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***  rhamnosidase_6gsz_2  ***

LOGs for ID: 2606190905412989214

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2606190905412989214.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2606190905412989214.atom to be opened. Openam> File opened: 2606190905412989214.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 863 First residue number = 2 Last residue number = 870 Number of atoms found = 6963 Mean number per residue = 8.1 Pdbmat> Coordinate statistics: = 42.206819 +/- 14.646524 From: 2.787000 To: 72.497000 = -4.772330 +/- 18.557421 From: -48.080000 To: 35.843000 = 49.598713 +/- 14.953794 From: 15.976000 To: 83.079000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 1.3223 % Filled. Pdbmat> 2885145 non-zero elements. Pdbmat> 315978 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 90.76 +/- 22.62 Maximum number = 138 Minimum number = 15 Pdbmat> Matrix trace = 6.319560E+06 Pdbmat> Larger element = 531.270 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 863 non-zero elements, NRBL set to 5 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2606190905412989214.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 5 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2606190905412989214.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2606190905412989214.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 6963 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 5 residue(s) per block. Blocpdb> 863 residues. Blocpdb> 33 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 41 atoms in block 2 Block first atom: 34 Blocpdb> 43 atoms in block 3 Block first atom: 75 Blocpdb> 33 atoms in block 4 Block first atom: 118 Blocpdb> 41 atoms in block 5 Block first atom: 151 Blocpdb> 58 atoms in block 6 Block first atom: 192 Blocpdb> 33 atoms in block 7 Block first atom: 250 Blocpdb> 56 atoms in block 8 Block first atom: 283 Blocpdb> 45 atoms in block 9 Block first atom: 339 Blocpdb> 39 atoms in block 10 Block first atom: 384 Blocpdb> 36 atoms in block 11 Block first atom: 423 Blocpdb> 44 atoms in block 12 Block first atom: 459 Blocpdb> 36 atoms in block 13 Block first atom: 503 Blocpdb> 40 atoms in block 14 Block first atom: 539 Blocpdb> 34 atoms in block 15 Block first atom: 579 Blocpdb> 37 atoms in block 16 Block first atom: 613 Blocpdb> 46 atoms in block 17 Block first atom: 650 Blocpdb> 31 atoms in block 18 Block first atom: 696 Blocpdb> 46 atoms in block 19 Block first atom: 727 Blocpdb> 33 atoms in block 20 Block first atom: 773 Blocpdb> 35 atoms in block 21 Block first atom: 806 Blocpdb> 38 atoms in block 22 Block first atom: 841 Blocpdb> 49 atoms in block 23 Block first atom: 879 Blocpdb> 34 atoms in block 24 Block first atom: 928 Blocpdb> 41 atoms in block 25 Block first atom: 962 Blocpdb> 41 atoms in block 26 Block first atom: 1003 Blocpdb> 46 atoms in block 27 Block first atom: 1044 Blocpdb> 42 atoms in block 28 Block first atom: 1090 Blocpdb> 41 atoms in block 29 Block first atom: 1132 Blocpdb> 42 atoms in block 30 Block first atom: 1173 Blocpdb> 32 atoms in block 31 Block first atom: 1215 Blocpdb> 45 atoms in block 32 Block first atom: 1247 Blocpdb> 44 atoms in block 33 Block first atom: 1292 Blocpdb> 36 atoms in block 34 Block first atom: 1336 Blocpdb> 38 atoms in block 35 Block first atom: 1372 Blocpdb> 48 atoms in block 36 Block first atom: 1410 Blocpdb> 50 atoms in block 37 Block first atom: 1458 Blocpdb> 41 atoms in block 38 Block first atom: 1508 Blocpdb> 42 atoms in block 39 Block first atom: 1549 Blocpdb> 32 atoms in block 40 Block first atom: 1591 Blocpdb> 29 atoms in block 41 Block first atom: 1623 Blocpdb> 45 atoms in block 42 Block first atom: 1652 Blocpdb> 39 atoms in block 43 Block first atom: 1697 Blocpdb> 36 atoms in block 44 Block first atom: 1736 Blocpdb> 40 atoms in block 45 Block first atom: 1772 Blocpdb> 35 atoms in block 46 Block first atom: 1812 Blocpdb> 44 atoms in block 47 Block first atom: 1847 Blocpdb> 34 atoms in block 48 Block first atom: 1891 Blocpdb> 48 atoms in block 49 Block first atom: 1925 Blocpdb> 36 atoms in block 50 Block first atom: 1973 Blocpdb> 42 atoms in block 51 Block first atom: 2009 Blocpdb> 33 atoms in block 52 Block first atom: 2051 Blocpdb> 48 atoms in block 53 Block first atom: 2084 Blocpdb> 42 atoms in block 54 Block first atom: 2132 Blocpdb> 43 atoms in block 55 Block first atom: 2174 Blocpdb> 42 atoms in block 56 Block first atom: 2217 Blocpdb> 36 atoms in block 57 Block first atom: 2259 Blocpdb> 37 atoms in block 58 Block first atom: 2295 Blocpdb> 40 atoms in block 59 Block first atom: 2332 Blocpdb> 47 atoms in block 60 Block first atom: 2372 Blocpdb> 34 atoms in block 61 Block first atom: 2419 Blocpdb> 36 atoms in block 62 Block first atom: 2453 Blocpdb> 48 atoms in block 63 Block first atom: 2489 Blocpdb> 37 atoms in block 64 Block first atom: 2537 Blocpdb> 34 atoms in block 65 Block first atom: 2574 Blocpdb> 35 atoms in block 66 Block first atom: 2608 Blocpdb> 40 atoms in block 67 Block first atom: 2643 Blocpdb> 41 atoms in block 68 Block first atom: 2683 Blocpdb> 54 atoms in block 69 Block first atom: 2724 Blocpdb> 33 atoms in block 70 Block first atom: 2778 Blocpdb> 44 atoms in block 71 Block first atom: 2811 Blocpdb> 41 atoms in block 72 Block first atom: 2855 Blocpdb> 37 atoms in block 73 Block first atom: 2896 Blocpdb> 38 atoms in block 74 Block first atom: 2933 Blocpdb> 39 atoms in block 75 Block first atom: 2971 Blocpdb> 43 atoms in block 76 Block first atom: 3010 Blocpdb> 40 atoms in block 77 Block first atom: 3053 Blocpdb> 54 atoms in block 78 Block first atom: 3093 Blocpdb> 43 atoms in block 79 Block first atom: 3147 Blocpdb> 48 atoms in block 80 Block first atom: 3190 Blocpdb> 35 atoms in block 81 Block first atom: 3238 Blocpdb> 41 atoms in block 82 Block first atom: 3273 Blocpdb> 40 atoms in block 83 Block first atom: 3314 Blocpdb> 37 atoms in block 84 Block first atom: 3354 Blocpdb> 38 atoms in block 85 Block first atom: 3391 Blocpdb> 39 atoms in block 86 Block first atom: 3429 Blocpdb> 44 atoms in block 87 Block first atom: 3468 Blocpdb> 37 atoms in block 88 Block first atom: 3512 Blocpdb> 50 atoms in block 89 Block first atom: 3549 Blocpdb> 44 atoms in block 90 Block first atom: 3599 Blocpdb> 45 atoms in block 91 Block first atom: 3643 Blocpdb> 36 atoms in block 92 Block first atom: 3688 Blocpdb> 41 atoms in block 93 Block first atom: 3724 Blocpdb> 46 atoms in block 94 Block first atom: 3765 Blocpdb> 37 atoms in block 95 Block first atom: 3811 Blocpdb> 40 atoms in block 96 Block first atom: 3848 Blocpdb> 44 atoms in block 97 Block first atom: 3888 Blocpdb> 35 atoms in block 98 Block first atom: 3932 Blocpdb> 46 atoms in block 99 Block first atom: 3967 Blocpdb> 39 atoms in block 100 Block first atom: 4013 Blocpdb> 44 atoms in block 101 Block first atom: 4052 Blocpdb> 39 atoms in block 102 Block first atom: 4096 Blocpdb> 42 atoms in block 103 Block first atom: 4135 Blocpdb> 34 atoms in block 104 Block first atom: 4177 Blocpdb> 36 atoms in block 105 Block first atom: 4211 Blocpdb> 39 atoms in block 106 Block first atom: 4247 Blocpdb> 33 atoms in block 107 Block first atom: 4286 Blocpdb> 52 atoms in block 108 Block first atom: 4319 Blocpdb> 38 atoms in block 109 Block first atom: 4371 Blocpdb> 46 atoms in block 110 Block first atom: 4409 Blocpdb> 34 atoms in block 111 Block first atom: 4455 Blocpdb> 46 atoms in block 112 Block first atom: 4489 Blocpdb> 39 atoms in block 113 Block first atom: 4535 Blocpdb> 35 atoms in block 114 Block first atom: 4574 Blocpdb> 46 atoms in block 115 Block first atom: 4609 Blocpdb> 47 atoms in block 116 Block first atom: 4655 Blocpdb> 46 atoms in block 117 Block first atom: 4702 Blocpdb> 33 atoms in block 118 Block first atom: 4748 Blocpdb> 31 atoms in block 119 Block first atom: 4781 Blocpdb> 44 atoms in block 120 Block first atom: 4812 Blocpdb> 38 atoms in block 121 Block first atom: 4856 Blocpdb> 44 atoms in block 122 Block first atom: 4894 Blocpdb> 37 atoms in block 123 Block first atom: 4938 Blocpdb> 35 atoms in block 124 Block first atom: 4975 Blocpdb> 40 atoms in block 125 Block first atom: 5010 Blocpdb> 41 atoms in block 126 Block first atom: 5050 Blocpdb> 51 atoms in block 127 Block first atom: 5091 Blocpdb> 50 atoms in block 128 Block first atom: 5142 Blocpdb> 45 atoms in block 129 Block first atom: 5192 Blocpdb> 35 atoms in block 130 Block first atom: 5237 Blocpdb> 37 atoms in block 131 Block first atom: 5272 Blocpdb> 33 atoms in block 132 Block first atom: 5309 Blocpdb> 46 atoms in block 133 Block first atom: 5342 Blocpdb> 40 atoms in block 134 Block first atom: 5388 Blocpdb> 43 atoms in block 135 Block first atom: 5428 Blocpdb> 36 atoms in block 136 Block first atom: 5471 Blocpdb> 39 atoms in block 137 Block first atom: 5507 Blocpdb> 46 atoms in block 138 Block first atom: 5546 Blocpdb> 39 atoms in block 139 Block first atom: 5592 Blocpdb> 37 atoms in block 140 Block first atom: 5631 Blocpdb> 37 atoms in block 141 Block first atom: 5668 Blocpdb> 48 atoms in block 142 Block first atom: 5705 Blocpdb> 39 atoms in block 143 Block first atom: 5753 Blocpdb> 45 atoms in block 144 Block first atom: 5792 Blocpdb> 39 atoms in block 145 Block first atom: 5837 Blocpdb> 49 atoms in block 146 Block first atom: 5876 Blocpdb> 34 atoms in block 147 Block first atom: 5925 Blocpdb> 44 atoms in block 148 Block first atom: 5959 Blocpdb> 47 atoms in block 149 Block first atom: 6003 Blocpdb> 33 atoms in block 150 Block first atom: 6050 Blocpdb> 32 atoms in block 151 Block first atom: 6083 Blocpdb> 40 atoms in block 152 Block first atom: 6115 Blocpdb> 38 atoms in block 153 Block first atom: 6155 Blocpdb> 40 atoms in block 154 Block first atom: 6193 Blocpdb> 42 atoms in block 155 Block first atom: 6233 Blocpdb> 29 atoms in block 156 Block first atom: 6275 Blocpdb> 39 atoms in block 157 Block first atom: 6304 Blocpdb> 51 atoms in block 158 Block first atom: 6343 Blocpdb> 34 atoms in block 159 Block first atom: 6394 Blocpdb> 44 atoms in block 160 Block first atom: 6428 Blocpdb> 41 atoms in block 161 Block first atom: 6472 Blocpdb> 38 atoms in block 162 Block first atom: 6513 Blocpdb> 41 atoms in block 163 Block first atom: 6551 Blocpdb> 48 atoms in block 164 Block first atom: 6592 Blocpdb> 44 atoms in block 165 Block first atom: 6640 Blocpdb> 36 atoms in block 166 Block first atom: 6684 Blocpdb> 40 atoms in block 167 Block first atom: 6720 Blocpdb> 34 atoms in block 168 Block first atom: 6760 Blocpdb> 24 atoms in block 169 Block first atom: 6794 Blocpdb> 40 atoms in block 170 Block first atom: 6818 Blocpdb> 31 atoms in block 171 Block first atom: 6858 Blocpdb> 57 atoms in block 172 Block first atom: 6889 Blocpdb> 18 atoms in block 173 Block first atom: 6945 Blocpdb> 173 blocks. Blocpdb> At most, 58 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 18 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 2885318 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 20889 Prepmat> Matrix trace = 6319560.0000 Prepmat> Last element read: 20889 20889 110.6075 Prepmat> 15052 lines saved. Prepmat> 13327 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 6963 RTB> Total mass = 6963.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 6963 RTB> Number of blocks = 173 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 228427.0574 RTB> 59469 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1038 Diagstd> Nb of non-zero elements: 59469 Diagstd> Projected matrix trace = 228427.0574 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1038 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 228427.0574 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 1.6787975 1.9628484 2.9195645 3.6134377 3.8437190 4.1470198 5.3874666 6.2806082 7.2243052 7.6302474 8.9453292 10.1888367 10.4172623 10.5420383 10.8657260 11.7605595 12.0679396 13.4313951 14.7139485 15.2242808 16.4436194 17.0450718 17.0506544 18.0498302 18.6089469 20.1269436 21.4900855 22.0501670 22.7639503 23.2830931 24.0573868 24.4800917 24.9735230 25.5037551 25.8950567 26.2510196 27.2515273 27.4720383 28.4636732 29.0538364 29.3798875 30.0930631 30.6317199 30.9768557 31.8545627 32.6938935 33.3468919 34.2498445 34.9018703 35.7244535 36.1304405 37.0938746 38.1411183 38.8174515 39.1807873 39.7117303 40.0434784 40.2207793 40.7375791 41.9332034 42.5602619 43.2392543 43.8010559 44.1294746 45.0459748 45.3390614 46.0583836 46.9368358 47.1169467 48.1318775 48.3993830 49.0877107 49.6993905 50.3961420 50.7329871 51.3245539 51.5565719 51.9262887 52.6144562 53.1400000 53.5095642 54.3189892 54.7609843 55.2989495 56.0541801 56.8201157 57.0101147 57.9334240 58.0498788 58.5132760 59.1501726 59.8641683 60.2246877 60.9920069 61.2613905 61.9104834 62.3827615 63.0912001 63.3907525 64.1249406 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034327 0.0034335 0.0034342 0.0034342 0.0034343 0.0034346 140.7001091 152.1383341 185.5471619 206.4218037 212.8977615 221.1379772 252.0505082 272.1423507 291.8725977 299.9608591 324.7831151 346.6231631 350.4871337 352.5799194 357.9518862 372.3996572 377.2348825 397.9750466 416.5430530 423.7050819 440.3459322 448.3267964 448.4002093 461.3513979 468.4423796 487.1741037 503.4013218 509.9190327 518.1065642 523.9810943 532.6224965 537.2813925 542.6692164 548.3998724 552.5908805 556.3759750 566.8794376 569.1683234 579.3496545 585.3249323 588.6001178 595.7012048 601.0089946 604.3853748 612.8879796 620.9099249 627.0800168 635.5132094 641.5339293 649.0498845 652.7274972 661.3728761 670.6439193 676.5638511 679.7228343 684.3128344 687.1652322 688.6848366 693.0951959 703.1926142 708.4307867 714.0594612 718.6833277 721.3726267 728.8250228 731.1921878 736.9696902 743.9644523 745.3904938 753.3758278 755.4664688 760.8195604 765.5451535 770.8926872 773.4646991 777.9610823 779.7175264 782.5082447 787.6763814 791.6004918 794.3483304 800.3337289 803.5833011 807.5208059 813.0163559 818.5521189 819.9195421 826.5323925 827.3627026 830.6584495 835.1669284 840.1924153 842.7185594 848.0700813 849.9408550 854.4317492 857.6845329 862.5408544 864.5860695 869.5784495 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 6963 Rtb_to_modes> Number of blocs = 173 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9929E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9971E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.679 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.963 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.920 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.613 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.844 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.147 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.387 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.281 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.224 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.630 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.945 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.12 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1038 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 0.99999 0.99997 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 0.99998 1.00001 1.00001 0.99999 0.99998 0.99999 1.00000 1.00000 0.99998 0.99998 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 0.99998 1.00001 0.99999 1.00002 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 1.00004 1.00000 0.99997 1.00000 0.99997 1.00002 0.99998 0.99999 0.99999 0.99998 1.00000 0.99999 0.99999 0.99996 0.99999 1.00003 1.00000 1.00000 1.00002 1.00002 1.00003 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 0.99999 1.00001 1.00002 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00002 0.99997 1.00002 1.00002 1.00001 0.99999 0.99999 0.99999 0.99999 1.00001 1.00002 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 0.99998 0.99999 1.00001 0.99997 1.00002 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999 1.00002 1.00001 0.99999 1.00000 0.99998 0.99996 1.00000 1.00002 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 125334 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 0.99999 0.99997 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 0.99998 1.00001 1.00001 0.99999 0.99998 0.99999 1.00000 1.00000 0.99998 0.99998 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 0.99998 1.00001 0.99999 1.00002 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 1.00004 1.00000 0.99997 1.00000 0.99997 1.00002 0.99998 0.99999 0.99999 0.99998 1.00000 0.99999 0.99999 0.99996 0.99999 1.00003 1.00000 1.00000 1.00002 1.00002 1.00003 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 0.99999 1.00001 1.00002 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00002 0.99997 1.00002 1.00002 1.00001 0.99999 0.99999 0.99999 0.99999 1.00001 1.00002 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 0.99998 0.99999 1.00001 0.99997 1.00002 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999 1.00002 1.00001 0.99999 1.00000 0.99998 0.99996 1.00000 1.00002 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3: 0.000 0.000 Vector 4:-0.000 0.000 0.000 Vector 5: 0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 6:-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 7: 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 8: 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 9:-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 10:-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2606190905412989214.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2606190905412989214.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2606190905412989214.atom Openam> file on opening on unit 11: 2606190905412989214.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 863 First residue number = 2 Last residue number = 870 Number of atoms found = 6963 Mean number per residue = 8.1 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9929E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9971E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.679 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.963 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.920 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.613 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.844 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.147 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.387 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.281 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.224 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.630 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.945 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.12 Bfactors> 106 vectors, 20889 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 1.679000 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.837 for 896 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.013 +/- 0.01 Bfactors> = 15.823 +/- 6.43 Bfactors> Shiftng-fct= 15.810 Bfactors> Scaling-fct= 497.210 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2606190905412989214.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2606190905412989214.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4326E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4333E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 140.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 152.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 185.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 206.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 212.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 221.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 252.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 272.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 291.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 299.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 324.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 346.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 350.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 352.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 358.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 372.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 377.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 397.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 416.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 423.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 440.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 448.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 448.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 461.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 468.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 487.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 503.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 509.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 518.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 523.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 532.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 537.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 542.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 548.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 552.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 556.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 566.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 569.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 579.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 585.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 588.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 595.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 601.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 604.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 612.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 620.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 627.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 635.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 641.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 649.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 652.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 661.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 670.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 676.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 679.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 684.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 687.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 688.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 693.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 703.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 708.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 714.0 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Chkmod> That is: 6963 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. 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DQ=-80 2606190905412989214.eigenfacs 2606190905412989214.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2606190905412989214.eigenfacs 2606190905412989214.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2606190905412989214.eigenfacs 2606190905412989214.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2606190905412989214.eigenfacs 2606190905412989214.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2606190905412989214.eigenfacs 2606190905412989214.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2606190905412989214.eigenfacs 2606190905412989214.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2606190905412989214.eigenfacs 2606190905412989214.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2606190905412989214.eigenfacs 2606190905412989214.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2606190905412989214.eigenfacs 2606190905412989214.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2606190905412989214.eigenfacs 2606190905412989214.atom making animated gifs 11 models are in 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generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 2606190905412989214.eigenfacs 2606190905412989214.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2606190905412989214.eigenfacs 2606190905412989214.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2606190905412989214.eigenfacs 2606190905412989214.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2606190905412989214.eigenfacs 2606190905412989214.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2606190905412989214.eigenfacs 2606190905412989214.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2606190905412989214.eigenfacs 2606190905412989214.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2606190905412989214.eigenfacs 2606190905412989214.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2606190905412989214.eigenfacs 2606190905412989214.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2606190905412989214.eigenfacs 2606190905412989214.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2606190905412989214.eigenfacs 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animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 2606190905412989214 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 2606190905412989214.eigenfacs 2606190905412989214.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2606190905412989214.eigenfacs 2606190905412989214.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2606190905412989214.eigenfacs 2606190905412989214.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2606190905412989214.eigenfacs 2606190905412989214.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2606190905412989214.eigenfacs 2606190905412989214.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2606190905412989214.eigenfacs 2606190905412989214.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2606190905412989214.eigenfacs 2606190905412989214.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2606190905412989214.eigenfacs 2606190905412989214.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2606190905412989214.eigenfacs 2606190905412989214.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2606190905412989214.eigenfacs 2606190905412989214.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2606190905412989214.eigenfacs 2606190905412989214.atom making animated gifs 11 models are in 2606190905412989214.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2606190905412989214.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2606190905412989214.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 2606190905412989214 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 2606190905412989214.eigenfacs 2606190905412989214.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2606190905412989214.eigenfacs 2606190905412989214.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2606190905412989214.eigenfacs 2606190905412989214.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2606190905412989214.eigenfacs 2606190905412989214.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2606190905412989214.eigenfacs 2606190905412989214.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2606190905412989214.eigenfacs 2606190905412989214.atom calculating perturbed structure for DQ=20 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100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2606190905412989214.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 2606190905412989214 11 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-100 2606190905412989214.eigenfacs 2606190905412989214.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2606190905412989214.eigenfacs 2606190905412989214.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2606190905412989214.eigenfacs 2606190905412989214.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2606190905412989214.eigenfacs 2606190905412989214.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2606190905412989214.eigenfacs 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MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2606190905412989214.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 2606190905412989214.10.pdb 2606190905412989214.11.pdb 2606190905412989214.7.pdb 2606190905412989214.8.pdb 2606190905412989214.9.pdb STDERR: Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL real 0m32.743s user 0m32.473s sys 0m0.252s rm: cannot remove '2606190905412989214.sdijf': No such file or directory pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: 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