606190142442927379.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2606190142442927379.eigenfacs
2606190142442927379.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2606190142442927379.eigenfacs
2606190142442927379.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2606190142442927379.eigenfacs
2606190142442927379.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2606190142442927379.eigenfacs
2606190142442927379.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2606190142442927379.eigenfacs
2606190142442927379.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2606190142442927379.eigenfacs
2606190142442927379.atom
making animated gifs
11 models are in 2606190142442927379.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2606190142442927379.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2606190142442927379.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
2606190142442927379.10.pdb
2606190142442927379.11.pdb
2606190142442927379.7.pdb
2606190142442927379.8.pdb
2606190142442927379.9.pdb
STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 0m21.719s
user 0m21.547s
sys 0m0.162s
rm: cannot remove '2606190142442927379.sdijf': No such file or directory
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:
elNémo
is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed
by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Between 2015 and 2025, it was hosted by US2B (Nantes).
Last modification: april 24th, 2026.
|